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Descartes aplica los pasos del mtodo a la metafsica para que sirvan para fundamentar
el sistema filosfico. A partir de la duda metdica, duda de los sentidos, ya que nos
aportan datos confusos. Tambin duda de la realidad, ya que afirma que todos hemos
tenido sueos intensos que llegan a parecer reales. Finalmente duda del entendimiento,
incluso en los sueos hay cosas que se nos presentan como ciertas siempre. La cuestin
era encontrar algo que resiste a toda duda. Por ello, la duda es una evidencia absoluta. Si
dudamos, se deduce que somos un ser presente, por lo que se llega a la primera certeza.
A partir de ah, ya que tenemos ideas en nuestro entendimiento sobre los dems seres y
Dios, podemos demostrarlo deductivamente.
En conclusin, a travs de su epistemologa Descartes logra separar, de manera
fundamental, la metafsica de la religin, y pone como primera fuente del conocimiento
la razn, que conlleva una segunda separacin: dos sustancias en su metafsica,
pensamiento y materia, Filosofa y Ciencias. Es el que da el empujn definitivo a la
independencia de la ciencia. Dar paso al primer gran cientfico, Isaac Newton, que
desarrollar una serie de leyes que contribuirn en el avance de la Fsica.