[M. E.

] mesure, statistique et mycomtre

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Sujet : [M. E.] mesure, statistique et mycomtre

De : Georges Fannechre <gfannechere@unilim.fr>
Date : 28/01/2005 12:51
Bonjour tous,
De nombreux messages ont circul sur divers forums ces derniers temps, traitant des pbs de
mesures et statistiques.
Le calcul statistique n'est pas un problme de dbutant, malgr son apparente facilit,
apparence d'autant plus fallacieuse qu'il suffit maintenant d'appuyer sur un bouton pour
obtenir ... n'importe quoi.
Ce n'est pas parceque le calcul statistique utilise des rsutats approchs que l'on peut faire
n'importe quoi, et c'est mme l la difficult : le calcul statistique, c'est faire des raisonnement
mathmatiquement corrects et rigoureux sur des rsultats approchs.
Le problme de la mesure sporale sur spore dpose ou autre est d'autant plus complexe que
l'on a affaire une population stratifie et que la statistique infrentielle est ici encore plus
dlicate.
Quant l'interprtation des rsultats, en supposant qu'ils soient corrects, le problme est
encore plus ardu.
Si l'utilisateur est novice (reste savoir ce que l'on entend par novice), il se prcipite sur
l'interprtation qui l'arrange, ce qui ne rsout rien, bien au contraire.
Le raisonnement qui consiste conclure sur des sries de mesures par une analyse grossire,
mme si elle repose sur un calcul exact, de quelques paramtres, d'un graphique ou d'un
nuage de points est gnralement mathmatiquement aberrante. Le problme est
malheureusement bien plus complexe, sinon cela se saurait dj chez les non-novices. Un
grand nombre de prcautions et d'hypothses pralables sont impratives avant d'oser toute
comparaison.
Le calcul peut tre tout fait exact dans sa procdure, mais la conclusion compltement
erronne si les hypothses de travail ne sont pas pralablement vrifies. Tout homme
politique utilise cette technique chaque jour !
J'avais pos sur le site Mycolim qques pages crites sur un sujet connexe, dont certaines
avaient t transmises ME.
Je viens de m'apercevoir que je les ai fait disparaitre du site (rcemment, je pense, suite une
crise de nettoyite aige), et en attendant de les retrouver toutes dans mes archive, j'en ai
retrouv qqes unes dans celles de ME (chercher "student" dans les annes 1999)
J'y ai abord trs furtivement, car ce n'tait pas le but de cette discussion que j'avais initie
puis finalement conclue moi-mme aide de l'exprience de mes patients collgues -merci
encore- , le problme de l'chantillonnage.
A l'poque j'avais encore quelques illusions sur la distribution des mesures sporales, mais
mon exprience s'est affermie et a volu depuis.
Paralllement, je dveloppais et utilisais MYCOMETRE pour mon usage personnel, la partie
"mesure sporale" n'ayant pratiquement pas volu depuis, quelques complments prs. Ce
n'est que bien plus tard que je l'ai laiss la disposition des abonns de ME.
Diverses variantes de MYCOMETRE ont t disponibles, et pour viter toute confusion, je viens
de supprimer toutes les versions considres comme obsolte ou non stables.
Concernant MYCOMETRE, les seuls paramtres statistiques calculs et exports sur la version

25/05/2016 17:29

[M. E.] mesure, statistique et mycomtre

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1.xx sont
* moyenne,
* cart-type vrai (NB : le calcul de l'estimateur de l'cart-type est du niveau Bepc)
* moments centrs d'ordre 3 et 4 .
Pourquoi les moments d'ordre 3 et 4 ? Tout simplement parce que c'est une mthode rustique
pour se rendre compte que l'on a affaire une loi non-Normale ( la rciproque est fausse,
hlas). Je pensais nvement que cela servirait mes collgues de ME , mais il apparait que,
pratiquement, seuls mes "clients" Italiens utilisent ces rsultats (NB : le prix a chang en Italie
depuis le passage l'Euro : il est pass de "0 lire" "0 euro", donc inutile de vous fournir en
Italie)
* L' "intervalle de confiance", seulement affich, calcul avec l'cart-type non biais a t
rajout rcemment sur demande expresse, mais personnellement, je n'utilise pas ce rsultat (
je m'en justifierai plus tard) . J'ai d'ailleurs, il me semble, mis l'utilisateur en garde dans l'aide
(mycm.chm) en ce qui concerne cette question.
* L'histogramme et le nuage de points paramtrables associs disponibles ont t rajouts
assez rcemment pour une analyse visuelle grossire, mais ne peuvent en aucun cas tre
utiliss "dans l'tat" pour une analyse statistique srieuse (ce n'est pas la qualit des donnes
affiches qui est mis en cause, c'est le principe). Il est d'ailleurs toujours possible de comparer
"graphiquement, de visu" plusieurs fichiers de mesures en ouvrant autant de fois Mycomtre
que ncessaire (c'tait prvu ainsi depuis le dbut, et le restera probablement dans la version
future, car la taille de l'excutable de mycomtre n'est pas pnalisante pour la machine).
Si l'interface utilisateur peut paraitre parfois (un peu seulement !) contraignante, c'est
gnralement parce que cette contrainte a t impose pour des raisons de rigueur statistique
: il ne s'agit pas de pouvoir faire n'importe quoi n'importe comment. J'essaierai volontiers
d'amliorer certains dtails avec la nouvelle structure, mais toujours dans la mesure o la
rigueur ncessaire l'autorise.
Aux autres types de mesures ( par exemple mesure de la couleur, comparaison entre
chantillons et ajustement une table de rfrence) sont ajoutes les mmes rsultats
statistiques ainsi que les valeurs des carts aux rfrences.
La meilleure solution actuellement pour traiter srieusement ses rsultats est de rcuprer le
fichier "CSV" export, et d'utiliser un logiciel adquat (voir aide).
NB : Excel est une solution de secours facile d'usage, mais pas la meilleure, il s'en faut. Il
existe de bien meilleurs logiciels, mais le permis "poids lourds" semble ncessaire pour leur
conduite en toute scurit.
Avec bientt 10 ans de bons et loyaux service, une refonte totale s'avre ncessaire, car sa
structure de dpart n'est plus adapte aux dveloppements envisags depuis longtemps.
Dans la version 2, parmi les nombreuses fonctionnalits prvues mais diffres, des
techniques statistiques seront dveloppes qui sont soit impossible excuter avec Excel, soit
mme totalement indites par ailleurs, et dont l'efficacit est ddie prcisment aux mesures
en mycologie qui nous intressent.
Pour mmoire et en attendant la version future, MYCOMETRE est toujours fonctionnel et
disponible sur "http://membres.lycos.fr/mycolim/DOC_SML/mycometre/"
Aprs nettoyage du site, il reste une version de mise jour -150 Ko- pour les anciens
utilisateurs ou ceux qui disposent dj des dll ncessaires sur leur machine, et une version
complte -2.5 Mo- pour les nouveaux.

25/05/2016 17:29

[M. E.] mesure, statistique et mycomtre

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amicalement
GF
PS : pour ceux qui cherchent un bon bouquin de rfrence en calcul de satistiques :
A. Papoulis , Probability Random Variables & Stochastic Processes: Sanitary & Water
Resources Engineering, McGraw-Hill Companies, December, 1989

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