PEPTIDOS Y PROTEINAS

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PEPTIDOS Y PROTEINAS
Los pptidos y las protenas estn formados por aminocidos
Los pptidos y protenas resultan de la condensacin del grupo carboxilo (-COOH) de un aminocido con
el grupo amino (-NH2) de otro, con la eliminacin de una molcula de H2O. La condensacin de molculas
con prdida de agua y la ruptura de enlaces por hidrlisis son procesos comunes a todas las
biomolculas.

El enlace covalente resultante se denomina enlace peptdico y su hidrlisis, es decir la ruptura por
incorporacin de H2O, libera aminocidos. Estos procesos a nivel biolgico son ms complejos que lo
representado arriba y los detalles los veremos en Sntesis Proteica y digestin de protenas.
Las protenas son macromolculas
En trminos promedio las protenas estn formadas por 200-300 aminocidos y su peso molecular supera
los 10.000 dalton.
Tanto los polipptidos como las protenas son cadenas aminoacdicas no ramificadas. La diferencia entre
ellos es la masa molecular, relacionada con la cantidad y el peso molecular de los aminocidos.
Los pptidos y protenas tienen residuos -N terminal y -C terminal
Cada uno de los elementos de la cadena polipeptdica ya no es un aminocido, aunque a veces nos
refiramos a ellos con ese trmino, sino un producto de condensacin al que se le denomina residuo.
Como el enlace peptdico se da entre el grupo carboxilo y amino de los aminocidos, la cadena
polipeptdica tendr un extremo amino libre, N terminal y un extremo carboxilo libre, C terminal que se
representa a continuacin.

Polipptidos y protenas participan en varias funciones biolgicas
Estas biomolculas son las que exhiben una mayor diversidad de funciones biolgicas, algunas de las
cuales se enumeran a continuacin:
Estructural, integran diferentes estructuras como, la lana y el cuero (colgeno).
Enzimtica, todas las enzimas son protenas y aceleran la velocidad de las reacciones
metablicas.
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Movilidad, la actina y la miosina, protenas del msculo, son responsables del acortamiento y
extensin de estos rganos.
Transporte, la hemoglobina de los eritrocitos transporta O2 y parcialmente del CO2. Otra
protena, la mioglobina, se encarga del transporte de O2 en las clulas musculares.
Inmune, las inmunoglobulinas o anticuerpos son encargadas del reconocimiento de otras
molculas (antgenos) y estn relaciondas al mantenimiento de la individualidad, dado que
reconocen como extraas a distintas sustancias, por lo general, exgenas.
Hormonas, algunas hormonas son pptidos o protenas como la insulina y la somatotropina.
Toxinas, muchas sustancias de este tipo son de naturaleza peptdica, como la toxina diftrica, la
botulnica, la ricina presente en la semilla de ricino y venenos de ofidios.
Receptores de membrana, le permiten a la clula un relacionamiento con el medio, dado que
no todas las clulas tienen los mismos receptores. Un ejemplo son los receptores hormonales,
cada hormona tiene un receptor especfico y la unin de la hormona a su receptor le da a la
clula la seal para iniciar la respuesta metablica.
Un aspecto que merece ser resaltado es la especificidad de algunas protenas. Este concepto ser visto
muchas veces a lo largo del curso a propsito de las enzimas. Sin embargo, hay otras protenas como los
transportadores y receptores de membrana que implican necesariamente procesos altamente especficos.
La funcin de los polipptidos y protenas est determinada por la secuencia de aminocidos
La hidrlisis de cualquier protena libera siempre los 20 aminocidos. Entre protenas distintas los
aminocidos varan en la secuencia, nmero y en el porcentaje en que cada uno de ellos se encuentra.
En el caso de los pptidos pequeos, al ser molculas formadas por pocos aminocidos pueden no estar
representados todos.
La unin entre aminocidos para formar una protena est dirigida por el ADN, concretamente por una
regin del ADN denominada gen. Simplificado este concepto, se puede asumir que: un gen una
protena. Para empezar a comprender este proceso, que ser motivo de estudio detallado ms adelante,
se analiza la Sntesis Proteica a travs del esquema que aparece a continuacin:

Estructura de las protenas
La estructura primaria de una protena est dada por la secuencia de aminocidos
Los aminocidos pueden unirse entre s sin restricciones en cuanto a la cantidad de veces que se repiten,
para formar protenas. La secuencia y nmero de aminocidos, unidos entre s por enlace peptdico,
constituyen el nivel elemental de su estructura: la estructura primaria de una protena.
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Estructura primaria de la insulina
La estructura tridimensional de las protenas depende de la secuencia de aminocidos
Las protenas adquieren una conformacin espacial que depende de las secuencias de sus aminocidos.
Una determinada secuencia aminoacdica se ordenar espontneamente siempre igual porque los -R que
interactan son los mismos y estn a la misma distancia. As, las molculas se ordenarn espacialmente
siempre de la misma forma, a un determinado pH y temperatura, entre otros factores.
De esta forma, en un medio acuoso, los -R apolares tendern a orientarse hacia el interior de la molcula
para interactuar con otros -R apolares y evitar el contacto con el agua. Los -R polares por el contrario, se
situarn hacia la parte externa de la molcula e interaccionarn con el agua.
La flexibilidad de la cadena aminoacdica permite que grupos -R alejados en la estructura primaria se
encuentren prximos cuando la molcula se pliega. En su estado nativo las protenas se encuentran
plegadas segn patrones tridimensionales especficos que en su conjunto determinan la conformacin. La
conformacin de una protena, resulta principalmente de un conjunto de interacciones dbiles entre los -R
de los aminocidos y de ellos con el medio acuoso en que se encuentran. Del plegamiento de la protena
resulta la conformacin con menor energa, es decir la forma ms estable.

Estructura secundaria: protenas fibrilares
La estructura secundaria, plegamiento inicial de las protenas, incluye dos ordenamientos espaciales
bsicos, la -hlice y la lmina plegada o hoja . En estos ordenamientos los puentes de hidrgeno,
interacciones no covalentes entre grupos -NH y -C=O adyacentes, segn se esquematiza abajo,
estabilizan a la molcula.
-NH ||||||||| O=C-
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-hlice: caracterstica en protenas de tipo estructural como las queratinas del pelo, la lana, la sustancia
crnea de los cuernos y las pezuas.

Lmina plegada o hoja : Las protenas fibrosas como la seda, tienen ordenamiento . La figura
muestra esta disposicin que, segn la direccin de las cadenas, puede ser paralela o antiparalela. Las
hojas adoptan ordenamientos lineales, por eso a las protenas con este predominio se denominan
fibrilares.

Lmina plegada antiparalela
Estructura terciaria: protenas globulares
La estructura terciaria corresponde al ordenamiento tridimensional de la molcula plegada, es decir con
regiones con estructura secundaria. De esta forma, las protenas con estructura terciaria o cuaternaria
incluyen amplias regiones bajo forma secundaria segn se ve en la figura 1. Estas protenas adems
presentan otras interacciones (fuerzas estabilizadoras) que se detallan a continuacin.

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Figura 1. Protenas con estructura terciaria en las que se sealan las regiones bajo estructura secundaria.
Entre las fuerzas estabilizadoras de la estructura terciaria se encuentran:
Interacciones hidrofbicas entre -R apolares, los R hidrofbicos se orientan hacia el interior
de la molcula, dado que hacia el exterior de la misma se encuentra el medio acuoso.
Interacciones electrostticas, se dan entre residuos cargados como el de un R cido (-COO
-
)
y el de un -R bsico (-NH3
+
). Las protenas en general tienen pocas interacciones electrostticas,
por lo que contribuyen poco a su estabilidad.
Enlaces covalentes, entre dos residuos cistena de la misma o diferente cadena se pueden
formar enlaces disulfuro, despus que la protena se orden espacialmente.

Representacin de una protena con estructura terciaria sealando distintas fuerzas estabilizadoras
Estructura cuaternaria: protenas oligomricas
Esta categora incluye algunas molculas proteicas que interaccionan con otras molculas proteicas y
producen estructuras complejas y de gran tamao en las que cada subunidad corresponde a un
oligomro. Un ejemplo de este tipo de protena es la hemoglobina, protena formada por cuatro
oligmeros, dos cadenas y dos : es un tetrmero 2, 2. El grupo hemo asociado a cada una de las
molculas porteicas es un grupo prosttico.

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Recuerde que:
El ordenamiento espacial de una protena es consecuencia de su plegamiento.
El plegamiento surge como resultado de las interacciones entre los -R.
Las protenas con distinta secuencia se plegarn distinto y las que tienen igual secuencia lo
harn siempre de la misma forma a igual temperatura, pH y fuerza inica.
La estructura primaria corresponde a la secuencia de aminocidos sin ordenamiento espacial
definido.
La estructura secundaria se estabiliza por puentes H, formando hlices y lminas .
En la estructura terciaria las molculas con regiones helicoidales se pliegan sobre s mismas y
se hacen ms compactas: adoptan formas globulares. Aparecen interacciones hidrofbicas, etc.
Algunas protenas que constan de varias cadenas (oligmeros) que se estabilizan por
interacciones entre sus -R y se ordenan regularmente forman estructura cuaternaria.
Las protenas se pliegan adoptando la conformacin termodinmicamente ms estable
Una cadena polipeptdica podra plegarse en un nmero infinito de conformaciones. Sin embargo, una
determinada secuencia siempre adopta la misma conformacin, a determinada temperatura, pH y fuerza
inica. Esa conformacin, ms estable termodinmicamente, se denomina nativa.
Desnaturalizacin
La conformacin nativa de las protenas puede perderse por accin de agentes qumicos y fsicos. Esta
prdida de la conformacin, o desarreglo espacial de la molcula se conoce como desnaturalizacin.
La accin de cidos y bases, metales, solventes orgnicos y temperatura producen disturbios que no
afectan la secuencia de aminocidos. Sin embargo pueden producir cambios conformacionales tales que
las molculas pueden llegar a la precipitacin, por ejemplo el cortado de la leche por cambio de pH.
Como consecuencia de este desorden espacial las protenas pierden reversible o irreversiblemente su
funcin biolgica.
Aplicaciones de la desnaturalizacin de protenas
La esterilizacin en autoclave, por calentamiento en vapor y a presin, se basa en que los microorganismos mueren
al desnaturalizarse sus protenas: El alcohol es tambin un eficaz desnaturalizador de protenas.
Los iones de metales pesados como Hg
+2
o Pb
+2
son venenosos porque reaccionan con los grupos sulfhidrilo de
cistenas presentes en las protenas y las protenas se desnaturalizan y pierden su funcin. Por eso para tratar
pacientes intoxicados con metales pesados se les suministra clara de huevo y leche, que tienen protenas que son
desnaturalizadas por los iones metlicos y forman un complejo insoluble que es eliminado por lavado estomacal
antes que las enzimas digestivas lo hidrolicen. Este tratamiento no puede aplicarse en casos de plombemia ya que
en esos casos el Pb
+2
ha pasado a la sangre y se ha combinado con protenas celulares.
Protenas y evolucin
Los anlisis de las protenas de individuos de distintas especies muestran que cuanto ms prximos se
encuentren evolutivamente, mayor es la semejanza en la secuencia de aminocidos.
Por anlisis de secuencias de una protena determinada en distintas especies se han construido rboles
genealgicos de los distintos grupos. As, comparando las secuencias de las hemoglobinas de distintos
mamferos, se pueden establecer grados de parentesco ms o menos estrechos entre distintas especies.
Abajo aparece la secuencia de una protena (el citocromo c humano). Los R en negrita son los mismos y
estn en esa misma posicin en el citocromo c de 38 organismos diferentes.
gli-asp-val-glu-lis-gli-lis-lis-ile-fen-ile-met-lis-cis-ser-gln-cis-his-tre-val-glu-lis-gli-gli-lis-his-lis-tre-gli-pro-
asn-leu-his-gli-leu-fen-gli-arg-lis-tre-gli-gln-ala-pro-gli-tir-ser-tir-tre-ala-ala-asn-lis-asn-lis-gli-ile-ile-trp-gli-
lis-asp-tre-leu-met-glu-tir-leu-glu-tir-prolis-lis-tir-ile-pro-gli-tre-lis-met-ile-fen-val-gli-ile-lis-lis-lis-glu-glu-
arg-ala-asp-leu-ileala-tir-leu-lis-lis-ala-tre-tir-glu