B YOLOJ K TEMEL LEMLER

DERS N ER Enerji reten Metabolik Sreler Enzim kineti i Biyolojik Ar tma Sistemlerinin Kineti i Aktif amur Sistemleri Biyofilm Sistemleri Anaerobik Ar tma Sistemleri

Bakteri metabolizmas

Katabolik reaksiyon= Byk molekllerin kk molekller dn mesi ve enerji retimi Anabolik reaksiyon= Yeni hcrelerin meydana gelmesi

Enzimlerin Rol
Enzimler protein yap da, yksek katalitik gce sahip, kolloidal, kompleks, geni kullan m alanl ve kimyasal katalistlere k yasla ok daha h zl tepkime veren biyokatalizrlerdir.

Her biyolojik dn m bir enzim taraf ndan katalizlenir. ki binden fazla e idi bilinen enzimler, etki ettikleri maddenin isminin sonuna -az eki getirilerek adland r l r (Maltaz, laktaz, amilaz v.b. gibi).

glyoxalase

Baz enzimler kofaktr olarak adland r lan Mg, Zn, Fe, Mn, NAD, FAD, CoA gibi protein olmayan gruplar ierirler. Enzimler o unlukla; yksek molekl a rl nda protein yap s nda olan nda ve

ta y c grevini yapan apoenzim, di eri d k molekl a rl basit organik yap daki koenzim veya prostetik grup tan olu ur. Apoenzim ve koenzim birlikte aktif holoenzim i olu turur.

 Enzimin etki etti i maddeye substrat denir. Baz enzimler birden fazla substrat ba layabilirler (dzenleyici alosterik enzimler).

Biyolojik ar tmada organik bile ikler organizmalar n salg lad enzimler taraf ndan paralan rlar.

Biyolojik ar tma kineti i enzim kineti ine benzemektedir

 Enzimler, tepkimenin serbest enerji de i imini ya da denge sabitini etkilememelerine kar n; substrata (reaktant) ba lanarak katalizledikleri tepkimenin aktivasyon enerjisini d rr ve h z n art r rlar.

Enzim Aktivitesine S cakl k Etkisi

Enzimatik tepkimelerin h zlar belli bir noktaya kadar s cakl k art yla artmas na kar n (aktivasyon), bu noktadan sonra h z yla d er (enzim denaturasyonu - inaktivasyon). s cakl k art

Enzim Aktivitesine pH Etkisi

Baz enzimler, aktif k s mlar nda iyonik gruplar ierirler. Ortam n pH na ba l olarak bu iyonik gruplar asidik ya da bazik olabilirler. Enzimin aktivite gsterebilmesi iin asidik ya da bazik aktif k s m zelliklerine sahip olmas gerekti inden, enzim aktivitesi pH a ba l olarak de i ir. o u enzim iin optimum etki pH aral 5,0-8,0 aral ndad r.

Enerji ve Karbon Kaynaklar

Hcre sentezi iin gerekli karbonun kayna na gre mikroorganizmalar hetetrofik ve ototrofik olarak iki gruba ayr l rlar. E er gerekli karbon iin CO2 veya karbonat kullan l yorsa bu tr organizmalara ototrofik organizma, organik karbon kullan l yorsa hetetrofik organizma ad verilir. Hetetrofik organizmalar enerji kayna olarak organik maddeleri kullan r ya da inorganik

ototrofik organizmalar ise enerji kayna olarak oksidasyon-redksiyon denklemlerini kullan rlar.

E er bir ototrofik organizma gerekli enerjiyi ktan sa l yorsa fotosentetik organizma, inorganik oksidasyon-redksiyon denklemlerinden sa l yorsa kemosentetik organizma ad verilir.

 Canl organizmalar n hcre sentezi yaparak o almalar olay na asimilasyon, asimilasyon ve hareket gibi i ler iin gerekli enerjiyi retmeleri ve depo etmeleri i lemine de disimilasyon ad verilir. At ksudaki organik madde s n rl oldu unda organik madde yerine hcre materyali kullan l r ve hcre yap s nda bir azalma olur. Hcre yap s ndaki bu azalmaya isel solunum denir. Aerobik, anaerobik, kemolitrofik ve fototrofik solunumda hcre sentezi iin kullan lan karbon ve enerji ak ekil de gsterilmi tir.

Ntrient htiyac
Azot ve fosfor gibi ntrientler bakterilerin hcre sentezi yapabilmesi ve bymesi iin gerekli maddelerdir. Ancak her at ksuda ntrientler yeterli lde bulunmayabilir. Bu gibi durumlarda at ksuya d ar dan ntrent ilavesi gereklidir. Genel olarak evsel at ksular biyolojik byme iin yeterli miktarda ntrient ihtiva etmektedir.

Bakteriyel Byme
o alma bakterilerin hayatlar n devam ettirebilmeleri iin temel faaliyetlerinden biridir. Bakterilerde o alma blnme, iftle me ve tomurcuklanma ekillerinden biriyle olur. Ancak genel olarak grlen o alma tr blnmedir. Blnme yoluyla iki adet ayn zelliklerde bakteri hcresi retilmi olur. Ortam artlar uygun oldu unda bakteri hcresi blnerek sonsuz o unlu a ula abilir. . Bakteriyel byme iki ekilde ifade edilebilir Bunlardan ilki bakteri say s bak m ndan byme, ikincisi ise bakteri ktlesi olarak bymedir.

Bakteri Say s Bak m ndan Byme

1. Lag Faz : Bu faz bakterilerin yeni evre artlar na uyum sa lamas ve blnmeye ba lamas iin gereken sreyi kapsar. 2. Logaritmik Byme Faz : Bu fazda bakteriler henz evre artlar k s tlay c bir duruma gelmedi inden blnme srelerine kar l k gelecek h zda byrler. 3. Durgunluk Faz : Bu fazda substrat ve ntrientlerin azalmas nedeniyle yeni hcrelerin bymesi ile eski hcrelerin lmesi dengelendi inden bakteri say s sabit kal r. 4. Logaritmik Azalma Faz : Bu fazda len bakteri say s yeni retilen hcre say s n a ar ve bakteri say s h zla azalmaya ba lar.

Bakteri Ktlesi Bak m ndan Byme

1. Lag Faz : Bu faz bakteri say s na ba l de i imden farkl d r. Bunun nedeni blnme ba lamadan bakteri ktlesinde bir artma olmas d r. 2. Logaritmik Byme Faz : Bu fazda bakterilerin kullan m iin bol miktarda substrat mevcuttur. Byme h z mikroorganizmalar n substrat kullanabilme yetene ine ba l d r. 3. Azalan H zla Art Faz : Bu fazda besi maddesi azald ndan bakteri ktlesindeki art h z azal r. 4. sel Tkenme Faz : Bu fazda art k besi maddesi minimum bir seviyede oldu undan mikroorganizmalar yenileme olmaks z n kendi protoplazmalar n tketmeye ba larlar ve bylece bakteri ktlesinde h zl bir azalma grlr.