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2 Bachillerato
Apuntes de Biologa
2 Bachillerato
FOSFOGLICRIDOS (GLICEROFOSFOLPIDOS)........................................................20
ESFINGOLIPIDOS.............................................................................................................. 20
ESTEROIDES..................................................................................................................... 20
FUNCIONES....................................................................................................................... 21
CARCTER ANFIPTICO DE LOS LPIDOS. LPIDOS DE MEMBRANA......................21
LOS PRTIDOS........................................................................................................................ 22
CONCEPTO DE PROTENA.................................................................................................. 22
LOS AMINOCIDOS.............................................................................................................. 23
Clasificacin de los aminocidos........................................................................................ 23
El enlace peptdico.......................................................................................................... 23
LOS PPTIDOS..................................................................................................................... 24
ESTRUCTURA DE PROTENAS........................................................................................ 24
A) La estructura primaria..................................................................................................... 24
B) La estructura secundaria................................................................................................ 24
La alfahlice, la hlice de colgeno y la disposicin beta o de lmina plegada...............25
C) Estructura terciaria......................................................................................................... 26
D) Estructura cuaternaria.................................................................................................... 26
PROPIEDADES DE LAS PROTENAS...............................................................................28
* Solubilidad........................................................................................................................ 28
* Desnaturalizacin............................................................................................................. 28
* Especificidad..................................................................................................................... 28
CLASIFICACIN DE LAS PROTENAS EN FUNCIN DE SU ACTIVIDAD BIOLGICA.....28
CIDOS NUCLICOS................................................................................................................ 29
Estructura qumica de los cidos nucleicos:....................................................................29
LOS NUCLETIDOS.............................................................................................................. 31
ESTRUCTURA BIOLOGICA DEL DNA: Doble hlice, cadenas complementarias y
antiparalelas................................................................................................................. 33
ACIDO RIBONUCLEICO (RNA o ARN)..................................................................................34
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GRUPOS FUNCIONALES
Formula
General
Nombre
Compuesto
ROH
Alcoholes
CH3CH2OH
Etanol
CHO
Carbonilo
Aldehidos
CH3CHO
Etanal
CCOCCarbonilo
Cetonas
CH3COCH3
Propanona
COOH
cido o Carboxilo
cidos
CH3COOH
cido Etanoico
Aminas
CH3CH2NH2
Etilamina
Grupo Funcional
OH
Hidroxilo
NH2
Amino
RNH2
BIOMOLCULAS
Lo normal es que los bioelementos no se encuentren libres sino que se unen entre s mediante
enlaces dando lugar a las biomolculas:
INORGNICAS
SALES
MINERALES
AGUA
ORGNICAS
GLCIDOS
LPIDOS
PROTENAS
CIDOS
NUCLEICOS
Los enlaces son las fuerzas de atraccin que mantienen unidos a los tomos. En el caso de las
biomolculas pueden ser fuertes (covalente) y dbiles. (no covalentes)
Enlaces
1. Inico
2. Covalente
3. Enlaces dbiles/intermoleculares
Fuerzas de Van der Waals: Se producen por atraccin electrosttica entre los
ncleos de una molcula y los electrones de otra. Estas fuerzas son mayores cuantos
ms electrones tienen las molculas.
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Los tomos de las molculas biolgicas suelen estar unidos por enlaces covalentes (formados al
compartir entre ellos pares de electrones) constituyendo las molculas sillares o monmeros (glucosa,
aminocidos etc.). Estos monmeros, a su vez, se unen mediante enlaces tambin covalentes formando
los polmeros.
Los polmeros son molculas complejas formadas por la unin de muchos monmeros
(almidn, protenas, etc.).
diseados alrededor de las propiedades caractersticas del agua, tales como su carcter polar,
sus enlaces hidrogeno, su elevado punto de fusin, ebullicin, calor especfico y su elevada
tensin superficial.
POLARIDAD
As, el ncleo del tomo de oxgeno, debido a su mayor electronegatividad, desplaza
parcialmente a los electrones que constituyen los enlaces hacia su ncleo dejando a
los ncleos de los tomos de hidrgeno con una pequea carga parcial positiva (+);
mientras que existen regiones dbilmente negativas (-) cerca del tomo de oxgeno.
Por ello, la molcula de agua tiene en su estructura unas zonas con mayor densidad
electrnica y otras con un dficit electrnico; lo que hace que sea una molcula
dipolar.
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SUBSTANCIA
ENLACES DE HIDRGENO:
Como consecuencia de la estructura dipolar, las molculas de agua pueden
interaccionar unas con otras. Esta interaccin se produce por atraccin electrosttica
entre la carga parcial negativa del tomo de oxgeno de una molcula de agua y la
carga parcial positiva localizada sobre los tomos de hidrgeno de otra molcula. Estas
uniones se denominan enlaces de hidrgeno.
Debido a la ordenacin de los electrones alrededor de los tomos de oxgeno, cada molcula de agua es
potencialmente capaz de unirse mediante enlaces de hidrgeno a otras molculas de agua, lo que
permite que se formen estructuras de tipo reticular Estos enlaces de hidrogeno entre las molculas se
forman y escinden a una gran velocidad, aunque su estabilidad disminuye al elevarse la temperatura.
Los enlaces de hidrgeno mantienen unidas a las molculas de agua entre s, con lo que su peso
molecular aumenta, y por ello, a una temperatura a la que otras molculas qumicamente comparables
(H2S o CH4) estn en estado gaseoso, el agua se encuentra en estado lquido.
Como consecuencia, el agua se emplea como medio fluido de transporte entre las diferentes partes de un
organismo, y como medio lubricante en rganos de movimiento.
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Elevada tensin superficial; esta propiedad permite deformaciones en el citoplasma celular,
causa de los movimientos internos de la clula.
Elevado calor especfico; as al comunicar una cierta cantidad de calor, la temperatura se
eleva poco y, de la misma forma, al liberar energa por enfriamiento, la temperatura desciende
mas lentamente que en otros lquidos.
Esto permite que el agua acte como un amortiguador trmico, manteniendo la temperatura del
organismo relativamente constante, a pesar, de las fluctuaciones ambientales.
De esta forma se evita la alteracin de algunas molculas, fundamentalmente protenas, muy
sensibles a los cambios trmicos.
Elevado calor de vaporizacin; la evaporacin de agua precisa una considerable cantidad de
energa pues es necesario romper los enlaces de hidrgeno existentes en la fase lquida.
Esta propiedad, junto con la anterior, participa en el proceso de amortiguacin trmica, pues se
consigue una disminucin de la temperatura de un organismo al perder una cantidad de calor
que es empleada en la evaporacin del agua. La sudoracin es un mtodo fisiolgico de
refrigeracin, basado en esta propiedad.
SOLUBILIDAD
El agua por su naturaleza dipolar es un buen disolvente para gran cantidad de
compuestos:
Compuestos inicos, como las sales cristalizadas; por ser el agua dipolar se interpone
entre los compuestos inicos disminuyendo la fuerza de atraccin de los iones y provocando su
separacin y por tanto su disolucin.
Compuestos orgnicos neutros que poseen grupos funcionales polares (hidroxilo,
aldehdo cetona, carboxilo, amina, amida, sulfhidrilo); son solubles en el agua, pues no
interrumpen su estructura al formar enlaces de hidrgeno con ella. A estos compuestos se les
llama hidrfilos o polares.
Compuestos orgnicos no polares (radicales alifticos); son insolubles en agua porque
interrumpen su estructura, al no formar
enlaces de hidrgeno con ella. A estos
compuestos se les llama hidrfobos o
apolares.
Substancias anfipticas (poseen a la
vez grupos hidrfilos e hidrfobos); son
dispersadas por el agua. Por ejemplo,
un cido graso de cadena larga forma
unos agregados denominados micelas,
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Otra manera de disponerse las substancias anfipticas cuando se aaden en pequea cantidad al agua,
es formando una monocapa en la superficie, y las cabezas polares se disponen en contacto con la
superficie de sta. Sobre esta monocapa puede disponerse una segunda capa con las colas apolares
sobre la primera, formando una bicapa lipdica. En ella las cabezas polares forman enlaces de hidrogeno
con el agua y los grupos apolares se mantienen unidos por interacciones hidrofbicas.
De todo ello, se deduce, que una de las primordiales funciones del agua es la de actuar como
disolvente de la mayora de las molculas y dado que es condicin imprescindible, que para
que una reaccin qumica tenga lugar, que los reactivos se encuentren disueltos, podemos
deducir que el agua, al permitir la disolucin de los compuestos biolgicos, acta como el
medio donde se realizan todas las reacciones metablicas caractersticas de la actividad vital.
As mismo, sirve de vehculo de entrada y salida de las distintas substancias disueltas en ella, a
travs de la membrana, en la clula.
Una pequea parte de las molculas de agua pueden ionizarse al unirse un tomo de
hidrgeno de una molcula al oxigeno de otra molcula, rompiendo su unin con la
primera.
O H
H
O
O
H
+
H
H
H
Aparecen as dos iones de carga opuesta: H 3O+ y HO. Habitualmente, los iones H3O+
se representan con H+.
pH = - log [H+]
En el agua destilada la proporcin de molculas ionizadas es muy baja.
A 25 C [H+] x [HO] = 1 * 10-14
A este producto se le denomina producto inico del agua.
La escala de pH vara entre 1 y 14, correspondiendo el 7 a la neutralidad. Valores por debajo de este
corresponden a disoluciones de sustancias cidas, y si estn comprendidos entre 7 y 14, la disolucin
ser bsica. En los seres vivos existen disoluciones con un pH determinado, casi siempre prximo a la
neutralidad.
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GLCIDOS
CONCEPTO
Son biomolculas orgnicas formadas por carbono, hidrgeno y oxgeno.
Qumicamente son polihidroxialdehidos o polihidroxicetonas, es decir compuestos que poseen
varios grupos hidroxilo ( OH) y un grupo carbonilo, bien aldehido ( CHO) o bien cetona (C = O).
Tambin se incluyen en este grupo molculas derivadas, con grupos amina, carboxilos, etc, que poseen
una gran semejanza qumica con los glcidos ms comunes.
MONOSACRIDOS
Como ya se ha dicho, son los glcidos ms sencillos, no hidrolizables y constituyen los
monmeros de los dems glcidos.
Propiedades fsicas son slidos, cristalinos, incoloros o blancos, dulces y solubles en agua.
Su solubilidad, se debe a que tanto los radicales hidroxilo, como el grupo carbonilo son polares
y establecen por ello enlaces de hidrogeno con las molculas de agua tambin polares.
Propiedades qumicas Poseen poder reductor frente a determinadas sustancias (por ejemplo
el licor de Fehling), debido a la presencia del grupo carbonilo que puede oxidarse a cido con
facilidad por disoluciones alcalinas de plata o cobre. Esta propiedad es utilizada para detectar
su presencia en medios biolgicos. Si el glcido es reductor, la disolucin que lo contiene
pasar de color azul a color rojo anaranjado. Se suele utilizar sulfato de cobre.
Estereoisomera: (Es muy importante entender esta propiedad para saber como sale la serie D o L
de los monosacridos) propiedad fundamental de los monosacridos, que consiste en la existencia de
molculas con la misma frmula plana pero distinta estructura espacial. Esto sucede siempre que hay
algn tomo de carbono asimtrico, es decir, un carbono que est unido a cuatro grupos diferentes. El
carbono asimtrico se identifica en la molcula con un asterisco.
Para representar los estereoismeros en el papel se utiliza la proyeccin de Fischer, en la que la
cadena carbonada de dispone en vertical y los grupos unidos a los carbonos asimtricos se sitan a la
izquierda y derecha de stos.
As, las estructuras tridimensionales de los dos ismeros del gliceraldehido (frmulas en pgina 12) son
distintas y ambas presentan un comportamiento diferente frente a la luz polarizada (las partculas vibran
en un solo plano): uno la desva hacia la derecha (dextrgiro) y otro a la izquierda (levgiro).
Si el OH del carbono asimtrico se representa a la derecha, se trata del ismero D y si se representa a
la izquierda, se trata del ismero L (que no tiene nada que ver con ser dextrgiro o levgiro)
Normalmente, en los seres vivos, los monosacridos son los de la serie D (pg. 12). Todos se deducen a
partir del D-Gliceraldehido.
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En otros glcidos que contienen ms carbonos asimtricos existe un nmero mayor de ismeros. De
hecho, por cada carbono asimtrico existen dos estereoismeros, por lo que el nmero total de para una
molcula de n carbonos asimtricos ser de 2n.
Dentro de los esteeroismeros hay que distinguir:
A.
B.
seis tomos de carbono con funcin aldehido ser una aldohexosa. Ejemplos:
Ciclacin glucosa
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Ciclacin ribosa
Estos compuestos, por lo anteriormente explicado sern , segn que el OH hemiacetlico est
representado hacia abajo o arriba del plano.
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GLUCOSA Aldohexosa.
FRUCTOSA
OLIGOSACRIDOS
Son glcidos formados por la unin de dos a diez monosacridos. Los ms abundantes en la
naturaleza son los DISACRIDOS constituidos por la unin de dos monosacridos,
Los disacridos son dulces, solubles en agua, cristalizables y por hidrlisis se descomponen en
sus monosacridos constituyentes.
Entre los disacridos de mayor inters biolgico, se pueden citar como ejemplo
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germinacin de la cebada que se emplea en la fabricacin de la cerveza y, una vez tostada
como sucedneo del caf (malta). Se nombra: alfa-D-Glucopiranosil (1--------4) alfa-DGlucopiranosa
POLISACRIDOS
Son los glcidos ms abundantes en la naturaleza y los de mayor peso molecular.
Estn formados por ms de diez monosacridos, unidos entre s mediante enlaces "Oglucosdicos". En la reaccin se desprenden tantas molculas de agua como enlaces forman.
Su hidrlisis completa libera monosacridos. Son inspidos, amorfos e insolubles en agua.
Algunos, como el almidn, pueden formar dispersiones coloidales.
Los polisacridos realizan funciones biolgicas de dos tipos: de reserva energtica y
estructural. Los primeros presentan enlaces de tipo como el almidn y el glucgeno. Los
segundos, como la celulosa y la quitina, poseen enlaces de tipo
Los mas frecuentes estn formados por hexosas, sobre todo glucosa. o sus derivados. En los
vegetales tambin existen polisacridos formados por pentosas.
Entre los ms importantes se pueden citar:
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caractersticos de cada especie vegetal. Es especialmente abundante en tubrculos y en
semillas.
Es un polmero de elevado peso molecular formado por miles de molculas deglucosa, cuya
estructura es adems de ramificada helicoidal con 6 molculas de glucosa por vuelta de hlice
y las ramificaciones se producen cada 12 molculas de glucosa, por enlaces 1-----6.
Es
un polmero lineal y no ramificado de molculas de glucosa. Cada molcula de glucosa est
girada 180 respecto al residuo adyacente, de modo que el oxgeno de cada anillo establece un
puente de hidrgeno con el grupo OH del C3 del anillo siguiente, lo que impide la formacin de
estructuras helicoidales, obtenindose de este modo una cadena recta y extendida. Varias
cadenas adyacentes, con esta conformacin, pueden establecer, entre ellas, enlaces de
hidrgeno, dando como resultado la formacin de fibras con una elevada fuerza tensil
Sin embargo, los enlaces del almidn y del glucgeno originan una estructura muy distinta.
La celulosa se hidroliza por accin de las "celulasas" capaces de romper los enlaces dando
molculas de celobiosa y estas finalmente glucosa. Solo algunos microorganismos, como
protozoos y bacterias sirnbiticos del aparato digestivo de animales herbvoros y de insectos
xilfagos poseen dicho enzima.
Quitina
Homopolisacrido con funcin estructural que forma la parte fundamental del exoesqueleto de
los artrpodos.
FUNCIONES:
Los glcidos desempean las siguientes funciones biolgicas:
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acumular miles de molculas de glucosa en animales y vegetales respectivamente. Estas
molculas al ser bastante insolubles en agua pueden almacenarse en grandes cantidades.
Por otra parte y dado que los glcidos son los primeros productos obtenidos durante la
fotosntesis, constituyen una fuente de carbono para los dems compuestos orgnicos.
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LPIDOS
CONCEPTO
Son biomolculas orgnicas, compuestas bsicamente por carbono, hidrgeno y oxgeno y, en
determinadas ocasiones tambin por otros elementos, como fsforo, nitrgeno y azufre.
Constituyen un grupo de molculas muy heterogneas, que tienen en comn dos
caractersticas:
ser insolubles en agua y otros disolventes polares.
ser solubles en disolventes orgnicos, es decir, no polares, como el benceno, el cloroformo, la
acetona, el ter, etc.
Desde el punto de vista qumico, se pueden clasificar teniendo en cuenta diversos criterios.
Uno de ellos es, en funcin de sus relaciones con los cidos grasos. Segn este criterio, los
lpidos se dividen en:
Acilglicridos o grasas
Ceras
Saponificables
Fosfolpidos
Glicerofosfolpidos
con ac. grasos
Esfingofosfolpidos
Lpidos de
Glicolpidos
Esfingoglicolpidos
membrana
Esteroides
Insaponificables
sin ac. grasos
Colesterol
Hormonas
Vitaminas
Terpenos
Prostaglandinas
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1. ACILGLICRIDOS O GRASAS
Son steres formados por una molcula de glicerina y una, dos o tres molculas de cidos
grasos. En el primer caso se denominan monoacilglicridos, en el segundo diacilglicridos y en
el tercero triacilglicridos.
Entre ellos cabe destacar los triacilglicridos denominados tambin triglicridos o grasas.
Son mas apropiadas que el glucgeno como reserva energtica, ya que ocupan menos
volumen.
En algunos animales, las grasas acumuladas debajo de la piel sirven tambin de aislante
trmico.
2. CERAS
Resultan de la esterificacin de un monoalcohol lineal de cadena larga con un cido graso
tambin de cadena larga. Suelen recubrir superficies de rganos vegetales, como frutos, tallos,
etc.
Debido a su elevado grado de insolubilidad, las ceras desempean primordialmente una
funcin de proteccin, como impermeabilizar superficies de rganos vegetales o plumas en las
aves.
3. FOSFOLPIDOS
Son lpidos que forman parte de todas las membranas celulares. Derivan del glicerol, o de la
esfingosina, un alcohol ms complejo. Los derivados del glicerol se denominan Fosfoglicridos
y los derivados de la esfingosina, Esfingolpidos.
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a. FOSFOGLICRIDOS (GLICEROFOSFOLPIDOS)
Su estructura molecular deriva de la unin de un cido fosfatdico con un compuesto polar,
generalmente aminoalcohol.
El cido fosfatdco es un triester de glicerol con dos cidos grasos (posiciones 1 y 2) y un
cido ortofosfrico (posicin 3)
El cido graso que se esterifica con el primer OH del glicerol suele ser saturado y el segundo
insaturado.
El compuesto polar se une al cido fosfatdico, a nivel del cido ortofosfrico, mediante una
nueva reaccin de esterificacin.
Dado que el cido ortofosfrico esterifica a dos grupos hidroxilo, se dice que forma un enlace fosfodister.
Existen varias clases de fosfoglicridos, dependiendo del compuesto polar. Como ejemplo se
pueden citar la Lecitina (fosfatidilcolina), que se encuentra en la mayora
de las membranas celulares de los organismos superiores, y cuyo grupo
polar es la colina:
b. ESFINGOLIPIDOS
Su estructura molecular deriva de la unin del alcohol
esfingosina, un cido graso y un grupo polar que puede
ser un aminoalcohol o un glcido.
De todos ellos el ms conocido es la esfingomielina
4. ESTEROIDES
Derivan de un hidrocarburo cclico el esterano o
ciclopentano perhidrofenantreno.
Esteroles: Son los esteroides entre los que cabe destacar
el colesterol presente en la mayora de las clulas
eucariticas. Poseen un grupo OH y una cadena hidrocarbonada y a diferencia de otros
lpidos, no presenta cidos grasos
Es un compuesto anfiptico, ya que posee un grupo polar, hidrfilo (el grupo OH), mientras que
el resto de la molcula es apolar, hidrfobo. Este carcter anfptico le permite desempear
una funcin estructural, siendo componente muy importante de las membranas de las clulas
animales, a las que confiere estabilidad y fluidez. Tambin aparece unido a protenas en el
plasma sanguneo.
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El colesterol es tambin el precursor de otros esteroides, entre los que destaca tambin la
vitamina D, los cidos biliares y las hormonas sexuales.
FUNCIONES
Los lpidos desempean entre otras, las siguientes funciones biolgicas:
1. Energtica Tal es el caso de las grasas, que al ser molculas muy poco oxidadas
poseen un alto contenido energtico. Por ejemplo la oxidacin de un gramo de grasa
libera 9,4 Kcal., ms del doble de la que se consigue con la oxidacin de un gramo de
glcidos o de protenas (4,1 Kcal).
Las grasas acumuladas en el tejido adiposo de los animales adems de constituir una
reserva energtica para el organismo, son un poderoso aislante trmico y en ocasiones
mecnico, como por ejemplo la grasa que rodea a los riones.
2. Estructural Los fosfolpidos, esfingoglicolpidos y el colesterol, dada su naturaleza
polar forman parte de las membranas celulares.
3. Protectora Funcin desempeada por las ceras al impermeabilizar las superficies en
que se depositan.
4. Transportadora Por ejemplo los cidos y las sales biliares que dispersan las grasas
facilitando su degradacin y posterior absorcin intestinal.
5. Reguladora Contribuyendo al normal funcionamiento del organismo. Desempean
esta funcin las vitaminas lipdicas (A, D, K, E), as como las hormonas sexuales y
hormonas suprarrenales, de carcter tambin lipdico.
Colesterol
Unidad hidrofbica
Cadenas de cidos grasos
Cadena de cido graso y cadena
hidrocarbonada de esfingosina.
Cadena de cido graso y cadena
hidrocarbonada de esfingosina
Unidad hidroflica
Alcohol fosforilado
Fosforilcolina
Uno o ms residuos de azcar
Grupo OH en C3
Al observar la frmula de fosfoglicridos vemos que las dos cadenas de cidos grasos (unidad
hidrofbica) quedan aproximadamente paralelas entre s, mientras que la parte de la
fosforilcolina (unidad hidroflica) apunta en direccin opuesta. En la esfingomielina y glicolpidos
tienen una conformacin semejante. Por todo ello se ha adoptado la siguiente representacin
abreviada para los lpidos de membrana. Su unidad hidroflica tambin denominada grupo o
cabeza polar, se representa mediante un circulo, mientras que sus colas hidrocarbonadas son
representadas mediante lneas rectas u onduladas:
Es evidente que cuando estos lpidos se encuentran en medio acuoso (como ya estudiamos)
sus cabezas polares tendrn afinidad por el agua mientras que las colas hidrocarbonadas
evitarn el agua. Esto puede conseguirse formando una micela en la que los grupos polares
estn en la superficie y las colas hidrocarbonadas quedan inmersas en el interior de la micela.
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Sin embargo, la ordenacin que satisface tanto las preferencias hidrofbicas como hidroflicas,
en medios acuosos es la de la bicapa lipdica (una capa bimolecular de lpidos).
La razn es que sus colas de cidos grasos los
hacen demasiado voluminosos para acumularse en
el interior de la micela. Adems una micela es una
estructura limitada, en contraposicin con una
bicapa lipdica que puede tener dimensiones
macroscpicas de hasta 1 mm. (10 7 ). Por ello, al
poder formar capas bimoleculares extensas, son los
constituyentes claves de las membranas. Adems
estas pelculas sirven como barreras de
permeabilidad, a pesar de ser estructuras bastantes
fluidas.
La formacin de estas bicapas de fosfolpidos y
glicolpidos, como consecuencia de su carcter
anfiptico, es un proceso de autoensamblaje o
autoasociacin, rpido y espontneo en el agua.
Las principales fuerzas que determinan la formacin
de
bicapas son las interacciones hidrofbicas
originadas al liberarse las molculas de agua de las
colas hidrocarbonadas a medida que estas colas
quedan secuestradas en el interior apolar de la
bicapa. Adems, entre estas colas hidrocarbonadas
existen fuerzas de Van der Waals que favorecen su
empaquetamiento compacto. Finalmente, se producen interacciones favorables, electrostticas
y de enlace de hidrgeno entre los grupos polares de la cabeza y las molculas de agua.
Por tanto, las bicapas lipdicas estn estabilizadas por todo el conjunto de fuerzas que
intervienen en las interacciones moleculares de los sistemas biolgicos.
Las bicapas lipdicas tienden a cerrarse sobre si mismas de tal manera que no existan
extremos con cadenas hidrocarbonadas expuestas al agua, lo que da como resultado la
formacin de un compartimento. Adems, las bicapas lipdicas se autorreparan puesto que un
orificio en la bicapa es energticamente desfavorable.
LOS PRTIDOS
CONCEPTO DE PROTENA
Son polmeros formados por la unin, mediante enlaces peptdicos, de molculas de baja masa
molecular llamadas aminocidos.
Son macromolculas muy complejas, de elevada masa molecular . Algunas protenas estn
constituidas por un solo polmero de aminocidos pero otras son grandes edificios moleculares formados por
varios polmeros ensamblados que adems, en ciertas ocasiones, se encuentran unidos a otras molculas
orgnicas (lpidos y glcidos principalmente).
Son las molculas orgnicas ms abundantes en las clulas, ms del 50% del peso seco de una
clula es materia proteica. Bsicamente estn formadas por C, H, O y N, aunque casi todas
contienen adems S. Otros bioelementos que con frecuencia forman parte de los prtidos son: P, Fe, Zn
y Cu. De todos estos elementos el ms caracterstico de las protenas es el N, son los compuestos
nitrogenados por excelencia de todos los seres vivos.
Las funciones ms importantes y especficas de la materia viva son realizadas por protenas o por molculas
complejas en cuya composicin encontramos alguna protena.
Las protenas son las molculas especficas que marcan la individualidad de cada ser vivo.
Adems son las molculas mediante las que se expresa la informacin gentica, de hecho el dogma central
de la gentica molecular nos dice:
DNA
RNA
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PROTENA.
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LOS AMINOCIDOS
Son las unidades estructurales que constituyen las protenas, los monmeros que, enlazados y
repetidos muchas veces, forman los distintos tipos de protenas.
Qumicamente son cidos orgnicos que llevan adems del grupo carboxlico, un grupo amino.
En los aminocidos que se encuentran en las protenas de los seres vivos el grupo amino est
siempre en posicin alfa (por estar el grupo amino NH2 unido al carbono ms cercano al grupo
carboxilo); por este motivo solemos referirnos a los aminocidos con el smbolo aa (alfa
aminocidos). Todos los aminocidos que se encuentran en las protenas, salvo la prolina,
responden a la frmula general expresada al margen.
En la frmula general R representa el radical o "resto"
de la molcula, lo que diferencia a unos aminocidos
de otros. La R puede ser un simple H o algo ms
complejo como un anillo hexagonal, una corta cadena
aliftica, etc. En las protenas naturales encontramos
20 aminocidos diferentes que son prcticamente los
mismos para todos los seres vivos.
La mayora de los veinte aminocidos pueden sintetizarse unos a partir de otros, pero existen
algunos que no pueden obtenerse de esta manera y tienen que ser adquiridos con la dieta
habitual, es decir que son aminocidos esenciales. Los aminocidos esenciales son diferentes
para cada especie, por ejemplo en el hombre y como simple dato informativo son diez: Thr, Lys, Arg, His,
Val, Leu, Ileu, Met, Phe y Trp. ( Os adjuntar fotocopia de aminocidos del libro, para que sirvan
como ejemplo)
El enlace peptdico
Se establece entre el grupo carboxilo de un aminocido y el grupo amino de otro. La
configuracin espacial de este enlace es tal, que los tomos del grupo carboxlico y del grupo
amino se sitan en un mismo plano.
Es un enlace covalente muy resistente, lo que hace posible el
gran tamao y estabilidad de las molculas proteicas.
En cierto modo se comporta como un doble enlace, tiene una
cierta rigidez e impide el giro libre a su alrededor.
Inmoviliza en un plano a los cuatro tomos que lo integran. Las
distancias y los ngulos entre estos cuatro tomos se
mantienen constantes.
Es el enlace mediante el cual se encadenan los aminocidos
para formar polmeros llamados pptidos: dipptidos,
tripptidos, tetrapptidos, polipptidos (segn el nmero de aminocidos
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LOS PPTIDOS
Estn formados por la unin de aminocidos mediante enlaces peptdicos. Si el nmero de
aminocidos es inferior a diez, oligopptido; si es mayor de diez, polipptido. Si el polipptido
tiene ms de cien aminocidos o un peso molecular alto, se denomina protena.
Un ejemplo de pptido bien conocido es la insulina (dos cadenas de 21 y 30 aminocidos unidos) y la
oxitocina (9 aminocidos) de la hipfisis que produce las contracciones del tero durante el parto.
ESTRUCTURA DE PROTENAS
Distinguimos dos grandes grupos de prtidos: las holoprotenas, formadas exclusivamente por
aminocidos; y las heteroprotenas, que estn formadas por holoprotenas asociadas a alguna
otra molcula no proteica como puede ser un glcido, un lpidido, etc.
La conformacin de una protena es la disposicin que adopta la molcula en el espacio. En
condiciones normales de pH y temperatura, suelen poseer una nica conformacin, responsable
de sus funciones biolgicas.
La conformacin puede tener diferentes niveles de complejidad.
A) La estructura primaria.
Se refiere a la secuencia u orden que siguen los aminocidos.
Toda cadena polipeptdica est polarizada, esto es, posee dos extremos bien definidos.
Llamamos extremo N terminal al extremo donde se encuentra el aminocidos con el grupo
amino libre, llamamos extremo C terminal al extremo en el que se encuentra el aminocidos con
el grupo carboxlico libre. Al enumerar los aminocidos de una protena lo haremos desde el
extremo Nterminal hacia el Cterminal:
NH2GlyGlyLys .......ValLeuCOOH
De la estructura primaria van a depender todos los dems niveles estructurales. La alteracin de
la secuencia de aminocidos de un polipptido dar lugar a una protena diferente que puede
incluso perder toda actividad biolgica o realizar una funcin diferente de la original. Dos
polipptidos son diferentes aunque tengan exactamente los mismos aminocidos si stos estn
dispuestos en orden diferente.
En realidad, la estructura primaria constituye una cadena de planos articulados, pues, como
hemos visto, los enlaces peptdicos no pueden girar y los tomos de C, N y O que participan en
ellos se sitan en el mismo plano.
B) La estructura secundaria.
Es la disposicin de la secuencia de aminocidos o estructura primaria en el espacio. Depender
de la disposicin regular y repetida de los radicales R.
La estabilidad de esta estructura se debe a la capacidad de giro de los enlaces (de todos excepto
de los enlaces peptdicos) y a la formacin de puentes de hidrgeno entre los grupos carboxilo y
amino de diferentes aminocidos:
C = O ......H - N
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Se conocen bsicamente tres tipos de estructuras secundarias: la alfahlice, la hlice de
colgeno y la disposicin beta o de lmina plegada.
AlfaHlice. Este nombre alude a la alfa queratina, protena muy abundante en las
clulas de la epidermis, que presenta esta caracterstica estructura helicoidal. En la
conformacin de la estructura secundaria en Alfahlice, la cadena de aminocidos se
enrolla sobre s misma, en forma de hlice que gira hacia la derecha (en sentido de las
agujas del reloj) y contiene 3,6 aminocidos por cada vuelta. Debido a la especial
disposicin en que se van orientando los aminocidos al enlazarse, en cada plano que
contiene un enlace peptdico se realiza un giro determinado respecto al plano anterior.
El plegamiento se mantiene gracias a los puentes de hidrgeno que se establecen entre
C=O yH-N
de los enlaces peptdicos no consecutivos son los responsables de la
estabilidad de esta estructura.1
* En el caso de la hlice de colgeno la disposicin es similar pero la hlice que resulta est ms distendida porque la
abundancia de aminocidos como la prolina e hidroxiprolina, que poseen un radical muy voluminoso, dificultan la
formacin de puentes de hidrgeno entre las espiras. Son tres polipptidos en alfa hlice ensamblados; para muchos
bioqumicos esa sera una estructura tpicamente cuaternaria. Esta estructura es prcticamente exclusiva del colgeno
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de esta lmina plegada. Esta estructura corresponde a la beta queratina que se encuentra en
uas, pelo y plumas.
C) Estructura terciaria
Es la disposicin que adquiere en el espacio la estructura secundaria.
Conjunto de plegamientos caractersticos que se produce por la unin entre los radicales R de los
aminocidos.
Una secuencia de aminocidos en
disposicin alfa o beta, normalmente se
dobla o retuerce, adquiriendo lo que
llamamos estructuras terciarias.
Existen dos tipos de estructuras terciarias: la
filamentosa y la globular. Tambin es cierto
que para muchos autores la estructura
filamentosa es la ausencia de estructura
terciaria.
Las protenas con conformacin filamentosa
o fibrosa, suelen ser estructurales, de
proteccin o ambas cosas a la vez.
Mantienen la disposicin alargada y no se
retuercen y por este motivo podemos decir
que carecen de estructura terciaria. Son
insolubles en agua y soluciones salina:
colgeno, elastina, etc.
Las protenas que realmente adquieren
estructuras terciarias con pliegues, repliegues y dobleces son las protenas con conformacin
globular. Suelen ser dinmicas o dinmicoestructurales, la estructura secundaria se dobla y
retuerce varias veces hasta adquirir una forma ms o menos globular o esfrica, son solubles en
agua y/o disoluciones salinas: enzimas, protenas de membrana, transportadores, etc.
Los tramos rectos de las protenas globulares generalmente tienen estructura secundaria en alfahlice, los
tramos donde dobla la cadena polipeptdica tienen disposicin beta.
En una protena globular pueden existir diferentes segmentos de alfahlices y/o de lminas beta, pero
siempre se encuentran las formas beta en el centro y las formas alfahlice en la superficie. Por otra parte el
polipptido siempre se dobla de manera que los radicales hidrfobos quedan en el centro del glbulo y los
hidrfilos en la superficie excepto en el caso de las protenas de membrana que, al estar inmersas en un
ambiente lipdico, disponen sus radicales hidrfobos en la superficie.
D) Estructura cuaternaria
Cuando varias cadenas de aminocidos, iguales o diferentes, se unen para formar un edificio
proteico de orden superior, se disponen segn lo que llamamos estructura cuaternaria . Tambin
se considera estructura cuaternaria la unin de una o varias protenas a otras molculas no proteicas.
Cada polipptido que interviene en la formacin de este complejo proteico es un protmero y segn el
nmero de protmeros tendremos: dmeros, tetrmeros, pentmeros, etc.
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La asociacin o unin de las molculas que forman una estructura cuaternaria, se consigue y
mantiene mediante enlaces de hidrgeno, fuerzas de Van der Waals, interacciones
electrostticas y algn que otro puente disulfuro.
Un ejemplo de estructura cuaternaria es la hemoglobina , formada por las globinas o parte proteica
(dos cadenas alfa y dos cadenas beta) ms la parte no proteica o grupos Hemo.
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* Solubilidad.
Las protenas (sobre todo las globulares) en soluciones acuosas forman dispersiones coloidales
debido a la polaridad de algunos radicales hidrfilos de los aminocidos que se quedan
dispuestos en la periferia de la molcula. Cada macromolcula proteica queda rodeada de
molculas de agua y no contacta con otras macromolculas gemelas con lo que no puede
producirse la precipitacin.
* Desnaturalizacin.
La funcin biolgica de las protenas depende de su estructura tridimensional. Cualquier cambio que
suponga una alteracin de esta conformacin, afecta a la funcionalidad biolgica. As, las
alteraciones de la concentracin salina, del grado de acidez y de la temperatura (calor) provocan
la prdida de solubilidad de las protenas y la consecuente precipitacin. A todo este proceso lo
llamamos desnaturalizacin.
Esto es debido a la desaparicin de los enlaces dbiles tipo puente de hidrgeno, Van der Waals,
etc. que existen en las estructuras cuaternaria, terciaria y secundaria, y en realidad no afecta a
los enlaces peptdicos y por tanto a la estructura primaria.
Puede existir una renaturalizacin casi siempre, excepto cuando el agente causante de la
desnaturalizacin es el calor.
* Especificidad.
En las protenas existen sectores fijos que tienen siempre la misma secuencia de aminocidos sin
que se altere la funcin biolgica de la protena. Este hecho da lugar a que a lo largo de la
evolucin se desarrollen infinidad de molculas proteicas diferentes para cumplir la misma
funcin y por la tanto a que cada especie, o incluso cada individuo, tenga sus propias protenas
especficas.
La especificidad de las protenas depender por lo tanto de los sectores variables y a ellos se
deben, por ejemplo, los problemas de rechazos en los transplantes de rganos.
Por ejemplo: La insulina consta de 51 aminocidos en todos los mamferos, que estn distribuidos en dos
cadenas, de 21 y 30 aminocidos respectivamente, unidas mediante dos enlaces disulfuro; de stos 51
aminocidos, la mayora son los mismos en todas las especies, pero unos pocos (tres de la cadena corta)
varan de unas a otras.
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Si atendemos a su actividad biolgica, podemos establecer la siguiente clasificacin:
* De reserva. En general las protenas no tienen funcin de reserva, pero pueden utilizarse con
este fin en algunos casos especiales como por ejemplo en el desarrollo embrionario:
ovoalbmina del huevo, casena de la leche y gliadina del trigo.
* Estructural En casi todas las estructuras celulares como membranas, material extracelular,
complejos macromoleculares, asociadas al ADN, citoesqueletos, fibras del huso acromtico, cilios
y flagelos, ribosomas, etc.
Ej. : glucoprotenas de la membrana plasmtica, Histonas, colgeno (tejs. conectivos,
tendones, hueso, cartlago, etc.), elastina (ligamentos, tej, conjuntivo), queratina (en la
epidermis, pelos, plumas, uas, cuernos, escamas), fibrona (en los artrpodos, tela de araa)
* Homeosttica. En el medio interno celular y extracelular mantienen el equilibrio osmtico.
* De transporte. Adems de las protenas de transporte que se encuentran en todas las
membranas, otras protenas transportan sustancias por los medios internos.
Ej: Hemoglobina que transporta O2 en la sangre de los vertebrados; hemocianina que
transporta O2 en los invertebrados y mioglobina que hace lo mismo en los msculos estriados;
citocromos que transportan electrones en la cadena respiratoria y en la fase luminosa de la
fotosntesis, las lipoprotenas que transportan lpidos, etc.
* Inmunolgica y defensiva. Como ejemplos de este tipo de protenas tenemos:
Trombina y fibringeno, responsables de la coagulacin de la sangre, inmunoglobulinas o
anticuerpos sanguneos que bloquean la accin de los antgenos.
* Hormonal. Como ejemplos de esta funcionalidad proteica tenemos:
Insulina que aumenta la permeabilidad para la glucosa de las membranas plasmticas,
glucagn que es antagnico de la insulina, somatotropa u hormona del crecimiento, etc.
* Contrctil. Debida a la posibilidad que tienen algunas para cambiar de forma manteniendo su
estabilidad.
Ejemplos tpicos son: la actina y la miosina, responsables de la contraccin muscular, la dinena
de los cilios y flagelos, tubulinas de los microtbulos y micrifibrillas, etc.
* Enzimtica. Quizs la funcin ms especfica e importante de las protenas. Los enzimas que
controlan el metabolismo celular son de naturaleza proteica.
CIDOS NUCLICOS
Estructura qumica de los cidos nucleicos:
Conceptos generales:
Los cidos nucleicos son biomolculas responsables de las funciones de los seres vivos, ya
que contienen los mensajes y las instrucciones para llevar a cabo todos los procesos vitales. Lo
que un individuo es o puede llegar a ser est determinado por sus cidos nucleicos. Se puede
decir que son los depositarios del guin de la historia que tiene lugar en la clula.
Qumicamente estas macromolculas son polmeros de elevado peso molecular cuyo
monmero se denomina NUCLETIDO.
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Constituidos por 5 bioelementos fundamentales: C, H, O, N, P
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La hidrlisis del enlace entre los dos ltimos fosfatos en el ATP segn la reaccin:
ATP+H2O ADP+ Pi
genera 7 kcal/mol. El proceso inverso es capaz de almacenar las mismas 7 kcal/mol. De esta
forma la energa es transportada de aquellos procesos donde se produce a aquellos en los que
se necesita.
ii) Coenzimas que intervienen
en las reacciones en las que
hay
transferencias
de
electrones
Estas molculas, en su estado
oxidado, captan electrones de
aquellas sustancias que se
oxidan, reducindose, y los
ceden a aquellas que se
reducen, oxidndose. De estas
forma, los electrones son
transportados
de
unas
molculas a otras.
R
epresentacin esquemtica de algunas coenzimas
importantes: A) NAD+/NADP+. X es un hidrgeno en el
NAD+ y un grupo fosfato en el NADP+. B) ATP.
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Datos preliminares:
A) A finales de los 40 CHARGAFF y sus colaboradores, tras
estudiar gran cantidad de muestras de ADN
pertenecientes a diferentes especies observ que:
-La concentracin de bases vara de una especie a otra. El
porcentaje de A, G, C y T es el mismo en los individuos de la
misma especie y no por esto el mensaje es el mismo. Esta
composicin de bases no vara con la edad, estado
nutricional, tipo de tejido, etc.
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-La existencia de enlaces de Hidrgeno entre los grupos NH y los grupos CO.
-La concentracin de Adenina es igual a la de Timina, y la de Citosina a la de Guanina. Las
dos primeras establecen dos puentes de hidrgeno entre ellas, y las ltimas tres puentes. La
cantidad de purinas es igual a la cantidad de pirimidinas.
B) Por medio del mtodo analtico de difraccin de rayos X, FRANKLIN Y WIL KINS observaron
una estructura fibrilar de 20 (Amstrongs) de dimetro con repeticiones cada 3,4 y una
mayor cada 34 .
C) WATSON Y CRICK en 1953 postularon un modelo tridimensional para la estructura del DNA
que estaba de acuerdo con todos los datos disponibles anteriores.
As establecen el MODELO DE DOBLE HELICE: (saber muy bien)
La molcula de ADN est formada por dos cadenas antiparalelas y equidistantes de
nucletidos, enrolladas en espiral en torno a un eje imaginario, formando una hlice dextrgira
(gira hacia la derecha)
Las bases nitrogenadas se encuentran en el interior de la hlice unidas mediante puentes de
hidrgeno y siempre emparejadas AT y CG, lo que hace que las dos cadenas sean
complementarias.
Las desoxirribosas y los grupos fosfato que las unen se encuentran en el exterior de la hlice,
de modo que las cargas negativas de los grupos fosfato interaccionan con los cationes
presentes en el nucleoplasma dando ms estabilidad a la molcula.
El modelo de Watson y Crick dio una explicacin coherente y satisfactoria para las propiedades
fisicoqumicas del ADN y su funcin biolgica, como estabilidad biolgica y capacidad de
duplicacin
TIPOS DE ADN.
Segn la estructura: monocatenarios una cadena, (por ej. algunos virus) o bicatenarios con dos
hebras o cadenas. A su vez en ambos casos puede ser el ADN lineal (ej. el ncleo de clulas
eucariotas y algunos virus) o circular (en mitocondrias, cloroplastos y bacterias y algunos virus).
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