Metabolismo bacteriano Existe una diversidad de opciones para extraer energa a las bacterias.

Metabolismo Por lo general todas las bacterias o en general todas las clulas requieren de energa para vivir y esta energa se trasportan atravs de molculas que es el ATP, mediante el clivaje de enlaces ricos de energa, la cual es liberada y utilizada en reacciones biosintticas para sintetizar constituyentes para el crecimiento y divisin, en el cual se debe netamente a la ocupacin de todos sus componentes, como la membrana citoplasmtica, la pared celular, que ya vimos que bastante compleja. Cuando hay un proceso de crecimiento, debe aumentar el contenido de estos bloques estructurales, para eso se requiere de ATP, son reacciones de anabolismo. El trasporte, yo le mencionaba que en la membrana citoplasmtica, hay protenas de transporte que se encarga del transporte de nutrientes hacia el interior o la bacteria secreta al exterior alguna toxina, esa toxina es disipada al exterior. Muchas veces hay un tipo de transporte que es activo y requiere de energa para que ocurra. Existen algunas bacterias que tenian flagelos, estos flagelos requieren de protenas motoras que requieren ATP, por lo tanto todas las funciones celulares requieren de un flujo importante de energa. Cmo producen la energa los microorganismos? Hay dos posibilidades fermentacin o respiracin. La respiracin puede ser aerbica o anaerbica. Miles de reacciones ocurren diariamente en las clulas y las podemos agrupar en dos grandes categorias, como las reacciones : Anabolismo, que ya hice alusin a ellas en la sntesis de nuevos constituyentes celulares, nuevos compuestos, sntesis toxinas los LPC todos los que requieren sintetizar, requieren de uso de energa o de ATP Catabolismo, de degradacin en la cual en el caso de la glucosa ocurren oxidaciones y degradaciones de compuestos qumicos para extraerles la energa. Para extraer energa existen otros mtodos como transportadores de electrones. La glucosa es un azcar de 6 carbonos y este proceso de oxidacin tambin se va ligando entre anillos, y generan esqueletos de 3 carbonos de 2 carbonos, como el grupo acetilo que transporta la acetil co enzima A, que se usan para la sntesis de nuevos constituyentes orgnicos. En una clula puede estar ocurriendo de una forma sinrgica una reaccin catablica y una anablica.

Este es el esquema la adenosin trifosfato:

Destacar que la energa provine del clivaje de estos fosfatos, por este enlace fosfodiester es rico en energa. Nicotilamina dimina trinucleotido es una molcula, un transportador de electrones que va a extrayendo por reacciones de oxidacin los electrones de las vias metabolicas y estos electrones pueden servir para la sntesis de lpidos, donde hay que hacer dobles enlaces. ( pregunta si vimos ciclo de krebbs, hemolisis, fosforizacin oxidativa. Aqu vemos lo mismo, sntesis de ADP y como este clivaje de fosfodiester libera un gran contenido de energa que se utilizan en reacciones anabolicas para formar macromoleculas, a partir de precursores. Y va de la mano con reacciones de catabolismo, donde usamos un carbohidrato para liberar sus productos de desecho como el CO2, amoniaco, en el que en este proceso de oxidacin se extrajo ATP y electrones a travs de estas molculas. Fuentes Energa Bueno uno puede clasificar los microorganismos dependiendo de la fuente que usen para extraer energa. Luz solar fototrofos que son capaces de fijar los fotos que vienen de la luz natural Tambin existen organismos que no pueden hacer esto, organismos ambientales que subsistir en la tierra en diferentes habitats del planeta Hay otros organismos que captan la energa de medios qumicos, como la glucosa por ejemplo, son organismos Quimiototrofos. Fuente de Carbono Otra forma de clasificacin la forma como extraen los carbonos, porque ellos van a necesitar carbono, ya que es un elemento fundamental de los constituyentes orgnicos, por ello todos o la gran mayora de los constituyentes que forman parte de la clula y que se van a sintetizar toxinas u otros constituyentes, la mayora de su contenido es carbono, por lo tanto es fundamental. Hay microorganismos que por lo general son ambientales que logran fijar el CO2 atmosfrico y hablamos de microorganismos auttrofos, sin embargo los que requieren sustancias organicas, como la glucosa, fructosa, para mediante ruptura y oxidacin extraer el carbono, se llaman heterotrofos.

En esta tabla junta ambas clasificaciones, fuente de energa y fuente de carbono:

Los que nos importan a nosotros son los quimiohetertrofos, porque obviamente la mayora de los microorganismos que impactan en la salud humana, extraen la energa de de compuestos qumicos y fijan el CO2 de compuestos orgnicos, osea extraen el carbono. Este esquema muestra el mismo tema pero en relacin al aceptor final de electrones, porque cuando ocurre la fosforilacin oxidativa en una clula eucarionte, todo el poder reductor se transporta en un transportador de electrones como el NADH, que ingresa a la mitocondria y mediante una serie de transportadores que son los citocromos se van a sintetizar las molculas de ATP, que es el mayor contenido energtico en un clula dentro de un metabolismo se genera en la fosforilacin oxidativa y los electrones pirmides ceden al oxgeno en condiciones aerbicas, pero en los microorganismos tenemos diversidad hay bacterias que no viven en presencia del oxigeno, por lo tanto tienen metabolismos alternativos y ac incorpora esta clasificacin, cuando el aceptor final de electrones es el oxigeno habla de metabolismo aerobio ( en todos los animales, hongos, protozoos y bacterias), sin embargo cuando el aceptor final de electrones no es el oxigeno tenemos dos alternativas o es un compuesto orgnico hablamos del proceso de fermentacin y cuando ocurre la fosforilacin oxidativa pero en vez de ceder los electrones al oxigeno la alternativa es que se cedan a otro compuesto inorgnico diferente de este, hablamos de respiracin anaerbica, porque opera respiracin oxidativa pero en condiciones de anaerobiosis, que es la presencia del oxigeno. La fosforilacin oxidativa de las bacterias ocurre en la membrana plasmtica, no tiene mitocondrias las bacterias. Diferentes alternativas de remplazo de oxigeno da la diversidad metablicos, esto se trata de reproducir en el laboratorio como tcnica de diagnostico para ir identificando que microorganismo puede venir. En una muestra biolgica uno recurre a medios artificiales donde uno va variando los niveles de un compuesto metablico y as va armando un arbolismo diagnostico.

Catabolismo de carbohidratos como ejemplo tenemos al glucosa, pero sin olvidarnos que en bacterias hay un sin numero de alternativas, hay 3 vas principales en los microorganismos: * Via glicolisis o glucolisis, que lleva el nombre de sus descubridores EmdemMeyerhoff-Parnas (EMP) favorece la produccin de ATP * Va de las pentosos Fosfato (PPP) o shunt de las pentosas que es una va alternativa que tb ocurre en las celulas eucariontes. Cuando hay exceso energa y disponibilidad de nutrientes en la clula, esta dice que esta en optimas condiciones para crecer, entonces esta va alternativa, tiene la ventaja que se favorece la produccin de precursores por ej de los ac nucleicos, precursores aa, por lo tanto aumenta la cantidad de precursores de componentes celulares . puede ocurrir en aerobiosis o anaerobiosis. * Va del 2ceto 3 deoxi 6 fosfogluconato o Entner Doudoroff , propio de porcariontes, permite al microorganismo usar otro tipo de nutrientes, acido aldonico, y otros variantes que no pueden entrar a la va de la glicolisis Sntesis ATP clula Fosforilacin oxidativa por tranporte de los citocromos, en los eucariontes ocurre en la membrana citoplasmatica, pero tambin hay 2 paso importantes que producen moleculas de ATP en la glucolisis, en la primera etapa es la oxidacin de un compuesto para generar otro se habla que esta ATP se formo por fosforilacin a nivel de sustrato.

Glucosa en aerobiosis ( en presencia de oxigeno) Intemediarios: menor cantidad de carbonos,, 3PGA =3; PEP= 3; acetil CoA=2

Exoenzimas: en el espacio periplasmatico , secretan enzimas que degrada proteinas, lipidos (lipazas) carbohidratos (galactosidazas), degradan componentes estrucutrales de mayor tamao a estructuras de menor tamao proteinas polipptidos; lipidos ac grasos glicerol. Crean sustancias que puedan entrar en las vas metablicas, que puedan extraer energa, poder reductor y en general intermediarios metabolicos que puedan inducir a la sntesis de otros compuestos. Las vas mencionadas anteriormente convergen en la produccin de piruvato o ac piruvico y adems de metabolitos, el cual puede entrar a fermentacin si la bacteria tiene las enximas para fermentar. En aerobiosis hay bacterias que pueden fermentar, hay otras que no. Tambin puede ocurrir la respiracin en aerobiosis con la energa que se entregan electrones al oxigeno, o si ocurre en anaerobiosis, se ceden electrones a otros nucleones.

Este es un resumen de un metabolismo en presencia de oxigeno de bacterias que tienen este metabolismo, van de la glicolisis..( lee el cuadro) En ausencia de oxigeno puede que vaya de la fermentacin, que no se genera mas ATP del que se genero arriba. Se generan 2 ATP y 2 NADH oxidado, si este componente no cede los electrones, las molculas son restringidas en un NADH oxidado, si este componente no cede los electrones no sera un proceso continuo de ingreso de energa, por lo tanto que se produzca fermentacin en un microorganismo no es por ms energa sino que es toda una aplicacin, que permite que el proceso sea fsico, porque se regenera una mayor cantidad de energa. Hay ms tipos de fermentacin y su nombre va a estar dado por el principal producto que se genera, aqu entras las 2 molculas de piruvato ms el poder del reductor de ac, los electrones creen enlaces y generan cido lctico. Gluclisis ocurre en citoplasma. No organelos en bacterias.

(Vuelve a mirar el cuadro y lee la cantidades de ATP en cada etapa) Slo algunos tiene estas vas, lo que lo va delimitar de otras, por ej bacterias que dependen de la glucosa en ausencia de esta va a morir. En comparacin una que si tiene la glucosa va a generar otros componentes o ac aldnicos. ( NADH), es una ventaja, ya que se adapta a otros entornos y da diversidad. Hay algunos que slo ocupan la gluclisis o pueden ocupar la Va entner- Doudoroff. Mejor.. formacin en la va, pero en medios in Vitro al generar los medios que darn los nutrientes al no estar la glucosa la bacteria no va a expresar la enzima, por lo tanto la voy a diagnosticar en forma herrada. Esto da que expresen ciertas vas, se da serotipo v/s genotipo, tiene la informacin de la va pero no se va a expresar fenotpicamente, porque optimiza recursos energticos no va a estar dispuesto a expresar alguna protena, que no necesitan sintetizar por ejemplo timina porque est en el medio, ellas modulan su expresin de acuerdo a los requerimientos del entorno. (se va a tener en gentica y nutricin ) En la fermentacin el ltimo aceptor de electrones es un compuesto orgnico se generan 2 ATP, importante es que se oxidan nuevamente las enzimas reductivas. Un ATP no reaccionan en el proceso, esto es fundamental, porque hay bacteria que pueden fermentar estando presente el oxigeno, porque no son sensibles a el, pero no lo ultilizan, por lo tanto el ATP que genera es a travs de la fosforilacin nivel de sustrato en las dos etapas de la gluclisis. El NADH y el FHAD es el beneficio de que las bacteria fermenten, dentro de las reacciones de fermentacin, se incluye este poder reductor, tanto en su forma productiva o que se oxide, para activarlo puede continuar la gluclisis. En una oxidacin aerbica, se oxidan en el ciclo de krebbs, usan a la mitocondria en una clula eucarionte y a la fosforilacin oxidativa de la membrana plasmtica en las bacterias.

En el caso de le fermentacin no hubiese fermentacin si no hubiese habido antes oxidacin. Por ende la forma de energa se acaba si se acaba la forma oxidada. As dentro de la serie de reacciones que tiene cada tipo de fermentacin, su finalidad es sustituir el estado oxidado, para que vuelvan a funcionar ac y se genere energa constante. Es un proceso continuo Dependiendo del producto de la fermentacin es el nombre que recibe, ac -Bacterias que producen ciertas fermentaciones, importancia caries. EJ: fermentacin lctica: streptoccus mutans. Algunas levaduras como, Sacaronil, que son hongos, pero que tienen actividad biotecnolgica en la elaboracin de las cervezas, ya que al fermentar produce el etanol. Esta fermentacin pruduce cido provionico y su fermentacin provionica. Enterobacterias en el tracto intestinal, que se relaciona con la fermentacin mixta, porque adems genera otro tipo de cido, adems del lctico. Otro medio de metabolismo que puede tener las bacterias es la gliclisis de kreebs, que tienen una oxidacin o fosforilacin oxidativa, pero el aceptor final no es el oxgeno, hablamos de reacciones anaerbicas, donde el aceptor final puede ser el un sulfato, fosfato o el CO2, incluso algunos productos que se generan tienen un olor caracterstico, hay bacterias que tienen olor bien desagradable, sobre todo los que estn en la cavidad bucal, que tienen cierta fermentacin dependiendo del medio, as en condiciones anaerbicas no van a estar expuestas sino van a estar en la parte ms interna donde no pueda llegar el oxigeno y pueda generar sus productos y olor caracterstico propio. Es importante que cuando vean las diferentes familias vean que son aerobios o anaerobios y los tipos de fermentacin que pueda haber.

Esta es un cuadro resumen donde diferencia la respiracin aerbica de la anaerbica y de la fermentacin. Cul es el aceptor de electrones y como se genera el ATP. El mismo piruvato se condensa dos molculas de piruvato, con los electrones del NAD se generan enlaces y se genera el piruvato. Va de las pentosas Va alternativa. Cuando hay exceso energa y disponibilidad de nutrientes en la clula, esta dice que esta en ptimas condiciones para crecer, y para crecer necesita de sustancias bsicos, por lo tanto esta va entra a la glucosa y se genere precursores de autonutrismo, para captar energa se generan vas que se conectan con la gluclisis.

No es que este en un esquina cada uno sino que estn todos conectados,. Uno de los precursores esncialas para estas vas son los niveles de ATP, esto quiere decir si hay aumento de ATP se estimula una va, si falta ATP se estimulan otras. Aqu vemos una va catablica como es la gluclisis y el ciclo de kreebs, donda la glucosa va denigrndose en compuestos orgnicos de menor tamao , donde ocurre la accin de oxidacin y la extraccin de energa. Sus pasos o la mayora de ellos estn vinculados a una reaccin o una serie de ellas , en las que se utilizan estos componentes para la sntesis de carbohidratos, sntesis de ciertos nucletidos que tienen carbohidratos en su estructura, el mismo peptidoglicano que es el componente de la pared celular, glicogeno cuando la bacteria tiene metabolismo oxidativo muy estricto y se van introduccin por los grnulos de intrusin siendo las clulas nutritivas. Aminocidos , la produccin de cido lctico y sntesis de lpidos, por lo tanto estas vas estn interconectadas. Las 3 vas aportan con precursores de aminocidos. En general estos 2 esquemas sintetizan todo lo que hemos hablado.

En el caso de la respiracin aerbica, el compuesto orgnico es degradado y en todas estas etapas compuestos intermediarios van sacando carbonos. En cada etapa se pueden usar compuestos intermediarios. En estas etapas hay un flujo de electrones mediante el cul se puede usar la energa para la sntesis de ATP, todo converge en libera de oxgeno y de desechos. En el caso de oxidacin anaerbica, tambin tenemos un flujo de carbono hasta liberar CO2, en que cada paso se puede ir utilizando compuestos intermediarios para reacciones de biosntesis y tambin para generar un flujo de electrones para la sntesis de ATP, pero el aceptor final es un compuesto orgnico. En la respiracin anaerbica va ocurrir fosforilacin oxidativa y el aceptor final va a ser otro compuesto inorgnico.

En base del requerimiento o la dependencia de oxigeno o el dao que pueda ocasionar a un microorganismo tambin se usa como medio de clasificacin y diagnostico, junto con la tincin de gram, que se hablo la clase pasada. Al recibir una muestra y que nos permite tambin clasificar si son sensibles o no al oxigeno. Como producto del metabolismo que utiliza oxigeno se generan radicales libres, de hecho obviamente tambin el crecimiento celular esta dado por la generacin de radicales libres que tambin van dao las membranas que se ven alteradas, eso ocurre en todo tipo celular. Algunos de los productos txicos del metabolismo o oxigeno son el peroxido de hidrogeno y el anin superoxido, ahora si una bacteria usara uno de estos productos el complejo T de estas enzimas, como esta esquematizado, la catalasa o algunas oxidasas como peroxidasas que le permiten inactivar estos compuestos txicos y transformarlos en agua. Una bacteria por composicin gentica no puede generar esta enzima, va a ser sensible a la presencia de oxigeno, ideal cuando se produce el metabolismo anaerobio o facultativo. Pruebas Estas son las pruebas que se realizan rpidamente en el laboratorio en el que uno realiza en un portaobjeto la suspensin de una colonia de bacterias y adiciona agua oxigenada, si la bacteria tiene la catalasa que es la enzima, y esta transformando el peroxido en agua junto con la liberacin de burbujas. Existen catalasas nicas y que permiten clasificar a los microorganismos. Existen reactivos que nos permiten conocer si la bacteria tienen o no oxidasa. Si tiene oxidasa un microorganismo significa que puede inactivar los radicales libres. Ocurre reaccin slo cuando se tiene esta enzima. Requirimiento de oxigeno En base a este tipo de clasificacin esta la nomenclatura utilizada. Hablamos de bacterias o microorganismos anaerobios y aerobios. Aerobios Obligados: que el bioflim retiene el oxigeno para susistir. Porque haran la fosforilacion oxidativa y requieren de oxigeno atmosferico a 1 atm y contenido de oxigeno al 21 %. Microaeroflicos: necesitan oxigeno pero no a presin atmoesferica si no a menores. Parte de la enzima inactiva los readicales, por esto cuando crecen en el laboratorio se debe producir las condiciones termo-atmosfericas propios del habitat de estos microorganismos, con presencia de oxigeno ( requieren menos que los anteriores) Lactilobacter es una enterobacteria que genera cuadros de diarrea en este tipo de metabolismo.

Anaerobios Facultativos: que tambin los van a encontrar en libros como aerobios facultativos. SE llama as porque tiene ambas posibilidades. Va a depender si es aerobio lo va a ser porca genera ms ATP (mejor) si no hay oxigeno fermenta. Ejemplo: E. coli. Aerotolerantes: su metabolismo es anaerobio pero si esta el oxigeno le da lo mismo porque tiene enzimas que pueden desactivarlo, pero no genera fosforilacin oxidativa. Anaerobio obligados: no toleran el oxigeno, por ende no tiene enzimas y mueren en presencia de el. Son segmentadotes metabolismo segmentativo.

Uno en el laboratorio en forma artificial puede reproducir diferentes medios de cultivos para identificar o diagnosticar ciertos microorganismos, taxonomicamente basado en todas las diferencias que vimos, generando una batera de cultivo, donde en cada uno se pondrn compuestos metabolizables distintos. Luego se hace una lectura de estos y nos vamos a dar cuenta que se produce un cambio en el ph. As nos permite saber si una bacteria creci en un medio u en otro. Otro indicador.. es el cambio de color de la colonia. Otro medio es el unifolio que es una gelatina blanda, que tiene un componente que se llama acido glicolato, el cul reduce el contenido de oxigeno en el medio paulatinamente. As se puede observar cuando se genera el mayor crecimiento bacteriano y en esta etapa se inocula. Esto depende de su metabolismo, as si es: Aerobio obligado: crecimiento superficie Anaerobio facultativo: crecimiento superficie Anaerobio obligado: crecimiento en la base del tubo o agar. Anaerobio aerotolerante: le da lo mismo, tolera el oxigeno. Forma virtual en que los medios controlados podemos ver o clasificar estas bacterias.

Makarena Ojeda Toledo.