Professional Documents
Culture Documents
P3
P3
We wish to suggest a structure for the salt of deoxyribose nucleic acid (D.N.A.). This structure has novel features which are of considerable biological interest. It has not escaped our notice that the specific pairing we have postulated immediately suggests a possible copying mechanism for the genetic material. We are much indebted to Dr. Jerry Donohue...
April 2. J. D. Watson F. H. C. Crick
1962
eer
fosfat
eer
fosfat
eer
fosfat
eer
fosfat
eer
fosfat
purin PIRIMIDINI
riboza
adenin
gvanin
pirimidin
deoksiriboza
citozin
uracil
timin
gvanin (G)
gvanozin deoksigvanidin
citozin (C)
citidin deoksicitidin
Atom duika na poloaju devet (N9) purina vezan je glikozidnom vezom na anomerni atom (deoksi)riboze
uracil (U)
uridin
timin (T)
deoksitimidin
Kemijska struktura nukleinskih kiselina Vie nukleotida povezanih fosfodiesterskom vezom ine oligonukleotide
DNA je dvolanana molekula s bazama u unutranjosti, a eerno-fosfatnom okosnicom na vanjskoj strani uzvojnice
adenin
timin
Kad strukturu nukleinskih kiselina prikazujemo u skraenom obliku, ukoliko nije drugaije navedeno, smjer je uvijek 5 3
5-ATTGCGTA-3 3-ATGCGTTA-5 ATTGCGTA = 5-ATTGCGTA-3
5-ATGCTGCAT-3 3-TACGACGTA-5
Hidrofobne interakcije izme u susjednih parova baza u DNA daju dodatnu vrstinu dvostrukoj uzvojnici slaganje baza (engl. stacking)
Mathew Meselson i Franklin Stahl su 1958. godine pokazali da je replikacija DNA semikonzervativna
Denaturacija DNA je proces u kojem se razdvajaju dva komplementarna lanca, a molekula prelazi u konformaciju nasuminog klupka
Temperaturu pri kojoj je 50% molekula DNA denaturirano nazivamo temperatura mekanja (Tm)
molekula DNA
molekula RNA
Najjednostavnija i najea struktura koju zauzimaju jednolanane DNA i RNA je oma s peteljkom (engl. stem-loop)
Davno u evoluciji RNA je vjerojatno i pohranjivala informaciju i katalizirala njezin prijenos. Katalitiki aktivne RNA znaajne su i danas, primjerice u ribosomima.
crno sparivanje baza prema Watsonu i Cricku zeleno nestandardno sparivanje baza
Pan troglodytes
30.000 gena 98% homologije
Mus musculus
30.000 gena 90% homologije
Danio rerio
30.000 gena 85% homologije
D. melanogaster
13.600 gena 36% homologije
A. thaliana
25.000 gena 26% homologije
S. cerevisiae
6.275 gena 23% homologije
C. elegans
19.000 gena 21% homologije
E. coli
4.800 gena 7% homologije
reverzna-transkriptaza
reverzna-transkriptaza
reverzna-transkriptaza
Manje od 0.1%
virusna RNA
RNA-DNA hibrid
U retrovirusima tijek genetike informacije ide od RNA ka DNA. Virusni enzim reverzna-transkriptaza RNA prvo prepisuje u DNA, zatim razgra uje RNA lanac hibridne DNA-RNA molekule i na kraju sintetizira drugi lanac DNA. Takva dvolanana DNA ugra uje se u genom domaina.
asimetrina
prepisuje se samo nekodirajui lanac - kalup (3 5) novonastala RNA jednaka je kodirajuem (smislenom) lancu, a komplementarna kalupu
Za razliku od DNA, RNA ima OH skupinu na 2 C atomu
5 ACTGGGCATGCTAGAATGCAGGTAATTGCCG
DNA
TGACCCGTACGATCTTACGTCCATTAACGGC
mRNA
ACUGGGCAUGCUAGAAUGCAGGUAAUUGCCG
prokariotski promotor
kalup DNA CAAT-slog (ponekad je prisutan) TATA-slog (Hognesov slog) poetak RNA
eukariotski promotor
Slijed nukleotida u svim promotorima nije identian, ve postoje odre ene slinosti na osnovi kojih je modeliran usuglaeni slijed (engl. consensus sequence). Gotovo svi promotori od usuglaenog slijeda razlikuju se u svega jednom ili dva nukleotida.
Stvaranje specifine strukture koju nazivamo ukosnica (engl. hairpin) iza koje se nalazi niz uridina signal je za prestanak transkripcije kod E. coli.
Genetiki kod je skup pravila koji odre uje prevo enje slijeda nukleotida u slijed aminokiselina
kodon
standardni kod
mitohondrijski kod
prokariotski START-signal
Prvi AUG od 5 kraja kapa
eukariotski START-signal
formil-metionin
introni
-globinski gen
transkripcija sinteza 5-kape poliadenilacija
Usporedba sljedova visoko-ouvanih gena kod raznih organizama pokazala je da su introni vjerojatno postojali u praiskonskim genima i da su ih tijekom evolucije izgubili oni organizmi koji su selektirani za brzi rast (primjerice prokarioti).
kapa
-globinska mRNA
Mijeanjem egzona (engl. exon shuffling) nastaju nove kombinacije koje proiruju genetiki repertoar
rekombinacija