1. Apakah yang dimaksud dengan CoMSIA ? Jelaskan !

CoMSIA (Comparative Molecular Similarity Indices Analysis) merupakan salah satu deskriptor 3D-QSAR yang lebih baru. CoMSIA dikembangkan di BASF Ludwigshafen, Jerman oleh Klebe dkk. Tehnik ini paling sering digunakan untuk menemukan parameterparameter umum yang penting dalam pengikatannya dengan reseptor biologis yang relevan. Dalam CoMSIA, baik parameter sterik maupun elektronik, ikatan donor hidrogen, ikatan akseptor hidrogen dan parameter hidrofobik perlu dipertimbangkan.

2. Apakah yang dimaksud dengan CoMFA ? Jelaskan ! CoMFA (Comparative Molecular Field Analysis) atau perbandingan medan molekuler merupakan metode 3D-QSAR. Analisis 3D-QSAR

dikembangkan sebagai antisipasi permasalahan yg terdapat pada metode LFER Hansch, yaitu senyawa-senyawa enantiomer yang memiliki kuantitas sifat fisika kimia sama, namun aktifitasnya berbeda. Efek stereokimia memegang peranan penting disini. Melalui CoMFA dapat dilakukan perhitungan atau analisis terhadap parameter-parameter 3D-QSAR yang meliputi : panjang ikatan, pasangan ikatan, dan energi eksitasi. CoMFA menggunakan tehnik hubungan kuantitatif antara aktifitas biologis dari sekelompok senyawa deret homolog dengan sifat tiga dimensinya yang berkaitan dengan sifat elektronik dan sterik. Struktur eletronik dari suatu molekul dapat memberi gambaran dari sifat molekul tersebut, mengingat elektron-elektron pada atom dalam suatu molekul berpengaruh terhadap interaksi antara obat dengan reseptor. Dalam metode CoMFA, efek sterik, elektrostatik, luas permukaan, hidrofobisitas dan ikatan hidrogen dari molekul dihubungkan pada deskripsi molekuler spesifik. Selain berkaitan dengan nilai sterik dan elektronik, CoMFA juga dilengkapi dengan nilai ClogP yaitu parameter hidrofobik dari ligan. Dalam analisis CoMFA, ligan ditempatkan dalam struktur 3D kemudian parameter sterik dan elektrostatik dari berbagai grid points dihitung. Biasanya bagian matriks dianalisis dengan metode PLS (Partial Least Squares).

3. Apakah perbedaan dan persamaan CoMFA dan ComSIA ?

PERSAMAAN : Merupakan metode 3D-QSAR. Keduanya menggunakan tehnik hubungan kuantitatif antara aktifitas biologis dari sekelompok senyawa deret homolog dengan sifat tiga dimensi yang berkaitan dengan sifat elektronik dan sterik. Korelasi keduanya sama-sama dapat dihitung menggunakan metode statistik PLS (Partial Least Squares). PERBEDAAN : Kontribusi relatif CoMFA : sterik, elektrostatik, dan ClogP sedangkan kontribusi relatif CoMSIA meliputi : sterik, elektrostatik, hidrofobik, donor-aseptor sterik dan donoraseptor elektrostatik. Parameter hidrofobik tidak digunakan dalam CoMFA, namun digunakan dalam CoMSIA. 4. Apakah yang dimaksud dengan training set ? Training set adalah masa coba-coba yang dilakukan oleh peneliti ketika menentukan suatu model QSAR. Dengan adanya training set, model HKSA akan dikembangkan lebih lanjut sehingga dapat menentukan korelasi menggunakan variabel bebas dan variabel terikat (parameter-parameternya). Dalam training set, dipilih beberapa set senyawa tertentu yang harus berbeda dari senyawa-senyawa yang terdapat dalam test set.

5. Apakah yang dimaksud dengan test set ? Test set adalah data yang independen dari data training set. Test set merupakan senyawa yang diamati yang untuk memvalidasi dan memperkirakan keakuratan suatu data.

DAFTAR PUSTAKA

Dwi, Harno P. 2009. Peran Kimia Komputasi dalam Desain Molekul Obat. Yogyakarta: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Gajah Mada Khadke, A.P dkk. 2011. 2D-QSAR Study of Novel Oxazoline Benzyl Ester Derivatives As Anti-Tuberculosis Agents. International Journal of Pharmacy and Biological Sciences. 2011, 1 (4) 501-509 Robert, Paul M.W dkk. 2008. Hubungan Kuantitatif Struktur Elektronik Aktivitas Senyawa Antimalaria Turunan Artemisinin Dengan Pendekatan Regresi Komponen Utama. Indo. J. Chem. 2008, 8 (3), 404 410 Suh, Myung-Eun dkk. 2002. Comparison of QSAR Methods (CoMFA, CoMSIA, HQSAR) of Anticancer 1-N-Subtituted Imidazoquinoline-4,9-dione Derivatives. Bull. Korean Chem. Soc. 2002, 23 (3) 417-422