Professional Documents
Culture Documents
Praktikum Iz Genetike 1 PDF
Praktikum Iz Genetike 1 PDF
Zagreb, 2013.
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MONOHIBRIDNO KRIANJE I ZAKON SEGREGACIJE
P:
Zakljuio je slijedee:
(a) u svakoj se somatskoj stanici biljke graka nalaze dva nasljedna faktora za jedno
svojstvo, od kojih se samo jedan prenosi u sljedeu generaciju (spolna stanica ili gameta
prenosi samo jedan od dva alela nekog gena),
(b) u F 1 generaciji jedan nasljedni faktor (alel) je dominantan (vidljiv, izraen u
fenotipu), a drugi je skriven (recesivan alel),
(c) dva nasljedna faktora (alela) razdvajaju se jedan od drugoga tijekom gametogeneze
(razdvajanje alela odvija se u anafazi I ili anafazi II mejoze), a zatim se slobodno kombiniraju
s nasljednim faktorom (alelom) druge jedinke.
* Monogensko svojstvo: svojstvo kontrolirano jednim genom ili jednim parom alela (za razliku od poligenskog
svojstva kontroliranog s 2 ili vie gena/parova alela).
** Monohibridno krianje: krianje dva heterozigota za jedan par alela (jedno svojstvo ).
1
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MONOHIBRIDNO KRIANJE I ZAKON SEGREGACIJE
Mendelov prvi zakon nasljeivanja ili zakon segregacije: par alela za neko svojstvo
razdvaja se ili segregira tijekom stvaranja gameta* tako da svaka gameta dobije po jedan alel.
Fizika osnova segregacije alela je razdvajanje homolognih kromosoma u anafazi I ili
sestrinskih kromatida u anafazi II mejoze. Ako se alel za visoku stabljiku nalazi na jednom
kromosomu, a alel za nisku stabljiku na njegovom homolognom paru, jasno je da se ti aleli ne
mogu nai zajedno u istoj gameti.
Test-krianje (test-cross)
okruglo naborano
Ss
okruglo naborano
50% potomaka dominantnog fenotipa i 50% potomaka recesivnog fenotipa (omjer 1:1)
___________________
2
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MONOHIBRIDNO KRIANJE I ZAKON SEGREGACIJE
Krianje
1. Povratno
krianje
2. Povratno
krianje
Slika 1.2. Prikaz krianja kultivirane biljke velikog klasa i visoke stabljike (A) s divljim
(nekultiviranim) srodnikom malog klasa niske stabljike (B), s ciljem dobivanja biljke velikog
klasa i niske stabljike (A') u F 2 generaciji. Konani cilj je u nekoliko ciklusa povratnog
krianja dobiti jedinku A''' koja je genetiki gotovo istovjetna roditelju genotipa A osim u
svojstvu za duinu stabljike.
Iako je Mendel utvrdio zakone nasljeivanja na primjeru svojstava odreenih jednim genom,
osobine u biljaka, ivotinja te u ovjeka mogu biti, i najee jesu, odreene s vie gena.
Takva se svojstva nazivaju poligenska svojstva. Neka poligenska svojstva u ovjeka su: boja
oiju, boja kose, visina, teina, inteligencija. Takoer, razvoj kompleksnih bolesti poput
sranih bolesti, dijabetesa i raka, uvjetovan je mutacijama u vie gena. U ovjeka je poznato
puno monogenskih nasljednih bolesti ije je nasljeivanje lako pratiti (jer su uvjetovane
promjenom u samo jednom genu) analizom rodoslovlja. Mogunost otkrivanja genetikih
bolesti vrlo je vana u planiranju obitelji.
________________________
*Hibrid jedinka heterozigotna za sve parove alela; jedinka nastala krianjem genetiki razliitih roditelja.
*Knockout mi: mi-mutant kod kojeg je ciljano inaktiviran samo jedan gen.
3
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MONOHIBRIDNO KRIANJE I ZAKON SEGREGACIJE
DOMINANTNO RECESIVNO
Uni reanj slobodan Uni reanj sraten
Uho s Darwinovom kvrgom Uho bez Darwinove kvrge
Uho bez snopa dlaica Snop dlaica na obodu uha
Uni reanj s rupicom Uni reanj bez rupice
Ivica kose na sredini ela izvijena Ravna ivica kose na elu
Deformirani nokti (Nail patella sindrom) Normalni nokti i patela
Bijeli pramen u kosi kod mukaraca Bijeli pramen u kosi kod ena
elavost kod mukaraca Prorijeenost kose kod ena
Tamna kosa Crvena kosa
Rupica na bradi (kost) Bez rupice na bradi
Kratki prsti (brahidaktilija) Normalna duina prstiju
Vie prstiju (polidaktilija) Normalan broj prstiju
Nemogunost savijanja palaca (distalna Distalna hiperekstenzibilnost palca
hiperekstenzibilnost) (savijanje i do 45%)
Posljednji lanak malog prsta savijen ka Mali prst ravan
domalom
Dlaice na srednjem lanku prstiju Odsustvo dlaica na srednjem lanku svih
prstiju
Sposobnost uzdunog savijanja jezika Nesposobnost uzdunog savijanja jezika
Normalna usta Zeja usna
Sposobnost poprenog savijanja jezika Nesposobnost poprenog savijanja jezika
Lijevi palac preko desnog Desni palac preko lijevoga (pri sklopljenim
akama)
Kaiprst krai od etvrtog prsta kod Kaiprst krai od etvrtog prsta kod ena
mukaraca
Dvije tetive u korijenu ake Tri tetive u korijenu ake
Maljavost Odsustvo maljavosti
Pjegavost (izraena) Odsustvo pjegavosti
Osjeanje gorkog okusa feniltiokarbamida Nesposobnost osjeaja gorine PTC-a
(PTC)
Osjeanje okusa brucina Nesposobnost osjeaj brucina
4
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MONOHIBRIDNO KRIANJE I ZAKON SEGREGACIJE
OSNOVNA PRAVILA:
III. Ukupna vjerojatnost da e se dogoditi dva ili vie nezavisnih dogaaja, je umnoak
vjerojatnosti svakog od tih dogaaja (tzv. i pravilo). Npr. vjerojatnost dobivanja
dvije uzastopne etvorke bacanjem kocke je 1/6 x 1/6 = 1/36.
IV. Ukupna vjerojatnost da e se dogoditi dva ili vie meusobno iskljuivih dogaaja, je
zbroj vjerojatnosti svakog pojedinanog dogaaja (tzv. ili pravilo). Npr. vjerojatnost
dobivanja etvorke ili estice jednim bacanjem kocke je 1/6 + 1/6 = 2/6.
Praktian rad
Pribor:
5
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MONOHIBRIDNO KRIANJE I ZAKON SEGREGACIJE
Rad je organiziran u etiri skupine po etiri studenta. Svaka skupina dobiva sljedei pribor: a)
petrijevku sa neselektivnom hranjivom podlogom, b) petrijevku s dodatkom herbicida
BASTA, c) sterilne akalice, d) mikropipetu, e) ute nastavke za mikropipetu, f) parafilm, g)
dvije tube s otprilike stotinjak F 2 sjemenki, prethodno steriliziranih, h) tube sa steriliziranim
sjemenkama roditeljskog genotipa. Dvoje studenata iz svake skupine nasauju sjemenke na
podlogu bez herbicida, a ostali na podlogu s herbicidom. U oba sluaja potrebno je na podloge
nasaditi i oko desetak sjemenki obje roditeljske linije radi upoznavanja fenotipova ija se
segregacija prati (divlji tip: Col i mutante: wol1 ili mop2).
Na podlogama bez herbicida pratit e se segregacija morfolokog fenotipa mutante
wol1 (va zadatak je da uoite razliku izmeu fenotipa divljeg tipa i mutanta).
Na podlogama s herbicidom pratit e se segregacija rezistencije na herbicid mutante
mop2. Gen za rezistenciju na herbicid BASTA (BAR fosfinotricin acetiltransferaza) nalazi
se na T-DNA ugraenoj u genom mutanta mop2 posredstvom bakterije Agrobacterium
tumefaciens.
Nasaivanje se izvodi pomou mikropipete i utih nastavaka ili sterilnim akalicama,
u komori sa sterilnim protokom zraka (laminar) ili na radnim mjestima pored upaljenog
plamenika. Nakon nasaivanja, petrijevke treba zatvoriti ljepljivom trakom (parafilm) i
inkubirati u komori za biljke (fitotron) u sljedeim uvjetima: 22C, 16 sati svjetla, 8 sati
tame. Sljedei tjedan, svaka skupina e razvrstati proklijale biljice u fenotipske skupine i
dobivene omjere statistiki analizirati 2- testom (hi-kvadrat).
6
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MONOHIBRIDNO KRIANJE I ZAKON SEGREGACIJE
ZADACI:
7. Pretpostavimo da je kod ljudi plava boja oiju recesivno svojstvo. ena smeih oiju i
mukarac plavih oiju imaju plavooko dijete. Koja je vjerojatnost da e slijedee troje
djece imati plave oi?
8. Pretpostavimo da je kod ljudi plava boja oiju recesivno svojstvo. ena smeih oiju i
mukarac plavih oiju imaju plavooko dijete. Koja je vjerojatnost da e slijedee troje
djece biti plavooke keri?
7
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MONOHIBRIDNO KRIANJE I ZAKON SEGREGACIJE
11. Mladi brani par je posjetio specijalista za nasljedne bolesti (genetic counselor)
zbog toga to svaki od njih ima brata ili sestru koji su oboljeli od cistine fibroze dok
niti jedan suprunik niti njihovi roditelji nemaju ovu bolest (cistina fibroza je
recesivna bolest).
12. Tay-Sacs je recesivna letalna bolest ivanog sustava u ljudi. Javlja se u ranoj
ivotnoj dobi. Bolest je rijetka u ljudskoj populaciji openito, no esta u idova iz
sredinje Europe. ena, iji je ujak obolio od te bolesti, pokuava odrediti vjerojatnost
da ona i njen mu imaju bolesno dijete. Njezin otac ne pripada visoko-rizinoj skupini
ljudi, a mueva sestra je umrla od te bolesti.
13. Plod rajice moe biti crvene ili ute boje. Kriane su biljke slijedeih fenotipova
Roditelji: Potomstvo:
crvena x crvena 61 crvena
crvena x crvena 47 crvena, 16 utih
crvena x uta 58 crvenih
uta x uta 64 ute
crvena x uta 33 crvene, 36 utih
crveno x crveno
crveno x bijelo
ruiasto x bijelo
15. Krianjem dvaju sojeva krune plijesni (Neurospora crassa) od kojih jedan stvara crne
spore (+), a drugi utosmee (a) spore, dobiven je slijedei raspored spora u askusima:
8
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MONOHIBRIDNO KRIANJE I ZAKON SEGREGACIJE
a) Objasnite sliku.
A B
9
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: DIHIBRIDNO KRIANJE I ZAKON NEZAVISNE SEGREGACIJE
P:
RRYY rryy
F1:
RrYy
F2:
svojstva (dihibridi). Ako se ovakve biljke, potomci F 1 generacije, dalje meusobno kriaju
svaki od njih dat e etiri tipa gameta s istom uestalou.
Svaka od 4 razliite gamete mukog roditelja moe se spojiti s bilo kojom od 4 vrste gameta
enskog roditelja, to daje 16 razliitih kombinacija prikazanih Punnett-ovim kvadratom
(omjeri fenotipova i genotipova izraeni su esnaestinama jer postoji 16 kombinacija) (slika
2.2.).
10
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: DIHIBRIDNO KRIANJE I ZAKON NEZAVISNE SEGREGACIJE
11
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: DIHIBRIDNO KRIANJE I ZAKON NEZAVISNE SEGREGACIJE
Omjer: Interpretacija:
1:1 Monohibridno test krianje.
1:1:1:1 Dihibridno test krianje.
1:2:1 Genotipski ili fenotipski omjer monohibrida u sluaju nepotpune
dominacije ili kodominacije alela
1:2 Monohibridni genotipski ili fenotipski omjer u sluaju letalnih alela
(recesivnog ili dominantnog)
3:1 Monohibridni fenotipski omjer.
9:3:3:1 Dihibridni fenotipski omjer.
12:3:1 Dominantna epistaza.
9:3:4 Recesivna epistaza.
15:1 Barem jedan dominantni alel dovoljan je za stvaranje fenotipa.
9:7 Oba dominantna alela potrebna su za stvaranje fenotipa.
9:6:1 Svi jednostruki recesivni homozigoti daju intermedijarni fenotip.
Praktian rad
12
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: DIHIBRIDNO KRIANJE I ZAKON NEZAVISNE SEGREGACIJE
Studenti rade u etiri skupine. Svaka skupina sastoji se od dvije podskupine. Prva podskupina
nasauje potomke F 2 generacije navedenog krianja, a druga podskupina potomke F 3
generacije. Potrebno je zasaditi oko stotinjak sjemenki na svaku podlogu (4 reda po 20-25
sjemenki). Sjemenke e se nasaivati pomou mikropipete sa utim nastavkom ili sterilnim
akalicama. Nakon nasaivanja, petrijevke se zatvaraju parafilmom i inkubiraju u komori za
biljke u sljedeim uvjetima: 22C, 16 sati svjetla, 8 sati tame. Za tjedan dana svaka skupina e
svrstati proklijale biljice u fenotipske klase (crvene : zelene) i dobivene omjere statistiki
analizirati hi-kvadrat testom.
A B
Slika 2.3. (A) Jedinka u cvatu vrste Arabidopsis thaliana koja hiperakumulira (nakuplja)
antocijanine (crvenkasto-smea biljka lijevo). Divlji tip u istoj razvojnoj fazi (intenzivno
zelene boje, desno). (B) Biosintetski put antocijanina. Crveno je zaokruen gen TT4 koji
kodira za prvi enzim u sintezi antocijanina CHS.
Da bismo procijenili tonost neke hipoteze (tzv. nul-hipoteze ili H 0 ) potreban nam je
test koji moe analizirati veliinu odstupanja (devijacije) opaenih rezultata od oekivanih
vrijednosti, odnosno koji moe razlikovati da li su izmjerena odstupanja statistiki znaajna ili
su posljedica sluajnosti. U sluaju dihibridnog krianja u naem eksperimentu H 0 glasi:
nema statistiki znaajne razlike izmeu oekivanih i eksperimentalnih omjera tj. opaeno
odstupanje je posljedica sluajnosti.
13
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: DIHIBRIDNO KRIANJE I ZAKON NEZAVISNE SEGREGACIJE
E= eksperimentalna vrijednost
T= teoretska vrijednost
(E-T) = odstupanje ili devijacija
2
X test mora uzeti u obzir i broj varijabli koje ispitujemo (tzv. stupnjevi slobode).
Broj stupnjeva slobode df (degree of freedom) jednak je broju razreda (klasa)
umanjenom za jedan. Razred oznaava broj fenotipskih ili genotipskih klasa nekog krianja
(broj varijabli). Na primjer, u dihibridnom krianju postoji 9 genotipskih klasa, stoga je broj
stupnjeva slobode 9-1=8. Po istom principu, za fenotipski omjer dihibridnog krianja broj
stupnjeva slobode je: 4-1=3.
U biologiji se kao granina vjerojatnost da je neko odstupanje posljedica sluajnosti
uzima 0,05 tj. 5% (P=0,05). Ukoliko je vjerojatnost da je odstupanje posljedica sluajnosti
vea od 0,05 (P>0,05) prihvaamo H 0 hipotezu. Ukoliko je P 0,05, devijacija izmeu
oekivanih i opaenih vrijednosti je statistiki znaajna (posljedica je nekog drugog faktora, a
ne sluajnosti) pa moramo odbaciti H 0 hipotezu. Kod X2 testa raunamo X2 vrijednost za neki
eksperiment te je usporeujemo s graninom X2 vrijednosti. Granina X2 vrijednost iitava se
iz tablice na temelju stupnjeva slobode kod vjerojatnosti 0,05 (Tablica 2). Ako je dobivena X2
vrijednost manja ili jednaka graninoj vrijednosti, H 0 se prihvaa, a ako je vea, H 0 se
odbacuje.
Eksperimentalni model prikaza rezultata dihibridnog krianja
Uzmite po dvije kovanice od 1 kune i dvije kovanice od 50 lipa. Kune predstavljaju par alela
za boju sjemenke, a lipe predstavljaju par alela za oblik sjemenke znai pratimo dihibridno
krianje. Glava kovanice oznaava dominantno svojstvo, a pismo recesivno svojstvo.
Kovanice dobro protresite, bacite na klupu i unesite kombinacije glava-pismo koje ste dobili
nakon bacanja u slijedeu tabelu. Izvedite ukupno 100 bacanja koja predstavljaju genotipove
100 potomaka dihibridnog krianja.
14
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: DIHIBRIDNO KRIANJE I ZAKON NEZAVISNE SEGREGACIJE
Dodaci:
A a
A AA Aa
a Aa aa
FENOTIPSKI OMJER:
3 1
n=1
Fenotipske klase (2n)=21=2
Genotipske klase (3n)=31=3
Udio recesivnih homozigota 1/(2n)2=1/(21)2=1
15
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: DIHIBRIDNO KRIANJE I ZAKON NEZAVISNE SEGREGACIJE
AB Ab aB ab
FENOTIPSKI OMJER:
9 3 3 1
n=2
Fenotipske klase (2n)=22=4
Genotipske klase (3n)=32=9
Udio dvostrukih recesivnih homozigota 1/(2n)2=1/(22)2=1/16
16
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: DIHIBRIDNO KRIANJE I ZAKON NEZAVISNE SEGREGACIJE
FENOTIPSKI OMJER:
27 9 9 9 3 3 3 1
n=3
Fenotipske klase (2n)=23=8
Genotipske klase (3n)=33=27
Udio trostrukih recesivnih homozigota 1/(2n)2=1/(23)2=1/64
17
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: DIHIBRIDNO KRIANJE I ZAKON NEZAVISNE SEGREGACIJE
ZADACI:
1. Ispiite sve mogue genotipove koje moe imati jedinka dominantnog fenotipa kod
koje pratite nasljeivanje dvaju svojstava i prikaite odgovarajua test-krianja! Koje
genotipske omjere oekujete u potomstvu?
2. Visoki rast rajice odreen je dominantnim alelom D, dok je patuljasti rast odreen
recesivnim alelom d. Dlakavost stabljike odreuju dominantni alel H, dok je glatka
stabljika odreena njegovim recesivnim alelom h. S biljkom fenotipa visoka-dlakava
izvreno je krianje.
Dobiveno je sljedee potomstvo:
118 visokih-dlakavih
121 patuljastih-glatkih
112 visokih- glatkih
109 patuljastih-dlakavih
a) Prikaite krianje!
b) Koji je fenotipski omjer visokih i patuljastih biljaka, te dlakavih i glatkih?
c) Da li se ovi lokusi nasljeuju nezavisno jedan od drugog?
3. Jedno dihibridno krianje dalo je 217 potpuno recesivnih potomaka. Koliko je bilo
ukupno potomaka?
5. Krian je dihibridni visoki graak utog zrna s niskim grakom zelenog zrna. Od 2096
potomaka, koliko ih je bilo dominantno samo za jedno svojstvo.
6. Mendel je uoio da je kod graka uta boja zrna dominantna nad zelenom i glatko
okruglo sjeme nad naboranim.
a) kakav se fenotipski omjer oekuje u F 2 generaciji prilikom krianja
homozigotnih utih biljaka okruglog zrna i biljaka zelenog naboranog zrna?
b) Kakav je omjer zelenih i utih zrna, te glatkih i naboranih zrna u F 2 generaciji?
8. Kod graka uta boja zrna dominantna je nad zelenom i glatko okruglo sjeme nad
naboranim. Kriali ste biljku utog glatkog sjemena s biljkom zelenog naboranog zrna
i dobili 13 biljaka utog glatkog sjemena i 14 biljaka utog naboranog sjemena.
Kakvog su genotipa roditelji?
18
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: DIHIBRIDNO KRIANJE I ZAKON NEZAVISNE SEGREGACIJE
12. Novi je baen 10 puta: 6 puta je pala glava, a 4 puta pismo. Da li je ovaj rezultat u
skladu s oekivanim omjerom 50:50?
13. Ako je novi baen 100 puta sa istim relativnim brojem devijacije kao u prethodnom
zadatku, da li je hipoteza jo uvijek prihvatljiva?
15. Kod graka uta boja zrna (A) dominantna je nad zelenom (a) i glatko okruglo sjeme
(B) nad naboranim (b). Kriali ste biljku utog glatkog sjemena s biljkom zelenog
naboranog zrna i dobili 25 biljaka utog glatkog sjemena i 35 biljaka zelenog glatkog
sjemena. Koja je hipoteza pokusa (hipoteza = oekivani fenotipski omjeri F 1
generacije)? Da li se hipoteza prihvaa?
16. Krianjem jedinki genotipa AaBbCcDd i AabbCcDD, koliki e biti udio potomaka koji
u fenotipu izraavaju (eksprimiraju) sva etiri dominantna svojstva?
18. Pretpostavimo da je gen za elavost (B) dominantan u odnosu na svoj alel za rast kose
(b) te da je gen za kovravu kosu (cy) recesivan u odnosu na svoj alel za ravnu kosu
(Cy). Ova dva lokusa nisu vezana, a B je epistatian u odnosu na Cy. a) Kakvo
potomstvo obzirom na rast i oblik kose oekujete u krianju Bb Cycy x bb cycy?
20. Kriane su dvije genetiki razliite sorte kukuruza s klipovima nepigmentiranog zrna:
AAbb x aaBB. Svi potomci tog krianja imali su klipove ljubiastog zrna. Koji e biti
fenotipski omjer F 2 generacije obzirom na boju zrna?
19
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MULTIPLI ALELI
Do sada smo prouavali nasljeivanje svojstava odreenih parom alela koji su mogli
biti u dominantno-recesivnom odnosno kodominantnom odnosu ili su pak mogli biti u odnosu
nepotpune dominacije. Znai, odreeni gen se u nekoj populaciji moe javljati samo sa dva
alelna oblika. Kako gen ini slijed od nekoliko stotina pa i do nekoliko tisua nukleotida
molekule DNA mogue je da se pri replikaciji DNA (S faza) dogode pogreke to e
rezultirati manjim izmjenama u genu (spontane mutacije). Takve promjene u slijedu
nukleotida tvore nove alelne oblike odreenog gena. Iako je u diploidnoj jedinci gen uvijek
predstavljen samo s dva alela, u populaciji jedne vrste mogue je puno razliitih alela istoga
gena. To su multipli aleli. Svaki od ovih alela nastao kao produkt razliitih mutacija jednog
gena daje razliitu fenotipsku ekspresiju. Odnos izmeu tih alela moe biti razliit.
Boja krzna kunia odreena je sa etiri razliita alela u populaciji ija ekspresija daje
etiri razliita fenotipa:
h
hijerarhija dominantnosti: C > c > c > c
Fenotip Genotip
Agouti
inila
Himalajski
Albino
20
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MULTIPLI ALELI
2 3
3 6
4 10
n n/2 x (n + 1)
3. U populaciji kunia, nalaze se tri razliita fenotipa s obzirom na boju krzna: inila (c),
himalajski (h) i albino (a). Kako bi rastumaili nasljeivanje boje krzna, kriamo jedinke
kunia meusobno i biljeimo rezultate u sljedeoj tablici:
1 hxh h:a
2 hxa h:a
3 cxc c:h
4 cxh svi c
5 cxc c:a
6 hxa svi h
7 cxa c:a
8 axa svi a
9 cxh c:h
10 cxh c:h:a
U mieva je boja koe i krzna odreena genom A koji je u populaciji zastupljen serijom
multiplih alela. Hijerarhija dominacije slina je hijerarhiji dominacije alela za boju krzna
kod kunia.
21
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MULTIPLI ALELI
Fenotip Alel
uti AY
Agouti sa svijetlim trbuhom A1
Agouti A+
Crno-smei a1
Crni a
4. Kriali ste agouti mia sa utim i u potomstvu dobili 4 uta, 2 crno-smea i 1 agouti
mia. Prikaite krianje!
22
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MULTIPLI ALELI
23
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MULTIPLI ALELI
5. Kod djeteline postoji itav niz samoinkompatibilnih alela, tako da haploidan pelud ne
moe klijati i oploditi sjemeni zametak koji nosi isti alel. U tablici je navedena serija
samoinkompatibilnih alela: S1, S2,S3 i S4. Koji se genotipski omjeri embrija i endosperma
oekuju prilikom sljedeih krianja (gametofitska inkopatibilnost)?
Majka Otac
1 1 1 2
1) S S SS
1 2 1 2
2) S S SS
1 3 2 4
3) S S SS
2 3 3 4
4) S S SS
Daleko najpolimorfniji sustav multiplih alela u ljudi ine aleli glavnog sustava tkivne
snoljivosti (engl. major histocompatibility complex, MHC). Geni ovog sustava kodiraju
membranske proteine ija je zadaa prezentacija vlastitih i stranih proteinskih fragmenata
stanicama imunolokog sustava. Najpoznatiji iz ove porodice gena su geni HLA sustava
(engl. human leukocyte antigen) iji su proteinski produkti glavni uzronici odbacivanja tkiva
nakon transplantacije. est je glavnih gena HLA sustava: HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-
DP, HLA-DQ i HLA-DR. Svaki od ovih gena zastupljen je u populaciji s nekoliko stotina
alela.
24
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MULTIPLI ALELI
prisutnosti odnosno odsutnosti specifinog antigena na povrini eritrocita. Osobe krvne grupe
A imaju eritrocite na kojima se nalazi antigen ili aglutinogen tipa A, osobe krvne grupe B
imaju eritrocite sa antigenom B, a osobe krvne grupe AB na eritrocitima oba tipa antigena,
antigen A i antigen B (fenotipska posljedica kodominantnosti). Osobe krvne grupe O ne
sadre niti jedan tip antigena (A ili B) na eritrocitima. Prisutnost specifinog antigena na
eritrocitima osobe definira odgovarajui tip krvne grupe.
25
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MULTIPLI ALELI
26
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MULTIPLI ALELI
Osoba krvne grupe AB u pravilu ne moe imati roditelja krvne grupe O. Meutim
utvreni su rijetki sluajevi osoba koje nose antigene A i B, ali koji se ne moraju detektirati
imunolokom reakcijom antigen-protutijelo. Tako osoba genotipa IAIB moe zapravo biti
krvne grupe O. Naime, proizvodnja A i B antigena ne ovisi samo o ABO lokusu (I lokus na
kromosomu 9) ve i o genskom lokusu H (na kromosomu 2). Dominantni alel H kontrolira
proizvodnju antigena H koju sadre i antigen A i antigen B. Veina ljudi u populaciji je
genotipa HH. Utvreni su rijetki sluajevi osoba genotipa hh. Te osobe ne mogu proizvoditi
strukturu H, pa ne samo da su negativni za antigen H ve reakcijom antigen-protutijelo odaju
kao da su krvna grupa O iako su u stvari genotipa IAIB. Ovaj sluaj nazvan je Bombaj
fenomen, jer je prvi puta opisan u ovom indijskom gradu. Iako je taj fenomen vrlo rijedak,
dobar je primjer recesivne epistaze i ukazuje na predostronost prilikom donoenja savjeta za
utvrivanje oinstva.
Osim ABO sustava vano je poznavanje i MN sustava krvnih grupa. Kod MN krvnih
grupa u serumu nema prirodnih protutijela. Protutijela se meutim mogu umjetno proizvesti
ako se u eksperimentalne ivotinje (na pr. kuni, konj) ubrizga ljudska krv. Takav ivotinjski
serum sa proizvedenim protutijelima moe posluiti za identifikaciju antigena na ljudskim
eritrocitima. Aleli M i N su kodominantni pa su mogua tri genotipa (MM, MN, NN) i tri
fenotipa (M, N, MN). Postoji jo nekoliko sustava za odreivanje krvnih grupa kao to su npr.
Kell, Lutheran, Duffy, Lewis, Kidd i dr. Svi su ovi sustavi kontrolirani razliitim genima koji
uglavnom dolaze u multiplim formama. Svi ovi geni imaju specifine antigene koji se nalaze
na povrini istih eritrocita. Ako se svi geni koji odreuju razliite krvne grupe promatraju
zajedno onda moemo opisati za svaku osobu detaljan genetiki profil za fenotip krvne grupe.
POSTUPAK: na predmetno stakalce kapnemo po 4 kapi krvi. Pored svake kapi krvi kapnemo
jedan od 4 anti-seruma. Staklenim tapiem pomijeamo krv i anti-serum, te priekamo 1-2
minute. Dok ekamo lagano naginjemo stakalce mijeajui krv i anti-serum.
Ljudska populacija moe biti pozitivna odnosno negativna za Rhesus faktor. Rhesus
krvne grupe opisali su 1940. Landsteiner i Wiener kada su pokazali da antiserum dobiven
ubrizgavanjem krvi majmuna Macaca mullata zecu, moe aglutinirati eritrocite ovjeka.
Naime, krv zeca proizvodi protutijela na antigen D koji se nalazi na membrani eritrocita
rhesus majmuna. U ljudskoj populaciji 85% osoba je Rhesus-pozitivnih (genotip Rh+Rh+ ili
Rh+Rh-) a 15% Rhesus-negativnih jedinki (genotip Rh-Rh- ). Rhesus faktor je dakle odreen s
dva alela jednoga genskog lokusa (na kromosomu 1) koji su u dominantnom-recesivnom
odnosu. Dvije osobe razliitih spolova mogu biti inkompatibilne zbog razliitog Rh faktora u
krvi. Rh negativna majka e sa Rh pozitivnim ocem moi imati Rh pozitivno dijete. Ako je to
prva trudnoa ova razlika nee biti kobna za dijete, meutim druga trudnoa moe predstaviti
27
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MULTIPLI ALELI
problem za plod. Naime, tijekom poroda prve trudnoe Rh pozitivni (koji sadre D antigen)
eritrociti djeteta zbog mijeanja majine i djetetove krvi ulazit e u krv majke i stimulirati
proizvodnju protutijela u njenom krvnom serumu. Ova protutijela proizvedena tijekom prve
trudnoe mogu natetiti plodu u drugoj trudnoi izmjenom krvi majke i djeteta kroz placentu.
Protutijela e koagulirati eritrocite fetusa to moe dovesti do bolesti fetalne eritroblastoze.
Ipak, samo 1 na 200 roenih beba bude pogoena fetalnom eritroblastozom. To je zato to se
kod svih trudnoa ne dogodi da krv bebe proe kroz placentu i ue u krv majke (to je jako
rijetko), a i prva trudnoa nikada nije riskantna (osim u sluaju da je majka senzibilizirana od
neke ranije transfuzije). enama se danas nakon prvog poroda ubrizgava anti-D serum koji
uniti sve eritrocite djeteta koji su eventualno uli u krv majke. Na taj nain je sigurno da plod
u drugoj trudnoi nee biti ugroen.
ZADACI:
2. Suprug tui suprugu zbog nevjere. Njihovo prvo i drugo dijete imaju krvne grupe 0 i AB.
Tree dijete za koje postoji sumnja da nije njegovo ima krvnu grupu B.
28
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MULTIPLI ALELI
6. ena ima krvnu grupu B. Mukarac 1 ima grupu 0, a mukarac 2 grupu A 2 . Dijete je krvne
.
grupe A 1 B. Koji bi mukarac mogao biti otac?
8. ena je krvne grupe A MN. Njezino dijete je grupa 0 N. Mukarac I ima krvnu grupu A M,
a mukarac II 0 N. Koji je od dvojice mukaraca je potencijalni otac?
29
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: VEZANI GENI
3. VEZANI GENI
Kada se dva ili vie gena nalaze na istom kromosomu nazivamo ih vezanim genima.
Oni mogu biti zajedno na nekom od autosoma ili pak na spolnim kromosomima. Geni koji
se nalaze na razliitim kromosomima razdvajaju se neovisno jedan od drugoga, dok geni
koji se nalaze na istom kromosomu kod stvaranja gameta nastoje ostati na istom
kromosomu u istoj kombinaciji kao to su bili i u roditeljskom genotipu.
Dva lokusa smjetena na razliitim kromosomima segregiraju u mejozi (anafaza I ili
anafaza II) neovisno jedan o drugom (II zakon Mendelovog nasljeivanja). U tom sluaju
test krianje dihibrida dat e fenotipski omjer u F 1 generaciji 1:1:1:1. Meutim, ako test
krianjem u F 1 generaciji dobijemo velika odstupanja od ovog omjera zakljuujemo da se
geni za dva svojstva ije nasljeivanje pratimo, nalaze na istom kromosomu, tj. da se radi o
vezanim genima.
Vezanost gena moe biti potpuna ili djelomina. Potpunu vezanost pokazuju geni
izmeu kojih ne dolazi do rekombinacije (krosingovera), odnosno ne postoji izmjena
izmeu dijelova kromatida majinskog i oevog kromosoma u bivalentu. Kod potpune
vezanosti gena nema rekombinantnih potomaka. Dihibridnim test-krianjem nastaju samo
dvije klase potomaka koje po fenotipu i genotipu odgovaraju roditeljima. To su
RODITELJSKI potomci. Mejoza bez krosingovera poznata je u mujaka vinske muice,
enke dudovog svilca, te nekih biljaka.
30
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: VEZANI GENI
Vezani geni ipak ne ostaju uvijek zajedno na istom kromosomu nakon gametogeneze jer
nesestrinske kromatide homolognih kromosoma mogu izmijeniti dijelove razliitih duljina
tijekom profaze I mejoze kroz proces mejotskog sparivanja homolognih kromosoma i
krosingovera. Geni izmeu kojih dolazi do rekombinacije putem krosingovera pokazuju
djelominu vezanost.
Da bi se utvrdila uestalost krosingovera izmeu dva gena na istom kromosomu,
provodi se test-krianje heterozigota za dva svojstva (dihibrid) s recesivnim homozigotom
za ta dva svojstva:
P: AB/ab X ab/ab
rekombinantni potomci
Odgovori na pitanje:
A) Koliko su jedinica udaljeni lokusi a i b u gore navedenom krianju?
B) Po emu zakljuujete da se geni ne nalaze na razliitim kromosomima?
31
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: VEZANI GENI
(kromosomskih tetrada) u bilo kojem dijelu kromosoma. Kao rezultat ovakve mejoze
nastat e etiri tipa gameta; samo dvije gamete imat e gene vezane na isti nain kao to su
bili i u roditeljskoj stanici (ove gamete nastale su od kromatida koje nisu sudjelovale u
krosingoveru, roditeljski tipovi gameta) dok e druge dvije gamete imati rekombinirani
vezani odnos meu genima roditelja (ove gamete nastale su od kromatida koje su
pretrpjele krosingover; rekombinantni tipovi gameta).
Aleli dvostrukog heterozigota (dihibrida) u dva vezana lokusa mogu se pojaviti u dva
razliita poloaja jedan naspram drugoga. Ako se dva dominantna alela nalaze na jednom
kromosomu, a dva recesivna alela na drugom kromosomu tada vezani odnos nazivamo
CIS poloaj. Ako pak na istom kromosomu nalazimo dominantni alel jednog lokusa, a
recesivni alel drugog lokusa tada ovaj odnos vezanosti nazivamo TRANS poloaj.
Roditeljske i rekombinantne gamete e u ova dva sluaja biti razliite. Ako se radi o CIS
poloaju dihibrida, nakon test-krianja roditeljska klasa potomaka fenotipski odgovara
fenotipu roditelja. Ako su aleli dihibrida u TRANS poloaju, nakon test-krianja
roditeljska klasa potomaka ne odgovara fenotipu roditelja, pa govorimo samo o
roditeljskim gametama, a ne o roditeljskom fenotipu.
A B
a b
A) B)
Odgovori na pitanja:
A) Koja je vrsta vezanosti na slici A), te na slici B) ?
32
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: VEZANI GENI
Kromosomsko kartiranje
Svaki kromosom nekog organizma nosi veliki broj gena. Aleli koji se nalaze na istom
kromosomu zajedno segregiraju u anafazi I. Ipak, u mejozi moe doi do homologne
rekombinacije, a krosingover izmeu genskih lokusa moe nam pokazati koliko su dva genska
lokusa udaljena jedan od drugoga pa na taj nain moemo kartirati cijeli kromosom. Kartirati
znai odrediti poloaj i meusobnu udaljenost gena na kromosomu. Jednu grupu vezanih gena
ine svi genski lokusi koji se nalaze na istom kromosomu. Broj grupa vezanih gena jednak je
broju kromosoma u haploidnom setu. Kromosom X predstavlja jednu grupu vezanih gena,
dok kromosom Y predstavlja drugu grupu vezanih gena. Prema tome, enka vinske muice
ima 4 grupe vezanih gena (2n = 8, XX), dok mujak ima 5 grupa vezanih gena (2n = 8, XY).
Niska uestalost rekombinacije (mali broj rekombinantnih potomaka) ukazuje na malu
udaljenost dvaju genskih lokusa na kromosomu. Uestalost rekombinacije je mjera udaljenosti
izmeu genskih lokusa; 1% rekombinantnih potomaka odnosi se na jednu jedinicu genske
karte (ili 1 centimorgan u ast T.H. Morganu, prvom genetiaru koji je dobio Nobelovu
nagradu). Ova mjera je relativna udaljenost genskih lokusa, a ne prava fizika udaljenost.
Dihibridno krianje uzima u obzir dva genska lokusa; trihibridno krianje uzima u obzir tri
genska lokusa; na ovaj nain moemo odrediti relativan poloaj lokusa u odnosu jedan na
drugi, ali to je jo vanije moemo analizirati uinak viestrukog krosingovera na udaljenost
na genskoj karti. Uinak viestrukog krosingovera se ne moe detektirati ako se promatraju
samo dva lokusa. Naime, dvostruki krosingover izmeu dva genska lokusa daje dojam kao da
nije uope dolo do krosingovera (iskljuuje rekombinante) i na taj nain emo dobiti krivu
informaciju o udaljenosti tih lokusa. Zbog toga je potrebno u krianja ukljuiti i trei genski
lokus da bi mogli detektirati ovakve genetike dogaaje.
U svrhu utvrivanja vezanosti gena radimo test-krianje. Npr. ako elimo vidjeti da li su tri
gena na istom kromosomu i u kojem su meusobnom poretku smjeteni, te kolika je njihova
udaljenost napravit emo test-krianje trihibrida (P: ABC/abc x abc/abc)
Primjer:
Test krianje enke vinske muice heterozigotne za crnu boju tijela (b), purpurnu boju
oiju (pr) i zakrivljena krila (c): b+ pr+ c+/ b pr c x b pr c / b pr c
B. Ako su pak geni potpuno vezani (ne dolazi do krosingovera izmeu njih jer se
lokusi nalaze vrlo blizu jedan drugome) trihibrid e proizvoditi samo dvije vrste
gameta i sa istom uestalou, te emo tim krianjem dobiti dvije fenotipske klase
potomaka (roditeljski fenotipovi).
C. Ako se geni nalaze na istom kromosomu i izmeu njih dolazi do krosingovera imat
emo osam razliitih gameta (kao produkt krosingovera) i osam razliitih
fenotipova. Rezultati test krianja predoeni su u tablici.
33
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: VEZANI GENI
5,9 19,5
23,7 (25,4)
34
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: VEZANI GENI
U tablici su grupirane reciprone klase potomaka. Reciprone klase nastaju kao rezultat
jednog krosingovera, te se pojavljuju u priblino istom broju u potomstvu. Dvije
najzastupljenije klase uvijek predstavljaju roditeljske klase potomaka (1 i 2). Dvije najmanje
zastupljene klase su posljedica dvostrukog krosingovera (7 i 8). Ostale 4 klase su
rekombinante klase nastale kao posljedica jednog krosingovera izmeu b i pr (3 i 4), odnosno
pr i c genskog lokusa (5 i 6).
U posljednjem stupcu tablice prikazana je rekombinacija izmeu gena b i c. Ubrojene su
samo one rekombinantne klase koje daju novi poredak alela b i c (dominantni ili recesivni),
ako ih usporedimo s roditeljskim poretkom. Ovaj posljednji stupac pokazuje nam to bi nam
otkrilo krianje dihibrida za ova dva genska lokusa (b i c) s recesivnim homozigotom da
nemamo trei genski lokus pr izmeu njih.
Dakle, 5,9% rekombinantnih potomaka nastalo je krosingoverom izmeu lokusa b i pr,
19,5% rekombinantnih potomaka krosingoverom izmeu lokusa pr i c, te 23,7%
rekombinantnih potomka krosingoverom izmeu lokusa b i c. Ovi podaci nam daju
mogunost da napravimo provizornu ili hipotetsku gensku kartu za tri lokusa (vidi sliku gore).
Dvostruki krosingover:
b+ pr+ c+
b pr c
Odgovori na pitanja:
A) Koja je vrijednost udaljenosti gena tonija: 23,7 cM ili 25,4 cM? B) Zbog ega?
35
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: VEZANI GENI
Najpreciznije genske karte su one koje su napravljene uzimajui u obzir lokuse koji su
vrlo blizu jedan drugoga. Drugim rijeima zbrajanje kratkih udaljenosti puno je tonije nego
direktno mjerenje dugih udaljenosti (dobro je imati druge genske lokuse izmeu dva udaljena
gena za tonu procjenu njihove udaljenosti). Ovaj primjer nam pokazuje i da za odreena dva
lokusa moemo dobiti uvijek barem dvije genske karte; mjerenu i pravu udaljenost gena.
Mjerena udaljenost za dva gena je ona koju smo dobili izraunavanjem uestalosti
rekombinanti dobivenih test-krianjem dihibrida. Pravu udaljenost izmeu dva genska lokusa
dobili smo zbrajajui kratke udaljenosti genskih lokusa koji se nalaze izmeu dva odreena
gena iju udaljenost elimo znati. Kratke udaljenosti su pak dobivene uz pomo test krianja
dihibrida za mnoge lokuse izmeu dva udaljena. Ako izmjerene vrijednosti unesemo u graf
zajedno s idealnim pravim vrijednostima udaljenosti izmeu dva gena dobit emo krivulju
koja se naziva funkcija kartiranja.
ZADACI:
1. Zato se dva svojstva iji se lokusi nalaze na istom kromosomu ne nasljeuju prema
zakonitostima II. Mendelovog zakona nasljeivanja?
4. Na kromosomu III u vinske muice, lokus e (od ebony, crna boja tijela) nalazi se na
67,5 jedinica genske karte, dok se lokus w (od white, bijele oi) nalazi na 72 jedinice
genske karte. Koliko su udaljena ova dva lokusa izraeno u jedinicama genske
udaljenosti?
5. U enke vinske muice, genski lokusi e i h (od hairless, tijelo bez dlaka) nalaze se na
kromosomu III, dok se lokus swg (od small-wing, kratka krila) nalazi na kromosomu I.
A) Koliko razliitih vrsta gameta stvara trihibrid? B) Ispii genotipove gameta.
36
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: VEZANI GENI
7. Kod vinske muice, geni za boju tijela (b+ = siva boja tijela; b = crna boja tijela) i
duinu krila (vg+ = duga krila; vg = kratka krila) su vezani. Provedeno je test krianje
dihibrida koje je dalo 17% rekombinantnih potomaka. A) Kolika je zastupljenost (u
postotcima) pojedinih fenotipskih klasa nastalih nakon krianja? B) Kolika bi bila
zastupljenost pojedinih fenotipskih klasa da se lokusi b i vg nalaze na razliitim
kromosomima?
10. Mendel je studirao 7 pari kontrastnih karakteristika kod vrtnog graka (Pisum
sativum). Zato nikada nije otkrio princip vezanog nasljeivanja?
11. Koliko vezanih grupa gena posjeduje: A) enka skakavca 2n=22+XX, B) mujak
skakavca 2n=22+X, C) obini jeam 2n=14, D) ena 2n=44+XX, e) mukarac
2n=44+XY?
12. Eliptocitoza (rijetko i nekodljivo stanje kod kojeg su eritrociti elipsoidni umjesto
uobiajenog diskoidalnog oblika) i sposobnost stvaranja antigena D su oba
dominantna i vezana svojstva. Rh-pozitivan mukarac pokazivao je eliptocitozu kao i
njegova Rh-negativna majka. Njegov otac je imao normalne eritrocite i bio je Rh-
pozitivan. A) Upotrijebivi simbol E za eliptocitozu i D za produkciju antigena D,
prikaite genotip mukarca. B) Koju vrstu vezane konfiguracije predstavlja ovaj
genotip?
37
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: VEZANI GENI
15. Koliko razliitih gameta i u kojem omjeru stvara mujak vinske muice genotipa
Ab/Ab, ako su geni vezani?
16. Kod kukuruza, obojeni aleuron (R) je dominantno svojstvo nad bezbojnim aleuronom
(r). uta boja biljke (y) je recesivna u odnosu na zelenu boju (Y). Dvije biljke (A i B),
heterozigoti, kriane s dvostrukim recesivnim homozigotom ry/ry, dale su slijedee
potomstvo:
Fenotip biljke A B
Obojeni aleuron, zelena 88 23
biljka
Obojeni aleuron, uta biljka 12 170
Bezbojni aleuron, zelena 8 190
biljka
Bezbojni aleuron, uta biljka 92 17
17. Test krianje enki vinske muice heterozigotnih za tri recesivna svojstva: grimizne
oi (st), zdepasta krila (dp) i crno tijelo (b) s mujacima recesivnim za sva tri svojstva,
dobiveno je slijedee potomstvo (fenotipski):
+++ 210
++b 104
+ dp + 96
+ dp b 232
st + + 224
st + b 98
st dp + 102
st dp b 240
18. Oko bubreastog oblika vinske muice pod kontrolom je recesivnog gena k koji se
nalazi na III kromosomu. Naranasto oko je pod kontrolom recesivnog gena cd
(cardinal) na istom kromosomu. Izmeu ova dva lokusa smjeten je lokus e
38
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: VEZANI GENI
k cd + 1761
e+ + 1773
ke+ 128
cd + + 138
k++ 97
e cd + 89
k e cd 6
+++ 8
39
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MEHANIZMI DETERMINACIJE SPOLA
Spol nekog organizma je najee odreen slijedom vrlo sloenih dogaaja tijekom
embrionalnog razvoja, a pod kontrolom su razliitih gena i hormona. Meutim, pravac u
kojem e krenuti razvoj prema jednom ili drugom spolu najee je determiniran s jednim ili
vrlo malim brojem gena. Ti geni okidai nalaze se na spolnim kromosomima u onih vrsta kod
kojih se spol odreuje na temelju spolnih kromosoma. Spol ne mora nuno biti odreen
spolnim kromosomima, ve moe ovisiti o stupnju ploidnosti, genskoj ravnotei,
autosomalnim genima, te okolinim faktorima.
40
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MEHANIZMI DETERMINACIJE SPOLA
mujaka nema rane transkripcije gena zbog prisutnosti veeg broja represorskih proteina
kodiranih denominatorskim genima. Kasnije tijekom embrionalnog razvitka u oba spola
poinje transkripcija gena sxl sa kasnog promotora, no prisutnost proteina Sxl u enki
potrebna je za pravilno prekrajanje pre-mRNA i proizvodnju funkcionalnog proteina Sxl.
Protein Sxl je ukljuen u pravilnu preradu svog vlastitog transkripta kao i transkripata drugih
gena te na taj nain utjee na ekspresiju cijelog niza gena koji dovode do formiranja enske
jedinke.
Dakle, omjer X/A u stvari predstavlja kompeticiju izmeu transkripcijskih aktivatora
gena slx kodiranih genima na kromosomu X i transkripcijskih represora kodiranih genima koji
se nalaze na autosomima.
1 enka
0,5 mujak
>1 superenka*
<0,5 supermujak*
0,5-1 meuspol
41
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MEHANIZMI DETERMINACIJE SPOLA
U mnogih gmazova, ukljuujui veinu kopnenih kornjaa, morske kornjae (slika 5.3.) i
sve krokodile, spol jedinke odreen je temperaturom okolia tijekom inkubacije jajeta. Period
u drugoj treini inkubacije naziva se termoosjetljivi period i u tom razdoblju dolazi do
aktivacije termoosjetljivog enzima aromataze koji pretvara androgene u estrogene.
Temperatura pri kojoj dolazi do aktivacije enzima ovisi o vrsti organizma. Kod glavate elve,
primjerice, pri temperaturi od 26C embrij e se razviti u mujaka, a pri 32C u enku.
42
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MEHANIZMI DETERMINACIJE SPOLA
Ovaj tip determinacije karakteristian je za veinu sisavaca i neke kukce (Diptera). enke su
HOMOGAMETNOG spola (stvaraju jednu vrstu gameta s obzirom na spolne kromosome;
X), a mujaci su HETEROGAMETNOG spola (stvaraju dvije vrste gameta: 50% gameta nosi
X, a 50% gameta nosi Y kromosom).
Slika 5.4. Nasljeivanje spolnih kromosoma u vrstama sa XX/XY tipom determinacije spola.
43
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MEHANIZMI DETERMINACIJE SPOLA
Slika 5.5. Barr-ovo tjelece vidljivo kao tamno podruje uz periferiju jezgre
44
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MEHANIZMI DETERMINACIJE SPOLA
X0
XY
XX
XXY
XXX
istim vatiranim tapiem nekoliko puta proite po unutarnjoj strani bukalne sluznice i
napravite razmaz na predmetnom stakalcu. Dodajte kap acetokarmina, pokrijte pokrovnicom,
lagano zagrijte i pritisnite palcem pokrovnicu zajedno sa filter papirom (squash). Spolni
kromatin vidljiv je kao jae obojano duguljasto tijelo uz jezgrinu ovojnicu.
Nacrtajte sliku koju vidite promatrajui stanice pomou mikroskopa te na njoj oznaite Barr-
ovo tijelo!
Ovaj tip determinacije spola predstavlja evolucijski derivat XX/XY tipa determinacije
spola, a nalazimo ga u nekih vrsta sisavaca i nekih kukaca, primjerice stjenica, skakavaca i
kornjaa. enke su homogametnog spola (XX), dok su mujaci (X0) hetererogametnog spola
(slika 5.6.).
Slika 5.6. Nasljeivanje spolnih kromosoma u vrsta sa XX/XO tipom determinacije spola.
45
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MEHANIZMI DETERMINACIJE SPOLA
Slika 5.7. Nasljeivanje spolnih kromosoma u vrsta sa ZZ/ZW tipom determinacije spola.
Spolno vezanim genima nazivamo one gene koji se nalaze na kromosomu X ili
analognom kromosomu Z. Kod veine organizama kromosom Y nosi vrlo malo ili gotovo
nema aktivnih gena, stoga se spolno vezani geni prvenstveno odnose na gene na kromosomu
X. Gene na kromosomu Y nazivamo holandrinima zato jer ih nalazimo samo u mujaka.
Mujaci su za spolno vezane gene HEMIZIGOTI jer nose samo jedan alel za spolno-vezana
46
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MEHANIZMI DETERMINACIJE SPOLA
svojstva.
Kod diploidnih organizama s XX/XY ili XX/XO tipom determinacije spola, svojstvo
determinirano spolno-vezanim:
Boja oiju u vinske muice odreena je genom koji se nalazi na X kromosomu. Crvena boja
oiju (divlji tip) dominantna je u odnosu na bijelu boju. Budui da enke imaju dva X
kromosoma, one mogu biti homozigotne ili heterozigotne za ovaj gen, dok mujaci mogu biti
samo hemizigotni tj. boja oiju ovisi o genu koji se nalazi na X kromosomu naslijeenom od
majke:
areno perje kod kokoi odreeno je spolno vezanim dominantnim alelom ZB, dok recesivni
alel Zb odreuje jednobojno perje. Na kromosomu W nema alela za boju perja.
47
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MEHANIZMI DETERMINACIJE SPOLA
ZADACI
a) Ako bi se gen za bijelu boju oiju nalazio na autosomu, kakav fenotipski omjer biste
oekivali nakon krianja istih linija enke crvenih i mujaka bijelih oiju?
b) Ako bi se gen za bijelu boju oiju nalazio na kromosomu Y, kakav biste fenotipski
omjer oekivali nakon krianja istih linija enke crvenih i mujaka bijelih oiju?
3. Zamislite da imate dvije iste linije kanarinaca, jedna linija kanarinaca ima uto perje,
a druga smee. U krianjima izmeu te dvije linije, ute enke i smei mujaci dobili
su samo smee potomke, dok su smee enke i uti mujaci dobili smee potomke
mukog spola i ute potomke enskog spola. Predloite hipotezu koja objanjava ove
rezultate. Napiite ova krianja.
4. Kriali ste enku vinske muice bijelih oiju s mujakom divljeg fenotipa.
48
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MEHANIZMI DETERMINACIJE SPOLA
6. Krzno boje kornjaevine, kombinacija naranaste i crne boje krzna iskljuivo ovisi o
spolno-vezanom genu na kromosomu X. O emu ovisi veliina povrine krzna jedne
ili druge boje?
8. Kakvo potomstvo oekujete kod roditelja koji su fenotipski normalnog vida, ali je
majka nositeljica gena za daltonizam.
49
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MEHANIZMI DETERMINACIJE SPOLA
10. ena s defektnom zubnom caklinom (dominantno spolno-vezano svojstvo) ima oca
daltonistu sa zdravim zubima i majku normalna vida, ali defektne zubne cakline, a
udaje se za svog bratia koji je daltonist s normalnom zubnom caklinom. Koja je
vjerojatnost da e njihovo dijete biti daltonist s normalnom zubnom caklinom?
11. Miina distrofija (MD) je bolest u ljudi uzrokovana rijetkim X-vezanim recesivnim
alelom. Uzrokuje progresivno slabljenje miia i smrt prije 20-te godine ivota.
a) Koja je vjerojatnost da prvi sin ene iji je brat imao MD, takoer
oboli od miine distrofije?
b) Koja je vjerojatnost da drugi sin ene iji je brat imao MD, oboli od
MD, ako prvi sin takoer ima MD?
c) Koja je vjerojatnost da dijete zdravog oca iji brat ima MD, oboli od
MD?
12. areno perje kod kokoi odreeno je spolno vezanim dominantnim alelom B, dok
recesivni alel b odreuje jednobojno perje. Kakve pilie oekujte iz krianja
jednobojne koke i arenog pijetla iji je enski roditelj bio jednobojan?
13. Pretpostavimo da je boja perja u papige spolno vezano svojstvo i da je zeleno perje
(P) dominantno nad plavim (p). Kakve potomke oekujete nakon krianja zelene
enke i plavog mujaka?
14. Spolno vezani gen notch (N) je letalan u vinske muice u hemizigota i dominantnih
homozigota. Mutacija se fenotipski oituje kao urezi na vrhovima krila. Kakvo
potomstvo oekujete nakon krianja mujaka divljeg tipa i enke koja ima ureze na
krilima? Kakvi su fenotipski omjeri F 1 i F 2 generacije s obzirom na spol i oblik krila?
16. Autosomalni recesivni gen tra, kada ju u homozigotnom stanju, transformira enke
vinske muice u fenotipske mujake koji su sterilni. Taj gen nema utjecaja na mujake
vinske muice. Kriani su enka heterozigotna za tra lokus i mujak homozigotan za
recesivni alel. Kakav odnos spolova oekujete meu potomstvom?
50
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: VINSKA MUICA
6. VINSKA MUICA
Vinska muica je maleni kukac, dvokrilac, duine 2-3 mm ije je znanstveno ime
Drosophila melanogaster, Meigen 1830. Naziv je dobila prema latinskim rijeima koje
oznaavaju organizam koji voli rosu, vlagu i ima tamni zadak. Vjerojatno ste je zapazili
krajem ljeta i u jesen kad se u velikom broju sakuplja na toplim mjestima na kojima
fermentira voe, vino, pivo ili isparava octena kiselina. Do sada je otkriveno preko 1200
vrsta roda Drosophila. Veina vrsta ivi u tropskoj i suptropskoj zoni. Smatra se da D.
melanogaster potjee iz indo-malajskog podruja. Pratei transport voa, iri se u gotovo
sva podruja svijeta te postaje kozmopolit. Slab je leta. U toku dana udalji se najvie do
180 m.
Vinska muica je pogodan organizam za upoznavanje razliitih biolokih procesa
(razvitak, nasljeivanje, mutacije i dr.). Njezino je ime u znanosti vezano uz razvoj klasine i
molekularne genetike. Vinska muica se koristi u genetikim istraivanjima od 1909. godine
kada ju je u svoje pokuse uveo Thomas H. Morgan (1866-1945). Od tada je ova neugledna
muica nezamjenjiv materijal u klasinim i molekularnim genetikim istraivanjima. Postoji
niz razloga zato je vinska muica modelni organizam u genetikim istraivanjima:
Vinska muica ima 4 para kromosoma (2n=8): 3 para autosoma (kromosomi II; III;
IV) i jedan par spolnih kromosoma X i Y. Kromosom X je velik i akrocentrian, kromosomi
II i III su veliki i metacentrini, a kromosom IV je znaajno manji od ostalih kromosoma u
kariotipu (2% veliine najveeg autosoma) i naziva se minutni kromosom. Veliina genoma
vinske muice iznosi 165 x 106 pb. Genom se sastoji od oko 13.600 gena.
51
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: VINSKA MUICA
GRAA TIJELA
Vinska muica kao i svi kukci ima tijelo sastavljeno od glave, prsa i zatka. Povrinu
tijela obavija hitinski oklop pokriven sitnim dlaicama i krupnijim ekinjama.
Na glavi se nalaze usni organi, ticala i oi. Tri mala jednostavna oka smjetena su na
tjemenu, a velike poput saa sastavljene oi nalaze se na bonim stranama glave. U mujaka
one imaju oko 740 okaaca, a u enke oko 780. Usni organi s velikom donjom usnom se
isprue u sluaju ako lagano iglicom pritisnete glavu.
Prsa se sastoje od tri kolutia. Svaki koluti povezan je s jednim parom lankovitih
nogu. Velika ispruena krila vezana su za drugi koluti. Iza njih na zadnjem prsnom kolutiu
vide se mali izrataji poput balonia, mahalice. To su ostaci nekadanjeg drugog para krila
nestalih tokom evolucije. Zadak je sastavljen iz 10 segmenata. U enke jasno se uoava 7
kolutia, a u mujaka 6. Ostali kolutii su izmijenjeni, izgrauju strukture vezane za spolne
organe.
Slika 6.1. Spolni dimorfizam (dvolije) vinske muice: mujak (lijevo) i enka (desno).
Upotrebom mikroskopa moete ralanjivanjem zatka dobro vidjeti probavilo, dine organe i
spolni sustav.
SPOLNO DVOLIJE
U vinskih muica relativno je dobro izraeno spolno dvolije (dimorfizam, slika 6.1.)
vidljivo okom iskusnog promatraa ili pomou lupe. Razvrstajte narkotizirane muice u dvije
skupine prema veliini tijela i obliku zatka. enke su vee, zadak zavrava iljato. Na lenoj
strani vidi se 5-6 vodoravnih tamnih pruga. Na zatku mujaka vidljive su dvije pruge i tamni
obli zavretak zatka (Slika 3.1). Okrenite muicu na lea. Na prednjim nogama samo mujaci
imaju spolni ealj, vidljiv na malom poveanju kao crna toka. Sekundarne spolne osobine
mujaka i enki vinske muice predoene su u Tablici 6.1.
52
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: VINSKA MUICA
Mujak enka
Manji Vea
Zaobljen zadak Zailjen zadak
Distalni dio zatka tamno obojen Na distalnom dijelu zatka tamne i svijetle
pruge
Na prvom paru nogu ealj za prihvaanje Nema elja na prvom paru nogu
na enku pri kopulaciji
Kopulatorni organi izmeu dva genitalna Vanjsko genitalno polje s leglicom
nabora
RAZVOJNI CIKLUS
DAN STADIJ
1 Poloeno jaje
2 Izlaenje iz jaja
3 Prvo presvlaenje
4 Drugo presvlaenje
5 Tree presvlaenje
6 Poetak kukuljienja
10 Odrasla muica
1 1 1 3 4
1 2/3 4 5 6 10
Slika 6.2. Faze razvoja vinske muice: brojevi iznad strelica predstavljaju broj dana izmeu
pojedinih faza razvoja. Brojevi ispod crtea odgovaraju gore navedenim stadijima razvoja.
53
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: VINSKA MUICA
OPLODNJA
Ako stavimo dva do tri para muica na svjeu hranjivu podlogu, nakon perioda
prilagoavanja u povoljnim uvjetima u toku prvog dana dolazi do parenja i oplodnje.
Mujak zapoinje ples krilima. enku prepoznaje mirisom. Za vrijeme parenja mujak je
privren za zadak enke, savijen u luku to traje oko dvadeset minuta. 500-700
spermatozoida preivljava nekoliko dana u spolnim organima enke. Jedno parenje
dovoljno je za oplodnju do 600 jajnih stanica. enke vinske muice pare se vie puta pa
moe doi do mijeanja sperme i pojave potomaka razliitih svojstava.
Prva dva dana nakon izlaska iz kukuljice enke ne odlau jaja. enke nose najvei
broj jajaaca etvrti i peti dan i tada ih u toku dana mogu odloiti 50-70. Broj snesenih jaja
najvie ovisi o plodnosti linije i sastavu podloge. Maksimalan broj jaja ostavljaju na kulturi
kvaevih gljivica, staroj 24-36 sati. Starenjem kulture kvasca broj jajaaca se smanjuje.
GRAA JAJETA
Jaje vinske muice vidljivo je prostim okom kao bijelo sitno zrnce. Veliko je do 0,5
mm, ima ovalan oblik. Donja strana mu je ravna, a gornja obla. Na prednjem kraju nalazi se
otvor, mikropila. Izrataji (filamenti) poveavaju dodirnu povrinu s podlogom i ne
dozvoljavaju da jaje potone u tekuu podlogu. Time se osigurava embrionalni razvoj u
atmosferi s kisikom. Liinka izlazi iz jajeta pri temperaturi od 25 C nakon 24 sata.
LIINKA
Postembrionalni razvoj vinske muice poinje izlaskom male liinke velike oko 0.5
mm iz jajeta. Liinke najprije borave na povrini podloge, a zatim ulaze u podlogu. Mogu
ivjeti anaerobno, bez kisika iz atmosfere. Prozirna kutikula obavija tijelo liinke sastavljeno
iz 12 kolutia. Prvi koluti pripada glavi, tri izgrauju prsa, a zadnjih osam zadak. Liinka
raste, razvija se kroz tri razvojna stadija izmeu kojih se presvlai te odbacuje kutikulu. Od
unutranjih organa u prozirnoj liinki vidljivo je probavilo, uzdunice, lijezde slinovnice,
masno tkivo, spolne lijezde i zametne ploice iz kojih e se razviti organi kukca. Prema
razvoju prednjeg dijela uzdunica moe se odrediti u kojem je razvojnom stadiju liinka.
Primarna liinka ima samo tanke ogranke uzdunica u prsnim segmentima. U sekundarnoj se
formiraju dini otvori. Izgledaju poput pribadae, jo uvijek su zatvoreni. Otvaraju se u
sekundarnoj liinki, razgranjenim nastavcima poput kista. Zavretkom treeg razvojnog
stadija liinke dostiu duinu do 5 mm. Izlaze iz hranjive podloge, pronalaze suha mjesta,
privrste se, skrauju i prelaze u stadij pretkukuljice. Kutikula se ne odbacuje, ve se
stvrdnjava u bavicu, puparijum, uto-smee boje. Pretkukuljica se unutar bavice odvaja i
razvija u novu kutikulu. Razvoj liinke pri temperaturi od 25 C traje etiri dana.
KUKULJICA
54
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: VINSKA MUICA
boje i bez pigmenta. Krila su joj sloena na zatku. Postepeno ih iri, dobiva pigment i izgled
odrasle muice.
voda 400 ml
agar 4 g
eer 40g
propionska kiselina 4 ml
Podlogu skuhajte tako da najprije postupnim zagrijavanjem vode otopite agar, a zatim
eer i kvasac. Smjesu zagrijte do vrenja, dodajte posije, kuhajte uz stalno mijeanje 10
minuta. Nakon kuhanja u podlogu se doda propionska kiselina. Smjesu dobro promijeajte da
dobije ravnomjernu koncentraciju konzervansa. Nakon prestanka isparavanja podlogu izlite
kroz lijevak u sterilizirane staklene boice ili epruvete do visine oko 2 cm. Nakon to se
podloge ohlade zatvorite ih epovima od vate. Do upotrebe podloge je najbolje drati u
hladnjaku na temperaturi vioj od ledita. Zamrzavanjem bi agar izgubio sposobnost
vezivanja vode. Suenje podloge sprijeite pokrivanjem otvora posude folijom ili poklopcem.
OPREMA ZA ISTRAIVANJE
55
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: VINSKA MUICA
Kemikalije:
Eter
Pribor:
Lupa i mikroskop
Petrijeve zdjelice
Predmetna stakalca
Mekani kist
Slamice za hvatanje i anesteziranje muica
Sterilna gaza
kare
Ljepljiva traka
Izradite alat za hvatanje vinske muice. Na raspolaganju vam je slamica, sterilna gaza
i ljepljiva traka. Odreite dio sterilne gaze (otprilike 4 cm x 4 cm). Sa sterilnom gazom
pokrite jedan otvor slamice te zalijepite ljepljivom trakom. Usiite muice u slamicu
(otvor slamice sa sterilnom gazom okrenut je prema gore). Dovoljno je da upuete
jednog mujaka i jednu enku. Okrenite slamicu tako da je otvor s gazom okrenut
prema dolje. Omamite muice nad eterom (otvor slamice s gazom i vinskim
muicama drite nad eterom), te ih zatim prebacite na satno staklo i gledajte uz pomo
lupe ili mikroskopa na malom poveanju. Pri omamljivanju budite oprezni, eter je lako
zapaljiv, ima snaan miris i moe ubiti muice ako su mu predugo izloene. Muice
odvajajte kistom da ih ne biste otetili. Uoite spolne razlike navedene u tablici 6.1.
MUTACIJE
56
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: VINSKA MUICA
Mutacije mogu biti recesivne (mutantni fenotip se ispoljava samo ako se radi o
recesivnom homozigotu) i dominantne (mutantni fenotip se ispoljava i kod dominantnog
homozigota i kod heterozigota). Mutirani geni mogu se nalaziti na autosomima ili na spolnim
kromosomima.
Mutante imaju razliita imena koja opisuju promijenjeni fenotip u odnosu na divlji tip.
Recesivne mutacije se oznaavaju malim slovom, a dominantne velikim slovom ili malim
slovom uz koje se nalazi oznaka + (tablica 6.2.).
oznaka naziv
kromosom mutante mutante fenotip
I (X) w white bijele oi
y yellow uta boja tijela
wa warty naranaste oi
II bw brown smee oi
savijena krila, dominantna mutacija (dom. homozigoti
Cy curly wings ugibaju)
reddish-
pr1 purple crveno-ljubiaste oi
cn cinnobar cinober oi
b black crna boja tijela
vg vestigial zakrljala krila
wg wingless bez krila, recesivna letalna mutacija
na glavi umjesto ticala narastu noge, dominantna letalna
III Antp antapedia mutacija
e ebony crno tijelo
cd cardinal naranaste oi
st scarlet grimizne oi
IV ey eyeless bez oiju
57
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: VINSKA MUICA
NEOPLOENE ENKE
Studenti se trebaju podijeliti u grupe po dvoje. Svaka grupa izvodi jedno krianje.
Prvi tjedan studenti postavljaju krianje roditeljske generacije (P). Asistent daje grupi
dvije staklene boice sa vinskim muicama. Vinske muice u obje boice su iste linije. U
jednoj se nalaze mujaci i enke divljeg tipa, a u drugoj mutantne djevianske enke
(neoploene enke). Boica s mutantnim enkama oznaena je brojem/slovom koji
predstavlja ifru mutacije. Studenti trebaju iz boice s divljim tipom uhvatiti 4-5 mujaka i
ubaciti ih u boicu s enkama. ifru treba zapisati (zapamtiti) zbog kontrole izvoenja pokusa.
Ideja je tijekom pet tjedana izvoenja pokusa dokuiti o kakvoj je mutaciji rije (dominantna
ili recesivna; spolno vezana ili autosomalna) te da li je krianje bilo dihibridno ili
monohibridno. Protokol krianja naveden je u tablici 6.3.
Drugi tjedan od postavljanja krianja (P generacije) u podlozi se nalaze liinke koje
predstavljaju F 1 generaciju. Studenti trebaju iz boice izbaciti sve odrasle jedinke tj.
roditeljsku generaciju kako se ne bi parila s F 1 generacijom (backcrossing povratno
krianje).
Trei tjedan od postavljanja pokusa krianja (P generacije) izlei e se odrasle
jedinke odnosno F 1 generacija. Tada treba iz boice u kojoj se nalaze muice F 1 generacije
uhvatiti nekoliko mujaka (4-5) i enki (3-4) i prebaciti ih u novu boicu.
etvrti tjedan od postavljanja krianja (P generacije) treba iz boice izbaciti odrasle
jedinke, odnosno F1 generaciju kako se ne bi parila s F 2 generacijom (povratno krianje). F 2
generaciju predstavljaju liinke koje su u podlozi.
Peti-esti tjedan od postavljanja krianja (P generacije) izlei e se F 2 generacija.
Studenti trebaju eterom omamiti sve jedinke F 2 generacije tako da zaepe boicu s muicama
vatom prethodno namoenom u eter, prebaciti vinske muice na satno staklo, te pod lupom
prebrojati dobivene fenotipove.
58
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: VINSKA MUICA
59
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: KARIOTIP
7. KARIOTIP OVJEKA
Spolni kromosomi:
X kromosom je metacentrian i pripada grupi B kariotipa
Y kromosom pripada grupi G kariotipa
60
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: KARIOTIP
61
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: KARIOTIP
62
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: KARIOTIP
Slika 7.4. Kromosomi vrste Anemone hortensis (2n=2x=16) nakon bojanja fluorokromom DAPI.
Svjetlo plave pruge predstavljaju heterokromatinska podruja na kromosomu bogata parovima
baza AT. Karakteristine interkalarne DAPI-pruge nalaze se na svim akrocentrinim
kromosomima, dok se telomerne-DAPI pruge nalaze na duim krakovima svih akrocentrinih,
jednog meta-submetacentrinog kromosoma i jednog metacentrinog kromosoma.
63
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: KARIOTIP
1 2 3 4 6 8
Praktian rad
Svaka grupa (tri ili etiri studenta) ima jedan preparat na raspolaganju.
Kromomicin i DAPI su mutageni i kancerogeni stoga OPREZ PRI
UPOTREBI! Treba koristiti zatitne rukavice i kute!
Za vrijeme bojanja drati preparate u mraku.
Preparati se boje kromomicinom u trajanju od 1 h. Za to vrijeme treba napraviti
zadatak 2
Praktian rad
Materijal
CMA: radna koncentracija 0,1 mg/ml (u McIvaine puferu s 2,5 mM MgCl2, pH=7)
DAPI: radna koncenracija 0,1 g/ml (u 2xSSC puferu)
Distamicin: radna koncentracija 0,2 mg/mL (u McIlvaine puferu s 2,5 mM MgCl2,
pH=7)
64
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: KARIOTIP
Destilirana voda
Otopina za uklapanje: McIlvaine pufer s MgCl2 i glicerolom u omjeru 1:1
Pufer McIlvaine bez Mg2+, pH=7
Pufer McIlvaine sa 2,5 mM MgCl2, pH=7
Plastina pokrovnica
Pinceta
Iglica za preparaciju
Pokrovno stakalce
Kadica za bojanje preparata
Poklopac od kutije
PROTOKOL:
65
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: KARIOTIP
66
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: KARIOTIP
67
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: KROMOSOMSKE ANOMALIJE
8. KROMOSOMSKE ANOMALIJE
KVANTITATIVNE PROMJENE
DELECIJE
68
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: KROMOSOMSKE ANOMALIJE
Uinak delecija:
Cri-du-chat sindrom
Delecija dijela kromosoma 5 (1/50.000 novoroenadi)
Maji pla novoroenadi; mentalna retardacija
Prader-Willi sindrom
Delecija dijela kromosoma 15 (oinskog); 1/10.000-25.000
Slabo razvijena djeca, problemi s prehranom (pretilost), mentalna
retardacija
Angelman sindrom
Delecija dijela kromosoma 15 (majinskog); 1/20.000
Razvojni problemi, poremeaji spavanja, nekontrolirani pokreti
(Happy puppet syndrome)
69
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: KROMOSOMSKE ANOMALIJE
DUPLIKACIJE
Jedan kromosom unutar homolognog para ima deleciju (ABFGHIJ), dok je drugi normalan
(ABCDEFGHIJ). Centromer se nalazi izmeu gena G i H. Nacrtaj bivalent koji se formira u
profazi I mejoze.
Duplikacija moe nastati kao rezultat nejednolikog krosing-overa (slika 8 . 4.). Rezultat
nejednolikog krosing-overa je poveanje i gubitak broja kopija uzastopnih ponavljanja.
Satelitske DNA koje se sastoje od odsjeaka DNA koji se uzastopno ponavljaju mogu se putem
nejednolikog krosing-overa proiriti po genomu u relativno kratkom periodu. Duplikacijama su
nastale mutante Bar vinske muice (slika 8.4.). Multigenske porodice, kao na primjer
hemoglobinski geni, nastale su kao rezultat duplikacija.
70
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: KROMOSOMSKE ANOMALIJE
71
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: KROMOSOMSKE ANOMALIJE
KVALITATIVNE PROMJENE
INVERZIJE
Inverzije se dogaaju kada se unutar pojedinog kromosoma dogodio lom na dva mjesta,
nakon ega se odlomljeni dio kromosoma zarotira za 180 (inverzija) i ponovno
intergrira u kromosom ali u obrnutoj orijentaciji. Kod inverzija nema gubitka DNA.
Inverzija ne predstavlja problem za osobu koja je tu aberaciju naslijedila od roditelja. Postoji
slabo poveani rizik za fenotipske abnormalnosti ako se inverzija dogodila de novo (u mejozi ili
postzigotno) zbog mogueg prekida u nekom esencijalnom genu. Iako je osoba, nositelj
inverzije, potpuno zdrava i normalna, ima problema sa gametogenezom. Naime, kod takvih
osoba postoji poveani rizik od stvaranja kromosomski nebalansiranih gameta. Nebalansirane
gamete nastaju zbog toga to kromosom s inverzijom ima problema u sparivanju sa svojim
homologom za vrijeme profaze I mejoze. Da bi se kromosomi mogli spariti u profazi I formira
se inverzna oma (slike 8.6. i 8.7.). Problem nastaje ako se unutar inverzne ome dogodi
krosing-over iji je rezultat nastanak genetiki nebalansiranih gameta koje sadre kromosom
koji je pretrpio viestruke strukturne promjene. Takve gamete ne preivljavaju (nisu vijabilne)
pa je osoba s inverzijom smanjeno fertilna.
72
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: KROMOSOMSKE ANOMALIJE
Vezani geni obino zajedno preive inverziju, tako da redoslijed gena obino ostane isti.
Homozigoti: ADCBEFGH nemaju problema u razvoju
ADCBEFGH
Heterozigoti: ABCDEFGH
ADCBEFGH mogu je problem u gametogenezi - smanjena fertilnost
Gamete su razliite, ovisno o tome da li se radi o paracetrinoj ili o
pericentrinoj inverziji.
PARACENTRINA INVERZIJA
PERICENTRINA INVERZIJA
Zakljuak:
1) Za veinu tipova kromosomskih rearanmana:
2) Inverzije mogu igrati ulogu mehanizma reproduktivne izolacije izmeu dvije populacije,
vodei ka specijaciji.
Primjer:
IN = divlji tip; in = inverzija
TRANSLOKACIJE
Pri translokaciji nema gubitka DNA. Moe doi do promjene u ekspresiji ako se promijeni
poloaj gena = pozicijski uinak.
a. Intrakromosomska
b. Interkromosomska
c. Reciprona
d. Nereciprona (=jednosmjerna translokacija) jedan kromosom pretrpi deleciju
(DONOR fragmenta), a drugi kromosom pretrpi adiciju fragmenta (RECIPIJENT
fragmenta)
74
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: KROMOSOMSKE ANOMALIJE
II. Heterozigoti: Nastaju ako se spare gameta s normalanim kromosomom (N) i gameta s
translociranim kromosomom (T). Reciproni translokacijski heterozigot nastane ako se
spoji gameta s normalnim kromosomima (N1 i N2) s gametom s reciprono translociranim
kromosomima (T1 i T2). Heterozigoti su polusterilni.
75
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: KROMOSOMSKE ANOMALIJE
76
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: KROMOSOMSKE ANOMALIJE
a o m c
a c m o a c m o
a o
m c
a c
m o
1:
2:
3:
4:
77
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: KROMOSOMSKE ANOMALIJE
1:
2:
3:
4:
U vrsti Rhoeo discolor, jedan set kromosoma zahvaen je translokacijama, a drugi nije
(slika 8.11.).
78
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: KROMOSOMSKE ANOMALIJE
Svaka grupa posjeduje odreenu skupinu letalnih gena koji se nalaze u podruju kromosoma
koje se ne sparuju. Letalni geni postaju aktivni u zigoti. Samo kombinacija GV
preivljava zbog kompenzatornih gena.
79
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: KROMOSOMSKE ANOMALIJE
2n -2 nulisomik
2n -1 monosomik
2n -1-1 dvostruki monosomik
2n +1 trisomik
2n +1+1 dvostruki trisomik
2n +2 tetrasomik
Aneuploidija moe nastati zbog nepravilne raspodjele kromosoma u mejozi, tonije zbog
nerazdvajanja kromosoma u anafazi I ili u anafazi II. Par kromosoma odlazi na isti pol nakon
ega nastaje gameta s vikom kromosoma i gameta bez jednog kromosoma. Aneuploidija
uzrokuje neravnoteu u kromosomskom komplementu to rezultira abnormalnim fenotipom.
Gotovo svi monosomici za autosome u ovjeka umiru odmah nakon zaea, a samo
nekoliko trisomika za autosome preivljava. Najpoznatija trisomija je Downov sindrom (slika
8.12.) ili trisomija kromosoma 21. Trisomici za kromosome 13 i 18 takoer
preivljavaju porod ali su oteenja vea nego u osobe s Downovim sindromom.
Ope pravilo je da gubitak ili viak spolnih kromosoma ima manje teke posljedice nego
gubitak ili viak autosoma. Najpoznatije aneuplodije spolnih kromosoma su Turnerov sindrom
(45, X) i Klinefelterov sindrom (47, XXY).
Slika 8.12. Kariotip osobe koja s Down-ovim sindromom (47, XY, +21).
80
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: KROMOSOMSKE ANOMALIJE
EUPLOIDIJA
Euploidija je promjena broja kromosoma koja zahvaa cijeli kromosomski set.
MONOPLOIDIJA
Monoploidi imaju samo jedan kromosomski set, a takve su i gamete diploidnih
organizama (n).
POLIPLOIDIJA
Poliploidi su organizmi s tri ili vie kromosomskih setova (3n, 4n, 5n, 6n)
Primjer:
n=7
2n = 14 diploid
3n = 21 triploid
4n = 28 tetraploid
5n = 35 pentaploid
6n = 42 heksaploid
ZADACI:
1. Acer platanoides (mlije) i A. campastre (klen), oba imaju diploidan broj kromosoma
2n = 26. Iako su to dvije vrste istog roda, njihovi hibridi su sterilni. Objasnite zato?
Da li je mogue dobiti fertilan hibrid i kako? Prisjetite se Karpeenkovog pokusa.
Monosomik
Trisomik
Tetrasomik
Dvostruki trisomik
Nulisomik
Monoploid
Triploid
81
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: KROMOSOMSKE ANOMALIJE
Alotetraploid
4. Majka daltonostica i otac normalnog vida imaju dijete normalnog vida s Klinefelterovim
sindromom. Prikaite krianje, specijalno gamete koje daju ovu kombinaciju.
5. Diploidan broj kromosoma vrtnog graka je 2n = 14. Koliko moe nastati razliitih
trisomika ? Koliko razliitih dvostrukih trisomika moe nastati?
6. Do kakve promjene obzirom na broj kromosoma moe doi nakon djelovanja mutagena
koji je potpuno unitio diobeno vreteno u somatskim stanicama luka Allium cepa (2n =
16)?
82
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: GENETIKA MIKROORGANIZAMA
9. GENETIKA MIKROORGANIZAMA
1. Bakterije i virusi imaju jedan set genetike informacije (kao i gamete diploidnih
organizama).
2. Geni haploidnih organizama nisu niti dominantni niti recesivni, zbog prisutnosti samo
jednog alela. Svaki gen kojeg posjeduje organizam moe doi do izraaja u fenotipu.
3. Relativna jednostavnost mikroorganizama (npr. virusa) prua mogunosti za
prouavanjem strukture gena na molekularnoj razini.
4. Mogue je prouavanje mutacija, jer s lakoom moemo dobiti velik broj stanica
(jedinki) u populaciji (106-109 stanica po epruveti ili petrijevoj posudi).
5. Upotreba selektivnih podloga omoguuje izolaciju jedne mutante iz populacije od 106
stanica.
6. Kratko generacijsko vrijeme (veina mikroorganizama se dijeli svakih 30 min, pa tako
iz jedne stanice kroz 15 sati moe nastati 30 generacija).
7. Svi potomci nespolnog razmnoavanja (binarna dioba) su genetiki identini i
predstavljaju klon.
Nedostaci mikroorganizama:
1. Dijele se amitotski
2. Nema pravilnih rekombinacijskih pojava
3. Nema morfolokih varijacija
Bakterije se uzgajaju na hranjivim podlogama koje sadre hranjive tvari potrebne za rast i
razvoj bakterija. Hranjive podloge dijelimo na:
83
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: GENETIKA MIKROORGANIZAMA
SELEKTIVNA PODLOGA
Minimalna podloga + odreena aminokiselina
PROTOTROFAN SOJ bakterijski soj koji raste na MINIMALNOJ PODLOZI. Divlji soj
je prototrofan i raste na minimalnoj podlozi.
Rijeite zadatak:
Genotip kolonije 1:
Genotip kolonije 2:
Genotip kolonije 3:
Genotip kolonije 4:
Genotip kolonije 5:
Genotip kolonije 6:
84
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: GENETIKA MIKROORGANIZAMA
1. KONJUGACIJA
Muka stanica, donor, posjeduje spolni faktor (plazmid) F, pa se obiljeava kao F+, dok
enska stanica, recipijent, ne posjeduje taj faktor pa se obiljeava kao F- (slike 9.1 i 9.2.).
Neki sojevi mogu integrirati plazmid F u svoj genom. To su sojevi Hfr (engl. high frequency
of recombination) koji imaju visoku sposobnost prijenosa genetikog materijala u stanicu F-.
Tijekom konjugacije Hfr i F- soja dolazi do prijenosa integriranog plazmida i dijela
bakterijskog kromosoma iz stanice donora (Hfr) u stanicu recipijenta (F-). Dio kromosoma
donora sparuje se s homolognim segmentom kromosoma recipijenta, i ako nastanu barem
dvije rekombinacije (odnosno dva krosing-overa) doi e do ugradnje i nastanka
rekombiniranog kromosoma. Hfr sojevi se meusobno razlikuju prema mjestu gdje se ugradio
plazmid F. Da bi se izolirale eljene rekombinante potrebno je provesti selekciju. Na temelju
dobivenih podataka izrauju se genetike karte za onaj dio kromosoma koji prenosi neki Hfr
soj (slika 9.3.). Za izradu genetike karte koriste se vremenske jedinice i jedinice
rekombinacije.
85
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: GENETIKA MIKROORGANIZAMA
Zadatak:
Egzogenot =
Endogenot =
Merozigota =
Parcijalni diploid =
86
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: GENETIKA MIKROORGANIZAMA
je u stanici F- lokus a mutiran (a-) onda je vjerojatnost da se zamijeni divljim tipom alela a
(a+) iz stanice Hfr vea.
Slika 9.3. Mjesta u bakterijskom kromosomu gdje se moe ugraditi plazmid F oznaena su
crveno, plavo, uto i zeleno. Za potrebe kartiranja odreenog dijela bakterijskog kromosoma
izabire se odreeni bakterijski soj. Na primjer, ako elimo kartirati podruje na kromosomu
oznaeno slovima ONMLK za pokus izabiremo soj Hfr 2.
Zadatak:
Nacrtajte konjugaciju izmeu bakterije F+ i F- s posebnim osvrtom na sigma replikaciju.
Zadatak:
F plazmid se ugradio pokraj gena trf+ i leu+ i nastao je soj Hfr. Pri konjugaciji bakterija Hfr i
F- geni trf+ i leu+ zajedno se s plazmidom F izrezuju iz bakterijskog kromosoma stanice Hfr
te se prenose u stanicu F-. Stanica F- je recipronog genotipa (trf- leu-). Nacrtajte ugradnju
gena trf+ i leu+ u genom stanice F-. Kakvu biste podlogu izabrali za izolaciju prototrofnih F-
stanica?
87
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: GENETIKA MIKROORGANIZAMA
ZADATAK:
Soj Hfr koji nosi prototrofne biljege a+, b+, c+ mijea se s F- sojem koji nosi auksotrofne
biljege a-, b- i c-. Konjugacija je prekidana svakih 5 minuta i bakterije su nacijepljene na
podloge koje otkrivaju prisutnost rekombinanti.
Vrijeme rekombinante
5 min a-b-c+
10 min a-b+c+
15 min a+b+c+
ZADATAK:
Rezultati vremenskg kartiranja prikazani su na slici 9.4. Koji je redoslijed biljega gal, trp, leu i
thr na bakterijskom kromosomu?
88
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: GENETIKA MIKROORGANIZAMA
Biljezi thr i leu ulaze u isto vrijeme u stanicu F-. to moete iz toga zakljuiti o njihovoj
relativnoj udaljenosti? Zaokruite odgovor:
B. REKOMBINACIJSKO KARTIRANJE
ZADATAK:
ZADATAK:
Znanstveni problem:
89
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: GENETIKA MIKROORGANIZAMA
Lokusi thr i leu su previe blizu te se pomou vremenskog kartiranja ne moe odrediti njihov
redoslijed u genomu bakterije. Cilj pokusa je odrediti redoslijed lokusa thr i leu.
Znanstvena hipoteza:
Prekinutom konjugacijom izmeu sojeva Hfr i F- ustanovljen je slijedei poredak lokusa na
bakterijskom kromosomu: thr-leu-gal-trp ili leu-thr-gal-trp.
Dakle, postoje dvije mogunosti redoslijeda lokusa trh i leu:
I mogunost: redoslijed je thr-leu-gal-trp
II mogunost: redolijed je leu-thr-gal-trp
Postavljanje pokusa:
Rekombinacijsko kartiranje temelji se na konjugaciji sojeva Hfr i F-. Genotipovi sojeva Hfr i
F- moraju biti RECIPRONI. Na primjer, ako je Hfr soj thr-, onda je F- soj thr+. Nakon
konjugacije potrebno je izolirati samo PROTOTROFNE F- sojeve. To se postie
nacjepljivanjem stanica na minimalnu podlogu sa streptomicinom nakon konjugacije. Na
minimalnoj podlozi narasti e samo prototrofi, a na minimalnoj podlozi sa streptomicinom
narast e prototrofi koji su rezistentni na streptomicin (odnosno F- sojevi). Dakle, za pokus
emo izabrati sojeve Hfr koji su StrS (S-senzitivan) i sojeve F- koji su StrR (R-rezistentan).
Preostaje nam da izaberemo genotip bakterija s obzirom na lokuse leu, thr, gal i trp.
Odabir genotipa mora zadovoljiti slijedee: da se mogunosti I i II razlikuju u broju
krosing-overa koji su potrebni za dobijavanje prototrofa. To su slijedei genotipovi:
Pitanje: S obzirom na gore navedene genotipove sojeva Hfr i F- koliko je potrebno krosing-
overa za dobivanje prototrofnog F- soja koji je StrR ako je poredak leu-thr-gal? Nacrtajte
krosing-overe.
Pitanje: S obzirom na gore navedene genotipove sojeva Hfr i F- koliko je potrebno krosing-
overa za dobivanje prototrofnog F- soja koji je StrR ako je poredak thr-leu-gal? Nacrtajte
krosing-overe.
Dakle, ako je va odabir genotipova zadovoljio uvjet da je kod razliitog poretka potreban
razliiti broj krosing-overa za nastanak prototrofa, izmijeate ta dva soja i nacijepite ih na
minimalnu podlogu sa streptomicinom. Bitan je samo broj kolonija koji je narastao!
90
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: GENETIKA MIKROORGANIZAMA
2. TRANSFORMACIJA
Baterijske stanice koje su sposobne primiti stranu DNA nazivamo kompetentnim stanicama
(kompetencija = sposobnost bakterijske stanice da primi stranu DNA). Neke bakterije kao na
primjer vrste Bacillus subtilis, Streptococcus sp., Pseudomonas sp., Haemophilus sp.,
Acinetobacter sp., Azotobacter sp., Neisseria sp., Thermus sp. prirodno su kompetentne, dok
se druge treba dovesti u stanje kompetentnosti. Postoji nekoliko naina kako uiniti bakterije
kompetentnima: 1) kemijski tretman na primjer stanica E. coli s 10 mM otopinom Ca2+ pri
temperaturi od 4 C, 2) elektroporacija djelovanje elektrinim impulsom u trajanju nekoliko
milisekundi nakon ega nastaju pore u membrani kroz koje gola DNA moe ui u stanicu i 3)
toplinski ok kojim uzrokuje poremeaj membrane.
Praktini rad:
Potreban materijal:
91
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: GENETIKA MIKROORGANIZAMA
LB ploe
2 bakterijska soja-prototrof i auksotrof
Etanol 96%-tni
Stakleni tapi za razmazivanje bakterija
Petrijeva posuda
Plamenik
Flomaster
Studenti e ovu vjebu raditi u grupama po troje. Svaka grupa ima na raspolaganju 3 ploe sa
hranjivom podlogom. Jedna od ploa sadri minimalnu podlogu, druga minimalnu podlogu sa
streptomicinom, a trea minimalnu podlogu sa streptomicinom te aminokiselinama treoninom,
leucinom, histidinom, prolinom i argininom.
Na raspolaganju su vam 2 bakterijska soja: A i B. Jedan od sojeva je prototrof osjetljiv na
streptomicin, a drugi je auksotrof rezistentan na navedeni antibiotik.
Svaku od ploa podijelite u 2 dijela (razdjelnu liniju oznaite flomasterom na poleini ploe) i
oznaite svaku polovicu slovom A ili B.
Nasaivanje bakterija izvodi se u laminaru u sterilnim uvjetima. Potrebno je 70%-tnim
etanolom sterilizirati laminar i pribor. tapi za nasaivanje bakterija sterilizira se tako da se
umoi u etanol te zapali. Pri otvaranju i zatvaranju epruvete sa bakterijskom suspenzijom
potrebno je nad plamenom sterilizirati otvor epruvete.
Nakapajte 20 l bakterijske suspenzije na odgovarajuu polovinu ploe te razmaite
prethodno steriliziranim tapiem. Priekajte 2-3 minute da se ploa osui te je prebacite u
termostat na 37C. Na svaku plou nasadite oba bakterijska soja (svaki na jednu polovinu)!
Odgovorite na pitanja:
92
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: REGULACIJA EKSPRESIJE GENA
93
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: REGULACIJA EKSPRESIJE GENA
E. coli, osim glukoze, moe koristiti i laktozu kao izvor energije, zahvaljujui
lac genima koji se nalaze zajedno na jednom odsjeku DNA, tzv. operonu. Operon je
usklaeni regulacijski sistem ekspresije, koji obuhvaa nekoliko gena: a) tzv.
strukturne gene, b) promotor (slijed nukleotida kojeg prepoznaje RNA polimeraza i
zapoinje transkripciju) i c) operator (slijed nukleotida na koji se vee represorski
protein). Nedaleko od lac operona nalazi se regulatorni gen ili gen regulator (i) koji
je ukljuen u kontrolu ekspresije strukturnih gena na nain da kodira (za) represor.
Represor je alosteriki protein, koji ima mogunost promjene konformacije (3D
strukture) ovisno o tome da li je za njega vezan induktor (u sluaju lac operona
induktor je laktoza). Kada u stanici nije prisutna laktoza, represor se vee na operator
i fiziki sprjeava vezanje RNA polimeraze za promotor. S druge strane, kad je u
stanici prisutna laktoza (induktor), dolazi do vezanja alolaktoze na represor. Represor
s vezanom alolaktozom mijenja konformaciju i vie se ne moe vezati na operator.
RNA polimeraza se sada moe nesmetano vezati za promotor i zapoeti transkripciju
strukturnih gena (Slika 10.2. A i B):
94
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: REGULACIJA EKSPRESIJE GENA
A Laktoze nema
B Laktoza prisutna
Slika 10.2. Mehanizam aktivacije i represije lac operona. i-gen regulator (kodira
represor); p lac -promotor lac operona na koji se vee RNA polimeraza; o-operator:
mjesto vezanja represora; z-prvi strukturni gen: -galaktozidaza. Sustav lac operona
opisali su istraivai Francois Jacob i Jacques Monod 1961. godine, a za to otkrie
dobili su Nobelovu nagradu 1965. godine.
95
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: REGULACIJA EKSPRESIJE GENA
Praktian rad
96
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: REGULACIJA EKSPRESIJE GENA
-lacZ -lacZ
Vektor:
pBluescript
AmpR AmpR
42C
-lacZ -lacZ
+ IPTG + IPTG
97
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: REGULACIJA EKSPRESIJE GENA
U drugom dijelu vjebe va je zadatak inducirati ekspresiju reporter gena koji je pod
transkripcijskom kontrolom hormonski osjetljivog promotora. Reporter-gen koji e se
eksprimirati dodatkom biljnog hormona je -glukuronidaza (GUS). Na raspolaganju
ete imati tri linije biljke Arabidopsis thaliana na hranjivoj podlozi. Sve linije ispred
spomenutog reporter gena imaju promotor osjetljiv na biljni hormon auksin.
GUS gen izoliran je iz bakterije E.coli i koristi se kao reporter-gen u biljaka.
Dodatkom supstrata X-Gluc (5-bromo-4-kloro-3-indolil--D-glukuronida), GUS ga
cijepa na glukuronsku kiselinu i derivat indiga koji dimerizacijom stvara plavi
precipitat vidljiv u tkivu biljke.
Sve tri biljne linije koje ete dobiti eksprimiraju GUS reporter-gen pod utjecajem
vlastitih endogenih hormona. Vi ete pokuati inducirati/pojaati ekspresiju reporter
gena (GUS) u tim linijama upotrebom egzogeno dodanog hormona auksina.
Mehanizam regulacije i aktivacije hormonski osjetljivih promotora u biljaka objanjen
je i prikazan je na slici 10.4.
INDUKTOR
TRANSKRIPCIJSKI
AKTIVATOR
REPRESOR
Diferencijacija
Proteolitika razgradnja represora
98
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: REGULACIJA EKSPRESIJE GENA
PROMOTOR
DR5::GUS
PIN1p::GUS
PIN7::GUS
99
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: REGULACIJA EKSPRESIJE GENA
ZADACI:
i+o+z+/i+ocz+
i+ocz+/i+ocz+
i+o+z+/i-o+z+
i-o+z+/i+o+z+
100
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: METODE IZOLACIJE DNA
Postupak izolacije vrlo iste DNA (one koja e biti podobna za postupke kao to su
rezanje restrikcijskim endonukleazama, radioaktivno ili neradioaktivno obiljeavanje,
ligaciju itd.) zahtijeva relativno sloenu proceduru. Ona gotovo uvijek ukljuuje upotrebu
specijalnih deterdenata, luina, organskih otapala i/ili enzima. Meutim, DNA se moe
izolirati (i vidjeti prostim okom) prilino jednostavnim postupkom koji, u smislu
materijala, ne zahtijeva nita vie od onoga to moete nai u vlastitoj kuhinji. Ukratko,
postupak izolacije DNA sastoji se od tri osnovna koraka: (1) mehanikog usitnjavanja
tkiva i razgradnja stanica, (2) oslobaanja staninog sadraja u otopinu te (3)
precipitacije/taloenja DNA iz otopine.
101
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: METODE IZOLACIJE DNA
Praktian rad
Va zadatak tijekom ove vjebe bit e izolacija DNA u tri spomenuta koraka. Na
raspolaganju ete imati samo kuhinjsku opremu: mikser-reza, filtre za kavu,
kuhinjsku sol i deterdent za pranje sua. Izvor DNA bit e razliit za svaku od etiri
grupe (3-4 studenta/studentice po grupi). Svaka grupa e na stolu zatei sljedeu opremu
za izolaciju (slika 11.2.): menzuru, plastini lijevak, laboratorijsku au, Erlenmeyer-ovu
tikvicu, stakleni tapi, mikropipetu i malu plastinu epruvetu od 1,5 ml (kolokvijalno:
"ependorficu/epicu"; prema imenu proizvoaa: Eppendorf).
Jedna od vanih toaka u dobivanju to ie DNA je njeno odvajanje od proteina s
kojima se nalazi u kompleksu. To se u laboratorijskoj praksi postie upotrebom organskih
otapala fenola i kloroforma (triklormetan) ili dodatkom nekih proienih proteolitikih
enzima (sinonimi: proteaze, proteinaze, peptidaze) koji cijepaju peptidne veze izmeu
aminokiselina nekog proteina. U vaem sluaju odvajanje DNA od proteina improvizirat
ete upotrebom soka od ananasa (sadri proteolitiki enzim bromelin).
Materijal:
Mljeveno meso
Brokula (oko 200g po izolaciji)
Banana (1 komad po izolaciji)
Tikvica (0,5-1 komad po izolaciji)
Postupak/protokol:
102
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: METODE IZOLACIJE DNA
103
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: METODE IZOLACIJE DNA
ZADACI:
1. Objasnite koja je svrha navedenih koraka u izolaciji DNA metodom uradi sam:
a) Usitnjavanje u mikseru:
b) Deterdent:
c) Kuhinjska sol:
d) Etanol
5. Biste li uspjeli izolirati DNA da ste dodali manje/vie soli i deterdenta u ekstrakcijsku
otopinu?
104
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: METODE IZOLACIJE DNA
Nakon to ste u prethodnoj vjebi nauili kako izolirati DNA iz voa i povra na vrlo
jednostavan nain, u ovoj vjebi va je zadatak izolirati DNA, koristei neto sloenije
laboratorijske metode na organizmima Escherichia coli i Arabidopsis thaliana. Takoer,
definirat emo nekoliko novih pojmova: transgena biljka, transgen, plazmid,
transformacija, vektor.
Laboratorijski soj E. coli s plazmidom, dobit ete u tekuoj prekononoj kulturi.
Zadatak svake od 4 grupe biti e izolacija tog plazmida. to je plazmid? Plazmid je
autonomna (samostalna), replicirajua, ekstrakromosomalna (izvan kromosoma), kruna
molekula DNA koja se nalazi u bakterijskoj citoplazmi odvojeno od bakterijskog genoma
(koji je takoer kruna molekula DNA, ali puno vea). Plazmidi, kao i bakterijska DNA
(bakterijski kromosom) sadre gene. Geni na plazmidu nemaju utjecaj na rast i
preivljavanje bakterije u normalnim uvjetima. Meutim, u uvjetima selektivnog pritiska
plazmidi omoguuju preivljavanje bakterija koje ih posjeduju. Tako npr. plazmidi mogu
nositi gene za rezistenciju na teke metale i/ili antibiotike, gene odgovorne za bakterijsku
virulenciju, gene koji omoguuju razgradnju razliitih kompleksnih spojeva ili gene koji
omoguuju konjugaciju. Neki plazmidi se mogu ugraditi u bakterijski kromosom.
Modifikacijom prirodnih plazmida dobiveni su "umjetni" plazmidi koji se koriste u
tehnologiji rekombinantne DNA tj. kloniranja. U tom kontekstu takvi plazmidi esto se
nazivaju vektorima. U vektor se ugrauje sekvenca DNA (slijed nukleotida) koja nam je
interesantna, a obino se radi o genu za neko svojstvo. Stanice E. coli slue nam kao
"tvornice" vektora jer se tijekom svake bakterijske diobe dijele i plazmidi/vektori te
raspodjeljuju u stanice keri. Izolacijom plazmida dobiva se mogunost za njegovu
manipuaciju (npr. rezanje restrikcijskim enzimima) i prebacivanje u druge organizme:
npr. biljke.
U narednoj vjebi, trebat ete pokazati da transgena linija A. thaliana sadri istu
sekvencu/odsjeak DNA kao i plazmid koji ste izolirali iz E.coli, za razliku od prirodne
linije/divljeg tipa koja ne bi smjela sadravati tu sekvencu (jer ta linija nije bila
transformirana).
105
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: METODE IZOLACIJE DNA
Praktian rad
106
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: METODE IZOLACIJE DNA
107
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: METODE IZOLACIJE DNA
(4 grupe po 4 studenta)
Svaka grupa na radnom mjestu ima:
1 Erlenmeyer-icu (300 ml) za odlijevanje tekuina
1 kutiju utih nastavaka
1 kutiju plavih nastavaka
1 kutija bijelih nastavaka
1 stalak za staklene epruvete s 1 epruvetom prekonone kulture E. coli i kompletom
pufera
1 tarionik s tukom
1 plavi stalak za epruvete s epicama
1 mali ko za tipseve/plastine nastavke
1. GTE
50 mM glukoza
25 mM Tris-Cl pH 8
10 mM EDTA pH 8
2. 0,5M NaOH
3. 10 % SDS
4. 3 M CH 3 COOK, pH 5,2
5. Izopropanol (2-propanol)
6. 70 % etanol
108
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: METODE IZOLACIJE DNA
7. TE pufer
10 mM Tris-HCl, pH 7,5
1 mM EDTA
8. dH 2 O
9. Ekstrakcijski pufer
200 mM Tris/HCl (pH 8)
250 mM NaCl
25 mM EDTA
0,5 % SDS
Na kolicima se nalaze:
Vreica s epicama
Biljni materijal (transgena linija i divlji tip)
Vreice s plavim i utim nastavcima
Krupna oprema:
Vodena kupelj
Mikrocentrifuga
ZADACI:
E.coli
A.thaliana
109
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MOLEKULARNE METODE
U proloj vjebi izolirali ste plazmid/vektor iz bakterije Escherichia coli. Dio tog
plazmida ugradio se pomou bakterije Agrobacterium tumefaciens u genom biljke
Arabidopsis thaliana. Takoer, izolirali ste genomsku DNA transgene biljke i divljeg tipa
vrste Arabidopsis thaliana. Da biste utvrdili da li je u biljni genom transgene linije zaista
ugraen dio plazmida iz E.coli, primjenit ete tehniku PCR (PCR = Polimerase Chain
Reaction = lanana reakcija DNA polimerazom). Koncept PCR-a smislio je (bio)kemiar
Kary Mullis 70.-tih godina 20. stoljea. Ideja je tehniki ostvarena sredinom 80.-tih i
pokrenula je pravu revoluciju u molekularnoj biologiji. Kary Mullis je za svoju ideju
1993. dobio Nobelovu nagradu za kemiju. U emu se sastoji revolucionarnost PCR-a? U
tome da od vrlo malog broja poetnih molekula DNA, tijekom nekoliko sati moete
dobiti milijune i milijarde identinih kopija (DNA sekvence/slijeda koja vas zanima).
PCR reakcija sastoji se od 30-tak identinih ciklusa (slika 13.1). Na kraju svakog ciklusa
umnoavanja, broj molekula DNA udvostruen je u odnosu na predhodni ciklus (tzv.
eksponencijalno umoavanje). Svaki ciklus sastoji se od tri uzastopna koraka u kojima se
mijenja temperatura inkubacije svih prethodno spomenutih komponenti (1-4):
110
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MOLEKULARNE METODE
Nakon PCR-a umnoenu DNA nanijet ete na agarozni gel i u puferu je izloiti
elekrinom polju. Taj postupak naziva se elektroforeza. Budui da je negativno nabijena,
111
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MOLEKULARNE METODE
DNA u elektrinom polju putuje prema pozitivnoj elektrodi (anodi). Na tom putu
molekule DNA razliite duine putuju razliitim brzinama i na gelu se na kraju
elektroforeze vide kao odvojeni bend-ovi/trake/fragmenti. Agaroza koja se koristi za
izradu gela je prirodni linearni polimer polisaharida (na bazi galaktoze) koji se dobiva iz
nekih vrsta crvenih algi. Dolazi u obliku bijelog praha koji se kuhanjem otapa u vodi.
Tijekom postepenog hlaenja dolazi do uzajamnog povezivanja lanaca polimera
vodikovim vezama te se formira gel s porama. Veliina pora gela ovisi o koncentraciji
agaroze koja je obino od 0,1-3% (w/v). Gelovi s visokom koncentracijom agaroze bolje
razluuju/razdvajaju male/kratke molekule DNA, a gelovi s niskom koncentracijom
agaroze bolje razdvajaju velike/dugake molekule DNA. Elektroforeza se najee
provodi u TAE (Tris-Acetate-EDTA) puferu koji je dobar elektrolit. Na slikama
prikazana je aparatura za elektroforezu s agaroznim gelom (slika 13.2.) i DNA fragmenti
raznih veliina razdvojeni/razlueni nakon elektroforeze na agaroznom gelu (13.3.).
112
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MOLEKULARNE METODE
Praktian rad
113
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MOLEKULARNE METODE
standard za odreivanje veliine fragmenata u vaem uzorku. Kao marker imat ete DNA
-faga porezanog s resrikcijskom endonukleazom HindIII .
114
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MOLEKULARNE METODE
115
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MOLEKULARNE METODE
(4 grupe po 4 studenta)
Svaka grupa na radnom mjestu ima (Slika 13.6.)
1 kutiju utih nastavaka
1 kutiju plavih nastavaka
1 kutija bijelih nastavaka
1 plavi stalak za mikroepruvete (1,5 ml) sa setom otopina i pufera za PCR i digestiju
1 mali ko za tipseve/plastine nastavke
1 bijeli stalak za PCR epice s 3 epice
1 marker (tanki)
Na kolicima se nalaze:
Vreica s epicama (1,5 ml)
Vreice s plavim, utim i bijelim nastavcima
Vreica s PCR epicama
PCR ureaj
Kadica za elektroforezu
Ureaj za napajanje (power supply)
Kalup za izlijevanje gela + 2 elja
Steznik za kalup (umjesto selotejpa)
Erlenmeyer-ica za otapanje agaroze
1xTAE pufer
Agaroza
Sybr safe (drati na +4)+
Metalna patula za agarozu
Mikrovalna penica
Transiluminator
116
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MOLEKULARNE METODE
117
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: MOLEKULARNE METODE
ZADACI:
1. Pretpostavimo da imate dva uzorka DNA. Jedan sadri linearne DNA molekule, a
drugi cirkularne/krune DNA molekule (plazmid). Linearna DNA ima 10
restrikcijskih mjesta koje prepoznaje restrikcijska endonukleaza EcoRI i 7 koje
prepoznaje restrikcijska endonukleaza HindIII, a kruna DNA 10 restrikcijskih mjesta
koje prepoznaje restrikcijska endonukleaza HindIII i 7 mjesta koje prepoznaje
restrikcijska endonukleaza EcoRI. Koliko fragmenata DNA ete dobiti na gelu nakon
inkubacije s EcoRI i HindIII u sluaju linearne, a koliko u sluaju krune molekule
DNA?
2. Pretpostavimo da nakon 7. ciklusa PCR reakcije imate sveukupno 512 molekula DNA
i da je efikasnost amplifikacije/umnaanja u svakom cikllusu 100%. Koliko ste
molekula DNA imali prije prvog ciklusa, koliko nakon 3., a koliko ete ih imati prije
34. ciklusa? Sastavite jednadbu koja povezuje eksponencijalno umnoavanje DNA,
broj molekulna nakon n ciklusa i broj molekula na poetku reakcije.
3. O emu ovisi brzina putovanja molekula DNA u gelu tijekom elektroforeze? Objasnite.
a)
b)
c)
4. Nacrtajte gel s tri fragmenta DNA (svaki u svojoj jaici!) veliine 200, 450 i 1100 pb
(pb=parova baza). Na gelu u prvoj (lijevoj) stazi nacrtajte DNA marker s 10
fragmenata (od 100 pb do 1000 pb, razlika u veliini fragmenata markera je 100 pb).
Oznaite elektrode te smjer putovanja i veliinu fragmenata.
5'-gtgatacatatgcgcacagaaaaaacagatacaccccagatacacagaggggctttaatata-3'
118
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: CITOPLAZMATSKO NASLJEIVANJE
Majinski uinak
Zavojitost kuice u pueva moe biti lijeva (sinistralna) ili desna (dekstralna), a
odreuje se dranjem pua apeksom prema gore i odreivanjem smjera zavoja od otvora
kuice. Smjer zavoja je odreen parom jezgrinih gena s+ (dominantnan alel) i s (recesivan
alel). Meutim, promatranjem fenotipova potomaka recipronih krianja (slika 14.1.) uoeno
je da fenotip ponekad nije ekspresija odreenog genotipa. Potomci u F 1 generaciji pokazivali
su zavojitost koja je odgovarala zavojitosti kuice majke bez obzira na genotip potomka.
Majinski genotip odgovoran je za organizaciju citoplazme jajeta, tako da e, nakon oplodnje
potomci biti ili desno zavijene kuice ili lijevo zavijene kuice bez obzira na genotip zigote.
Ako enski roditelj u genotipu ima dominantni gen s+, svi puevi potomci e imati desno
zavijene kuice. Genotip majke ss daje potomke sa lijevo zavijenim kuicama. Zavojitost
zapravo ovisi o orijentaciji diobenog vretena u I mitozi zigote, a orijentacija vretena
kontrolirana je genotipom oocite iz koje nastaje jaje. Potomci F 2 generacije su identini jer je i
genotip majke u oba krianja identian.
119
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: CITOPLAZMATSKO NASLJEIVANJE
120
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: CITOPLAZMATSKO NASLJEIVANJE
Mutante zvane poky kod gljive Neurospora karakterizirane su sporim rastom zbog
nepravilnosti u respiratornom enzimskom sustavu uslijed mutirane mtDNA, slino petite
mutantama kvasca (vidi dolje). Poky svojstvo nasljeuje se enskim roditeljem.
Kromosomski gen F u interakciji sa citoplazmom poky mutante pomae rastu poky
mutanata i proizvede brzo rastuu kulturu, fast-poky, iako je enzimski sustav jo uvijek
defektan (slika 14.2.). Poky citoplazma nije trajno promijenjena kontaktom s F genotipom u
zigoti.
Gljiva e ponovo imati poky fenotip ako u genotipu ima, umjesto alela divljeg tipa,
recesivni alel F'. Gen F nema fenotipsku ekspresiju u prisutnosti normalne citoplazme.
Kloroplasti
zigoti i jezgru i citoplazmu (te u njoj i sve organelle ukljuujui plastide kloroplaste), dok
muki roditelj daje samo jezgru. Biljke mogu imati zelene listove, arolike listove i potpuno
bijele listove. arolikost listova daju dva tipa kloroplasta normalni zeleni i defektni koji ne
mogu sintetizirati klorofil. Majinski uinak manifestira se kroz gene na kloroplastima koji se
nalaze u citoplazmi i nasljeuju se od majke, bez obzira na fenotip mukog roditelja (pri
oplodnji ulazi samo spermalna jezgra). Nakon samooplodnje biljke nastat e razliiti potomci,
ovisno o grani na kojoj su se nalazili enski cvjetovi. Ako je zigota nastala oplodnjom iz jaja
enskog cvijeta koji se nalazio na bijeloj grani, svi potomci e biti bijeli. Razlog tome je to je
zigota jajnom stanicom dobila citoplazmu koja je sadravala defektne plastide (ne mogu
sintetizirati klorofil, slika 14.3.).
Kod 2/3 viih biljaka kloroplasti porijeklom od mukog roditelja (peludno zrno) ne
ulaze u zigotu (prijenos jezgre bez citoplazme). Stoga je nasljeivanje kloroplasta primjer za
majinsko (citoplazmatsko) nasljeivanje koje ne podlijee zakonima nasljeivanja po
Mendelu.
Mitohondriji
Sve ive stanice osim bakterija, cijanobakterija, te zrelih eritrocita imaju mitohondrije.
To su mali organeli, centri aerobnog disanja, koji imaju vlastitu DNA (mtDNA). Dvolanana,
kruna mtDNA se replicira neovisno o jezgrinoj DNA. mtDNA odgovorna je za sintezu samo
mitohondrijskih proteina, dok su veina mt proteina pod kontrolom jezgrine DNA.
122
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: CITOPLAZMATSKO NASLJEIVANJE
Primjer 6.
promjenu nekih osobina stanica kvasca, a njezino nasljeivanje nije u skladu s Mendelovim
zakonima. Petite mutante imaju promijenjeni fenotip, razlikuju se od divljeg tipa kvasca po
veliini (male sitne kolonije) te u brzini rasta (sporo rastu). Mutante se razmnoavaju
vegetativno (pupanjem) ali spore mogu dati tek ako se spolno razmnoavaju s divljim tipom
kvasca. Kada su se mutante petite spolno razmnoavale (sporulacija) s divljim tipom
primijeena su tri razliita tipa nasljeivanja fenotipa.
1. Segregacijski petite - omjer potomaka divljeg tipa i mutanti petite je 1:1, to
odgovara Mendelovom nasljeivanju. Segregacijski petite ima strukturno i
funkcionalno normalne mitohondrije, ali ima recesivni alel na kromosomskom genu
(genom kvasca) koji inhibira normalnu funkciju mitohondrija (aerobnu respiraciju)
(slika 14.6.).
2. Neutralni ili recesivni petite - svi potomci su divljeg tipa. Mutantni fenotip se vie
nikada ne ispoljava. Ovakvim krianjem svi potomci imaju normalne, funkcionalne
mitohondrije koji mogu obavljati aerobnu respiraciju (slika 14.5.).
3. Supresivni petite - skoro svi potomci petite fenotipa. Defektni mitohondriji
(delecija ili insercija velikog dijela mtDNA) mogu prevladati (opetovanim diobama)
nad mt divljeg tipa ili pak mtDNA s mutacijom rekombinira s mtDNA divljeg tipa
(tijekom fuzije dvaju mitohondrija) tako da novonastala rekombinantna mtDNA
eksprimira promijenjeni fenotip.
124
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: CITOPLAZMATSKO NASLJEIVANJE
125
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: CITOPLAZMATSKO NASLJEIVANJE
Infektivne estice
papuice koji imaju kappa estice u citoplazmi, a u genotipu barem jedan dominantni alel K
126
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: CITOPLAZMATSKO NASLJEIVANJE
nazivaju se killer sojevi ili ubojice. Sojevi koji nemaju kappa estice su, bez obzira na
genotip, osjetljivi (engl. sensitive) (slika 14.7.).
ZADACI:
3. Dobili ste sjeme muki sterilne linije kukuruza. Kako biste utvrdili da li se radi o
genskoj ili citoplazmatskoj sterilnosti?
Genotip Citoplazma
KK kappa
Kk -
kk kappa
KK -
Kk kappa
Kk -
127
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: POPULACIJSKA GENETIKA
genotip MM MN NN
broj osoba 22 220 488
uestalost genotipova (%) 3 30,1 66,9
genotip MM MN NN
broj genotipova 22 220 488
broj M alela 2x22 + 220
broj N alela 220 + 2x488
ukupan broj alela 44 + 440 + 976
uestalost alela M = ?
uestalost alela N = ?
Uestalost gena i genotipova ostaje ista tijekom niza generacija. Razlog tomu je binarna
priroda nasljeivanja, jer se prilikom oplodnje aleli sluajno kombiniraju u parove u diploidnoj
zigoti. Ako promatramo par alela (A i a), tada e uestalost gameta koje e nositi alel A ili a
ovisiti o uestalosti genotipova roditeljske generacije. Kada se parenje meu lanovima
populacije odvija potpuno sluajno, tada se oekivana uestalost zigota u sljedeoj generaciji
moe predvidjeti ako je poznata uestalost alela u genskoj zalihi roditeljske generacije.
128
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: POPULACIJSKA GENETIKA
Na primjer: ako je uestalost alela A = 0,6, a alela a = 0,4, njihovom kombinacijom uvijek se
dobije ista uestalost genotipova:
Slika 15.1. Stvaranje zigota konceptom genske zalihe. Mujaci i enke imaju jednaku
uestalost 2 alela: f(A) = p i f(a) = q. Nakon jedne generacije sluajnog
sparivanja, 3 genotipa, AA, Aa i aa, imaju uestalost p2, 2pq i q2.
129
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: POPULACIJSKA GENETIKA
p+q+r =1
2 2
p + 2 pq + 2 pr + q + 2 qr + r2 = 1
130
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: POPULACIJSKA GENETIKA
kvantitativne jer svaka jedinka u populaciji mora biti zasebno izmjerena. Okolini uvjeti mogu
uzrokovati varijacije unutar svakog genotipa (slika 15.3). Npr. dvije jedinke istog genotipa za
boju oiju ne moraju imati istu boju oiju jer na fenotip utjeu mnogi okolini uvjeti (ishrana,
fiziologija i dr.) Kod ljudi su djeca obino visine svojih roditelja, ali slabo hranjena djeca e biti
nia od dobro hranjene djece. Rast u visinu je limitiran s uvjetima prehrane (ispod genetskog
kapaciteta).
Slika 15.2. Promjena oblika distribucije fenotipskih klasa u populaciji poveanjem broja lokusa
koji odreuju boju zrna u penice. Ako je svaki lokus predstavljen s 2 alela koji segregiraju, u F 2
generaciji dobit emo kontinuiranu distribuciju razliitih fenotipova.
131
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: POPULACIJSKA GENETIKA
Kvantitativna svojstva jedinki mogu varirati na razliite naine, to moe posluiti kao
osnova za odreivanje genetikih razlika meu populacijama. Svrstavajui jedinke svake od
132
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: POPULACIJSKA GENETIKA
ispitivanih populacija u odgovarajue veliinske kategorije (razrede) (npr. po visini, duljini, teini
i dr.) dobit emo specifian raspored tih jedinki na tzv. varijacijskom poligonu ili krivulji.
Nakon mjerenja i unoenja podataka u koordinatni sustav moe se uoiti da su srednje vrijednosti
nekog svojstva najuestalije, dok su krajnje vrijednosti sve rjee. to je vei broj uzoraka to se
poligon vie pribliava varijacijskoj krivulji. Normalna varijacijska krivulja (Gaussova krivulja)
je simetrina, no u praksi su ee nesimetrine krivulje. Korisno je izraunati srednju vrijednost
varijabilnosti, budui da se ona ne poklapa uvijek s najuestalijom vrijednosti.
X = (f x X) / F
Budui da je svako mjerenje varijabilnosti samo sluajan izbor odreenog broja jedinki iz neke
populacije, nikada nema apsolutne vrijednosti varijabilnosti. To bismo dobili samo kada bismo
ispitali sve jedinke odreene vrste. Zbog toga je neophodno izraunati srednju pogreku srednje
vrijednosti.
S = s / f
s standardna devijacija
f broj ispitanih jedinki
133
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: POPULACIJSKA GENETIKA
ZADACI:
2. Boju krzna make odreuje par kodominantnih X-vezanih alela koji daju slijedee
fenotipove: CBCB crno krzno; CYCY uto krzno; CBCY calico krzno (mjeavina
crnog i utog). Istraivanje populacije maaka u Rimu pokazalo je sljedee:
3. Od 2400 poroda u podrunoj bolnici 6 beba je umrlo ubrzo nakon roenja zbog
autosomalne recesivne letalne disfunkcije (opstrukcija debelog crijeva). Koja je uestalost
recesivnog alela co u populaciji? Koji dio populacije je heterozigotan za alel co? Koji dio
populacije je homozigotan za normalni co+ alel?
4. Oni albinizam uzrokuje X-vezani recesivni alel koji je prisutan u 1% gameta u genskoj
zalihi humane populacije. Koja je oekivana uestalost onog albinizma u mukaraca, a
koja u ena?
5. Bijelu vunu ovaca odreuje dominantan alel B, a crnu vunu recesivni alel b. U uzorku od
900 ovaca naeno je 891 bijela i 9 crnih. Odredite frekvenciju alela.
6. Kod goveda rase Shorthorn (kratkorogo govedo) genotip CRCR ima crvenu dlaku, CRCW
arenu dlaku (mjeavina crne i bijele) i CWCW bijelu dlaku. U jednom uzorku kratkorogih
goveda bilo je 108 crvenih, 48 bijelih i 144 arenih. a) Odredite frekvenciju alela u
populacijskom skupu gena. Kakav je odnos meu navedenim alelima? b) Ako je ova
populacija u potpunosti panmiktina, kakva e biti frekvencija genotipova u sljedeoj
generaciji? c) Kako se podaci o uzorcima iz pitanja a) odnose prema oekivanjima iz
pitanja b)? Je li populacija iz a) dijela zadatka u ravnotei?
7. Farmer ima 10 krava koje dnevno daju 24, 23, 18, 26, 32, 34, 41, 12, 63 i 14 litara mlijeka.
Izraunajte srednju vrijednost varijabilnosti i standardnu devijaciju. Ako farmer kupi jo
dvije krave koje daju 73 i 12 litara mlijeka po danu, kako to utjee na standardnu
devijaciju dnevnog prinosa mlijeka?
8. MN krvne grupe kontroliraju 2 kodominantna alela (LM i LN). Ispitivan je uzorak od 208
beduina u sirijskoj pustinji na prisustvo M i N antigena i utvreno je 119 osoba s krvnom
grupom M, 76 s grupom MN i 13 s grupom N. Izraunaj frekvencije alela LM i LN. Ako je
frekvencija alela LM= 0,3, koliko e osoba u uzorku od 500 imati krvnu grupu MN?
134
PRAKTIKUM IZ GENETIKE: POPULACIJSKA GENETIKA
Praktian rad
Sjemenkama graha izmjerite duinu ili teinu. Prikaite rezultate mjerenja varijabilnosti
grafom, te odredite srednju vrijednost varijabilnosti.
135