Sminaire de bactriologie 2014

Jocelyne Favet

7 : ANTIBIOTIQUES ET RSISTANCE BACTRIENNE :

offensives et contre-offensives
Dfinition
Les antibiotiques sont des substances dorigine biologique qui, basse concentration,
peuvent inhiber la croissance des micro-organismes (Waksman, 1943).

Dcouverte de la pnicilline
Le premier antibiotique a t dcouvert par Flemming en 1929, ctait la pnicilline.

Penicillium chrysogenum, moisissure productrice

de la pnicilline
Flemming dans son laboratoire

Flemming devait sabsenter quelques jours ; il a laiss des botes inocules avec
Staphylococcus aureus sur sa table, temprature ambiante. Normalement, ces bactries se
dveloppent en 36-48h 37C. Mais une temprature plus basse, la croissance est plus lente.
Cest ce qui a permis une moisissure contaminante de se dvelopper avant les bactries. A
son retour, Flemming a observ quautour de la moisissure, les bactries taient lyses. Il en a
conclu que la moisissure librait une substance inhibitrice. Cette moisissure tait un
Penicillium chrysogenum : elle produit la pnicilline G.

Penicillium chrysogenum au centre de la bote

produit une zone dinhibition sur les bactries
jaunes qui lentourent. A droite les sporanges du
champignon.

La pnicilline est instable en solution aqueuse. Flemming na pas pu la stabiliser. Il a fini par
abandonner cette recherche aprs avoir publi ses rsultats.
En 1939, Howard Florey (professeur de pathologie Oxford) testait lactivit de substances
bactricides1. Son collaborateur, Ernest Chain a entrepris de reprendre les travaux de
Flemming et de purifier la pnicilline avec laide de Heatley, un biochimiste. Ils russirent et
confirmrent les rsultats de Flemming, ce qui leur valut le prix Nobel.
Alors commena la recherche dautres antibiotiques chez les micro-organismes du sol
(Penicillium chrysogenum est un habitant du sol).

1
Bactricide : qui tue les bactries.

1
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En 1944, Waksman dcouvrait la

streptomycine produite par une bactrie du
sol:
Streptomyces griseus (bactrie filamenteuse,
ici gauche). Il reut le prix Nobel en 1952.
Les Streptomyces, bactries filamenteuses
abondantes dans le sol, se sont rvls de
grands producteurs dantibiotiques.

Dautres espces de moisissures et de bactries ont t analyses. Malheureusement,

beaucoup dantibiotiques ne sont pas utilisables (trop toxiques pour lhomme). Nanmoins,
les annes 50 ont t lge dor des antibiotiques!

Diffrentes tapes de la recherche dun nouvel antibiotique

On commence par prlever divers chantillons de sol. La terre est mise en suspension dans de
leau saline strile et tale sur diffrents milieux de culture. Ici lexemple dune recherche de
Streptomyces producteurs dantibiotique.

Ensuite, il faut:
1. Isoler et purifier la souche
productrice
2. Dfinir ses besoins pour quelle
produise le ou les antibiotique(s)
3. Dfinir les conditions de culture en
fermenteur2 de 5L
4. Isoler lantibiotique
5. Le purifier
6. Tester la substance chimiquement
7. Tests microbiologiques:
Spectre (germes sensibles)
Recherche des concentrations
minimales inhibitrices

Spectre
Pour un antibiotique donn, le spectre correspond la gamme despces qui devraient tre
sensible au traitement avec cet antibiotique. La notion de spectre concerne surtout les
antibactriens. Un antibiotique large spectre agit sur une gamme tendue de bactries. Un
spectre troit nagit que sur des bactries qui appartiennent un groupe bien dfini (par
exemple les Gram +).
Sil ne connat pas lagent infectieux, le mdecin va utiliser un large spectre. Sil le connat, il
peut cibler avec un antibiotique spectre troit.

2
Fermenteur : grand rcipient de 5 plusieurs centaines de litres utilis pour les productions industrielles.

2
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CMI
La CMI correspond la concentration minimale dantibiotique capable dinhiber
totalement la croissance dune souche3 bactrienne.
La CMI est spcifique une souche et un antibiotique.
En analyse mdicale, il faut dterminer la CMI de chaque bactrie isole de patients.
En recherche, on value la CMI sur un grand nombre de souches appartenant chaque
espce juge sensible lantibiotique. Cela donne une ide de la concentration quil faudra
utiliser pour un usage mdical. Ce renseignement sera capital quand on valuera la toxicit
pour lhomme (dose maximale utilisable).

CMI = concentration minimale dantibiotique

qui inhibe totalement la croissance.
Ici, 2 g/ml.

http://microbiologie.univ-
tours.fr/ue_libre_antibiotiques.pdf

Gamme des concentrations actives :

Pour une espce bactrienne, on dtermine
sur plusieurs centaines de souches les CMI,
ce qui donne la gamme de concentrations
actives.
La valeur moyenne dans cet exemple est
denviron 32 g/ml. Pour un usage
thrapeutique, il faut tenir compte de la
limite maximale, ici plus de 40 g/ml.
Il faut donc atteindre plus de 40 g/ml dans
le srum du malade. A comparer avec les
tests de toxicit!

Evaluations pour un usage thrapeutique

Si la substance isole a pass avec succs toutes ces tapes, viennent les:
8. Tests sur animal pour dterminer:
la toxicit
la pharmacocintique (vitesse dlimination)
la dose utilisable
9. Comparaison de la CMI et de la dose utilisable pour valuer les chances de succs
thrapeutique
10. Tests sur volontaires humains
Dure des recherches pour un nouvel antibiotique: minimum 10 ans et beaucoup de
substances quil faut abandonner parce que trop toxiques pour lhomme.
Nanmoins, la dcouverte des antibiotiques a rvolutionn la mdecine moderne.

3
Souche = isolat provenant dun patient. Les souches de mme espce provenant de divers patients peuvent
rpondre diffremment un antibiotique.

3
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Dfinitions
On dit quune souche est sensible un antibiotique quand on prvoit un succs thrapeutique
avec ce traitement. On parle dune souche rsistante quand on prvoit un chec
thrapeutique. Ces dfinitions sont lies la dose thrapeutique.
Ce qui importe, cest de prvoir avec des tests in vitro si on a une chance de succs et
avec quels antibiotiques.

Organismes producteurs
Il sagit essentiellement dorganismes du sol : 1) moisissures (champignons) (ex.:
Penicillium) ; 2) bactries, particulirement les genres Streptomyces (filamenteux) et Bacillus
(formant une endospore). Plus de nombreuses bactries marines.

Penicillium
Streptomyces

Les antibiotiques sont des mtabolites secondaires, cest--dire quils ne servent pas la
construction cellulaire de lorganisme producteur, mais quils apparaissent quand il ny a plus
de croissance. Les Streptomyces ont une production trs riche en mtabolites secondaires qui
semblent avoir des effets inhibiteurs varis: antibiotiques, substances agissant contre les
vers, herbicides, antiviraux, immunosuppresseurs, anticancreux.
On ne connat pas la raison de ce mtabolisme secondaire. On a mis lhypothse que ces
substances appartiennent un mtabolisme ancien et nont plus de rle rel, mais les gnes
sont rests actifs. Dans certains cas, ces substances offrent un avantage lorganisme qui les
produit (antibiotiques), ce qui a contribu leur maintien.

4
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Streptomyces
Coelicolor

a) Morphologie typique de
Streptomyces du sol
Les pigments sont des
mtabolites secondaires
b) Vue panoramique de S.
coelicolor
c) Production de
mtabolites y compris
lantibiotique bleu
(actinorhodine) dans des
gouttelettes aqueuses
sur la surface
hydrophobe de la colonie

Rf.: Genome Biology Vol3, N7

(2002) Thompson et al.

Cette souche de Streptomyces intresse beaucoup les chercheurs. Elle produit plusieurs
antibiotiques. On cherche identifier les gnes responsables.
Si la souche ncessite un milieu et des conditions complexes pour se dvelopper, on va tenter
dinsrer ces gnes dans un autre Streptomyces plus facile cultiver en fermenteur.
Les Streptomyces sont des bactries ubiquistes, elles ont un gnome trs riche.

Agents antimicrobiens de synthse

On synthtise diffrents agents thrapeutiques comme des antibiotiques, des antifongiques ou
des antiviraux.

Les sulfamids. Ce sont des analogues structurels de lacide para-amino-benzoque, cest--

dire dune molcule qui participe la synthse de lacide folique, une vitamine indispensable
la synthse des acides nucliques. Chez les bactries, le sulfamid est incorpor la place de
lacide para-amino-benzoque et bloque la synthse! Comme nous ne savons pas fabriquer
cette vitamine, il ny a pas de risque que lantibiotique interfre avec notre mtabolisme.

Certains antibiotiques sont faciles synthtiser comme le chloramphnicol, cest un

antibiotique de synthse, bien que dorigine naturelle.
Par contre, la ttracycline ncessite environ 72 tapes enzymatiques, dont une bonne partie
non spcifique cette synthse. Il semble que la bactrie productrice, Streptomyces
aureofasciens, utilise plus de 300 gnes! Il est plus simple de laisser le micro-organisme la
produire.

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Ttracycline

Chloramphnicol

On a produit beaucoup de drivs de la pnicilline (beta-lactamines). Le but est de modifier

le spectre ou de les rendre rsistants aux enzymes destructrices produites par les bactries4.

Pnicillines semi-synthtiques

Mode daction des antibiotiques

Les antibiotiques ont une cible prcise dans le mtabolisme bactrien. Ce sont en gnral
des molcules qui prsentent une analogie structurelle avec le substrat denzymes jouant un
rle important dans les principales synthses. Lenzyme se fixe lantibiotique et la synthse
est stoppe.
Il arrive aussi que lantibiotique trouve un site de fixations sur lenzyme, provoquant sa
dformation et le rendant inefficace.
Ils agissent donc presque exclusivement sur des bactries en voie de croissance. Une bactrie
au repos (par exemple sans source dnergie, donc sans activit) peut cohabiter avec un
antibiotique sans dommage!
Les synthses concernes sont:
synthse de la paroi (rupture de la paroi)

4
Systme de dfense labor par les bactries.

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On voit la bactrie coupe en deux par rupture de la paroi, conscutive au

blocage de la synthse: il y a lyse pour insrer une nouvelle brique; ici il y a
eu lyse, mais las de brique insrer!

synthse des protines (enzymes, protines structurelles)

synthse de lADN (multiplication)
synthse de lARN (synthse des protines, autres fonctions).
Un groupe dantibiotiques fait exception en agissant sur la permabilit de la membrane
plasmique. Lantibiotique sinsre dans la membrane plasmique et forme un pore. Une perte
de matriel cellulaire sensuit, provoquant la mort de la cellule.

Les antibiotiques utiliss en mdecine doivent avoir une toxicit slective, cest--dire que la
cible ne doit pas se trouver chez lhomme.

THF: ttrahydrofolate / DHF: dihydrofolate / PABA: acide paraminobenzoique

La paroi des bactries contient un polysaccharide (peptidoglycane), qui nexiste pas chez
lhomme. Cest une cible idale. Les antibiotiques actifs sur cette synthse ne pourront
inhiber que des bactries, les champignons ayant une paroi diffrente. Pour eux, on utilise un
fongicide qui bloque spcifiquement la synthse de leur paroi.

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Pour la synthse des protines : les ribosomes (units qui synthtisent les protines) des
procaryotes sont diffrents de ceux des eucaryotes. On a donc la possibilit de bloquer
slectivement la synthse des protines des procaryotes.

La majorit des antibiotiques tue les bactries (effet bactricide). Mais dans certains cas, on
prfre que lantibiotique inhibe la croissance sans tuer les bactries (effet bactriostatique).
En particulier avec les Gram qui relchent en mourant des endotoxines5, pouvant
occasionner un choc septique. Dans ce cas, on inhibe les bactries pathognes jusqu ce que
le systme immunitaire fasse son travail de nettoyage par phagocytose.

Macrophages migrant vers des bactries

Phagocytose

Bactries

Production Macrophage (bleu) phagocytant

des anticorps une levure (jaune)

Macrophage

Fixation sur la
bactrie pour
faciliter la
phagocytose

Libration des
anticorps

La production danticorps et la phagocytose sont deux mcanismes de dfense de notre

systme immunitaire. Mme en prsence dun antibiotique, le rle des macrophages est
prpondrant.

Emergence de la rsistance aux antibiotiques

La forte utilisation des antibiotiques a provoqu lmergence et la distribution de la
rsistance entre bactries. Cest un grave problme sanitaire!
LOMS met en garde contre la monte de la rsistance aux antimicrobien!
Rsum des principaux faits6:
Il nest pas rare que des infections provoques par des micro-organismes rsistants ne
rpondent pas au traitement classique, ce qui se traduit par une maladie prolonge et
un risque de mortalit accru
Prs de 440 000 nouveaux cas de tuberculose multirsistante font leur apparition
chaque anne, entranant au moins 150 000 dcs (34%).
La rsistance la prcdente gnration dantipaludens est trs rpandue dans la
plupart des pays dendmie palustre (malaria provoques par Plasmodium,
protozoaire).
Un pourcentage lev dinfections nosocomiales est provoqu par des bactries
hautement rsistantes telles que Staphylococcus aureus rsistant la mthicilline
(MRSA), ou les entrocoques rsistants la vancomycine.

5
Endotoxines : lment de la paroi des bactries Gram-, relch aprs la mort de la bactrie. Les endotoxines
peuvent provoquer une cascade dvnements nfastes.
6
http://www.who.int/mediacentre/factsheets/fs194/fr/

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Lusage inadapt et irrationnel des mdicaments antimicrobiens offre des conditions

favorables lmergence, la propagation et la persistance de micro-organismes
rsistants.

La ciprofloxacine est le seul antibiotique actuellement recommand par lOMS pour le

traitement de la diarrhe sanglante due Shigella maintenant quune rsistance gnralise
est apparue aux autres antibiotiques prcdemment efficaces. Mais laugmentation rapide de
la prvalence de la rsistance la ciprofloxacine rduit les options pour un traitement sr et
efficace de la shigellose, en particulier chez lenfant. De nouveaux antibiotiques adapts
lusage oral sont absolument ncessaires.

Gonorrhe ou blennorragie (affection gnito-urinaire sexuellement transmissible). La

rsistance aux antimicrobiens est devenue un problme srieux pour le traitement de la
gonorrhe (due Neisseria gonorrhoeae). Elle est en augmentation partout dans le monde.
Les gonococcies non traitables entraneront des taux accrus de morbidit et de mortalit,
annulant ainsi les gains obtenus en matire de lutte contre cette infection sexuellement
transmissible.

De nouveaux mcanismes de rsistance ont fait leur apparition chez plusieurs bacilles
Gram-ngatifs.
Cela rend inefficaces des antibiotiques puissants, qui sont souvent la dernire dfense
contre les souches multirsistantes de bactries7.

Rsistance bactrienne
16
Exemples de lvolution de la rsistance
14
90
Oxacillin
14 13 76.5 76.9
Ciprofloxacin 80
12 70
% Resistance

10 9.2 60
% Resistance

52.6
8 50
6.5
40
6
30
4
2.2 20 13.9
2
10
0 0 0
0
0
1992 1995 1998 2003 1992 1995 1998 2003

Staphylococcus aureus Salmonella typhimurium

(sang) (Ampicilline)
25
Streptococcus pneumoniae
21.1
Streptococcus pyogenes
12 11.4
20
10 9.1
% Resistance

15.2
8.1 15
8
% Resistance

6.9 12.1

6 9.8
10 9
4.4
4
4.9 5.3
5
2
1.2
0
0
1999 2000 2001 2002 2003
1992 1995 1998 2003

Escherichia coli Erythromycine (tractus resp)

ciprofloxacine

La rsistance aux agents antimicrobiens est dfinie comme la capacit acquise dun micro-
organisme rsister laction inhibitrice dantibiotiques auxquelles lespce est gnralement
sensible.
La rsistance naturelle de certains groupes de micro-organismes est prise en compte dans
lvaluation du spectre de lagent antimicrobien. Elle est lie leur structure qui les protge.
7
OMS: Aide-mmoire N194, Mars 2012

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Mais ici, il sagit de lacquisition dune rsistance. Cela signifie quinitialement, ces
bactries taient tues par cet antibiotique. Aujourdhui, ce mdicament est inefficace!

Rsistance chez deux

souches de MRSA
traites la ciprofloxacine
selon un mode proche de
lutilisation thrapeutique:
infusion toutes les 8 ou 12h
On constate une diminution
importante de la population,
puis une recroissance qui
rejoint le tmoin non trait.

Staphylococcus aureus in In Vitro harmacokinetic

Environments
Jeffrey J. Campion,1 Patrick J. cNamara,2 and Martin
E. Evans1,*
Antimicrob Agents Chemother. Dec 2004; 48(12):
47334744.
doi: 10.1128/AAC.48.12.4733-4744.2004

Lvolution de la rsistance montre un paralllisme avec lutilisation des

antibiotiques.
Cest chez les bactries responsables des principales infections humaines que se dveloppe la
rsistance! (diarrhes, problmes respiratoires, mningites, infections sexuellement
transmissibles, infections nosocomiales).
Le problme existe aussi pour les drogues contre certains parasites (malaria) et virus (HIV).

UTILISATION DES ANTIBIOTIQUES

O? Genre d'utilisation Utilisation correcte?

Mdecine humaine 20% Hpital 20-50% non
50% 80% Mdecine ambulatoire ncessaire

Agriculture - Mdecine 20% Thrapie

vtrinaire 40-80% hautement
80% Prophylaxie - Promoteurs de questionnable
50% croissance
Ex cours Piffaretti

Lutilisation massive des antibiotiques pour llevage a

beaucoup contribu laugmentation de la rsistance.

Comment volue la rsistance?

Il est probable que les facteurs de rsistance devaient exister chez certains micro-organismes.

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Lutilisation massive des antibiotiques a provoqu la slection et la multiplication des souches

rsistantes. De plus, les bactries peuvent se transmettre ces facteurs de rsistance, mme
entre espces diffrentes!

Exemples de transferts de gnes dans la nature

Gne Phnotype Hte initial Hte final
aphA3 Kanamycine Enterococcus Campylobacter coli
Streptococcus
Staphylococcus

ermB MLS Enterococcus Escherichia coli

Streptococcus Klebsiella pneumoniae
Staphylococcus

ermC MLS Staphylococcus Escherichia coli

tet(M) Ttracycline Enterococcus Eikenella corrodens

Streptococcus Gardnerella vaginalis
Staphylococcus Haemophilus spp
Neisseria spp
Kingella denitrificans

tet(O) Ttracycline Enterococcus Campylobacter spp

Streptococcus

Ex Piffaretti

MLS: Macrolide, Lincosamide, Streptogramine B

Les bactries passent de lenvironnement aux animaux

et aux hommes:

Animals

Environment Foodstuff

Humans
Ex Piffaretti

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Structure mosaque du gne penA

chez Neisseria meningitidis

Les gnes de rsistance passent progressivement de la souche

environnementale la souche pathogne pour lhomme.

La souche environnementale N. flavescens (en bas) est naturellement rsistance aux beta-lactames. La souche
pathogne est sensible. On voit comment cette souche va devenir progressivement rsistante en incorporant les
gnes prsents dans le domaine de rsistance Transpeptidase .

Acquisition de la rsistance
Les moyens dacquisition reconnus sont: 1) Origine naturelle (les souches productrices
dantibiotiques produisent des facteurs de rsistance !) ; 2) Mutation et adaptation ; 3)
Echanges gntiques entre bactries.

Conjugaison : change dirig de matriel gntique

Conjugaison

Il y a transmission de matriel gntique entre deux

bactries par un plasmide conjugatif (lment
dADN indpendant du chromosome).

Chez Escherichia coli

donneuse
La cellule donneuse (cilie)
produit un pont
cytoplasmique qui relie les
deux cellules.
Par ce canal, du matriel
receveuse gntique va passer de la
cellule donneuse la
receveuse.

Transformation : acquisition dADN libre dans lenvironnement

On parle de transformation quand une bactrie intgre de lADN tranger du milieu et peut
sen servir. Cet ADN vient gnralement de cellules lyses et est libre dans lenvironnement
des bactries. Pendant la croissance de la colonie, les bactries passent par une phase o elles
laissent entrer des petites molcules dADN (phase de comptence).

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Mcanismes de la rsistance
Il y a divers mcanismes.

Modification de lantibiotique
Lantibiotique est inactiv ou dtruit par des enzymes. Exemple: les beta-lactamases qui
dtruisent les beta-lactames (famille de la pnicilline). On compte plus de 200 beta-lactamases
chez les Gram et les Gram +. Ces gnes sont soit sur le chromosome, soit sur un plasmide.

Il existe plus de 200 bta-lactamases,

chromosomiques et plasmidiques

TEM-I beta-lactamase

Pompe efflux
La bactrie recrache les molcules dantibiotique mesure quelles pntrent dans la cellule.
Ainsi, lantibiotique na pas le temps dagir.

Modification de la cible

Modification de la cible
Site actif de
l'enzyme

Antibiotique
Substrat
Site de Enzyme
fixation de
l'antibiotique

Substitution de la cible
Les bactries sadaptent en synthtisant des rcepteurs modifis qui ne fixent plus
lantibiotique.

Causes de laugmentation de la rsistance

Utilisation massive
Pauvret, do accs inadquat aux mdicaments

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Pauvret: mauvais diagnostic

Pauvret: manque de formation des mdecins
Mauvaise utilisation (dure du traitement non respecte)
Contrefaons non conformes
Demande des patients
Urbanisation et surpopulation:
situation sanitaire
contagion
Pollution, dgradation de lenvironnement et changements climatiques:
Incidence sur la distribution des vecteurs (insectes)
Changements dmographiques:
Personnes ges hospitalises
SIDA, augmente la propagation de maladies qui taient rares
Rsurgence de vieux maux: malaria, tuberculose
Dplacement en avion: distribution inter continents

Consquences attendues
La gnralisation de la rsistance aux antibiotiques va avoir des consquences graves. Lchec
dun traitement prolonge la maladie et augmente le risque de dcs. Les patients restent
contagieux plus longtemps, do un risque accru de propagation et lobligation de se rabattre
sur des mdicaments plus rares et plus chers.
Scnario catastrophe: retour la situation pr antibiotiques.
Faute dantimicrobiens efficaces pour le traitement et la prvention des infections, les taux de
succs des traitements tels que les greffes dorganes, la chimiothrapie anticancreuse et les
interventions chirurgicales majeures pourraient tre en danger.

La monte de la rsistance est-elle rversible?

S
Abt
Mutation
Recombination
Transfer
Cost >0 R R Cost =0

Abt Abt
S R
S
R

R
S

S: sensible / R: rsistant / ABT: antibiotique / Cost: cot pour les bactries

> plus grand que

Aprs contact avec lantibiotique, on slectionne des rsistants. Il y a 3 possibilits :

1) la rsistance apporte un handicape. A la suppression de lantibiotique, il y a retour la
forme sensible S.

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2) Mme situation, mais il y a des mutations compensatoires, on aboutit un mlange de

formes S et R.
3) Il ny a pas de handicape li la rsistance, on aboutit un mlange S et R.

Recherche de nouvelles molcules

1) Recherche dans lenvironnement de nouvelles souches productrices : isolement dune
souche productrice identification de la cible.
2) Utilisation de mthodes modernes (gnomique et chimie combinatoire) : recherche dune
cible potentielle laboration dune molcule.
Utilisation de la gnomique : 1) Connaissance du gnome de plusieurs bactries pathognes,
do recherche de rgions associes une fonction spcifique ; 2) Connaissance du gnome
humain, do comparaison pour vrifier labsence de la cible ; 3) Quand une cible est
identifie, il faut sassurer que la fonction est essentielle et utilise lors de linfection (in
vivo).
Quand on connat la structure de la cible, on peut par comparaison avec les banques de
donnes rechercher un type de molcule qui pourrait avoir une action inhibitrice (chimie
combinatoire). Cette molcule sera amliore par voie chimique.
Viennent ensuite les essais traditionnels: antibiogramme, recherche du spectre, de la
concentration minimale inhibitrice ; essais pour dterminer la dose utilisable, toxicit,
pharmacocintique ; essais sur volontaires humains.
Mme avec les mthodes modernes de recherche, il est difficile de trouver de nouvelles
substances.
De plus, les industries ne sont pas trs motives dinvestir dans cette recherche, car au final
les antibiotiques rapportent moins que les mdicaments pour les maladies chroniques.
LOMS a publi la liste des antibiotiques protger, substance que lon ne peut pas utiliser
pour les animaux, car ce sont les derniers recours en attendant de trouver mieux.

Stratgies alternatives : soigner sans antibiotiques

Utilisation de la phagothrapie, une alternative?
Les bactriophages sont les ennemis naturels des bactries. Ce sont des virus, trs spcifiques
pour une espce donne. Ils sont intressants, parce quils ne sattaqueront pas aux bactries
de notre flore.
Une voie intressante: lutilisation conjointe dantibiotique et de bactriophages spcifiques.
Cela permettrait de diminuer la dose dantibiotique et dpargner notre flore.
Mais il y a beaucoup de problmes rsoudre avant de pouvoir les administrer lhomme.
La recherche avait commenc peut aprs la dcouverte des phages en 1915. Elle a t
abandonne avec lavnement des sulfamids et des antibiotiques.
Aujourdhui diffrents groupes ont repris les recherches. Par exemple le projet europen
Phagoburn dmarr en 2013 pour traiter les grands brls (participation du centre concern du
CHUV et dUNIL). A noter quen Gorgie, on na jamais abandonn ces recherches.
Vido sur le cycle lytique dun phage spcifique sur Escherichia coli :
http://www.youtube.com/watch?v=uFXuxGuT7H8

Dautres mthodes alternatives sont ltude, toutes visant diminuer lutilisation des
antibiotiques.
Il faut accepter que bientt la chimie ne pourra plus nous protger, cet pourquoi il faut
exploiter chaque piste, commencer par la guerre biologique (par exemple avec les phages).

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Conclusion
On ne sait toujours pas avec certitude pourquoi certains micro-organismes produisent des
antibiotiques.
Il est vident que la slection naturelle a favoris les souches productrices et a ainsi maintenu
ce rle dfensif.
La prsence permanente de substances inhibitrices dans lenvironnement a favoris son tour
la propagation et laccumulation des facteurs de rsistance.
Un jour, lhomme a dcouvert ce mcanisme de dfense chez certains organismes du sol. Il en
a tir parti. Mais il navait pas compris que la situation naturelle tait beaucoup plus
complexe.
La rsistance existait dj, mais tait peu rpandue, surtout chez les pathognes qui navaient
pas loccasion de rencontrer les organismes du sol. Lutilisation massive des antibiotiques a
slectionn des souches rsistantes.
Lerreur est davoir tout mis sur les antibiotiques. Aujourdhui nous recherchons en urgence
des stratgies alternatives. Dans lavenir, quoi quon trouve, il faudra se souvenir que les
bactries sont constamment en train de sadapter aux changements de leur environnement et
quune rsistance peut encore sorganiser.

16