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IUPAC Pirimidina
Frmula qumica C4H4N2
Derivados
La pirimidina tiene tres derivados muy importantes para la vida, ya que forman parte de los
cidos nucleicos: la timina, la citosina y el uracilo; las tres tienen un grupo carbonilo (=O)
en el carbono 2; las dos primeras forman parte del ADN donde se aparean con sus purinas
complementarias, mientras que la ltima est presente solo en el ARN.
Nuclesidos y nucletidos
El ADN y el ARN son componentes fundamentales de las clulas vivas, compuestos por
bases de nitrgeno conocidas como purinas y pirimidinas. Estas bases son tambin
componentes crticos de almacenamientos momentneos de energa en las clulas, y sin
ellas, muchos procesos celulares no podran lograrse.
Uso en el laboratorio
La clase de molculas que se conocen como purinas son todas derivadas de la purina de
compuesto heterocclico, que en realidad no se encuentra nunca en la naturaleza. La
guanina, como se muestra en la imagen, es una molcula de purina modificada por un
grupo amino y un oxgeno de una cetona. Las purinas estndar que toman parte en la unin
de alta energa y la sntesis de ADN/ARN son la guanina y la adenina.
Las pirimidinas son molculas derivadas de la pirimidina. Esta, al igual que la purina, es
una molcula heterocclica que no se encuentra en la naturaleza. La citosina, mostrada en la
imagen, es similar a la guanina en que es una pirimidina modificada con un grupo amino y
un oxgeno de una cetona.
Purinas y pirimidinas cumplen dos funciones principales en la clula. En primer lugar, las
purinas adenina y guanina y las pirimidinas citosina, timina y uracilo participan todas en la
produccin de ADN y ARN. Estas bases de nitrgeno se sintetizan asociadas a un residuo
fosforilado de ribosa, un azcar, y los nucleotidos monofosfatados se incorporan a cadenas
en desarrollo del nuevo ADN o ARN durante la replicacin o la transcripcin. La segunda
funcin de las pirimidinas y las purinas es el almacenamiento de energa a corto plazo. La
forma ms comn de energa en todas las clulas es el trifosfato de adenosina, o ATP. La
liberacin del tercer fosfato para producir difosfato de adenosina, o ADP, es una reaccin
extremadamente favorable y puede dar paso a otras que requieren un aporte de energa.
Algunas enzimas y receptores utilizan el trifosfato y el difosfato de guanina como
interruptores de encendido/apagado, mientras que el trifosfato de citosina y el de uridina se
usan ambos en la produccin de biomolculas.
Las purinas y las pirimidinas usadas por la clula para la sntesis de nucletidos (adenina,
citosina, guanina, timina y uracilo) tienen muchos tomos que pueden crear puentes de
hidrgeno, como el nitrgeno, el oxgeno y el propio hidrgeno. Estas molculas estn
diseadas de tal forma que la citosina y la guanina forman tres puentes de hidrgeno,
mientras que o bien la adenina o la timina en el ADN, o el uracilo en el ARN, forman dos.
Durante la rplica del ADN, las polimerasas forman pares A-T y C-G con tasas de error
minsculas debido a la eficiencia de sus puentes de hidrgeno. Un emparejamiento de bases
inadecuado se detecta rpidamente debido a la inestabilidad inherente de los pares
incorrectos.
Los trifosfatos de los nucletido son ingredientes comunes para varios procedimientos
comunes en el laboratorio. La reaccin en cadena de la polimerasa (PCR) requiere la
entrada de una combinacin de NTP para la amplificacin del ADN. El ATP puede aadirse
a una mezcla para iniciar una reaccin que se desea que ocurra y que requiere un aporte de
energa.
Purina
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Purina
Dos de las bases de los cidos nucleicos, adenina (tambin llamada 6-aminopurina) y
guanina (o 2-amino-6-oxo-purina), son derivados de una purina. En el ADN (cido
desoxirribonucleico, almacenador principal y fundamental de la informacin gentica en
todos los seres vivos), estas bases se unen con sus pirimidinas complementarias, la timina
(2,4-dioxi-5-metilpirimidina) y la citosina (2-oxi-4-aminopirimidina), a travs de enlaces de
hidrgeno.
A = T (doble enlace)
G C (triple enlace)
A = U (doble enlace)
G C (triple enlace)
Cuando las purinas son metabolizadas en el interior de las clulas se produce cido rico.
Este cido rico puede cristalizar en las articulaciones, por diferentes motivos, produciendo
gota o en los riones o vas urinarias produciendo as litiasis rica. Si en cambio se
degradan en el intestino delgado por medio de enzimas pancreticas se hidrolizan en
nuclesidos y bases libres.
Qu son las purinas y pirimidinas?
Esos nucletidos estn presentes en todas las clulas de nuestro organismo, lo que refleja su
importancia.
Purinas
Hay dos tipos de purinas: adenina y guanina. Se diferencian de las pirimidinas porque se
componen de 2 "anillos" qumicos de carbono-nitrgeno, mientras que las pirimidinas
tienen 1 anillo solamente. Por lo tanto, son ms grandes y pesadas que las pirimidinas. La
adenina y la guanina se encuentran tanto en el ADN como en el ARN.
Pirimidinas
Existen 3 tipos de pirimidinas: tiamina, citosina y uracilo. Las pirimidinas se componen de
1 solo anillo de carbono-nitrgeno, por lo que son ms pequeas que las purinas. La
citosina se encuentra tanto en el ADN como en el ARN, mientras que la tiamina se
encuentra solamente en el ADN y el uracilo, por su parte, solamente en el ARN.
Pares de bases
Las pirimidinas y las purinas forman pares de bases que crean la estructura de cadena doble
del ADN. La adenina forma un par con la tiamina y la guanina forma un par con la citosina.
Cuando una molcula de ARN se une a una cadena de ADN, la adenina del ADN forma un
par con el uracilo del ARN.
Genes
Cada cadena de 3 bases, denominada codn triplete, codifica para un aminocido. Estos
significa que las enzimas "leen" los codones y forman porciones de protenas segn sus
cdigos individuales. Los codones, por su parte, estn dispuestos en genes, que constituyen
una cadena de ADN. Las cadenas de ADN se enrollan formando cromosomas, que se
encuentran en el ncleo de las clulas eucariticas.
Las bases purinas presentes son: adenina y guanina. Y las bases pirimidinas
son: citosina y timina. Mientras que en el ARN la timina es reeemplazada por el
uracilo. Esta diferencia, sumada a la pentosa (desoxirribosa en ADN y ribosa en
ARN), son las dos diferencias fundamentales en la composicin qumica entre
ADN y ARN. La diferencia de las bases pirimidicas es aprovechada en los
estudios de biologa celular mediante la utilizacin de timidina y uridina
radioactivas (32P) para marcar de manera especifica al ADN y ARN,
respectivamente. Las bases nitrogenadas se unen al carbono 1 de la pentosa,
formando un nuclesido, en ausencia del grupo fosfato. Cuando el corbono 5
de la pentosa se encuentra sustituido por un fostato lo llamamos nucletido.
Cdigo gentico
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Serie de codones en un segmento de ARN. Cada codn se compone de tres nucletidos que
codifican un aminocido especfico.
La secuencia del material gentico se compone de cuatro bases nitrogenadas distintas, que
tienen una funcin equivalente a letras en el cdigo gentico: adenina (A), timina (T),
guanina (G) y citosina (C) en el ADN y adenina (A), uracilo (U), guanina (G) y citosina (C)
en el ARN.
Debido a esto, el nmero de codones posibles es 64, de los cuales 61 codifican aminocidos
(siendo adems uno de ellos el codn de inicio, AUG) y los tres restantes son sitios de
parada (UAA, llamado ocre; UAG, llamado mbar; UGA, llamado palo). La secuencia de
codones determina la secuencia de aminocidos en una protena en concreto, que tendr una
estructura y una funcin especficas.
El ARN o cido ribonucleico es tambin un polinucletido, integrado por una sola cadena
y compuesto de ribosa, cido fosfrico, adenina, guanina, citosina y uracilo. Hay tres clases
de ARN: el ARN mensajero, que es el patrn de copia en el proceso de transcripcin y se
forma directamente a partir del molde de ADN; el ARN de transferencia, encargado de
transferir o llevar los correspondientes aminocidos a la cadena proteica que se est
sintetizando, y el ARN ribosmico.
Introduccin
Durante muchos aos el hombre se ha interesado por descubrir los secretos de la herencia.
Se pens primero en algn tipo de mecanismo similar al de la auto duplicacin del ADN,
pero no fue posible encontrar una adecuacin fisicoqumica satisfactoria. Las relaciones
entre el ADN y las protenas eran aparentemente ms complicadas. Si las protenas con sus
20 aminocidos, fueran el "lenguaje de la vida" -para utilizar 'la metfora de los aos 40- la
molcula del ADN, con sus cuatro bases nitrogenadas, poda imaginarse como un tipo de
cdigo para este lenguaje.
La biosntesis de las protenas comienza cuando un cordn de ARN, con la ayuda de ciertas
enzimas, se forma frente a un segmento de uno de los cordones de la hlice del ADN.
El ARN se forma a lo largo del cordn del ADN de acuerdo con la misma regla del
apareamiento de las bases que regula la formacin de un cordn de ADN, excepto en que
en el ARN el uracilo sustituye a la timing debido al mecanismo de copia, el cordn del
ARN, cuando se ha completado lleva una transcripcin fiel del mensaje del ADN. Entonces
el cordn de ARN se traslada al citoplasma en el cual se encuentran los aminocidos,
enzimas especiales, molculas de ATP, ribosomas y molculas de ARN de transferencia.
Una vez en el citoplasma, la molcula de ARN se una a un ribosoma. Cada tipo de ARNt
engancha por un extremo a un aminocido particular y cada uno de estos enganches implica
una enzima especial y una molcula de ATP.
A medida que el cordn de ARN se desplaza a lo largo del ribosoma, se sita en su lugar la
siguiente molcula de ARNt con su aminocido. En este punto, la primera molcula de
ARNt se desengancha de la molcula de ARN. La energa de enlace que mantienen a la
molcula de ARNt unida al aminocido se utiliza ahora para forjar el enlace peptdico entre
los dos aminocidos, y el ARNt desprendido queda de nuevo disponible. Aparentemente,
estas molculas de ARNc pueden utilizarse muchas veces.
De esta manera, los cromosomas bacterianos mantienen un control muy rgido de las
actividades celulares, evitando la produccin de protenas anormales que pudiera ocurrir
por el posible desgaste de la molcula de ARN.
descifrando el cdigo.
La existencia del ARN fue postulada en 1961 por los cientficos franceses Francois Jacob y
Jacques Monod. Casi inmediatamente Marahall Niremberg, del Public Healt Service de los
EE.UU., emprendi la comprobacin de la hiptesis del ARN. Aadi varios estratos brutos
de ARN de una cierta variedad de fuentes celulares a extractos de E.coli, es decir, materia
que contena aminocidos, ribosomas, ATP y ARNt extractados de las clulas de E.coli y
encontr que todos ellos estimulaban la sntesis protenica.
El cdigo pareca tener un lenguaje universal. Niremberg razon que si E.coli poda leer un
mensaje extrao y traducirlo en una protena, quizs podra leer un mensaje totalmente
sinttico. Deseaba conocer el contenido exacto de cualquier mensaje que dictase.
Una solucin simple para ste problema aparentemente difcil se le ocurri sbitamente;
utilizar una molcula de ARN construida a base de uno slo ribonucletico repetido
muchsimas veces.
El ADN del ncleo transcribe el mensaje codificado al ARN. Una banda complementaria de
ARN.
El ARN mensajero formado sobre el ADN del ncleo, sale a travs de los poros de la
membrana nuclear y llega al citoplasma donde se adhiere a un ribosoma. All ser ledo y
descifrado al cdigo o mensaje codificado que trae el ADN del ncleo.
Las protenas formadas se desprenden del ribosoma y posteriormente sern utilizados por
las clulas. Igualmente el ARN de transferencia, es "descargado" y el ARN mensajero, se
libera del ribosoma y puede ser destruido por las enzimas celulares o ledo por una o ms
ribosomas.
Las sntesis de las protenas comienza, por consiguiente, en el ncleo, ya que all el ADN
tiene la informacin, pero se efecta en el citoplasma a nivel de los ribosomas.
regulacin gentica.
La clula realiza una serie de procesos qumicos muy complejos en los que intervienen
muchas enzimas Cmo y quien sigue stos procesos? Cmo se sintetizan las protenas en
funcin de las necesidades del organismo o de las condiciones del medico?.
Las sntesis de enzimas est dirigida y regulada por los genes. Cmo se efecta esta
regulacin?. El modelo gentico propuesto por Jacob y Monod explica este mecanismo.
Los genes estructurales: Ocupan una funcin del ADN y tienen la funcin de explicar la
funcin de aminocidos en las molculas de protenas.
El operon: Est formado por varios genes estructurales y el gen operado que estn ubicado
en el extremo inicial. Este gen acta como interruptor de corriente.
El gen regulador: Produce una determinada sustancia que al combinarse con el producto
final, acta como represor del operon. Esta sustancia produce un bloqueo de la accin del
operon ya que se combinaron con el operador, el cual como dijimos anteriormente.
La teora ms ampliamente aceptada sobre la manera de actuar los genes proviene de los
trabajos de loa genetistas G. W. Beadle y E. L. Fatom, con el moho rojo del pan,
Neurospora Crassa, perteneciente a los hongos asoomicetos. Neurospora es particularmente
un organismo apropiado para llevar adelante estudios genticos.
La Neurospora puede crecer en tubos de ensayo que contengan un medio de cultivo muy
simple compuesto de: sacarosa, unas pocas sales y una vitamina, la biotina que proporciona
todos los requerimientos nutricionales que necesita Neurospora para crecer, vivir y
reproducirse. A partir de stas sustancia relativamente complejas requeridas para su vida,
tales como protenas y cidos nucleicos.
Beadle y Tatum expusieron a la accin de los rayos ultravioletas algunas esporas sexuales
provenientes de cierto tipo de apareamiento de Neurospora. Lego dejaron que stas esporas
germinaran en un medio "completo", es decir, enriquecidos con vitaminas y aminocidos.
Una vez que se hubo desarrollado el micelio, se hicieron cruces con otros tipos de
apareamiento. Las ascosporas producidas fueron retiradas individualmente y luego
colocadas separadamente en medios de cultivos completos.
Una vez que crecieron, se colocaron porciones de micelio de cada cultivo en un medio
mnimo. A veces el crecimiento continuaba, a veces se suspenda, cuando esto ltimo
ocurra la raza particular reciba varias vitaminas, aminocidos, etc. hasta lograr que se
produjera crecimiento. Finalmente se pudo establecer que cada raza deficientemente era
capaz de crecer en un medio mnimo, al cual se haba agregado una sustancia accesoria, por
ejemplo, la tiamina. Beadle y Tatum supusieron que la radiacin ultravioleta haba
producido una mutacin del gen, que posibilita la sntesis de la tiamina, y lo haba
transformado en un alelo que no es capaz de hacerlo.
Los investigadores concluyeron que el cambio de un precursor a otro estaba bloqueado por
cuanto la enzima especfica requerida estaba ausente.
Sobre sta base, crearon la teora de "Un gen una enzima" referente a la accin del gen,
que puede formularse en los siguientes trminos: cada gen en un determinado organismo
regula la produccin de una enzima especfica.
Son stas enzimas las que pueden llevar a cabo todas las actividades metablicas del
organismo, de las cuales a la vez depende el desarrollo de una estructura y su fisiologa
caracterstica, es decir, el fenotipo del organismo.
CONCLUSIN
El cdigo gentico se transfiere desde el ncleo hasta el citoplasma a travs del ARN y
ARNt donde se producen las protenas especficas que determinan al organismo.
Finalmente se pudo establecer la teora de un gen una enzima que establece que cada gen
en determinado organismo regula la produccin de una enzima especifica.
BIBLIOGRAFA
Las bases nitrogenadas son compuestos orgnicos cclicos, con dos o ms tomos de
nitrgeno, que constituyen una parte fundamental de los nucletidos, nuclesidos y cidos
nucleicos. Desde el punto de vista de la Biologa existen cinco bases nitrogenadas
principales, que se clasifican en dos grupos, bases pricas (derivadas de la estructura de la
purina) y bases pirimidnicas (derivadas de la estructura de la pirimidina).
La adenina (A) y la guanina (G) son pricas, mientras que la timina (T), la citosina (C) y
el uracilo (U) son pirimidnicas. Las cuatro primeras bases se encuentran en el ADN,
mientras que en el ARN en lugar de timina existe el uracilo.
Para mayor comodidad, cada base se representa con la letra indicada. Las bases
nitrogenadas son complementarias entre s, es decir, forman parejas de igual manera que lo
haran una llave y su cerradura. La adenina y la timina son complementarias (A-T), al igual
que la guanina y la citosina (G-C). Como en el ARN no existe timina, la
complementariedad se establece entre adenina y uracilo (A-U). La complementariedad de
las bases es la clave de la estructura del ADN y tiene importantes implicaciones, ya que
permite procesos como la replicacin del ADN y la traduccin del ARN en protenas.
Agustn
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Mxico
crisvier...
ADENINA-TIMINA ADN
CITOCINA-GUANINA
ARN
ADENINA-TIMINA
CITOCINA-URACILO
o hace 5 aos
o Reportar abusos
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En el ADN son: Adenina (A), Timina (T), Citosina (C) y Guanina (G).
En el ARN son: Adenina (A), Uracilo (U), Citosina (C) y Guanina (G).
Suerte!
o hace 5 aos
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Enrique G
=)
o hace 5 aos
o Reportar abusos
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ofendida
el ADN est formado por ADENINA (A), quien hace pareja con TIMINA (T),
GUANINA (G) quien hace siempre pareja con CITOCINA (C),
el ARN est formado por ADENINA (A), URACILO (U) quien hace pareja con
adenina. GUANINA (G) y CITOCINA (C).
Estas bases se unen a sus parejas por puentes de hidrogeno.
o hace 5 aos
o Reportar abusos
Bases nitrogenadas
mircoles, 11 de febrero de 2009
Bases Nitrogenadas.
Adenina, -->
compuesto orgnico nitrogenado de frmula C5H5N5, que forma parte de los cidos
nucleicos. Es un derivado de la purina (es una base prica) en la que un hidrgeno
ha sido sustituido por un grupo amino (NH2):
Al igual que la guanina, la citosina, la timina y el uracilo (todas bases nitrogenadas),
forma parte de los nucletidos que constituyen las largas cadenas de cidos
nucleicos; cada nucletido est formado por un grupo fosfato, un azcar de cinco
carbonos (ribosa o desoxirribosa) y una de estas bases. En la estructura de doble
hlice en forma de escalera retorcida que presenta el cido desoxirribonucleico
(ADN), cada base se acopla con otra base especfica, formando los travesaos de
la escalera. La unin de estas bases se produce por afinidad qumica, de forma que
en el ADN, la adenina siempre se une a la timina. En las secuencias de nucletidos,
la adenina se representa por la letra A.
Tambin forma parte de la molcula de trifosfato de adenosina, que constituye la
fuente principal de energa a nivel celular, y est presente en muchas sustancias
naturales como la remolacha, el t y la orina.
La adenina, junto con la timina, fue descubierta en 1885 por el bioqumico alemn
Albrecht Kossel.
Timina:
base orgnica nitrogenada de frmula C5H6N2O2, que forma parte del cido
desoxirribonucleico (ADN). Es un compuesto cclico derivado de la pirimidina (es
una base pirimidnica):
Los nucletidos que constituyen el ADN estn formados por un grupo fosfato,
desoxirribosa (un azcar de cinco carbonos) y una base nitrogenada. La timina es
una de las cuatro bases que forman estos nucletidos; las otras tres bases son la
adenina, la citosina y la guanina. Estas ltimas tambin intervienen en la
composicin del cido ribonucleico (ARN), pero la cuarta base de este cido es el
uracilo.
Las uniones transversales en la estructura de doble hlice del ADN tienen lugar a
travs de las bases, que siempre se emparejan de forma especfica; la timina, que se
representa por la letra T en las secuencias de nucletidos, siempre se acopla con la
adenina.
La timina fue descubierta en 1885 por el bioqumico alemn Albrecht Kossel.
Citosina:
base orgnica nitrogenada de frmula C4H5N3O, que forma parte del cido
desoxirribonucleico (ADN) y del cido ribonucleico (ARN). Es un compuesto
cclico hexagonal derivado de la pirimidina (es una base pirimidnica):
Los cidos nucleicos (ARN y ADN) estn constituidos por unidades denominadas
nucletidos, formadas por un grupo fosfato, un azcar de cinco tomos de carbono
(ribosa o desoxirribosa) y una base nitrogenada. La citosina es una de las cinco
bases que forman parte de los nucletidos; adenina, guanina, timina y uracilo son
las otras cuatro. La unin entre las dos hebras del ADN que constituyen su
estructura de doble hlice tiene lugar a travs de estas bases, que se emparejan
siempre de la misma forma; la citosina siempre se acopla con la guanina. En las
secuencias de nucletidos, la citosina se representa por la letra C.
Guanina,
base orgnica nitrogenada de frmula C5H5N5O, que forma parte de los cidos
nucleicos. Es un compuesto cclico derivado de la purina (es una base prica):
En las secuencias de nucletidos, unidades constituyentes de los cidos nucleicos, la
guanina se representa por la letra G. En la estructura de doble hlice del cido
desoxirribonucleico (ADN), la guanina siempre se acopla con la citosina, otra de las
bases nitrogenadas que junto con la adenina y la timina forman parte de las largas
cadenas de ADN. Tambin est presente en el cido ribonucleico.
La guanina fue descubierta en el guano, de ah su nombre. La presencia de guanina
cristalizada en la piel y las escamas de los anfibios, reptiles y peces es lo que
muchas veces origina, por accin de la luz, la aparicin de ciertos colores
caractersticos de la dermis de estos animales.
Uracilo
Es una de las cuatro bases qumicas del ARN y en el cdigo gentico se representa
con la letra U. El uracilo reemplaza a la timina que es una de las cuatro bases
nitrogenadas que contiene el ADN. Al igual que la timina, el uracilo siempre se
aparea con la adenina. Tambin como :Uracil es 2-oxy-4-oxy pirimidina..
___________________________________________________________
Quedando entonces as el ADN
_________________________________
ARN
Propsitos generales
Promover el uso de los equipos porttiles en el proceso de enseanza y aprendizaje.
Tanto el ADN como el ARN son molculas orgnicas (las molculas orgnicas poseen en su
estructura C y por lo menos un tomo de H). En las clulas procariotas, el ADN se
encuentra en una regin denominada nucleoide y en las clulas eucariotas, en el interior del
ncleo celular.
La posicin del ARN en la clula depende de la variedad de la que se trate, as hay tres
tipos de ARN: mensajero, de transferencia y ribosomal.
Actividad 1:
El ADN se encuentra constituido por nucletidos, que son molculas orgnicas compuestas
a su vez por una base nitrogenada, un azcar (la desoxirribosa) y un grupo fosfato. La
informacin gentica en el ADN posibilita la sntesis del ARN y este, a su vez, la sntesis de
protenas, que se constituyen como los productos de expresin de la informacin gentica.
Estas protenas pueden tener una funcin estructural o enzimtica. Si tienen una funcin
estructural, formarn parte de alguna de las estructuras de la clula, como la membrana
plasmtica, la envoltura nuclear, las mitocondrias, etc. Ahora bien, si poseen una funcin
enzimtica, las protenas habrn de catalizar reacciones qumicas especficas en las clulas.
2. Sobre la base del siguiente esquema de las bases nitrogenadas que conforman el
ADN, especifiquen brevemente cules son las diferencias en sus estructuras qumicas.
3. Realicen una bsqueda en la web y el material bibliogrfico de referencia sobre la
funcin del ADN. Completen un mapa conceptual como el siguiente utilizando los
siguientes conectores: es, duplicacin, transcripcin, traduccin, formado, contiene,
sntesis.
A qu atribuyen el hecho de que Rosalind Franklin no haya sido reconocida como una
investigadora clave en el descubrimiento de la estructura molecular del ADN? Consideran
que la condicin de gnero influye en la actividad cientfica? Discutan sobre este tema en
clase.
Actividad 2:
Cules son los diferentes tipos de ARN que existen? Qu funcin cumplen?
Actividad 3:
1. Sobre la base de lo trabajado con relacin a la estructura y la funcin de los cidos
nucleicos, respondan si las siguientes afirmaciones son verdaderas (V) o falsas (F).
Argumenten todas sus respuestas. Pueden escribir las respuestas en el procesador de
textos de sus equipos porttiles.
La nica diferencia en la estructura del ADN y ARN radica en las bases nitrogenadas que
los componen.
Los codones son los elementos que constituyen la estructura de las protenas.
Los cidos nucleicos (ADN y ARN) estn conformados por cadenas dobles.
Materiales
80 g de levadura de panadera
Vaso de precipitados
Agua
Sal
Embudo de vidrio
Papel de filtro
Tela delgada
Cuchara de metal
Alcohol
Detergente
Aguja de diseccin
Microscopio ptico
Procedimiento
Bibliografa sugerida
H. Curtis, S. N. Barnes, A. Schnek, A. Massarini. Biologa. Buenos Aires, Editorial
Panamericana, 2008.
Base nitrogenada
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Apareamiento A=T con dos puentes de hidrgeno. Los puentes de hidrgeno se muestran
como lneas discontinuas.
Las bases nitrogenadas son compuestos orgnicos cclicos, que incluyen dos o ms tomos
de nitrgeno. Son parte fundamental de los nuclesidos, nucletidos, nucletidos cclicos
(mensajeros intracelulares), dinucletidos (poderes reductores) y cidos nucleicos.
Biolgicamente existen seis bases nitrogenadas principales (en realidad hay muchas ms),
que se clasifican en tres grupos, bases isoaloxaznicas (derivadas de la estructura de la
isoaloxazina), bases pricas o purinas (derivadas de la estructura de la purina) y bases
pirimidinas (derivadas de la estructura de la pirimidina). La flavina (F) es isoaloxaznica,
la adenina (A) y la guanina (G) son pricas, y la timina (T), la citosina (C) y el uracilo (U)
son pirimidnicas. Por comodidad, cada una de las bases se representa por la letra indicada.
Las bases A, T, G y C se encuentran en el ADN, mientras que en el ARN en lugar de timina
aparece el uracilo.
ndice
1 Complementariedad entre purinas y pirimidinas
2 Estructura
o 2.1 Isoaloxazinas
o 2.2 Purinas
o 2.3 Pirimidinas
Estructura
El "esqueleto" de las flavinas es la isoaloxazina, por lo que son bases
isoaloxaznicas.
El "esqueleto" de adenina, hipoxantina, xantina, etc. es la purina, por lo que toman
el nombre de bases pricas o purnicas.
El "esqueleto" de citosina, uracilo, timina, nicotina, nicotinamida, etc. es la
pirimidina, son bases pirimdicas.
Isoaloxazinas
Flavina
Riboflavina
F
Purinas
Adenina Adenosina
A
Guanina
Guanosina
Pirimidinas
Timina Timidina
T
Citosina Citidina
C
Uracilo Uridina
U
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Bases nitrogenadas
PIRIDINA
La piridina (frmula molecular C5H5N, masa molecular: 79,10) es
un lquido incoloro de olor desagradable, similar al pescado en mal estado.
Pertenece a la familia de los compuestos aromticos heterocclicos, y est
estructuralmente relacionada al benceno, siendo la nica diferencia entre ellos
el reemplazo de un grupo CH del anillo bencnico por un tomo de nitrgeno.
Historia
La piridina impura fue sin dudas preparada por los primeros alquimistas al
calentar huesos animales y otra materia orgnica, pero la referencia
documentada ms temprana se adjudica al cientfico escocs Thomas
Anderson. En 1849, Anderson examin el contenido del aceite obtenido a
travs del calentamiento a altas temperaturas de huesos animales. Entre otras
sustancias, separ del aceite un lquido incoloro de olor desagradable, desde el
cual aslo piridina pura dos aos despus. La describi como altamente soluble
en agua, fcilmente soluble en cidos concentrados y sales luego de calentarla
y levemente soluble en aceites. Debido a su inflamabilidad, Anderson llam a
la nueva sustancia piridina, del griego (pyros) que significa fuego. El
sufijo -idina se le suma de acuerdo a la nomenclatura qumica, como
en toluidina, para indicar que un carbono del ciclo contiene un tomo
de nitrgeno
La estructura qumica de la piridina fue determinada dcadas despus de su
descubrimiento En 1876, William Ramsay combin acetileno y cianuro de
hidrgeno en piridina en un horno de acero al rojo. Esta, fue la primera sntesis
de un compuesto hetero-aromtico.
Los mtodos contemporneos en la produccin de piridina tienen un bajo
rendimiento y una demanda creciente para el compuesto requiere de la bsqueda de nuevas
rutas su sntesis. Un punto de inflexin ocurri en 1924 cuando el qumico ruso Aleksei
Chichibabin desarroll la sntesis de piridina de Chichibabin, la cual utiliza reactivos
relativamente baratos. Este mtodo an se usa en la produccin industrial de la piridina
Obtencin en la Industria
Industrialmente, se obtiene del petrleo y en menor medida, del alquitrn de hulla (en el
cual su concentracin es de aproximadamente 0,1%), o bien por medio de sntesis a partir
del acetaldehdo y el amonaco. Tambin puede ser preparada por destilacin del aceite
obtenido de la destilacin destructiva de huesos.
Derivados de la piridina pueden ser sintetizados haciendo reaccionar 1,5-dicetonas con
acetato de amonio en cido actico, seguido de oxidacin.
Nomenclatura
El nombre sistemtico de la piridina, dentro de la nomenclatura de Hantzsch-
Widman recomendada por la IUPAC, es azina. Sin embargo, los nombres sistemticos para
compuestos simples son raramente utilizados, por lo que la nomenclatura de los
heterociclos sigue a los nombres comunes. La IUPAC no recomienda el uso de azina en vez
de piridina. La numeracin de los tomos del anillo de piridina comienza en el nitrgeno.
Tambin se utiliza la distribucin de las posiciones de los carbonos segn el alfabeto
griego (-) y cuando se habla de los patrones de sustitucin se utiliza (orto, meta y para).
Aqu (orto), (meta) y (para) se refieren a las posiciones 2, 3 y 4 del anillo
respectivamente. El nombre sistemtico de los derivados de piridina es piridinil, donde la
posicin del sustituyente es precedida por un nmero. Sin embargo en este caso tambin la
IUPAC no aconseja el uso optando por el nombre comn piridil en vez del sistemtico. El
derivado catinico formado por la adicin de un electrfilo al nitrgeno es
llamado piridinio
4-bromopiridina
2,2-bipiridina
Catin piridinio
Existencia en la naturaleza.
La piridina se presenta en un sinfn de compuestos relacionados a la vida (pero no en su
forma pura), entre ellos el NAD, la nicotina, la vitamina B3 niacina (cuya falta causa
pelagra), y la vitamina B6 piridoxina.
Riesgos
La piridina pura no est muy extendida en la naturaleza es una sustancia nociva si se la
inhala, ingiere o si se absorbe por la piel. Reduce la fertilidad masculina y femenina y es
considerada un carcingeno. Los sntomas de exposicin ms comunes son: dolor de
cabeza, tos, dificultad respiratoria, laringitis, nuseas y vmitos.
En la naturaleza, en su forma ms perjudicial se la encuentra en las hojas y races de la
belladona (Atropa belladona) y en el malvavisco (Althaea officinalis) Pero como vimos,
los derivados de la piridina se encuentran en ciertas biomolculas como los nucletidos de
piridina y alcaloides. En la vida diaria se encuentran trazas de piridina como componentes
voltiles de compuestos orgnicos que se generan en los procesos de tostacin y enlatado.
Como es el caso del pollo frito, panceta frita, el queso Beaufort, el aroma del caf el t
negro y la miel de girasol. El humo del tabaco y el de la marihuana contienen piridina.
Aplicaciones
Propiedades Fsicas
Propiedades Qumicas
La piridina es miscible en agua y prcticamente en todos los solventes orgnicos. Es
dbilmente bsica y con cido clorhdrico forma una sal cristalina (hidrocloruro) que funde
a 145-147 C
La mayora de las propiedades qumicas de la piridina son tpicas de los compuestos
heteroaromticos. En reacciones orgnicas se comporta tanto como una amina terciaria
experimentando la protonacin, alquilacin, acilacin y N-oxidacin en el tomo de
nitrgeno. Y tambin como un compuesto aromtico experimentando sustituciones
nuclefilas.
Debido a su nitrgeno electronegativo en el anillo, la molcula es relativamente electro-
deficiente. Y por lo tanto, experimenta ms lentamente la sustitucin electrfila aromtica,
que es tpica de los derivados del benceno. Sin embargo, en contraposicin al benceno y a
sus derivados, la piridina es ms lbil frente a sustituciones nucleoflicas y frente a
la metalacin del anillo frente a bases fuertes organometlicas.
La reactividad de la piridina puede ser diferenciada para tres grupos qumicos. Frente
a electrfilos, la sustitucin electrfila tiene lugar cuando la piridina presenta propiedades
aromticas. Frente a nuclefilos, la piridina reacciona a travs del segundo y cuarto tomo
de carbono y por lo tanto, se comporta como iminas y carbonilos. La reaccin con
muchos cidos de Lewis resulta en la adicin al nitrgeno de la piridina, lo cual es similar
al comportamiento de las aminas terciarias. La capacidad de la piridina y de sus derivados a
oxidarse, formando nitrxidos (N-xidos), es tambin una caracterstica de las aminas
terciarias
HETEROCICLICOS FUSIONADOS
Los compuestos heterocclicos son compuestos orgnicos cclicos en los que al menos uno
de los componentes del ciclo es de un elemento diferente al carbono. Los tomos distintos
de carbono presentes en el ciclo se denominan heterotomos, siendo ms comunes los
heterotomos de nitrgeno, oxgeno y azufre.
a) Se elige el nombre del heteroanillo como el compuesto base y se le aade como prefijo el
nombre del anillo unido a l. Por ejemplo:
=+
Benzoxazol Oxazol
b) Los nombres de los componentes de los sistemas fusionados se eligen, siempre que sea
posible, de la lista de nombres triviales reconocidos. Se selecciona el componente mayor
que posee un nombre reconocido (p. ej., indol mejor que pirrol si est presente un
fragmento de indol en el sistema policclico). Cuando un componente monocclico no tiene
un nombre trivial reconocido, se utiliza su nombre sistemtico.
d) El segundo componente se aade como prefijo al nombre del componente base. Dicho
prefijo se deduce remplazando la a final del nombre sistemtico anular por o. As,
pirazina se convierte en pirazino, etc.
.
PIRIMIDINAS
La pirimidina es un compuesto orgnico, similar al benceno, y a la piridina pero con
un anillo heterocclico: dos tomos de nitrgeno sustituyen al carbono en las posiciones 1 y
3. Se degrada en sustancias muy solubles como alanina beta y aminoisobutirato beta,
precursores de acetil-CoA y succinil-CoA.
La pirimidina es un componente de importantes productos naturales, tales como la vitamina
B1, las purinas y los productos de degradacin de los cidos nuclecos.
Obtencin
Los derivados 4,6-disustituidos de la pirimidina son accesibles por calentamiento de 1,3-
dicetonas con formamida a 180-200oC. El transcurso de la reaccin se interpreta como
sigue:
Utilizando el diacetal del aldehdo malnico se puede obtener por este mtodo la pirimidina
misma, con un rendimiento del 65%.
Propiedades
La pirimidina es una sustancia cristalina con p.f. de 22C (295 K) que se disuelve en agua
dando reaccin neutra y que forma sales con los cidos minerales.
Los reactivos electrfilos atacan al anillo de pirimidina en la posicin 5, pero estas
sustituciones se producen considerablemente mejor cuando en el anillo existen grupos con
fuerte efecto dador de electrones; as, la 2-aminopirimidina reacciona con el acido de nitrar
a 50oC (325K) originando la 2-amino-5-nitropirimidina.
La pirimidina tiene tres derivados muy importantes para la vida, ya que forman parte de
los cidos nucleicos: la timina, la citosina y el uracilo; las tres tienen un
grupo carbonilo (=O) en el carbono 2; las dos primeras forman parte del ADN donde se
aparean con sus purinas complementarias, mientras que la ltima est presente solo en
el ARN.
|||
Timina | Uracilo | Citosina |
Reacciones
De la base pirimidina, es de donde se sintetizan varios compuestos orgnicos, que dan
origen a otros, por sntesis orgnica, y varios medicamentos tales como:
1.pirimetamina
2.sulfadiazina
3.sulfamerazina
4.sulfametazina
5.tiamina
6.tonsilamina
7.citosina
8.uracilo
9.timina.
10. barbituricos: veronal, seconal, soneril, nembutal, amital, Dial, luminal, gardenal,
fanodormo.
11. aloxano
12.acidourico.
13. acido barbiturico
14.pentotal.
15. cellocilina
16.Hidrazidamaleica
17.pirazina
18.piridazina
19.idoxuridina,antibitico.
20. AZT, antisida.
21. succinonitrilo
22.tiouracilo.
PURINAS
La purina es una base nitrogenada, un compuesto
orgnico heterocclico aromtico. La estructura de la purina est compuesta
por dos anillos fusionados, uno de seis tomos y el otro de cinco. En total estos
anillos presentan cuatro nitrgenos, tres de estos son bsicos, ya que tienen el
par de electrones sin compartir en orbitales sp2 en el plano del anillo, el
nitrgeno restante no tiene carcter bsico ya que el par de electrones no
compartidos que posee, es parte del sistema de electrones del sistema
aromtico, por lo cual se encuentran deslocalizados e incapaces de captar un
protn.
Dos de las bases de los cidos nucleicos, adenina (tambin llamada 6-
aminopurina) y guanina (o 2-amino-6-oxo-purina), son derivados de una purina.
En el ADN (cido desoxirribonucleico, almacenador principal y fundamental de
la informacin gentica en todos los seres vivos), estas bases se unen con
sus pirimidinas complementarias, la timina (2,4-dioxi-5-metilpirimidina) y
la citosina (2-oxi-4-aminopirimidina), a travs de enlaces de hidrgeno.
* A = T (doble enlace)
* G C (triple enlace)
En el ARN (cido ribonucleico, encargado principalmente de copiar y transmitir
la informacin gentica en todos los seres vivos), la complementaria de la
adenina es el uracilo (o 2,4-dioxipirimidina) en vez de la timina:
* A = U (doble enlace)
* G C (triple enlace)
Cuando las purinas son metabolizadas en el interior de las clulas se
produce cido rico. Este cido rico puede cristalizar en las articulaciones, por
diferentes motivos, produciendo gota o en los riones o vas urinarias
produciendo as litiasis rica. Si en cambio se degradan en el intestino
delgado por medio de enzimas pancreticas se hidrolizan en nuclesidos y
bases libres.
Propiedades fisicoqumicas
Las propiedades fisicoqumicas de las purinas dependen de la naturaleza de
sus sustituyentes, pero todos ellos presentan un carcter aromtico marcado y
resisten la oxidacin, absorben en el espectro U.V. propiedad muy utilizada
para su caracterizacin.
Sntesis
La hidrlisis extracelular de cidos nuclecos injeridos ocurre a travs de las
acciones coordinadas de endonucleasas, de fosfodiesterasas y de nuclesido
fosforilasas. Las endonucleasas degradan el ADN y el ARN en los sitios internos
dando lugar a la produccin de oligonucletidos. Los oligonucletidos son
posteriormente digeridos por las fosfodiesterasas que actan desde sus
extremos hacia el interior de estos, liberando nuclesidos libres. Las bases son
hidrolizadas desde los nuclesidos por la accin de las fosforilasas que
producen ribosa-1-fosfato y bases libres. Si los nuclesidos y/o las bases no son
reutilizadas las bases de purina se degradan tambin a cido rico y las
pirimidinas a -aminoisobutirato, NH3 y CO2.
Tanto las vas de sntesis de salvataje, como las vas de sntesis de novo de
purina y de pirimidina conducen a la produccin de nuclesido-5'-fosfato a
travs de la utilizacin de un azcar intermediario activado y de una clase de
enzimas llamadas fosforibosiltransferasas. El azcar activado que se utiliza es
el 5-fosforibosil-1-pirofosfato, PRPP. El PRPP es generado por la accin de la
PRPP sintetasa y requiere de energa en forma de ATP como se muestra:
Hay que observar que esta reaccin libera AMP. Por lo tanto, 2 equivalentes de
fosfato de alta energa son consumidos durante la reaccin.
Biosntesis del Nucletido de Purina
El sitio principal de la sntesis de purina est en el hgado. La sntesis de los
nucletidos de purina comienza con el PRPP y conduce al primer nucletido
completamente formado, inosina-5'-monofosfato (IMP). Esta va esta
representada grficamente abajo. La base de purina sin la ribosa unida es la
hipoxantina. La base de purina es construida sobre la ribosa mediante varias
reacciones de amidotransferasa y transformilacin. La sntesis de IMP requiere
de cinco moles de ATP, dos moles de glutamina, un mol de glicina, un mol de
CO2, un mol de aspartato y dos moles de formato. Las partes de formil son
llevadas en el tetrahydrofolate (THF) en forma de N5, N10- metenil-THF y N10-
formil-THF.
1. -5-Fosforribosilamina (PRA)
2. Glicinamida ribonucletido (GAR)
3. Formilglicinamida ribonucletido (FGAR)
4. Formilglicinamida ribonucletido (FGAM)
5. 5-aminoimidazol ribonucletido (AIR)
6. 4-carboxi-5-aminoimidazol ribonucletido (CAIR)
7. N-succinilo-5-aminoimidazol-4-carboxamida ribonucletido (SAICAR)
8. 5-aminimidazol-4-carboxamida ribonucletido (AICAR)
9. N-formilaminoimidazol-4-carboxamida ribonucletido (FAICAR)
10. Acido inosnico (IMP)
AMP y a GMP. La acumulacin del exceso de ATP conduce a la sntesis acelerada de GMP,
y el exceso de GTP conduce a la sntesis acelerada de AMP.
Usos de las purinas
1. sirven como almacenamiento de energa para uso futuro en reacciones de transferencia
de fosfatos. Estas reacciones se realizan predominantemente por el ATP
2. forman parte de varias coenzimas importantes como NAD+, NADP+, FAD y coenzima
A.
3. sirven como mediadores de importantes procesos celulares como segundos mensajeros
en eventos de sealizacin intracelular. El mensajero intracelular predominante es el AMP-
cclico (cAMP), un derivado cclico del AMP formado a partir del ATP.
4. controlan varias reacciones enzimticas por medio de efectos alostricos en la actividad
de las enzimas.
5. sirven como intermediarios activados en varias reacciones de biosntesis. Estos
intermediarios activados incluyen a la S-adenosilmetionina (S-AdoMet o SAM)
involucrada en reacciones de transferencia de grupos metilo as como tambin en la sntesis
azcares conjugados con nucletidos de glicgeno y glucoprotenas.
Fuentes Bibliogrficas
* Qumica Orgnica, Jhon Mcmurry, CENGAGE LEARNING,7 Edicin
* Quimica Organica fundamental,Robert Thornton Morrison,Pearson Educacin, 5
Edicin
* Quimica Organica Fundamental,Henry Rakoff, LIMUSA,
* Bioquimica,Mathews, Van Holden Ahem, Pearson Addison Wesley, 3 Edicin
* Manual de qumica orgnica. Hans Beyer, Wolfgang Walter. Anillos aromticos con dos
heterotomos. Pagina 847. Editorial Reverte.
* Weissberger (Ed.), A. Klingberg (ed.), R.A. Barnes, F. Brody, P.R. Ruby: Pyridine and its
Derivatives, Volume 1, 1960, Interscience Pub., New York
Duplicacin del ADN: es un mecanismo que tiene el ADN y gracias a ella una molcula
nica puede hacer dos clones de ella, esto es gracias a que este es un mecanismo
semiconservativo que indica que las cadenas complementarias al separarse del ADN,
tambin sirven de molde para nuevas cadenas complementarias de la cadena molde.
Gracias a la complementacin entre bases de las cadenas el ADN puede reproducirse
idnticamente y as transmitir la informacin hereditaria de la clula madre a las celular
hijas.
Transmisin del ADN: este es el primer proceso de la expresin gentica, en el cual se
transfiere la informacin contenida en la secuencia de ADN rumbo a la secuencia de
protena utilizando varios ARN de por medio.
Las secuencias de ADN son copiadas mediante una encima conocida como ARN
polimerasa y que genera un ARN mensajero que mantiene la secuencia de la informacin
del ADN, en otras palabras el transporte del ADN tambin se podra llamar como la sntesis
del ARN mensajero.
Traduccin de ADN: es el camino de transporte de informacin del ARN a la protena. La
especialidad funcional de los polipptidos reside en su secuencia lnea de aminocidos que
determina su estructura primaria, secundaria y terciaria. De manera que los aminocidos
libres que hay en el citoplasma tienen que unirse para formar polipptidos y la secuencial
lineal de aminocidos de un polipptido depende de la secuencial lineal de los
ribonucletidos en el ARN que a su vez est determinada por la secuencial
lineal de bases nitrogenadas como el ADN.
Composicin de un nucletido: los nucletidos son molculas orgnicas
formadas por la unin covalente de un monosacrido de cinco carbonos
(pentosa), una base nitrogenada y un grupo fosfato. El nuclesido es la nica
parte del nucletido formado nicamente por la base nitrogenada y la pentosa.
Son monmeros de los cidos nucleicos (ARN y ADN) en los cuales forman
cadenas lineales de miles o millones de nucletidos, pero tambin realizan
tareas importantes como molculas libres (por ejemplo ATP o el GTP).
Secuencia de bases integradas (alineamiento de secuencias): (MSA por sus
siglas en ingls) es un alineamiento de tres o ms secuencias biolgicas.
Generalmente protenas, ARN o ADN. En general, se asume que el conjunto de
secuencias de consulta que se ingresa como entrada (conjunto problema)
tienen una relacin evolutiva por la cual comparten un linaje y descienden de
un ancestro comn.
Del MSA resultante, se puede inferir la homologa, y puede llevarse a cabo el
anlisis filogentico para evaluar los orgenes evolutivos compartidos por las
secuencias.