Universidad Nacional Autnoma de Mxico

Facultad de Qumica
Bioqumica Experimental
GLOSARIO BIOLOGA MOLECULAR
Rizo Grajales Norma A.

Clulas competentes: Las clulas que tienen

la capacidad de absorber las molculas de
DNA se dice son competentes. Algunas
clulas son naturalmente competentes en
ciertas etapas de su crecimiento, mientras
que otras requieren ser tratadas con calcio u
otros iones y exponerse a varios choques de
calor y fro. Las clulas competentes se
utilizan en los estudios de transformacin.
Conjugacin: Transferencia de DNA de una
clula bacteriana a otra.
Enzimas de restriccin: Enzimas que
reconocen y catalizan el rompimiento de
secuencias de DNA de doble banda en sitios
especficos de cada banda, generando
extremos romos o pegajosos (cohesivos).
Aisladas por lo general de bacterias.

lactosa. El termino induccin se refiere

tambin a la activacin de la transcripcin de
un gen como consecuencia de un inductor
que interacta con una protena reguladora.
Lisis alcalina: Uso de una solucin alcalina
de detergente que lisa las clulas y
desnaturaliza al DNA. Se utiliza en el
aislamiento de DNA de las clulas
microbianas.
Plsmido: Molcula de DNA circular
extracromosmico que tiene la capacidad de
duplicarse en forma autnoma.
Promotor: Secuencia de bases de una
molcula de DNA que la RNA polimerasa
reconoce y a la que se une, promoviendo as
la transcripcin.

Extremos cohesivos: Extremos prominentes

5 o 3 de banda sencilla de fragmentos de
DNA producidos por la actividad de enzimas
de restriccin.

Sitios de restriccin: Secuencias especficas

cortas del DNA de doble banda que son
reconocidas y atacadas por las enzimas de
restriccin.

Extremos romos: Extremos de los

fragmentos de DNA que producen las
enzimas de restriccin cuando cortan el DNA
en la misma posicin en ambas bandas.

Traduccin: Proceso de sntesis de

protenas, llevado a cabo en los ribosomas,
en el que la secuencia de bases de la clave
de tradas del mRNA se convierte en los
aminocidos apropiados de la protena para la
cual codifica.

Kilobase (kb): Secuencia de mil bases de

una molcula de cido nucleico.
Induccin: Capacidad que tienen los
organismos para sintetizar ciertas enzimas
slo cuando las necesitan; por ejemplo, en E.
coli, las enzimas que utilizan lactosa slo se
sintetizan cuando est presente su sustrato

Transcriptasa reversa: Sintetiza una copia

de DNA a partir de una molcula de mRNA.
Transcripcin: Proceso por el que la enzima
RNA polimerasa sintetiza una molcula de

RNA de banda sencilla que

complementaria de un molde de DNA.

es

Transduccin: Transferencia de genes

bacterianos de una bacteria a otra por un
bacterifago.
Transformacin: En ingeniera gentica,
trmino que se utiliza para describir la
introduccin de DNA exgeno en las clulas.
Vector: Molcula de DNA, por lo comn un
plsmido o un bacterifago, en el que pueden
insertarse (clonarse) fragmentos de DNA
extrao. El vector posee tpicamente uno o
ms genes de resistencia a los antibiticos a
manera de marcadores seleccionables y uno
o ms sitios de restriccin nicos, con
frecuencia dentro de esos genes de
resistencia. El vector tiene tambin la
capacidad de duplicarse en forma autnoma
en un organismo hospedante definido, como
es el caso de E. coli.
REACTIVOS
Dodecil Sulfato de Sodio: (SDS) Un fuerte
detergente cargado negativamente usado
para desnaturalizar protenas en la
electroforesis de gel de poliacrilamida SDS. El
detergente SDS disuelve los componentes
lipdicos y las protenas de la pared celular. El
hidrxido de sodio desnaturaliza el DNA
cromosomal y plasmdico en hebras simples;
los crculos intctos de DNA plasmdico
permanece entrelazado.
Gel de agarosa: Carbohidrato polimrico
inerte que forma un gel cuando se hierve en
agua y se deja enfriar. Los cidos nucleicos
pueden separarse en agarosa con base en su
tamao y conformacin al aplicar una
corriente elctrica a travs del gel (un
ejemplo de electroforesis).
Escherichia coli: Bacteria en forma de bacilo,
gramnegativa, que no forma esporas y se

encuentra en el intestino grueso de la mayora

de los mamferos, entre ellos el hombre. Es la
bacteria que mejor se ha caracterizado desde
el punto de vista gentico.
Buffer Tango: Es un buffer diseado
especialmente para usarlo en digestiones
dobles. Composicin del Buffer:
33mM Tris-acetato (pH 7.9 at 37C),
10mM acetate de magnesio,
66mM acetato de potasio,
0.1mg/ml BSA.
Glucosa/Tis/EDTA: (Solucin GTE) La
glucosa mantiene la presin osmtica,
mientras que el Tris amortigua a las clulas a
pH8.0. El EDTA une los cationes divalentes
en la bicapa lipdica, debilitando la cubierta
celular. Siguiendo la lisis celular, el EDTA
limita la degradacin de DNA por la unin de
iones MG++ que son un cofactor necesario
para las nucleasas bacterianas.
Etanol: Un lavado con etanol remueve
algunos remanentes de sal y SDS de la
preparacin. Es un buen disolvente, y puede
utilizarse como anticongelante. Tambin es un
desinfectante. Su mayor potencial bactericida
se obtiene a una concentracin de
aproximadamente el 70 %.
Isopropanol: El alcohol precipita rpidamente
cidos nucleicos pero precipita lentamente las
protenas. De esta manera, una precipitacin
rpida preferencialmente nos brinda o baja los
cidos nucleicos.
IPTG: El IPTG suele utilizarse como inductor
artificial del opern lac, ya que es capaz de
unirse al represor LacI, pero no es un sustrato
para la -galactosidasa y no puede ser
metabolizado por la bacteria.
Plsmido PET-TEM-1: El plsmido pET,
contiene el gen 10 del fago T7, en un sistema
de expresin adecuado, tal como un
procariota, por ejemplo un microorganismo

perteneciente al gnero Escherichia, Bacillus,

Salmonella, Listeria, Yersinia, etc.
Tris-EDTA: El buffer Tris amortigua la
solucin de DNA, el EDTA protege el DNA de
la degradacin de DNAasas por la unin de
cationes divalentes (especialmente MG++)
que son los cofactores necesarios para la
actividad DNAsa.
Acetato de potasio/cido actico: El cido
actico pasa el pH a neutral, permitiendo que
las hebras de DNA se renaturalicen. Al mismo
tiempo, el acetato de potasio precipita el SDS
de la suspensin celular, junto con los lpidos
y protenas asociadas. La renaturalizacin
cromosomal del DNA est atrapado en el
precipitado
de
SDS/lpido/protena.
nicamente los plsmidos pequeos de DNA,
fragmentos de DNA cromosomal, y molculas
de RNA se escapan del precipitado y
permanecen en solucin.
Bromuro de etidio: (BrEt) Es un agente
intercalante usado comnmente como
marcador de cidos nucleicos en laboratorios
de biologa molecular para procesos como la
electroforesis en gel de agarosa. Cuando se
expone esta sustancia a luz ultravioleta, emite
una luz roja-anaranjada, que se intensifica
unas 20 veces despus de haberse unido a
una cadena de ADN. Este efecto es debido al
aumento de la hidrofobia del medio, y no a la
rigidificacin del anillo bencnico, no estando
ste entre pares de bases del ADN. Como el
bromuro de etidio se intercala en el ADN, esta
sustancia tiene un poderoso efecto mutgeno
y, posiblemente puede ser cancergeno o
teratgeno.
Medio LB: Medio nutritivo, utilizado para el
crecimiento de bacterias. Conocido tambin
como caldo Luria o caldo Luria-Bertani. Este
medio son comnmente utilizados en biologa
molecular para la preparacin de DNA
plasmdico y protenas recombinantes; y sigue

siendo uno de los medios ms comnes para

mantener y cultivar cepas de Escherichia coli.
Existen diferentes formulaciones para este
medio:
Pptidos y peptonas
Vitaminas (incluida la vitamina B)
Elementos traza
Minerales
Los pptidos y las peptonas son provedos
por la triptona. Las vitaminas y los elementos
traza son provedos por el extracto de
levadura. Los iones sodio para el transporte y
le balance osmtico estos son provedos por
el cloruro de sodio. La bacto-triptona es
utilizada para proveer aminocidos esenciales
para el crecimiento bacteriano, de vez en
cuando el extracto de levadura es utilizado
para proveer componentes orgnicos tiles
para el crecimiento celular.
Kanamicina: La Kanamicina es un antibitico
del grupo de los aminoglucsidos, de amplio
espectro, bactericida,1 activo sobre bacterias
Gram positivas, Gram negativas y
Mycobacterium, por lo que se indica en una
amplia gama de infecciones. La kanamicina
se asla del hongo Streptomyces
kanamyceticus.2 Debido a su frecuente
toxicidad, el uso de kanamicina se ha limitado
ltimamente al uso oral y tpico.

BSA: (Albmina srica de bovino) Tambin

conocida como fraccin V. Es una protena
srica que tiene muchas aplicaciones
bioqumicas incluyendo ELISAs (Ensayos
Inmunosorbentes Ligados a Enzima) e
inmunoblots. Tambin es utilizado como
nutriente en los cultivos celulares y
microbiolgicos. En digestiones de restriccin
la BSA es utilizada para estabilizar algunas

enzimas durante la digestin de DNA. Esta

protena no afecta a otras enzimas que no la
necesitan para su estabilizacin. La BSA es
comnmente utilizada como estndar de peso
molecular, para determinar la cantidad de
otras protenas, comparando una cantidad
desconocida de protena con cantidades
conocidas de BSA.
Propiedades fsicas:

Numero de residuos: 607

Peso Molecular: 69323.4 Da

pI in agua a 25 C: 4.7

Absorbancia Optica de 1 g/l a 279nm:

0.667 mL mg-1 cm-1 a 279nm

Dimensiones: 40x40x140 angstroms

cbicos.