Professional Documents
Culture Documents
Colloque de
lAssociation Franaise
de Cristallographie
Bordeaux 2 5 juillet
Programme et rsums
- 2 -
- 3 -
Chres et chers collgues,
Nous vous souhaitons la bienvenue au Congrs AFC2013 de l'Association
Franaise de Cristallographie, qui se tiendra dans la belle ville de
Bordeaux qui avait dj accueilli le Congrs de l'IUCr en 1990.
Le Comit Scientifique a organis un programme riche et vari de
confrences plnires, de sessions thmatiques ou interdisciplinaires et de
rencontres autour de posters. Les scientifiques de nombreuses disciplines
utilisant la cristallographie ou la cristallogense dans leurs recherches
pourront y dcouvrir les rsultats les plus rcents et partager leurs points
de vue.
L'AFC a pour tradition de mettre l'honneur les jeunes chercheurs, qu'elle
soutient par des prix et des bourses. L'AFC2013 sera l'occasion de la
remise du prix de Thse nos laurats 2012, qui y prsenteront leurs
travaux. Un jury slectionnera galement les meilleurs posters, qui
l'AFC remettra un prix. A noter cette anne une initiative indite, "Meet
the experts", o doctorants et jeunes chercheurs sont invits venir
rencontrer des chercheurs confirms et leur poser toutes les questions qui
leur tiennent cur.
Nous comptons sur votre prsence l'Assemble Gnrale, un vnement
majeur de la vie de notre Association. Le Conseil d'Administration vous y
prsentera le bilan de sa mandature qui s'achve et changera avec vous
sur les perspectives futures, en particulier les prparatifs de l'Anne
Internationale de la Cristallographie en 2014.
Le Comit d'Organisation a enfin dploy tous ses efforts pour complter
ce programme par des soires conviviales, qui devraient achever, nous
l'esprons, de faire de l'AFC2013 Bordeaux un "Grand Cru" tous les
gards.
Au plaisir de vous y retrouver en personne,
Jacqueline Cherfils, Prsidente du Comit Scientifique
Alain Dautant, Prsident du Comit d'Organisation
- 4 -
Remerciements
Le comit local dorganisation tient remercier tout spcialement toutes celles
et ceux sans qui ce congrs naurait pas t possible :
Martine Galian, Catherine Alves-Magalhaes Isabelle Nicolas, (Service de
Gestion de lIBGC),
Lydie Goutire (Services gnraux de lIBGC),
Axel Catouillart et Jean Baptiste Maurange (Service informatique de lIBGC),
Annie Nadeau et Guillaume Moissonni (Cellule Colloque la DR 15 du
CNRS),
Jean-Louis Hodeau (Grenoble) qui vous a propos lexposition dans le Hall de
lENSCBP,
Mireille Frimigacci (Responsable HSE, ENSCBP),
Marie Hnault (Responsable Cellule Congrs de lUniversit Bordeaux
Segalen),
lAFC et le conseil scientifique de lAFC 2013,
les chairs et les co-chairs pour lorganisation des sessions,
les confrenciers qui ont bien voulu accepter linvitation,
les organismes qui nous ont soutenus,
les partenaires,
et tous les participants au congrs de lAFC 2013.
- 5 -
Le Comit Scientifique
Jacqueline Cherfils, prsidente (LEBS, Gif, AFC)
Ren Guinebretire, vice-prsident (SPCTS, Limoges, AFC)
Nathalie Audebrand (ESI, Rennes)
Yves Bourne (AFMB, Marseille)
Alain Dautant (IBGC, Bordeaux)
Denis Gratias (ONERA, Paris)
Ivan Huc (IECB, Bordeaux)
Jean-Paul Iti (Soleil, AFC)
Mario Maglione (ICMCB, Bordeaux)
Claudine Mayer (Pasteur, Paris, AFC)
Olivier Perez (ENSI, Caen, AFC)
- 6 -
Le Comit Local dOrganisation
Alain Dautant, prsident (IBGC, CNRS)
Pierre Dechambenoit (CRPP, UB1)
Stephan Dubernet (IRAMAT-CRP2A, UB3)
Sbastien Fribourg (IECB-ARNA, INSERM)
Bernard Gallois (CBMN, CNRS)
Philippe Guionneau (ICMCB, UB1)
Elizabeth Hillard (CRPP, CNRS)
Ivan Huc (IECB-CBMN, CNRS)
Brice Kauffmann (IECB, CNRS)
Aline Lacoudre (ISM, UB1)
Eric Lebraud (ICMCB, CNRS)
Stphane Massip (Facult de Pharmacie, UBS)
Denise Mondieg (LOMA, UB1)
Stanislas Pechev (ICMCB, CNRS)
Thierry Toupance (ISM, UB1)
- 7 -
Organismes soutenant le congrs
- 8 -
LAssociation Bordelaise de Cristallographie
www.abc.u-bordeaux1.fr
La Rgion Aquitaine
region.aquitaine.fr
AVIESAN
www.aviesan.fr
LUniversit de Bordeaux 1
www.u-bordeaux1.fr
LUniversit Bordeaux Segalen
www.univ-bordeauxsegalen.fr
CNRS Dlgation rgionale Aquitaine
www.cnrs.fr
Le CROUS de Bordeaux
www.crous-bordeaux.fr
La CUB - Communaut Urbaine de Bordeaux
www.lacub.fr
Le Conseil Gnral de Gironde - CG33
www.gironde.fr
LIBGC
www.ibgc.cnrs.fr
LINSERM
www.inserm.fr
LIPB ENSCBP
www.enscbp.fr
LOffice de Tourisme de Bordeaux - OTB
www.bordeaux-tourisme.com
TransBioMed
www.transbiomed.u-bordeaux2.fr
Organismes soutenant le congrs
- 9 -
Partenaires
- 10 -
www.sourcedesabatilles.com
genomics.agilent.com
www.bruker.com
www.dectris.com
www.dutscher.com
www.dunnlab.de
www.elexience.fr
www.exploranova.com
www.inel.fr
www.moleculardimensions.com
Partenaires
- 11 -
www.mitegen.com
www.natx-ray.com
www.oxcryo.com
www.panalytical.com
www.rigaku.com
www.stoe.com
www.xenocs.com
Journal des sessions
- 12 -
Mardi 2 juillet
1A Matriaux fonctionnels (1) 15h00 16h30 A
MARIO MAGLIONE et CHRISTINE MARTIN
1B Surfaces et interfaces 15h00 16h30 B
GILLES RENAUD et DAVID BABONNEAU
1C Nouvelles structures en biologie 15h00 16h30 C
MIRJAM CZJZEK et LIONEL MOUREY
2A Chimie supramolculaire et Ingnierie molculaire 17h00 18h30 A
NATHALIE GUILLOU et IVAN HUC
2B Cristallographie pour les nanosciences 17h00 18h30 B
RENE GUINEBRETIERE et VALERIE DEMANGE
2C Enzymologie et dynamique 17h00 18h30 C
HERMAN VAN TILBEURGH et GERLIND SULZENBACHER
Mercredi 3 juillet
3A Croissance cristalline (GFCC) 10h30 12h00 A
ALAIN IBANEZ et FRANOISE BONNETE
3B Cristallographie rsolue en temps 10h30 12h00 B
MARYLISE BURON et SYLVAIN RAVY
3C La cristallographie sous conditions extrmes 10h30 12h00 C
ERIC GIRARD et JEAN-PAUL ITIE
4A Matriaux fonctionnels (2) 13h30 15h00 A
MARIO MAGLIONE et CHRISTINE MARTIN
4B Apriodicit, Structure module 13h30 15h00 B
BERTRAND TOUDIC et DENIS GRATIAS
4C Biologie structurale des gnomes 13h30 14h40 C
CLAUDINE MAYEr et ANNE-CATHERINE DOCK-BREGEON
4D Formation ReNaFoBis 14h40 15h00 C
JEAN CAVARELLI
Jeudi 4 juillet
5A Approches multitechniques en cristallochimie 10h30 12h00 A
NATHALIE AUDEBRAND et PASCAL ROUSSEL
5B Densit lectronique, modlisation 10h30 12h00 B
PHILIPPE RABILLER et MARIE-BERNADETTE LEPETIT
5C Cristallographie biologique et Sant 10h30 12h00 C
YVES BOURNE et MAGALI MATHIEU
6A/B Mthodes mergentes en cristallographie 13h30 15h15 A
OLIVIER PEREZ ET DAVID LE BOLLOC'H
6C Biologie Structurale Intgrative et gros assemblages 13h30 15h15 C
DINO MORAS et JACQUELINE CHERFILS
Vendredi 5 juillet
7A Cristallographie in situ, in operando 9h00 10h30 A
ERIK ELKAM ET BEATRICE GILLON
7B Texture, Microstructure, dformation 9h00 10h30 B
ALAIN LODINI ET DANIEL CHATEIGNER
7C GI Synchrotron et plateformes en biologie structurale 9h00 10h30 C
ANDREW THOMPSONet MICHEL KOCHOYAN
8A Chiralit, polymorphisme 11h00 12h30 A
GERARD COQUEREL et CHRISTIAN JARRY
8B De l'ordre local l'ordre longue distance 11h00 12h30 B
PIERRE-ANTOINE ALBOUY; ET PAULINE MARTINETTO
8C Dfis en cristallographie biologique - Success stories. 11h00 12h30 C
PHILIPPE DUMAS ET JULIE MENETREY
- 13 -
Programme
- 14 -
Programme
- 15 -
Mardi 2 juillet
10h00 14h00 Accueil et enregistrement des participants Hall de lENSCPB
Repas
12h00 13h30 Djeuner dans le hall de lENSCBP
13h30 14h00 Discours inauguraux et de bienvenue
ALAIN DAUTANT ; Prsident du comit local dorganisation
JACQUELINE CHERFILS ; Prsidente de lAssociation Franaise de Cristallographie
* * * * * * * * * * Confrence plnire I * * * * * * * * *
14h00 15h00 Amphi C
Chair : RENE GUINEBRETIERE, vice prsident de lAFC
IVAN HUC ; CBMN & IECB, Bordeaux
SP1 - Les foldamres : une expansion de l'espace chimique base sur l'analyse des
structures.
= = = Session 1A Matriaux fonctionnels (1)= = =
15h00 16h30 Amphi A
Chair : MARIO MAGLIONE; ICMCB, Bordeaux
Co-chair : CHRISTINE MARTIN; ENSI, Caen
15h00 CHRISTOPHE PAYEN; Institut des Matriaux Jean Rouxel, Nantes
O1 - Relations structure-magntisme dans le compos magnto-lectrique MnWO
4
.
15h30 JULIEN ROBIN; Institut des Sciences Chimiques Universit de Rennes 1
O2 - Synthse et structures cristallines de nouveaux polymres de coordination
chiraux base de fluorne pour la sparation et la catalyse nantioslective.
16h00 16h30 JEROME ROUQUETTE; CNRS Universit de Montpellier II
O3 - Origine de la fatigue ferrolectrique dans le zirconate-titanate de Plomb PZT.
= = = Session 1B Surfaces et interfaces = = =
15h00 16h30 Amphi B
Chair : GILLES RENAUD; ESRF, Grenoble
Co-Chair : DAVID BABONNEAU; Universit de Poitiers
15h00 YVONNE SOLDO-OLIVIER; LEPMI, Grenoble
O4 - SXRD in situ couple llectrochimie : tude de llectro-insertion dhydrogne
dans des nanofilms de Pd.
15h30 ALESSANDRO COATI; Synchrotron SOLEIL, Gif-sur-Yvette
O5 - Surfaces vicinales : des nano-gabarits pour croissance pitaxiale.
Programme
- 16 -
16h00 GABIN GBABODE; Universit de Rouen
O6 - Mise en vidence de phases induites par le substrat pour des msognes -
conjugus.
16h15 16h30 RENE GUINEBRETIERE; ENS de Cramique Industrielle, Universit de
Limoges
O7 - Etude de surfaces vicinales ordonnes par diffusion centrale des rayons X sous
incidence rasante. Nouveaux dveloppements sur la ligne BM02 lESRF.
= = = Session 1C Nouvelles structures en biologie = = =
15h00 16h30 Amphi C
Chair : MIRJAM CZJZEK; Station Biologique, Roscoff
Co-chair : LIONEL MOUREY; IBPS, Toulouse
15h00 MARIE-CHRISTINE VANEY; Institut Pasteur, Unit de Virologie Structurale Paris
O8 - Structure de l'ectodomaine de la glycoprotine d'enveloppe E1, dans sa forme
post-fusion, du virus de la Rubole.
15h30 SEBASTIEN FRIBOURG; Institut Europen de Chimie et Biologie, Bordeaux
O9 - Bases structurales de l'initiation de la transcription de l'ARN polymerase III.
16h00 CORALIE BOMPARD; Universit Lille 1
O10 - Analyse structurale par SAXS de SopB, un effecteur de type III de Salmonella
en complexe avec sa chaperonne spcifique SigE.
16h15 16h30 PASCAL ARNOUX ; CEA Cadarache
O11 - Bases structurales et fonctionnelles de la biominralisation de la magntite :
importance des domaines magntochromes.
Tout le monde rencontre tout le monde
16h30 17h00 Pause caf sponsorise par lABC Rencontre avec les partenaires
industriels Salle ChemInnov.
= = = Session 2A Chimie supramolculaire et Ingnierie molculaire = = =
17h00 18h30 Amphi A
Chair : NATHALIE GUILLOU; Institut Lavoisier, Versailles St-Quentin-en-Yvelines
Co-chair : IVAN HUC; CBMN & IECB, Bordeaux
17h00 NICOLAS MERCIER; MOLTECH-Anjou, Universit d'Angers
O12 - Analyse structurale dhybrides organique-inorganique et relations structure-
proprits : limportance de linterface et des liaisons faibles.
17h30 JONATHAN NITSCHKE; Cambridge University
O13 - Crystallography as a critical resource in metal-organic self assembly.
18h00 MARC FOURMIGUE; Universit de Rennes 1
O14 - La liaison halogne pour l'laboration d'architectures complexes: contribution
lectrostatique et rseaux d'anions (2D, 3D).
18h15 18h30 CLEMENT FALAISE; UCCS
O15 - Les carboxylates duranium ttravalents : prcurseurs du combustible nuclaire.
Programme
- 17 -
= = = Session 2B Cristallographie pour les nanosciences = = =
17h00 18h30 Amphi B
Chair : RENE GUINEBRETIERE; Universit de Limoges
Co-chair : VALERIE DEMANGE; Institut des Sciences Chimiques de Rennes, Rennes 1
17h00 ANNICK LOISEAU; Laboratoire d'Etude des Microstructures ONERA CNRS
O16 - Structure des nanostructures de nitrure de bore: quel impact sur leurs proprits
de luminescence ?
17h30 ETIENNE SNOECK; CEMES, Toulouse
O17 - Imagerie des champs de dformations par holographie lectronique.
18h00 PASCALE LAUNOIS, CRM2, Universit Paris Sud
O18 - Structuration de leau pendant le remplissage des nanotubes de carbone.
18h15 18h30 DOMINIK SCHANIEL, CRM2, Universit Nancy 1
O19 - Structure et dynamique de molcules isoles dans des matrices poreuses.
= = = Session 2C Enzymologie et dynamique.= = =
17h00 18h30 Amphi C
Chair : HERMAN VAN TILBEURGH; IBBMC, Universit Paris-Sud, Orsay
Co-chair : GERLIND SULZENBACHER; AFMB, Marseille
17h00 AUDE ECHALIER-GLAZER; CBS, Montpellier
O20 - Activation et activit du complexe COP9 signalosome.
17h30 MURIEL GONDRY; CEA, Saclay
O21 - Les synthases de cyclodipeptides (CDPS), des homologues daminoacyl-ARNt
synthtases impliques dans la synthse peptidique non ribosomale.
18h00 JULIEN HIBLOT; Facult de Mdecine Marseille
O22 - Promiscuit enzymatique lactonase/phosphotriestrase : implications volutives
et biotechnologiques.
18h15 18h30 VALERIE CAMPANACCI; LEBS Gif-sur-Yvette
O23 - Aperu structural du mcanisme enzymatique dAnkX, une protine de
Legionella pneumophila modifiant la petite protine G Rab.
Tout le monde rencontre tout le monde
18h30 20h30 Soire daccueil dans le hall de lENSCBP
Programme
- 18 -
Programme
- 19 -
Mercredi 3 juillet
* * * * * * * * * * Confrence plnire II * * * * * * * * *
9h00-10h00 Amphi C
Chair : JACQUELINE CHERFILS, prsidente de lAFC
9h00-10h00 Amphi C - RAY STEVENS, Department of Molecular Biology, Scripps, USA
SP2 - The Amazing Diversity of the Human GPCR Superfamily.
Tout le monde rencontre tout le monde
10h00 10h30 Pause caf Rencontre avec les partenaires industriels Salle ChemInnov.
= = = Session 3A Croissance cristalline (GFCC) = = =
10h30 12h00 Amphi A
Chair : ALAIN IBANEZ; Institut Nel, Grenoble
Co-chair : FRANOISE BONNETE, Universit d'Avignon et des Pays de Vaucluse
10h30 VALENTIN GORDELIY; IBS Grenoble
O24 - Cristallisation des protines membranaires in cubo.
11h00 PASCAL LOISEAU; Chimie Paris Tech / ENSCP Paris
O25 - Croissance, Structure et Optique Non Linaire Quadratique.
11h30 MARJORIE ALBINO; ICMCB Bordeaux
O26 - Etude structurale par diffraction des rayons X sur monocristaux relaxeurs de
Ba
2
LnFeNb
4
O
15
(Ln=La, Pr, Nd, Sm et Eu).
11h45 12h00 PIERRE GRAS; ENSIACET Toulouse
O27 - Synthse, caractrisation et croissance cristalline de cristaux de pyrophosphate
de calcium dintrt biologique.
= = = Session 3B Cristallographie rsolue en temps = = =
10h30 12h00 Amphi B
Chair : MARYLISE BURON; Universit Rennes 1
Co-chair : SYLVAIN RAVY; CRISTAL, Synchrotron SOLEIL
10h30 CAROLINE CURFS; ESRF, Grenoble
O28 -Etudes par Diffraction Rsolue en Temps de Phnomnes Irrversibles:
Application aux Synthses Auto-Propages.
11h00 PAUL BEAUD; SLS (Swiss Light Source)
O29 - Ultrafast structural dynamics in charge and orbitally ordered manganites under
non-equilibrium conditions.
Programme
- 20 -
11h30 12h00 CLAIRE LAULHE; Synchrotron-soleil
O30 - Diffraction pompe-sonde rsolue en temps sur la ligne de lumire CRISTAL
SOLEIL.
= = = Session 3C La cristallographie sous conditions extrmes = = =
10h30 12h00 Amphi C
Chair : ERIC GIRARD; IBS, Grenoble
Co-chair : JEAN-PAUL ITIE; Synchrotron SOLEIL
10h30 JULIEN HAINES; Institut Charles Gerhardt, Montpellier
O31 - Diffraction des rayons X sur monocristaux sous pression : application ltude
de structures complexes.
11h00 LOUISE LASSALLE; IBS Grenoble
O32 - Molecular basis of piezophilic adaptation.
11h20 NATHALIE COLLOC'H; CNRS CEA Universit de Caen, Centre Cyceron
O33 - Structure cristallographique de la neuroglobine sous pression.
11h40 12h00 PHILIPPE GUIONNEAU; ICMCB Bordeaux
O34 - Haute pression et cristallographie des matriaux molculaires conversion de
spin.
Repas
12h00-13h30 Djeuner dans le hall de lENSCBP
= = = Session 4A Matriaux fonctionnels (2)= = =
13h30 15h00 Amphi A
Chair: MARIO MAGLIONE; ICMCB, Bordeaux
Co-chair: CHRISTINE MARTIN; ENSI Caen
13h30 MATHIEU ALLIX; CEMHTI, Orlans
O35 -Cramiques transparentes par cristallisation complte du verre.
14h00 JEAN-MICHEL RUEFF; ENSI Caen
O36 -Matriaux hybrides base dargent et dacides phosphoniques et carboxyliques :
exploration de nouvelles architectures proprits bactricides.
14h20 LIANG TAO; Universit de Picardie
O37 - Crystal and Magnetic Structure of LiMBO
3
(M=Fe, Co, Mn).
14h40 15h00 ARNAUD GROSJEAN; ICMCB Bordeaux
O38 -Matriaux polymriques conversion de spin de type [Fe(R-trz)
3
]Xn:
Comportement structural et microstructural.
Programme
- 21 -
= = = Session 4B Apriodicit, Structure module = = =
13h30 15h00 Amphi B
Chair : BERTRAND TOUDIC; GMCM, Rennes
Co-chair : DENIS GRATIAS; ONERA, Chatillon
13h30 BERTRAND DEVOUARD; Observatoire de Physique du Globe, Clermont-Ferrand
O39 -Structures naturelles apriodiques et multimacles icosadriques. (30 min)
14h00 MARIANNE QUIQUANDON; LEM CNRS/ONERA, Chatillon
O40 - Etude de la filiation structurale entre les phases icosadriques F (Faces
Centres) et P (Primitives).
14h20 SYLVAIN RAVY; Synchrotron SOLEIL
O41 - L'homomtrie la lumire des faisceaux cohrents.
14h40 15h00 WERNER PAULUS; Institut Charles Gerhard, Universit de Montpellier 2
O42 - Limpact des corrlations structurales grande chelle pour la ractivit des
solides : l'exemple des oxydes AO(ABO
3
)n Ruddlesden-Popper.
= = Session 4C Biologie structurale des gnomes (interactions protines/ADN, ARN)= =
13h30 14h30 Amphi C
Chair : CLAUDINE MAYER; Institut Pasteur, Universit Paris 7, Paris
Co-Chair : ANNE-CATHERINE DOCK-BREGEON; ENS, Paris
13h30 MARIE-HELENE LE DU; Laboratoire de Biologie Structurale et Radiologie, CEA,
CNRS, Universit Paris Sud, Gif-sur-Yvette
O43 -Vers l'architecture du tlomre de la levure bourgeonnante par biologie
structurale intgrative.
14h00 VALERIE LAMOUR; IGBMC, Illkirch
O44 - Nouvelles informations sur le mcanisme de surenroulement de l'ADN obtenues
par cryo-microscopie lectronique d'une ADN gyrase complte.
14h20 14h40 JOANNA TIMMINS; IBS, Grenoble
O45 - Etudes structurales de la recombinaison homologue chez Deinococcus
radiodurans.
= = = 4D Formation ReNaFoBis = = =
14h40 15h00 Amphi C
Chair : JEAN CAVARELLI; IGBMC, Strasbourg
14h40 15h00 CLAUDINE MAYER; Institut Pasteur, Universit Paris 7
O46 - ReNaFoBis : Rseau National de Formation Doctorale en Biologie Structurale
Intgrative
Programme
- 22 -
* * * * * * * * * * Hommage Roger Fourme * * * * * * * * *
15h00 15h30 Amphi C
15h00 15h30 ERIC GIRARD; IBS, Grenoble
SP3 - Un hommage Roger Fourme
Tout le monde rencontre tout le monde
15h30 16h00 Pause caf Rencontre avec les partenaires industriels Salle ChemInnov.
16h00 17h00 Premire sance Poster
17h00 18h00 Transfert en TRAMWAY Ligne B
(Direction Bassins flot ou Claveau Station Victoire)
= = = = = = = = = = Confrence grand public = = = = = = = = =
Amphitatre Denigs
Universit Bordeaux Segalen
Place de la Victoire Bordeaux
18h00 : Photo de groupe sur le parvis de lUniversit de Bordeaux Segalen Site Victoire
18h15 Accueil par MANUEL TUNON DE LARA ; Prsident de lUniversit Bordeaux Segalen
18h25 AN-PANG TSAI, Tohoku University, Japan
SP4 - Quasicrystals : Structures, properties and applications
19h25 20h00 Rception dans latrium de lUniversit offert par lUniversit Bordeaux
Segalen
Programme
- 23 -
Jeudi 4 juillet
* * * * * * * * * * Confrence plnire III * * * * * * * * *
9h00-10h00 Amphi C
Chair : PASCAL ROUSSEL, vice-prsident de lAFC
MARC DE BOISSIEU, SIMAP, Grenoble
SP5 - Les quasicristaux : structure atomique et dynamique.
Tout le monde rencontre tout le monde
10h00 10h30 Pause caf Rencontre avec les partenaires industriels Salle ChemInnov.
= = = Session 5A Approches multitechniques en cristallochimie = = =
10h30 12h00 Amphi A
Chair : NATHALIE AUDEBRAND; Universit Rennes 1
Co-chair : PASCAL ROUSSEL; ENSC, Lille
10h30 PHILIPPE BOULLAY; CRISMAT, Caen
O47 - Combinaison des donnes de diffraction des lectrons et de diffraction des
rayons X poudre: que peut-on en attendre?
11h00 FLORENT BOUCHER; Institut des Matriaux Jean Rouxel, Nantes
O48 - Apport des calculs ab initio la rsolution des structures cristallines : intrt de
la modlisation en spectromtrie RMN et Mssbauer.
11h30 VALERIE DEMANGE; Universit de Rennes 1
O49 - Nanorods de niobates et niobo-tantalates de potassium pitaxis sur substrats
monocristallins : tude par diffraction des rayons X, diffraction des lectrons en
prcession et tomodiffraction des lectrons.
11h45 12h00 LUCY COOPER; Institut Lavoisier, CNRS Universit de Versailles St-
Quentin-en-Yvelines
O50 - Solides hybrides base de ligands dorigine naturelle : rsolution structurale via
une approche multitechnique diffraction / RMN .
= = = Session 5B Densit lectronique, modlisation = = =
10h30 12h00 Amphi B
Chair : PHILIPPE RABILLER; Universit de Rennes 1, Rennes
Co-Chair : MARIE-BERNADETTE LEPETIT; Institut Nel, Grenoble
10h30 NOUR EDDINE GHERMANI; Laboratoire Structures, Proprits de Modlisation des
Solides, Ecole centrale de Paris
O51 - Proprits lectrostatiques de molcules d'intrt pharmaceutique.
11h00 ALESSANDRO ERBA; Dipartimento di Chimica, Universit de Turin, Italie
O52 - Ab initio description of nuclear motion and dispersion effects on the electron
density matrix of crystals.
Programme
- 24 -
11h30 ENRIQUE ESPINOSA; CRM2, Universit de Lorraine
O53 - Les liaisons halogne et chalcogne pour l'ingnierie cristalline et la chimie
supramolculaire.
11h45 12h00 SAMIR BENTATA; Facult des Sciences et de la Technologie, Mostaganem,
Algrie
O54 - Ab-initio Study of structural, Electronic and Magnetic Properties of CdTe
Doped Transition Metal Co.
= = = Session 5C Cristallographie biologique et Sant = = =
10h30 12h00 Amphi C
Chair : YVES BOURNE; AFMB, Marseille
Co-chair : MAGALI MATHIEU, Sanofi, Chilly-Mazarin
10h30 WILLIAM BOURGUET; CBS, Montpellier
O55 - Mcanismes de reconnaissance et d'activation des rcepteurs hormonaux par les
perturbateurs endocriniens environnementaux.
11h00 THOMAS BERTRAND; Sanofi, Vitry sur Seine
O56 -Une approche structurale pour linhibition slective de PI3Kbeta.
11h20 VALERIE GUILLET; IPBS, Toulouse
O57 - Structure cristallographique de la protine FadD32 de Mycobacterium marinum,
une cible potentielle pour le dveloppement de nouveaux antituberculeux.
11h40 12h00 PASCALE MARCHOT; AFMB, Marseille
O58 - Toward closing the synaptic gap: a molecular approach to explore neuronal
connectivity deficiencies associated with autism.
Repas
12h00-13h30 Djeuner dans le hall de lENSCBP
= = =Session 6A/B Mthodes mergentes en cristallographie = = =
13h30 15h15 Amphi A
Chair : OLIVIER PEREZ; ENSI Caen
Co-chair : DAVID LE BOLLOC'H; LPS, Orsay
13h30 PIERRE BORDET; Institut Nel, Grenoble
O59 - Application de la Fonction de Distribution de Paires l'tude de matriaux
nano-cristallins ou mal ordonns.
14h00 JAN LNING; Universit Pierre et Marie Curie, Paris
O60 - Nouvelles possibilits exprimentales en physique introduites par les XFELs.
14h30 BERTRAND TOUDIC; GMCM, Rennes
O61 - Mthodes rapides pour analyser les dsordres structuraux statiques et
dynamiques dans limmense espace rciproque.
Programme
- 25 -
14h55 VINCENT JACQUES; LPS Universit Paris Sud
O62 - Dfauts de phase dans les cristaux lectroniques tudis par diffraction
cohrente des rayons X.
15h15 15h30 NICOLETA GALATANU; Xenocs
O63 - La socit Xenocs
= = = Session 6C Biologie Structurale Intgrative et gros assemblages = = =
13h30 15h15 Amphi C
Chair : DINO MORAS ; IGBMC, Illkirch
Co chair : JACQUELINE CHERFILS; LEBS, Gif-sur-Yvette
13h30 YVES MECHULAM; Ecole Polytechnique Palaiseau
O64 - Dmarrage de la traduction chez les eucaryotes et les arches : le facteur e/aIF2.
14h00 NICOLAS GARREAU DE LOUBRESSE; Equipe Marat Yusupov, IGBMC Strasbourg
O65 - Crystal structure of the eukaryotic 80S ribosome.
14h30 ZEINEB FOURATI-KAMMOUN; Ecole Polytechnique, Palaiseau et IBBMC, Orsay
O66 - Etude structurale et fonctionnelle de la protine Pat1 de Saccharomyces
cerevisiae.
14h50 LUDOVIC SAUGUET; Institut Pasteur, Paris
O67 - Dtermination des bases structurales du mcanisme de permation des ions chez
les rcepteurs-canaux pentamriques de la famille Cys-loop.
15h10 15h30 MARC RUFF; IGBMC, Illkirch
O68 - Etudes structurales et fonctionnelles du complexe de pr-intgration du VIH-1.
Tout le monde rencontre tout le monde
Meet the experts
15h30 16h00 Amphis A/B
Jeunes chercheurs, venez rencontrer et poser vos questions des chercheurs et diteurs de
l'AFC:
Comment choisir le "bon" journal ?
Comment rdiger une demande de financement ?
Etc
15h30 16h00 Pause caf Rencontre avec les partenaires industriels Salle ChemInnov.
16h00 17h00 Seconde sance Poster
= = = Assemble Gnrale de lAFC = = =
17h00 18h00 Amphi C
= = = Prix de thse 2012 de lAFC = = =
18h00 19h00 Amphi C
Confrences des trois Laurats des prix de l'AFC 2012.
Chair : ENRIQUE ESPINOSA ; Nancy
Programme
- 26 -
Chair : JACQUELINE CHERFILS; Prsidente de lAFC
Co-Chair : CLAUDINE MAYER; Vice-prsidente de lAFC
Co-Chair : RENE GUINEBRETIERE ; Vice-prsident de lAFC
Co-Chair : PASCAL ROUSSEL; Vice-prsident de lAFC
18h00 (GT Bio) - TRISTAN WAGNER ; Institut Pasteur, Paris
O69 - Contrle du mtabolisme central chez les mycobactries par la rgulation
allostrique de lalpha-ktoglutarate dshydrognase.
18h20 (GT Chimie) FLORIAN MOREAU; Laboratoire des Sciences Chimiques, Rennes
O70 - Cristallochimie de nouveaux polymres de coordination noyau spirobifluorne
ou ttraphnylmthane : du design du ligand la topologie et aux proprits du solide
hybrides.
18h40 19h00 (GT Physique) ERWAN PAINEAU; Institut National Polytechnique Lorraine,
Nancy
O71 - Transitions de phases cristal-liquides et comportement sous champs de
suspensions collodales d'argile naturelle.
19h00 20h00 Transfert en TRAMWAY Ligne B (direction Bassins flot ou Claveau,
Station CAPC)
20h00 23h00
Cit Mondiale du vin
Dner de Gala
Remise des prix des posters
Programme
- 27 -
Vendredi 5 juillet
= = = Session 7A Cristallographie in situ, in operando = = =
9h00 10h20 Amphi A
Chair: ERIK ELKAM; Synchrotron SOLEIL
Co-chair: BEATRICE GILLON; Laboratoire Lon Brillouin, CEA-CNRS, Saclay
9h00 MONICA CERETTI; Institut Charles Gerhardt, Montpellier
O72 - Structural complexity in (Re)
2
NiO
4+
: electrochemically controlled oxygen
intercalation reactions, explored by neutron and synchrotron scattering methods under
operando conditions.
9h30 LAURENCE CROGUENNEC; ICMCB, Bordeaux
O73 - Apport des tudes menes operando par diffraction et absorption des rayons X
la comprhension des mcanismes mis en jeu au sein des matriaux d'lectrode pour
batteries Li-ion.
10h00 10h20 OMAR KAMMOUN; Institut des Sciences Chimiques de Rennes
O74 - Structures lamellaires supramolculaires de sulfates hybrides : du design la
stabilit thermique et aux transitions de phases.
= = = Session 7B Texture, Microstructure, dformation = = =
9h00 10h30 Amphi B
Chair : ALAIN LODINI; LACM, Reims
Co-Chair : DANIEL CHATEIGNER; ENSI Caen
9h00 CHRISTOPHE WIERZBANOWSKI; Universit de Cracovie
O75 - Study of texture development in asymmetrically rolled titanium. Experimental
study and calculations.
9h30 VINCENT KLOSEK; CEA - LLB Saclay
O76 - Evolutions microstructurales et htrognits de dformation dans les aciers
ODS Fe-14Cr1W.
10h00 10h30 HLNE ROTELLA, ENSI Caen
O77 - Rsolution et affinement de structure dun film mince pitaxi de LaVO
3
.
= = = Session 7C Grands Instruments Synchrotron et plateformes
en biologie structurale - (Dveloppements, XFEL, nouveauts) = = =
9h00 10h30 Amphi C
Chair : ANDREW THOMPSON; Synchrotron SOLEIL
Co-Chair : MICHEL KOCHOYAN; CBS, Montpellier
9h00 JEAN DAILLANT; DSM/IRAMIS/SIS2M/LIONS CEA
O78 - La cristallographie SOLEIL.
Programme
- 28 -
9h30 Marie-EMMANUELLE COUPRIE; Synchrotron SOLEIL
O79 - FELs dans le monde, leurs proprits et avantages cf synchrotrons, et l'avenir
des projets en France.
9h50 JAN LNING; Universit Pierre et Marie Curie, Paris
O80 - Nouvelles possibilits exprimentales en cristallographie introduites par les
XFELs.
10h10 10h30 HASSAN BELRHALI; EMBL Grenoble
O81 - BM14-2: une ligne MX MAD lESRF avec de nouveaux outils pour exposer
des cristaux biologiques temprature ambiante.
Tout le monde rencontre tout le monde
10h30 11h00 Pause caf Rencontre avec les partenaires industriels Salle ChemInnov.
= = = Session 8A Chiralit, polymorphisme = = =
11h00 12h30 Amphi A
Chair : GERARD COQUEREL; TSHO, Rouen
Co-Chair : CHRISTIAN JARRY; Pharmacochimie, Universit Bordeaux Segalen
11h00 PHILIPPE ESPEAU; Laboratoire de Chimie Physique, Universit Paris Descartes
O82 - Formulations Pharmaceutiques et Polymorphisme
11h30 HOWARD D. FLACK; Genve, Suisse
O83 - Configuration absolue et structure absolue: notions de base et valuation.
12h00 12h30 PATRICK ROSA; ICMCB Bordeaux
O84 - Composs multifonctionnels : transition de spin et chiralit.
= = = Session 8B De l'ordre local l'ordre longue distance = = =
11h00 12h30 Amphi B
Chair : PIERRE-ANTOINE ALBOUY; LPS, Orsay
Co-chair : PAULINE MARTINETTO; Institut Nel, Grenoble
11h00 DOMINIQUE THIAUDIERE; Synchrotron SOLEIL
O85 - Apport du synchrotron pour des expriences combines DRX et XAS.
11h30 MICHELA BRUNELLI; ILL, Grenoble
O86 - Analyse par PDF (rayons X et neutrons) l'chelle nanomtrique des
inhomognits dans des oxydes de crium dops au rhnium.
12h00 12h30 CELINE MARIETTE; Institut de Physique de Rennes
O87 - Dsordre "quasi-liquide" de chaines d'alcane sous-confinement
subnanomtrique supramolculaire.
Programme
- 29 -
= = = 8C Dfis en cristallographie biologique - Success stories.= = =
11h00 12h30 Amphi C
Chair : Philippe Dumas; IBMC, Strasbourg
Co-chair : Julie Mntrey; LEBS, Gif-sur-Yvette
11h00 ANNE HOUDUSSE; Institut Curie
O88 - La myosine VI, un nanomoteur contre-sensMyosin VI.
11h25 JEAN-BAPTISTE CHARBONNIER; IBiTec, CEA Saclay
O89 - Control of the DNA mismatch repair and the meiosis recombination by
eukaryotic MutL homologs.
11h50 MIKAEL ELIAS; Weizmann Institute of Science, Rehovot Israel
O90 - La survie en milieu riche en arsniate : le mcanisme molculaire de
discrimination du phosphate.
12h10 12h30 JACQUELINE CHERFILS; LEBS, Gif-sur-Yvette
O91 - Integrated conformational and lipid-sensing regulation of ArfGEFs.
Repas
12h30-14h00 Djeuner dans le hall de lENSCBP
Clture de lAFC 2013
Au revoir
et
bientt
Programme
- 30 -
- 31 -
Rsums des
confrences plnires
SP1-5
et orales
O1-91
- 32 -
Session plnire I Mardi 2 juillet 14h00-15h00
- 33 -
SP1 - Les foldamres: une expansion de l'espace chimique base sur
l'analyse des structures
Ivan Huc
Universit de Bordeaux CNRS IPB UMR5248 (CBMN), Institut Europen de Chimie et
Biologie, 2 rue Robert Escarpit, 33600 Pessac, France.
i.huc@iecb.u-bordeaux.fr
Nous avons entrepris un programme de recherche dans le domaine des foldamres des
architectures molculaires artificielles replies dont le succs a repos trs largement sur
l'analyse des structures cristallographiques. Spcifiquement, nous avons dvelopp des
foldamres hlicodaux drivs d'acides amins aromatiques.
[1]
Certains de ces objets replis
prsentent une stabilit conformationnelle sans prcdent,
[2]
et constituent des briques
lmentaires bien dfinies pour l'laboration de structures replies artificielles de la taille de
petites protines (Fig. 1).
[3]
Ils possdent frquemment une forte propension s'assembler en
hlices double, triple voire quadruple.
[4]
Des cavits peuvent tre conues l'intrieur de ces
hlices qui leur confrent des proprits de rcepteurs artificiels
[5]
et de moteurs
molculaires.
[6]
Des analogues solubles dans l'eau de ces foldamres se montrent prometteurs
pour la reconnaissance d'acides nucliques et de protines.
[7]
Figure 1. A gauche et au centre: structure dans le cristal d'un grand foldamre constitu de
deux hlices de sens d'hlicit opposs orientes 90. A droite: la structure cristalline d'une
petite protine est montre la mme chelle pour en comparer la taille.
[1] G. Guichard, I. Huc, Chem. Commun. 2011, 47, 5933.
[2] H. Jiang, J.-M. Lger, I. Huc, J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 3448; N. Delsuc, T.
Kawanami, J. Lefeuvre, A. Shundo, H. Ihara, M. Takafuji, I. Huc ChemPhysChem 2008, 9,
1882.
[3] N. Delsuc, J.-M. Lger, S. Massip, I. Huc Angew. Chem. Int. Ed. 2007, 46, 214; N.
Delsuc, S. Massip, J.-M. Lger, B. Kauffmann, I. Huc, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 3165.
[4] Q. Gan, C. Bao, B. Kauffmann, A. Grlard, J. Xiang, S. Liu, I. Huc, H. Jiang, Angew.
Chem. Int. Ed. 2008, 47, 1715; D. Haldar, H. Jiang, J.-M. Lger, I. Huc, Angew. Chem. Int.
Ed. 2006, 45, 5483.
[5] Y. Ferrand, A. M. Kendhale, B. Kauffmann, A. Grlard, C. Marie, V. Blot, M. Pipelier, D.
Dubreuil, I. Huc, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 7858.
[6] Q. Gan, Y. Ferrand, C. Bao, B. Kauffmann, A. Grlard, H. Jiang, I. Huc, Science 2011,
331, 1172.
[7] L. Delaurire, Z. Dong, K. Laxmi-Reddy, F. Godde, J.-J. Toulm, I. Huc, Angew. Chem.
Int. Ed. 2012, 51, 473.
1a - Matriaux fonctionnels (1) Mardi 2 juillet 15h00-16h30
- 34 -
O1 - Relations structure-magntisme dans le compos magnto-
lectrique MnWO
4
Christophe Payen
1
, Lynda Meddar
1
, Michael Josse
2
,
Pascaline Patureau
1
, Philippe
Deniard
1
,
Mario Maglione
2
, Franoise Damay
3
, Gilles Andr
3
1
Institut des Matriaux Jean Rouxel, Universit de Nantes - CNRS,
2
CNRS, ICMCB, Bordeaux,
2
LLB, CEA,CNRS
MnWO
4
est un compos magntolectrique de type II bien tudi depuis quelques
annes [1]. Cet oxyde de Mn
2+
(spin S=5/2) prsente une structure cristalline simple
(hubnerite ou wolframite) avec des chanes zigzag issues du partage dartes doctadres
MnO
6
distordus [2]. Trois phases magntiques sont prsentes basse temprature [3]. Une de
ces phases (AF2, entre T
1
= 7.5 K et T
2
= 12.5 K) associe une structure magntique
hlicodale incommensurable et une polarisation ferrolectrique spontane dans une direction
perpendiculaire aux chanes MnO
4
(phase multiferroque ). La succession d'tats
magntiques basse temprature est la consquence d'une comptition entre interactions
magntiques et anisotropie magntique locale. Il est possible de raliser des substitutions
chimiques du Mn
2+
ou du W
6+
par dautres mtaux de transition, ce qui ouvre des possibilits
de modulation des proprits.
Nous prsenterons diffrents travaux raliss pour comprendre les proprits
magntiques du compos MnWO
4
et celles des solutions solides issues des diffrentes
substitutions chimiques. Ltat multiferroque peut tre dstabilis ou stabilis selon le
type de substitution, les substitutions impliquant des modifications des interactions
magntiques et de lanisotropie magntique qui modulent les proprits magntiques.
[1] A.H. Arkenbout, Phys. Rev. B, 74, 184431 (2006) ; K. Taniguchi et al., Phys. Rev. Lett.
97, 097203 (2006) ; O. Heyer et al., J. Phys.: Condens. Matter 18, L471 (2006).
[2] H. Weitzel, Z. Kristallogr. Kristallgeom. Kristallphys. Kristallchem., 144, 238 (1976) ; J.
Macavei, H. Schulz, H., Z. Kristallogr. 207, 193 (1993).
[3] G. Lautenschlger et al., Phys. Rev. B, 48, 6087 (1993).
1a - Matriaux fonctionnels (1) Mardi 2 juillet 15h00-16h30
- 35 -
O2 - Synthse et structures cristallines de nouveaux polymres de coordination chiraux
base de fluorne pour la sparation et la catalyse nantioslective
Julien Robin
1
, Nathalie Audebrand
1
, Cyril Poriel
2
, Carmelo Prestipino
1
1
Equipe Chimie du Solide et Matriaux,
2
Equipe Matire Condense et Systmes Electroactifs.
Institut des Sciences chimiques de Rennes, UMR CNRS 6226, Universit de Rennes 1.
Les recherches sur les Metal Organic Frameworks (MOFs), ou polymres de
coordination, se sont largement dveloppes ces vingt dernires annes [1] et les applications
potentielles sont nombreuses notamment dans le domaine de lenvironnement (stockage et
sparation de gaz, dpollution des eaux). Les MOFs chiraux sont de plus en plus tudis
compte tenu de leurs proprits en catalyse htrogne et sparation nantioslective [2,3].
Nous avons synthtis trois ligands originaux cur fluorne sur lesquels ont t greffes
deux chanes chirales (Figure 1).
Figure 1 : Ligands chiraux cur fluorne synthtiss
La ractivit de ces ligands avec des sels mtalliques (Zn, Cu, Cd, Y, La) a t tudie
avec diffrentes conditions de synthses solvothermales. Les structures cristallines des MOFs
synthtiss ont t dtermines par diffraction des rayons X (DRX) par le monocristal. La
variation de la taille, de la gomtrie et de la connectivit du ligand a permis de contrler
linterpntration, la topologie, la dimensionnalit et la porosit des MOFs, comme lillustre
la Figure 2.
Figure 2 : Srie de MOFs au cuivre : a) [Cu L1H
2
O] porosit potentielle de 15% ; b) [Cu
2
(L2)
2
(DMF) (H
2
O)] porosit potentielle de 35% ; c) [Cu
4
(L3)
2
DMF (H
2
O)
3
] porosit potentielle de 60%.
La ractivit de ces MOFs a t tudie en particulier par DRX par les poudres in situ
avec des diffractomtres de laboratoire et le rayonnement synchrotron.
[1] L. R. MacGillvray, Metal-Organic Frameworks: Design and applications, John Wiley &
Sons, 2010.
[2] Y. Minyoung, S. Renganathan, and K. Kimoon, Chem. Rev, 2012, 112, 1196-1231.
[3] L. Jian-Rong, J. Sculley, and H. C. Zhou, 2012, Chem. Rev, 112, 869-932.
1a - Matriaux fonctionnels (1) Mardi 2 juillet 15h00-16h30
- 36 -
O3 - Origine de la fatigue Ferrolectrique dans le zirconate-titanate de
Plomb PZT
J. Rouquette,
1
M. Hinterstein,
2
J. Haines,
1
Ph. Papet,
1
M. Knap,
3
J. Glaum,
4
H. Fuess
5
1
Institut Charles Gerhardt UMR CNRS 5253 Equipe C2M, Montpellier cedex 5, France.
2
Institut fr Werkstffwissenschaften, Technische Universitt Dresden, Germany
3
CELLS-ALBA, Barcelona, Spain
4
School of Materials Science and Engineering, Australian
5
Institute for Materials Science, Technische Universitt Darmstadt, Germany .
E-mail: Jerome.Rouquette@um2.fr
Les Ferrolectriques prsentent un fort potentiel pour des applications
microlectroniques. Dans les mmoires ferrolectriques non volatiles (FeRAM), linformation
est stocke et lue en renversant la direction de la polarisation lectrique. La dgradation du
basculement de polarisation, i.e. fatigue ferrolectrique, est une contrainte technique la
commercialisation des mmoires ferrolectriques ; la quantit de charges bascules sous
champs diminue lors de cycles (de lordre de 10
7
) rpts. Malgr de nombreuses tudes
thoriques et exprimentales, lorigine de la fatigue nest pas connue. Dans la littrature la
fatigue serait cause par la formation dune couche linterface entre llectrode mtallique
et le matriau ferrolectrique, des dformations rsultantes de domaines 90, de llectro-
migration de lacunes doxygne formant des dfauts tendus pouvant bloquer des domaines,
de mcanismes dinhibition de nuclation dinterface induit par injection de charge, de
fissures micro- et macro-scopiques, , mais notre connaissance lorigine structurale de la
fatigue na jamais t propose.
Dans cette tude, la fatigue ferrolectrique de cramiques commerciales de PZT est
tudie par diffraction X synchrotron en fonction du champ lectrique appliqu. Utilisant la
mthodologie rapporte rcemment [1], nous avons caractris lorigine structurale de la
fatigue par une dgradation de la transformation quadratique-monoclinique sous champ, qui
traduit la rduction de lefficacit pizolectrique. La perte de polarisation rmanente peut
aussi tre dtecte par une anomalie moins intense et plus diffuse du dplacement quadratique
moyen du plomb B
iso
(Pb) sous champ pour lchantillon fatigu (10
7
cycles) qui traduit le
basculement de polarisation. Nous avons aussi pu caractriser la cintique de la raction
induite sous champ, de lordre de la milliseconde, qui conforte sans aucun doute notre
interprtation sur lorigine structurale de la fatigue ferrolectrique.
[1] M. Hinterstein, J. Rouquette*, J. Haines, P. Papet, M. Knapp, J. Glaum, H. Fuess,
Structural Description of the Macroscopic Piezo- and Ferroelectric Properties of Lead
Zirconate Titanate, Phys. Rev. Lett., 107 (2011).
1b - Surfaces et Interfaces Mardi 2 juillet 15h00-16h30
- 37 -
O4 - SXRD in situ couple llectrochimie : tude de llectro-
insertion dhydrogne dans des nanofilms de Pd
Yvonne Soldo-Olivier
1
, Eric Sibert
1
, W. Liang
1
, M. De Santis
2
1
Laboratoire dElectrochimie et de Physico Chimie des Matriaux et des Interfaces, CNRS-
Grenoble INP-UJF-UdS, 1130 rue de la Piscine, 30402 St . Martin dHres, France
2 Institut Nel, CNRS-UJF, 25 av. des Martyrs, 38042 Grenoble, France
Le palladium prsente non seulement des proprits catalytiques remarquables vis--vis
de la dissociation d'hydrogne, mais il est aussi caractris par une grande cintique
dinsertion/dsinsertion de cet lment. Par rapport au Pd massif, la taille nanomtrique des
films ultra-minces est de nature induire de profondes modifications sur les proprits
thermodynamiques. C'est le cas pour les nanoparticules de Pd, qui prsentent une solubilit de
l'hydrogne rduite [1-4].
Afin d'obtenir une comprhension approfondie des mcanismes rgissant l'insertion
d'hydrogne dans les films ultra-minces de Pd, nous avons tudi l'influence de la taille
nanomtrique et du substrat monocristallin sur les isothermes dinsertion lectrochimique de
lhydrogne. Le comportement original des diffrentes paramtres thermodynamiques, tel le
taux d'insertion maximale d'hydrogne, a t observ pour les systmes Pd/Pt(111) et
Pd/Au(111).
Nous avons ralis des mesures de diffraction de surface des rayons X (SXRD) in situ
en milieu lectrochimique. Pour ceci, nous avons conu une cellule lectrochimique adapte
la diffraction de surface et venant sinsrer dans le diffractomtre de la ligne franaise CRG-
D2AM lESRF (Grenoble, France). Ces mesures nous ont permis dobtenir la structure
microscopique des films de Pd avant et aprs hydruration. Lexistence de zones au sein des
films de Pd avec des paramtres cristallographiques diffrents a t mise en vidence.
Nous avons ainsi t en mesure de donner une description dtaille de la relation forte
entre la structure des films l'chelle atomique et le comportement des isothermes dinsertion
en fonction du substrat et de lpaisseur du film [5,6].
[1] A. Pundt, M. Suleiman, C. Bhtz, M.T. Reetz, R. Kirchheim, N.M. Jisrawi, Mat. Sci. Engi.
2004, B108, 19.
[2] A. Pundt, Adv. Engi. Mat. 2004, 6, 11.
[3] C. Lebouin, Y. Soldo, S.A. Grigoriev, M. Guymont, P. Millet, Int. J. Hydrogen Energ.,
2013, 38(2), 966.
[4] C. Lebouin, Y. Soldo-Olivier, E. Sibert, P. Millet, M. Maret, R. Faure J. Electroanal.
Chem., 2009, 626, 59.
[5] C. Lebouin, Y. Soldo-Olivier, E. Sibert, M. De Santis, F. Maillard, R. Faure, Langmuir
2009, 25(8), 4251.
[6] Y. Soldo-Olivier, M. C. Lafouresse, M. De Santis, C. Lebouin, M. de Boissieu, E. Sibert,
J. Phys. Chem. C, 2011, 115(24), 12041.
1b - Surfaces et Interfaces Mardi 2 juillet 15h00-16h30
- 38 -
O5 - Surfaces vicinales : des nano-gabarits pour croissance pitaxiale
Alessandro Coati
1
, Yves Garreau
1,2
1
Synchrotron SOLEIL, LOrme des Merisiers, Saint Aubin, B.P. 48, 91192 Gif sur Yvette
Cedex, France,
2
Matriaux et Phnomnes Quantiques (MPQ), Btiment Condorcet, Case courrier 7021, 10
rue Alice Domon et Lonie Duquet, 75205 Paris Cedex 13
Les surfaces vicinales mtalliques sont des bons gabarits pour la croissance de
nanostructure. En effet, elles prsentent une succession rgulire de terrasses spares par des
marches et constituent elles mmes de nanostructures dont on peut contrler les dimensions
(largeur de terrasses, priode) en choisissant langle de coupe par rapport une surface
nominale. Suite un recuit thermique ou ladsorption dune espce chimique, ou encore
un dpt dun autre matriau, les surfaces vicinales peuvent se rorganiser et donner
naissance des nouvelles structures priodiques, comme par exemple des facettes, qui
peuvent tre contrles par les paramtres de recuit, dadsorption ou de dpt.
Nous nous sommes intresss lorganisation de surfaces vicinales mtalliques et la
modification de leurs morphologies suite au dpt sub-monocouche dune espce chimique en
utilisant la diffraction de rayons X en incidence rasante (GIXD) et la microscopie effet
tunnel (STM).
Pour des dpts dpassant la monocouche, nous avons pu observer des phnomnes
intressants dpitaxie sur les surfaces mtalliques vicinales tudies. Par exemple, le dpt
dAg sur une surface vicinale de Cu ou de Ni (espces prsentant une forte non miscibilit en
volume), une croissance pitaxiale lieu, avec une interface abrupte entre le substrat et la
couche dpose. Nous avons pu mettre en vidence que linterface entre les deux mtaux est
constitue de deux surfaces vicinales qui semboitent parfaitement. Nous obtenons ainsi une
croissance avec une couche bien cristalline et sans dfauts, prsentant une surface
bidimensionnelle, mme en prsence de matriaux qui prsentent au dpart des paramtres
rticulaires trs diffrents.
Laction dune surface vicinale dans lpitaxie dune couche peut avoir aussi dautres
effets tonnants : cest le cas de la croissance dune couche de Co sur une surface vicinale
dAu. Dans ce cas le Co, qui prsente naturellement une structure fcc, est contraint croitre
avec une structure fcc, hrite du substrat dAu.
Dans cet expos on pourra mettre en vidence ces phnomnes trs particuliers lis la
croissance sur substrats vicinaux.
1b - Surfaces et Interfaces Mardi 2 juillet 15h00-16h30
- 39 -
O6 - Mise en vidence de phases induites par le substrat pour des
msognes -conjugus
Gabin Gbabode
1,4
, Oliver Werzer
2
, Armin Moser
2
, Roland Resel
2
, Yves Geerts
3
, Johann
de Silva
4
, Michele Sferrazza
4
1
Sciences et Mthodes Sparatives, EA 3233, Universit de Rouen, 76821 Mont-Saint-
Aignan, France,
2
Institute of Solid State Physics, Graz University of Technology, Petersgasse 16, 810 Graz,
Autriche,
3
Laboratoire de Chimie des Polymres, Facult des Sciences, Universit libre de Bruxelles
(ULB), Boulevard du Triomphe, 1050, Bruxelles, Belgique,
4
Dpartement de Physique, Facult des Sciences, Universit libre de Bruxelles, Boulevard du
Triomphe, 1050 Bruxelles, Belgique.
Llectronique organique est un domaine de recherche trs attractif qui est bas sur
lutilisation de molcules semi-conductrices organiques pour la fabrication de composants
lectroniques comme les transistors effet de champ organiques (ou OFETs). Il est connu,
pour ces derniers, que le transport de charges seffectue dans les premires couches
molculaires du semi-conducteur organique (OSC) linterface entre celui-ci et le
dilectrique [1]. Il est ainsi crucial de pouvoir connatre lorganisation structurale des OSCs
proche du substrat sur lequel ils sont dposs car elle est directement relie leurs proprits
de transport de charges.
Nous prsenterons deux exemples de msognes -conjugus dposs en film minces
(paisseur infrieure 100 nm) par la mthode de spin-coating sur des wafers de silicium
conventionnels. Nous avons mis en vidence pour chacun deux la prsence dune
organisation structurale proche du substrat (phase induite par le substrat) diffrente de celle
observe dans le reste du film (phase bulk ), notamment grce des analyses structurales
combinant principalement diffraction des rayons X spculaire et en incidence rasante.
Le premier compos, le o,e-dioctylterthiophne, prsente un comportement thermotrope
assez complexe avec des transitions de phases 337 K (cristalline - smectique G), 344 K
(smectique G smectique F), 358 K (smectique F smectique C) et fond 363 K. La
prsence de deux phases cristallines en films minces temprature ambiante a pu tre prouve
dont la proportion relative dpend des conditions de fabrication du film.
Pour le deuxime, un driv de phthalocyanine, nous avons pu montrer lexistence dune
phase induite par le substrat sur une paisseur denviron 30 nm. De plus, de manire tout fait
originale, cette phase possde une organisation structurale tridimensionnelle alors que la
phase bulk est une msophase colonnaire bidimensionnelle typique [2].
[1] Dinelli et al., Phys. Rev. Lett. 2004, 92, 116802.
[2] Gbabode et al., Adv. Mater. 2012, 24, 658-662.
1b - Surfaces et Interfaces Mardi 2 juillet 15h00-16h30
- 40 -
O7 - Etude de surfaces vicinales ordonnes par diffusion centrale des
rayons X sous incidence rasante. Nouveaux dveloppements sur la
ligne BM02 lESRF
Caroline Matringe
1
, Elsa Thune
1
, Ren Guinebretire
1
,
David Babonneau
2
, Nathalie
Boudet
3
, Nils Blanc
3
, Mireille Maret
4
1
Science des Procds Cramiques et de Traitements de Surface, SPCTS, UMR CNRS 7315,
ENSCI, Centre Europen de la Cramique (CEC), 12 rue Atlantis, 87068 Limoges Cedex
2
Institut PPRIME, UPR CNRS 3346, Universit de Poitiers, SP2MI, Tlport 2, Boulevard
Marie et Pierre Curie, BP 30179, 86962 Futuroscope Chasseneuil Cedex
3
Institut Nel, UPR CNRS 2940, 25 rue des Martyrs, BP 166, 38042 Grenoble cedex 9
4
Science et Ingnierie des Matriaux et Procds, SIMAP UMR 5266 CNRS, 1130 rue de la
Piscine, BP 75, 38402 St Martin dHres.
Les surfaces vicinales sont des substrats utiliss pour faire crotre des nanostructures
auto-organises. Dune manire gnrale, aprs dcoupe des monocristaux ces surfaces
prsentent des marches de dimension latrale et de hauteur variables. Des traitements
thermiques judicieusement choisis conduisent, par simple minimisation de lentropie, la
formation de rseaux de marches priodiques qui peuvent a priori tre mono ou
bidimensionnels. Les dimensions caractristiques des nanostructures labores sur ces
surfaces gabarits sont directement dpendantes de la priode des rseaux forms et de la
hauteur des marches qui les constituent. La mesure de lvolution de la priode ainsi que du
profil des marches constitue donc une tape clef de llaboration de ces nanostructures par
auto-organisation.
La diffusion centrale des rayons X sous incidence rasante est une mthode de choix pour
dterminer la fois le profil et les dimensions caractristiques des rseaux de marches.
Lorientation relative entre lchantillon, et plus particulirement les bords de marche, et le
faisceau incident de rayons X doit toutefois tre contrle de faon trs prcise. De cette
prcision dpendra laptitude dterminer notamment le profil des marches. Les bords de
marche tant des directions cristallographiques, lorientation azimutale de lchantillon, qui
est un monocristal, peut tre dtermine par diffraction. Nous montrerons dans cette
communication, comment lassociation du nouveau goniomtre implant sur la ligne BM02
lESRF et du banc de diffusion centrale prsent sur cette mme ligne nous a permis dtudier
de faon complte des rseaux mono ou bidimensionnel forms par traitements thermiques
trs haute temprature de surfaces de saphir. La pertinence de lapproche propose sera
illustre notamment par le trs bon accord entre des observations locales dans lespace rel
menes par microscopie force atomique et la cartographie bidimensionnelle du rseau
rciproque au voisinage du centre de ce rseau.
1c - Nouvelles structures en biologie Mardi 2 juillet 15h00-16h30
- 41 -
O8 - Structure de l'ectodomaine de la glycoprotine d'enveloppe E1,
dans sa forme post-fusion, du virus de la Rubole.
Marie-Christine Vaney, Rebecca Phillips, Alejandra Tortorici, Rana Al-Kurdi, Giovanna
Barba-Spaeth, Thomas Krey, Flix A. Rey
Unit de Recherche de Virologie Structurale, Dpartement de Virologie, Institut Pasteur,
CNRS UMR 3569,28 rue du Dr. Roux, 75015 Paris, France
Le virus de la rubole (RV) est lagent responsable de cette maladie gnralement
bnigne touchant les enfants, mais qui peut provoquer de graves malformations congnitales
au foetus lors d'une infection in utero. RV est le seul membre du genre des Rubivirus
appartenant la famille des Togaviridae, qui inclut aussi le genre Alphavirus dont le virus
chikungunya fait partie. Malgr son importance mdicale, l'organisation structurale de RV
reste peu connue l'heure actuelle. Les glycoprotines E1 et E2 sont les protines d'enveloppe
de RV. Nous avons dtermin la structure de la forme post-fusion de l'ectodomain de E1
(E1e) 1.8 de rsolution [1]. E1 est l'antigne principal et la seule cible des anticorps
neutralisants contre RV, et l'pitope d'un de ces anticorps neutralisants a t localis sur la
structure. E1 est aussi implique dans l'entre du virus dans les cellules cibles par sa liaison
des rcepteurs cellulaires de surface, dont l'un d'entre eux a t rcemment identifi [2], ainsi
que dans la fusion membranaire. La structure du trimre de E1e rvle deux boucles de fusion
et un site mtallique par protomre, ainsi qu'une trs large surface de fusion (~8000
2
).
Celle-ci pourrait servir induire une pression importante lors de l'insertion membranaire du
virus, de faon catalyser plus efficacement la fusion des membranes virale et cellulaire.
Nous avons aussi montr que les proprits de liaison de E1e aux lipides sont diffrentes en
fonction de la nature de l'ion (Na
+
ou Ca
2+
) et du pH. La prsence de mtal dans E1e voque
les protines cellulaires de la famille "TIM" [3], lesquelles reconnaissent spcifiquement, via
un mtal, les ttes lipidiques des phosphatidylsrines la surface plasmatique des cellules en
apoptose. Les caractristiques structurales de RV E1e et sa comparaison avec les autres
protines de fusion de classe II, qui englobe les protines d'enveloppe des alphavirus et
flavivirus, seront prsentes.
[1] DuBois RM, Vaney MC, Tortorici MA, Kurdi RA, Barba-Spaeth G, Krey T, Rey FA.
Functional and evolutionary insight from the crystal structure of rubella virus protein E1.
Nature. 2013, 493(7433):552-556.
[2] Cong H, Jiang Y, Tien P. Identification of the Myelin Oligodendrocyte Glycoprotein as a
Cellular Receptor for Rubella Virus. J. Virology. 2011, 85(21):1103811047.
[3] Santiago C, Ballesteros A, Martinez-Munoz L, Mellado M, Kaplan GG, Freeman GJ,
Casasnovas JM. Structures of T cell immunoglobulin mucin receptors 1 and 2 reveal
mechanisms for regulation of immune responses by the TIM receptor family. Immunity.
2007, 26:299310.
1c - Nouvelles structures en biologie Mardi 2 juillet 15h00-16h30
- 42 -
O9 - Bases structurales de l'initiation de la transcription de l'ARN
polymerase III
Stphane Lefvre
1,2
, Hlne Dumay-Odelot
1,2
, Leyla El Ayoubi
1,2
, Nol Pinaud
1,2
, Martin
Teichmann
1,2
, Sbastien Fribourg
1,2
1
Univ. Bordeaux, IECB, F-33607 Pessac, France,
2
INSERM, U869, Laboratoire ARNA, F-33000, Bordeaux, France,
LARN polymrase III humaine (hPol III) transcrit les gnes codants pour les ARN de
transfert et lARN ribosomal 5S, ainsi que ceretains ARN non codants impliqus dans la
rgulation de la transcription et dans lpissage tels que 7SK, U6 snRNA. hPol III est la plus
complexe des trois ARN polymrases nuclaires avec 17 sous-units. Parmi ces 17 sous-
units seulement 5 sont spcifiques de hPol III et sont rparties en deux sous-complexes
stables de 2 (RPC4 et RPC5) et 3 sous-units (RPC62, RPC39, RPC32) respectivement.
Le complexe ternaire form par RPC62, RPC39 et RPC32 est impliqu dans
linitiation spcifique de la transcription. Par ailleurs la sous-unit RPC32 est prsente dans le
gnome sous deux isoformes codes par deux gnes distincts [1]. RPC32| est la sous-unit
constitutive prsente dans chaque type cellulaire test ce jour, alors que RPC32o, la
premire historiquement identifie, a une expression hautement rgule et nest retrouve que
dans les cellules souches embryonnaires et les cellules en cours de transformation [1].
Dans le but de comprendre les bases molculaires de la fonction de ce complexe ternaire et
limplication pour lholoenzyme de la prsence de lune ou lautre isoforme de RPC32, nous
avons dbut une tude structure-fonction de ce complexe.
En rsolvant la structure de la sous-unit humaine RPC62 nous avons identifi des
domaines classiques de liaison lADN et une homologie forte avec TFIIEo, un facteur de
transcription Pol II [2]. Ltude fonctionnelle in vitro associe a permis lidentification des
domaines ncessaires la formation du complexe et dmontre une spcificit de RPC62 et
RPC39 pour lADN simple ou double brin respectivement. Cette premire tape dans la
comprhension du rle du complexe dans linitiation de la transcription permet de proposer un
modle fonctionnel du complexe ternaire et dmontre une homologie tendue entre les
systme de transcription Pol I/II et III.
[1] Haurie et al. (2010) Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 107 (9), 4176-81.
[2] Lefvre et al. (2011) Nat. Struct. Mol. Biol., 18(3), 352-8.
1c - Nouvelles structures en biologie Mardi 2 juillet 15h00-16h30
- 43 -
O10 - Analyse structurale par SAXS de SopB, un effecteur de type III
de Salmonella en complexe avec sa chaperonne spcifique SigE.
Pierre Roblin
1
, Pierre Lebrun
2
, Prakash Rucktooa
3
, Frderique Dewitte
3
, Zo Lens
3
, Vincent
Villeret
3
& Coralie Bompard
3
.
1
Synchrotron SOLEIL, Lorme des merisiers, Saint Aubin, BP 48, 91192 Gif sur Yvette Cedex,
France
2
Structural Biology, Brussels , Vlaams Instituut voor Biotechnologie (VIB) Vrije Universiteit
Brussel (VUB) , Pleinlaan 2, 1050 Brussels, Belgium
3
Interdisciplinary Research Institute, CNRS -USR 3078, Universite Lille Nord de France, 50
Avenue de Halley, 59658 Villeneuve dAscq, France
SopB/SigD est une inositol phosphatase multi-domaines implique dans lentro-
pathognicit de Salmonella enterica. Ce facteur de virulence est inject dans les cellules
eucaryotes par le systme de scrtion de type III (TTSS) provoquant une rorganisation du
cytosquelette actine qui aboutit linternalisation de la bactrie. Avant sa scrtion, la
protine est maintenue dans le cytoplasme des bactries par interaction avec une chaperonne
spcifique SigE dont la structure atomique est connue. Nous avons ralis ltude du
complexe SopB/SigE par diffusion des rayons-X aux petits angles (SAXS) afin davancer
dans la connaissance des mcanismes de scrtion de type III et notamment dans la
reconnaissance des effecteurs par lappareil de scrtion lui-mme. Le SAXS combin
dautres approches biochimique, biophysiques et de modlisation molculaire sest avr tre
la technique la plus approprie pour ltude de ce complexe qui possde plusieurs rgions
dsordonnes. Linteraction entre SopB et SigE a pu tre caractrise par lanalyse structurale
de plusieurs constructions de leffecteur co-exprimes avec la chaperonne. La structure a
basse rsolution du complexe obtenue par SAXS a abouti la mise en vidence dune
structure quaternaire originale permettant de mieux comprendre les mcanismes de
reconnaissance des complexes effecteur/chaperonne de type III et les composant du TTSS et a
permis de proposer un mcanisme de scrtion pour ce facteur de virulence.
1c - Nouvelles structures en biologie Mardi 2 juillet 15h00-16h30
- 44 -
O11 - Bases structurales et fonctionnelles de la biominralisation de la
magntite : importance des domaines magntochromes.
Marina I Siponen
1
, Pierre Legrand
2
, Marc Widdrat
3
, Stphanie R. Jones
4
, Michelle C.Y.
Chang
4
, Damien Faivre
3
, David Pignol
1
, Pascal Arnoux
1
1
Laboratoire de Bionergtique Cellulaire, CEA/DSV/IBEB, UMR 7265 CNRS/CEA,
Universit Aix-Marseille, Saint-Paul-lez-Durance, F-13180, France
2
French National Synchrotron facility-SOLEIL, GIF-sur-Yvette, France
3
Department of Biomaterials, Max Planck Institute of Colloids and Interfaces, Science Park
Golm, 14424 Potsdam, Germany
4
Departments of Chemistry and Molecular and Cell Biology, University of California,
Berkeley, Berkeley, CA 94720-1460, United States
Les bactries magntotactiques salignent le long des lignes de champ magntique
terrestre grce la mise en place dun organite appel le magntosome : un cristal de
magntite [Fe(II)Fe(III)
2
O
4
] ou bien de greigite [Fe(II)Fe(III)
2
S
4
] entour dune vsicule
proto-lipidique. Alors que les besoins en Fer(II) et Fe(III) sont vidents, rien nest connu
concernant les mcanismes biologiques de contrle de ce ratio Fe(II)/Fe(III). Nous avons
propos lintervention dun domaine contenant un motif CXXCH (typique des cytochromes c)
qui est spcifique des MTB et qui se retrouve en tandem dans plusieurs protines associes au
magntosome (MamE, P, T et X) et nous avons propos le nom de magntochrome pour
dfinir ce domaine [1].
Ici, nous prsentons la structure de MamP qui se caractrise par lassociation dun
domaine PDZ avec deux domaines magntochrome [2]. Le domain PDZ joue un rle central
dans loligomrisation de MamP via la reconnaissance dun peptide provenant de sa propre
squence (auto-inhibition). Quant aux deux domaines magntochrome ils dfinissent une
nouvelle classe de cytochrome de type c extrmement compacte et caractrise par une forte
exposition de lhme au solvant. Larrangement relatif des domaines PDZ et magntochromes
dans le dimre de MamP contribue la cration dune poche acide que lon peut dcrire
comme un creuset entour de quatre hmes. Des expriences de cintique, de co-cristallisation
de MamP avec du Fe(II) ainsi que des expriences de production de magntite in vitro en
prsence de MamP indiquent que MamP est une fer oxidase qui contribue la formation et
la solubilisation despces de Fe(III) dans le creuset. Ces espces seraient par la suite
ncessaires la croissance des cristaux de magntites ou de greigite. Ces rsultats montrent
les mcanismes molculaires de la gestion du fer prenant place dans le magntosome et
soulignent limportance des domaines magntochromes dans ce processus.
[1] Siponen, et al., Biochem Soc Trans. 2013, 40, 1319-23
[2] Siponen, et al., Soumis
2a - Chimie supramolculaire et ingnierie molculaire
Mardi 2 juillet 17h00-18h30
- 45 -
O12 - Analyse structurale dhybrides organique-inorganique et
relations structure-proprits : limportance de linterface et des
liaisons faibles
Nicolas Mercier
MOLTECH-Anjou UMR CNRS 6200- Universit dAngers, 2Bd Lavoisier, 49045 Angers
Dans cette prsentation, nous analyserons des structures cristallines ( retro-crystal-
engineering analysis) de composs de type hybride organique-inorganique en relation avec
leurs proprits. Beaucoup dexemples seront pris parmi des hybrides constitus danions
halognomtallate et de cations organiques [1]. On attachera une importance particulire
linterface organique-inorganique qui est le sige dinteractions faibles et on montrera
limpact de celles-ci sur les proprits des matriaux. Ainsi, nous verrons comment la
combinaison de liaisons halogne et liaisons hydrogne permet la rduction du gap BC-BV de
perovskites hybrides [2], comment un changement de liaison hydrogne avec la temprature,
corrl un changement conformationnel du cation cystaminium, a un impact drastique sur
les proprits optiques (doublage de frquence) des matriaux [3], comment le
methylviologne permet la formation ( effet template ) de chaines polaires doctadres
trans-connects dans une nouvelle famille de ferrolectriques hybrides [4], ou comment les
interactions N
+
Cl ont un effet sur les proprits de transfert de charge photo-induit de
chlorometallates de viologne [5]. Dautres exemples seront emprunts la chimie de
coordination, en particulier des complexes ou des polymres de coordination possdant des
proprits de photoluminescence [6].
[1] N. Mercier et al., CrystEngComm 2009, 11, 720-734.
[2] S. Sourisseau, N. Mercier et al., Chem. Mater. 2007, 19, 600-607.
[3] N. Mercier et al., Angew. Chemie 2006, 45, 2100-2103 ; W. Bi, N. Mercier et al., Adv.
Mater. 2008, 20, 1013-1017
[4] N. Leblanc, N. Mercier et al., J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 14924-14927.
[5] N. Mercier, Eur. J. Inorg. Chem. 2013, 19-31.
[6] O. Toma, N. Mercier et al., CrystEngComm 2012, 14, 7844-7847 ; O. Toma, N. Mercier et
al., Eur. J. Inorg. Chem. 2013, 1113-1117.
2a - Chimie supramolculaire et ingnierie molculaire
Mardi 2 juillet 17h00-18h30
- 46 -
O13 - Crystallography as a critical resource in metal-organic self
assembly
Jonathan Nitschke
Cambridge University, United Kingdom
Designing complex materials for new devices through the art of chemical synthesis
brings challenges and opportunities; single-crystal X-ray diffraction is a key front-line
technique in the structural characteration of new, complex self-assembled materials.This talk
will focus upon the design of self-assembly processes that can bring together simple, organic
molecules and first-row transition-metal ions into complex, functional structures, and how
these structures may be characterised using state-of-the-art crystallographic techniques
developed by our partners at Global Phasing Ltd. Examples include an octa-Fe(II) cubic cage
that is capable of selectively binding to higher fullerenes,[1] a tetra-Fe(II) tetrahedral cage
that is capable of rendering air-stable white phosphorus (P4), which is ordinarily
pyrophoric,[2] and a deca-Co(II) pentagonal prism, shown at right, which forms part of a
chemical network that behaves differently under the influences of different chemical
signals.[3] This prism is formed through the action of hexafluorophosphate template ions, and
it binds tightly to chloride once formed.
[1] W. Meng, B. Breiner, K. Rissanen, J. D. Thoburn, J. K. Clegg, J.
R. Nitschke, Angew. Chem. Int. Ed. 2011, 50, 3479.
[2] P. Mal, B. Breiner, K. Rissanen, J. R. Nitschke, Science 2009, 324, 1697.
[3] I. A. Riddell, M. M. J. Smulders, J. K. Clegg, Y. R. Hristova, B.
Breiner, J. D. Thoburn, J. R. Nitschke, Nature Chem. 2012, 4, 751.
2a - Chimie supramolculaire et ingnierie molculaire
Mardi 2 juillet 17h00-18h30
- 47 -
O14 - La liaison halogne pour l'laboration d'architectures
complexes: contribution lectrostatique et rseaux d'anions (2D, 3D)
Marc Fourmigu, Julien Lieffrig, Olivier Jeannin
Institut des Sciences Chimiques de Rennes, Universit Rennes 1, UMR CNRS 6226, Campus
de Beaulieu, 35042 Rennes (France)
La liaison halogne est base sur une distribution lectronique anisotrope autour
datomes dhalogne organiques, conduisant une dformation et une lacune de densit
lectronique le long de la liaison CHal. Cette polarisation est lorigine dinteractions
HalHal directes mais aussi dinteractions CHalNC avec des
nitriles ou tout autre base de Lewis, qui peuvent tre aussi fortes et
plus directionnelles qu'une liaison hydrogne normale [1,2].
La contribution lectrostatique cette interaction est dmontre ici dans une srie de
complexes transfert de charge formuls (EDT-TTFI
2
)
2
(TCNQF
n
) avec n = 02 dans lequel
la charge des partenaires lectro-
actifs est modulable (et module)
en fonction de n et/ou de la
temprature, dans des composs
prsentant une conversion
neutre-ionique [3,4].
Par ailleurs, la mise en uvre d'anions halognures (Cl
, Br
, I
) ou pseudo-halognures
(SCN
Les interactions molculaires sont rgies par les proprits lectrostatiques tells que
les charges et les moments atomiques, le potentiel et le champ lectrostatique. Ces proprits
sont drives de la distribution lectronique de la molcule isole ou lintrieur dun cristal.
Deux mthodes existent pour la dtermination de la distribution lectronique : une mthode
exprimentale base sur la diffraction X haute rsolution et une mthode thorique base sur
les calculs quantiques Hartree-Fock ou DFT (fonctionnelle de densit). Ces deux mthodes
donnent des rsultats trs comparables. Depuis plus de dix ans, nous avons appliqu ces
mthodes diffrentes molcules pharmaceutiques qui ont dans le domaine de la recherche et
de la sant en gnral un intrt certains.
Dans cette prsentation orale, nous commencerons par donner les bases de calculs des
proprits lectrostatiques avant de prsenter nos rsultats sur les molcules pharmaceutiques
que nous avons tudies.
5b - Densit lectronique, modlisation Jeudi 4 juillet 10h30-12h00
- 92 -
O52 - Ab initio Description of Nuclear Motion and Electron
Correlation Effects on the Density Matrix of Crystals
Alessandro Erba,
a,*
Cesare Pisani,
a
Matteo Ferrabone
a
and Roberto Dovesi
a
a
Dipartimento di Chimica, Universit di Torino, via Giuria 5 10125, Torino, Italy
* E-mail: alessandro.erba@unito.it
A large number of effects has to be accurately taken into account when comparing theoretical
predictions with experimental determinations of the electron charge distribution of crystals.
Within the framework of ab initio simulations, in this contribution we address two of them:
thermal nuclear motion and dynamic electron correlation.
Two schemes for the inclusion of nuclear motion effects are presented: (i) a fully ab initio
technique for the determination of atomic anisotropic displacement parameters (ADP) of
crystalline materials within the harmonic approximation to the lattice potential [1]; (ii) a
harmonic Monte Carlo ab initio approach for the description of nuclear motion effects on the
electronic density matrix of crystalline materials [2]: in the frame of the Born-Oppenheimer
approximation, nuclear motions in crystals can be simulated rather accurately using a
harmonic model. In turn, the electronic first-order density matrix can be expressed as the
statistically weighted average over all its determinations each resulting from an instantaneous
nuclear configuration.
As regards electron correlation, the CRYSCOR program implements the MP2 method for
crystals, reformulated according to the so-called local approach (namely LMP2) [3]. The
program provides both the LMP2 correction to the Hartree-Fock energy and one-electron
Density Matrix (DM) [4]. As a consequence, the correlation correction at LMP2 level to
several DM-related quantities such as electron charge and momentum densities, Compton
profiles, static structure factors, etc. can be evaluated.
Such schemes have been developed within the formalism of all-electron atom-centered basis
sets, one-electron Hamiltonians (Hartree-Fock, Density-functionaltheory, hybrids) and
periodic boundary conditions, and implemented in the CRYSTAL and CRYSCOR programs
for solid state quantum chemistry.
[1] A. Erba, M. Ferrabone, R. Orlando and R. Dovesi, J. Comput. Chem., 34, 346 (2013).
[2] C. Pisani, A. Erba, M. Ferrabone and R. Dovesi, J. Chem. Phys., 137, 044114 (2012).
[3] C. Pisani, M. Schtz, S. Casassa, D. Usvyat, L. Maschio, M. Lorenz and A. Erba, Phys.
Chem. Chem. Phys., 14, 7615 (2012)
[4] D. Usvyat and M. Schtz, J. Phys.: Conf. Ser., Honorary issue Pisani, 117, 012027
(2008).
5b - Densit lectronique, modlisation Jeudi 4 juillet 10h30-12h00
- 93 -
O53 - Les liaisons halogne et chalcogne pour lingnierie cristalline
et la chimie supramolculaire
M. Brezgunova
1
, E. Aubert
1
, S. Dahaoui
1
, T.T.T. Bui,
1
J. Lieffrig,
2
S. Lebgue,
1
C. Jelsch,
1
P.
Fertey,
3
C. Lecomte,
1
J.G. ngyn,
1
M. Fourmigu,
2
Enrique Espinosa
1
1
Laboratoire de Cristallographie, Rsonance Magntique et Modlisations (CRM2), UMR
CNRS 7036, Universit de Lorraine, BP 70239, Bd. des Aiguillettes, 54506 Vandoeuvre-ls-
Nancy, France.
2
Institut des Sciences Chimiques de Rennes Universit Rennes 1, UMR CNRS 6226 Campus
de Beaulieu, 35042 Rennes, France.
3
Synchrotron Soleil, LOrme des Merisiers Saint-Aubin, BP 48, 91192 Gif-sur-Yvette, France.
E-mail : enrique.espinosa@crm2.uhp-nancy.fr
La liaison halogne est une interaction attractive et directionnelle. Elle se forme entre un
atome dhalogne, li un atome de carbone, et un autre atome dhalogne ou une base de
Lewis (CHalX, X = Hal, B). Lorigine de cette interaction faible a t associe
lanisotropie de la distribution lectronique autour du noyau de lhalogne. Cette anisotropie
conduit des rgions lectrophiles (
+
) selon la direction CHal et des rgions nuclophiles
(
-
) dans le plan perpendiculaire cette direction. Lintensit et les aspects directionnels de la
liaison halogne peuvent tre aussi efficaces que ceux de la liaison hydrogne pour guider
lassemblage molculaire. Malgr le fait que cette interaction puisse tre mise profit dans les
domaines de lingnierie cristalline et de la chimie supramolculaire, la caractrisation et la
modlisation exprimentale de la liaison halogne ont t trs peu explores. Notre groupe a
tudi la structure et la densit lectronique cristalline des composs hexachlorobenzne
(C
6
Cl
6
), hexabromobenzne (C
6
Br
6
), pentachlorophnol (C
6
Cl
5
OH) et pentabromophnol
(C
6
Br
5
OH), ce qui a permis de mettre en vidence les rgions lectrophile/nuclophile autour
des noyaux des atomes de chlore et de brome et les interactions que celles-ci ralisent.[1,2]
Par ailleurs, la liaison chalcogne prsente de nombreuses similitudes avec la liaison
halogne. En effet, elle est galement contrle par des interactions lectrostatiques du type
lectrophile-nuclophile entre rgions atomiques
+
et
-
. Avec ltude du compos C
8
H
4
O
2
Se
nous avons prouv le fort caractre directionnel de la liaison chalcogne ChalX (X = Chal,
Hal, B).[3]
Afin de les utiliser dans les domaines de lingnierie cristalline et de la chimie
supramolculaire, lintensit lectrostatique et lnergie des liaisons halogne et chalcogne
ont t caractrises et compares celles des liaisons hydrogne dans les mmes structures
cristallines.[2,3]
[1] (a) T. T. T. Bui, S. Dahaoui, C. Lecomte, G. R. Desiraju, E. Espinosa, Angew. Chem. Int.
Ed., 2009, 48, 3838-3841; (b) E. Aubert, S. Lebgue, M. Marsman, T.T.T. Bui, C. Jelsch, S.
Dahaoui, E. Espinosa and J.G. ngyn, J. Phys. Chem. A, 2011, 115, 14484-14494.
[2] M. E. Brezgunova, E. Aubert, S. Dahaoui, P. Fertey, S. Lebgue, C. Jelsch, J. G. ngyn,
E. Espinosa, Cryst. Growth & Des., 2012, 12, 5373-5386.
[3] M. E. Brezgunova, J. Lieffrig, E. Aubert, S. Dahaoui, P. Fertey, S. Lebgue, J. G. ngyn,
M. Fourmigu, E. Espinosa, Cryst. Growth & Des., 2013 (submitted).
5b - Densit lectronique, modlisation Jeudi 4 juillet 10h30-12h00
- 94 -
O54 - Ab-initio Study of structural, Electronic and Magnetic
Properties of CdTe Doped Transition Metal Co
Samir Bentata*, Ali Zitouni, Bouabdellah Bouadjemi and Wissam Benstaali
Laboratoire de Technologie et des Proprits du Solide
Faculty of Sciences and Technology, BP227
Abdelhamid Ibn Badis University, Mostaganem (27000) Algeria
*E-mail: sam_bentata@yahoo.com
The full potential linear augmented plane wave (FPLAPW) based on density-
functional theory (DFT) is employed to study the structural, electronic and magnetic
properties of transition metal Co doped CdTe. The 3d transition element Co is used as a
dopant in order to induce spin polarization. We have analyzed the structural parameters,
charge and spin densities, total and partial densities of states within the generalized gradient
approximation (GGA). The results show a half-metallic ferromagnetic character with an
important magnetic moment. The results obtained, make the Co
x
Zn
1-x
Te a promising
candidate for application in spintronics.
Keywords: magnetic moment, half-metallic, spin-up/spin-down, GGA.
5c - Cristallographie biologique et sant Jeudi 4 juillet 10h30-12h00
- 95 -
O55 - Mcanismes de reconnaissance et d'activation des rcepteurs
hormonaux par les perturbateurs endocriniens environnementaux
William Bourguet
Centre de Biochimie Structurale, Inserm U1054-CNRS U5048-UM1, 34090 Montpellier, France
Nous sommes quotidiennement exposs des milliers de polluants environnementaux
dont certains peuvent agir comme des perturbateurs endocriniens. Le terme de perturbation
endocrinienne fait rfrence la capacit de certaines substances exognes moduler le
systme hormonal de manire inapproprie et provoquer des effets dltres sur les
organismes vivants tels que des troubles de la reproduction, du comportement, du
mtabolisme ou encore des cancers. Les perturbateurs endocriniens sont le plus souvent des
composs de synthse produits par lindustrie mais on en trouve galement ltat naturel,
notamment dans les plantes et les champignons. Ils ont des structures chimiques gnralement
trs loignes de celles des hormones naturelles qui rendent la comprhension de leur liaison
aux rcepteurs nuclaires hormonaux particulirement difficile.
Dans ce contexte, nous dveloppons un projet original visant tudier de manire
systmatique les modes de reconnaissance et dactivation utiliss par les grandes familles de
polluants environnementaux (phtalates, parabnes, benzophnones, pesticides, alkylphenols,
organotains, etc.) lors de linteraction avec leurs rcepteurs hormonaux cibles. Lors de cet
expos, je prsenterai plus particulirement les cas du bisphnol A (BPA) [1], des
organotains [2] et du phtalate MEHP [3] afin dillustrer la diversit des mcanismes mis en
uvre. Jvoquerai galement le dveloppement dun outil bioinformatique qui utilise ces
structures cristallographiques exprimentales pour faciliter la modlisation de linteraction des
molcules environnementales avec les rcepteurs nuclaires et donc la prdiction de leur
activit hormonale.
Une application directe de ces rsultats dans le domaine de lenvironnement est de
pouvoir proposer des modifications chimiques des composs existants afin de dissocier leurs
proprits industrielles de leur activit hormonale rsiduelle. Ces recherches peuvent avoir
galement des retombes dans le domaine de la sant car elles permettent de rvler des
modes de liaison insouponns pouvant inspirer la conception de nouvelles molcules
thrapeutiques.
[1] Delfosse et al., Proc Natl Acad Sci U S A. 2012, 109, 14930-5.
[2] le Maire et al., EMBO Rep. 2009, 10, 367-73.
[3] Rsultats non publis.
5c - Cristallographie biologique et sant Jeudi 4 juillet 10h30-12h00
- 96 -
O56 - Une approche structurale pour linhibition slective de
PI3Kbeta
Thomas Bertrand
1
, Jean-Pierre Marquette
1
, Andreas Karlsson
1
, Nadine Michot
2
, Angela
Virone-Oddos
3
, Victor Certal
3
,
Frank Halley
3
1
Structure Design and Informatics,
2
Protein Production,
3
Oncology Drug Discovery
Sanofi, 13 Quai Jules Guesde, 94403 Vitry-sur-Seine France.
La voie de signalisation PI3K/mTOR est implique dans la prolifration, la survie des
cellules tumorales et les mtastases. Lidentification de mutations somatiques activatrices du
gne PIK3CA ainsi que la frquence trs leve de la perte du suppresseur de tumeur PTEN
(Phosphatase and TENsin homologue), activant cette voie dans les tumeurs humaines, ont
conduit au dveloppement de nouvelles thrapies anticancreuses ciblant cette voie. Dans le
cas de la perte de PTEN, lactivation anormale de cette voie de signalisation est due
lisoforme PI3Kbeta. La plupart des inhibiteurs de PI3K en dveloppement clinique tant des
molcules pan-PI3K, il serait utile de dcouvrir des inhibiteurs slectifs de lisoforme
PI3Kbeta pour le traitement des cancers humains prsentant une dficience en PTEN. Les
structures de PI3Kbeta et dautres isoformes en complexe avec diffrents inhibiteurs ont t
rsolues par cristallographie des rayons X. Elles ont permis de mieux comprendre la relation
structure-activit de la srie chimique du candidat actuellement en phase clinique ainsi que sa
slectivit
1
.
[1] Certal et al., J. Med. Chem. 2012, 55(10), 4788-4805.
5c - Cristallographie biologique et sant Jeudi 4 juillet 10h30-12h00
- 97 -
O57 - Structure cristallographique de la protine FadD32 de
Mycobacterium marinum, une cible potentielle pour le dveloppement
de nouveaux antituberculeux
Valrie Guillet
1
, Sgolne Galandrin
2
, Mamadou Daff
2
, Hdia Marrakchi
2
et Lionel
Mourey
1
1
Groupe de Biophysique Structurale, IPBS/CNRS,
2
Enveloppes mycobactriennes : Structure, biosynthse et fonctions, IPBS/CNRS Universit
de Toulouse, F-31077 Toulouse, France
La dcouverte de nouveaux antituberculeux est ncessaire pour permettre un traitement
efficace de la maladie quel que soit le stade de linfection. Un des axes pour la dcouverte de
nouvelles molcules est de cibler la biosynthse de composants de lenveloppe
Mycobacterium tuberculosis, parmi lesquels les acides mycoliques. Ces lipides sont des
composants majeurs et spcifiques de lenveloppe mycobactrienne et essentiels la survie.
Ltape clef de la formation des acides mycoliques est la condensation de deux chanes
dacides gras. Cette tape est contrle par lopron fadD32-pks13-accD4, essentiel la
croissance du bacille tuberculeux [1]. FadD32 est une fatty acyl-AMP ligase (FAAL) qui
active un acide gras en C50-C60 (conversion des acides gras en acyl-adnylates [2]) avant
condensation avec un acide gras en C22-C26 par lenzyme Pks13 [3]. La protine FadD32 est
conserve dans tous les gnomes des espces mycobactriennes squences et reprsentent
une cible trs prometteuse. Lactivit enzymatique in vitro de FadD32 de M. tuberculosis
tant relativement faible, nous avons largi cette tude dautres enzymes orthologues
complexes des analogues de substrats ou inhibiteurs. Des cristaux de FadD32 de M.
marinum et M. smegmatis ont t obtenus et les structures rsolues en complexe avec un
inhibiteur analogue de substrat [4].
Ces structures sont essentielles pour comprendre les disparits de spcificit de substrat
et dactivit enzymatique entre les diffrentes FadD32 et au sein de la famille des FAAL,
ouvrant ainsi de nouvelles perspectives en drug design. Outre la rsolution de la structure,
nous avons galement dvelopp un test de criblage haut-dbit (HTS). Lidentification de
ligands potentiels et la validation de ces composs a t ralise par mesure de la modulation
de la stabilit thermique. Ce criblage a permis lidentification de nouvelles classes
dinhibiteurs [5].
[1] Portevin D. et al., J. Biol. Chem. 2005, 280, 8862-8874.
[2] Lger M. et al., Chem. Biol. 2009, 16 (5): 510519.
[3] Gavalda S. et al., J. Biol. Chem. 2009, 284 (29): 1925519264.
[4] Guillet V. et al., manuscrit en prparation
[5] Galandrin S. et al., J. Biomol. Screen. 2013, 18(5):576-87.
5c - Cristallographie biologique et sant Jeudi 4 juillet 10h30-12h00
- 98 -
O58 - Toward closing the synaptic gap: a molecular approach to
explore neuronal connectivity deficiencies associated with autism
Pascale Marchot
1,2
, Philippe Leone
1
, Igor P Fabrichny
1,2
, Davide Comoletti
3
, Meghan T
Miller
3
, Graldine Ferracci
4
, Simon U Garcia
3
, Sandrine Conrod
2
, Palmer Taylor
3
, Yves
Bourne
1
1
Architecture et Fonction des Macromolcules Biologiques (AFMB), CNRS/AMU, Marseille,
France.
2
Biochimie des
Interactions Cellulaires et Molculaires (BIMC), CNRS/AMU, and
4
Centre
dAnalyse Protomique de Marseille (CAPM), Facult de Mdecine Secteur Nord, Marseille,
France.
3
Dept. of Pharmacology, Skaggs School of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences (SSPPS),
UCSD, La Jolla, CA.
Neuronal circuits are maintained by homeostatic mechanisms controlling synapse
maturation and signaling. The neuroligins are postsynaptic cell adhesion proteins whose
transient associations with presynaptic alpha- and beta-neurexins participate in synaptogenesis
and may regulate the ne balance between excitation and inhibition. This heterophilic
interaction is regulated by gene selection, alternative mRNA splicing and post-translational
modifications. Mutations in the neuroligin and neurexin genes appear to be associated with
autism and mental retardation.
Structural analyses of neuroligin-4 [1] and its complex with a beta-neurexin partner [2]
led to position the neuroligin structural defects associated with autism-linked mutations and
precluding either proper folding and trafficking to the cell membrane, or recognition of the
neurexin partner. These analyses also showed that whereas neuroligin-1 (found at
glutamatergic and central cholinergic synapses) and neuroligin-2 (found at gabaergic and
glycinergic synapses) are preset conformationally to respectively bind and not bind neurexin,
conformational reshaping at the surface of neuroligin-4 (found at glycinergic synapses),
controled by environmental variations, is required for accommodating neurexin, thus adding
another mean for regulation of the neurexin-neuroligin interaction.
This work illustrates how structural biology, associated with molecular biology and
biochemistry approaches, can contribute to dissect the organization and functioning of inter-
cellular interactions crucial for neuronal activity.
[1] Fabrichny, Leone, Sulzenbacher, Comoletti, Miller, Taylor, Bourne, Marchot (2007)
Structural analysis of the synaptic protein neuroligin and its |-neurexin complex:
determinants for folding and cell adhesion. Neuron 56, 979-91.
[2] Leone, Comoletti, Ferracci, Conrod, Garcia, Taylor, Bourne, Marchot (2010) Structural
insights into the exquisite selectivity of neurexin/neuroligin synaptic interactions. EMBO J 29,
2461-71.
Work supported by the SPINE2-Complexes Consortium (to YB, PM and PL); the CNRS
Direction des Relations Internationales Sciences de la Vie (to PM and YB); the CNRS and
Fondation pour la Recherche Mdicale (to IF); the Autism Speaks and the Cure Autism Now
Pilot Study (to DC), and NIH grants (to PT and MM).
6a - Mthodes mergentes en cristallographie Jeudi 4 juillet 13h30-15h30
- 99 -
O59 - Application de la Fonction de Distribution de Paires l'tude de
matriaux nano-cristallins ou mal ordonns
Pierre Bordet
Institut Nel, CNRS-UJF, Grenoble
Depuis quelques annes, lanalyse de la diffusion totale par la fonction de distribution
de paires (PDF) connait un renouveau important [1], motiv, dune part, par le dveloppement
de nouvelles sources de haute nergie et intensit allies des mthodes danalyse robustes et
dautre part par lmergence de thmatiques matriaux ncessitant la prise en compte de la
structure locale. Ainsi, lanalyse PDF a-t-elle t applique avec succs des problmes trs
varis allant de ltude de la transition Jahn-Teller dans les manganites magnto-rsistives [2]
celle dinclusions nanocristallines dans des minraux base de titane [3].
Cependant, lutilisation de la PDF a t jusquici cantonne pour lessentiel au domaine
des composs minraux de structures relativement simples. Nous voulons ici montrer travers
deux exemples que la PDF peut tre un outil prcieux dans le cadre dtudes structurales de
matriaux plus complexes
Le premier de ces exemples portera sur lapport de la PDF dans ltude de composs
molculaires ou pharmaceutiques. Le deuxime, sur ltude du verdissement progressif de
pigments de bleu de Prusse anciens. Dans les deux cas, on prcisera lapport de lanalyse PDF
ainsi que les difficults nouvelles qui devront tre prises en compte pour un application
optimale de la mthode ce type de composs
[1] EGAMI T., BILLINGE S. J. L. (2003) Underneath the Bragg Peaks: Structural analysis of
complex materials, Pergamon, Oxford, England.
[2] BOZIN ET AL. (2007) Phys. Rev; Lett. 98, 137203.
[3] GREY I.E., et al. (2010) American Mineralogist, 95, 161
6a - Mthodes mergentes en cristallographie Jeudi 4 juillet 13h30-15h30
- 100 -
O60 - Nouvelles possibilits exprimentales en physique introduites
par les XFELs
Jan Lning
Universit Pierre et Marie Curie, Paris
Le rayonnement des nouveaux lasers lectrons libres mettant des rayons X (XFEL,
pour X-ray Free Electron Laser) permet de raliser des expriences entirement nouvelles
grce aux proprits uniques de leur rayonnement : des impulsions ultra-brves (domaine de
la femtoseconde) et ultra-intenses avec un trs haut degr de cohrence. Ceci cre des
nouvelles possibilits pour l'tude exprimentale dans une grande diversit de domaines
scientifiques, aller de la physique la chimie, la biologie et autres.
Pour leur exploitation, un grand nombre de nouvelles techniques exprimentales et
d'instrumentations originaux ont t conus pendant les quelques annes depuis le XFEL
FLASH en Hambourg est devenu une source ouverte aux utilisateurs. Entre temps, il y a
quatre XFELs qui servent une communaut d'utilisateurs en pleine croissance : les XUV-
FELs FLASH et FERMI (Italie) et les XFELs LCLS (Etats-Unis) et SACLA (Japon).
Cette prsentation commencera par un rsum de ce dveloppement rcent en mettant
l'accent sur les capacits et les dfis exprimentaux qui drivent des proprits uniques de ces
sources.
Aprs une prsentation plus gnrale de l'tat de l'art des techniques de diffusion aux
XFELs, quelques exemples rcents concernant la physique de la matire condense sont
discuts en plus de dtails.
6a - Mthodes mergentes en cristallographie Jeudi 4 juillet 13h30-15h30
- 101 -
O61 - Mthodes rapides pour analyser les dsordres structuraux
statiques et dynamiques dans limmense espace rciproque.
Laurent Gurin
1
, Bertrand Toudic
1
, Cline Mariette
1
, Philippe Rabiller
1
, Alexei Bosak
2
,
Danile de Sanctis
2
, Jacques Ollivier
3
1
Institut de Physique de Rennes,
2
ESRF, Grenoble,
3
ILL, Grenoble
Une tendance constante de la cristallographie est daller vers ltude de systmes de
plus en plus complexes. Ceci se caractrise par des mailles de plus en plus grandes, voire
infinies pour des cristaux apriodiques qui possdent un ordre grande distance mais sans la
symtrie de translation. Aux structures moyennes sont associs des dsordres, fluctuations de
diffrents types qui induisent la rduction de lintensit des pics de Bragg et simultanment
lapparition de la diffusion diffuse dans lespace rciproque. Un exemple fameux est le
Thermal Diffuse Scattering (T.D.S.), signature des branches de phonon dont lintensit crot
comme le module du vecteur rciproque au carr. Bien sr de nombreux autres sources de
dsordre existent en lien, comme le T.D.S., avec des fluctuations collectives (modes de
phason si matriaux apriodiques, phnomnes prtransitionnels critiques de type mode mou
ou ralentissement critique des fluctuations autour dinstabilits structurales) ou des
fluctuations locales darrangement structural ou de composition. Dun point de vue structural,
le challenge est videmment de rsoudre la structure en affinant simultanment la diffusion
diffuse et les pics de Bragg. Cette mthode dite 3D-PDF ne fera pas lobjet de cette
prsentation et nous nous focaliserons ici sur le caractre potentiellement dynamique du
dsordre prsent dans ces matriaux. Cette information en nergie est essentielle pour
dterminer lorigine du dsordre et le caractriser. Ltude couple de la diffraction X et des
X inlastiques permet une analyse rapide et complte grce aux dveloppements rcents de
dtecteurs trs haute rsolution bruit nul et aux spectromtres rtrodiffusion sur sources
synchrotrons. Si ncessaire, des mesures par diffusion neutronique en temps de vol peuvent
complter ces informations pour les dynamiques les plus lentes. Cette approche exprimentale
sera illustre par une tude du dsordre dans un cristal composite apriodique organique.
6a - Mthodes mergentes en cristallographie Jeudi 4 juillet 13h30-15h30
- 102 -
O62 - Dfauts de phase dans les cristaux lectroniques tudis par
diffraction cohrente des rayons X
Vincent Jacques
LPS, Universit Paris Sud
La diffraction cohrente des rayons X est une technique trs sensible la prsence de
dfauts de phase dans les cristaux. Une dislocation de rseau est un exemple typique de
dfaut de phase cristallin qui cre un effet dinterfrence visible en diffraction cohrente. Cet
effet a t dmontr exprimentalement sur des boucles de dislocation isoles dans le silicium
[1]. Au-del des dislocations de rseau, les dfauts de phase se rencontrent dans tout type de
structure, et en particulier dans les cristaux lectroniques, qui prsentent des modulations
statiques de la densit de charge appeles Ondes de Densit de Charge (ODC). Ces structures
lectroniques sont des cristaux part entire qui se forment dans une structure atomique sous-
jacente par un mcanisme de distorsion priodique de rseau appele distorsion de Peierls.
Dans certains systmes, les ODC sont incommensurables et elles ont la possibilit de glisser
lorsquelles sont soumises laction dune force extrieure telle que celle engendre par
lapplication dun courant lectrique. Nous montrerons comment les ODC des systmes
quasi-unidimensionnels K0.3MoO3 et NbSe3 se comportent sous courant, et notamment
comment la diffraction cohrente des rayons X a permis de mettre en vidence les diffrents
rgimes de glissement de lODC dans NbSe3 [2] et un rseau de solitons dans K0.3MoO3
[3,4].
[1] V.L.R. Jacques et al., PRL 106, 065502 (2011)
[2] E. Pinsolle et al., PRL 109, 256402 (2012)
[3] D. Le Bolloch et al., PRL 100, 096403 (2008)
[4] V.L.R. Jacques et al., PRB 85, 035113 (2012)
6b - Biologie structurale intgrative et gros assemblages
Jeudi 4 juillet 13h30-15h30
- 103 -
O64 - Dmarrage de la traduction chez les eucaryotes et les arches: le
facteur e/aIF2
Yves Mechulam, Pierre-Damien Coureux, Etienne Dubiez, Auriane Monestier, Marie
Naveau, Christine Lazennec-Schurdevin, Michel Panvert et Emmanuelle Schmitt
Laboratoire de Biochimie, Unit mixte de Recherche 7654, Ecole Polytechnique, Centre
National de la Recherche Scientifique, F-91128 Palaiseau cedex.
Chez tous les tres vivants, le dmarrage de la traduction implique le recrutement dun
ARNt initiateur spcialis, systmatiquement aminoacyl par une mthionine. Cet ARNt joue
un rle cl dans lidentification du codon de dmarrage sur lARNm. Malgr luniversalit de
ce processus, les mcanismes de slection et dutilisation de cet ARNt diffrent suivant le
domaine, bactrien, eucaryote ou archen. Chez les eucaryotes et les arches, le facteur
htrotrimrique de dmarrage de la traduction 2 (e/aIF2) forme un complexe ternaire avec le
GTP et l'ARN de transfert initiateur, puis vient se lier la petite sous-unit du ribosome.
Lappariement entre lanticodon de lARNt et le codon de dmarrage sur lARNm engendre
une cascade dvnements qui aboutit au dpart des facteurs de dmarrage et au
positionnement correct du ribosome pour une traduction fidle.
Nous utilisons un ensemble de mthodes biochimiques et structurales pour dcrire la
formation du complexe de dmarrage archen, et le rle des facteurs dans la spcificit du
systme. Nous dcrirons plus particulirement les rsultats obtenus concernant la liaison de
lARNt initiateur au facteur aIF2, ainsi que le rle du facteur aIF1 dans la formation du
complexe de dmarrage. De manire surprenante, malgr une similitude structurale
considrable entre la sous unit centrale d'e/aIF2 et le facteur d'allongement de la traduction
EF-Tu, ces deux protines G de l'appareil de traduction utilisent des stratgies de liaison de
l'ARNt radicalement diffrentes [1]. Ces rsultats seront galement discuts dans le contexte
du dmarrage de la traduction chez les eucaryotes [2].
[1] Schmitt et al., Nat. Struct. Mol. Biol. 2012, 19, 450-454.
[2] Naveau et al., Nucleic Acids Res. 2013, 41, 1047-1057.
6b - Biologie structurale intgrative et gros assemblages
Jeudi 4 juillet 13h30-15h30
- 104 -
O65 - Crystal structure of the eukaryotic 80S ribosome
Nicolas Garreau de Loubresse and Marat Yusupov
Institut de Gnetique et de Biologie Molculaire et Cellulaire, UMR7104 IGBMC, U964
INSERM, Dpartement de Biologie Structurale Intgrative, Illkirch, France.
Ribosomes translate genetic information encoded by messenger RNA into proteins.
Many aspects of translation and its regulation are specific to eukaryotes, whose ribosomes are
much larger and intricate than their bacterial counterparts. We report the crystal structure of
the 80S ribosome from the yeast Saccharomyces cerevisiae at a resolution of 3.0 angstroms.
This atomic model reveals the precise architecture of eukaryote-specific elements and their
interaction with the universally conserved core. Together, it forms the structural and
experimental framework to explore the eukaryotic translation apparatus as well as small
molecules of therapeutic interest against infectious diseases, genetic disorders and cancers.
Emphasis will be placed on methods development and recent advances to investigate small
molecules on the yeast ribosome.
6b - Biologie structurale intgrative et gros assemblages
Jeudi 4 juillet 13h30-15h30
- 105 -
O66 - Etude structurale et fonctionnelle de la protine Pat1 de
Saccharomyces cerevisiae
Zeineb Fourati-Kammoun
1,2
, Olga Kolesnikova
3
, Jenny Keller
2
, Noureddine Lazar
2
,
Anthony Doizy
2
, Herman van Tilbeurgh
2
, Bertrand Sraphin
3
et Marc Graille
1,2
1
Laboratoire de Biochimie, Ecole Polytechnique, Route de Saclay, Palaiseau,
2
Institut de Biochimie et Biophysique Molculaire et Cellulaire, Universit Paris sud, Orsay
3
Equipe Labellise La Ligue, IGBMC (Institut de Gntique et de Biologie Molculaire et
Cellulaire), Illkirch F-67400, France; CNRS, UMR7104, Illkirch F-67404, France; Inserm,
U964, Illkirch F-67400, France; and Universit de Strasbourg, Strasbourg F-67000, France
La quantit dun ARNm eucaryote dans la cellule est finement rgule par lquilibre
entre son niveau de transcription et sa vitesse de dgradation. Chez la levure S. cerevisiae, la
dgradation des ARNm se fait essentiellement par la voie 5-3, tributaire dune tape de
decapping . Cette tape, catalyse par lenzyme Dcp2, vise dtruire la coiffe stabilisatrice
en 5 des ARNm pour permettre lexonuclase Xrn1 de dgrader lARNm dans le sens 5-
3. Lactivit catalytique intrinsque de Dcp2 est trs faible et requiert lintervention dun
ensemble de facteurs formant le complexe activateur du decapping . La protine Pat1
constitue un lment central de ce complexe [1]. En effet, Pat1 active directement la catalyse
par Dcp2 travers son domaine C terminal, et utilise ce domaine pour fixer Dcp2 et certains
autres activateurs du decapping [2, 3].
La structure cristallographique du domaine C terminal de Pat1 de S. cerevisiae ainsi
que la caractrisation de son interaction avec lARN seront prsents. La structure de ce
domaine rvle une particularit par rapport son orthologue humain [4]. Il sagit dune
extension C terminale caractristique des levures, dont la dltion induit un phnotype
thermosensible in vivo, suggrant quil sagit dun domaine fonctionnellement important. En
considrant quil existe deux paralogues Pat1 chez lhomme (Pat1a et Pat1b) dont un seul est
impliqu dans le decapping , ce rsultat stipule que Pat1 ait volu en sparant deux
domaines fonctionnellement importants chez les eucaryotes suprieurs.
[1] Bonnerot C, Boeck R, Lapeyre B (2000) The two proteins Pat1p (Mrt1p) and Spb8p
interact in vivo, are required for mRNA decay, and are functionally linked to Pab1p. Mol Cell
Biol 20: 5939-5946
[2] Nissan T, Rajyaguru P, She M, Song H, Parker R (2010) Decapping activators in
Saccharomyces cerevisiae act by multiple mechanisms. Mol Cell 39: 773-783
[3] Pilkington GR, Parker R (2008) Pat1 contains distinct functional domains that promote P-
body assembly and activation of decapping. Mol Cell Biol 28: 1298-1312
[4] Braun JE, Tritschler F, Haas G, Igreja C, Truffault V, Weichenrieder O, Izaurralde E
(2010) The C-terminal alpha-alpha superhelix of Pat is required for mRNA decapping in
metazoa. EMBO J 29: 2368-2380
6b - Biologie structurale intgrative et gros assemblages
Jeudi 4 juillet 13h30-15h30
- 106 -
O67 - Dtermination des bases structurales du mcanisme de
permation des ions chez les rcepteurs-canaux pentamriques de la
famille Cys-loop
Ludovic Sauguet
1
, Samuel Murail
2
, Catherine Van Renterghem
3
, Laurie Malherbe
1
, Frdric
Poitevin
1
, Andy Thompson
4
, Pierre-Jean Corringer
3
, Marc Baaden
2
et Marc Delarue
1
1
Unit de Dynamique Structurale des Macromolcules, Institut Pasteur, Paris
2
IBPC, Paris,
3
Unit Rcepteurs-Canaux, Institut Pasteur, Paris,
4
Synchrotron SOLEIL, Gif-sur-Yvette
Chez les vertbrs, les rcepteurs-canaux de la famille Cys-loop (RCPs) assurent la
transmission chimio-lectrique du signal lectrique nerveux par lintermdiaire de transitions
allostriques qui couplent la liaison dun agoniste avec louverture ou la fermeture du canal
|1|. Chez lhomme, ces protines membranaires pentamriques comprennent les rcepteurs
nicotiniques, GABA, glycine et srotonine, qui sont la cible de nombreuses classes de
molcules thrapeutiques. Les mcanismes de permation des ions chez les RCPs demeurent
nanmoins peu documents. La dtermination de la structure de GLIC |2|, un homologue
procaryote de la famille, dans une conformation ouverte permante aux ions |3-4|, constitue
un bon modle structural permettant dtudier les mcanismes de permation chez les RCPs.
En amliorant rcemment la structure de GLIC 2.4 de rsolution, la plus haute
rsolution atteinte pour des RCPs, nous avons pu pour la premire fois dcrire
exprimentalement la gomtrie dhydratation dans le pore de ces rcepteurs et notamment la
prsence de deux pentagones deau |5|. A partir de co-cristaux obtenus en prsence de
diffuseurs anomaux (Br
-
, Cs
+
et Rb
+
), nous avons cartographi les sites de fixation des ions
monovalents positifs et ngatifs dans la structure de GLIC et notamment dans le pore
transmembranaire. Cette tude structurale a t complte par des simulations de dynamique
molculaire et des expriences dlectrophysiologie sur canal-unique qui ont permis de
proposer un mcanisme pour la permation des ions |5|.
[1] Corringer P.J., Poitevin F., Prevost M.S., Sauguet L. et al. Structure. 2012, 20 (6)
941-56
[2] Bocquet N. et al. Nature 2009, 457 (7225) 111-4
[3] Prevost M., Sauguet L. et al. Nature Struct. Mol. Biol. 2012, 19 (6) 642-9
[4] Sauguet L. et al. Nature communications. 2013, 16 (4) 1697
[5] Sauguet L. et al. EMBO J. 2013, 32 (5) 728-41
6b - Biologie structurale intgrative et gros assemblages
Jeudi 4 juillet 13h30-15h30
- 107 -
O68 - tudes structurales et fonctionnelles du complexe de pr-
intgration du VIH-1
Nicolas Levy
1
, Sylvia Eiler
1
, Aurlie Schaetzel
1
, Corinne Crucifix
1
, Karine Pradeau-
Aubtreton
1
, Vincent Parissi
2
, Stphane Emiliani
3
, Yves Mly
4
, Patrick Schultz
1
, Marc Ruff
1
1
IGBMC, 1 rue Laurent Fries, 67404 Illkirch,
2
Laboratoire de Microbiologie Fondamentale et Pathognicit, Universit de Bordeaux 2,
Bordeaux,
3
Institut Cochin, Universit Paris Descartes, Paris,
4
Laboratoire de Biophotonique et Pharmacologie. UMR 7213 CNRS, UDS, Facult de
Pharmacie, Illkirch
Dans les tapes prcoces de la rplication du VIH-1, le gnome viral est converti en
ADN qui va interagir avec des protines cellulaires et virales pour former le complexe de pr-
intgration (PIC). Lintgrase (IN) est une protine essentielle du PIC et intervient dans
plusieurs tapes de la rplication du virus, comme la dcapsidation, la rverse transcription,
limport nuclaire, le ciblage de la chromatine et lintgration. Lintgrase va recruter des
protines de la cellule hte pour effectuer ces diverses fonctions. Les mcanismes
molculaires et la dynamique de ces processus ainsi que le rle des cofacteurs cellulaires
restent largement inconnus. Les intgrases rtrovirales sont des protines montrant une grande
flexibilit inter domaine. Comme pour dautres protines dsordonnes, cette flexibilit
intrinsque confre lintgrase la capacit dinteragir avec des partenaires multiples. Nous
assumons que les diffrentes fonctions du PIC dans linfection virale refltent les diffrentes
conformations de ses composant protiques qui peuvent varier avec les protines partenaires
et les modifications post traductionnelles. Nous avons dmontr que la faible solubilit et la
flexibilit inter domaine peuvent tre contournes par la formation de complexes stables et
spcifiques avec des substrats comme des cofacteurs protiques et par des modifications post
traductionnelles. Nous avons reconstitus in vitro des complexes solubles et stables autour de
lintgrase qui est prsente toutes les tapes de la transcription inverse lintgration. Les
structures des complexes IN/LEDGF/DNA [1] et IN/LEDGF/INI1/DNA [2] ont t rsolues
par cryo microscopie lectronique. Ces structures combines aux essais fonctionnels ont
donns des informations importantes pour les rles de LEDGF et INI1 dans linfection virale.
Un autre sous complexe du PIC a t caractris au laboratoire, le complexe IN/transportine-
SR2/VBP1 impliqu dans le transfert nuclaire du PIC. Des rsultats prliminaires sur la
structure de ce complexe seront prsents.
[1] Michel et al, EMBO J.. 2009, 28, 980-991.
[2] Maillot et al, PLoS ONE, 2013, 8(4): e60734. doi:10.1371/journal.pone.0060734
Laurats des prix de thse de lAFC 2012 Jeudi 4 juillet 18h00-19h00
- 108 -
(GT-BIO)
O69 - Contrle du mtabolisme central chez les mycobactries par la
rgulation allostrique de lalpha-ktoglutarate dshydrognase.
Tristan Wagner
Institut Pasteur, Paris
L-ktoglutarate dshydrognase (KDH) est un complexe multienzymatique
constitu de trois composants (E1o, E2o, E3) situ au nud mtabolique entre le cycle de
Krebs et lassimilation de lazote. Vu son rle clef, ce complexe ncessite une rgulation fine
pour coordonner le flux de carbone ainsi que la production dnergie par le cycle de Krebs.
Les Corynebacterineae ont une situation particulire car E2o est absent, son domaine
catalytique est fusionn E1o. Ce nouveau polypeptide (appel KGD pour E1o+E2o) possde
un systme unique de contrle par GarA, une protine domaine en tte de fourche (ce
domaine appel FHA reconnait les thronines phosphoryles). GarA est une sorte d
interrupteur molculaire qui rgule la synthse du glutamate et est contrl lui-mme par
phosphorylation. Dans ltat non phosphoryl, GarA lie E1o, le cur catalytique du complexe
KDH, en inhibant son activit.
Le but de cette thse est de dchiffrer le mcanisme catalytique de E1o, ainsi que les
bases molculaires de linhibition par GarA. Nous avons rsolu la structure cristalline de
KGD de Mycobacterium smegmatis en complexe avec son cofacteur thiamine diphosphate.
Nous montrons pour la premire fois que KGD effectue dimportants rarrangements
conformationnels pendant le cycle catalytique, le principal tant une translocation dun tour
dune hlice externe (E). GarA agit comme inhibiteur en liant cette hlice par son domaine
FHA, bloquant ainsi sa translocation. Linteraction KGD-GarA nimplique aucun rsidu
phospho-thronine mais un aspartate mimant la charge phosphate sur lhlice E, un
comportement sans prcdents pour une protine domaine FHA. Le domaine additionnel de
type E2o interagit galement avec la mme hlice E, gnrant un effet dinhibition
synergique avec GarA. Cet effet peut nanmoins tre contrecarr par laction de lactyl-CoA,
un activateur allostrique qui se lie un site distinct. Laction de lactyl-CoA, jusqu
prsent unique pour lenzyme mycobactrienne, est due des changements subtils de certains
rsidus clefs pour le rarrangement conformationnel catalytique.
Laurats des prix de thse de lAFC 2012 Jeudi 4 juillet 18h00-19h00
- 109 -
Structure de lorganisation hexamrique de KGD compos de E1o (en vert) et du domaine
E2o (en bleu). Le domaine FHA de GarA est reprsent en surface (violet) alors que
lemplacement du site actif de E1o est localis par le cofacteur thiamine pyrophosphate
(rouge).
Laurats des prix de thse de lAFC 2012 Jeudi 4 juillet 18h00-19h00
- 110 -
(GT CHIMIE)
O70 - Cristallochimie de nouveaux polymres de coordination
noyau spirobifluorne ou ttraphnylmthane : du design du ligand
la topologie et aux proprits du solide hybrides.
Florian Moreau
Laboratoire des Sciences Chimiques, Rennes
Ce travail concerne la cristallochimie de nouveaux polymres de coordination. Afin de
diriger la topologie des rseaux forms et d'obtenir des polymres de coordination poreux,
nous avons propos le design de ligands ttracarboxylates comportant deux types de noyaux
de gomtries fixes : le noyau ttraphnylmthane de symtrie Td et le noyau spirobifluorne
de symtrie D2d. des espaceurs phnyles ont t introduits dans une stratgie de chimie
d'chelle et la position de la fonction coordinante sur l'espaceur a t module afin de
permettre une flexibilit conformationnelle des ligands. La ractivit de ces ligands a t
explore vis--vis de sels de zinc, de cuivre et de lanthane. Les structures des polymres de
coordination ont t dtermines par diffraction des rayons x par le monocristal. La stabilit
thermique, la ractivit chimique et les proprits d'adsorption de gaz ont t investigues. Le
premier chapitre de ce mmoire est consacr l'tude bibliographique des polymres de
coordination poreux. Le deuxime chapitre expose la stratgie de synthse organique des
ligands viss. Les trois chapitres suivants regroupent selon leurs caractristiques structurales
les polymres de coordination synthtiss. Un clairage particulier est port sur les topologies
et le phnomne d'interpntration des rseaux ainsi que sur l'influence de la flexibilit des
ligands. Un dernier chapitre est consacr aux polymres de coordination 2D noyau
spirobifluorne. Enfin, un rcapitulatif des traits marquants des matriaux synthtiss clture
ce mmoire en abordant les perspectives offertes par ce travail.
Laurats des prix de thse de lAFC 2012 Jeudi 4 juillet 18h00-19h00
- 111 -
(GT PHYSIQUE)
O71 - Transitions de phases dans les argiles. Influence de la
minralogie et de la morphologie. Comportement sous coulement et
sous champs.
Erwan Paineau
Institut National Polytechnique Lorraine, Nancy
Lobjectif de ce travail est dtudier les transitions de phases sol-gel et isotrope-
nmatique dans des suspensions de smectites dioctadriques en fonction de la morphologie et
de la nature minralogique des argiles. Bien que tous les systmes tudis prsentent une
transition sol-gel de faibles fraction volumique, la transition cristal-liquide isotrope-
nmatique na pu tre identifie que dans le cas de suspensions de smectites ayant un dficit
de charge ttradrique. Leffet de la localisation de la charge sur le comportement collodal a
t dtermine laide de la diffusion des rayons X aux petits angles (SAXS) et par des
mesures rhologiques. La nature des interactions lectrostatiques dans ces suspensions est
purement rpulsive et rejette lide dune structure tridimensionnelle de type chteau de
carte . Cependant, les smectites ayant un dficit de charge ttradrique sont plus rpulsives et
ont des proprits viscolastiques plus faibles que celles ayant un dficit octadrique. Il a
galement t montr que la dpendance en taille de particules de la position de la transition
sol-gel tait lie une statistique de pigeage hydrodynamique des plaquettes dargile.
Finalement, lapplication de champs externes (lectrique et magntique) a permis dobtenir
lalignement de la phase nmatique tandis que dans la phase isotrope, le champ lectrique
induit un ordre antinmatique parfait. Afin de prserver lordre induit, ces suspensions ont t
polymrises sous champ permettant lobtention de nanocomposites orientes et structurs.
7a - Cristallographie in situ, in operando Vendredi 5 juillet 9h00-10h30
- 112 -
O72 - Complexit structurale de (RE)
2
NiO
4+o
explore par diffraction in
situ des neutrons et du rayonnement synchrotron pendant une raction
d'intercalation de loxygne contrle lectrochimiquement
M Ceretti
1
,
O. Wahyudi
2,3
, J. Stern
1
,
A. Villesuzanne
3
, J.M. Bassat
3
, G. Andr
4
, F. Porcher
4
,
W. Paulus
1
1
Universit de Montpellier 2, Institut Charles Gerhardt, UMR CNRS 5253, Montpellier,
2
Universit de Rennes 1, Rennes,
3
CNRS, Universit de Bordeaux, ICMCB, 87 Av. Dr. A. Schweitzer, Pessac,
4
Laboratoire Lon Brillouin, CEA-CNRS, CE Saclay, 91191 Gif sur Yvette
Les conducteurs d'ions oxygne basse temprature sont des matriaux d'intrt majeur
pour une srie d'applications dans le domaine des conducteurs ioniques. Nd
2
NiO
4+o
et
Pr
2
NiO
4+o
appartiennent ces oxydes non stchiomtriques, avec une structure type K
2
NiF
4,
qui montrent une mobilit d'ions d'oxygne ds la temprature ambiante. Pour cette raison, ils
figurent parmi les candidats les plus prometteurs pour les membranes d'oxygne, les capteurs
ou les catalyseurs, oprant temprature modre. Une des caractristiques les plus
intressantes est la possibilit d'accueillir une quantit importante d'atomes d'oxygne
supplmentaires sur les sites interstitiels, la rgion non stchiomtrique tant 0 <o <0,26 [1].
Dans cette tude, nous avons suivi par diffraction in situ des neutrons sur poudre et par
diffraction du rayonnement synchrotron sur monocristal, lvolution structurale en fonction de
la stchiomtrie en oxygne de (Nd,Pr)
2
NiO
4+o
temprature ambiante, pendant une raction
lectrochimique. La raction a t effectue dans des cellules spcialement conues [2-3].
Nous rapportons ici le riche diagramme de phase en fonction du transfert de charge, allant
d'une phase orthorhombique incommensurable pour (Nd,Pr)
2
NiO
4.25,
passant par une phase
ordonne intermdiaire quadratique, jusqu la phase stchiomtrique AF (Nd,Pr)
2
NiO
4.0
. La
raction de Nd
2
NiO
4.0
s'est rvle tre partialement rversible en sarrtant une
stchiomtrie o=0.10. Une tude structurale de cette phase a rvl une structure P42/ncm.
Les calculs prliminaires de dynamique de rseau (algorithme DFT ab initio) indiquent que
cette rversibilit limite est li aux contraintes de structure et en particulier la valeur du
paramtre c, accompagn d'un facteur de Debye-Waller rduit pour les atomes d'oxygne
apicaux. Pr
2
NiO
4+o
prsente un mcanisme d'intercalation diffrente, et la phase rduite peut
tre charg jusqu' sa stchiomtrie initiale o=0.25. Il s'agit d'une diffrence importante qui
nous pensons tre lie au rayon ionique lgrement plus lev de Pr
3+
par rapport Nd
3+
et
associe une dynamique du rseau modifie [4-5].
[1] Y. Toyosumi et al. J. Alloys and Compounds 408412 (2006) 12001204.
[2] W. Paulus, et al, JACS (2008)
[3] R. Le Toquin, et al, J. Am. Chem. Soc. 128 (2006) 1316113174
[4] A Villesuzanne et al., J. Solid State Electrochem. 15, 2 (2012), 357
[5] O. Wayudi, PhD Thesis, University Rennes 1, dec. 2011
7a - Cristallographie in situ, in operando Vendredi 5 juillet 9h00-10h30
- 113 -
O73 - Lapport des tudes menes operando par diffraction et
absorption des rayons X la comprhension des mcanismes mis en
jeu au sein des matriaux dlectrode pour batteries Li-ion.
Laurence Croguennec
1
, Jean-Marcel Ateba Mba
1,2
, Matteo Bianchini
1,2,3
, Hideyuki Koga
1
,
Emmanuelle Suard
3
, Stphanie Belin
4
, Claude Delmas
1
et Christian Masquelier
2
1
ICMCB-CNRS, Universit de Bordeaux, IPB-ENSCBP, 33600 Pessac, France,
2
LRCS-CNRS, Universit de Picardie Jules Vernes, 80039 Amiens Cedex 1, France,
3
Institut Laue-Langevin, 38000 Grenoble, France,
4
Synchrotron Soleil, 91192 Gif-sur-Yvette, France
Ces vingt dernires annes les efforts de recherche menes dans le domaine des
batteries Li-ion ont t largement orients vers la recherche de nouveaux matriaux
dlectrode et de nouveaux lectrolytes, avec lobjectif daccroitre la scurit, la dure de vie
et les densits dnergie et de puissance de ces systmes lectrochimiques [1]. Il sest avr
essentiel de suivre les volutions structurales et les processus redox mis en jeu au cours des
ractions de dsintercalation et de rintercalation des ions Li
+
des matriaux dlectrodes,
pour mieux prdire la rversibilit de ces batteries Li-ion. Des mthodes de caractrisation ont
t rapidement dveloppes pour suivre in situ ces ractions dynamiques au cours du
fonctionnement de la batterie, notamment par diffraction des rayons X (de laboratoire ou
Synchrotron) [2-3] ou par spectroscopie dabsorption des rayons X [3-4]. Ces tudes menes
operando apportent une information globale sur la nature des ractions mises en jeu, dans des
conditions proches des conditions relles dutilisation dune batterie. Les caractrisations
menes ex situ sur des compositions cls restent nanmoins essentielles car complmentaires :
elles permettent en effet une dtermination plus fine de leur structure atomique et
lectronique. Nous illustrerons travers quelques exemples lapport de ces caractrisations,
ralises operando, pour la comprhension de systmes de choix : ici, des matriaux
dlectrodes positives de type polyanioniques (LiFePO
4
et LiVPO
4
F) et oxydes lamellaires
surlithis (Li
1.20
Ni
0.13
Co
0.13
Mn
0.54
O
2
) [3-6]. Nous prsenterons galement pour la premire
fois la cellule lectrochimique que nous avons dveloppe pour raliser de la diffraction des
neutrons in situ, de rsolution suffisante pour raliser une dtermination structurale par la
mthode de Rietveld.
Remerciements : Les auteurs remercient lInstitut de Recherche Europen Alistore-ERI, le
Rseau Franais sur le Stockage Electrochimique de lEnergie (RS2E), lindustriel Toyota
Motor Europe, lInstitut Laue-Langevin (ILL-Grenoble), le Synchrotron SOLEIL et la Rgion
Aquitaine pour leur soutien aux recherches prsentes.
[1] Goodenough et al., Chem. Mater. 2010, 22, 587-603.
[2] Morcrette et al., Electrochimica Acta 2002, 47(19), 3137-3149.
[3] Leriche et al., J. Electrochem. Soc. 2010, 157(5), A606-A610.
[4] Ouvrard et al., J. Power Sources 2013, 229, 16-21.
[5] Ateba Mba et al., J. Electrochem. Soc. 2012, 159(8), A1171-A1175.
[6] Koga et al., J. Phys. Chem. C, soumise.
[7] Bianchini et al., J. Electrochem. Soc., soumise.
7a - Cristallographie in situ, in operando Vendredi 5 juillet 9h00-10h30
- 114 -
O74 - Structures lamellaires supramolculaires de sulfates hybrides :
du design la stabilit thermique et aux transitions de phases
Omar Kammoun
1,2
, Thierry Bataille
1
, Walid Rekik
2
, Anita Lucas
1
, Houcine Nali
2
, Tahar
Mhiri
2
1
Institut des Sciences Chimiques de Rennes, UMR 6226 CNRS Universit de Rennes 1, UEB,
Rennes, France ;
2
Laboratoire physicochimie de lEtat Solide, Facult des Sciences de Sfax, universit de Sfax,
Tunisie.
Les composs hybrides organique-inorganique supramolculaires de classe I
reprsentent une opportunit intressante pour le dveloppement de nouveaux matriaux dans
diffrents domaines d'applications, en tant que dilectriques, semiconducteurs, ou matriaux
ONL [1,2]. Dans ce contexte, nous nous intressons des sulfates mixtes de mtaux de
transition et damines protones possdant une bonne stabilit thermique et prsentant des
transitions de phase rversibles, pour des applications potentielles comme dilectriques ou
catalyseurs [3]. Dans la continuit de notre activit, nous avons choisi dintroduire
laromaticit dans la partie organique afin daugmenter la mobilit des lectrons pour faciliter
le transfert de charge. Plusieurs familles de nouveaux composs de formule
(Amine)
2
M
II
(SO
4
)
2
(H
2
O)
x
(avec Amine = mthylbenzylamine, benzimidazole, 2-
mthylimidazole, 4-aminopyridine et M = Mn, Fe, Co, Ni, Cu, Zn)ont t prpares et
caractrises partir des donnes de diffraction des rayons X (cristal et poudre). De manire
surprenante, elles appartiennent un type structural indit dans les sulfates, savoir un rseau
entirement supramolculaire fort caractre lamellaire. Le design des couches minrales et
lespace interfeuillets sont principalement gouverns par lamine utilise.
Ltude systmatique de leur comportement thermique par diffraction des rayons X in
situ a mis en vidence une grande disparit dans la stabilit des prcurseurs et rvl
lexistence dun nombre important de phases intermdiaires au cours du chauffage. Nous
montrerons la complexit des structures obtenues travers une discussion cristallochimique,
et nous mettrons en parallle les diffrences entre les structures et leur ractivit thermique et
les transitions de phases observes.
[1] R. Masse, J. Zyss, European Patent EP 0 488 869 B1 (1996).
[2] N. Leblanc, N. Mercier, L. Zorina, S. Simonov, P. Auban-Senzier, C. Pasquier, JACS
2011, 133, 1492414927.
[3] F. Hajlaoui, S. Yahyaoui, H. Naili, T. Mhiri, T. Bataille, Inorg. Chim. Acta 2010, 363,
691695.
7b - Texture, Microstructure, dformation Vendredi 5 juillet 9h00-10h30
O75 - Study of texture development in asymmetrically rolled titanium.
Experimental study and calculations.
M. Wronski
1
, K. Wierzbanowski
1
, S. Wronski
1
, B. Bacroix
2
, A. Lodini
3
, P. Lipinski
4
1
AGH University of Science and Technology, Faculty of Physics and Applied Computer Science, al.
Mickiewicza 30, 30-059 Krakw, Poland,
2
LSPM-CNRS, Universit Paris XIII, 99, av. J.B. Clement, 93 430 Villetaneuse, France
3
LISM, UFR SEN, Universit de Reims Champagne Ardenne, Moulin de la Housse BP1039, 51687
Reims, France
4
LaBPS, ENIM, 1, Route dArs Laquenexy CS 65820, 57078 Metz Cedex 3, France
The goal of this work was to study the asymmetric rolling process using Finite
Element (FEM) method coupled with the crystallographic deformation model of
polycrystalline material. The Leffers-Wierzbanowski (LW) model was selected to be coupled
with Finite Elements Method (FEM). The implementation of LW model into FEM enabled a
study of heterogeneous plastic deformation process (with elastic interactions), like
asymmetric rolling, taking into account its crystallographic nature. The experimental textures
of asymmetrically rolled titanium were determined using Electron Back Scattering Diffraction
(EBSD) technique. The observed trends of texture formation were confirmed by our
calculations.
The studied asymmetric rolling process was realized using two identical rolls, driven
by independent motors, rotating with different angular velocities e
1
and e
2
. This ensured a
high range of rolling asymmetry. During asymmetric rolling a strong stress component is
induced in the material. Our aim was to examine the influence of this shear stress on the
microstructure and crystallographic texture.
It should be mentioned that asymmetric rolling offers numerous possibilities of
material modification, it can provide large volumes of deformed material and is easy to
implement on existing industrial rolling mills.
7b - Texture, Microstructure, dformation Vendredi 5 juillet 9h00-10h30
- 116 -
O76 - Evolutions microstructurales et htrognits de dformation
dans les aciers ODS Fe-14Cr1W
S. Zhong
1
, V. Klosek
1
, Y. de Carlan
2
, V. Ji
3
, M.H. Mathon
1
1
CEA, IRAMIS, Laboratoire Lon Brillouin (CEA CNRS), F-91191 Gif-sur-Yvette cedex
2
CEA, DEN, SRMA, F-91191 Gif-sur-Yvette cedex
3
ICMMO / LEMHE, Univ. Paris Sud XI, F-91405 Orsay cedex
Les aciers ODS (Oxide Dispersion Strengthening) sont envisags comme matriaux de
structure pour les racteurs de future gnration neutrons rapides (RNR) ou fusion. Le
renforcement de ces matriaux par une dispersion fine doxydes de type Y
2
O
3
a ouvert de
nombreuses perspectives dapplications de ces aciers ODS. Ces systmes sont labors par
mcanosynthse (mechanical alloying). Il est acquis que ce procd permet dobtenir ces
matriaux nanostructurs avec mise en solution des atomes dyttrium et doxygne introduits
sous forme de nanocomposs durant le co-broyage, ce qui permet ensuite de contrler la
phase de prcipitation des particules durcissantes. Les proprits mcaniques tant troitement
dpendantes de la dispersion doxydes, la maitrise de la prcipitation est un enjeu important
dans le dveloppement de ces aciers.
Lobjectif de ce travail a t, dabord, de prciser les cintiques de prcipitation ainsi
que les conditions de recristallisation entre 850 et 1450C dans un matriau choisi comme
rfrence (Fe-14Cr-1W-0,3Ti-0,3Y
2
O
3
) ainsi que dans 4 nuances prsentant des teneurs en Ti,
Y et O diffrentes, afin de mettre en vidence leffet de la composition chimique sur le
comportement de ce type dalliage sous traitement thermique. La microstructure au sens large
du terme (taille des grains, dispersion des oxydes, textures cristallographiques) a t
caractrise par diffraction et diffusion des neutrons ainsi que par microscopie lectronique.
Dans un deuxime temps, limpact de ces volutions microstructurales sur les
proprits mcaniques a t tudi. Une partie du travail a notamment t focalise sur
lanalyse sous sollicitation uni-axiale des htrognits de dformation des grains en
fonction de leur orientation cristallographique. Cette tude, ralise sur plusieurs nuances
avec diffrentes distributions de tailles de nanoparticules, sest appuye sur la technique de
diffraction des neutrons pour lanalyse des dformations et des textures cristallographiques.
Les comportements observs ont t confronts une modlisation micromcanique.
7b - Texture, Microstructure, dformation Vendredi 5 juillet 9h00-10h30
- 117 -
O77 - Rsolution et affinement de structure dun film mince pitaxi
de LaVO
3
.
Hlne Rotella
1
, Pascal Roussel
2
, Magali Morales
3
, Henni Ouerdane
1
, Philippe Boullay
1
,
Olivier Copie
1
, Adrian David
1
, Daniel Chateigner
1
, Lucas Lutterotti
4
, Wilfrid Prellier
1
.
1
Laboratoire CRISMAT, CNRS UMR 6508, ENSICAEN et Universit de Caen Basse-
Normandie, 6 bd Marchal Juin, 14050 Caen Cedex 4, France.
2
Laboratoire UCCS, CNRS UMR 8181, ENSCL, Cit Scientifique, Btiment C7 - BP 90108,
59652 Villeneuve d'Ascq Cedex, France.
3
Laboratoire CIMAP, CNRS UMR 6252, ENSICAEN et Universit de Caen Basse-
Normandie, 6 bd Marchal Juin, 14050 Caen Cedex 4, France.
4
Dipartimento di Ingegneria dei Materiali, Univ. di Trento, I-38050 Trento, Italy
E-mail: helene.rotella@ensicaen.fr
Ltude des provskites ABO
3
synthtises sous forme de films minces suscite depuis de
nombreuses annes un grand intrt tant ils prsentent un large spectre de proprits
fonctionnelles, telles que la ferrolectricit, la supraconductivit, ou encore les transitions
mtal-isolant. Ces proprits, souvent lies la structure de ces matriaux, ncessitent une
dtermination de plus en plus prcise des proprits structurales. La connaissance des angles
B-O-B permet par exemple de comprendre les recouvrements orbitalaires responsables du
type de transport des lectrons au sein du matriau ou encore interviennent dans les
interactions dchange entre les spins des lectrons.
Ce travail prsente la rsolution et laffinement de la structure dun film mince de
LaVO
3
ralise par diffraction de rayons X en haute rsolution et sinscrit dans cette optique.
Lorthovanadate de lanthane prsente, sous forme massive, une structure orthorhombique
Pnma commune dans les provskites, qui se dforme facilement sous la contrainte travers
les rotations doctadres doxygnes. Le film mince ainsi dpos sur un substrat de SrTiO
3
orient (001), sadapte pour compenser la contrainte qui lui est impose [1]. Bien que le
principe de cette tude soit de considrer le film comme un monocristal, on ne peut se
soustraire aux contraintes de mesures imposes par la gomtrie de lchantillon. Sa taille est
en effet un inconvnient majeur (lpaisseur du film tant dun peu moins dune centaine de
nanomtres) qui conduit une intensit diffracte fortement diminue. A cela, sajoute
lorientation prfrentielle du cristal induite par la croissance pitaxiale du film sur le substrat
monocristallin. En consquence, dterminer la structure prcise dun film mince devient un
challenge intressant.
Dans cet expos, je montrerai, en mappuyant sur les dveloppements rcents de la
diffraction des rayons X, quil devient possible daccder un grand nombre de rflexions et,
aprs une analyse fine, daccder la structure complte dun film mince doxyde.
[1] Rotella et al., Phys. Rev. B, 2012, 85, 184101
7c - Grands Instruments Synchrotron et plateformes en biologie structurale -
(Dveloppements, XFEL, nouveauts) Vendredi 5 juillet 9h00-10h30
- 118 -
O78 - La cristallographie SOLEIL
Jean Daillant
DSM/IRAMIS/SIS2M/LIONS CEA
Lanne 2014 a t choisie par lUNESCO pour tre lanne internationale de la
cristallographie. Dans ce cadre, je dresserai un panorama de la cristallographie SOLEIL en
insistant sur les axes stratgiques que nous avons dfinis :
Biocristallographie,
rsolution temporelle,
utilisation de la cohrence,
conditions extrmes,
mesures in operando
et couplage de techniques.
Ces diffrents points seront illustrs par des exemples rcents.
7c - Grands Instruments Synchrotron et plateformes en biologie structurale -
(Dveloppements, XFEL, nouveauts) Vendredi 5 juillet 9h00-10h30
- 119 -
O79 - X-ray Free Electron Laser sources
Marie-Emmanuelle Couprie
Synchrotron SOLEIL
Since the first laser discovery in 1960 and the first Free Electron Laser (FEL) in 1977,
Free Electron Lasers provide intense coherent fs pulses in the X-ray range for
multidisciplinary investigations of matter. After introducing the concepts, and the various
configurations, the panorama of the presently available facilities around the world will be
described. The different properties of these sources will be presented. New recent trends will
be givcn, such as two-color operation. Further prospects including multi- Free Electron Laser
beamlines on superconducting linear accelerators, laser wakefield accelerators based Free
Electrons Lasers will be open. Future advanced FELs will be discussed as well, in particular
with the case of the LUNEX5 (free electron Laser Using a New accelerator for the
Exploitation of X-ray radiation of 5th generation) project in France, which aims at
investigating the production of short, intense, and coherent pulses in the soft X-ray region,
with a 400 MeV superconducting linear accelerator and a laser wakefield accelerator
(LWFA), feeding a single Free Electron Laser line with seeding with High order Harmonic in
Gas and Echo Enable Harmonic Generation.
7c - Grands Instruments Synchrotron et plateformes en biologie structurale -
(Dveloppements, XFEL, nouveauts) Vendredi 5 juillet 9h00-10h30
- 120 -
O80 - Nouvelles possibilits exprimentales en cristallographie
introduites par les XFELs
Jan Lning
Universit Pierre et Marie Curie, Paris
Le rayonnement des nouveaux lasers lectrons libres mettant des rayons X (XFEL,
pour X-ray Free Electron Laser) permet de raliser des expriences entirement nouvelles
grce aux proprits uniques de leur rayonnement : des impulsions ultra-brves (domaine de
la femtoseconde) et ultra-intenses avec un trs haut degr de cohrence. Ceci cre des
nouvelles possibilits pour l'tude exprimentale dans une grande diversit de domaines
scientifiques, aller de la physique la chimie, la biologie et autres.
Pour leur exploitation, un grand nombre de nouvelles techniques exprimentales et
d'instrumentations originaux ont t conus pendant les quelques annes depuis le XFEL
FLASH en Hambourg est devenu une source ouverte aux utilisateurs. Entre temps, il y a
quatre XFELs qui servent une communaut d'utilisateurs en pleine croissance : les XUV-
FELs FLASH et FERMI (Italie) et les XFELs LCLS (tats-Unis) et SACLA (Japon).
Cette prsentation commencera par un rsum de ce dveloppement rcent en mettant
l'accent sur les capacits et les dfis exprimentaux qui drivent des proprits uniques de ces
sources. Aprs une prsentation plus gnrale de l'tat de lart des techniques de diffusion aux
XFELs, quelques exemples rcents concernant l'tude de la structure des nano-structures
biologiques sont discuts en plus de dtails.
7c - Grands Instruments Synchrotron et plateformes en biologie structurale -
(Dveloppements, XFEL, nouveauts) Vendredi 5 juillet 9h00-10h30
- 121 -
O81 - BM14-2: une ligne MX MAD lESRF avec de nouveaux
outils pour exposer des cristaux biologiques temprature ambiante.
Belrhali H
1
, Nanao M, Manjasetty B
1
, Zander U, Hoffmann G, Mrquez JA
1
, Felissaz F,
Gobbo A, Papp G, Cipriani F
1
, Nasri JA, Geoffroy L, Elhorga V, Lavault B, Siebrecht R
2
1
EMBL Grenoble Outstation,
2
Arina.x
BM14 est la station exprimentale situe sur laimant de courbure 14 de lESRF. Elle
est ddie aux expriences de cristallographie des macromolcules biologiques et notamment
celles qui utilisent la mthode exprimentale MAD (Multiple Anomalous Diffraction).
BM14 a bnfici en 2011 et 2012 dun renouvellement complet de ses lments
optiques, augmentant la brillance de son faisceau dun facteur 3 4 selon lnergie utilise (de
7 17 keV). Il en rsulte pour lutilisateur un temps moyen dexposition de 5 7 secondes par
image.
En collaboration avec les quipes de Florent Cipriani et de Jose-Antonio Marquez de
lEMBL, nous avons rcemment dvelopp une nouvelle tte goniomtrique pour le
microdiffractomtre de la ligne (MDII) qui permet de manipuler les plaques de cristallisation
de type Crystal Direct [2] et ainsi offrir aux utilisateurs la possibilit dexposer leur
chantillons in situ, c'est--dire encore dans leur milieu de cristallisation, aux rayons X de la
ligne de lumire. Ces plaques ont t optimises pour ne diffuser que trs faiblement sous les
rayons-X minimisant le bruit accumul sur les clichs de diffraction.
Nous prsenterons les expriences initiales de collectes de donnes et in situ ainsi que
leur traitement automatis et les perspectives quoffre ce nouvel instrument sur la ligne.
Lquipe de BM14 a galement dvelopp une collaboration avec lentreprise Arinax un
changeur de buse pour optimiser lutilisation de la dshydratation contrle des chantillons
temprature ambiante [3]. Grce ce systme, lutilisateur peut bascule dune exprience de
dshydration une exprience de collecte de donnes cristallographiques sous flux dazote
cryognique distance. Nous avons pu vrifier que le schage de cristaux tests permet leur
conglation sans ajout de cryo-protectant [4].
Nous nous proposons dexposer les principes de ces dveloppements et leur modus
operandi ainsi que les premiers rsultats enregistrs qui semblent prometteur.
[1] A. Thompson et al 1993-1994 (EMBL Report 1993-1994)
[2] CrystalDirect: a new method for automated crystal harvesting based on laser-induced
photoablation of thin films F. Cipriani, M. Rwer, C. Landret, U. Zander, F. Felisaz and J. A.
Mrquez Acta Cryst. (2012). D68, 1393-1399. [ doi:10.1107/S0907444912031459 ]
[3] Improvement of the diffraction quality of macromolecular crystals at European
synchrotrons using the HC1 dehydration control device U. Mueller, M. S. Weiss, J. Sanchez-
Weatherby, T. L.-M. Sorensen, M. Thunnissen, T. Ursby, A. Gobbo, S. R. Russi, M. W.
Bowler and F. Cipriani. Acta Cryst A. (2012). A68, s14
[4] Direct cryocooling of naked crystals: are cryoprotection agents always necessary? E.
Pellegrini, D. Piano and M. W. Bowler. Acta Cryst. (2011). D67, 902-906
8a - Chiralit, polymorphisme Vendredi 5 juillet 11h00-12h30
- 122 -
O82 - Formulations Pharmaceutiques et Polymorphisme
Philippe Espeau
1
, Yohann Corvis
1
, Philippe Ngrier
2
, Stphane Massip
3
, Jean-Michel Lger
3
1
EA 4066 Physico-Chimie Industrielle du Mdicament , Facult des Sciences
Pharmaceutiques et Biologiques, 4 avenue de lObservatoire, F-75006 Paris.
2
LOMA, UMR CNRS 5798, Universit Bordeaux, F-33400 Talence.
3
Pharmacochimie, FRE CNRS 3396, Universit Bordeaux 2, 33000 Bordeaux.
Le polymorphisme revt un grand intrt en pharmacie, et plus particulirement dans
lindustrie pharmaceutique, pour des raisons dactivit thrapeutique mais aussi de
brevetabilit. Un polymorphisme mal caractris ou mconnu peut entraner des consquences
dramatiques tant dun point de vue sanitaire (inefficacit, surdosage) que dun point de vue
financier. Cest pour la premire raison que la recherche et la caractrisation des polymorphes
pour une substance active donne sont devenues obligatoires depuis une quinzaine dannes.
En effet, pour une substance active donne, lactivit thrapeutique peut varier dun
polymorphe un autre car sa biodisponibilit nest pas la mme. La forme solide retenue
sera celle qui rpond des exigences de stabilit physique et chimique, pharmacocintiques,
et donc dactivit thrapeutique. Si gnralement, le choix se porte sur la forme solide la plus
stable dans des conditions ordinaires de temprature et de pression, dans certains cas, une
forme mtastable peut lui tre prfre pour des raisons de biodisponibilit ou de
contournement de brevet. Tout ceci ncessite de procder, en amont, un criblage des
polymorphes pour ensuite tablir leur stabilit relative. Grce la calorimtrie et la
diffraction des rayons X, des rgles simples de hirarchisation peuvent tre tablies [1].
Le polymorphisme cristallin, quil soit li la substance active [2] ou aux excipients [3],
sera donc abord sous langle thermodynamique et cristallographique. Son impact, en termes
dactivit thrapeutique, de formulation galnique, mais galement de brevet, sera discut aux
travers dexemples.
[1] H.G. Brittain, in Polymorphism in pharmaceutical solids , Ed.Informa Healthcare,
2009.
[2] P. Espeau et al., J. Pharm. Sci. 2005, 94(3), 524-39.
[3] Y. Corvis et al., CrystEngComm. 2012, 14, 7055-64.
8a - Chiralit, polymorphisme Vendredi 5 juillet 11h00-12h30
- 123 -
O83 - Configuration absolue et structure absolue: notions de base et
valuation
Howard D. Flack
1
1
Chimie minrale, analytique et applique, Universit de Genve, Suisse
On traitera les questions de symtrie dimportance dans la comprhension et la
dtermination de la configuration absolue et la structure absolue. Les dfinitions de chiralit,
nantiomorphe, nantiomre et racmate vont tre exposes. On va considrer la formation
de structures cristallines chirales et achirales partir de molcules chirales et achirales. Le
phnomne de maclage par inversion sera trait par les exemples du quartz et du
hexahelicne. Par la suite, cest la symtrie de limage de diffraction en prsence de la
diffusion resonante qui va occuper notre attention. La modlisation de tout cristal non-
centrosymtrique comme macl par inversion en suit naturellement. Pour terminer la partie
notions de base, il convient den dduire les rgles concernant la dtermination de la
configuration absolue dune molcule chirale partir des mesures de diffraction.
Les travaux exposs sous le thme valuation ont dbut en 2007. Ils concernent
uniquement les structures cristallines non-centrosymtriques. On utilise la moyenne (A) et la
diffrence (D) dintensit des opposs de Friedel i.e. A(hkl) = [|F(hkl)|
2
+ |F(hkl)|
2
], D(hkl) =
|F(hkl)|
2
- |F(hkl)|
2
. Par un calcul des valeurs attendues de A et de |D|
2
on arrive Friedif
stat
qui quantifie a priori la grandeur du signale de la diffusion resonante dun cristal partir de sa
composition chimique et la longueur donde de la radiation. On peut aussi calculer les valeurs
Friedif
obs
et Friedif
model
, et les comparer avec Friedif
stat
, ce qui donne les indications
intressantes concernant la prsence dun centre de symtrie dans le cristal. Les graphiques
de A
obs
contre A
model
et de D
obs
contre D
model
permettent de visualiser laccord entre
paramtres. On observe souvent, mme trop souvent, que les valeurs de D
obs
sont domines
par les incertitudes alatoires et les erreurs systmatiques. Lutilisation de valeurs comme R
int
ou R
merge
permet, dans les bons cas, de dterminer le groupe ponctuel du cristal.
[1] Parsons, S., Pattison, P. & Flack, H.D., Acta Cryst. A. 2012, 68, 736-749.
[2] Flack, H.D., Sadki, M., Thompson, A.L. & Watkin, D.J., Acta Cryst. A. 2011, 67, 21-34.
8a - Chiralit, polymorphisme Vendredi 5 juillet 11h00-12h30
- 124 -
O84 - Composs multifonctionnels : transition de spin et chiralit
Patrick Rosa, Ahmad Naim, Elen Duverger-Nedellec, Philippe Guionneau
CNRS, Universit de Bordeaux, ICMCB, 87 avenue du Dr. A. Schweitzer, Pessac, F-33608,
France
rosa@icmcb-bordeaux.cnrs.fr
La synthse de nouveaux composs transition de spin est intressante tant d'un point
de vue fondamental, pour la comprhension physique des transitions de phase impliques, que
pour les applications technologiques ventuelles de ces composs. L'obtention de matriaux
magntiques non-centrosymtriques constitue un objet d'tude intressant en optique non-
linaire (effet potentiel des lectrons non-apparis), en cristallographie (mise en vidence
rcente dun arrangement incommensurable dtats de spin) [1].
Pour obtenir des matriaux molculaires transition de spin non-centrosymtriques,
nous dveloppons actuellement plusieurs stratgies au sein du groupe de Sciences
Molculaires de l'ICMCB. Ces stratgies passent par l'introduction de la chiralit par les deux
composantes variables du matriau, les ligands du mtal de transition (typiquement le Fe(II)
ou le Co(II)) et les ventuels contre-anions. Nous exposerons les rsultats rcents que nous
avons obtenus avec cette dernire approche, en dtaillant l'utilisation de plusieurs familles
d'anions chiraux, utilises prcdemment principalement en HPLC chirale et/ou
diffrentiation nantioslective en RMN, rarement pour la synthse de matriaux
molculaires, mais jamais dans le contexte de la transition de spin: des tris(dioxolnes) de
phosphate(V) (famille TRISPHAT dveloppe par le Prof. Lacour de l'Universit de
Genve)[2] ou darsenic(V)[3], des adduits de (+)- ou (-)-tartrate avec As(III) ou Sb(III).[4]
Nous prsenterons les structures de nouveaux anions obtenus, ainsi que divers complexes de
Fe(II) cristalliss en prsence de ces anions. Nous montrerons que l'analyse des interactions
chirales en phase solide peut prsenter des rsultats inverss par rapport aux rsultats en
solution (RMN, dichrosme circulaire), et que celles-ci dpendent fortement, comme le
phnomne de transition de spin lui-mme, dinteractions intermolculaires non-covalentes,
en particulier les liaisons hydrogne.
[1] E. Collet et collab., Phys. Rev. Lett., 2012, 109, 257206 1-5.
[2]. J. J. Jodry et collab., Inorg. Chem., 2004, 43, 3329.
[3] T. Ito et collab. Inorg. Nucl. Chem. Lett., 1971, 7, 1097-1102. B. A. Borgias, Inorg.
Chem., 1986, 25, 1057-1060.
[4] A. Zalkin, Inorg. Chem., 1973, 12, 1641-1646.
8b - De l'ordre local l'ordre longue distance Vendredi 5 juillet 11h00-12h30
- 125 -
O85 - Apport du synchrotron pour des expriences combines de
diffraction des rayons X et de spectroscopie dabsorption des rayons X
Dominique Thiaudire
Synchrotron SOLEIL, lorme des merisiers, Saint-Aubin. 91192 Gif sur Yvette
La diffraction des rayons X (XRD) et la spectroscopie dabsorption des rayons X (XAS)
sont deux techniques danalyse indispensables pour obtenir des informations sur la structure
de matriaux. Puisque le rayonnement synchrotron permet de choisir aisment lnergie du
faisceau de photons, il est un outil incontournable pour des mesures XAS. En ce qui concerne
la diffraction des rayons X, en plus du choix de lnergie, les flux importants de photons
permettent de rduire considrablement les temps denregistrement de diagrammes ou de
clichs de diffraction. On peut aussi envisager dtudier des matriaux dont les quantits de
matire diffractantes sont trs faibles. Enfin, les tailles de faisceau pouvant tre de plus en
plus rduites, les mesures XRD (mais aussi les mesures XAS) peuvent tre menes
localement en vue de cartographier des matriaux.
Les informations pouvant tre recueillies par ces deux techniques sont dans la plupart
des cas complmentaires, il nest donc pas rare de devoir faire des mesures combines.
Celles-ci peuvent tre dissocies ds lors que les conditions exprimentales nont pas pour
consquence une irrversibilit des proprits des matriaux tudier. Pour des tudes de
transformation in-situ, ces mesures combines en quasi-simultan deviennent importantes si
on souhaite garantir que les deux expriences sont effectues sur la mme zone de
lchantillon et dans des conditions physico-chimiques (temprature, pression, sollicitation
mcanique, processus ractionnels, etc) totalement identiques, ce qui est trs important pour
tablir des corrlations entre les informations complmentaires donnes par les deux types de
mesures.
Mon expos dbutera par un rappel des techniques danalyse couramment utilises sur
les installations synchrotrons. Jexpliquerai lintrt de combiner des mesures XRD et XAS
pour obtenir des informations courte, moyenne et grande distance. Je donnerai les conditions
exprimentales optimales pour russir de telles mesures. Enfin, je prsenterai diffrentes
tudes qui ont ncessites des mesures combines en quasi-simultan.
8b - De l'ordre local l'ordre longue distance Vendredi 5 juillet 11h00-12h30
- 126 -
O86 - Structure d'oxydes fonctionnels: le rle de l'chelle
msoscopique
Michela Brunelli
Institut Laue-Langevin, Grenoble, France.
Les oxydes fonctionnels prsentent des proprits physiques complexes et fascinantes
lis leur structure. La prsence de fortes corrlations lectroniques et/ou dune importante
concentration en dfauts affectent leur structure diffrentes chelles. En particulier,
limportance des inhomognits une chelle nanomtrique (et parfois plus grande
chelle) devient de plus en plus vidente.
Je prsenterai dans cette contribution quelques rsultats rcents obtenus lESRF et
lILL en collaboration avec le dpartement de chimie de lUniversit de Milan I. Nous avons
effectus des mesures de diffraction X et neutronique sur des poudres doxydes fort dfaut
de concentration de type Ce
1-x
TR
x
O
2-x/2
o TR est une terre rare (ces oxydes servent
dlectrolytes dans des piles combustible). Les donnes ont t analyses par PDF afin de
remonter aux inhomognits nanomtriques. Grce lextrme souplesse de cette technique,
il est possible de se concentrer sur diffrentes chelles de longueur partir des seules donnes
de diffraction de poudre.
A partir des quelques exemples concernant ce type de matriau, je voudrais souligner
la complmentarit entre les informations obtenues en utilisant les neutrons ou les rayons X,
une analyse dans lespace direct ou rciproque.
[1] E. Dagotto, Science 309 (2005) 257-262.
[2] M. Coduri et al., Phys. Chem. Chem. Phys. 15 (2013), 8495 8505.
[3] M. Scavini et al., Chem. Mater., 24 (2012) 1338-1345.
[4] M. Coduri et al., Z. Kristallogr. 227 (2012) 272-79.
8b - De l'ordre local l'ordre longue distance Vendredi 5 juillet 11h00-12h30
- 127 -
O87 - Dsordre "quasi-liquide" de chaines d'alcane sous-confinement
subnanomtrique supramolculaire.
Cline Mariette
1
, Bertrand Toudic
1
, Philippe Rabiller
1
, Laurent Gurin
1
, Alexei Bosak
2
1
Institut de Physique de Rennes,
2
ESRF, Grenoble
Il existe une trs vaste littrature concernant les phases uni-dimensionnelles de type
"liquide" gnralement sous confinement dans des matrices htes [1, 2]. Ce travail a t
gnralis dans le cadre du confinement de molcules linaires d'alcanes (C
n
H
2n+2
) dans une
matrice hte d'ure (CO(NH
2
)
2
). Ces composs d'inclusion sont connus pour tre une famille
prototype de matriaux apriodiques lorsque la molcule invite est suffisamment longue (n
suprieur 13) [3]. Nous montrerons ici que des signatures spcifiques existent dans le cas
des molcules invites plus courtes, le cristal tant stable au del de n=7. Le dsordre
translationnel y apparait alors important, pouvant autoriser de vritables glissements de ces
molcules confines. Cette ordre purement local dans la phase haute temprature "liquide
quasi-unidimensionnel" conduit froid un ordre longue distance soit commensurable avec
le rseau hte (n=8 et n=11) soit fabriquant un composite incommensurable intermodul (n=7
[4] ou n=12). L'ordre local dans la phase "quasi-liquide" se traduit par une image de diffusion
du sous-rseau invit particulirement structure. L'extrme richesse de ces informations en
font des matriaux adapts pour des tudes 3D-PDF.
FIGURE: Plans de diffusion associs la priodicit de la molcule confine d'alcane dans la
matrice hte d'ure, mesurs par rayonnement synchrotron sur la ligne de lumire ID23
(ESRF): gauche, dans le n-nonane/ure et droite, dans le n-dodcane/ure.
[1] Heilmann et al., Phys. Rev. B, 1979, 20, 2, 751.
[2] Albouy et al., Phys. Rev. B, 1987, 35, 173.
[3] Toudic et al., Science, 2008, 319, 69.
[4] Mariette et al., J. Chem. Phys. 2012, 136, 104507.
8c - Dfis en cristallographie biologique Success stories
Vendredi 5 juillet 11h00-12h30
- 128 -
O88 - La myosine VI, un nanomoteur contre-sens.
Anne Houdusse
1
, Amel Bahloul
1
, Julie Mntrey
1
, Paola Llinas
1
, Tatiana Isabet
1
, Olena
Pylypenko
1
, Hannah Benisty
1
, Virginie Ropars
1
, Serena Sirigu
1
, Carlos Kikuti
1
, Helena
Sirkia
1
, H. Lee Sweeney
2
.
1
Structural Motility, Institut Curie UMR 144, Paris, France
2
University Pennsylvania, Philadelphia, USA
La myosine VI est le seul moteur de la superfamille capable de diriger la production de
force dans une direction oppose celle des autres le long des filaments dactine. De
nombreuses tudes structurales couples des expriences de molcule unique ont permis de
dterminer les lments structuraux et le mcanisme particulier de ce nanomoteur. Alors quil
ne fait plus de doute que les rarrangements du domaine moteur sont similaires ceux des
autres myosines, la procession du moteur le long du filament dactine requiert un dcouplage
de son bras de levier. Ce qui rend le mcanisme de cette myosine plus proche de celui dj
dcrit pour le mouvement de kinsines. Les dfis restant relever pour ce moteur consistent
dcrire comment il sassemble en dimre lors de la reconnaissance de partenaires et comment
cela dfinit le rle cellulaire quil peut jouer en transportant ou en ancrant ses partenaires au
cytosquelette dactine.
[1] Mntrey J*, Bahloul A*, et al. Nature (London) 435, 779-85, 2005.
[2] Mntrey J*, Llinas P*, et al. The structural basis for the large powerstroke of myosin VI.
Cell 131:300-308, 2007.
[3] Mukherjea M*, Llinas P*, et al. Myosin VI dimerization triggers an unfolding of a 3-helix
bundle in order to extend its reach. Molecular Cell, 35:305-15, 2009.
[4] Sweeney HL and Houdusse A, Myosin VI rewrites the rules for myosin motors, Cell,
141:573-82, 2010.
[5] Mntrey J*, Isabet T*, et al. Processive steps in the reverse direction require uncoupling
of the lead head lever arm of myosin VI. Mol Cell. 48,75-86, 2012.
8c - Dfis en cristallographie biologique Success stories
Vendredi 5 juillet 11h00-12h30
- 129 -
O89 - Control of the DNA mismatch repair and the meiosis
recombination by eukaryotic MutL homologs.
JB Charbonnier
1
, E Gueneau
1
, C Tellier-Lebegue
1
, P Legrand
2
, J Marquz
3
, C Dherin
4
, S
Boiteux
4
1
UMR 8221, CEA, CNRS, Univ Paris Sud, iBiTec-S, Gif-s-Yvette
2
Synchrotron SOLEIL, Proxima 1, St Aubin
3
HTX platform, EMBL, Grenoble
4
UPR 4301, CNRS, Centre Biophysique Molculaire, Orlans
jb.charbonnier@cea.fr
The DNA mismatch-repair (MMR) system corrects replication errors and is thus
essential for maintaining genome integrity. MMR factors are also involved in other DNA-
metabolic processes including a correct meiotic recombination. These functions depend on
MutL homolog heterodimers with Mlh1 as a common subunit. In human, MLH1 mutations
underlie half of hereditary nonpolyposis colorectal cancers (HNPCC). We solved the crystal
structures of MutLa (Mlh1/Pms1 heterodimer) C-terminal domain (CTD) from S. cerevisiae,
alone and in complex with fragments derived from Mlh1 partners [1]. These structures reveal
structural rearrangements and additional domains compared to the bacterial MutL
counterparts and in particular they highlight a role of Mlh1 subunit in Pms1 endonuclease site.
We determined the structures of the ternary complexes between MutLa-CTD and Exo1 or
Ntg2 fragments reveal the binding mode of the MIP-box motif shared by several Mlh1
partners [2, 3, 4]. Finally, the structures provide a rationale for the deleterious impact of
mutations in HNPCC.
[1] Gueneau, E et al (2013) Nat Struct Mol Biol
[2] Gellon, L et al (2002) J Biol Chem
[3] Dherin, C, et al (2009) Mol Cell Biol
[4] Zakharyevich, K et al (2010) Mol Cell
8c - Dfis en cristallographie biologique Success stories
Vendredi 5 juillet 11h00-12h30
- 130 -
O90 - La survie en milieu riche en arsniate : le mcanisme
molculaire de discrimination du phosphate
Mikael Elias
1
, Alon Wellner
1
, Korina Goldin-Azulay
1
, Eric Chabriere
2
, Julia A. Vorholt
3
,
Tobias J. Erb
3
& Dan S. Tawfik
1
1
Department of Biological Chemistry, Weizmann Institute of Science, Rehovot 76100, Israel.
2
URMITE CNRS-Universit de la Mditerrane, Marseille, France
3
Institute of Microbiology, ETH Zurich, Switzerland
Larsniate et le phosphate sont abondants sur notre plante et sont des espces proches
sur les plans physico-chimiques : pK
a
quasi identiques, charges similaires sur les atomes
doxygne, et une taille qui ne diffre que de 4%. Le phosphate est pourtant indispensable la
vie (tant notamment un constituant essentiel de lADN) alors que larsniate est extrmement
toxique. Cette similarit a suscit lide que larsniate pourrait substituer le phosphate dans
certaines niches [1]. Mais quil soit utilis ou exclu, discriminer larsniate du phosphate est
une tche trs complexe : toutes les enzymes qui utilisent le phosphate sont incapables de
discriminer ces deux anions. Ceci constitue par ailleurs une des raisons principales de la trs
grande toxicit de larsniate. Les protines sont-elles capables de discriminer ces deux ions ?
Et si oui, par quel mcanisme ?
Nous nous sommes intresss en particulier au systme dimport cellulaire de
phosphate, qui est soumis ce challenge dans les environnements riches en arsniate. Plus
particulirement, nous avons examin les Phosphate-Binding Protein priplasmiques (PBPs)
associes au transporteur ABC qui permettent limport de phosphate. Nous avons pu montrer
que toutes ces protines sont capables de discriminer efficacement le phosphate de larsniate
(>500 fois) [2]. Nous avons rsolu la structure de lune de ces PBPs, en prsence de
phosphate et darsniate, des rsolutions sub-atomiques (0.88-0.98). Les anions sont fixs
et immobiliss par une constellation de liaisons hydrogne (12) avec la protine et des
interactions rpulsives. Ce mode de fixation provoque la distorsion dune liaison hydrogne
courte, unique (Low barrier H-bond) par lion arsniate, 4% plus gros que le phosphate [2].
Ces dterminants structuraux permettent au systme dimport de phosphate de fixer
slectivement le phosphate par rapport larsniate, et ce mme dans des environnements
riches en arsniate tels que le Lac Mono (californie, USA).
[1] Wolfe-Simon et al., Science. 2011, 332, 1163-6.
[2] Elias et al., Nature. 2012, 491, 134-7.
8c - Dfis en cristallographie biologique Success stories
Vendredi 5 juillet 11h00-12h30
- 131 -
O91 - Integrated conformational and lipid-sensing regulation of
ArfGEFs
Jacqueline Cherfils, Kaheina Aizel, Valrie Biou, Jorge Navaza, Mahel Zeghouf
Laboratoire d'Enzymologie et Biochimie Structurales, CNRS, Gif-sur-Yvette, France
The structural and biochemical mechanisms whereby GEFs coordinate their
subcellular targeting to their nucleotide exchange activity remain poorly understood. I will
present the crystal structure of an ArfGEF in a complex that mimics a membrane-bound
intermediate combined with the analysis of its exchange activity reconstituted on membranes.
This uncovered a novel regulatory mechanism mediated by an atypical PH domain, which
restricts the activity of the GEF to specific membranes and potentiates its efficiency by about
2000-fold by concurrent optimization of membrane recruitment and nucleotide exchange.
- 132 -
- 133 -
Rsums des
POSTERS
P1-70
- 134 -
Session Posters 1a/4a Matriaux fonctionnels (1 et 2)
- 135 -
P1 - Etude de diffrentes structures des conducteurs protoniques
base de sulfate, de phosphate et de slnate avec le benzylamine
Asma BEN RACHED
1
, Zakaria ELAOUD
1
, Arnaud GROSJEAN
2
, Philippe GUIONNEAU
2
,
et Tahar MHIRI
1
1
Laboratoire de lEtat Solide, Facult des Sciences de Sfax, BP1171 Sfax Tunisie,
2
CNRS, Univ. Bordeaux, ICMCB, UPR 9048, 87 avenue du Dr A. Schweitzer, F-33608 Pessac
La recherche et la caractrisation de nouveaux matriaux hybrides de type MH
n
XO
4-n
(M= ligand organique, X=S, Se, P, As ) constituent un thme de recherche trs prometteur
en cristallochimie. Ces matriaux prsentent un intrt considrable parce quils rassemblent
les proprits physiques des lments organiques et inorganiques [1,2]. Les applications de
ces matriaux couvrent des domaines aussi varis que la biolectronique ou loptique par
exemple [3,4]. Notre dmarche est base sur une synthse systmatique de composs
cristalliss suivie de la dtermination de leurs structures cristallines et de la nature des liaisons
chimiques qui sont donc la cl de la comprhension du comportement physique de ces
matriaux.
Dans cette optique nous poursuivons nos recherches sur les synthses de benzylamine avec
diffrents acides comme les acides sulfurique, phosphorique, phosphoreux et slnique.
Ltude cristallographique par diffraction X a montr que ces matriaux ne sont pas
isotypes bien que bass sur le mme amine (M=C
7
H
9
N
1
). Le sulfate organique (X=S)
cristallise dans le systme monoclinique de groupe despace P2
1
/c alors que le slnate
(X=Se) et le phosphate (X=P) organiques cristallisent dans le systme triclinique de groupe
despace P-1 tandis que le compos base de lacide phosphoreux cristallise dans le systme
orthorhombique de groupe despace Pbca. Lexamen de ces structures montre une alternance
de plans contenant des chanes organiques [C
6
H
5
CH
2
NH
3
+
] et de plans forms de chanes de
ttradres [HSO
4
]
-
,[SeO
3
]
2-
, [HPO
3
]
-
et [PO
4
]
2-
. Les plans inorganiques et organiques sont lis
entre eux par des liaisons hydrogne du type NHO.et O
_
H