Microbiologia ambiental

Objetivo geral fornecer ao ps-graduando

conhecimentos sobre os microrganismos
presentes no meio ambiente e suas funes.
Microbiologia ambiental
Ementa:
1. Caracterizao dos seres vivos
2. Processos metablicos em microrganismos
3. Microbiologia industrial
4. Microbiologia aqutica
5. Aspectos biolgicos da poluio aqutica
6. Uso de organismos como indicadores de poluio
7. Microbiologia do tratamento de guas residurias
8. Microbiologia de solo
9. Microbiologia atmosfrica
Microbiologia
Microrganismos o que so?
Tipos de microrganismos
Bactrias
Vrus
Leveduras
Bolores
Protozorios
Algas
Onde os microrganismos esto?
gua
Insetos e roedores
Objetos
Roupas
Dinheiro
Pessoas
Ar
Poeira
Alimentos crus
Lixo
O que fazem os microrganismos?
Benficos Malficos/Patognicos
Deteriorantes
GRUPOS DE MICRORGANISMOS
GRUPOS DE MICRORGANISMOS
BACTRIAS
BACTRIAS
Bactrias
So unicelulares
Procarointes
Podem viver em qualquer ambiente
Podem aerbias, microaerfila, facultativas e anaerbias
Algumas podem causar doenas
Algumas so benficas
Interagem com outros microrganismos (simbiose, mutalismo e
parasitismo)
Bactrias
Fazem parte do nosso corpo, intestino.
Existem centenas de gneros e milhares de espcies.
Algumas produzem toxinas.
Tamanho varia 0,5 a 1,0 m em dimetro ou largura
As clulas bacterianas apresentam-se sob diferentes formas: esfricas
(cocos), em forma de basto (bastonetes ou bacilos), espiraladas ou
helicoidais (espirilos) e vrgula (vbrio).
Bactrias
Pleomorfismo
Podem ser heterotrficas e autotrficas
pH timo: 6,5 - 7,5
Temperatura tima: 20 - 37
0
C
E. Coli
Arranjo
Elipsoidal ou Esfrica (Cocos) forma ovide e achatados
quando aderidos a outra clula - apresentam tipos e
arranjos diferentes:
diplococos - dois cocos
estreptococos - vrios cocos arranjados em cadeia
ttrades - cocos arranjados 4 a 4, formando tipo um
quadrado
estafilococos- cocos arranjados tipo cacho de uva
sarcina- cocos arranjados em forma cbica
Arranjo
Arranjo
Cilndrica ou Bastonetes (Bacilos) existem diferenas
considerveis no comprimento e largura entre as vrias
espcies, pode ser com terminaes arredondadas ou
quadradas.
diplobacilos- ocorrem aos pares
estreptobacilos- ocorrem em cadeias
Diplobacilos- ocorrem aos pares
Estreptobacilos- ocorrem em cadeias
Flagelos
(A) flagelo monotrquio
(B) flagelos anfilofotrquios
(C) flagelos anfitrquios
(D) flagelos peritrquios
Adeso bacteriana
Pseudomonas aeruginosa em ao inoxidvel
Um biofilme: Pseudomonas fragi aderida em ao inoxidvel
Classificao - Gram + e Gram -
Gram + Gram + Gram + Gram +
Gram Gram Gram Gram - -- -
Gram -
Gram +
Reproduo das bactrias
Fisso binria, bipartio ou cissiparidade
Conjugao
Transduo
Transformao
Endosporos mltiplos
Produo de prognie intracelular
Escherichia coli - fisso binria
Conjugao
Transduo
Transformao
- Incorporao de um material gentico livre no meio por
uma clula bacteriana.
- A transformao ocorre quando uma bactria incorpora
molculas de DNA existentes em seu meio e esta passa a
ter novas caractersticas.
Reproduo das bactrias
Reproduo das bactrias
Esporulao
Os endsporos so formados por diviso assimtrica em ambos os plos
da bactria
Por diviso simtrica de endsporos ainda nos estgios iniciais de seu
desenvolvimento.
A bactria M. polyspora produz de dois a nove endsporos.
A capacidade de produzir mais que dois endsporos viveis no usual
entre as espcies bacterianas formadoras de endsporos.
Forma duas clulas-filhas vegetativas em um processo de reproduo
interna.
Esporulao
Metabacterium polyspora
Clulas-filhas de Epulopiscium sp formadas e liberadas da
clula-me.
Doenas causadas por bactrias
As bactrias podem causar:
- Infeco
- Intoxicao
Infeces
Microrganismos invasivos:
Shigella, salmonella, Camphylobacter
Micorganismos toxignicos:
E. coli, Vbrio cholerae, Clostridium perfringens
FUNGOS
FUNGOS
Bolores
Crescimento de bolores em placa
100.000 espcies so conhecidas 100 so patognicas
dos homens e animais.
Os fungos so seres vivos eucariticos, multinucleados e
alguns so macroscpicos
Seu citoplasma contm mitocndrias e retculo
endoplasmtico rugoso.
So heterotrficos e nutrem-se de matria orgnica
morta
Bolores Fungos Filamentosos
Quase todos so aerbios
So mais resitentes presso osmtica que as bactrias
Podem crescer com baixo grau de umidade
Nescessitam de menos nitrognio para crescimento que as
bactrias
So capazes de metabolizar carboidratos complexos, tais
como lignina (madeira), que as bactrias no podem utilizar
como nutriente.
Bolores Fungos Filamentosos
So quimio-heterotrficos e assim como as bactrias,
eles adsorvem nutrientes ao invs de inger-los
Fungos saprofticos nutrem-se de microrganismos vivos
Fungos parasitrios.
Se desenvolvem em ambientes mais cidos que as
bactrias
Bolores Fungos Filamentosos
Os fungos so ubquos, encontrando-se no solo, na gua,
nos vegetais, em animais, no homem e em detritos, em
geral.
O vento age como importante veculo de disperso de seus
esporos e fragmentos de hifa.
Bolores Fungos Filamentosos
So capazes de se desenvolver em produtos com Aw 0,80 e
0,88 para a maioria dos bolores e leveduras deterioradores,
respectivamente.
Algumas leveduras osmoflicas e fungos filamentosos
xeroflicos so capazes de se multiplicar em Aw cerca de
0,62;
Caracterstica de se multiplicarem em uma ampla faixa de
pH entre 2,0 e 8,5, torna o grupo importante no estudo de
produtos cidos ( frutas, produtos de furtas, conservas,
vegetais fermentados).
Caractersticas
So os principais deterioradores de alimentos com pH
inferior a 4,0-4,5, nos quais se multiplicam com facilidade.
Com relao temperatura, a maioria dos bolores e
leveduras so mesfilos, com temperatura tima de
crescimento entre 25-30C.
Entretanto, h espcie psicotrficas que causam problemas
de deteriorao em produtos refrigerados e congelados
(laticnios).
Os fungos possuem propriedade pectinoltica e celuloltica
e, portanto so associados a deteriorao de vegetais in
natura.
Caractersticas
Fungos filamentosos so aerbios, desenvolvem-se na
superfcie dos alimentos ou na presena de ar (O2).
J as leveduras possuem espcies aerbias estritas e
espcies facultativas, e as ltimas provocam a fermentao
alcolica de alimentos.
Caractersticas
Os fungos podem se desenvolver em meios de cultivo
especiais formando colnias de dois tipos:
- leveduriformes;
- filamentosas.
As colnias leveduriformes so pastosas ou cremosas,
formadas por microrganismos unicelulares que cumprem as
funes vegetativas e reprodutivas.
As colnias filamentosas podem ser algodonosas,
aveludadas ou pulverulentas; so constitudas
fundamentalmente por elementos multicelulares em forma
de tubo as hifas.
Estrutura
Colnia
As hifas podem ser contnuas ou cenocticas e tabicadas ou
septadas.
Possuem hifas septadas os fungos das Divises
Ascomycota, Basidiomycota e Deuteromycota e
Hifas cenocticas, os das Divises Mastigomycota e
Zygomycota.
Estrutura
Ao conjunto de hifas, d-se o nome de miclio.
O miclio que se desenvolve no interior do substrato,
funcionando tambm como elemento de sustentao e de
absoro de nutrientes, chamado de miclio vegetativo.
O miclio que se projeta na superfcie e cresce
acima do meio de cultivo o miclio areo.
Miclio
Imagem de
microscopia de
varredura eletrnica
(cores adicionadas)
de miclio fngico
com as hifas (verde),
esporngio (laranja) e
esporos (azul),
Penicillium sp.
(aumento de 1560 x).
Miclio
Reproduo dos fungos
- Os fungos filamentosos podem reproduzir-se
assexualmente por fragmentao de suas hifas.
-Tanto a reproduo sexual quanto a reproduo assexual
ocorrem pela formao de esporos.
Doenas dos fungos
Qualquer infeco de origem fngica chamada de micose.
So geralmente, infeces crnicas porque os fungos
crescem lentamente.
Podem ser:
- Sistmicas
- Subcutneas
- Cutneas
- Superficiais ou oportunistas
Toxina de Fungos
Micotoxinas - Mikes = fungo
Toxicum = veneno
Doena: micotoxicose
Aflatoxina
Patulina
Ocratoxina A
LEVEDURAS
LEVEDURAS
Ex: Saccharomyces cerevisiae,
Candida albicans
As leveduras so fungos unicelulares
No-filamentosos
So amplamente distribudas na natureza
So encontradas como um p branco cobrindo frutas e
folhas
Se multiplicam por fisso binria (se dividem produzindo
duas clulas iguais) ou por brotamento ou gemulao (se
dividem formando clulas desiguais).
Leveduras
As clulas parental forma uma protuberncia (broto) na
sua superfcie externa.
medida que o broto se desenvolve, o ncleo da clula
parental se divide e um dos ncleos migra para o broto.
O material da parede celular ento sintetizado entre o
broto e a clula parental e o broto eventualmente
(pseudo-hifas) se separa da clula me.
Pode produzir mais de 24 clulas filhas por brotamento.
Reproduo por protamento
As clulas parentais se alongam, seus ncleos se
dividem, e duas clulas filhas so produzidas.
So capazes de crescimento anaerbio facultativo.
Podem utilizar oxignio ou componente orgnico como
aceptor final de eltrons sobrevivem em vrios
ambientes
Reproduo - Fisso binaria
Se dado acesso ao oxignio, as leveduras
respiram aerobicamente para metabolizar hidratos
de carbono formando dixido de carbono e gua;
Na ausncia de oxignio, elas fermentam os
hidratos de carbono e produzem etanol e dixido
de carbono.
Ex. produo da cerveja, vinho, panificao.
Saccharomyces produzem etanol nas bebidas
fermentadas e dixido de carbono para fermentar
a massa.
Reproduo - Fisso binaria
Leveduras requerem menos umidade que a maioria
das bactrias e mais umidade que a maioria do
bolores
A temperatura ideal - 25C a 30C
Acares so a melhor fonte de energia
Leveduras
Ex: Giardia lambia e Ameba
PROTOZORIOS
PROTOZORIOS
Caractersticas gerais dos protozorios
protos = primitivo, primeiro
zoon = animal
Os protozorios so microrganismos com caractersticas
semelhantes a animais, incluindo locomoo, ingesto de
alimentos e ausncia de uma parede celular rgida.
Podem ser organismos de vida livre, presente em gua
doce, ou marinha, no solo, ou podem ser simbiontes
dentro ou sobre os hospedeiros vivos.
Eucariontes, compreendem mais de 50.000 espcies;
Parasitas animais; unicelulares
Morfologia
Alguns protozorios so ovais ou esfricos,
outros alongados.
Outros podem ser polimrficos,
morfologicamente distintos em diferentes
estgios do ciclo de vida.
As clulas podem ser to pequenas como 1
m ou to grandes como 2000 m ou 2 mm
(visveis a olho nu).
Anatomia e fisiologia
Quanto ao tipo de alimentao, os protozorios
podem ser:
holofticos ou autotrficos: so os que, a partir
de gros ou pigmentos citoplasmticos
(cromatforos), conseguem sintetizar energia a
partir da luz solar (fotossntese);
holozicos ou heterotrficos: ingerem partculas
orgnicas, digerem-nas (enzimas) e,
posteriormente, expulsam os metablitos. Essa
ingesto se d por fagocitose (ingesto de
partculas slidas) ou pinocitose (ingesto de
partculas lquidas)
Anatomia e fisiologia
saprozicos: "absorvem,' substncias
inorgnicas, j decompostas e dissolvidas
em meio lquido;
mixotrficos: quando so capazes de se
alimentar por mais de um dos mtodos
acima descritos.
Exigncias nutricionais
pH: limites: 3,2 - 8,7
pH: timo: 6,0 - 8,0
Temperatura: timo: 16 - 250 C
Luz: alguns efetuam a fotossntese
Reproduo
A maioria se reproduzem assexuadamente (fisso).
Fisso Binria: indivduos similares quanto ao
tamanho
Figura: Ameba (Reproduo por Fisso binria)
Reproduo
Brotamento: indivduos resultantes de tamanhos
diferentes
Endogenia: formao de duas ou mais clulas-filhas
por brotamento interno.
Esquizogonia: a clula passa por uma srie de
divises nucleares que culmina numa diviso celular
que leva a formao de vrios indivduos.
conjugao: unio temporria de dois indivduos,
com troca mtua de materiais nucleares;
Classificao
Mastigophora ou flagelados
Geralmente possuem um ou dois flagelos, mas
algumas espcies chegam a ter dezenas.
Reproduo assexuada por fisso binria
longitudinal.
Reproduo sexuada conhecida em alguns grupos.
Autotrficos e/ou heterotrficos.
Formas amebides, com ou sem flagelo.
- Gneros representativos: Leishmania,
Trypanosoma, Giardia, Trichomonas.
Classificao
Sarcodina pseudpodos
Movimento amebide e alimentao por meio de
pseudpodes.
Reproduo assexuada por fisso.
Reproduo sexuada, quando presente,
geralmente est associada com gametas
flagelados.
Ex: amebas, foraminferos, radiolrios,
heliozorios.
Classificao
Sporozoa sem organelas locomotoras
Reproduo sexuada pela unio de gametas.
Reproduo assexuada por fisso mltipla.
Todas as espcies so parasitas.
Geralmente no so mveis, mas a locomoo de
organismos maduros feita pela flexo do corpo,
deslizamento ou ondulao do eixo longitudinal.
Gneros representativos: Toxoplasma,
Plasmodium.
Plasmodium.
Toxoplasma
Ciliophora Ciliata
- o maior filo.
-Todos possuem clios ou estruturas ciliares como
organelas de locomoo ou para obteno de alimentos em
alguma fase do ciclo de vida.
-Muitos ciliados possuem boca ou citstoma.
- Dois tipos de ncleos: o macroncleo (que controla o
metabolismo) e o microncleo (que controla a reproduo).
Classificao
Ciliophora Ciliata
-A reproduo por fisso
-Amplamente distribudos tanto em guas doces como
salgadas e em solos.
-Um tero das espcies parasita; outras so de vida livre.
- Gneros representativos: Didinium, Balantidium,
Tetrahymena, Paramecium, Euplotes.
Classificao
Doenas transmitidas por Protozorios de
interesse em Microbiologia de Alimentos
Amebase - Entamoeba histolytica
uma forma de desinteria com sangue e muco e pode
atacar o fgado causando um abcesso heptico ambico.
Giardiasis - Giardia lamblia
a causa mais freqente de diarria no bacteriana na
Amrica do Norte, sendo mais comumente associada ao
consumo de gua contaminada. muito mais comum em
crianas e perdura normalmente por 1 a 2 semanas, no
entanto so comuns casos de infeces crnicas que
perduram meses ou at anos.
Doenas transmitidas por Protozorios de
interesse em Microbiologia de Alimentos
Sarcocistose - S. hominis e S. suihominis
Causa derreia, naseas, vmito as alteraes aparecem
seis a 24 horas aps a ingesto de carne de porco
infectada.
Criptosporidioses - Criptosporidium parvum
Constitui uma das principais causas de diarria em
crianas pr-escolares e pacientes com imunodeficincia
por vrus HIV, no possuindo esquema teraputico
definido
Toxoplasmose
Doena do Gato
Hospedeiros definitivos: gatos e outros
felinos
Hospedeiros intermedirios: os homens,
mamferos no felinos e outros animais.
Vrus
- Vrus uma palavra latina que significa veneno
- So agentes infecciosos
- No so clulas
- So completamente dependentes de clulas vivas
- So partculas muito pequenas
- So parasitas intracelulares
Definio
Tamanho
determinado com o auxlio do microscpio
eletrnico.
Seu comprimento varia de 20 a 14.000 nm.
ESTRUTURA
So constitudos de uma espcie de cido
nuclico e de protenas;
Apresentam apenas um tipo de cido
nuclico:DNA ou RNA;
Uma cpsula protica protege este cido
nuclico, denominada capsdeo;
ESTRUTURA
O conjunto cido nuclico/invlucro
protico constitui a nucleocpsideo
As protenas que formam o capsdeo so
chamadas subunidades estruturais e se
agrupam em arranjos morfologicamente
distintos denominados capsmeros.
Estrutura viral completa: vrion
O capsdeo, que pode apresentar uma
simetria cbica ou icosadrica e helicoidal.
ESTRUTURA
Estrutura
Classificao vrus envelopado
Ex. vrus da gripe, herpes.
Classificao
Helicoidal polidricos
Complexo
Os fagos podem se multiplicar por dois mecanismos
alternativos: o ciclo ltico ou ciclo lisognico.
No processo infeccioso ltico, aps a replicao
do vrion, a clula hospedeira rompe-se,
liberando nova prognie de fagos para infectar
outras clulas hospedeiras.
Multiplicao dos vrus
O ciclo de multiplicao ocorre em cinco estgios
distintos:
ancoragem ou adsoro
penetrao
biossntese
maturao
liberao
Multiplicao dos vrus
Os fagos temperados (lisognico) no destroem
suas clulas hospedeiras.
Em vez disso, na infeco do tipo temperado, o
cido nuclico viral integrado ao genoma da
clula hospedeira e replica-se na clula bacteriana
hospedeira de uma gerao a outra sem que haja
lise celular.
Este processo denominado lisogenia e realizado
somente pelos fagos que possuem DNA de fita
dupla.
Multiplicao dos vrus
Ciclo ltico
Ciclo lisognico
Vrus e as Doenas
AIDS;
Sarampo;
Rubola;
Gripe;
Hepatite;
Herpes;
Dengue;
Poliomielite;
Varola;
Caxumba;
Raiva;
Febre amarela.