BIOENERGETIKA

BIOENERGETIKA

OLEH :
T.M.Fauzi,S.Si, M.Kes
 BIOENERGETIKA
• Thermodinamika biokimia : perubahan energi
yang menyertai reaksi-reaksi biokimia
• Energi bebas :bagian energi total yang tersedia
untuk kerja bermanfaat
• Reaksi kimia yang berlangsung spontanenergi
bebas pada produk lebih kecil dari energi bebas
pada reaktanpelepasan energi
• Jumlah reaksi yang diperlukan organisme
berkaitan dengan penurunan bersih energi
bebas
 BIOENERGETIKA (1)
• Sumber energi bebas pada organisme hidup
adalah reaksi oksidatif
• Reaksi oksidatif menghasilkan energi yang
disimpan dalam bentuk “senyawa phospat
berenergi” dan sedikit dalam bentuk panas

• Hukum dasar aliran energi:

1. Total energi sebuah sistem adalah konstan
2. Entropi total sebuah sistem meningkat
pada proses yang berlansung spontan
 BIOENERGETIKA (2)

• Pada suhu dan tekanan yang konstan : hubungan

perubahan energi bebas dan perubahan entropi
suatu sistem adalah : G = H - T S dalam
biokimia : G = E - T S dimana
G : prubahan energi bebas
H : perubahan panas / entalpi
E : perubahan total energi internal reaksi
T : suhu absolut
S : entropi
 BIOENERGETIKA (3)
Bila G negative : reaksi spontan / eksergonik dan
irreversible
G positive : reaksi endergonik (berlangsung
bila ada energi bebas )
G nol : sistem dalam kesetimbangan
• Proses endergonik harus menjadi komponen
dari sistem eksergonik-endergonik
• Dalam sistem biologi , rangkaian proses
eksergonik-endergonik butuh zat antara
senyawa phosfat berenergi
 A

E
D

B C

Transfer of free energy from an exergonic to an endergonic

reaction via a high-energy intermediate coumpound
 A

Chemical
energy

C B

A + C B + D + Heat

Coupling of an exergonic to an endergonic reaction

 Senyawa-senyawa berenergi tinggi
• 1. Ikatan anhidrida : ATP , ADP
1,3biphosfogliserat
2. Ikatan enolphosfat : phosfoenolpiruvat
3. Ikatan phosfoguanidin : kreatinphosfat ,
argininphosfat
4. Lainnya : ko-A-SH , ACP , UDPG
• ATP merupakan senyawa pembawa energi tinggi
utama pada sel hidup (transducer energi pada sistem
eksergonik-endergonik)
 Endergonic
processes

1 Syntheses

2
Muscular
contraksion
Exergonic
reactions E

Nervous
3 excitation

Active
transport
4
 BIOENERGETIKA (4)
• ATP adalah suatu nukleotida , mengandung adenin , ribosa
dan tiga gugus phosfat
Berfungsi sebagai kompleks dengan Mg
Depot ATP /ADP kecildikonsumsi terus menerus
dibentuk dengan kecepatan tinggi
• Sumber utama gugus phosfat energi tinggi :
1. Fosforilasi oksidatif : sumber paling besar (pada
organisme aerobik)
2. Glikolisis
3. Siklus krebs
 Interkonversi Adenilat
• ATP + AMP  2 ADP dengan bantuan adenilat
kinase , reaksi ini berguna untuk :
1. Sintesa ATP
2. Phosforilasi ulang AMP menjadi ADP
3. [AMP] tinggi adalah sinyal metabolik untuk
mempercepat reaksi katabolik  pembentukan ATP
kembali
• ATP + ko-A-SH + R-COOH  AMP + PPi +R-COOS
ko-A (dengan bantuan tiokinase)
PPi + H2O  2 Pi
 Interkonversi Adenilat
• Pada aktivasi asam lemak rantai panjang diatas ,
ATP menjadi AMP dan pirophosfat an-organik
disertai hilangnya energi bebas sebagai panas
• Pirophosfat an-organik dihidrolisa menjadi 2
molekol phosfat an-organik ( reaksi ini berguna
juga sebagai daur ulang phosfat)
• Senyawa-senyawa nukleosida triphosfat disintesa
dari senyawa diphosfatnya dengan enzym
nukleosida diphosfat kinase , contoh antara lain :
 Interkonversi Adenilat
ATP + UDP  ADP +UTP
ATP + GDP  ADP + GTP
ATP + CDP  ADP + CTP
• Bila ATP berperan sebagai donor phosfat untuk
membentuk senyawa berenergi lainnya gugus
phosfat nya menjadi berenergi lebih rendah
contoh :
Gliserol + ATP  Gliserol-P + ADP (dengan bantuan
giserol kinase )
 INORGANIC
PYROPHOSPHATASE
2PI

Pi PPI
ACYL – CoA
SYNTHETASE, etc

ATP

X 2
AMP
ADP
ADENYLYL
KINASE
Table. Standard free energy of hydrolysis of some
organophospates of biocemical importance.
GO’
COMPOUND
kJ/mol Kcal/mol
Phosphoenolpyruvate -61.9 -14.8
Carbomoyl phosphate -51.4 -12.3
1,3-Bisphophoglycerate -49.3 -11.8
(to 3-phosphoglycerate) -43.1 -10.3
Creatine phosphate
ATP  ADP + Pi -30.5 -7.3
ADP  AMP + Pi -27.6 -6.6
Pyrophosphate -27.6 -6.6
Glucose 1-phosphate -20.9 -5.0
Fructose 6-phosphate -15.9 -3.8
AMP -14.2 -3.4
Glucose 6-phosphate -13.8 -3.3
Glycerol 3-phosphate -9.2 -2.2
 OKSIDASI BIOLOGI (1)

• Reaksi oksidasi :pelepasan elektron 

diikuti reaksi reduksi  penerima elektron
• Potensial oksidasi – reduksi ( Eo ) :
perubahan energi bebas pada reaksi oks-
red yang sebanding dengan kecendrungan
tiap reaktan melepas atau menerima
elektron
• Pada sistem biologi Eo diukur pada PH 7 dan
potensial elektroda ion H –0,42 volt 
tabel Eo pada beberapa sistem oksidasi
 System E’O volts
H+/H­2 -0.42
NAD+/ NADH -0.32
Lipoate; ox / red -0.29
Acetoacetate/ 3 – hydroxybutyrate -0.27
Pyruvate/ lactate -0.19
Oxaloacetate/ malate -0.17
Fumarate/ succcinate +0.03
Cytochrome b; Fe3+/Fe2+ +0.08
Ubiquinone; ox/red +0.10
Cytocrome c1; Fe3+/Fe2+ +0.22
Cytocrome a; Fe3+/Fe2+ +0.29
Oxygen/ water +0.82
 OKSIDASI BIOLOGI (2)
• Enzym dan ko-enzym yang terlibat dalam
reaksi oks-red adalah enzym kelas I
(oksidoreduktase ) dengan 4 sub kelas :
oksidase
dehidrogenase
hidroperoksidase
oksigenase
 Enzym oksidase (1)
• Mengkatalisa pelepasan ion H dari substrat
dan sebagai reseptor adalah O2.
• Membentuk H2O atau H2O2 sebagai produk
• Dibedakan menjadi oksidase yang
mengandung tembaga dan flavoprotein
• Sitokrome oksidase ( sit.a.a3 ) adalah :
suatu hem protein yang mengandung
tembaga
terdapat pada mioglobin , hemoglobin
komponen akhir rantai respirasi
 Enzym oksidase (2)
• Oksidase berupa flavoprotein mengandung
FMN atau FAD
• Ko-enzym terikat kuat , berikatan non
kovalen dengan apoenzymnya  tidak bebas
berdissosiasi
• Antara lain : asam L amino oksidase ( pada
ginjal ) , xantin oksidase ( pada susu,ileum,
ginjal dan hati ) , aldehide oksidase ( pada
hati ) dan glukosa oksidase ( pada jamur )
AH2 /2
1 AH O2
(Re O2 2

d)

OXIDA OXIDA
SE SE

A H2O A H2O2
(OX A B
)

Oxidation of a metabolite catalyzed by an oxidase (A)

forming H2O, (B) forming H2O2
 Dehidrogenase (1)

• Tidak menggunakan O2 sebagai akseptor ion

H
• Punya 2 fungsi utama :
1. Pemindah ion H dalam reaksi oks-red
yang terangkai
sangat spesifik untuk substratnya , tapi
reaksinya reversible
pada reaksi oksidasi fase an-aerob
2. Komponen rantai respirasi 
mengangkut elektron dari substrat ke O2
 Dehidrogenase (2)
• Dehidrogenase yang terikat ko-enzym NAD
-enzym spesifik dengan ko-enzym NAD
atau NADP
-ko-enzym dapat berdissosiasi bebas
dari apoenzym
-umumnya mengkatalisa reaksi oks-red
dalam metabolisme oksidatif ( glikolisis ,
TCA cycle , rantai respirasi )
-yang link NADP khas untuk sintesa
reduktif ( sintesa asam lemak dan steroid )
dan PMP-shunt
 Dehidrogenase (3)
• Dehidrogenase yang terikat riboflavin
-sebagian besar berhubungan dengan
pengangkut elektron di atau ke dalam rantai
respirasi
-pada dehidrogenasi lipoat tereduksi
dalam rantai respirasi , FAD adalah carrier
ion H ke NADH dehidrogenase
-beberapa enzym ini :NADH d’ase ,
suksinat d’ase , asil ko-A d’ase , gliserol 3 p
d’ase
 Dehidrogenase (4)
• Dehidrogenase yang berhubungan dengan
sitokrome
-semua enzym sitokrome , golongan
dehidrogenase kecuali sit.oksidase
-sebagai carrier elektron dari
flavoprotein ke sitokrome oksidase pada
rantai respirasi
-sitokrome adalah hem-protein
(mengandung Fe++) , didalam sistem rantai
respirasi dikenal atl : sit b , c1 , c , a , a3 dan
dalam retikulum endoplasma terdapat
sitP450 dan sit b5
AH2 Carrier BH2
(Red (OX) (Red
) )

A Carrier-H2 B
(OX) (Red (OX)
)
DEHYDROGENASE DEHYDROGENASE
SPECIFIC FOR A SPECIFIC FOR B

Oxidation of a metabolite catalyzed by coupled

dehydrogenases
 Hidroperoksidase (1)
• Menggunakan H2O2 sebagai substrat
• Ada 2 jenis : -peroksidase dan
- katalase
• Melindungi tubuh dari senyawa peroksida
yang dapat membentuk radikal bebas yang
bersifat merusak membran sel dan
menyebabkan artherosclerosis dan cancer
 Hidroperoksidase (2)
• Peroksidase
Mereduksi peroksida menjadi air dengan
bantuan asam ascorbat , quinon dan sit c
dengan reaksi :
H2O2 + AH2  2H2O + A
Terdapat pada tumbuhan , susu , eritrosit
leukosit , trombosit serta jaringan yang
terlibat dalam metabolisme eikosanoid
• Katalase
Menggunakan H2O2 sebagai donor dan
akseptor elektron dengan reaksi :
2 H2O2  2H2O + O2
 A’H2 A’

AH2
A

O2 H2O2 CATALASE 2H2O

OXIDASE

H2O2 O2

Role of catalase in the destruction of hydrogen peroxie

 Oksigenase (1)

• Mengkatalisa pengangkutan langsung dan

koorporasi O2 ke molekul substrat
• Ada 2 sub kelompok :
1. Di-oksigenase / oksigen transferase
Mengkatalisa penyatuan 2 atom oksigen ke
substrat ( A + O2  AO2 )
2. Mono oksigenase
Berfungsi campuran oksidase dan hidroksilase
 mengkatalisa 1 atom oksigen kesubstrat
dan 1 atom lagi direduksi menjadi air
 Mono oksigenase (2)
Dengan reaksi :
A-H + O2 + ZH2  A-OH + H2O + Z
Membutuhkan satu ko-substrat sebagai donor
elektron tambahan  dimana :
Sistem mono-oksigenase sitokrome P450 (sbg
ko-substrat ) dalam mikrosom sel hati
melaksanakan proses hidroksilasi obat –
obatan dan terdapat juga dalam
mitokondria dari korteks adrenal, testis,
ovarium, plasenta berhubungan dengan
sintesa hormon steroid dari cholesterol
 Radikal bebas super oksid (O2-)
• Dibentuk dari hasil reduksi O2
• Enzym superoksid dismutase melindungi
organisme aerob dengan menghilangkan O2-
melalui reaksi :
O2- + O2- + 2H+  H2O2 + O2
• Superoksid dismutase terdapat pada sitosol
(mgdg Cu dan Zn ) serta mitokondria
(mgdg- Mn) dalam semua jaringan aerob
• Pemaparan terhadap O2 atmosfir yang
meningkat  peningkatan kadar enzym tsb
Rantai Pernapasan
dan
Fosforilasi oksidaif

T.M.Fauzi,S.Si, M.Kes
 Energi Matahari

Ekosistem
Fotosintesis dan
Respirasi merupakan
Fotosintesis proses yang
berkebalikan

Respirasi Selular

Kerja Selular
Energi Panas
2
Aktivitas hidup memerlukan energi dalam bentuk ATP

Pernapasan

Paru-paru
Gambar
Orang
berolah raga
Sel-sel otot
Aliran darah melakukan
Respirasi
Selular

3
ATP dapat digunakan untuk:
Protein Kerja transpor
membran

Solut Solut ditranspor

Kerja mekanik

Portein motor Portein dipindahkan

Kerja kimia

Reaktan Produk

4
ATP dihasilkan dari proses oksidasi molekul organik
(seperti glukosa) di dalam sel hidup

Glukosa + Oksigen Karbondioksida + Air + Energi

Oksidasi

C6H12O6 + 6 O2 6 CO2 + 6 H2O

Reduksi

ΔG = - 686 kkal/mol

Reaksi oksidasi dan reduksi memiliki peran penting

dalam proses-proses biologi, seperti Respirasi

5
Respirasi Selular

Melibatkan reaksi oksidasi-reduksi di dalam sel

Memanen energi kimia menjadi ATP
Reaksi umum

C6H12O6 + 6 O2 + 6 H2O

6 CO2 + 12 H2O + ATP

6
 Glikolisis tahap awal dari respirasi selular
2 ATP
1 molekul Glukosa 2 molekul asam piruvat
4 ATP
2 NADH

Glikolisis
sitosol

glukosa

2 piruvat

Respirasi selular

Terjadi pada seluruh organisme

Menggunakan enzim-enzim sitoplasma
7
Glikolisis ATP
Glukosa
Tahap persiapan
ADP
(memerlukan
Glukosa 6-Fosfat energi)
Fruktosa 6-Fosfat
ATP

ADP

Fruktosa 1,6-difosfat

Gliseraldehid 3-difosfat

NADH

Asam 1,3-difosfogliserat

ATP
(2 molekul) Tahap
menghasilkan
Asam 3-fosfogliserat
(2 molekul)
energi
Asam 2-fosfogliserat
(2 molekul)

Asam fosfoenolpiruvat
(2 molekul)
ATP

Asam piruvat (2 molekul per

molekul glukosa)

8
 Lintasan Respirasi Aerobik-Anaerobik

Asam Piruvat Ketersediaan

Oksigen

Oksigen Oksigen
tak ada / tak cukup ada / cukup

Respirasi Respirasi
Anaerobik Aerobik

9
 Lintasan Respirasi Anaerobik

Contoh : Fermentasi pada Ragi

Glukosa
2 Piruvat

2 Asetaldehid
2 Etanol

10
Pada otot hewan dan manusia saat kontraksi berlebihan

Glukosa

2 Piruvat

2 Asam
laktat

Timbunan asam laktat menurunkan pH otot sehingga

kapasitas serat otot menurun, menimbulkan rasa lelah.
Asam laktat dibawa ke liver, dan diubah kembali
menjadi asam piruvat jika oksigen telah cukup kembali.
Pada respirasi anaerob hanya dihasilkan 2 ATP (per 1
molekul glukosa)
11
 Lintasan Respirasi Aerobik

Respirasi :

Pernapasan (memasukkan O2 dan mengeluarkan CO2)

Oksidasi molekul-molekul organik oleh sel (respirasi selular)
terjadi di dalam mitokondria (pada sel-sel eukariot)
Ruang
intermembran matriks Krista
Kompleks
Membran sintesis ATP
Membran luar
dalam

Keterangan :
• membran luar : permeabel terhadap sebagian besar molekul kecil
• membran dalam : hanya dapat melewatkan molekul-molekul tertentu
seperti asam piruvat dan ATP
12
 Rantai pernapasan dan phosforilasi
oksidatif (1)
• Kumpulan enzym yang terangkai dalam
mitokondria untuk re-oksidasi ko-enzym
tereduksi oleh kerja dehidrogenase
• Terjadi pengumpulan dan pengangkutan
ekivalen pereduksi diakhiri dengan
pengikatan O2 molekuler membentuk air
• Terdiri dari carrier redoks yang berjalan
dari unsur yang lebih elektronegativ ke
yang lebih elektropositif
DEHYDROGENASE DEHYDROGENASE DEHYDROGENASE OXIDASE

Carrier Carrier Carrier

AH2 1 2 3 H2O
(Red) (Ox) (Red) (Ox)

Carrier-H2 Carrier Carrier-H2

A 2 / 2 O2
1
1 3
(Ox) (Ox)
(Red) (Red)

Oxidation of a metabolite by dehydrogenases and finally

by an oxidase in a respiratory chain
 AH2 NAD+ FpH2 2Fe3+ H2O

Substrate Flavoprotein Cytochrome

s
A NADH Fp 2Fe2+ 1
/2O

H+ H+ 2H
+ 2H+ 2

Transport of reducing equivalents through the respiratory

chain
 Energi maksimum hasil oksidasi 1 molekul glukosa

Tempat proses Produk Setara ATP Total ATP

Dalam sitoplasma
glikolisis 2 ATP 2 ATP 2 ATP
Dalam mitokondria
dari glikolisis 2 NADH 6 ATP 6 ATP

dari respirasi
asam piruvat- 1 NADH 3 ATP (2 X) 6 ATP
Asetil KoA

Siklus Krebs 3 NADH 9 ATP

1 FADH2 2 ATP (2 X) 24 ATP
1 ATP 1 ATP
Total 38 ATP

21
Rantai pernapasan dan phosforilasi
oksidatif (2)
• Sebagian oksidasi substrat masuk kesistem
melalui dehidrogenase-NAD dan sebagian
lain melalui dehidrogenase-Fp
• Co-Q (ubiquinon)adalh carrier tambahan
yang menghubungkan flavoprotein dengan
sit.b
• Carrier tambahan lain adalah protein Fe-S
(non-hem) yang terikat pada Fp dan sit b
• Sit c dan co-Q merupakan komponen yang
mobile , menghubungkan kompleks lainnya
yang terfiksasi
 Rantai pernapasan dan phosforilasi
oksidatif (3)
• Sit oksidase (sit a.a3) punya affinitas yang
sangat tinggi terhadap O2 irreversible
• Rantai pernapasan memberi banyak energi
dari pelepasan ekivalen pereduksi dalam
reaksi katabolisme melalui peristiwa
phosforilasi oksidatif
• Phosforilasi oksidatif adalah sistem dalam
mitokondria yang terangkai dengan
respirasi , membentuk ATP dari ADP dan Pi
 Proline Succin
3-Hydroxyacyl- ate
CoA Cholin
3-Hydroxybutyrate e
Pyruvat Glutamate Fp
e Malate (FAD)
Isocitrate FeS

Fp Fp Cyt aa3
Lipoate Cyt b Cyt c1 Cyt O2
(FAD) NAD (FMN) Q
FeS c Cu
FeS
FeS
- ETF
Fp FeS : Iron-sulfur
Ketoglutarate (FAD)
(FAD) protein
FeS ETF : Electron-
Fp transferring
(FAD) flavoprotein
Fp : Flavoprotein
Acyl-CoA Q : Ubiquinone
Sarcosine Cyt : Cytochrome
Glycerol 3-phosphate Dimethylglycin
Rantai Transport Elektron

Hasil oksidasi gula menghasilkan :

- ATP
- NADH dan FADH2 (pembawa elektron berenergi tinggi)

Elektron berenergi tinggi dalam NADH dan FADH2

dilewatkan setahap demi setahap ke tingkat energi yang
rendah dan akhirnya diterima oksigen (O2)

Siklus
Krebs Te
red
uksi
Te
rok
sid
asi
Energi

Rantai Transport Elektron

16
Mengapa harus ada rantai transpor elektron ?

Dari makanan via NADH

Energi
untuk
sintesis

Ran
tai tran
Pelepasan
energi
panas

spo
elekr
tr
on

17
 H+ H+ H+

Kompleks
Protein H+

Pembawa
elektron

Aliran
elektron
NADH NAD+

H+ +
ADP P
ATP

ATP sintase
18
 Fosforilasi oksidatif
• Oksidasi substrat melalu dehidrogenase-NAD
dalam rantai respirasi membentuk 3 molekul
ATP sedang melalui dehidrogenase Fp
membentuk 2 molekul ATP untuk setiap ½ mol
O2 yang dikonsumsi
• Secara fungsional dan struktural, komponen
rantai respirasi dalam membran internal
mitokondria yang dianggap sebagai tempat
yang menyokong fosforilasi dikelompokkan
menjadi 4 buah kompleks
 Mitokondria
• Mitokondria terdiri dari membran eksternal,
membran internal dan matriks
• Membran eksternal :permeabel untuk banyak
metabolite , mengandung enzym monoamin
oksidase , asil ko-A sintetase , gliserol-p asil
transferase dan phosfolipase A
• Membran interna :permeabel selektif ,
berupa lipatan / krista , mengandung enzym
gliserol 3-p D’ase dan suksinat D’ase
• Matriks : terdapat di sebelah dalam
m.interna mengandung enzym siklus krebs dan
enzym -oksidase
 A B MATRIX
F1 subunits
OUTER
Phosphorylating F0 subunits
MEMBRANE
B complexes
INNER
MEMBRANE

MATRIX

Sonication
Cristae

INNER
MEMBRANE
OUTER
MEMBRANE
Submitochondrial particel
Formed from fragments of
the inner membrance
 Laju rantai pernapasan
• Pengendalian respirasi
laju respirasi mitokondria dikendalikan oleh
[ ADP ]oksidasi tidak berlangsung bila
pada saat yang sama phosforilasi tidak
terjadi
• Status pengendalian respirasi mitokondria :
1. Tersedia ADP dan substrat
2. Hanya tersedia substrat
3. Substrat dan komponen lainnya cukup
4. Hanya tersedia ADP
5. Hanya tersedia O2
 Inhibitor rantai pernapasan dan
phosforilasi oksidatif (1)
• Inhibitor rantai respirasi
Bekerja di 3 tempat :
1. Menghalangi pemindahan elektron dari Fe-S
ke co-Q , contoh: barbiturat , pierisidin-A ,
rotenon , karboksin , TTFA
Inhibitor kompetitif dari suksinat D’ase ,
contoh : malonat
2. Menghalangi pemindahan elektron dari sit b
ke sit c ,
contoh : dimerkaprol , anti histamin A
 Inhibitor rantai pernapasan
dan phosforilasi oksidatif (2)
3. Menghambat sitokrom oksidase
contoh : H2S , CO , CN
• Inhibitor phosforilasi oksidatif
contoh : oligomycin , atraktilosida
• Un-couplers ( pemutus rangkaian oksidasi
dan phosforilasi )
contoh : dinitrophenol , dinitrokressol ,
pentachlorophenol , chloro carbonil cianida
phenilhidrazon ( cccp )
 Rotenon Sianida, CO Oligomisin

Rantai transpor elektron ATP sintase

Pengaruh senyawa racun pada proses transpor elektron dan

kemiosmosis (Cambel et al., 2000).
- Rotenon: termasuk insektisida,
- oligomisin: fungisida,
- dinitrophenol (DNP) pernah digunakan sebagai obat
penurun berat badan 23
 FAD
Succinate
FeS
H2S
BAL CO
Antimycin A CN -

Complex I Complex III Complex IV

NADH FMN, FeS Cyt b, FeS, Cyt c Cyt a Cyt a3 O2

Q
Cyt C1 Cu Cu

Piericidin A
Amobarbital
Rotenone Uncouplers
Uncouplers

Oligomycin
Oligomycin

ADP + P1 ATP ADP + P1 ATP ADP + P1 ATP

Diagram Produksi Energi
(Siklus Asam Trikarboksilat=TCA Cycle)