Ribosom

Ribosom tersusun atas 65% RNA-ribosom (RNAr) dan 35% protein ribosom atau sering disebut Ribonukleoprotein (RNP). Ribosom tidak memiliki membran. Menurut bentuknya ribosom terdiri dari unit besar dan unit kecil yang masing-masing berbentuk bulat. Dan jika keduanya bergabung akan membentuk ribosom yang mirip angka delapan.

Gambar. Ribosom

Gambar. Ribosom II

Sifat Organel Ribosom

Bentuknya universal, pada potongan longitudinal berbentuk elips. Pada teknik pewarnaan negatif, tampak adanya satu alur transversal, tegak lurus pada sumbu, terbagi dalam dua sub unit yang memiliki dimensi berbeda. Dengan ultrasentrifugasi yang menurun pada kedua sub unit ribosom tersebut dapat dipisahkan sehingga dapat penyusunnya dapat dideterminasis. Sub unit-sub unit berasosiasi secara tegak iurus pada bagian sumbu dalam aiur yang memisahkannya. Setiap sub unit dicirikan oleh koefisiensi sedimentasi yang dinyatakan dalam unit Svedberg (S). Sehingga koefisien sedimentasi dari prokariot adalah 70S untuk keseluruhan ribosom (50S untuk sub unit yang besar dan 30S untuk yang kecil). Untuk eukariot adalah 80S untuk keseluruhan ribosom (60S untuk sub unit besar dan 40S untuk yang kecil). Dimensi ribosom serta bentuk menjadi bervariasi. Pada prokariot, panjang ribosom adalah 29 nm dengan besar 21 nm. Dan eukariot, ukurannya 32 nm dengan besar 22 nm.

Pada prokariot sub unitnya kecil, memanjang, bentuk melengkung dengan 2 ekstremitas, memiliki 3 digitasi, menyerupai kursi. Pada eukariot, bentuk sub unit besar menyerupai ribosom E. coli.

Ribosom prokariot mempunyai massa total molekuler 2.520.000 dalton dengan ukuran 29 nm x 21 nm (1nm = 10 Ao). Ribosom eukariot lebih besar ukurannya, memiliki massa total 4.220.000 dalton dengan ukuran 32 nm x 22 nm. Ukuran ribosom ditentukan dengan analisis sedimentasi. Ribosom seperti banyak makromolekul dan perakitan multi molekul berukuran sangat besar dan sukar untuk diduga beratnya, sehingga untuk mengukurnya menggunakan cara, yaitu dengan mengukur kecepatan pengendapan pada larutan padat dengan kekuatan sentrifugasi 700.000 gr lebih. Ribosom prokariot mempunyai koefisiensi sedimentasi 70 s lebih kecil dari pada ribosom eukariot yaitu 80 s. Ribosom memiliki dua sub unit, yaitu subunit besar mengandung dua molekul rRNA 23s dan 5s dengan 31 polipeptida yang berbeda. Subunit kecil satu molekul tunggal rRNA 16s ditambah 21 polipeptida. Ribosom ada yang menempel pada membran Retikulum endoplasma (RE) dan ada juga yang melayang-layang diatas sitoplasma. Fungsi kedua ribososm itu sama, yaitu untuk mensintesis protein. Tetapi umumnya ribosom yang menempel pada RE berfungsi untuk mensintesis protein untuk dibawa keluar sel melalui RE dan kompleks Golgi. Sedangkan ribosom yang melayang mensintesis protein untuk keperluan di dalam sel. Ribosom sendiri di sintesis oleh nukleus.

Gambar. Ribosom melekat pada RE dan ribosom bebas

Ribosom memiliki 2 peran aktif dalam dalam proses sintesis protein : 1. Ribosom mengkoordinasi sintesis protein dengan menempatkan mRNA aminoacyl, tRNA dan menghubungkan faktor protein dengan posisi yang relatif benar satu sama-lainnya. 2. Komponen ribosom meliputi rRNAs, mengkatalisis sedikitnya reaksi kimia yang terjadi selama translasi. Komposisi Kimia ribosom Asam nukleat ribosom: Sub unit besar dibentuk dari protein dan RNA dalam kuantitas yang seimbang, mengandung 2 tipe rRNA, yakni: Satu rRNA 28S Satu rRNA SS

- Sub unit kecil mengandung r RNA 18s. Diketahui bahwa, dengan ketiadaan RNA 185, maka sub unit besar tidak dapat berasosiasi pada sub unit kecil. Sedangkan RNA 28s memungkinkan asosiasi tersebut. RNA SS melekat pada sequence asam nukleat ini yaitu tRNA. Bilamana terbaca maka tRNA melekat pada site yang merupakan bagian RNA 285. Perpindahan dari tRNA yang melekat pada molekul mRNA menyebabkan pergerakan translasi mRNA masing-masing.

Protein ribosomal

1. Sub unit kecil (30S prokariot): 21 protein digambarkan berturut-turut dengan huruf S dan satu angka antara 1 dan 21 (S1, S2, S21). Berat moleku130.000 40.000 Dalton. Berada pada permukaan ribosom, mengelilingi rRNA. Protein memainkan peranan sebagai reseptor pada faktor pemanjangan sedangkan yang lainnya mengontrol transducti. 2. Sub unit besar: 33 protein dikenal sebagai Li sampai L33. Terlibat dalam:

Translokasi oleh adanya GTP (melekat pada ribosam) yang memberikan energi untuk memindahkan inRNA dan pembebasan tRNA asetil. Fiksasi (protein L7 dan L1z) dari suatu faktor pemanjangan (EF-6) Dalam pembentukan suatu ikatan peptida antar rantai peptida yang telah dibentuk dan suatu asetil-NH2 baru.

Dalam konstruksi suatu alur longitudinal, menempatkan rantai protein dengan pembentukan dan melindunginya meiawan enzim proteolitik. Alur ini memiliki panjang sesuai dengan rantai polipeptida 35 asetil-NH2.