Professional Documents
Culture Documents
DarvinovaCrnaKutija PDF
DarvinovaCrnaKutija PDF
copyright za Srbiju:
EDEN
EDEN d.o.o. Sremska Kamenica
DARVINOVA CRNA KUTIJA
biohemijski izazov teoriji evolucije
Prevod:
dr Majkl Bihi
1000
ISBN 978-86-85197-16-1
Sadraj
Predgovor 7
Prvi deo: Kutija je otvorena
1. Liliputanska biologija 13
2. Zavrtnji i navrtnji 37
Drugi deo: e
3. Veslaj, veslaj 65
4. Rubi Goldberg u krvi 90
5. Odavde do tamo 117
6. Opasni svet 137
7. Smrt na drumu 162
e?
8. Objavljuj ili nestani 189
9. Inteligentni dizajn 214
10. Pitanja o dizajnu 238
11. 2
Dodatak: 4
Beleke 309
7 8
Predgovor
/
-
menili jednu od 146 aminokiselina u jednoj od desetina hiljada
Mraz nije imao vremena da ga izvadi iz kutije i sastavi pre nego to
je krenuo dalje. Zadatak je ostao tati. Izvadio sam delove iz kutije,
-
otvorio uputstvo za sastavljanje, i uzdahnuo. Sastojalo se od est
-
-
uticaju biohemije na teoriju evolucije u potpunosti oslanja na de-
brzinu kao dnevne novine sutina i jeste u detaljima. Ipak sam talje. Prema tome, moram da napiem knjigu kakvu ljudi ne vole
-
stvo zahtevalo.
Moja odbojnost prema uputstvima je, izgleda, rairena. Iako osnove i prikazuje se zato se o evoluciji sada mora raspravljati na
molekularnom nivou u domenu biohemije. Ovaj deo uglavnom
-
poznatim, svakodnevnim predmetima kako bih preneo svoje ideje,
Detaljno objasnite mehanizam hidrolize peptidne veze tripsinom,
ksta znakom
-
-
hemije, sastavio sam dodatak koji iznosi neke opte biohemijske
programirate video-rekorder.
uvodni tekst iz biohemije u nekoj biblioteci.
9 10
Prvi deo
Kutija je otvorena
-
. poglavlje
Liliputanska biologija -
neke grupe prolaze bolje na testu inteligencije od drugih, i zato
-
K
odabira.
-
Skoro vek i po nakon to je Darvin izneo svoju teoriju, evolucio-
-
na biologija je, navodno, imala puno uspeha u objanjavanju obra-
tkiva, koji katalizuju hemijske reakcije varenja, fotosinteze, imu-
-
niteta, i jo puno toga.1
~
-
nja. Kada se udari na temelje, zgrade se zatresu; ponekad se srue.
- Ubrzo nakon 1950. godine nauka je napredovala do te mere
da je mogla da utvrdi oblike i osobine nekolicinu molekula koji
teoriji evolucije putem prirodnog odabiranja? -
Kao i mnoge velike ideje, Darvinova ideja je elegantno jedno-
-
stavna. On je zapazio da unutar svih vrsta postoji variranje: neki
novan na mainama-
-
-
menile; tokom velikih vremenskih perioda mogle bi se javiti ve-
like promene.
*
13 14
>
-
kada se jedna otvori, otkrije se druga.
teoriju evolucije? Poto javni mediji vole da objavljuju uzbudljive
Crna kutija
-
videti, a ponekad zato to je jednostvano nerazumljiv. Kompjuteri
,
Zamislite da je kompjuter sa dugotrajnom baterijom prenesen
vala je pokuaj nauke da je objasni; molekularne maine posta-
hiljadu godina unazad kroz vreme do dvora kralja Artura. Kako bi
-
-
zapazio da se slova pojavljuju na ekranu kada se pritiska dugmad.
Neke kombinacije slova koja odgovaraju kompjuterskim koman-
sno prirodnim odabiranjem. Iako Darvinov mehanizam prirodna
dama mogle bi da promene sliku na ekranu; nakon nekog vreme-
iznenadio kad bi nauka o vrlo malom donela promenu pogleda na
neko uklonio poklopac i video unutranji mehanizam kompjutera.
svet jo manjeg.
Odjednom bi se teorija o tome kako kompjuter radi pokazala veo-
pogledu novu crnu kutiju.
s
U drevnim vremenima celokupna biologija je bila crna kutija,
Teko je zamisliti kako su drugi ljudi u druga vremena i na dru-
-
tehnologije. Bili su zaista u mraku.
-
2 Niz knjiga iz vremena oko 400 godi-
potraga za pouzdanim znanjem dug, naporan proces koji jo nije na pre nove ere (pripisanih Hipokratu, ocu medicine) opisuju
15 16
>
simptome nekih optih bolesti i pripisuju bolest ishrani i dru- krvi po otkucaju, pri 72 otkucaja u minutu, za jedan sat ispum-
-
nedostupne posmatranju bilo je potpuno novo; postavilo je pozor-
nicu za savremenu bioloku misao.
-
ku od skoro svih pre njega) da znanje o prirodi zahteva sistemat-
Brunfels, Bok (Bock), Fu (Fuchs) i Valerius Kord (Cordus) opisa-
je Konrad Gesner (Conrad Gesner), objavili su velike tomove celo-
-
stio u jedinstvenu grupu, a zmije u posebnu klasu. Iako njegova
hiljadama godina od njegove smrti.
-
odu od hiljadu godina nakon Aristotela. Jedan od njih je bio Ga-
len iz Rima, lekar iz drugog veka nove ere. Galenov rad pokazu-
-
- skoj skali. Tako je biologija dostigla plato: jedna crna kutija, krup-
gana. Iako je znao da srce pumpa krv, prostim posmatranjem nije na struktura organizma, otvorena je samo da bi se otkrila crna kuti-
tvrdio da je krv ispumpavana iz srca da bi navodnjavala tkiva, a
-
Tek je u 17. veku Englez Vilijam Harvi (William Harvey), izneo
17 18
>
-
formirala prvi grubi mikroskop. Galilej je koristio jedan od prvih -
- -
se evolucija odvija prirodnim odabiranjem koje deluje na varijaci-
i opisao rani razvoj srca embriona pileta. Nemija Gru (Nehemiah je bila je njegova.
vodeni cvet; Levenhuk (Leeuwenhoek) je bio prva osoba koja je
-
-
,
- se mogla otvoriti bez daljih tehnolokih poboljanja.
thodnoj generaciji, iako je trebalo daleko vie vremena da bi se
-
nove kutije zahtevaju da preispitamo sve nae teorije. U takvim
* - -
li Matijas lajden (Matthias Schleiden) i Teodor van (Theodor
Schwann). lajden je radio prvenstveno na biljnim tkivima; zastu-
e
- svetskog rata elektronski mikroskop je dobio veliku ulogu. Ot-
e-
-
-
-
e
dao: Prema tome, prvenstveno pitanje je: kakvo je poreklo ovog
ee od svih. Pitanje nije bilo ono na koje su
Darvinovih putovanja i njegovog Postanka vrsta. Za Darvina je, Darvin ili njegovi savremenici mogli da odgovore. Znali su da su
19 20
>
-
kim mikroskopom sastoje se i same od manjih komponenata. Koje
su to komponente? Kako izgledaju? Kako funkcioniu? Odgovo-
ri na ta pitanja vode nas van domena biologije, u oblast hemije.
zraci se rasipaju procesom zvanim difrakcija. Ako se fotografski
,
svakog
atoma u molekulu. Usmeravanje snopova X-zraka na protein, pri
-
-
Whler) je 1828. godine zagrejao amonijum-cijanat i bio zapa-
njen kad se formirala urea, bioloki otpadni proizvod. Sinteza uree ljudi imaju na desetine puta vie istrajnosti od nas ostalih.
-
-
(Ernst Hoppe-Seyler) kristalizovao je crveni materijal iz krvi (he-
moglobin) i pokazao da se vezuje za kiseonik kako bi ga prono-
sio telom. Emil Fier (Fischer) prikazao je veliku klasu supsta-
-
gradivnih blokova (zvanih aminokiseline) spojenih u lance.
Kako proteini izgledaju? Iako je Fier pokazao da su sastavljene
od aminokiselina, detalji njihovog izgleda bili su nepoznati. Nji-
-
kroskopa, ali je ipak postajalo jasno da su proteini bili osnovne
21 22
>
-
la do savremene biohemije, jedan po jedan sloj uklanjan je dok se
-
D
- Zamislite u svom dvoritu jedan metar irok jarak, koji se
nu-
klearna magnetna rezonanca vaeg komije. Ako jednog dana sretnete komiju u svom dvoritu
i upitate kako se tu naao, nemate razloga da sumnjate u odgovor:
odgovor, bili biste zadivljeni njegovim atletskim sposobnostima.
-
-
buva: -
tra udaljeni jedni od drugih; on je skakao sa jednog uzanog brda
W
mu da ne vidite nikakva brda, samo irok ponor koji razdvaja vaa
i tako u beskraj.
i godine kako bi stigao. Tokom tog vremena brda su se povremeno
Svift je pogreio; sled se ne nastavlja zauvek. Krajem 20. veka izdizala u ponoru, i on je napredovao kako su ona izbijala. Nakon
-
pobijete, temu razgovora menjate na fudbal.
e skok se
kleinskim kiselinama rasvetlio je principe koji deluju na os-
23 24
>
verovatnijim ako se objasne kao niz manjih skokova, a ne kao je- o brdima koja nestaju, mogu li da postoje neuhvatljivi i slabo
veoma je teko dokazati da li je neko u pravu ili grei ako tvrdi da
Sa napretkom savremene biohemije sada smo u stanju da sa-
su potpore za prelazak postojale u prolosti, ali su nestale.
Naravno, alegorija skokova preko uskih jaraka nasuprot kanjo- li navodni mali koraci, neophodni za nastanak velikih evolucionih
evolucija je prizvana da ob- -
jasni sitne promene u organizmima kao i one ogromne. Njima se
mikroevolucija opisuje
promene koje se mogu izvriti u jednom ili nekoliko malih kora- kroskopskom nivou. Kao i fraktalni obrazac u matematici, gde se
ka, dok makroevolucija opisuje promene koje, izgleda, zahtevaju motiv ponavlja u sve manjoj i manjoj razmeri, nepremostivi pono-
velike skokove.
-
E
- Biohemija je rastegla Darvinovu teoriju do krajnjih granica. To
-
organskih struktura je ta koja je navela na pitanje: kako je sve
godina.3 Ranije je pokazano da se broj tamnih nasuprot svetlim le-
skog sistema. Objanjenje porekla funkcije mora da prati tempo
rnu Ameriku razdvojile su se u nekoliko posebnih grupa. Poslednjih
- funkcije, vida, napredovalo od 19. veka, a zatim razmotrimo kako
-
terije vratile su se kao sojevi otporni na antibiotike. Mogu se nave-
sti i mnogi drugi primeri.
U malim razmerama, Darvinova teorija je trijumfovala; sada
-
va teorija izaziva sumnju. Mnogi ljudi su sledili Darvina u tvr-
povrine kako bi ispravilo hromatsku aberaciju (odstupanje). Ove
-
25 26
>
27 28
>
sveta da je savremeno oko postepeno evoluiralo od jednostavnije menja njegovo ponaanje. Sada se, pod imenom metarodopsin II,
-
odgovorio na pitanje kako je nastala ta relativno jednostavna mrlja
osetljiva na svetlost. Naprotiv, Darvin je odbacio pitanje prvobi- zvani GDP. Ali kada transducin reaguje sa metarodopsinom II, GDP
se odvaja, a molekul zvan GTP vezuje se za transducin. (GTP je bli-
4
^
potpunosti van domena nauke 19. veka. Na pitanje kako oko radi
- W&
nostavno se nije moglo odgovoriti u to vreme. U stvari, ni na je- d
infekcijama? Niko nije znao.
s
Za Darvina je vid bio crna kutija, ali nakon nakupljenog napo-
-
,
sutine.
molekulom zvanim 11-cis-retinal, koji se za nekoliko pikoseku-
Promena oblika molekula retinala izaziva promenu u obliku protei-
29 30
>
Kompleks GTP-transducin-metarodopsin II vezuje se sada za Jo jedan membranski protein koji vezuje cGMP naziva se jon-
protein zvani fosfodiesteraza, koji se nalazi na unutranjoj mem- ski kanal. On deluje kao kapija koja regulie broj jona natrijuma u
dok ih drugi protein, poput pumpe, aktivno ponovo izbacuje. Dvo-
zvan cGMP (hemikaliju srodnu i GDP-u i GTP-u). Prvobitno se u
-
vode u kadi.
^
ZZ<
'dW mozgu, vidjenje.
Kada bi gore spomenute reakcije bile jedine koje se odigravaju
-
liko mehanizama. Prvo, u mraku jonski kanal (pored jona natriju-
smanjuje. Dejstvo enzima fosfodiesteraze, koji razara cGMP, uspo-
-
-
kinaza hemijski menja metarodopsin II. Promenjeni rodopsin se
-
Trans-retinal odvaja se na kraju od rodopsina i mora da se
-
W D W European Journal of Bio- varilo, trans-retinal se prvo enzimom hemijski menja u trans-reti-
chemistry
31 32
>
prethodno dodate atome vodonika kako bi se formirao 11-cis-re- ili da fenomeni velikih razmera kao to je populaciona genetika
tinal, i ciklus je potpun.
Gore izneto objanjenje predstavlja samo povran pregled bio-
hemije vida. Ipak, to je krajnji nivo objanjenja kome bioloka nau-
krajno mali svet koji stoji otkriven mora se objasniti.
ka mora da stremi. Kako bi se zaista razumela funkcija, mora se do
-
ci u biolokim procesima u osnovi se odigravaju na molekularnom
<
- -
larno objanjenje.
Sada kada je crna kutija vida otvorena, evolucionom objanjenju
u kutiju sa svojim plianim tigrom, Hobsom, i putuje unazad kroz
te sposobnosti vie nije dovoljno da uzima u obzir samo anatom-
-
(i kako zastupnici evolucije nastavljaju danas). Svaki od anatom-
skih koraka i struktura, za koje je Darvin mislio da su jednosta-
mu drago), jer Kalvin ne zna kako avioni lete.
kao maliani poput Kalvina. Na primer, pre vie vekova smatralo
razdaljine za koje je potreban helikopter kako bi se prele odje-
dnom.
^
Anatomija je, jednostavno, nebitna za pitanje da li se evolucija
<,
mogla odigrati na molekularnom nivou. Kao i fosilni zapis. Vie
nije bitno da li postoje velike praznine u fosilnom zapisu ili da li Kalvin i Hobs Bill Watterson
-
-
-
nala sa rodopsinom, transudicom, i fosfodiesterazom mogle da se
-
>s/EE,K^th
W^
33 34
>
- -
je, prim. red.), a teorija je nazvana neodarvinizam. Neodarvinizam
kla do granica van kojih nauka nije mogla da registruje ta se stva- predstavlja osnovu savremene evolucione misli.
Jedna grana nauke nije bila pozvana na skupove, iz valjanog ra-
-
-
-
kroskopi 18. i 19. veka su pokazali da su tu rasle veoma male, na-
se mora ponovo razmotriti u svetlu napretka biohemije. Sve
stavne. Jedan od glavnih zastupnika teorije spontane generacije
tokom sredine 19. veka je bio Ernest Hekel (Ernst Haeckel), koji
je veoma cenio Darvina i svesrdno zastupao Darvinovu teoriju. Sa
kombinacije ugljenikaovih jedinjenja.7 Zbog toga je Hekelu iz-
znamo bolje.
vna. Vreme je pokazalo da su pogreili.
-
uporedna anatomija, embriologija i druge oblasti razvile su sop-
-
-
disciplinarnih skupova kako bi uklopili svoja gledita u doslednu
35 36
(Niles Eldredge) opisuje problem:2
. poglavlje
E/
Zavrtnji i navrtnji D
h
Lin Margulis (Lynn Margulis) je istaknuti profesor biologije W
-
kao manju 20-ovekovnu religioznu sektu unutar rairenog reli- 3 Teorija postulira dve stvari: da tokom
gioznog uverenja anglo-saksonske biologije.1 Na jednom od svo-
jih mnogih javnih govora ona poziva molekularne biologe u publi- promenama; a da je, kada se odigra, promena brza i koncentrisana
ci da navedu jedan nedvosmislen primer formiranja novih vrsta u malim, izolovanim populacijama. Ako se to desilo, onda bi bilo
nagomilavanjem mutacija. Njen izazov ostaje bez odgovora. Zastu-
ali smatraju da je potreban drugi mehanizam umesto prirodnog
odabiranja za objanjenje brzih promena velikih razmera.
-
-
kom prolih 130 godina darvinizam, iako bezbedno ukopan, nai-
stenama navodno starijim od oko 600 miliona godina. A onda se
Nedavno je procenjeno vreme, tokom koga se odigrala ova eksplo-
Goldmit je mislio da bi velike promene mogle vremenom da se
se izlegla ptica.
37 38
nja.4 klos) postavlja pitanje u pogledu korisnosti darvinizma:
ah
mislili da je Zemlja stara samo oko sto miliona godina, pa ipak,
Darvin je smatrao da prirodno odabiranje zahteva daleko vie vre-
,
-
D
veka.
-
forniji razmilja o tome kako nastaju korisne mutacije:
-
/
olozi Mej-Van Ho (Mae-Wan Ho) i Piter Sanders (Peter Saunders)
<
^
s
W
materija i energija.10
-
McDonald) napominje zagonetku:
Z 11 Na skupu je jedna strana bila
Izgleda da oni da nije bilo dovoljno vremena za broj mutacija potreban za evo-
luciju oka, biolozi su rekli da mora da su njegove cifre pogrene.
[geni]-
to je jedan rekao:
populacija.E
39 40
41 42
43 44
45 46
47 48
<
- Dokins i Darvin nas pozivaju da verujemo kako se evolucija oka
kaut), ne proputa priliku: -
Z
a
cis-retinal i rodopsin. Dokins ih ne spominje. I odakle je mali pe-
^
,
-
-
WD
-
K
D
-
ture predstavljaju mutacije od jednog koraka? Dokins nam nije
D
rekao kako je naizgled jednostavan pehar nastao. Iako nas uve-
rava da bi bilo kakav providan materijal bio poboljanje (setite
-
-
,-
lucije oka:
E
D
d
-
<
-
sani sistem za jedan sistem, i s pravom Dokins ukazuje na odvoji-
<
49 50
diti sa odgovorom na pitanje Kako se stereo sistem proizvodi? morao bi da se pojavi kao integrisana jedinica odjednom, kako bi
-
E
nae uverenje da je ispunjen Darvinov kriterijum neuspeha, strmo-
Darvin je znao da je njegova teorija postepene evolucije priro- glavo se penje do maksimuma koji nauka dozvoljava.
dnim odabiranjem nosila teko breme:
-
-
-
-
su pretpostavljali da je njegov kriterijum za neuspeh ispunjen. Ali,
kako da budemo sigurni? Koji tip biolokog sistema ne bi mogao
:
Pod (irreducibly complex) podrazume-
vam jedinstven sistem sastavljen od nekoliko dobro uklopljenih
Razlog tome nalazi se u prirodi mutacija.
uklanjanje bilo kog dela izaziva prestanak funkcije sistema. Neu-
U biohemiji, mutacija predstavlja promenu DNK. Da bi se nasle-
-
neprestanim poboljavanjem prvobitne funkcije, koja nastavlja da
nostvanija mutacija javlja se sa promenom jednog nukleotida
se odigrava istim mehanizmom) neznatnim, uzastopnim prome-
(nukleotidi su gradivni blokovi DNK) u drugi. Umesto toga, jedan
nama prethodnog sistema, jer je bilo koji prethodnik neumanji-
-
51 52
promena izgleda kao velika. Na primer, postoji dobro poznata mu-
tacija zvana antennapedia (kao to je buba) ili celog organa (kao to je oko) na molekularni
da donesemo sud o
noge koje mu izrastaju iz glave umesto antena. Iako nam to izgle- evoluciji jer su svi delovi mnogih molekularnih sistema poznati. U
vinske muice, samo na pogrenom mestu. doneti presudu.
-
rak po korak. Mutacija je promena u jednom od niza uputstava. u naoj raspravi
-
-
-
cimo, dobijemo uputstvo za nastanak faksimil aparat umesto radija.
-
Ako se vratimo na bubu bombardera i ljudsko oko, pitanje je da li
se brojne anatomske promene mogu objasniti velikim brojem ma- miolovkom.
lih mutacija. Odgovor koji daju evolucionisti je: -
Funkcija miolovke je da uhvati mia kako ne bi mogao da vri
cenimo
-
-
razmiljanje o mutacijama koje su mogle da ih proizvedu tre-
-
kada je zamka nategnuta; (4) osetljiva kukica koja se aktivira pri
delovanju i najmanjeg pritiska, i (5) metalna poluga koja povezu-
uzaludne, rekli bi evolucionisti, jer nisu poznate sve komponente.
da odgovore na mnoga pitanja koja su ih zanimala. tavie, to to
je: upitati da li su svi pomenuti delovi neophodni za funkciju. U
53 54
onesposobi mia. Pri drugim prilikama neki ljudi su koristili lep-
-
jedan od gore navedenih delova. Koji bi deo mogao da nedostaje,
- (prethodnici) standardne miolovke, poto se ne mogu preobra-
^
oprugom, kukicom i spojnom polugom.
<
Da pojasnimo stvar, razmotrimo niz: skejtbord, kolica, bicikl,
motocikl, automobil, avion, mlazni avion, svemirski brod. To izgleda
kao prirodna progresija, jer predstavlja listu objekta koji se mogu
-
-
thodnik motocikla? Ne. To je samo pojmovni prethodnik. Nije-
bicikl, stari motor za kosilicu, i neke rezervne delove i (uz neko-
liko sati napora) napravi motocikl koji radi. Ali to samo pokazu-
malim promenama bicikla.
Pokuajmo onda da evoluiramo bicikl u motocikl postepenim
nagomilavanjem mutacija. Pretpostavimo da je fabrika proizvo-
dila bicikle, ali da se povremeno javljala greka u proizvodnji. Pret-
postolje stajali bi oputeni i glodar ponovo ne bi bio ometen. Kada postavimo dalje da kada bi greka dovela do poboljanja u biciklu,
ne bi bilo kukice ili metalne spojne poluge, onda bi opruga povukla
fabrika bi izvrila zamenu opreme kako bi mutacija bila trajna od-
-
-
razlikovati prethodnika od konceptualnog (pojmovnog)
komponenata, i promena mora da pobolja funkciju bicikla. Prema
55 56
-
- ga prekratka, ne bi dosegla do kukice. Da je kukica prevelika, ne
- miolovke je neophodna, ali nije dovoljna, da bi proizvela funkcio-
nalnu miolovku.
Da li bismo uz te uslove mogli da evoluiramo bicikl u moto- Da bi bio kandidat za prirodno odabiranje, sistem mora da ima
sposobnost vrenja : sposobnost da se izvri za-
-
desnih materijala ne bi ispunila kriterijum minimalne funkcije, jer
biti od velike koristi. Kao ilustraciju, pretpostavimo da je prvi van-
,
kosilicu iz susedne fabrike u fabriku bicikla, motor bi morao da se
jer na primer, sagorevanje benzina u konzervi pored propelera ne
proizvodi bicikle jednostavno ne bi mogla da proizvede motocikl
prirodnim odabiranjem koje deluje na varijacije nastale broj- ne radi na nivou podesnom za svoju svrhu.
nim, uzastopnim, malim promenama i u stvari istorija nema
Funkcionalne odlike mogu biti nepodesne iz jednog od dva ra-
-
-
thodnike.
to bi se moglo ostvariti jednostavnijim sredstvima. Niko ne bi ko-
D
- -
motor, ta je sa sto? Ili hiljadu? Svejedno, minimalna funkcija je
bilo kakva naprava sa pet delova standardne -
57 58
- -
- lu od eksplozione komore predstavlja sistem sistema. Zbog toga,
-
-
predmeta relativno je direktna. Brzo smo pokazali da je miolovka
E
-
Biohemija je pokazala da bilo koji bioloki sistem koji zahteva tocikl nije nesvesno proizveden malim, uzastopnim poboljanjima
-
-
-
-
trenucima i pod promenljivim uslovima. Sinteza, razgradnja,
pokretljivost, regulacija, popravka, komunikacija sve te funkci-
Maine je relativno lako analizirati jer su i njihova funkcija i svi
- njihovi delovi, svaki navrtanj i zavrtanj, poznati i mogu se nave-
sti. Onda je lako videti da li je bilo koji dati deo potreban za funk-
ciju sistema. Ako sistem zahteva nekoliko tesno povezanih delo-
je proizveden kao integrisana jedinica. U principu, bioloki siste-
-
ja se ne bi odigravala na nivou fabrike; odigravala bi se na nivou
navrtanja i zavrtanja. U prolih nekoliko decenija, savremena biohemija je rasvetlila
-
o onome to se nalazi u sistemima oko kojih raspravljaju. Ne samo
- -
-
proizvode hidrokvinon i vodonik peroksid zavise u tom pogledu
59 60
-
li je sistem o kome se govori mogao postepeno da se razvije na
evoluciji tih sistema.
Nastojao sam da tih pet poglavlja sa primerima bude to je
ideje spajanja ili isecanja. Svejedno, kao to sam spomenuo u
nema ispita na kraju knjige. Detaljna rasprava treba samo da vam
-
kada budu spremni za vie detalja.
-
61
Drugi deo
Pregled sadraja kutije
-
. poglavlje
Veslaj, veslaj
,
Tako, dati protein ima samo jednu ili mali broj uloga: rodopsin ne
-
W
-
Proteini se proizvode hemijskim vezivanjem aminokiselina u
-
i svemirski brodovi), molekularne maine variraju od jednostavnih
nokiselinskih veza. Svaku poziciju u lancu zauzima jedna od dvade-
na solarnu energiju, kao one za fotosintezu. Naravno, molekularne
glicin, S za serin, H za histidin, i tako dalje. Svaka od 20 aminokise-
velika ali je A mala, R nosi pozitivno naelektrisanje a E negativno,
je potrebno za to.
S vie voli da se rastvara u vodi a I vie voli ulja, i tako dalje.
Ali prvo, malo neophodnih detalja. Da bi se razumela moleku-
Lanac verovatno zamiljate kao neto veoma savitljivo, bez
-
-
tako efektivne, i tako dalje ohrabrujem da iz biblioteke pozajme
se vri automatski kada, na primer, pozitivno naelektrisana ami-
-
o nekoliko detalja kao na primer kako izgledaju aminokiseline,
bljuju se kako bi istisle vodu; velike aminokiseline se istiskuju iz
-
-
kalija.
i testera.
-
-
65 66
s
-
bolje da ima negativno naelektrisanu aminokiselinu; u suprotnom, ^
katalizuje hemijsku reakciju, onda oblik enzima generalno odgo- ' <
vara obliku hemikalije koja predstavlja njenu metu. Kada se ve-
zuje, enzim ima precizno postavljene aminokiseline za izazivanje D
-
ljen, alat ne radi. Isto tako, ako je oblik proteina naruen, on ne us-
peva da vri svoj posao.
Savremena biohemija je uspostavljena pre pedeset godina,
-
-
trisati na timove proteina. Krenimo sada na plivanje.
W
-
nukleinskih kiselina (Nucleic Acids Research)
-
-
67 68
s
bez energije i prestaju efektivno da funkcioniu. Nervni impulsi
- izbezumljeno pokuavaju da izazovu pokrete potrebne za pliva-
vodu. Sila koju ruka i aka vre na vodu potiskuje vas unapred. sa polomljenom oprugom.
- -
oputaju se. Ostatak perioda za plivanje za odrasle provodite spo-
- ne izgura vas stampedo razigrane dece.
ravili ste da diete. Za predsednika Forda govorilo se da nije mogao
koordinirate okretanje glave do povrine vode i nazad sa drugim a
kretanjima potrebnim za plivanje. Bez kiseonika za metabolisa-
-
-
nervnih impulsa do udaljenih regiona tela.
ma osnovnoj opremi za plivanje. Da uzmemo poslednju scenu kao
prvu; plutanje zahteva samo da je objekat manje gustine u odnosu
spasilac koji pripada generaciji X, zaustavljate se, ustajete u vodi
- -
-
-
kursa, prilazite preblizu odbojkaima i u glavu vas udara pogreno
-
Da biste se udaljili od odbojkaa koji se izvinjavaju, odlazite u
bez nje.
-
-
ste 6 metara pre nego to vam je ponestalo kiseonika, a zatim ste se
-
69 70
s
71 72
s
73 74
s
^
istisle vodu, i tako dalje. Jedan kraj molekula tubulina ima povrinu
'W
komplementarnu suprotnom kraju drugog molekula tubulina, pa
-
W
mislite na slaganje konzervi tunjevine. Poto je dno nekih konzer-
konzerve ostaju na mestu.
8 9
7 10
10 9 8
6 11 7
5
4
12 6 Kada bi se konzerve tunjevine slagale vrh na vrh umesto dno
13 5
3
2 1
1
2 3
4 -
cem. tavie, ako konzerve tunjevine marke X nemaju zakrivljeno
8 7
9
10
6
5
11
12
4
3
13
1 2
smo onda zamislili tubulin kao konzervu tunjevine sa deset krat-
e
su komplementarni udubljenjima koja se nalaze skoro, ali ne sas-
konzerve stranu uz stranu i poto rupe nisu bile sasvim nasuprot
-
kon temeljnog meanja naih metafora) dalo strukturu nalik na
dimnjak od naih konzervi tunjevine.
-
'ss< toji dobar razlog za to: niz poslova koje mikrotubule moraju da vre
dozvolu.
75 76
s
77 78
s
,
da iznenadi. Ranije u ovom poglavlju videli smo da je sistemu za
Ti tragovi doveli su do modela rada cilije (videti sliku 3-2). Za- plivanje potrebno veslo radi kontakta sa vodom, motor ili izvor
-
-
-
za pokretanje sistema. Neksinske niti su spojnici, prenosnici sile
motora sa jedne mikrotubule na susednu.2
Kompleksnost cilije i drugih sistema plivanja je inheren-
- . Ne zavisi od toga koliko je
proizvodio zamahe, potrebno je nekoliko komponenata. Pitanje je
klize jedna pored druge. U odsustvu neksina, nastavile bi da klize - kako je cilija nastala?
Kada se savitljivi neksinski veznici istegnu do svojih grani-
ta ukazuje. Koje su komponente potrebne da bi cilija radila? Cili-
jarno kretanje svakako zahteva mikrotubule; u suprotnom, ne bi
-
e
jedne funkcije: cilijarnog kretanja. Kao to miolovka ne radi ako
nisu prisutni svi delovi, cilijarno kretanje jednostavno ne postoji
79 80
s
e - -
-
-
-
prim. red.).
poboljanja postepeno su proizvela ciliju koju nalazimo u savre-
E
-
nom scenariju jeste ono za koje mnogi evolucioni biolozi imaju
malo strpljenja: ali kako se to odigralo? ljavanje mnogih odvojenih gena koji kodiraju njene komponente
,
-
-
-
traga profesionalne literature pokazuje vie od hiljade radova u
Ali, ti delovi ne bi mogli da oforme funkcionalnu miolovku bez
poslednjih nekoliko godina koji imaju cilije
-
mogli da rade kao miolovka. Njihova prethodna funkcija nije ih
Science, Nature,
, Biochemistry,
gical Chemistry,
, Cell, i brojne druge. U
prolih nekoliko decenija u vezi sa cilijama objavljeno je verovat-
za transport. Protein koji nasumice spaja mikrotubule poremetio no oko deset hiljada radova.
Poto postoji tako obimna literatura o cilijama, i od interesa
-
su u tako raznovrsnim oblastima, i poto se nairoko tvrdi da je
-
teorija evolucije osnov celokupne savremene biologije, onda bi se
savitljivog veznika neksina. Neregulisan motorni protein, koji je
81 82
s
nauka mora imati dobar uvid u evoluciju cilije. Stupnjevi kroz koje -
je verovatno prola, problemi na koje bi naila u ranim stupnjevi-
novonastale cilije kao sistema za plivanje sve to svakako bi bilo
e
BioSystems4 Satmari
se ni oko opteg puta kojim je evolucija mogla da ide. Nijedan ne
5
ostali beskorisni.
-
-
BioSystems.3 Rad ne pokuava da
-
-
- ma za plivanje. Satmari je pokuao da ode malo dalje i da govo-
da podstakne takav eksperimentalan i teorijski rad.
-
Margulis i Kavalijer-Smit su se poslednjih godina sukobili u ra-
dovima.6
-
- -
-
- rali ni jedan rad vie od nekoliko puta u godinama nakon objav-
ljivanja.7
kako je cilija zaista mogla da evoluira.
~ -
tvaren poslednjih nekoliko decenija navela je mnoge ljude da
83 84
s
85 86
s
^ W
' Napomenuo sam da se cilija sastoji iz tubulina, dineina, neksi-
:
oformili funkcionalnu ciliju. Potrebno je daleko vie da bi se dobila
preko -
gli da budu potrebni spadaju vezivanje cilije za strukturu osnove
-
panju strukture; proteini koji reguliu proizvodnju proteina koji
-
-
ma je verovatno da su mnogi delovi koje ovde nismo razmatra-
'ss
^ Z </ D /
87 88
s
-
stati postepenim razvojem, potreba za novom vrstom objanjenja
- . poglavlje
-
Rubi Goldberg u krvi
krvi.
^
Ime Rubi Goldberg (Rube Goldberg) veliki karikaturista koji
Sofronije bi iznervirao maliana, koji bi onda planirao osvetu.
na listu papira. To je pokazivalo koliko je pametno (najzad, morate
Scenu ili dve kasnije Sofronije se eta, zapazi dolar ili neki dru-
gi mamac na zemlji i podigne ga. Dolar je uzicom vezan za tap
lopta se zakotrlja dok Sofronije zuri razjapljenog kljuna u prizor.
Lopta zatim pada sa litice na izdignuti kraj klackalice, udarivi je
i izbacivi uvis kamen sa privezanim komadom mirgl-papira. U
letu, mirgl-papir pali ibicu koja viri iz stene litice, i koja zatim
-
se ivicom nekoliko puta, i padne kroz levak. Pri izlasku iz levka,
89 90
Z'
EFGH
IJKL
MN
OP
-
sABCD
-
Kada malo razmislite o tome, shvatate da je maina Rubija Gold-
nekoliko uzajamno zavisnih delova koji doprinose osnovnoj funk-
Z'Z'/hD
ciji, i gde uklanjanje bilo kog dela izaziva prestanak funkcionisanja
u prethodnim poglavljima miolovka, eukariotska cilija i bakterij-
-
piru. On je sastavljen od odvojenih delova koji deluju sukcesivno
(postupno), jedan za drugim, kako bi ostvarili svoju funkciju.
-
ski i prostorno odvojeni, samo jedan od njih (telefonski stub) os-
-
ponente da bi se udarac zadao u pravo vreme i na pravom mestu.
Da mehanizam za izazivanje njegovog pada nije prisutan, Sofroni-
je bi ceo dan mogao da eta oko telefonskog stuba i nita mu se ne
bi desilo.
^DZ'
zamkom, postoje drugi sistemi koji mogu da zadaju udarac Sofro-
niju. Mogli bi da koristite bejzbol palicu, ili da oborite stub sekirom
dok Sofronije stoji na pravom mestu. Mogli bi da koristite nukle-
-
rektno za top, koji bi onda razneo petla kada bi on podigao mamac.
topa, uklanjanje uzice sa topa, njeno vezivanje za tap, dodavanje
91 92
Z'
vremena (mnogo generacija, prim. red.) bio van upotrebe, tako da
-
Sistemi Rubija Goldberga mogu dobro da nasmeju; publika
-
-
koristi za ozbiljan cilj, nema mesta za humor i ostaje divljenje
od brojnih komponenti, izazivaju gubitak funkcije sistema: krv se
-
Neki zadaci ostavljaju malo mesta za greku. Na primer, za mene
sistemu - uzica, tap, lopta, klackalica, kamen, mirgl papir, ibica,
-
-
hodnik plazma tromboplastina ili kininogen velike molekularne
ustavi pre kraja piste. Pre nekoliko godina jedan avion je skliznuo
-
sruili nedaleko od piste. Da je pista duga 30 umesto 2 kilometra,
K
,
Sletanje aviona samo je jedan primer sistema koji mora da radi
-
-
na na vreme posekao prst ili ogrebao koleno. Poto je bio mladi
,
strpljivo da se podnosi ako je trebalo obaviti bilo kakav posao.
Na kraju bi krv stala i posekotina bi zarasla. Da je Darvin to
nju preciznost. Kada je sistem za cirkulaciju krvi pod pritiskom
Nije imao dovoljno informacija ni da pretpostavlja mehanizam -
-
kon vie od jednog veka.
-
-
93 94
Z'
Zbog toga zgruavanje krvi mora biti strogo kontrolisano tako da
se ugruak formira samo kada i gde je potreban. 2
-
-
-
-
cilj rasprave nije da zapamtite detalje. (Uostalom, imena i odnosi
moglo da nastane korak po korak. ^
<
koji ostaje nakon to se crvena krvna zrnca uklone) sastoji se iz
1 Ime
materijal za zgruavanje. Kao i telefonski stub pre nego to je obo-
stuba potrebne su za kontrolu pada stuba.
-
-
ni ipke.
Fibrinogen je normalno rastvoren u plazmi, kao to je so ras-
-
ja posla, dok posekotina ili povreda ne izazove krvarenje. Zatim
drugi protein zvan trombin iseca nekoliko malih delova sa dva od D<W/
95 96
Z'
-
-
-
-
,
naziva kaskada sistem gde jedna komponenta aktivira drugu,
-
-
- se formirao ugruak.3
-
kontrolie aktivnost trombina. cesu zgruavanja krvi, Stjuartov faktor brzo bi pokrenuo kaska-
<
Ovde postoji mali problem u naem kokoka-i-jaje razvojnom
,
protrombin. Stjuartov faktor i protrombin mogu se meati u epru-
obliku za upotrebu po potrebi. Neaktivni oblici se nazivaju pro-
- do smrti i ne bi dolo ni do kakve primetne proizvodnje trombina.
Ispostavlja se da je potreban jo jedan protein, zvani akcelerin, da
-
lerin i aktivirani Stjuartov faktor isecaju protrombin dovoljno
mogu uskladititi u obliku neaktivnih proenzima, a zatim se brzo
jedan proenzim.
Trombin prvobitno postoji kao neaktivni oblik, protrombin. -
trombin se, kao to smo videli, u regulacionoj kaskadi nalazi na
Jo uvek ostaje nedoumica oko kontrole. Ako je testera iz crtanog
97 98
Z'
99 100
Z'
^
- -
tein, zvani prekalikrein, u njegov aktivni oblik, kalikrein. Kalikrein -
faktora u njegov aktivni oblik. Zatim, aktivirani Hagemanov faktor
Zatim se kontrola puta za zgruavanje krvi deli na dva dela. Pre-
aktivan oblik. Aktivirani PTA zauzvrat, zajedno sa aktiviranim obli-
kom drugog proteina zvanog konvertin (o kome se govori kasni-
je), menjaju protein zvani Krismasov faktor u njegov aktivni oblik. nejasan. Mnoge eksperimente u vezi sa zgruavanjem krvi teko
akcelerin) menja Stjuartov faktor u njegov aktivni oblik. -
e
-
vara u konvertin aktiviranim Hagemanovim faktorom i trombi-
nom. U prisustvu drugog proteina, tkivnog faktora, konvertin
-
-
ma za napad na Sofronija i puta zgruavanja krvi; oba su neuma-
samo kada povreda dovede tkivo u kontakt sa krvlju. (Posekoti- su neki detalji manje poznati, sistem zgruavanja krvi uklapa se
-
-
novnoj funkciji, i uklanjanjem bilo kog dela, sistem gubi funkciju.
-
-
-
unutranji put i da pomogne aktiviranom PTA da aktivira Krismasov
-
- akcelerin. Kao to nijedan od delova sistema za napad na Sofroni-
ranom Krismasovom faktoru u pretvaranju Stjuartovog faktora u akti- -
skog stuba, isto tako se nijedan od kaskadnih proteina ne koristi
ni za ta drugo osim za kontrolisanje formiranja krvnog ugruka.
U odsustvu bilo koje komponente, krv se ne zgruava i sistem gubi
funkciju.
101 102
Z'
-
-
virao proenzim u pravo vreme i na pravom mestu. Poto svaki ko-
-
stupanj.
mogu postepenim evolutivnim koracima preobraziti u sistem za
-
Najjednostavniji zamislivi sistem za zgruavanje krvi bi mogao Poto je kopno na viem nivou od nivoa mora, voda u predvodni-
-
na drugoj strani sputaju brod do nivoa mora. Na svakoj predvoni-
-
-
kada petao nije u blizini. tavie, stub nije usmeren ni u jednom
obe odlike kapiju i odvod ili ne funkcionie. Prema tome, svaka
-
sistem za zgruavanje krvi bi se aktivirao u neprikladnom trenu- -
ban i neaktivan proenzim i drugi enzim da ga aktivira.
-
voljili kriterijum minimalne funkcije. U sistemima Rubi Goldber-
ga, nije zavrna aktivnost (padanje telefonskog stuba, formiranje :
Mogao bi se zamisliti sistem za zgruavanje krvi koji je donekle
jednostavniji nego pravi gde, na primer, Stjuartov faktor, nakon -
ku 4-3.) Prvo, protein plazme zvani antitrombin vezuje se za akti-
-
-
kon aktiviranja trombinom, protein C unitava akcelerin i aktivi-
smrt ili ne bi radio nita, i ne bi postojao razlog da ga prirodna
selekcija izabere. Zbog prirode kaskade, novi protein bi odmah
103 104
Z'
ugruka predstavlja integrisani bioloki sistem, i zbog problema
da aktivira protein C. -
ciju. Nedostatak nekih faktora zgruavanja krvi, ili proizvodnja
-
-
toru u pretvaranju Stjuartovog faktora u njegov aktivni oblik.
-
gi proteini kaskade sistema za zgruavanje defektni, iako su tak-
nje rane napredovalo. Protein zvan plazmin deluje kao makaze,
2
u zgruavanje. Pored toga, nedostatak proteina C prouzrokuje smrt
rana ne bi imala dovoljno vremena da u potpunosti zaraste. Zbog
toga se on prvobitno javlja u neaktivnom obliku zvanom plaz-
minogen. Pretvaranje plazminogena u plazmin katalizuje pro-
<
tein zvan TPA. Postoje i drugi proteini koji kontroliu razlaganje
2-antiplazmin, koji se vezuje za plazmin,
-
ture mnogih komponenti. Da je uzica koja je vezivala dolarsku raturi. Ali prvo treba razmotriti nekoliko detalja.
ne bi funkcionisao. Isto tako, kaskada sistema za zgruavanje krvi
-
primer, pretpostavimo da su prvih deset aminokiselina u jednoj pro-
teinskoj sekvenci ANVLEGKIIS, a u drugom proteinu ANLLDGKIVS.
aktivirao prokonvertin u pogreno vreme; ili bi iskrvarila na smrt
- -
ni. Organizam bi uginuo ako bi trombin aktivirao protein C mno- -
- retisalo se da se u prolosti gen nekako duplirao, a vremenom su
tivirao Stjuartov faktor istom brzinom kojom se formira. Kada bi dve kopije gena nezavisno nagomilavale promene (mutacije) u
plazminogen bio aktiviran neposredno nakon formiranja ugruka, svojim sekvencama.4
105 106
Z'
-
-
tome kako je miolovka nastala. Da bi se tvrdilo da se sistem raz-
-
1970-tih godina pokazano je da se geni mogu javljati u delovima. ti da je funkcija sistema mogla da se formira brojnim uzastopnim,
sitnim promenama.
da budu odvojeni od DNK koja kodira desni deo. To bi bilo kao
karneval i pronali je navedenu kao ^
-
nog dela; drugi tip bi mogao da bude iz dvanaest delova. -
dan pokuaj evolucionog objanjenja zgruavanja krvi koji je po-
-
nudio Rasel Dulitl (Russell Doolittle). On je u svojoj hipotezi izneo
-
niz koraka po kojima su se proteini za zgruavanje krvi pojavili je-
binovanjem DNK fragmenata gena koji kodiraju delove starih pro-
teina kao to se karte mogu uzeti sa nekoliko gomila i dati novi
aminokiselinske sekvence i oblike zasebnih delova (zvanih dome-
-
bine novih proteina.
kao dokaz za ovakvo kombinovanje. Neki regioni kaskadnih pro- Rasel Dulitl, profesor biohemije pri Centru za molekularnu
- genetiku Univerziteta u Kaliforniji, u San Dijegu, je najistak-
jim aminokiselinskim sekvencama sa drugim regionima istog pro-
zgruavanje krvi. Od vremena svoje doktorske teze, Uporedna
- -
vertin, Krismasov faktor, Stjuartov faktor i protrombin poseduju
da bi to dovelo do razumevanja pojave sisarskog sistema. Dulitl
Thrombosis and Haemostasis iz-
neo pregled stanja trenutnog znanja.5 , -
- ,
koji znaju vie o zgruavanju krvi od bilo koga drugog na Zemlji.
sebi ne govori nita o tome kako je bilo koji konkretan protein ili
proteinski sistem isprva nastao sporo ili naglo, prirodnim odabi-
ranjem ili nekim drugim mehanizmom. Setite se, opruga miolovke
Paradoks je bio da, ako je svaki protein zavisio od aktivacije drugim,
107 108
Z'
109 110
Z'
: < ^ / (egzona). To daje ukupan zbir od oko 30.000 genskih delova. TPA
7 Raznovrsnim kombinovanjem,
8 je 1 prema 30.000 na
:
-
<
pen.9 Kada bi irska lutrija imala anse za dobitak od 1 na prema
:W deset na osamnaesti, i kada bi svake godine milion ljudi igralo lu-
triju, bilo bi potrebno u proseku oko hiljadu milijardi godina pre
Z W nego to bi bilo ko
ljadu milijardi godina je otprilike sto puta vie od trenutno pro-
'&d&
problem ultra-malih ansi bi smetao pojavi protrombina (rezu-
<
(kombinovani protein nastao od...), plazminogena, proakceleri-
- -
-
antiplazmin nastaje, TPA se pojavljuje, protein za stvaranje
-
- Drugo pitanje koje treba razmotriti je podrazumevana pret-
-
neophodne da bi se pravi delovi postavili na prava mesta. Eukari-
-
- vodnju bicikala, ona bi proizvodila bicikle, a ne motocikle; to se
- duplikacija. Gen za protein bi mogao da se duplira
-
tivnih, beskorisnih raznovrsno pomeanih domena moralo da se kopija starog gena, objanjenje za pojavu tkivnog faktora mora da
- -
lik na TPA aktivnost. ju. Ovaj problem se diskretno zaobilazi. Dulitlov scenario zapada u
iste probleme u proizvodnji protrombina, trombinskog receptora,
antitrombina, plazminogena, antiplazmina, proakcelerina, Stju-
- -
ju oko 10.000 gena, od kojih je svaki u proseku podeljen na tri dela
111 112
Z'
sutinska pitanja koliko, kojom brzinom, kada, i gde. Nita se ne
ali se njegov aktivator (TPA) javlja tek dva koraka kasnije. Stju-
koje bi bilo potrebno da se ugruak formira od trenutka pojave
-
gih takvih pitanja. Apsolutne i relativne vrednosti tih i drugih fak-
-
ili (daleko verovatnije) krajnje pogrenom. Na primer, kada bi bila
Poto su oba proteina proenzim i njegov aktivator potrebni za
jedan korak u putu, onda su anse da se oba proteina dobiju za-
tvo antitrobina bilo prebrzo, prvobitno dejstvo trombina prespo-
-
ro, ili ako bi se prvobitni Stjuartov faktor ili Krismasov faktor ili
set na osamnaesti stepen; anse da se dobiju zajedno TPA i nje-
-
ako bi se vezivali za neaktivne oblike svojih meta kao i za aktivne
oblike), onda bi se ceo sistem sruio. Ni kod jednog jedinog koraka
-
jeva nema nauke. Kada se iznese samo verbalna slika razvoja tako
ako bi se protein pojavio u jednom koraku10
funkcionisala. Kada se ignoriu tako sutinska pitanja, ostavljamo
onda bi mutacije i prirodno odabiranje . Poto
nauku i ulazimo u svet Kalvina i Hobsa.
ne radi nita bitno, njegov gubitak ne bi bio tetan, a proizvodnja
Pa ipak, do sad iznete zamerke nisu najozbiljnije. Najozbiljnija,
Proizvodnja beskorisnog proteina bi, prema tome, najmanje u
nekoj marginalnoj meri, bila tetna. Darvinov mehanizam prirod-
korisno upravo sada- sistema kao to je kaskada sistema za zgruavanje krvi.
timo njegov scenario u srvhu rasprave, samim Dulitlovim opisom
raka. Formiranje tkivnog faktora u prvom koraku je neobjanjeno,
cela
-
grupa proteina mora odjednom
-
-
dobija sve proteine odjednom, ili usmeravanjem od strane inteli-
113 114
Z'
-
- sledom dok, u raspletu, petao Sofronije ne odgurne telefonski stub
i ustane sa zemlje, i vidimo da su njegove rane prestale da krvare.
Publika ustaje i dugo aplaudira.
-
osim ako neko ili neto ne vodi proces.
Throm-
bosis and Haemostasis
kako je zgruavanje moglo da se javi i da zatim evoluira; umesto
,niko na zemlji nema ni
najmaglovitiju ideju o tome kako je nastala koagulaciona kaskada.
Dulitla, koji je godinama radio u oblasti proteinske strukture. U
toliko napora da utvrdi poreklo zgruavanja krvi. Rasprava je na-
-
-
-
Kao neka vrhunska maina Rubi Goldberga, kaskada
115 116
nja do aerodroma. Na aerodromu kamion dolazi do terminala ko-
. poglavlje
Odavde do tamo
-
vakcina se prepoznaju po oznakama, odvajaju od drugih pakova-
D -
-
ci istovaruju kamion i otvaraju kutije. Ubrzo gomila dece dolazi na
kliniku da bi bila vakcinisana. Pri prolasku svakog deteta, medicin-
boginje su danas retke. Ljudi zaboravljaju koliko one mogu da
budu opasne. Roditelji o njima misle kao o jednostavnom proble- deteta koje pravi grimase.
Doktorka dobija informaciju da je prvi pacijent upravo umro. na obrazovnu kampanju.
se bolest iri. Doktorka se plai da je epidemija na pomolu. Od-
hK
-
trolu zaraze (CDC) u Atlanti zahtev za deset hiljada doza vakcine
-
nisanja u neposrednom susedstvu kako bi se zaustavilo irenje
roditelji upoznali sa posledicama koje virusi mogu da prouzrokuju
kod dece. Ali pre svega: vakcina je neophodna odmah. je na previe glupih, nesposobnih ljudi da bi progutao tako neto.
je otila u bolnicu radi uklanjanja slepog creva. Oblasna komisija
skladite gde se nalazi niz velikih prostorija punih vakcina pro- kojoj je predsedavao susedov ujak dopustila je susedu da otvori
-
-
117 118
K
da ukazuju na ljudske nedostatke i tragedije prouzrokovane ljud- Albert Ajntajn protiv tri bezumnika. Ajntajn nema anse.
e
^
-
ma vakcine protiv malih boginja. Na kamion, u avion, do grada, i
-
-
ra i primaju vakcine. Dva meseca kasnije, dvesta maliana je mrtvo,
a na hiljade je bolesno. Skoro svi su primili vakcinu. Zbunjeni
u nizu, motori rade, spremni da krenu ka svojim destinacijama.
-
-
male boginje. Skoro sva deca u gradu su sada bolesna. Nita se ne bus i zavrili u Pitsburgu.
Autobuski sistem mora da se izbori sa istim problemom koji
-
-
kutija kako bi se utvrdilo koje vakcine su prave. Tokom tih sedmi-
Lako se mogu zamisliti varijacije na temu. Kamion smeta kutije prenosno sredstvo za raznoenje; prenosno sredstvo mora da pre-
vakcina na pogrean avion. Avion istovaruje svoj teret na pogrean
kamion. Neko otima kamion na putu do klinike. Kamion doprema
otvoriti kada stigne, onda nije moralo ni da se alje. Celokupan
sistem mora da bude potpun da bi funkcionisao.
-
119 120
K
proces. Detalji mogu da se razlikuju u zavisnosti od odredita pro-
teina, kao to se detalji raznoenja mogu razlikovati u zavisnosti
da li se paket alje unutar grada ili preko okeana. U ovom poglavlju
-
tri za kontrolu zaraze pri slanju neophodnog pakovanja.
/
-
larne maine. Neke od maina ga hvataju alju do mesta na koje je
/<
121 122
K
123 124
K
-
-
e-
Dok je drobilica prolazila kroz prozor druga maina je uklo-
to da vri precizno, a da se zatim odvoji, i svaka mora da stigne i da
-
zatvara.
W
glavnu oblast pre nego to naleti na drugu prostoriju za obradu.
-
*
ju za obradu #2. Drobilica baterija zatim prolazi kroz prostoriju za
ne? Pa ne, da, i ne.
je preneli iz prostorije #1 u prostoriju #2. Prostorije za obradu su Sve zamiljene maine u naoj svemirskoj sondi imaju
te u kojima maine primaju oznake koje ih usmeravaju do njihovih
krajnjih odredita. Na drobilicu baterija se postavlja antena i brzo biblioteka je jedro, plan je DNK, kopija plana je RNK, prozor bibli-
oteke je jedarna pora, proizvodne maine su ribozomi, glavna
oblast je citoplazma, ukras je signalna sekvenca, drobilica bate-
drobilicu do prostorije za obradu otpada. -
nala (SRP), prijemno mesto je SRP receptor, prostorija za obradu
U zidu poslednje prostorije za obradu se nalaze maine
-
-
-
ju za obradu otpada preko ove dve komplementarne maine. Na-
redna maina (kapija) zatim prolazi pored njih. Kapija ima oblik potreban samo jedan odeljak. Nemojte brinuti ako brzo zaboravite
RNK kopija (zvana informaciona RNK, ili samo iRNK) se
proizvodi na osnovu DNK gena koji kodira protein koji radi u
-
sni sistem koji je poslao drobilicu baterija do njenog odredita
125 126
K
127 128
K
129 130
K
131 132
K
prvobitno morao da radi na otvorenom.
*
iz dedinog sata) i koristiti ih direktno kao specijalizovane delove jedna od maina u dugom nizu koji prenosi proteine od citoplazme
do lizozoma. Zbog te mane, enzimi namenjeni lizozomu nikada
ne stignu dotle. Umesto toga su usmereni u pogrene vezikule do
-
*
-
jal se doprema do lizozoma radi razgradnje. Kod dece sa obolje-
izgradnju. U ovom poglavlju vidimo da se konstrukcija transport-
-
-
taviti deo po deo, bilo sa novim, bilo sa polovnim delovima.
*
^
-
etiketa je postavljena na kutiju sa vakcinama i deca su pomrla.
mnogih maina potrebnih za prenoenje proteina do lizozoma.
-
-
sistema za transport proteina predstavljaju recept za izumiranje.
-
Zbog medicinskih problema povezanih sa otkazivanjem trans-
-
i slezinu. Kaalj i nos koji curi govore o mnogim infekcijama gor-
-
-
tor uzima uzorak tkiva i alje ga u laboratoriju na analizu; labora-
Kako je takav sistem mogao da se razvije korak-po-korak? Koje bi
-
2 Poto je oboljenje
-
133 134
K
135 136
. poglavlje
Opasni svet i nasilnici svakodnevno napadaju vie ljudi u svom susedstvu
pijunku kako bi video ko je na vratima, i nositi sprej sa biberom
kada eta psa. U zemljama u kojima su takve savremene pogod-
^ nosti nepoznate, kameni ili drveni zidovi se mogu izgraditi oko ko-
Motka, kamen, prepreka, pitolj, alarm, tenk i atomska bomba
se mogu koristiti za odbijanje napada. Poto okolnosti u kojima
-
-
-
- -
-
atomske bombe, mogu se primeniti druge maine: mlaznjaci koji
bacaju pametne bombe, avaksi koji nadgledaju vazduni pro- prethodnika. I kamen i pitolj mogu da se koriste za odbranu, ali
-
da mogu da ubiju. Teroristi koji postavljaju bombe u avione ili
e -
- thodnici.
-
pitolji ili kamenje nedelotvorni. Bakterije, virusi, gljivice svi bi
137 138
K
ali uglavnom ne, jer naa tela imaju niz odbrambenih sistema za
~
- smo malopre govorili, ne smemo odmah da pretpostavimo da su
Iako telesni odbrambeni sistem i dalje predstavlja aktivnu oblast
govoriti o izabranim delovima imunog sistema i ukazati na pro-
Da bi se obeshrabrio uljez koji uspe da se popne na vrh, na bleme koje oni predstavljaju za model postepene evolucije. Oni
ograde se nekad postavljaju iljci. U delu Bronksa u kome sam
- da uzmu bilo koji tekst iz imunologije radi detalja.1
e
W
ili nagazne mine.
molekularni sistemi su, kao anti-raketni sistem rata zvezda koji
- je vojska nekad planirala, roboti dizajnirani za upravljanje auto-
vice da biste se zatitili od materijala kojim rukujete, ali ponekad pilotom. Poto je odbrana automatizovana, neki mehanizam mora
morate da nosite rukavice da biste zatitili materijal od vas. Ljudi
-
- -
jih je jedna klasa molekula zvana magainini, koju je otkrio biolog
-
-
-
lancem u svakoj polovini. Na kraju svakog vrha kraka ovog kom-
139 140
K
141 142
K
-
poruku nazad. glo signalizirati da proizvodi vie antitela, onda bi borba mogla da
-
-
*-
koji kodira hidrofobni rep proteina. Poto je i membrana hidrofob-
-
-
stranog proteina se vezuje za drugi protein (zvani MHC protein).
-
^ -
a
-
-
-
sto da proizvode oblik antitela koji se vezuje za membranu, plazma
-
<
Da li je ovaj sistem mogao da evoluira korak po korak? Razmotri-
antitela se naziva klonalna selekcija. Klonalna selekcija predstavlja
143 144
K
malni zahtevi za sistem klonalne selekcije, i da li su ti minimalni
zahtevi mogli da se ostvare korak po korak.
oblik antitela koji se vezuje za membranu; (2) glasnik; i (3) ob-
-
- -
maciju. Ako ne postoji oblik antitela koji se izbacuje, onda se pri
rak ne bi bio funkcionalan. Protein bi mogao da bude vezan za svo- -
antitelo nikada ne bi dolo u kontakt sa stranom materijom, koja
-
*
e
prevodila DNK poruku u jo proteina.
Smetanje antitela u membranu je dobro reenje problema;
poruka prenese od jednog do drugog. pojednostavljena klonalna selekcija, nije mogla da nastane poste-
penim koracima.
sastojka su morala da evoluiraju istovremeno. Svaki od ova tri ob-
sto toga zamislimo jednostavniji sistem u kome postoji jo samo je-
proteine koji su vrili druge poslove u komponente sistema anti-
- tela. Darvinovi mali koraci su postali nizovi krajnje neverovatnih
145 146
K
objanjenje. Bilo je poznato da su proteini savitljivi molekuli, a
-
na, njegovo isecanje, prezentovanje ka spoljanjosti na MHC pro- molekula u telo antitelo obmotava oko njega, pravi kalup tog ob-
-
-
gledi za korak po korak nastajanje ovakvog puta su dovoljni da i prepoznavanje stvari koje nikad nisu videli. Ali tako veliki broj anti-
D mutacija samo u oblastima koje kodiraju mesto vezivanja antite-
Fabrike plutaju uokolo u velikom broju kako bi se obezbedila
antitela? Ispostavlja se da postoji elegantan trik za proizvodnju
velikog broja raznovrsnih antitela koji ne zahteva da ogromne
bude neprekidan segment DNK mogao je da ima prekide.3 Ako
detalje; moja namera ovde je samo da vam pomognem da steknete -
menjen (bez unitavanja proteina) tako da glasi Brza smdkd-
-
surovim, ali neophodnim, eksperimentom. Samo da bi videli ta
-
u prirodi i onda ih vezali za protein. Kada je protein koji je nosio
,
-
to jo vie zapanjuje, i sama
da proizvede antitela protiv njega? Zato bi prepoznao molekul
koji nikada ranije nije sreo?
147 148
K
149 150
K
151 152
K
-
- -
-
-
i shvatate da je to bio samo san. no antitelo; ako bi se C1 vezivao za antitelo koje pluta unaokolo u
krvotoku, onda bi se iskoristili svi C1 proteini i bili bi nedostupni
za delovanje protiv neprijatelja. Ili, ako bi se C1 vezivao za antitela
-
-
sistem za stvaranje raznovrsnosti antitela, i nakon to je sa napo-
- proteina, to ukupno predstavlja 18. Druge dve grupe se zovu C1r
-
telima vri sistem komplemenata, koji se tako naziva jer dopu-
proteina u mini kompleksu. Ostatak proteinskih lanaca se zatim
^
W e -
Slike C1q-a snimljene elektronskim mikroskopom pokazuju neto
prilepe, neto u C1q se menja, i promena u C1q prouzrokuje da se
1r. (Aktivirani proteini
1r
1s.
C1 kompleksa se zbirno zovu jedinica za prepoznavanje. Naredna
153 154
K
grupa proteina (zvana C2, C3, i C4) se naziva aktivaciona jedini-
ca. Za razliku od one za prepoznavanje, aktivaciona jedinica se ne
sastoji odmah iz jednog komada; mora da se sastavi. Prvi korak u C3b,Bb
C1s. Kada C1s (C3b)2Bb. Interesantno, to je sada C5 konvertaza, koja proizvo-
-
neophodno, kako bi ostali proteini u aktivacionoj jedinici mogli da
je C4b usmeren u pogrenom smeru ili pluta uokolo u rastvoru,
membranu.
drugi protein (properdin), vezuje i titi C3b od razgradnje kako bi
C1s
4b,2a-
-
udaljava. Ako je C3 molekul u blizini, C3 konvertaza ga iseca na dva rusa.
4b,2a,3b, koji se
-
dinice je isecanje C5 na dva fragmenta. W
Kao i put zgruavanja krvi, put komplemenata predstavlja
pokuajima da se zamisli njihov postepeni nastanak. Nije poslednja
C5b,6,7 se zatim vezuje za molekul C8 proteina, i promenljiv broj aktivnost kaskade ta koja predstavlja problem. Formiranje rupe
(od jednog do osamnaest) molekula C9 proteina se tome dodaje.
nenti; jedan protein ubica bi mogao da izvri posao. Niti formira-
organizuju se u cevast oblik koji pravi rupu u membrani bakterij-
viestruke komponente; pod pravim uslovima, bilo koji protein
koncentrisani rastvori, osmotski pritisak izaziva prodiranje vode u
vre, to se mora objasniti.) Kao to smo videli, telefonski stub bi
Postoji alternativan put za aktivaciju kompleksa za napad na
sam mogao da udari petla Sofronija.
Kontrolni sistemi su ti koji predstavljaju problem. Na svakom
kontrolnom mestu i regulatorni protein i maskirani protein kojeg
155 156
K
^
bio prisutan, ostatak kaskade bi odmah bio pokrenut; ali ako bi Pravilno funkcionisanje imunog sistema je preduslov za zdra-
vlje. Teke bolesti kao to su rak i sida imaju ili svoj uzrok ili svoj
Ako bi C3b bio prisutan, ostatak kaskade bi odmah bio pokrenut;
,
-
Pored optih problema uspostavljanja kaskade, put kom- sistema, ne znamo kako je nastao. Ni na jedno od pitanja postavlje-
plemenata deli jo jedan problem sa kaskadom zgruavanja krvi:
oblasti; malo njih ga je uopte i postavilo. Pregled imunoloke lite-
-
-
grupe koje se hemijski vezuju za membranu, nakon to su proteini
nagrade Dejvida Baltimora (David Baltimore) i druga dva istaknu-
-
liku prepreku njihovom postepenom razvoju.
Brojne male odlike sistema komplemenata predstavljaju kamen
spoticanja postepenom razvoju. Razmotrimo neke suptilne kara-
dZD,
ksu bio promenjen, i postojala bi mnogo manja ansa dobijanja (Imunoglobulini su antitela. TCR molekuli su srodni antiteli-
ma.) Autori zatim tvrde da ajkule, koje su u veoma dalekom srod-
-
Napominju da:
kompleks sa antitelom, kaskada bi bila prerano pokrenuta. I tako
dalje. dZZ'
^Z'
157 158
K
dZ -
veo sisteme.
-
jski pokuaj da objasne poreklo komponenti, ali na kraju, to je -
skok u kutiju sa Kalvinom i Hobsom. Autori pretpostavljaju da je
imunog sistema.
U ovom poglavlju sam razmatrao tri odlike imunog sistema
klonalnu selekciju, raznovrsnost antitela i sistem komplemenata
se nalazili signali koji su bili blizu gena za antitela; i tako dalje.
i pokazao da svaka zasebno predstavlja ogromne izazove pred
sleganje ramenima.
-
Drugi rad koji hrabro pokuava da objasni deo imunog siste-
ma je objavljen pod nazivom Evolucija sistema komplemenata.6
neke matovite pretpostavke o tome ta bi moglo da nastane prvo
integrisanog sistema.
-
Razmotrili smo neke pozitivne odlike imunog sistema, ali pos-
-
tom za vezivanje za primitivni C3b; Evolucija drugih komponenti
rate da se ne upucate u nogu. Imuni sistem mora da pravi razli-
-
ja, zato telo proizvodi antitela protiv nje, ali ne i protiv crvenih
dalje razdvajanje i specijalizaciju dva puta). Nikakvi kvantita-
-
-
gih tkiva o koja se stalno odbijaju? Kada telo proizvede antitela
plikacija gena ne bi odmah proizvela novi protein. Niti bilo kak-
usmerena na sebe, uglavnom dolazi do katastrofe. Na primer, lju-
va briga o nedostatku kontrole za regulaciju puta. Ali opet, bilo
di koji pate od multipleks skleroze proizvode antitela koja su us-
bave molekularnim mehanizmima.
-
Postoje drugi radovi i knjige koji govore o evoluciji imunog
sistema.7
ne bavi detaljnim molekularnim mehanizmima, ili se jednostavno
159 160
K
-
ra na mehanizam, znamo jednu stvar: sistem samo-tolerancije je
. poglavlje
Raznovrsnost, prepoznavanje, razaranje, tolerancija - sve ovo, i
Smrt na drumu
-
'
-
da, na jednoj od mnogih lepih planina koje krase Pensilvaniju.
skromnijim sistemima? ta je sa fabrikama koje proizvode navr- Oblast je, iako blizu grada, ruralna, sa gustom umom gde god pro-
-
ju, nekad ne.
-
-
161 162
^
druga kola zbrisala le. -
mi. Navodno gladak prelaz nestaje kada se razmotri pri dnevnoj
-
-
ka, nema apsolutne prepreke postepenom sastavljanju nekih bio-
da tako. ajlkil (Schuylkill) autoput, glavni autoput koji ulazi u Fi-
-
ogromna.
e
'
Pretpostavimo da ste na mestu mrmota koji sedi pored jedne
strane puta nekoliko stotina puta ireg od ajlkil autoputa. Pos-
nih jedinica nanizanih u lanac). Gradivni blokovi proteina su ami-
toji hiljadu traka u jednom i hiljadu traka u drugom smeru, pri
nokiseline, a nukleinskih kiselina nukleotidi. U velikoj meri nalik
-
voze maksimalnom brzinom. Jedna mrmotica se nalazi na drugoj
-
-
jatelja uglavnom nalaze u prvoj traci, uz nekoliko u drugoj tra-
perle posebnih oblika tako da je mala rupa na jednom kraju, prave
-
-
like, perle ne bi mogle da se spoje; da su rupe prevelike, niska perli
-
,-
-
vnih blokova.
Primer mrmota koji prelaze put ilustruje problem za
-
vrste nukleotida: A, C, G i T.1
riti o gradivnom bloku A. Kada gradivni oblik nije vezan za poli-
-
-
-
-
ma, i AMP nije izuzetak. Sastoji se od pet vrsta atoma: deset uglje-
163 164
^
sfora.
kako se aminokiseline i nukleotidi sastavljaju u duge lance. Da bi-
smo razumeli kako se AMP sintetie, pomislimo na neto kao to
komponenti. Formiranje biolokih molekula se ne odigrava na
-
W
*
*
-
je od jednostavnog. u kojim koracima su nam potrebni.
Prva dva koraka u sintezi AMP-a nisu prikazana na slici 7-1
molekul, uglavnom morate da uzmete stare molekule i spojite
njihove delove. To je kao uzimanje kule sa zamka od Tinkertoj
ugljenika i jedan kiseonik. Za tri ugljenika iz prstena vezani su ato-
-
ka. U prvom koraku sinteze AMP-a enzim I prebacuje grupu od dva
- atoma fosfora i est atoma kiseonika na jedan od kiseonika temelja,
-
im bezopasna imena kao prelazni oblik (intermedijer) IV (i IV)
ili enzim VII (e VII).
165 166
^
167 168
^
169 170
^
medijera XII su kruti, nesavitljivi kao lanci atoma koji su pretho-
molekul glicina, dve formil grupe iz THF-a u odvojenim koracima,
- i dva molekula asparaginske kiseline koji daju atome azota u dru-
ga dva koraka. Pored toga, u dva odvojena koraka, ostaci moleku-
prethodnom dodavanju formil grupe. Ali iako su dva niza koraka -
neophodno jer se oblik molekula promenio tokom sinteze, a enzi- se dva prstena zatvorila. Svih trinaest koraka se odigravaju kako bi
se proizvela samo jedna vrsta molekula. Molekuli prekursori (pre-
Intermedijer XII predstavlja nukleotid zvan IMP, koji se kori- -
sti u nekim biomolekulima (na primer, jedan poseban tip RNK koji visnu ulogu; ne koriste se ni za ta drugo sem za proizvodnju AMP-a
i GMP-a.
adenina (koji predstavlja gornji deo AMP-a, bez temelja);5 osta-
molekula. To daje prelazni XIII oblik. Reakcija koristi energetsku
govoriti, koristi GTP. Ponovo, kao to se desilo i proli put kada je
-
smrt bilo kog poznatog organizma.
azota.
6 Uvideli su da
- -
skih kiselina.
cionisti smatraju da su bili obilni u ranim danima Zemlje formi-
rati adenin pod pravim uslovima. Jednostavnost reakcije je to-
liko impresionirala Stenlija Milera (Stanley Miller) da ju je nazvao
7
blem koji vreba u pozadini: cijanovodonik i amonijak se ne ko-
rintu, pa mi dopustite da sumiram biosintezu AMP-a. Sinteza se -
ma, IX, katalizuje dva koraka. Pored molekula osnove, ribozo-5-
-
-
kakve informacije o tome kako se put za proizvodnju molekula
cima, jedan molekul GTP-a, jedan molekul ugljen-dioksida, dva
171 172
^
-
ska imena) ribozo-5-fosfat, glutamin, asparaginsku kiselinu, glicin,
N10-formil-THF, ugljen-dioksid, i energetske pakete ATP-a i GTP-a
-
tavili ih da stoje dugo (recimo, hiljadu ili milion godina) ne bismo
dobili ni malo AMP-a.8 Da je Stenli Miler pomeao ove hemikalije nemaju drugu upotrebu osim to su prethodnici proizvoda D, ka-
kva je prednost za organizam da proizvodi samo A? Ili, ako proiz-
Cipele bi mogle da budu sve to nam treba da stignemo do Rima -
- putevi u kojima prelazna jedinjenja nisu korisna predstavljaju ve-
gli sa Marsa, bila bi nam potrebna visoko tehnoloka oprema. Da
potrebna visoko teholoka oprema: enzimi koji katalizuju reakci-
je ovog biohemijskog puta. U odsustvu enzima, AMP se jednosta- mrtva.
vno ne proizvodi reakcijama prikazanim na slici 7-1. Sutina je da
nego to su cipele prethodnice svemirskim brodovima. <
h
ABCD
D
u jedinjenje D preko prelaznih jedinjenja tj. intermedijera B i C.
Da li je put mogao postepeno da evoluira? Zavisi. Ako su A, B, i C
h
-
- W
173 174
^
- -
menom organizmu glasi, na primer, ABCD, onda je D bio lokarboksamid) ribotid (intermedijer IX). Teko je verovati zato
to, kada date prava imena hemikalijama, onda morate da izne-
- sete prave hemijske reakcije koje bi mogle da ih proizvedu. Niko
Problemi sa ABCD teorijom su bezbrojni. Pogledajmo
-
nekoliko istaknutijih. Prvo, osim prelaznog oblika (intermedijera)
-
, popularnom
oblika u biosintezi AMP-a.11-
-
vanjem amonijaka i cijanovodonika, biohemijski prekursori ade-
son (Watson), predsednik Nacionalne akademije nauka, Brus Al-
nina se ne mogu dobiti. Drugo, postoje dobri hemijski razlozi za
miljenje da se prelazni oblici u biohemijskom putu ne mogu proiz-
enzimi nisu dostupni za odigravanje reakcija ka intermedijerima
: V i XI, jon mravlje kiseline bi verovatnije reagovao na neproduk-
< -
zite da bi ti enzimi morali da budu dostupni pre nego to bi enzimi
za naredne korake mogli da se razviju, jer u suprotnom, ovi dru-
-
nostavno preobratiti B u C. Na kraju krajeva, nalaze se jedno pored
drugog u abecedi. A odakle dobijamo A, B i ostala? Iz primordi- -
jalne abecedne supe, naravno.
-
Stvar je u tome da niko ne stavlja prava hemijska imena ni
bu ATP energetskih kuglica, energija bi se rasipala. Zapazite jo
na jedno od mitskih slova u ABC -
jednom da bi enzimi koji su neophodni za usmeravanje tih kora-
ka bili potrebni pre nego to bi organizam imao jedinjenje koje se
se knjige koriste za obrazovanje postdiplomaca koji bi lako mo-
proizvodi u narednom koraku puta.
gli da prate detaljna objanjenja. Svakako da nije teko zamisliti
BC -
- medijera u putu hemijski nestabilni. Tako da i kada bi, nasuprot
-
ne bi bili dostupni za nastavljanje puta. Postoje i drugi razlozi koji
5-aminoimidazol-4-karboksilat ribotid (intermedijer VIII) stajao bi se mogli izneti protiv ABC
175 176
^
K <
h
(The Closing of the American Mind) Alena Bluma (Allan Bloom).
d
Ovde je izvor objanjenja razvoja biohemijskih puteva koja iz-
Tako je govorio Zaratu- -
stra.12 -
da gena je bila nepoznata, kao i strukture nukleinskih kiselina i
- proteina. Nikakvi eksperimenti jo uvek nisu bili izvreni kako
bi se utvrdilo da li je posebna vrsta hemijske sredine kakvu je
na koji svet funkcionie jednostavno pokupljene bez razmiljanja
izuzetno napredovala, ali napredak ne ide u prilog njegovoj hipo-
ABC
nego to se smatralo u Horovicevo vreme. Postoje dobri hemij-
-
Sciences. Horovic vidi problem:
W takva sredina nastala se sada rastegao na poslednjih pedeset go-
-
13 ,
Ali postoji nada:
pesme Mack the Knife.
h
-
reni. Dobitnik Nobelove nagrade Kristijan de Div (Christian de
Duve), u svojoj knjizi
-
K
ma se jednostavno desilo da puno malih proteina ima sposobnost
K
zni oblici u AMP putu. Da bi ilustrovao teoriju, daje sliku u kojoj su
prema slovima A, B, C, i
W
177 178
^
179 180
^
-
lisana sinteza AMP-a (skicirana na slici 7-2).
^ -
Z DW -
vi AMP, intermedijer I se tada koristi kao gorivo za proizvodnju
ATP-a.
Intermedijer I
ADP, GDP B stvari, kada se jednom preobrazi u intermedijer III, molekul se
Intermedijer II
AMP, ADP, ATP, -
B Intermedijer II la s kojim reaguje, poseduje dva druga mesta za vezivanje na svo-
GMP, GDP, GTP
Intermedijer III
funkcionie sporije; ako su oba mesta popunjena, funkcionie jo
sporije. tavie, pored mesta na kome se odigrava reakcija, enzim
i reaktant. Vezivanje intermedijera II za drugo mesto ubrzava rad
-
Intermedijer XII
Sinteza je regulisana i na jo nekoliko drugih mesta. Nakon
AMP B GTP GMP B ATP
to je proizveden IMP, put se deli da bi proizvodio ili AMP ili GMP.
Enzim XII, koji katalizuje prvi korak od IMP-a ka AMP-u, biva uspo-
GMP-u je inhibirana vikom GMP-a. (Za razliku od kralja Mide, enzi-
AMP GMP
enzim XII koristi GTP kao energetsku kuglicu jer, ako se uokolo
Enzim I zahteva ATP energetsku kuglicu da bi preobrazio ri-
nalazi puno GTP-a, potrebno je vie A nukleotida (AMP, ADP, i
bozo-5-fosfat (temelj) u prelazni oblik (intermedijer) II. Enzim
-
181 182
^
K
-
-
neuspeha regulacije AMP sinteze se zove Lesch-Nyhan-ov sin-
drom. Kod Lesch-Nyhan-ovog sindroma enzim potreban za recikli-
nije stigla dotle. Druga strana je zaista daleko.
ili je neaktivan; to indiretkno izaziva nagomilavanje intermedijera
-
^
-
-
stvene usne i prste.
pogledu ove knjige. U 3. i 6. poglavlju govorim o nekoliko neuma-
-
na pravom nivou: ni previe, ni premalo, i u pravom odnosu sa
je problem. Poto sam potroio puno vremena na tim sistemima,
-
nisam imao vremena da se pozabavim i drugim sistemima, to ne
nizme pre pojave novog katalizatora. Ali bi pojava novog, nereguli-
sanog puta, daleko od toga da predstavlja blagodat, za organizam
elektrona, sinteze telomera, fotosinteze, regulacije transkripcije, i
su se navodno razvijale korak po korak, i koje bi imale malo pro-
-
*
i Haribde regulacije.
Niko nema pojma kako se AMP put razvio. Iako je nekoliko
alizmu, niko nije pisao o prepreci koju postavlja potreba za regu-
,
ili kada stignu eksperimentalni rezultati pokazuju kao veliki
183 184
^
Ideja koju je ponudio Horovic je bila dobra u svoje vreme.
-
dine prolazile i nauka napredovala, preduslovi za njegovu emu su
-
-
-
185
Trei deo
ta nam kutija govori?
. poglavlje
Objavljuj ili nestani -
nuti, a koji problemi se, pak, ignoriu. Pogled unazad na prolu de-
ceniju pokazuju da se radovi u
tri odvojene kategorije: hemijska sinteza molekula za koje se sma-
-
h
-
vodi vreme u napornom radu na izolovanju proteina, analiziranju -
-
- uopte pojavio? Radovi koji se bave hemijskom sintezom moleku-
mijski sistemi neobjanjeni, kakvi su biohemijski radovi bili obja-
vljaju oko 10 procenata svih radova u
.
- svetskog rata u laboratoriji dobitnika Nobelove nagrade Harolda
-
,
. koje su hemikalije mogle da budu prisutne pre vie milijardi godi-
Pokrenut 1971. godine,
element u svemiru. Kada vodonik reaguje sa ugljenikom, azotom i
-
(Emile Zuckerkandl), koji je (zajedno sa Linusom Paulingom) prvi metan, amonijak, vodenu paru i vodonik.1
Metan, amonijak, vodena para i vodonik su generalno neak-
tivni. Miler je znao da je, da bi naveo gasove da proizvedu potenci-
energije u sistem da bi uskomeao stvari. Izvor energije koji bi bio
189 190
K
e
-
pionirskog eksperimenta? Ispostavlja se da uspeh, iako realan,
bledi pred obiljem problema koji se mogu shvatiti samo kad se
situacija razmotri detaljnije od jednostavne hemijske proizvodnje
-
problema.
-
- kupi neto hemikalija, izmeri ih u pravim proporcijama, rastvori
set vrsta aminokiselina je otkriveno u eksperimentima porekla
191 192
K
193 194
K
herojsku borbu protiv eksperimentalnih podataka.
(koji navodno predstavljaju retka mesta kao to su obodi vulkana)
zamiljanjem formiranja nukleinskih kiselina kao to je RNK. Veliki
od nekoliko komponenti, a procesi koji formiraju komponente
blem proizvodnje pravih proteina. U svojoj knjizi koja daje
e
jednoglasnost miljenja:
W
^D'
'D
brutalno iskreni:
^&3
E
W
ZE<
K
ZE< s
4
K
ZE<
tao E
195 196
K
ZE<
ne pokuavaju da testiraju evolucione scenarije na molekularnom
biologija je zarobljena u isti misaoni okvir koji je dominirao
opire objanjenju istom teorijom koja je tako dugo primenjivana
putu, o kome smo govorili u prethodnom poglavlju. Kao to nema
apsolutne prepreke nastanku proteina, nukleinskih kiselina, ili
bilo koje druge biohemikalije zamislivim, prirodnim hemijskim
poput: Da li se i druge aminokiseline koje Miler nije dobio
mogu proizvesti? ta ako je u drevnoj atmosferi preovladavao
u
4, CO, i CO2,8 Radioliza vodenih rastvora
prenose mrmote do trake 700 i posmatraju kako jedan prelazi do
hemijske evolucije,9
trake 701. To je herojski napor, ali ako ikada dosegnu do druge
sinteza urazola i njegovih ribozida,10 i Ciklizacija nukleotidnih
analoga kao prepreka polimerizaciji11. To su zanimljiva pitanja
treba da radi. Iako eksperimenti nisu ispali kako su se mnogi protiv bolesti.
prirodnim hemijskim procesima. E
Journal
7 , koja predstavlja oko 5 procenata njihovog
197 198
K
12 i
evolucionih stopa.13 tvrdi da je korelacija prouzrokovana nagomilavanjem mutacija u
koji se postepeni procesi ponaaju tokom vremena, matematika proteinima tokom vremena. Vodila se otra rasprava o moleku-
pretpostavlja
Krajem 1970-ih, brze i lake metode za sekvenciranje DNK
-
sekvencama. Neki geni su imali na desetine introna; drugi geni
drugim. Pitanje koje je odmah postavljeno bilo je da li su analogni
-
konjski hemoglobin, imali istu aminokiselinsku sekvencu. Odgovor -
-
Jour-
u preostalih 20. Kada su sekvence hemoglobina majmuna, pileta,
proteinskih sekvenci: Dvadeset sedam bakterijskih ferodoksina,14
- -
15 Filogenija proto-
16 i Rep-ka-repu ori-
jentacija gena za alfa i beta globin atlantskog lososa.17
-
ju pitanje koje nas u ovoj knjizi najvie zanima.18
se smatralo da su u dalekom srodstvu (kao tvor i kupus) nemaju
199 200
K
201 202
K
u PNAS-u
- rezultat: sekvence i sekvence, ali bez objanjenja.
putevi. Razlog za to je izgleda isti razlogu za neuspeh objanjenja
prostora za razvijanje ideja. Postavljanje novih ideja u kontekst,
-
W
-
Iako
- menoj evolucionoj literaturi predstavlja knjiga Neutralna teorija
molekularne evolucije (The Neutral Theory of Molecular Evolu-
- tion) Moto Kimure (Motoo Kimura).20 U knjizi je imao prostora da
posao; mutacije su neutralne. Drugi primer je
-
Proceedings
-
.
tano nastati samo-organizacijom.21 Nijedna knjiga ne objanjava
PNAS je objavio oko dvadeset hi- biohemijske strukture: Kimura se jednostavno bavi sekvencama,
te godine po kategorijama. Indeks pokazuje da se za tih deset go- su se javile biohemijske strukture.
dina oko 400 radova bavilo molekularnom evolucijom.19 To pred- -
-
lar Evolution objavljenih tokom istog vremenskog perioda. Broj
godinje objavljenih radova na ovu temu u PNAS-u
-
biohemijskih struktura skoro da ubija svaku ansu da postoji neka
knjiga objavljena po tom pitanju.
-
Tokom kompjuterske pretrage za knjigama o biohemijskoj evolu-
~
-
(John Gillespie) je objavljena 1991. godine pod primamljivim
naslovom Uzroci molekularne evolucije (The Causes of Molecular
203 204
K
- -
simbole, a zatim manipulie simbolima. Priroda je oguljena. (Morao -
-
i njegov neuspeh kao nauke na molekularnom nivou, moramo da
Druga knjiga, objavljena iste godine, je Evolucija na moleku-
larnom nivou (Evolution at the Molecular Level).22
-
jedna od mnogih akademskih knjiga koja predstavlja kolekci-
-
zitetu, i nekoliko puta je dopunjivan tokom godina. Na prvoj stra-
-
matematike, i bez odgovora. luciju. On postavlja pitanje zato biomolekuli koji se pojavljuju u
vljanje svojih zadataka:
skupova. Cold Spring Harbor Laboratories sa Long Ajlenda je to-
h
-
23 Kao D
predstavlja pregled onoga to se odigravalo u laboratoriji autora u
-
skih sistema.
D
205 206
K
teme u indeksu imaju viestruke unose, jer se moraju razmotri-
-
ja E. coli ima 42 unosa; a pod proteinima je uneseno 70 odred- ture izuzetnu anatomsku i biohemijsku adaptaciju, usavrenu evo-
nica. Ukupno, postoji skoro 6.000 unosa u indeks, ali samo 2 lucijom.26
pod nazivom evolucija. Prvi citat je iz rasprave o proteinskim
- da objasne kako je kit uljetura stekao strukture koje poseduje.
-
-
-
- larna mainerija nastala korak-po-korak. Ni u jednom trenutku
-
-
-
-
Dejvid Nelson sa Univerziteta u Viskonsinu su dopunili i obra- John Wiley & Sons 1982. godine; nova izdanja
su usledila 1986. i 1992. godine. Prvo izdanje ima oko 2.500 uno-
na listu ciljeva:
u Severnoj Karolini, koji je objavio , je je-
Zaista, u indeksu novog izdanja postoje 22 odrednice na evolu-
koju je izvrio Fridrih Veler (Friedrich Whler) 1928. godine. Po-
glavlje ne spominje Darvina ni evoluciju. U tri izdanja Armstrong-
ove knjige autor je smatrao da nije neophodno spomenuti evoluci-
evolucija John Wiley & Sons
mahanje nad misterijama. Na primer, jedan citat je iz evolucija,
207 208
K
d nizmi su evoluirali i prilagodili se na promenljive uslove na
K 27 Nita drugo
h h
se od
unosa u nose na
Autor Godina / indeks
> t
> t
rni stav.28
> t
:t^
:t^ -
t>
^ &
^ &
^ &
^ &
ss :t^
ss :t^
D,
, W, se nikada ne ostvaruje.29
D W,
t
D
t
t -
Kh
Kh
Kh
^
: <
'' ,
t
^ :t^
:t^
<Z D',
' D',
da znate da je demokratija najbolji oblik vladavine, da znate put
209 210
K
-
- stvari ili kroz sopstveno iskustvo ili preko autoriteta. Votson i Krik
su 1950-ih razmatrali difrakcioni obrazac proizveden snopom X
-
- sobnosti, odredili da je DNK u obliku dvostrukog heliksa (spi-
rale). To su znali radom, iz sopstvenog iskustva. Kao student, ja
-
veo eksperiment da bih to proverio; oslanjam se na autoritet. Svi
-
stvenog iskustva. Tako skoro svaka osoba koja je ila u kolu ve-
nje. Oslanjate se na autoritet ako, kada vas pitaju da li znate put do to je on sproveo u svojoj laboratoriji.
Lepa stvar u vezi nauke je da je autoritet lako locirati: nalazi se
Nature. Struktura holesterola i druge stvari se
da je demokratija bolja u odnosu na druge oblike vladavine iako
-
-
godine? Ako vas primoraju, mogli biste da priznate da ih nijedan
se bazira na objavljenim radovima, a ne na razmiljanjima pojedi-
oslanjate na autoritet. tavie, ne posedujete informaciju iz prve e-
kaze. Da je Votson objavio samo izjavu o uvijenom obliku DNK u
stav ne zasnivate na njihovoj igri u nedavnoj prolosti, koja se kre-
podlogu naoj tvrdnji.
-
skog sistema bilo odigrala ili uopte mogla da se odigra. Postoje
211 212
K
ne zna za molekularnu evoluciju iz direktnog iskustva, i poto . poglavlje
nema autoriteta na kome bi se zasnovale tvrdnje o tom znanju,
- Inteligentni dizajn
akademici uzimaju za ozbiljno. Ako ne objavite svoj rad da bi ga a
-
-
liranju, molekularna evolucija se nikada nije pozabavila pitanjem
prema tome, to nije objavila, pa treba da nestane.
-
iznese detaljan opis kako je cilija, ili vid, ili zgruavanje krvi, ili bilo
kako onda?
delova neprestano ne poboljava funkcionisanje sistema, onda se
-
ma. Razmotrimo ukratko te predloge, a zatim dublje razmotrimo
Prvu alternativu gradualizmu je zastupala Lin Margulis. Ume-
213 214
/
- izbledeli kada su nove tehnike sekvenciranja, razvijene nakon to
- -
na, Margulis je na kraju dobila nedragovoljno odobravanje a za- -
tim i prihvatanje (primljena je u Nacionalnu akademiju nauka) za
tavie, zastupnici simbiotskog porekla su ukazali na simbiotske
-
molekularnim mainama uredno razdvojenim u mnoge zasebne ju. Na primer, jedna vrsta pljosnatih crva nema usta jer nikada ne
-
bim mikroskopom iz 17. veka. Manji odeljci nisu otkriveni dok
poboljani mikroskopi nisu postali dostupni krajem 19. i u 20.
veku. Jedan od manjih odeljaka je mitohondrija.
-
- -
postavimo da je simbioza kakvu je Margulis zamislila bila u stvari
-
je iz hrane i njeno skladitenje u hemijski stabilnom, a ipak lako
dostupnom obliku. Mitohondrijalni mehanizmi koji to vre su biohemijskih sistema?
-
-
-
. U
komponenti. -
-
-
-
-
stila simbiontu.
-
-
-
-
215 216
/
217 218
/
219 220
/
221 222
/
e
da je obrazac rezultat inteligentnog dizajna. bilo bi vam potrebno vie informacija pre nego to biste mogli da
budete sigurni da nepoznati geoloki procesi prirodni za tu pla-
netu nisu proizveli ipke. Nasuprot tome, ako biste pronali de-
setak miolovki u blizini vulkana, uplaeno biste se osvrtali
(na primer, raspored puzavica i grana u umi za sklapanje zamke),
la iz gomile, cela gomila je krenula sa njom. Kada ste pritisnu-
li polugu ona je glatko skliznula na jednu stranu gomile i povu- .
-
- toku; da li bismo to trebali razmatrati? Ne. Pri razmatranju dizajna,
funkcija sistema koju moramo da razmatramo je ona koja zahteva
-
cenjujemo koliko dobro delovi odgovaraju funkciji.4
mogu da ukazuju na dizajn. Na primer, pretpostavimo da sa pri-
za granu drveta. Nakon to ga oslobodite, rekonstruiete zamku.
mieva. Umesto toga bi mogla da je koristi za odbranu od proval-
,
nika ili kao sistem za upozorenje od zemljotresa (ako bi vibracije
aktivirale zamku), ali i dalje na osnovu posmatranja kako delo-
-
-
-
gentnog dizajna.
<
223 224
/
Nemamo predstavu ko je sastavio napravu sa otpada, ili zamku sa
puzavicom, niti zato. Svejedno, znamo da su sve te stvari dizajni-
nja nekog cilja.
-
kakvog znanja o dizajneru.
-
mene blokove, zatrpane desetine stopa pod zemljom, sa slikama
E
,
zajnirana (jedna cela padina ove planine je isklesana tako da pri-
2001: Odiseja u svemiru (2001: A Space Odyssey)
-
nine i videti samo neznatne naznake lica u stenama. Da li bi osoba
pluta u svemiru. Siguran sam da je imao neki dubok smisao, ali mi -
-
bi mogli da prepoznaju planinu Ramor ako bi mogli da vide bar
U svom vijuganju naiao je na glatko oblikovan obelisk koji se
formaciju.
obelisk. Film nam je kasnije pokazao da su vanzemaljci bili na Ju-
-
-
-
laska astronauta koji ga je kasnije pronaao). Da se zaplet zaista ,National Enquirer je
225 226
/
Lako je videti dizajn u Elvisovim posterima, miolovkama i
-
mogu biti inteligentno dizajnirani? Nije prolo ba mnogo vreme-
- ler (Friedrich Wohler) je pobio tu ideju. Dugo vremena nakon toga,
-
Serratia marcescens bakterija koja raste u crvenim
slojevima. Pretpostavimo da su tu bile i kolonije kvasca Saccharo- skog dizajna.
myces cerevisiaePseudomo-
nas aeruginosa, koje je zelena, i Chromobacterium violaceum, koja
Staphylococcus aureus
da su zeleni mikroorganizmi rasli u obliku Elvisovih pantalona, a
bojom mesa. pokuavaju da u laboratoriji proizvedu novi protein
obavi posao bolje.6-
- gi proteini sistema za zgruavanje krvi se aktiviraju drugim fakto-
koji se odseca cilja samo njegov aktivator i nijedan drugi. Plazmi-
ima metu koja se iseca veoma sporo, nakon to se ugruak formirao
- odmah neopodan na mestu na kome se nalazi krvni ugruak koji
-
jenim traftama i imenom, mislili bismo da su dizajnirani. Kako
su izolovali i izmenili gen za plazminogen. Zamenjuje se deo gena
koji kodira mesto u plazminogenu koje se iseca da bi se aktivirao
5
da je tako detaljan sistem kao to je celovit bakterijski Elvis - di- protein. Zamenjen je delom gena za drugu komponentu puta za
zajniran. zgruavanje krvi (kao to je prethodnik plazma tromboplastina,
-
227 228
/
229 230
/
sposobnost vezivanja vitamina ili proteina. To se vri meanjem -
- ti virus, sekvencirati njegovu DNK, i deifrovati njegov kod. Poto
rastvora. Delovi DNK ili RNK koji vezuju vitamin ili protein ostaju ljudi koji nita ne znaju o dizajniranju svejedno mogu da ga regis-
- truju, onda se pitanje da li je biohemijski sistem bio dizajniran jed-
ni. Nakon odabiranja pravih delova eksperimentator koristi enzi- nostavno svodi na iznoenje dokaza koji podupiru dizajn.
-
pulacije molekula odabira one koji najbolje ispoljavju osobinu.8
Kao i selektivni uzgoj, metod ima prednosti mikroevolucije, ali -
gi biohemijski sistemi ne mogu nastati prirodnim odabiranjem
koje deluje na mutacije: ne postoji nijedan direktan, postepen put
ovoj knjizi.
vore protiv neusmerenog razvoja biohemijskih sistema koji proiz-
vode molekule kao to je AMP. Alternative gradualizmu koje se za-
sposobnost imunog sistema da proizvodi antitela protiv skoro snivaju na neinteligentnim uzrocima, kao to su teorije simbioze
resa (na primer, lek) i izoluju antitela koja se proizvedu protiv
proizvesti antitela koja se ponaaju kao jednostavni enzimi9 (na-
Da li bi mogao da postoji jo uvek neotkriven prirodni proces
, -
ako takav proces postoji, niko nema predstavu kako bi delovao.
Dalje, delovao bi nasuprot celokupnom ljudskom iskustvu, kao i
pretpostavka da bi prirodni proces mogao da objasni kompjutere.
10
231 232
/
233 234
/
- snazi vezivanja kiseonika rezultuje ponaanjem zvanim koopera-
-
-
-
dan kiseonik se ne vezuje za hemoglobin daleko manje nego to
- bi se vezivalo da ne postoji kooperativnost. Sa druge strane, kada
je u perifernim tkivima).
-
nika za mioglobin nije kooperativno. Pitanje je, ako pretpostavimo
-
-
- -
brana. Kao kamenje u kamenom zidu, svaka komponenta se lako
-
Ili razmotrimo hemoglobin protein u crvenim krvnim zrnci-
-
vidite da slika ima upisano ime umetnika u donjem uglu, ali su
235 236
/
. poglavlje
Poto je tako puno koraka potrebno za proizvodnju AMP-a,
-
Pitanja o dizajnu
- :
-
sistem.
Poto bi bilo ta moglo da bude dizajnirano, i poto moramo da kli unaokolo u kolima koja su vukli konji i koja su klizala na mot-
-
hemijskog sistema, a manje uspeni kod drugog. Samo za neke -
-
da su dizajnirane.
-
Fonetska azbuka stoji kao suprotnost u odnosu na sistem pisa-
zvuk
237 238
W
239 240
W
'
Slepi
(The Blind Watchmaker) je dobila naslov po Pejlijevom
-
W
s W
K
slepi
W ^
W W
-
-
3
-
Iako u Prirodnoj Teologiji nauke u borbi da objasni svet.
-
-
gim stvarima, Pejli pie o diskretnim (zasebnim) sistemima, kao
-
-
funkcioniu ako bi jedna od nekoliko komponenti nedostajala. To
ment osporenog Pejlija nikada nije pobijen. Ni Darvin ni Dokins,
-
-
Pejlijev argument je bio gurnut u stranu napadima na nerazumne
primere i teoloke rasprave van ove teme. Pejlija, naravno, treba
bio crna kutija; njegovi delovi i njihove uloge su bili poznati.
241 242
W
243 244
W
245 246
W
a ,
suprotstavljenih objanjenja o inteligentnom dizajnu i neusme-
D, renim prirodnim procesima, Pejlijev argument izgledao verova-
K tniji.
-
ta u Viskonsinu, u svojoj knjizi , nam detaljnije
objanjava Hjumovo razmiljanje:
,
<
E
E -
11
-
/,
W
Savremena biohemija bi verovatno mogla
^
-
tavie, poznato je da biohemijske komponente mogu da deluju
biolokih orga-
-
ma. Hjumova kritika argumenta za dizajn koja zastupa sutinsku
-
-
gli da uporedite kola sa avionom, iako oba predstavljaju prevo-
Sober nastavlja svoju analizu Hjuma:
zna sredstva, jer avion ima krila, a kola ih nemaju, i tako dalje. So-
ber odbacuje Hjumovo razmiljanje, jer on tvrdi da je argument za ^ ,
inteligentni dizajn u stvari neto to se zove pozivanje na najbolje ,
247 248
W
naem sve
-
drugih
13
Hjum kritikuje dizajn kao argument indukcijom. Primer induk-
-
Filozo-
-
:
van na indukciji bi zahtevao da posedujemo iskustvo o dizajnira-
- Z^
^
svetovima, onda nemamo iskustvo iz koga bismo izveli indukci- W
ju. Sober smatra da Hjumov argument nije valjan jer, ponovo, So-
ber smatra da je inteligentni dizajn u stvari pozivanje na najbolje
objanjenje, a ne induktivni argument.
<
je mogao da ide dalje. Iako je Hjumova zamerka iduktivnom argu- WW
:
napretkom nauke. Savremena biohemija rutinski dizajnira biohe- :D/^>/D::s s
:D/^>/D::s
Prema tome imamo i iskustvo posmatranja inteligentnog dizajna
eksperimenata u kojima su sastavljeni novi biohemijski sistemi, a
W
Neuspeh Dejvida Hjuma je naveo savremene protivnike dizajna <:D/^
>/D::s
K
W s
-
249 250
W
251 252
W
a
sa argumentom o nesavrenosti.
K s
Najosnovniji problem je da argument o dizajnu uopte zahteva
&
da ne traje koliko bi mogao, zbog razloga koji prevazilaze samo
/
E
E
Jo jedan problem sa argumentom o nesavrenosti je da
K
ne bi osim ako vam dizajner posebno ne navede koji su to razlozi.
Z
E d
<
svrhe, ili zbog nekog nepojmljivog razloga ili bez njega. Koliko
^
ligentnom dizajnu nije
(Freeman Dyson) je napisao:
- E
nenti radi ostvarivanja funkcije koju nijedna od sastavnih kompo-
Dd
253 254
W
255 256
W
257 258
W
milijardi godina i da su prenoeni do danas normalnim procesima
-
neselektivnih mutacija), protok gena (unos gena u populaciju iz
^
druge populacije), vezanost gena (raspored dva gena na istom
Nastanak nekih biolokih poboljanja mutacijom i priro-
dnim odabiranjem evolucijom je po nekima sasvim saglasna
Gould) sa Harvarda je napravio veliku stvar od pandinog palca. ,
bambusa panda ih hvata apom sa kotanim izratajem koji
tvrdi da bi dizajner dao pandi pravi palac nasuprot ostalih prstiju,
a
evolucije, teorija inteligentnog dizajna je nova za savremenu
nauku, tako da postoji niz pitanja na koja treba odgovoriti i puno
posla stoji pred nama. Za one koji rade na molekularnom nivou,
pandi; nije dao objanjenje promena ponaanja koje bi bile
potrebne da bi se iskoristila prednost promene kotane strukture;
koji su mogli da se razviju drugim mehanizmima. Da bi doli
i nije spomenuo kako su pande jele pre nego to su stekle palac.
~
eksplozije, udar asteroida, ili ruku vajara. Oblik jedne stene je
259 260
W
. poglavlje
dizajnirane sisteme mogla da miruje dug vremenski period, Nauka, filozofija, religija
ili bi informacija morala da se doda neposredno pre nego to
Tokom poslednje decenije savremena biohemija je otkrila tajne
-
molekularnom nivou je sastavljeno na osnovu bezbrojnih ekspe-
-
komponentne neumanjivosti. -
trole. Radovi su objavljivani, rezultati proveravani, kritike pisane,
jasan, prodoran uzvik Dizajn
e
eksperimentalne pristupe i nove hipoteze koje u suprotnom ne
korisno sredstvo za napredak nauke u oblasti koja je decenijama
bila na umoru. pobede, ostvarene uz tako veliku cenu uz neprekidan napor tokom
niza decenija, proslavlja u laboratorijama irom sveta. Ovaj trijumf
bude izgovor za uzimanje slobodnog dana.
261 262
E
uvede trupe u bitku kako bi peadija dobila zasluge za pobedu, iako
zatim zure u zemlju, odmahuju glavama i ostavljaju da ostane na iskoristi za neto drugo.
tome.
daleko od toga. Ankete pokazuju da vie od 90 procenata
Amerikanaca veruje u Boga, a da oko polovina njih redovno
apira,
biznismena se okupljaju radi molitava. Bolnice i aerodromi imaju
. Nakon to je
kapele; vojska i kongres zapoljavaju svetenike. Mi kao zemlja
e
delovanje bilo duboko ukorenjeno u veru u Boga. Uz svo ovo javno
odobravanje, zato je nauci teko da prihvati teoriju koja podupire
:
E
<
ali pokuajmo da ih malo razmrsimo.
h
D
s
1
e
svoje grane delatnosti, jer je odbrana zemlje dostojna svrha.
263 264
E
preko babe ili dede? Haksli je promrljao neto kao: Gospod mi ga
je udobno daleko.
iz biologije. Na kraju svog izlaganja Haksli je objavio da ne zna
Neko nepristrasan bi mogao da pomisli da, ako nijedna od
da li je srodnik majmunu preko babe ili dede, ali da bi radije bio
a koristi ga kako ga je ovaj svetenik koristio tog dana. Mnoge
e
lucione nauke i teologije je bio sudski proces Skoups (Scopes).
Dejtonu, u Tenesiju, se 1925. godine dobrovoljno prijavio da bude
advokata Klerensa Deroua (Darrow) na strani odbrane i Vilijema
podataka.
inteligentnog dizajna nikakav.
>
Drugi razlog za protivljenje nauke da se pozabavi ranije
pomenutim slonom proizilazi iz istorije. Od kada je prvi put
Darvinove teorije evolucije. Po nekima, ovakav odnos je verovatno
uspostavljen kada je anglikanski svetenik Semjuel Vilberfors
(Samuel Wilberforce) raspravljao sa Tomasom Henrijem Hakslijem
dana nakon to je Darvinova pionirska knjiga objavljena. Izveteno
je da je svetenik dobar teolog ali slab biolog zavrio svoj govor
265 266
E
na obe strane, i nakupilo se mnogo netrpeljivosti. Ta netrpeljivost
Science Education) je uspostavljena pre desetak godina u vreme
opravdanaosti koncepta biblijskog stvaranja (kreacionizma) koji
, je 1990.
pitanja. Razmotrimo ih.
W
Probni tekstovi su proli dobro, ali kada je Mims doao u Njujork
na zavrni intervju bio je upitan da li veruje u evoluciju. Mims je
odgovorio Pa, ne jer je verovao u biblijski izvetaj o stvaranju.
, , je
Naslediti vetar kakvu na hiljade postdiplomaca ima na umu kao svoj posao danju
je Mims afera iako nemaju nikakve direktne veze sa pravim
Perspectives on Science and Christian Faith
od tabora.
267 268
E
razlog da smatra da ne postoji nita iznad prirode, ali misli da nau-
ka nije dobra ako nudi natprirodno kao objanjenje za prirodan
ideje iskreno je pokuao da predstavi ono za ta je mislio da su
razumna i ubedljiva gledita osobama sa suprotnim gleditima:
Ed nema razloga smatrati da se cifra od 90 procenata opte populaci-
4
WZ
meanja hemikalija u epruveti; ne predstavlja proverljivu hipote-
K
W
a -
d
D
-
ta.
ka spoznaji realnog sveta, a neki (kao Galileo) su platili cenu za
se poziva samo na prirodne uzroke, i da daje objanjenja ukaziva-
njem samo na prirodne zakone.3
ono to se podrazumeva izrazom Razmotrimo koliko daleko.
predan pokuaj iznoenja istinitih
- .
zi pokazali da natprirodno nikada nije uticalo na prirodu (za one
koji su zabrinuti zbog izraza natprirodno, zamenite to slobodno sa
ispitivanju. Niko ne bi veoma dugo zastupao takav stav ozbiljno
via inteligencija). Umesto toga, on tvrdi da u principu, nauka ne
treba da se poziva na natprirodno. Jasna posledica je da se ne tre-
bi verovatno brzo povukao svoju izjavu ako bi morao da je brani
ba prizivati, bez obzira da li je . Za nau procenu nje-
a priori
269 270
E
271 272
E
,
-
-
da postoji neto iznad prirode. Oni
-
oni unose u svoju nauku a priori
krhka da bi se njen zdravi skepticizam preobratio u naivnost.
Drugi razlog za zabrinutost koji bi mogao da stoji iza Diker-
-
- &
ti u epruvetu? Ne, naravno da ne. Problem je to, kad god nauka
d
E
-
- -
kersona je da, iako autor svakako nije to nameravao, on predstavlja E
273 274
E
Teorija je sebe opravdala pozivanjem na opservacione podatke naziva imaginarnim vremenom. Druga ideja je da postoji
na irenje Univerzuma - a ne pozivanjem na svete tekstove ili -
-
opservacionih podataka a ne iz proivoljnog kalupa raznih reli- larizovana pod imenom Antropijski princip. U sutini antropij-
gioznih dogmi.
-
Ipak treba primetiti da teorija Velikog praska, iako prijatelj-
-
vom pokuaju da osmisle alternativne modele koji bi se uklopili u
verovatno jer nisu sasvim sigurni gde bismo smestili sve te
-
kreditovana, iznikle su druge teorije koje bi preduhitrile i uklonile
-
stvom gravitacije, celokupna materija bi se ponovo zgusnula. Oda-
-
i beskrajna ponavljanja ovog ciklusa bi ponovo osvojili vremen-
8
-
rastih svemira, imaginarnog vremena ili bezbrojnih antropijskih
svemira. Zaista, izgleda da ih nijedan eksperiment u principu ne
-
-
rom. A i kad bi ovaj model pao, stalno se pojavljuju nove teorijske -
-
275 276
E
277 278
E
vnim verovanjima je iznova dovodilo do katastrofa. Netolerancija
se ne javlja kada mislim da sam otkrio istinu. Javlja se samo kada
neuk, glup, ili lud (ili zloban ali to radije ne bih razmatrao).10 Nije
potreban veliki korak od nazivanja nekog zlobnim do preduzima-
mogu da budu sopstveni vanzemaljci, sopstvena napredna civi-
Nature
paradoksa (kao na primer da unuci grle dedu i babu pre nego to -
- trati za anti-nauku.11 U svojoj skorijoj knjizi Darvinova opasna
ideja-
neprijatne teoloke implikacije. -
U nudom) da dezinformiu svoju decu po pitanju istinitosti evolu-
12 To nije
9- mir. Jedno je pokuati ubediti nekog raspravom; sasvim je drugo
bi rekla Dokinsu da na nebesima i Zemlji postoji vie stvari nego
intelektualno spokojan ateista.13 Neuspeh Darvinove teorije na
-
Niti bi trebalo da pokuavaju. Svaka osoba ima dostupne po- -
-
da budu pisani sa jasnim izjavama da je Bog to uradio? Ne. Nau-
-
-
teorija, kao to su gravitacija ili elektromagnetizam, da organizuju
tanja. Na primer, Njutn je odbio da objasni ta izaziva gravitaciju,
-
Maksvel je odbio da precizira medijum za svetlosne talase kada
ski principi koji obrazuju predstavu realnosti i teoloki principi, ili
je postojanje etra negirano, a kosmolozi su kolektivno ignorisa-
,
bude slobodan da traga za dobrim, istinitim, i lepim.
279 280
E
bila retka.
nauka odmah pozabavila njime, rado se zaboravlja dok se druga,
Zemlja rotira; niko nije mogao to da vidi. Ali vrtela se jeste. Sa
ima neto da doda.
^
oduvek bile na zemlji; svet je nekad bio nastanjen ogromnim, stra-
objekti predstavljaju uglavnom prazan prostor, da subatomske
-
-
hemiju, da se umea. Pokazalo se da je jednostavnost za koju se
(koji iznose neki teisti) da nauka treba da izbegava teorije koje
Njihov strah da bi natprirodna objanjenja preplavila nauku je
neosnovan.
kao na rezultat jednostavnih prirodnih zakona. Ali i druga vreme-
-
na su imala svoje okove, i nema razloga pretpostaviti da smo mi
pu da ne postoji nita izvan prirode, ometa teoriju koja prirodno
,
-
averzija ne treba da bude presudna.
-
-
lokupan napredak nauke tokom poslednjih nekoliko stotina go-
281 282
E
Dodatak
Hemija ivota
-
-
teinima i nukleinskim kiselinama, i ukratko, mastima i ugljenim
informacija prevodi i prenosi. Naravno, na tako malom prostoru
-
-
-
C. elegans
-
koncentracije koje se razlikuju od onih koje preovladavaju spolja.
283 284
Dodatak
-
joj unutranjosti tako da budu dostupne za proizvodnju energije,
-
^
^
*
-
vodonici kao to je benzin, ne meaju se dobro sa vodom. To je deo
molekula koji voli ulje. Takvi regioni molekula se nazivaju hidro-
-
prot tome, uglavnom ima hemijsku grupu koja, kao kuhinjska so ili
(vole eukari-
vodu). Dva suprotna dela membranskih molekula su hemijski otske
prokariotske, koje nemaju tu odliku.1 Prokari-
puno jednostavniji od eukariota.
-
-
kroskopom, prim.red.) prokariota.2 Jedna je nukleoid
- DNK (dezokiribonukleinska kiselina) koja udobno stoji u sredi-
povi zatite od vode, a da se istovremeno grupama koje je vole ni citoplazme-
dopusti pristup vodi je formiranjem dva sloja (slika A-1), nazvanih .
lipidni dvosloj-
i on je krut ali i slobodno propustan za hranljive materije i manje
zatvaraju, kao mehur sapunice.
-
Poto je srednji deo membranskog dvosloja uljast, mno- pila je u velikoj meri nepozna-
gi molekuli koji su veoma skloni vodenoj sredini (kao to su soli ta. Bakterijski
rotira kao propeler kako bi pokretao prokariotski organizam.
285 286
Dodatak
koji su odvojeni od citoplazme sopstvenim membranama i na- tki ER sintetie lipide molekule masti.
(naz-
zivaju se organele
-
- stavlja gomilu naslaganih spljotenih membrana gde mnogi pro-
cije u odvojenim odeljcima. teini proizvedeni u ER-u odlaze radi dorade.
Prva specijalizovana organela je jedro *
sa velikim osmostranim otvorima zvanim jedarne pore Citoskelet
pore nisu pasivni otvori; to su aktivni vratari. Nijedan veliki -
molekul (kao to su proteini ili RNK) ne prolazi kroz jedarne pore skelet je sastavljen od tri glavna strukturna materijala: mikrotu-
jedra, i obrnuto. -
Niz drugih organela je rasut u citoplazmi. su
-
dve membrane. Kontrolisano sagorevanje molekula hranljivih
, tanji od mikrotubu-
-
odeljka proizvodi energiju, kao to protok vode preko brane proiz-
branu na pravim mestima. , koji su deblji
-
Lizozomi -
-
Hloro-
ma (videti 5. poglavlje). Kiselost u lizozomu je sto do hiljadu puta
plasti
-
nele imaju odgovornosti u proizvodnji energije. Hloroplasti
ni proteini otvore, a otvorene strukture zatim lako napadaju enzi-
mi koji vre razgradnju.
-
(ER) predstavlja obiman, spljoten, -
287 288
Dodatak
289 290
Dodatak
291 292
Dodatak
kiseonika peptidne veze usmeren direktno prema vodoniku pep-
-
skih ostataka pre nego to se spiralna struktura (ali ne obave-
-
sekundarne strukture pro-
-
-
strukture upakuju se naziva tercijarna struktura (slika A-3) pro-
ulje odvaja od vode kako bi formiralo poseban sloj, tako se i ulja-
^
293 294
Dodatak
e-
po svojoj bazi se jedan nukleotid razlikuje od drugog.
Dva nukleotida se mogu hemijski spojiti reakcijom fosfata jed-
nog nukleotida sa 3-OH grupom ugljeno-hidratnog dela drugog
ostaju zatvoreni u unutranjosti. Ako zatvoreni polarni atomi ne nukleotida (slika A-4). To jo uvek ostavlja slobodnu fosfatnu gru-
pu na jednom kraju i 3-OH grupu na drugom kraju, koje mogu
- dalje reagovati sa drugim nukleotidima. Ponavljanje ovog procesa
*
-
-
ja do 3 kraja.
,- *
lanaca. Postoji nekoliko biolokih klasa RNK. Prva se naziva -
maciona
-
vljenoj od nekoliko subjedinica. Na primer, hemoglobin, protein
Drugi tip RNK se naziva ribozomalna RNK (rRNK). Polinukleotidi
vljeni protein ima sposobnost vezivanja kiseonika koju nemaju
oformili ribozom, primarnu mainu za sintezu proteina. Posled-
- nja kategorija RNK se naziva transportna,
peptida je njegova kvatenerna struktura (slika A-3).
njem ribozoma.
^
Kao i proteini, nukleinske kiseline su polimeri malog bro-
ja gradivnih blokova, zvanih nukleotidi. Sam nukleotid ima neko- -
liko delova. Prvi deo je ugljeni hidrat, ili riboza (kod RNK) ili dezo- li razlog za to moramo da razmotrimo strukturu baza nukleotida
baza, bilo (Slika A-4). Nukleotidi se mogu podeliti na dve kategorije pu-
adenin (A), citozin (C), guanin (G) ili uracil (U). Ako je ugljeni hidrat
-
na), i pirimidine (C i T), koji imaju samo jedan prsten. Ako se A i T
prstena ugljenog hidrata (za 5-OH kraj) je vezana fosfatna grupa.
295 296
Dodatak
>
Druge dve glavne kategorije biomolekula su masti i polisaha-
i igraju niz uloga. Mogu se koristiti kao strukturni materijali, kao
to je celuloza koja se nalazi kod drvenastih biljaka; kao skladite
energije, kao to je glikogen koji se skladiti u jetri. Masti, za raz-
liku od proteina, nukleinskih kiselina i polisaharida, nisu poli-
-
rale velike strukture kao to su membrane.
d
DNK, skladite genetske informacije, predstavlja polinukleo-
/^W<'Z,
Outlines of Biochemistry:t^Ez
297 298
Dodatak
^
-
'
UUU & UCU UAU UGU
d
u polipeptidni jezik proteina.3 UUC nin UCC UAC UGC
^
UUA UCA UAA UGA ^
Tokom ranih 1960-tih godina kod je otkriven. Nobelovci Maral ^
UUG UCG UAG UGG d
Niremberg, Sivero Ohoa, H. Gobind Korana i njihovi saradnici su
CUU CCU CAU CGU
Leucin ,
CUC CCC CAC CGC
Prolin Arginin
CUA CCA CAA CGA
* '
CUG CCG CAG CGG
AUU ACU AAU AGU
Asparagin ^
istu aminokiselinu. Na primer ACU, ACC, ACA i ACG kodiraju za AUC / ACC AAC AGC
- d
AUA ACA AAA AGA
Lizin Arginin
AUG D ACG AAG AGG
- GUU GCU GAU GGU
dan od tih posebnih signala, zaustavlja svoju proizvodnju protei- GUC GCC GAC ska kiselina GGC
na na tom mestu. s Alanin Glicin
GUA GCA GAA ' GGA
GUG GCG GAG kiselina GGG
-
je zvane transkripcija i translacija
pravi RNK kopiju malog dela svoje DNK (koji zovemo gen), koji ko-
-
risti za sintezu proteina. stopu prepisivanja gena.
Transkripcija (prepisivanje) gena zahteva niz odluka, od ko-
subjedinica, zvani RNK polimeraza, vezuje za DNK. RNK polime-
raza se sastoji od pet polipeptidnih lanaca. Prvobitno se enzim
TCTTGACAT) zvana -35 region se javlja oko 35 nukleotida pre -
299 300
Dodatak
- otkriveni, ali dosta toga ostaje nejasno. Jedan od najjednostavnijih
otidna lanca jedan od drugog u tom regionu. To je neophodno da
aktivirani oblik ribonukleotida koji je komplementaran prvoj DNK
-
otid, komplementaran drugoj DNK bazi. dovoljno da proizvede sopstvenu maineriju za replikaciju tako da
Kada se jednom prva dva pravilna ribonukletida poklope sa
matricom, RNK polimeraza ih hemijski vezuje. Polimeraza se zatim
tako puno njegovih kopija da prsne. To se naziva ciklus
lizogeni ciklus.
Transkripcija prouzrokuje problem: kretanje polimeraze kroz
ispred polimeraze.4 To bi usporilo ili potpuno zaustavilo transkrip-
ciju da nije drugog proteina, zvanog topoizomeraza, koji odvija
bakteriofage.
-
e
-
jalnu DNK sekvencu. Kod prokariota to je palindromski5 region koji
se ispoljava je za enzim, zvan integraza, koji hemijski ubacuje
'
301 302
Dodatak
303 304
Dodatak
305 306
Dodatak
307 308
309 310
9. Endler, J. A., and McLellan, T. (1988) The Process of Evolu- 20. Eisner, T., Ball, G. E., Roach, B., Aeshansley, D. J., Eisner, M.,
tion: Toward a Newer Synthesis, Blankespoor, C. L., and Meinwald, J. (1989) Chemical Defense of an
Systematics, 19, 397. Ozanine Bombardier Beetle from New Guinea, Psyche, 96, 153.
- 21. Hitching, pp. 66-67.
gy, Cambridge University Press, Cambridge, England, chap. 9. 22. Dawkins, pp. 80-81.
11. Kaplan, M. (1967) Welcome to Participants u 23. Dawkins, pp. 85-86.
,
ed. P. S. Moorhead and M. M. Kaplan, Wistar Institute Press, Phila- 24. Darwin, C. (1872) , 6th ed. (1988), New
delphia, p. vii.
12. Schtzenberger, M. P. (1967) Algorithms and the Neo-Dar- 25. Dawkins, R. (1995) , Basic Books, New
winian Theory of Evolution u
, ed. P. S. Moorhead and M. M.
Kaplan, Wistar Institute Press, Philadelphia, p. 75.
3. poglavlje
, Oxford University
Press, Oxford, England, P. xiii.
G. (1995) Biochemistry
14. Smith, J. M. (1995) Life at the Edge of Chaos? New York Re- pp. 1253-1259.
view, March 2, pp. 28-30.
2. Postoje i drugi spojnici u ovom sistemu. Na primer, konta-
15. Mivart, St. G. (1871)
, Macmillan
and Co., London, p. 21.
16. Aneshansley, D. J., Eisner, T., Widom, J. M., and Widom, B.
(1969) Biochemistry at 100C: Explosive Secretory Discharge of mer takvog sistema.
Bombardier Beetles, Science, 165, 61; Crowson, R. A. (1981) The 3. Cavalier-Smith, T. (1978) The Evolutionary Origin and Phy-
logeny of Microtubules, Mitotic Spindles, and Eukarzote Flagella,
17. Hitching, F. (1982)
, Pan, London, p. BioSystems, 10, 93-114.
68. 4. Szathmarz, E. (1987) Early Evolution of Microtubules and
18 Dawkins, R. (1985) The Blind Watchmaker, W. W. Norton, Undulipodia, BioSystems, 20, 115-131.
London, pp. 86-87. 5. Bermudes, D., Margulis, L., and Tzertinis, G. (1986) Prokary-
19. Eisner, T., Attzgalle, A. B., Eisner, M., Aneshansley, D. J., and otic Origin of Undulipodia, -
Meinwald, J. (1991) Chemical Defense of a Preimitive Australian ence, 503, 187-197.
Bombardier Beetle (Carabidae): , Chemo- 6. Cavalier-Smith, T. (1992) The Number of Symbiotic Origins
ecology, 2, 29. of Organelles, BioSystems, 28, 91-106; Margulis L. (1992) Proto-
311 312
313 314
5. poglavlje *
ptica.
-
son, J. D. (1994) , 3rd ed., Garland Pub- *
-
2. Kornfeld, S., and Sly, W. S. (1995) I-Cell Disease and Pseudo-
Hurler Polydystrophy: Disorders of Lysosomal Enzime Phospho- log za postojanje isprekidanih gena ostaje misterija.
rylation and Localization, u
Inherited Disease, 7th ed., ed. C. R. Scriver, A. L. Beaudet, W. S. Sly,
5. Bartl, S., Baltimore, D. and Weismann, I. L., (1994) Molecular
3. Pryer, N. K., Wuestehube, L. J., and Schekman, R. (1992) Ve- Evolution of the Vertebrate Immune System.
sicle-Mediated Protein Sorting, , , 91, 10769-10770.
61, 471-516.
6. Farries, T. C., and Atkinson, J. P. (1991) Evolution of the Com-
4. Roise, D., and Maduke, M. (1994) Import of a Mitochondri- plement Syste, Immunology Today, 12, 295-300.
Letters, 337, 9-13; Ca-
valier-Smith, T. (1987) The Simultaneous Simbiotic Origins of Mi- 7. U primere spadaju: DuPasquier, L. (1992) Origin and Evolu-
tochondria, Chloroplasts and Microbodies, tion of the Vertebrate Imune System, APMIS, 100, 383-392; Stew-
, 503, 55-71; Cavalier-Smith, T. (1992) The art, J. (1994) -
Number of Simbiotic Origins of Organelles, BioSystems, 28, 91- tebrate Immunity, R. G. Landes Co., Austin; Sima, P., and Vetvicka, V.
106; Hartl, F., Ostermann, J., Guiard, B., and Neupert, W. (1987) (1993) Evolution of Immune Reactions, Critical Reviews in Immu-
Successive Translocation into and out of the Mitochondrial Ma- nology, 13, 83-114.
trix: Targeting of Proteins to the Inner membrane Space by a Bi-
partite Signal Peptide, Cell, 51, 1027-1037.
7. poglavlje
5. Alberts et al., pp. 551-651.
6. poglavlje
7-1. Atomi vodonika se uglavnom samo prenose sa drugim atomi-
J. G. (1995) Biochemistry
-
and Watson, J. D. (1994) , 3rd ed., Gar-
zanima samo spojivost.
315 316
3. Zubay, G., Parson, W. W., and Vance, D. E. (1995) Principles 12. Bloom, A. (1987) , Simon
, Wm. C. Brown Publishers, Dubuque, 1A, pp. 215-
216. 13. Horowitz, N. H. (1945) On the Evolution of Biochemical
4. Iako se ranije smatralo da ovaj korak nije zahtevao ATP, novi- Syntheses, , 31,
ji rad je pokazao da je ATP neophodan da bi se reakcija odigrava- 153-157.
14. Zbog doslednosti sa drugim opisima, promenio sam slova A
J. G. 1995. Biochemistry
800. i D u Horovicevom radu.
6. Or, J. (1961) Mechanism of Synthesis of Adenine from Hy- 16. Smith, J. M. (1995) Life at the Edge of Chaos? New York Re-
drogen Cyanide Under Plausible Primitive Earth Conditions, Na- view, March 2, pp. 28-30.
ture, 191, 1193-1194. Treba imati na umu da se reakcijama amoni-
jaka i vodonik cijanida proizvodi samo baza adenin. Krajnje je
teko proivesti nukleotid AMP pod pretpostavljenim uslovima na 8. poglavlje
ranoj Zemlji, kao to je napomenuo Joyce, G. F. (1989) RNK Evolu-
tion and the Origins of Life, Nature, 338, 217-224.
7. Navedeno u Joyce, G. F., and Orgel, L. E. 1993, Prospects for sposobna da proizvode aminokiseline atmosferskim procesima.
Understanding the Origin of the RNK World, u The RNA World,
2. Dose, K. (1988) The Origin of Life: More Questions then An-
ed. R. F. Gesteland and J. F. Atkins, Cold Spring Harbor Laboratory
swers, Interdisciplinary Science Reviews, 13, 348.
8. Osim razgradnjom ATP-a, koji se i sam prvo mora proizve- 3. Shapiro, R. (1986)
sti od AMP-a.
317 318
14. Otaka, E., and Ooi, T. (1987) Examination of Protein Se-
- quence Homologies: IV. Twenty-Seven Bacterial Ferredoins, Jour-
- , 26, 257-268.
Sea Urchin cDNA clones,
, 19, 397-
410.
(1994) The Comic Frame and the Rhetoric of Science: epistemo-
16. Kumazaki, T., Hori, H., and Osawa, S. (1983) Phylogeny of
logy and Ethics in Darwins Origin, Rhetoric Society Quarterly, 24, Protozoa Deduced from 5s rRNA Sequences,
Evolution, 19, 411-419.
17. Wagner, A., Deryckere, F., McMorrow, T., and Gannon, F.
8. Schlesinger, G., and Miller, S. L. (1983) Prebiotic Syntheses (1994) Tail-to-Tail Orientation of the Atlantic Salmon Alpha-and
in Atmospheres Containing CH4, CO, and CO2,
Beta-Globin Genes,
, 38, 28-35.
Evolution, 19, 376-382. 18. Zaista, neki proteini o kojima smo govorili u knjizi imaju
I. G. (1983) Radiolysis of aqueous Solutions of Hydrogen Cyanide
(pH 6): Compounds of Interest in Chemical Evolution Studies,
, 19, 184-191.
10. Kolb, V. M., Dworkin, J. P., and Miller, S. L. (1994) Alternative
Bases in the RNA World: The Prebiotic Synthesis of Urazole and Its imuni sistem mogli da se razviju korak-po-korak.
Ribosides,
, 38, 549-557. -
-
11. Hill, A. R., Jr., Nord, L. D., Orgel, L. E., and Robins, R. K. (1989)
Cyclization of Nucleotide Analogues as an Obstacle to Polyme-
rization,
, 28, 170-171. -
12. Nguyen, T., and Speed, T. P. (1992) A Derivation of All Line- pene evolucije.
ar Invariants for a Nonbalanced Transversion Model,
19. U ovu kategoriju sam svrstao radove koji su navedeni u in-
, 35, 60-76.
proteina, i nekim raznovrsnim temama.
13. Adell, J. C., and Dopazo, J. (1994) Monte Carlo Simulation in
Phylogenies: An Application to Test the Constancy of Evolutionary 20. Kimura, M. (1983) , Cam-
Rates,
, 38, 305-309.
319 320
-
zation and Selection in Evolution, Oxford University Press, New Videti Dembski, W (1996)
Through Small Probabilities, Ph. D. Dissertation, University of Illi-
nois.
22. Selander, R. K., Clark, A. G., & Whittam, T. S. (1991) Evolution
, Sinauer Associates, Saunderland, MA.
23. Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology
(1987), vol. 52, , Cold Spring Harbor
24. Lehninger, A. L. (1970) Biochemistry, Worth Publishers,
je izvrio Bill Dembski u svojoj disertaciji (Dembski, 1996), koja
-
25. Lehninger, A. L., Nelson, D. L., and Cox, M. M. (1993) Princi-
6. Dawson, K. M., Cook, A., Devine, J. M., Edwards, R. M., Hun-
26. Lehninger et al. (1993), p. 244. ter, M. G., Raper, R. H., and Roberts, G. (1994) Plasminogen Mu-
27. Con, E. E., Stumpf, P. K., Bruening, G., and Doi, R. H. (1987) tants Activated by Thrombin,
, 269,
15989-15992.
4.
28. Voet, D., and Voet, J. G. (1995) Biochemistry, 2nd ed., John (1995) Diversity of Oligonucleotide Functions,
iochemistry 64, 763-797.
American, August, p. 82. 10. poglavlje
, Oxford Universi- 1. Cited in Barrow, J. D., and Tipler, F. J. (1986) The Anthropic
ty Press, Oxford, England. Cosmological Principle
- 2. Barrow and Tipler, p. 36.
321 322
3. Paley, W. Natural Theology, American Tract Society, New 21. Miller, p. 32.
22. Gould, S. J. (1980) The Pandas Thumb, W. W. Norton, New
4. Dawkins, R. (1985) The Blind Watchmaker, W. W. Norton,
London, p. 5.
5. Paley, pp. 110-111. 11. poglavlje
6. Paley, pp. 199-200. 1. Shapiro, R. (1986)
7. Paley, pp. 171-172.
323 324
325 326
sleva i zdesna. Primer je potop. Kada se primeni na DNK, palin-
drom
53 smeru na oba lanca dvostruke spirale.
327