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INTRODUCCIN
La tecnologa de la fermentacin se utiliza extensamente para la produccin de
varios compuestos econmicamente importantes que tienen aplicaciones en la
produccin de energa, la industria farmacutica, qumica y de alimento.
Aunque, los procesos de fermentacin se utilizan a partir de generaciones, la
necesidad de una produccin sostenible de productos, satisfacer las
necesidades del mercado de una manera rentable ha planteado una demanda
desafiante. Para cualquier producto a base de fermentacin, lo ms importante
es la disponibilidad de un producto fermentado igual al de la demanda del
mercado. Se ha informado que varios microorganismos producen una serie de
metabolitos primarios y secundarios, pero en una cantidad muy baja. Con el fin
de satisfacer la demanda del mercado, se han descubierto varias tcnicas de
alto rendimiento en el pasado, y se han implementado con xito en diversos
procesos, como la produccin de metabolitos primarios o secundarios,
biotransformacin, extraccin de petrleo, etc. (Dubey et al., 2008, 2011; Singh
et al., 2009, Rajeswari et al., 2014).
La optimizacin media sigue siendo uno de los fenmenos ms investigados
crticamente que se lleva a cabo antes de cualquier produccin de metabolitos
a gran escala, y poseen muchos desafos tambin. Antes de 1970, la
optimizacin de los medios se llev a cabo mediante el uso de mtodos
clsicos, que eran costosos, mucho tiempo, con un montn de experimentos
con una precisin comprometida. Sin embargo, con la llegada de tcnicas
matemticas / estadsticas modernas, la optimizacin de los medios se ha
vuelto ms vibrante, eficaz, eficiente, econmica y robusta en dar los
resultados. Para disear un medio de produccin, las condiciones de
fermentacin ms adecuadas (por ejemplo, pH, temperatura, velocidad de
agitacin, etc.) y los componentes de medio apropiados (por ejemplo, carbono,
nitrgeno, etc.) deben identificarse y optimizarse en consecuencia. Adems, al
optimizar los parmetros citados anteriormente, se podra conseguir la mxima
concentracin de producto (Gupte y Kulkarni, 2003, y Franco-Lara et al., 2006,
Wang et al., 2011). La representacin esquemtica de un enfoque sistemtico
del diseo del medio de fermentacin se ha dado en la Figura 1. Un aumento
en la productividad reduce el costo total del producto, as como el costo de
produccin; Por lo tanto, es uno de los temas importantes para la investigacin.
Por lo general, se puede lograr una productividad mejorada mediante la mejora
de la deformacin o optimizando los parmetros del proceso. Pero, la mejora de
la tensin y la optimizacin son "Catch-22" situacin. Usted no puede elegir
una tensin de plomo hasta que tenga el mejor medio y no se puede proponer
un medio ms fino hasta que tenga la tensin de plomo. Por lo general, los
investigadores de todo el mundo solucionan este problema al adherirse a un
componente a la vez. Sin embargo, ambas estrategias no pueden garantizar
que una de la cepa preferida si se utiliza otro medio. Con este inconveniente y
la situacin de Catch-22, se han sugerido e investigado varios mtodos nuevos,
en los que tanto el diseo del medio como la mejora de la deformacin se
pueden llevar a cabo simultneamente.
En esta revisin hemos restringido nuestro alcance y discutido sobre la
formulacin de medios y tcnicas de optimizacin de medios en trminos de su
utilidad, aplicacin y viabilidad para maximizar el rendimiento de metabolitos
producido por el proceso de fermentacin. Con el fin de proporcionar claridad y
mejor comprensin para los lectores, inicialmente hemos discutido los papeles
de varios componentes (principales) de los medios de fermentacin, seguido
de una descripcin detallada de tcnicas de optimizacin estadstica /
matemtica.
Tambin se han discutido en detalle las ventajas y desventajas asociadas con
los mtodos anteriores junto con las direcciones futuras en el diseo y
optimizacin de medios de fermentacin.
Fuente de carbono
El carbono es el componente medio ms importante, ya que es una fuente de
energa para los microorganismos y juega un papel importante en el
crecimiento as como en la produccin de metabolito primario y secundario. La
velocidad a la que se metaboliza la fuente de carbono puede influir a menudo
en la formacin de biomasa y / o en la produccin de metabolitos primarios o
secundarios. Marwick et al. (1999), mientras que el estudio de la produccin de
antibiticos de bacterias marinas observ que las fuentes de carbono
asimilando gradualmente, como la galactosa en general, aumenta la
produccin de metabolitos secundarios (antibiticos). Un ejemplo clsico de
esto es la produccin de penicilina, donde se encuentra que la glucosa tiene
efecto de represin. Posteriormente, se encontr que la lactosa es una fuente
de carbono lentamente asimilante y ayud en la produccin de metabolitos
secundarios (es decir, penicilina). Por lo tanto, con el fin de superar el
fenmeno de represin catabolita de carbono, el proceso de produccin se
estableci mediante la fermentacin de lactosa. Describiendo el papel de cada
carbono en diferentes procesos de fermentacin, aumentar la longitud de este
manuscrito. Por lo tanto, compilamos una lista, en la que resumimos algunas
fuentes de carbono interferentes y no interferentes (Tabla 1).
Los procesos de fermentacin, donde las materias primas / componentes
medianos cubren la parte significativa del costo del producto, la seleccin de
estas cosas se convierte en una tarea importante para las empresas de
produccin. Adems de la tasa de asimilacin de fuentes de carbono, la
naturaleza de la fuente de carbono tambin afecta al tipo y cantidad del
producto. Un ejemplo de esto es el etanol o la produccin de protenas de una
sola clula, donde las materias primas contribuyen ~60-77% del costo de
produccin; Y el precio de venta del producto se determina en gran medida por
el costo de la fuente de carbono. El metanol podra ser una fuente muy barata
de carbono barato para la produccin de protenas de una sola clula, pero
siendo txico para las clulas, incluso a bajas concentraciones y puntos de
inflamacin bajos, nunca se puede utilizar en la fermentacin como medio. Por
lo tanto, no slo el coste, ni siquiera la dinmica de la fuente de carbono debe
ser considerado si desempea un papel como un sustrato en el proceso de
fermentacin o no.
Fuente de Nitrgeno
Al igual que el carbono, la seleccin de la fuente de nitrgeno y su
concentracin en los medios tambin juegan un papel crucial en la produccin
de metabolitos. El microorganismo puede utilizar tanto fuentes inorgnicas
como orgnicas de nitrgeno. El uso de aminocidos especficos puede
aumentar la productividad en algunos casos y, inversamente, los aminocidos
inadecuados pueden inhibir la sntesis de metabolitos secundarios (Marwick et
al., 1999). Singh et al. (2009) durante la optimizacin de la produccin de
actinomicina V por Streptomyces triostinicus encontr que la biosntesis de la
actinomicina V implica la ruta del triptfano y la adicin del aminocido
triptfano al medio mejora la produccin. Por el contrario, el mismo aminocido
mostr efecto inhibidor en la produccin de candicidina de Streptomyces
griseus (Snchez y Demain, 2002). Sin embargo, se confirma que las molculas
de nitrgeno tienen efecto inhibitorio sobre la produccin de metabolitos en
algunos casos, mientras que tambin se han reportado algunos efectos
potenciadores del nitrgeno (Tabla 2).
Fosfato
El fosfato es otro componente bsico que se requiere para la produccin de
fosfolpidos presentes en las membranas celulares microbianas y para la
produccin de cidos nucleicos. La cantidad de fosfato que debe a~nadirse en
el medio de fermentacin depende de la composicin del caldo y de la
necesidad del organismo, as como segn la naturaleza del producto deseado.
Por ejemplo, algunos cultivos no producen metabolitos secundarios en
presencia de fosfato, por ejemplo, fosfatasa, fitasas, etc. Snchez y Demain
(2002) informaron que la produccin de diversos metabolitos secundarios,
como actinorhodina, cefalosporina, cido clavulnico, estreptomicina,
tetraciclina, Vancomicina, etc. est altamente influenciado por la concentracin
inorgnica de fosfato presente en el medio de produccin. En la mayora de los
casos, se requiere una menor concentracin de fosfato para el inicio de la
produccin de metabolitos (antibiticos) y ms all de una cierta concentracin
suprime el metabolismo secundario y en ltima instancia inhibe la produccin
de metabolito primario o secundario. Se inform que la concentracin alta de
fosfato inhibe la produccin de teicoplanina, un antibitico glicopptido (Rokem
et al., 2007). De la descripcin anterior est claro que los cambios en las
fuentes de carbono o nitrgeno del medio de produccin o la variacin de su
concentracin ptima requerida pueden afectar a la naturaleza del producto
final o a su productividad. Por lo tanto, se requiere el medio de produccin con
todos los componentes requeridos en una concentracin apropiada para la
produccin del metabolito deseado a gran escala. Con el fin de estandarizar el
medio de produccin, ha surgido el concepto de optimizacin del medio.
Experimentos de suplementacin
Los experimentos de suplementacin se realizan generalmente para evaluar
los efectos de varios suplementos de carbono y nitrgeno sobre la produccin
de metabolitos. Durante el estudio de la produccin de antifngicos de
Streptomyces violaceusniger, se observ una mejora del 70-90% en el
rendimiento suplementando xilosa, sorbitol e hidroxil prolina en el medio de
produccin (Tripathi et al., 2004). De forma similar, se encontr glicerol y
peptona como las fuentes de carbono y nitrgeno ms adecuadas para la
produccin de metabolitos antimicticos y antibacterianos de Streptomyces
rimosus bajo condiciones de fermentacin sumergida (Singh y Rai, 2012).
Experimentos de reemplazo
Para la formulacin media, las fuentes de carbono / nitrgeno que muestran un
efecto potenciador sobre la produccin de metabolitos deseada en
experimentos de suplementacin se intentan generalmente ser utilizadas como
una fuente de carbono / nitrgeno completa.
Parmetros fsicos
Adems de las variables qumicas y biolgicas, varios investigadores utilizaron
experimentos de OFAT para estandarizar los parmetros fsicos como el pH, la
temperatura, la agitacin y los requisitos de aireacin del proceso de
fermentacin (Niwas et al., 2013).
Como cualquier otra tcnica, el mtodo OFAT de optimizacin del medio tiene
sus propias ventajas y desventajas. La principal ventaja de la OFAT es su
simplicidad mediante la cual se puede llevar a cabo una serie de experimentos
y los resultados pueden analizarse utilizando grficos sencillos sin la ayuda de
programas estadsticos de alto nivel. El principal inconveniente de la OFAT es la
dificultad de estimar las "interacciones" de los experimentos, ya que es una
secuencia de dispersin de los experimentos (Gupte y Kulkarni, 2003). Vaidya
et al. (2003) describieron el tiempo consumido y el costo involucrado en el
anlisis de un gran nmero de variables como las principales desventajas de
las tcnicas de la OFAT. En esta metodologa, a veces el punto ptimo puede
perderse completamente, por lo que se requiere un gran nmero de
experimentos para determinar el nivel ptimo, que se vuelve laborioso,
consume tiempo y no es econmico la mayor parte del tiempo (Gupte y
Kulkarni, 2003). Sin embargo, la tcnica OFAT puede ser una mejor herramienta
de deteccin cuando no se conoce nada sobre los medios de comunicacin por
su facilidad y conveniencia.
Diseo de experimentos
El uso del mtodo estadstico, es decir, el diseo de experimentos (DOE) para
la optimizacin de los medios en el proceso de fermentacin puede superar las
limitaciones del mtodo OFAT clsico y puede ser una herramienta poderosa
para la optimizacin de la produccin de metabolitos. Fisher (1992) propuso
una teora bsica del diseo experimental que muestra que el cambio de ms
de un componente en el medio a la vez puede ser ms eficiente que cambiar
slo un factor a la vez (Fisher, 1992).
DOE es una serie de experimentos que se planifican y ejecutan
estratgicamente para obtener una mayor cantidad de informacin sobre el
efecto de ms de un parmetro a la vez sobre la salida, es decir, el rendimiento
del producto. La mayora de los procedimientos del DOE permiten la seleccin
preliminar de 2-10 factores medianos en un nmero limitado de experimentos.
En este mtodo, varios factores o componentes medianos se comparan
simultneamente y los efectos se observan y clasifican en funcin de los
resultados. Una vez que se determinan y clasifican las variables de respuesta,
se generan parmetros estadsticos de rendimiento a partir del anlisis
subsiguiente. Debido a la necesidad de un mayor nmero de experimentos, la
OFAT es un proceso laborioso, demorado y extremadamente tedioso para un
gran nmero de variables, mientras que el DOE requiere menos experimentos,
menos tiempo y menos material para obtener la misma cantidad de
informacin (Adinarayana y Ellaiah, 2002, Keskin Gndogdu et al., 2016). La
interaccin entre los factores puede ser estimada sistemticamente en DOE
(Haaland, 1989). Despus de obtener la idea bsica sobre el proceso de
produccin de la fermentacin a partir de la literatura o de los experimentos
clsicos, el diseo de los experimentos son ms efectivos para determinar el
impacto de dos o ms factores en una respuesta que la OFAT.
Diseo experimental
El diseo experimental es un plan de estudio para obtener metas u objetivos
definidos. Las tcnicas estadsticas modernas nos proporcionan herramientas
poderosas para la evaluacin de los componentes o variables de efectos
basados en los resultados experimentales. Por lo tanto, los experimentos deben
planearse adecuadamente con el tamao de muestra suficiente para obtener
los datos adecuados que son esenciales para responder al objetivo de la
manera ms eficiente posible. Tales tipos de tcnicas se llaman comnmente
como DOE. En un diseo factorial completo, se ensayan todas las
combinaciones de los factores, por ejemplo, pH, cepa, componentes del medio,
temperatura, etc. Por el contrario, en un anlisis factorial parcial, slo pocas
combinaciones bien informadas son recogidas y probadas. Por lo general, se
realiza un anlisis factorial parcial, cuando no es posible el diseo factorial
completo y se dispone de algunos o pocos conocimientos sobre las
interacciones de los componentes del medio para una cepa particular.
Diseo Taguchi
Con el fin de superar los problemas asociados con el mtodo PBD, el Dr.
Genichi Taguchi desarroll un mtodo que se basa en "ORTHOGONAL ARRAY".
Este mtodo nos dice cmo diferentes parmetros afectan el rendimiento en un
pequeo nmero de experimentos en lugar de probar todo lo posible
Combinaciones, como, el diseo factorial. La tcnica de Taguchi ofrece tres
etapas de caractersticas de control de calidad fuera de lnea, como la
estrategia del sistema, el diseo de parmetros y la fase de diseo de
tolerancia (Pignatiello, 1988). La estrategia del sistema ayuda a encontrar los
niveles experimentales de las caractersticas de diseo, mientras que el diseo
de parmetros muestra el nivel del factor y proporciona los efectos
primordiales del proceso, mientras que la fase de diseo de la tolerancia
mejora la tolerancia elemental que afecta considerablemente la formacin del
producto (Muhammad et al. ). Este diseo ayuda a determinar los factores que
afectan al producto significativamente con un nmero mnimo de
experimentos, ahorrando as tiempo y recursos. El anlisis de varianza (ANOVA)
sobre los datos recolectados del DOE de Taguchi puede utilizarse para
seleccionar los nuevos valores de los parmetros para optimizar la
caracterstica de rendimiento. Durante la ejecucin del experimento, en primer
lugar se selecciona el grado total de libertad [la media general siempre usa 1
grado de libertad (DOF); Para cada factor DOF = n - 1, donde n = nmero de
niveles; Para cualquier interaccin de dos factores DOF = (na- 1) (nb - 1)]
seguida de la seleccin de la matriz ortogonal estndar (generalmente, el
nmero de ejecuciones en el diseo ortogonal es al DOF). Al final del
experimento, los factores se asignan a las columnas apropiadas. A diferencia
de PBD, analiza el efecto principal y las interacciones de dos factores. Sin
embargo, las interacciones de orden superior se asumen como despreciables.
El ruido, es decir, las variables no controladas de los experimentos se toma
como punto focal para el anlisis.
Las variables no controladas (ruidos) generalmente causan la prdida de la
calidad. Este efecto del ruido puede eliminarse empleando la metodologa de
Taguchi (Aggarwal y Singh, 2005). El mtodo de Taguchi resulta muy til para
medir la calidad mediante la desviacin de una caracterstica funcional de su
valor objetivo. El enfoque de Taguchi es un mtodo completamente
desarrollado que tiene la ventaja de ahorrar tiempo experimental, costo del
producto y mejorar la calidad, lo cual es un requisito bsico para la
optimizacin de cualquier proceso de fermentacin (Chanin et al., 1990).
Recientemente, Muhammad et al. (2014) aplicaron el enfoque estadstico de
Taguchi en el primer paso para optimizar la produccin de un nuevo compuesto
antibacteriano polipptido termoestable de Geobacillus pallidus en diferentes
condiciones de produccin tales como el perodo de incubacin, la
temperatura, el pH, la tasa de aireacin, el nitrgeno y las concentraciones de
carbono.
Nelder-Mead simplex
El mtodo simplex de Nelder Mead (NM) es otra tcnica estadstica, que se ha
demostrado til para reducir los gastos de las optimizaciones clsicas y da
resultados satisfactorios. El mtodo NM simplex se basa en un mtodo de
optimizacin de cuadro negro de parmetro real y funciona bien con funciones
objetivas irregulares. El "trmino" simplex denota una figura de lados regulares
en la dimensin n + 1. Para dos dimensiones, el simplex debe ser un tringulo
equiangular y para tres dimensiones, debe ser un tetraedro. NM mtodo
simplex para la funcin de n parmetros compara la funcin objetivo en los n +
1 vrtices de un simplex y da el peor vrtice a travs de la bsqueda de
simplificacin por pasos (Kennedy y Krouse, 1999). Durante este proceso, la
direccin del mejoramiento se logra desplazando los resultados del punto ms
alto con el valor ms pequeo. Durante el proceso de optimizacin para
maximizar la produccin de lpidos, se utilizaron regresiones lineales completas
y mltiples para ajustar los polinomios a los datos obtenidos (Kennedy y
Krouse, 1999).
El mtodo NM simplex a menudo da mejoras significativas en la iteracin
primaria y produce resultados rpidos y satisfactorios. Esta tcnica tambin se
puede utilizar con xito en combinacin con ANN para optimizar la produccin
de diversos metabolitos. En general, una mejora en el valor de la funcin es
ms prctica que optimizacin completa (Singer y Nelder, 2009). La estimacin
de los parmetros del proceso y los controles del proceso son algunos de los
problemas prcticos, donde los valores de la funcin son inciertos. Por lo tanto,
no es necesario un alto nivel de precisin en la solucin, y puede ser imposible
de calcular. La produccin de actinomicina D de Streptomyces sindenensis bajo
condiciones de fermentacin sumergidas es uno de los mejores ejemplos,
donde se ha utilizado la combinacin anterior (Tripathi et al., 2012). Ellos
compararon los resultados de la combinacin de ANN-GA con la optimizacin
de ANN-Nelder-Mead downhill simplex (NMDS) e informaron que ms tarde fue
ms eficaz y dio un rendimiento aproximadamente 12% superior al rendimiento
obtenido por ANN junto con GA en las mismas condiciones. Las condiciones
ptimas de frasco de agitacin se optimizaron an ms a nivel de biorreactor
(Khan y Tripathi, 2011). Utilizaron GA y NMDS por separado para optimizar los
parmetros de fermentacin, como el caudal de aire y la velocidad de agitacin
del biorreactor para una mxima produccin de actinomicina D. La GA y la
NMDS predijeron una combinacin ptima de parmetros de fermentacin casi
similar. Casi la produccin de 1,5 veces de actinomicina D se increment en
comparacin con el punto ptimo en un experimento de frasco de agitacin
(1,26 a ~ 2 g / L).
CONCLUSIONES
La optimizacin de los medios de fermentacin es un paso esencial para la
produccin de metabolitos antes de comenzar con planes de produccin semi-
piloto / piloto. En esta revisin crtica, se han revisado y discutido las tcnicas
de optimizacin convencionales y avanzadas utilizadas en el proceso de
optimizacin del medio. Se encontr que los enfoques estadsticos tenan el
potencial de ahorrar tiempo experimental para el desarrollo del proceso y la
mejora de la calidad. Adems, las tcnicas de optimizacin ayudan a reducir el
costo total del producto. Los diseos y mtodos discutidos en esta revisin se
han analizado en base a la eficiencia, simplicidad y consumo de tiempo, y sus
aplicaciones se han sugerido en consecuencia. Sin embargo, el medio
formulado despus de emplear varios diseos todava necesita una evaluacin
adicional bajo condiciones de produccin realistas y, finalmente, con modelos a
escala completa que reflejan el entorno de produccin. En general, esta
revisin proporciona una justificacin para la seleccin de la tcnica
actualizada adecuada para la optimizacin de los medios empleados durante el
proceso de fermentacin de la produccin de metabolitos. Tambin, en los
ltimos aos, se ha ensayado y aplicado un nuevo enfoque del modo integrado
de cultivo de microbios, es decir, la fermentacin aerobia y anaerbica usando
microbios facultativos adecuados. Cheng et al. (2014) ha aplicado este enfoque
integrado para la produccin de xilitol y etanol utilizando Candida tropicalis, e
inform que en condiciones aerobias el xilitol es el producto final que acta
como sustrato para la produccin de etanol mediante cultivo anaerobio. Del
mismo modo, Huang et al. (2014) sugirieron que el cambio de condiciones
anaerbicas / aerbicas durante la etapa de cultivo afecta la composicin de la
comunidad bacteriana y la posterior degradacin de los clorofenoles en las
clulas de combustible microbiano bioctodo. Este enfoque integrado tiene
varias ventajas, por ejemplo, sin necesidad de unidad de operacin
suplementaria, cero generacin de aguas residuales, procesamiento en
material slido pretratado, y tampoco necesidad de esterilizacin; Todas estas
ventajas pueden ayudar a que la industria biotecnolgica sea ms econmica y
respetuosa con el medio ambiente.