Biot ecnologa

EN MOVIMIENT
REVISTA DE DIVULGACIN DEL INSTITUTO DE BIOTECNOLOGA DE LA UNAM

UN MODELO EXPERIMENTAL
para estudiar la obesidad
EL CIDO FLICO
y las plantas
EMPRENDER LAS NUEVAS TECNOLOGAS
con compuestos que pican y los patgenos
DEL PULQUE Y LA SEQUA
LA DESAPARICIN en las plantas
de las abejas 2da. parte LOS INICIOS
del IBt 2da. parte
LA ECONOMA en el Unidad de Secuenciacin
SIGLO XXI Masiva y Bioinformtica
Disponible en: www.ibt.unam.mx

NUMERO 2 JULIO-AGOSTO-SEPTIEMBRE DE 2015

 PROGRAMA
(todos los ponentes son ex-alumnos del IBt)
8:30 9:15 Registro
9:15-9:30 Bienvenida Dr. Tonatiuh Ramrez, Director
9:30-9:55 De E. coli a Drosophila y clulas humanas,
pasando por gusanos y amibas, Dr. Mario Zurita,
Investigador del Instituto de Biotecnologa.
9:55-10:20 Excelencia y rigurosidad, el aprendizaje
del IBt para mi actividad profesional, Dr.
lvaro Daz, Profesor de la Escuela de Ingeniera
Bioqumica, Pontificia Universidad Catlica de
Valparaso, Chile
10:20- 11:00 Caf/Convivio
11:00-11:25 Simulando la realidad, Dra. Laura
Domnguez, Facultad de Qumica, UNAM.
11:25-11:50 ALNUBIO, el sueo por alimentar a
nios y adultos mayores, M. en C. Grecia Fuentes,
CEO y Fundadora de ALNUBIO, S. A. P. I. DE C. V.,
Presidenta del Club de Innovadores Universitarios
del Campus Morelos de la UNAM.
11:50-12:15 De la investigacin a la regulacin,
M. en C. Noem Sirena Snchez, Dictaminadora
especializada, Comisin de Autorizacin Sanitaria,
COFEPRIS.
12:15-13:00 Caf/Convivio
13:00-13:25 De la docencia, a la
investigacin, a la gestin y viceversa,
Dr. Alejandro Nieto, Profesor Investigador,
Facultad de Farmacia, UAEMor.
13:25-13:50 La docencia en el Colegio de
Ciencias y Humanidades de la UNAM, M. en
C. Juan Castro, CCH-Azcapotzalco, UNAM
13:50-14:15 Farmacovigilancia en el Siglo XXI,
M. en C. Eduardo Rosas, Farmacovigilancia,
Novartis Farmacutica S.A de C.V.
14:15-14:30 Acciones futuras Dr. Enrique
Galindo, Secretario de Vinculacin
14:30-15:00 Visita a las nuevas instalaciones
del IBt.
15:00-18:00 Comida* de convivencia.
*Aplica cuota de recuperacin como donativo
($ 400.00), confirmar a ms tardar el 23 de
octubre de 2015 a [exibt@ibt.unam.mx].
ENTRADA LIBRE A LAS PLTICAS
CUPO LIMITADO
INDISPENSABLE PRE-REGISTRO POR
CORREO ELECTRNICO
[exibt@ibt.unam.mx]
FECHA LMITE DE REGISTRO:
23 de octubre de 2015
 Biot ecnologa

D I R E C TO R I O
UNAM
EN MOVIMIENT
Dr. Jos Narro Robles
Rector REVISTA DE DIVULGACIN DEL INSTITUTO DE BIOTECNOLOGA
Dr. Eduardo Brzana Garca
Secretario General
JULIO-AGOSTO-SEPTIEMBRE 2015
Ing. Leopoldo Silva Gutirrez
Secretario Administrativo
Dr. Francisco Jos Trigo Tavera En este nmero:
Secretario de Desarrollo Institucional
M. en C. Miguel Robles Brcena 2 Presentacin del Comit Editorial
Secretario de Servicios a la Comunidad
Dr. Csar I. Astudillo Reyes Generando conocimiento en el IBt
Abogado General 3 Las nuevas tecnologas y el cmputo nos ayudan a estudiar
Dr. Carlos Armburo de la Hoz
Coordinador de la Investigacin Cientfica
detalladamente a los patgenos
Dr. Renato Dvalos Lpez 5 Por qu el pulque es viscoso?
Director General de Comunicacin Social 7 Las protenas desordenadas y la sequa en las plantas
IBt Reconocimientos a los miembros de nuestra comunidad
Dr. Octavio Tonatiuh Ramrez Reivich
Director
9 Dr. Luis Covarrubias Robles, premio de investigacin mdica
Dr. Enrique Rudio Piera Dr. Jorge Rosenkranz 2014
Secretario Acadmico 12 Dra. Blanca Jazmn Reyes Hernndez, Premio AgroBIO 2014
Dr. Enrique Galindo Fentanes
Secretario de Vinculacin Proyectos de investigacin de nuestros estudiantes
C.P. Francisco Arcos Milln
Secretario Administrativo
14 Lacasas: protenas amigables con el medio ambiente para
Dr. Gerardo Corzo Burguete descontaminar el agua
Coordinador de Infraestructura 16 Viendo dentro de los fermentadores: una forma de investigar qu tan
Jefes de Departamento eficientes son para dispersar burbujas de aire y gotas de aceite
Biologa Molecular de Plantas 18 Evolucin de una protena en el laboratorio
Dra. Patricia Len Meja
Gentica del Desarrollo y Fisiologa Molecular
Dr. Mario Zurita Ortega Propiedad intelectual, Tecnologa y Empresa
Ingeniera Celular y Biocatlisis 19 Emprender? Enchlame otra!
Dra. Gloria Saab Rincn
Medicina Molecular y Bioprocesos Unidades y Laboratorios que apoyan a la investigacin y a
Dra. Leonor Prez Martnez
Microbiologa Molecular
la industria
Dra. Guadalupe Espn Ocampo 23 Unidad de Secuenciacin Masiva y Bioinformtica, a la vanguardia de la
ciencia
Biotecnologa en Movimiento, ao 2015, No. 2,
publicacin trimestral, editada por la Universidad Cursos y tpicos en el IBt
Nacional Autnoma de Mxico, Av. Universidad
3000, Col. Universidad Nacional Autnoma de
25 Del gen al producto
Mxico, C.U. Delegacin Coyoacn C.P. 04510, a
travs del Instituto de Biotecnologa, Av. Universidad En la voz de nuestros ex-alumnos
2001, Col. Chamilpa, C.P. 62210, Cuernavaca, Mor., 27 El papel de la nutricin en la desaparicin de las abejas (2da. parte)
Tel. 3291771. Correo elctrnico biotecmov@ibt.
unam.mx. Editores responsables Enrique Galindo y
Georgina Ponce. Reserva de Derechos al uso exclu-
Historias de nuestra comunidad
sivo 04-2015-060211444700-102 ante el Instituto 29 El Departamento de Biologa Molecular del Instituto de Investigaciones Biomdicas y
Nacional del Derecho de Autor. Impresa en Grafimor, los inicios del IBt (2da. parte)
Av. Castillo de Chapultepec Nte. Lote 20 Col. Cd. Cha-
pultepec. C.P. 62398 Cuernavaca, Mor., este nmero Ciencia y cultura
se termin de imprimir el da 10 de septiembre del
2015, con un tiraje de 1000 ejemplares, impresin
31 Pobreza en la abundancia del siglo XXI
oset, 135 grs, papel couch mate

Editor
Dr. Enrique Galindo Fentanes
galindo@ibt.unam.mx
Editora ejecutiva
Dra. Georgina Ponce Romero
geop@ibt.unam.mx
Comit Editorial
Dra. Claudia Martnez Anaya
Dra. Martha Pedraza Escalona
Dr. Fernando Lledas Martnez
Dr. Jos Luis Reyes Taboada
Dr. Enrique Reynaud Garza
Dr. Adn Guerrero Crdenas
Dr. Carlos Pea Malacara
QFB Miguel Cisneros Ramrez

Fotgrafo
Sr. Sergio Trujillo Jimnez
Imgenes
Fotografa de portada
Modelo de obesidad en ratones C57BL/6NJ
Fotografa: Ricardo Campos
Diseo: M. en C. Jos Ral Prez y
Dra. Celina Garca
Ilustracin y Diseo Editorial
Sr. Dionicio Martnez Pineda
Impresin
GRAFIMOR, S. A. de C. V.

EN MOVIMIENTO 1
 Presentacin

En este nmero de Biotecnologa en Movimiento compartimos la experiencia del IBt en la secuenciacin del
genoma del agente infeccioso Babesia divergens, que transmitido por garrapatas causa sntomas similares a
los de la malaria. Para los amantes del pulque que se preguntan por qu es viscoso? incluimos un artculo
sobre la microbiologa del pulque de Huitzilac, Morelos. Los lectores conocern la estrategia usada por las
semillas, a travs de las protenas desordenadas, para favorecer la sobrevivencia de las plantas durante la
sequa.

El Dr. Luis Covarrubias nos comparte sus aportaciones al entendimiento de algunas de la bases bioqumicas
de la obesidad, que le llevaron a obtener el premio Dr. Jorge Rosenkranz 2014. Por otra parte, la Dra. Jazmn
Reyes fue distinguida con el Premio AgroBIO 2014 a la mejor tesis de doctorado en biotecnologa agrcola;
en su trabajo, identific la funcin que tiene el cido flico en el crecimiento de las races.

Tres estudiantes del IBt nos comparten sus resultados sobre el funcionamiento de enzimas que descon-
taminan agua; as como un vistazo al interior de los biorreactores y de cmo algunas veces no podemos
imitar a la naturaleza cuando de evolucin se trata. Presentamos asimismo el curso Del gen al producto en
el que los estudiantes reciben un entrenamiento terico-prctico para el desarrollo de bioprocesos.

El desarrollo de un producto y la creacin de una empresa con base tecnolgica puede ser un proceso difcil,
de largo aprendizaje, aunque muy enriquecedor. Los interesados podrn conocer el camino recorrido por el
Dr. Alejandro Torres, empresario y ex-alumno del IBt.

En nuestro primer nmero de Biotecnologa en Movimiento el Dr. Miguel Corona, ex-alumno del IBt, nos
cont sobre la desaparicin de las abejas; ahora nos plantea soluciones a ese grave problema, resultado de
su investigacin en el Departamento de Agricultura de los E.E.U.U.

A aquellos que les guste la historia, les invitamos a visitar la parte final de la narrativa del Dr. Mario Zurita
sobre sus experiencias como estudiante del entonces Centro de Investigacin sobre Ingeniera Gentica y
Biotecnologa, el antecesor del IBt.

En este nmero conoceremos las actividades y alcances de la Unidad de Secuenciacin Masiva y Bioin-
formtica del IBt.

Finalmente, se incluye la resea de tres libros que hablan de la paradoja de la pobreza dentro de la abun-
dancia de la sociedad actual, que invitan a reflexionar sobre la sociedad que queremos para nuestros hijos
y nietos.

Esperamos que los lectores disfruten de este segundo nmero de Biotecnologa en Movimiento, que da
cuenta del enorme potencial de la biotecnologa en diversos campos, as como el hecho de que el cono-
cimiento bsico involucrado, juega un papel fundamental en su desarrollo.

Agradecemos los comentarios, que nos motivan, entusiasman y que sin duda contribuyen a mejorar la
calidad de Biotecnologa en Movimiento.

El Comit Editorial
biotecmov@ibt.unam.mx

2 Biotecnologa
 Generando conocimiento en el IBt

Seccin a cargo de Claudia Martnez (cma@ibt.unam.mx) y Fernando Lledas (flledias@ibt.unam.mx)

Mediante la aplicacin del mtodo cientfico, estudiantes tigadores en todo el mundo. En el IBt se publican anual-
e investigadores contestan preguntas que van desde lo mente alrededor de 150 artculos en revistas cientficas. En
ms bsico, hasta la resolucin de problemas especfi- esta seccin se presenta una seleccin de resmenes de
cos en diversas reas del conocimiento. Los resultados publicaciones recientes del IBt, con la intencin de dar una
del gran nmero de experimentos que se llevan a cabo idea del panorama del trabajo experimental que hacen
cotidianamente en el IBt son publicados en revistas inter- los investigadores y los estudiantes de nuestro instituto.
nacionales para compartir esos hallazgos con otros inves-

Dr. Alejandro Snchez Flores

Las nuevas
L tecnologas
a lucha interminable entre el ser humano
y los organismos que afectan directa o

y el cmputo
indirectamente su salud e intereses es una
carrera evolutiva donde el humano lucha por
erradicar al parsito y este ltimo, se adapta para
sobrevivir a los ataques constantes para eliminarlo;
es decir, tanto el ser humano como los parsitos
nos ayudan a estudiar
co-evolucionan en su lucha por la existencia.
detalladamente a
La babesiosis (http://es.wikipedia.org/wiki/Babe-
siosis) es una enfermedad parasitaria transmitida
los patgenos
por garrapatas que portan organismos unicelulares
del gnero Babesia,, con la capacidad de infectar la
sangre de prcticamente cualquier vertebrado, y
por lo tanto tambin al ser humano. Los sntomas y
la gravedad de la babesiosis son muy similares a los

EN MOVIMIENTO 3
Clulas sanguneas
de bovino infecta-
das por Babesia di-
vergens.
h t t p : / / co m m o n s.
wikimedia.org/wiki/
File:Babesia-diver-
gens.jpg
de la malaria. Adems, afecta a animales domsti-
cos incluyendo al ganado lo que puede generar
prdidas econmicas importantes.
Hace algunos aos, iniciamos una colaboracin con
un grupo de investigacin del Instituto
de Salud Carlos III de Espaa
(principal organismo pblico
de investigacin biomdica
en ese pas), cuyo inters se
centra en uno de los agentes
causantes de la babesiosis,
Babesia divergens.
Este parsito presenta
adems, un peligro para los
receptores de transfusiones
sanguneas, ya que en los
bancos de sangre no siempre
es detectado por los mtodos
convencionales de control de calidad;
por esta razn se requiere de mejores tcnicas con
costos razonables para evitar infecciones. El de-
sarrollo de tecnologas de deteccin fina de Babesia
divergens requiere en primer lugar conocerlo bien y
de manera expedita.
El genoma de los organismos se refiere a la recopi-
lacin de toda la informacin gentica que ste con-
tiene, y es determinado a travs de la secuenciacin
del ADN (orden en el que se encuentran las bases
que lo componen: ATCG); al estudio de los genomas
se le conoce como Genmica. Para efectos prcticos,
la secuencia del ADN puede ser analizada como un
texto (extremadamente largo) compuesto por slo
4 letras: A, T, G y C. La informacin codificada en
estos textos puede descifrarse mediante el uso de
4 Biotecnologa
la bioinformtica, que de manera
muy simple, se refiere al manejo
e interpretacin de los datos
biolgicos en formatos digitales
para ser analizados en equipos
de cmputo.
En este trabajo, aplicamos nues-
tra experiencia en genmica y
bioinformtica para descifrar el
genoma de Babesia divergens
proveniente de un aislado hu-
mano, a partir de muestras de
ADN enviadas por nuestros co-
laboradores en Espaa. Para ello,
utilizamos tres de las tecnologas
de secuenciacin de ADN ms
modernas y efectivas desarrolla-
das hasta el momento (Illumina:
www.illumina.com; 454: www.454.com y PacBio:
www.pacificbiosciences.com ) cuya caracterstica es
la capacidad de secuenciar millones de fragmentos
de ADN a un bajo costo por base podemos com-
parar el mtodo convencional de Sanger capaz de
resolver 67,000 bases cada hora con el mtodo 454
que puede determinar la secuencia de 20
millones de bases en 4.5 horas-. Con estas
tecnologas logramos obtener en el
laboratorio un genoma de gran
calidad para la identificacin de
cerca de 3,800 genes.
La informacin obtenida
puede ser usada como base para
el desarrollo de nuevos mtodos mo-
leculares para la deteccin especfica
de Babesia divergens en bancos de
sangre o bien, para diagnosticar animales
domsticos y desde luego, utilizarse en la
clnica para determinar enfermedades en humanos
causadas por Babesia divergens. Adems, continuare-
mos la investigacin que nos permita entender los
mecanismos por los cuales este microorganismo in-
vade los glbulos rojos de la sangre y posiblemente
en un futuro no muy lejano, esta informacin sirva
para desarrollar nuevos frmacos y vacunas.
Este trabajo se report originalmente en la
siguiente publicacin cientfica:
Cuesta I., Gonzalez L.M., Estrada K., Grande R.,
Zaballos A., Lobo C.A., Barrera J., Sanchez-Flores
A., Montero E. 2014. High-quality draft genome
sequence of Babesia divergens, the etiological
agent of cattle and human babesiosis, Genome
announcements, vol. 2, No. 6, e01194-14
 Por qu
el pulque
es viscoso?
Dr. Adelfo Escalante Lozada
l pulque -una bebida fermentada tradicional,
de naturaleza alcohlica no destilada, de as-
pecto lechoso y ligeramente cida y viscosa-
se obtiene a partir de la fermentacin de la
savia o aguamiel de diversas variedades de maguey
(Agave) pulquero; es producido principalmente en
el centro del pas, siendo la regin colindante de Hi-
dalgo, Tlaxcala y Estado de Mxico la zona de pro-
duccin ms importante.
En la elaboracin del pulque participan diversos
microorganismos que al metabolizar los azcares
presentes en el aguamiel desarrollan tres tipos de
fermentacin: una alcohlica, en la que bacterias
(como Zymomonas mobilis) y levaduras (como
Saccharomyces cerevisiae) producen alcohol; una fer-
mentacin cida, en donde bacterias cido acticas
y cido lcticas generan cido actico y cido lc- cas, entre las que se identific a Leuconostoc citreum
tico respectivamente, son adems, las responsables
de la ligera acidez del pulque. Al final del proceso
las bacterias cido lcticas del gnero Leuconostoc
llevan a cabo una fermentacin cuyo producto es
una goma o polisacrido que al acumularse le con-
EN MOVIMIENTO
fiere al pulque su viscosidad caracterstica. Todos
estos compuestos (polisacridos, cidos y alcohol)
definen las caractersticas sensoriales del pulque: su
sabor, olor y textura.
Tradicionalmente se tuvo la idea de que la bacteria
Leuconostoc mesenteroides identificada en el pul-
que en 1953 por el Dr. Alfredo Snchez Marroqun,
un pionero en el estudio de esta bebida- es responsable de
producir un polisacrido llamado dextrana (polme-
ro de glucosa) a partir de sacarosa que es el azcar
ms abundante en el aguamiel. Las gomas o poli-
sacridos producidos por las bacterias cido-lcticas
del gnero Leuconostoc en bebidas como el pulque
resultan de gran inters ya que aportan beneficios a
los productos en los que se usan: como la reduccin
de la prdida de agua, determinan las caractersticas
sensoriales de viscosidad y aumentan la estabilidad.
Este tipo de polisacridos son considerados como
sustancias con propiedades de inters comercial, ya
que pueden ser usados como aditivos o ingre-
dientes naturales en la produccin de diversos tipos
de alimentos; recientemente se les ha considerado
tambin como productos funcionales que pueden
ser usados como fibra diettica o incluso como pre-
biticos (ingredientes alimenticios, usualmente car-
bohidratos).
En nuestro trabajo ms reciente sobre la micro-
biologa del pulque de la regin de Huitzilac en el
Estado de Morelos, realizada en colaboracin con la
Facultad de Qumica de la UNAM, demostramos la
presencia de una gran diversidad de bacterias lcti-
y Leuconostoc kimchii como las especies ms abun-
dantes en el aguamiel durante las primeras horas
del proceso de fermentacin. Como resultado de
este estudio aislamos dos especies de L. kimchii, am-
bas productoras de dos tipos distintos de polisacri-
5
Mural La industria dos conocidos como dextranas (ver figura).
del Maguey y del
Amate (fragmento) Los resultados de este trabajo aportan in-
1951. Palacio Nacio- formacin sobre el papel de las distintas
nal, Diego Rivera. bacterias productoras de polisacridos du-
rante la fermentacin del pulque y sobre
cmo afectan su viscosidad. Actualmente
estamos realizando un estudio de las bac-
terias lcticas productoras de polisacri-
dos en muestras de pulque del Estado de
Hidalgo. Los resultados que se obtengan
permitirn determinar la diversidad de este
tipo de bacterias entre muestras de pulque
de diferente origen geogrfico y su impor-
tancia durante el proceso de fermentacin
y desarrollo de la viscosidad del pulque,
que es una de sus caractersticas ms dis-
tintivas.

Este trabajo se public originalmente en el

siguiente artculo cientfico:
Torres-Rodrguez I., Rodrguez-Alegra
M.A., Miranda-Molina A., Giles-Gmez M.,
Conca-Morales R., Lpez-Mungua A., Bol-
var F. y Escalante A. (2014) Screening and
characterization of extracellular polysac-
charides produced by Leuconostoc kim-
chii isolated from traditional fermented
pulque beverage. Springerplus, vol. 3, pg.
583-597
Contacto: adelfo@ibt.unam.mx

Proceso de aislamien-
to de la bacteria cido Muestra de aguamiel y pulque,
lctica Leuconostoc Huitzilac, Morelos
kimchi, producto-
ra de polisacri-
Anlisis por microscopa
dos extracelulares
y algunas etapas del
electrnica de barrido
aislamiento y anlisis
de cada uno de los
dos polmeros de Colonia A
carbohidratos que
se producen en el
Colonia A 5000X
proceso.

colonia B
Aislamiento en medio de cultivo con
sacarosa para promover la produccin
del polmero
Anlisis por
microscopa
Fermentacin electrnica de barrido colonia B 5000X
en laboratorio

6 Biotecnologa
Las protenas
desordenadas
y la sequa
en las plantas
Dra. Lucero Y. Rivera Najera
E
n el contexto del cambio climtico, la sequa
es ya un problema grave y determinante en
la produccin de alimentos. Es por ello que
el estudio detallado de las estrategias de re-
sistencia de las plantas ante la limitacin de agua,
resulta central no slo para conocer los mecanismos
bsicos, sino tambin para planear estrategias que
integren estos conocimientos a la agricultura para
contender con la eventual falta de agua.
Una clula, de manera muy sencilla, es un compar-
timiento delimitado por una doble capa conforma-
da por lpidos particulares (membrana) en cuyo inte-
rior hay varios compuestos, entre ellos las protenas,
en un ambiente acuoso. Dentro de la clula, cada
protena tiene un plegamiento que le confiere una
conformacin tridimensional especfica. Este arre-
glo en el espacio est determinado principalmente
por los aminocidos que las constituyen y el agua
que los rodea. Una protena con una estructura as
definida se considera ordenada.
Ante la sequa, lo que implica la prdida del agua (el
solvente), las protenas (los solutos) no permanecen
intactas y pueden experimentar una prdida total o
parcial de su estructura, razn por lo que algunas de
ellas perderan su funcin. En esta condicin algu-
nas protenas dejan de ser solubles y por el incre-
mento en su concentracin por la falta de agua, las
Protena LEA Protena LEA
(en solucin) (en deshidratacin)
EN MOVIMIENTO
protenas empiezan a interaccionar entre s. Este
es un proceso potencialmente peligroso porque
se producen agregados protecos insolubles que
comprometen el funcionamiento celular adecuado
y pueden causar la muerte de la clula. Durante
la evolucin, la clula vegetal ha desarrollado al-
gunos mecanismos para evitar la agregacin de sus
protenas. Una respuesta ante el dficit hdrico es la
sobre-produccin de las protenas llamadas LEA (su
nombre viene de las siglas en ingls: Late Embryo-
genesis Abundant), conformadas principalmente
por aminocidos polares o con carga elctrica, lo
que las hace altamente hidroflicas (afines al agua).
Una caracterstica particular de estas protenas LEA,
es que son muy flexibles y que, a diferencia de una
protena ordenada que tiene una forma tridimen-
sional definida y ms o menos fija, las protenas LEA
carecen de una estructura estable hasta que entran
en accin como veremos ms adelante. Se puede
imaginar este tipo de protenas como un espagueti
que se mueve libremente en el agua.
En el laboratorio, trabajamos particularmente con la
protena LEA denominada PvLEA6 del frijol (Phaseo-
lus vulgaris). En un escenario de dficit hdrico, la
protena PvLEA6 disminuye su flexibilidad y algunas
de sus regiones adoptan una forma que asemeja una
espiral (conformacin de hlice, figura en la pgina
anterior). En nuestro estudio proponemos que la
La protena PvLEA6
en solucin se mueve
libremente, mien-
Protena LEA tras que cuando en
unida a su protena el medio se pierde
blanco agua, algunas re-
giones de la prote-
na se estructuran en
una conformacin
de hlice y se une
con mayor facilidad
a sus protenas blan-
co, de esta manera
las protege contra el
desplegamiento y la
agregacin.
7
 Contenido de H2O
TEMPRANO MEDIO
Una semilla de fri- protena PvLEA6 utiliza estas regiones en hlice para
jol, pierde gradual- reconocer y unirse a otras protenas que perdieron
mente hasta 90 % su forma nativa al disminuir el agua (protenas blan-
de su contenido
de agua durante la co). Las protenas LEA, evitan as la formacin de los
maduracin. peligrosos cmulos protenicos insolubles. Adems
Modificado de encontramos que la PvLEA6 puede unirse a otra Pv-
http://seedgene - LEA6 y formar dmeros (parejas entre protenas Pv-
network.net/media/
Soy_seed_dev.jpg LEA6) estables. Una posibilidad para la funcin de
estas estructuras, es que PvLEA6 en forma de dme-
ro, sea capaz de incrementar la eficiencia de unin
con sus protenas blanco e incremente la proteccin
contra la agregacin. La falta de estructura definida
de las protenas LEA (por ello pertenecen al grupo
de las protenas intrnsecamente desordenadas),
as como la facilidad para adoptar diferentes confor-
maciones, las vuelve elementos esenciales de respuesta
rpida y de proteccin bajo condiciones de sequa.
En otros laboratorios se han producido plantas en
las que por tcnicas de ingeniera gentica, se au-
menta artificialmente la cantidad de protenas LEA
en las clulas; estas plantas muestran mayor toleran-
cia al dficit hdrico.
8 Biotecnologa
TARDO Semilla madura
Durante la maduracin de las semillas ocurre una
condicin natural de deshidratacin, de hecho du-
rante este proceso se pierde hasta el 90 % de su
contenido de agua (ver figura). En esta condicin de
deshidratacin, la semilla puede permanecer latente
por largos perodos de tiempo, en algunas especies
incluso por siglos, hasta su rehidratacin y eventual
germinacin. El papel de las protenas LEA durante
los procesos de deshidratacin y rehidratacin en
las semillas es un tema actual de nuestro estudio.
Esta investigacin fue originalmente publicada en
el siguiente artculo cientfico:
Rivera-Najera L. Y., Saab-Rincn G., Battaglia M.,
Amero C., Pulido N. O., Garca-Hernndez E., Solr-
zano R. M., Reyes J. L., and Covarrubias A. A. (2014)
A group 6 late embryogenesis abundant protein
from common bean is a disordered protein with
extended helical structure and oligomer-forming
properties. Journal of Biological Chemistry, vol. 289,
No. 46, pgs. 31995-32009
Contacto: luceya12@yahoo.com.mx
Autor: Dr. Joseph Dubrovski
jdubrov@ibt.unam.mx

Seccin a cargo de Martha Pedraza (mapedmx@ibt.unam.mx)
Los acadmicos del IBt tienen trayectorias en la ciencia y la
tecnologa que les han hecho acreedores de reconocimien-
tos de diferentes instituciones. A la par, se encuentran es-
tudiantes que construyen su experiencia acompaados
Dra. Celina Garca Melndrez y
Dra. Martha Pedraza Escalona
E
l Dr. Luis Fernando Covarrubias fue galardo-
nado con el Premio de Investigacin Mdica
Dr. Jorge Rosenkranz 2014 en la categora
de Ciencia Bsica, otorgado por la empresa
ROCHE Mxico a investigaciones inditas realizadas
por cientficos mexicanos. Actualmente el Dr. Co-
varrubias se desempea como Investigador Titular
C en el departamento de Gentica del Desarrollo y
Fisiologa Molecular del Instituto de Biotecnologa
de la UNAM.
MSICA O CIENCIA?
Muy joven, el Dr. Covarrubias e indeciso sobre la carrera
a elegir, pens en Medicina (quiz influenciado
por su padre, quien es Mdico), Biologa, Qumica,
Matemticas y hasta Diseo y Msica dentro de las
EN MOVIMIENTO
Reconocimientos a los miembros
de nuestra comunidad
de sus tutores en la generacin de conocimiento. En esta
seccin se mencionan algunos de los reconocimientos
ms notables que nuestra comunidad recibi en 2014.
Dr. Luis Fernando
Covarrubias Robles,
Premio de Investigacin Mdica
Dr. Jorge Rosenkranz 2014
posibilidades. Finalmente opt por estudiar
Qumica y adicionalmente tom clases de
Biologa en la ltima fase de sus estudios
de Licenciatura, ya que consider que
esa combinacin le dara las bases nece-
sarias en el futuro. Aunque se decidi por la
ciencia, nunca ha dejado de lado su aficin
por la Msica, ya que toca la guitarra clsica
desde que cursaba la secundaria y actualmente
es uno de sus pasatiempos favoritos. Ya como es-
tudiante de Licenciatura en la Facultad de Qumica
de la UNAM, comenz a trabajar bajo la direccin
del Dr. Francisco Bolvar Zapata, fundador y actual
miembro del Instituto de Biotecnologa de la
UNAM, con quien tambin realiz la Maestra, en la
que desarroll la construccin de vectores para la
clonacin de ADN en bacterias (secuencias de ADN
o cido desoxirribonucleico, en las que se incorpora
un gen de inters, por ejemplo, un gen que lleva
informacin para la sntesis de una hormona o un
antibitico) lo que comnmente se denomina Inge-
niera Gentica.
EL RUMBO DE SUS INTERESES
El paso por el laboratorio del Dr. Bolvar result
muy productivo, ya que su trabajo experimental
desarrollado durante la Licenciatura y la Maestra,
contribuy a la generacin de cuatro publicaciones
internacionales en la revista Gene. Esta experiencia
le dej claro que su inters cientfico no estaba en
las bacterias, sino en animales superiores. Por esta
razn, y an sin iniciar el doctorado, decidi aden-
trarse en el campo de la Biologa del Desarrollo y rea-
liz una estancia posdoctoral en el laboratorio de la
Dra. Beatrice Mintz en el Institute for Cancer Research,
9
 Fox Chase, Filadelfia, E.U. Ah obtuvo experiencia en
el desarrollo de retrovirus y de animales trans-
gnicos, ya que en ese momento el laboratorio de la
Dra. Mintz era uno de los pioneros en la produccin
de ratones transgnicos. Luego de su estancia pos-
doctoral decidi regresar a Mxico, e incorporarse
al grupo de la Dra. Patricia Joseph, quien tambin
es investigadora del Instituto de Biotecnologa de la
UNAM. En este laboratorio, no slo obtuvo el grado
de Doctor en Ciencias Biomdicas enfocado en la
Neurobiologa Molecular, sino tambin comenz a
definir varias de las lneas de investigacin que han
marcado su trayectoria cientfica.
ROMPIENDO PARADIGMAS
Las lneas de investigacin que se comenzaron a ge-
star an estando dentro del grupo de la Dra. Joseph
fueron el estudio de la neurognesis (produccin
de nuevas clulas del sistema nervioso), la diferen-
ciacin de las clulas germinales, que dan origen
al vulo y al espermatozoide, y la regeneracin de
estructuras cuando stas sufren dao parcial o total,
entre otras. El resultado de estas investigaciones
han permitido en varias ocasiones mostrar que
muchos fenmenos no son como se ha propuesto
en la literatura y que se han sostenido por aos.
Muestra de ello son las aportaciones del Dr. Co-
varrubias y su grupo de trabajo en el entendimiento
del desarrollo de las extremidades y el desarrollo del
paladar, ya que ellos han evidenciado la relevancia
10
funcional de la muerte celular durante el desarrollo,
enfatizando que el balance entre la proliferacin, la
diferenciacin y la muerte celular es fundamental
para mantener un organismo sano.
DE LA INVESTIGACIN BSICA A LA APLICADA
El estudio del papel de las especies reactivas de oxge-
no en la muerte celular por apoptosis (proceso de
muerte celular programado y bajo control gentico)
y su contribucin en la promocin del envejecimien-
to, llev al grupo del Dr. Covarrubias a generar
un ratn mutante de la enzima catalasa, enzima
encargada de degradar el perxido de hidrgeno
en oxgeno y agua. Para sorpresa de todo su grupo
de trabajo, este ratn a pesar de carecer de la en-
zima catalasa result viable y sin ningn fenotipo
aparente, es decir, los ratones nacieron y crecieron
de forma normal y no mostraron signos de enve-
jecimiento prematuro, como era lo esperado. Dado
que la enzima catalasa se expresa abundantemente
en el hgado, sta podra tener un papel relevante
en la degradacin de las grasas; por lo que decidieron
alimentar a los ratones mutantes con una dieta
alta en grasa, con el fin de hacer notar la falta de la
enzima. Una sorpresa ms fue encontrar que estos
ratones, a pesar de que ganan peso por el consumo
elevado de grasa, no generan esteatosis heptica
(depsitos de grasa en el hgado) ni hiperglucemia
(altos niveles de glucosa en sangre) como lo hace
un ratn silvestre. Estos fenotipos son clsicos en las
Biotecnologa
personas que sufren obesidad y diabetes tipo 2, en-
fermedades consideradas como problema nacional.
Por estos hallazgos es que en diciembre del 2014 el
Dr. Covarrubias recibi el Premio de Investigacin
Mdica Dr. Jorge Rosenkranz.
Estos resultados inmersos dentro del campo de la
obesidad y la diabetes motivaron a una empresa
farmacutica a colaborar con esta investigacin, que
es de gran importancia por el elevado incremento
de estas enfermedades en la poblacin mundial en
general y en Mxico en particular.
En el ao 2006 el Dr. Covarrubias tambin fue
ganador del Premio de Investigacin Mdica Dr.
Jorge Rosenkranz por la identificacin de clulas
troncales neuronales con potencial neurognico y
capacidad para producir neuronas dopaminrgicas,
mismas que resultan afectadas en la enfermedad
de Parkinson, enfermedad neurodegenerativa que
se presenta en alta frecuencia en personas de edad
avanzada.
Otro de los reconocimientos que recibi el Dr.
Covarrubias en el 2014 fue el Premio CANIFARMA
otorgado por la Cmara Nacional de la Industria
Farmacutica por su contribucin al descubrimiento
de posibles ambientes neurognicos (regiones del
cerebro que mantienen un ambiente propicio para
la neurognesis: ver el No.1 de Biotecnologa en
Movimiento, pg. 4) en el cerebro de roedores adul-
tos. Esta distincin la comparte con la Dra. Magda
Guerra Crespo y con el Dr. Ren Drucker Coln, ambos
investigadores del Instituto de Fisiologa Celular de la
UNAM.
EL CAMINO NO ES SENCILLO
La investigacin recientemente galardonada,
inici hace ms de 15 aos y ha contado con la
participacin de diversos alumnos e investigadores
comprometidos. Ahora, gracias a la perseverancia
y al trabajo diario se comienzan a ver los frutos. El
Dr. Covarrubias nos comenta que espera que sus
alumnos aprendan que con constancia y dedicacin
se pueden llegar a cumplir las metas planteadas
superando las frustraciones comunes cuando se
involucra uno en lo desconocido.
LA CIENCIA POR LA CIENCIA
El Dr. Covarrubias hace nfasis en que la bsqueda de
la trascendencia de los trabajos cientficos realizados
en los laboratorios permitir realizar investigacin de
punta para la generacin de conocimiento nuevo y
de alto impacto. Finalmente nos comenta: Espero
que esta revista sea un excelente medio para trans-
mitir a los jvenes que, la ciencia se debe hacer en
busca de conocimiento, planteando ideas nuevas
es decir, la ciencia por aprender ms de la naturale-
za. Si este principio se mantiene, la ciencia aplicada
de alto impacto est garantizada.
Contacto: covs@ibt.unam.mx

Programa de Maestra y Doctorado

IBt UNAM

Instituto de Biotecnologa UNAM Campus Morelos

Seleccin mayo y noviembre
www.ibt.unam.mx/docencia
docencia@ibt.unam.mx

BECAS del Programa Nacional de Posgrado de Calidad (PNPC) CONACyT:

Calidad NIVEL INTERNACIONAL
Apoyos para participar en congresos y estancias en el extranjero para
maximizar tu formacin acadmica

EN MOVIMIENTO 11
 Dra. Blanca
Jazmn
Reyes
Hernndez
Premio
AgroBIO 2014

Dra. Martha Pedraza Escalona

groBIO es una organizacin que agrupa a

las principales empresas desarrolladoras
de Biotecnologa Agrcola con presencia
en nuestro pas. Cada ao reconoce el
trabajo profesional de investigadores y periodis-
tas en dicha rama. En su 12 edicin, el premio en
la categora a mejor tesis de doctorado fue otorga-
do a la Dra. Blanca Jazmn Reyes Hernndez por el
trabajo titulado: Mapeo gentico y caracterizacin
fenotpica de una mutante de Arabidopsis thaliana
afectada en el desarrollo de la raz, realizado bajo la
asesora del Dr. Joseph Dubrovsky, lder acadmico
del Instituto de Biotecnologa de la UNAM.

...nuestra comunidad est siempre dis-

puesta a colaborar, orientar y ensear, lo que fa-
cilita que se puedan responder preguntas cientfi-
cas importantes...

La gran curiosidad que desde pequea mostr

Jazmn por conocer cmo crecen las plantas la llev a
estudiar la carrera de Biologa en la Facultad de Cien-
cias de la UNAM. Con esta inspiracin, realiz su tesis
de licenciatura bajo la tutoria del Dr. Dubrovsky, so-
bre la caracterizacin de aquellos rasgos detectables
de una planta modelo, llamada Arabidopsis thaliana
con mutaciones (cambios en la secuencia de su ADN)
que afectan el desarrollo de la raz. Este primer traba-
jo le permiti darse cuenta que la carrera cientfica es
su vocacin por lo que decidi realizar estudios de
posgrado en la misma rea.

12 Biotecnologa

Su trabajo doctoral se enfoc en estudiar programas
de desarrollo en el que participan las clulas tron-
cales (indiferenciadas) presentes en la punta de
la raz de A. thaliana. En esta ocasin seleccion y
caracteriz una planta mutante, en la cual demostr
cambios en el gen de una enzima directamente
involucrada en la sntesis de vitamina B9, tambin
conocida como cido flico. Esta mutacin ocasio-
na alteraciones drsticas en el metabolismo y distri-
bucin de esta vitamina en la planta, afectando di-
rectamente el crecimiento de la raz. Estos hallazgos
podran tener en el futuro aplicaciones directas en
el sector agrcola; principalmente para el mejora-
miento en el crecimiento de races, con el fin de in-
crementar el tamao de la hojas y el contenido de
cido flico de los frutos en plantas de consumo hu-
...Mi trabajo en el laboratorio es como otro
deporte que puedo realizar en equipo, donde mi
profesor es mi entrenador, quien tiene la expe-
riencia y conocimiento para guiarnos; mis com-
paeros de laboratorio son parte del equipo, con
los que tambin tengo la confianza de proponer
ideas y analizar resultados...
EN MOVIMIENTO
A la par de su frrea
disciplina y com-
promiso hacia el
trabajo, tiene un
gran amor hacia el
deporte.
mano (ver el No. 1 de Biotecnologa en Movimiento,
pg. 14).
Jazmn manifiesta y agradece haber tenido la opor-
tunidad de trabajar en el IBt y apunta: Nuestra co-
munidad est siempre dispuesta a colaborar, orien-
tar y ensear, lo que facilita que se puedan responder
preguntas cientficas importantes.
A la par de su frrea disciplina y compromiso ha-
cia el trabajo, tiene un gran amor hacia el deporte.
Ella nos comenta: Mi trabajo en el laboratorio es
como otro deporte que puedo realizar en equipo,
donde mi profesor es mi entrenador, quien tiene la
experiencia y conocimiento para guiarnos; mis com-
paeros de laboratorio son parte del equipo, con los
que tambin tengo la confianza de proponer ideas y
analizar resultados.
Actualmente, Jazmn est realizando su trabajo
posdoctoral en el Centro de Ciencias Genmicas
de la UNAM, involucrada en el estudio de algunos
aspectos moleculares y evolutivos de bacterias
asociadas a la rizsfera de las plantas.
Contacto: jazminrh@ccg.unam.mx
13
Proyectos de investigacin de
nuestros estudiantes
Seccin a cargo de Georgina Ponce (geop@ibt.unam.mx),
Miguel Cisneros (miguelc@ibt.unam.mx) y Jos Luis Reyes (jlreyes@ibt.unam.mx)
La formacin de recursos humanos altamente especializa-
dos es una de las ms importantes tareas del IBt. Sede del
Programa de Maestra y Doctorado en Ciencias Bioqumi-
cas desde 1996, anteriormente lo fue del Posgrado en Inves-
tigacin Biomdica Bsica as como del de Biotecnologa.
En sus ms de 30 aos de existencia, en el IBt se han realiza-
L
a contaminacin del agua es uno de los
problemas ambientales ms importantes en
la actualidad. Los productos de desecho de
muchas industrias consisten en compuestos
txicos que persisten en el ambiente, ya que son
difciles de degradar por los microorganismos. La
biotecnologa (procesos que implican el uso de or-
ganismos vivos o sus derivados) es una de las herra-
mientas ms adecuadas para la prevencin, control
y eliminacin de contaminantes ambientales. La
biocatlisis ambiental se basa en el uso de enzimas
(protenas que aceleran reacciones qumicas) ca-
paces de transformar un compuesto contaminante
en otro con menor toxicidad o mayor susceptibili-
dad a ser degradado.
14
do cerca de 1700 tesis de Posgrado y Licenciatura. Durante
el ao 2014 se concluyeron 21 tesis de Doctorado, 39 de
Maestra y 32 de Licenciatura. Los egresados del IBt son
igualmente requeridos en la investigacin, la docencia y
la industria. En esta seccin se resean algunos trabajos
con los que se graduaron estudiantes del IBt en el 2014.
Lacasas:
Protenas amigables con el medio
ambiente para descontaminar el agua
M. en C. Joaqun Ramrez Ramrez
Las lacasas son enzimas que catalizan la oxidacin
de una gran variedad de compuestos qumicos, en-
tre ellos algunos compuestos contaminantes como
los fenoles. La enzima requiere nicamente el oxge-
no del aire, y genera agua como subproducto, por
lo que se considera una alternativa ambientalmente
amigable para la descontaminacin del agua.
La aplicacin de la lacasa a nivel industrial se ha vis-
to limitada por su baja estabilidad en condiciones
de operacin. Como toda protena, la enzima puede
inactivarse bajo condiciones de reaccin que se
alejan de las naturales; por ejemplo, la presen-
cia de solventes orgnicos o altas temperaturas.
Tambin puede inactivarse por el tipo de reaccin
que cataliza. Cuando la lacasa oxida compuestos
fenlicos (plaguicidas o compuestos provenientes
de procesos de la industria del petrleo, como los
hidrocarburos policclicos aromticos), se forman
radicales libres, que son especies qumicas suma-
mente reactivas capaces de reaccionar entre s y
formar polmeros insolubles. Estos ltimos pueden
...las lacasas son enzimas que catalizan la
oxidacin de una variedad de compuestos que uti-
lizan nicamente oxgeno, y generan agua como
subproducto, por lo que se consideran una alter-
nativa ambientalmente amigable con una poten-
cial aplicacin en la biocatlisis ambiental...
Biotecnologa
 Estructura tri-
dimensional
determinada
por rayos X de
la lacasa del
basidiomice-
to Coriolopsis
gallica a una
resolucin de
1.9 Angstroms
(pdb 4A2D)

separarse del agua por filtracin. Sin embargo, los

radicales libres tambien pueden reaccionar con la Este trabajo le otorg al Biol. Joaqun Ramrez
enzima, lo que lleva a su inactivacin. Ramrez el grado de Maestro en Ciencias Bioqumi-
cas, bajo la tutora de la Dra. Marcela Ayala Aceves
En el laboratorio se ha investigado este mecanis- (maa@ibt.unam.mx).
mo de inactivacin. Se ha estudiado la velocidad
con la que pierde actividad una lacasa proveniente El hongo Coriolopsis
del hongo Coriolopsis gallica durante la oxidacin gallica
de distintos fenoles. Los resultados indican que la
velocidad de inactivacin de la enzima depende
principalmente del poder oxidante de los radicales
y de la concentracin de los mismos. Adems, se
logr determinar que una cierta cantidad de enzima
queda atrapada en los polmeros polifenlicos (pro-
ductos de la reaccin). Con este trabajo se obtuvo
mayor informacin sobre el proceso de inactivacin
de la lacasa, con miras a disear una enzima ms es-
table a travs de diferentes estrategias. As, se po-
dra contar con procesos biocatalticos para eliminar
compuestos txicos presentes en aguas y suelos.

Te interesa visitar el IBt? El IBt ofrece visitas guiadas

a sus instalaciones

donde el personal acadmico y los estudiantes de posgrado dan al

visitante una pequea muestra del trabajo de investigacin
que realizan en sus laboratorios.

Se reciben grupos escolares de nivel medio y superior, as como

de profesores y otros interesados.

Las visitas son organizadas por la Biol. Irma Vichido Bez y se programan los mircoles y viernes en
un horario matutino desde las 10 hrs. con grupos no mayores de 20 personas.

Es posible planicar visitas con temas de inters particular, solicitndolo

Contacto: ivb@ibt.unam.mx al momento de concertar la cita.

EN MOVIMIENTO 15
 Viendo dentro de los
fermentadores:
M. en C. Axel Falcn Rojas
U
n elemento fundamental de los biopro-
cesos es el biorreactor, un recipiente que
mantiene los microorganismos de inters
bajo las condiciones ptimas de crecimien-
to y produccin de diversos compuestos (por ejem-
plo, un antibitico) en procesos de fermentacin. En
muchos de estos procesos se utiliza un lquido, que
consiste en agua con sales, donde se sumerge un
microorganismo al que se le suministra oxgeno (un
gas) mediante la inyeccin de aire, necesario para su
Imgenes obtenidas respiracin. En algunos casos, la mezcla contiene
utilizando tcnica tambin aceite (otro lquido) para proporcionar una
de videoendoscopa
con cmara de alta
fuente de carbono como alimento. Al agitarse, se
velocidad. Izq. Medio produce un medio complejo conocido como siste-
lquido-lquido 5% ma trifsico compuesto por tres elementos: lquido dad (que capta hasta 5000 imgenes por segun-
v/v. Der. Medio lqui- lquidogas, lo que dificulta la tarea del biorreactor
do-gas 0.5 vvm.
para homogeneizar las condiciones imperantes en
16
una forma de investigar qu
tan eficientes son para dispersar
burbujas de aire y gotas
de aceite
su interior y que podra disminuir la productividad
del proceso de fermentacin.
Es importante evaluar el efecto que tiene la
presencia de una fase inmiscible en agua (el aceite)
en los sistemas trifsicos y conocer qu tan pareci-
dos (o diferentes) son los tamaos de las gotas de
aceite y de las burbujas de gas, dentro de distintas
zonas de un biorreactor a escala de un laboratorio.
En este trabajo se utiliz una tcnica de anlisis de
imgenes que consiste en un endoscopio (tubo con
luz y ptica que facilita la visualizacin al interior
de un sistema, rgano hueco, cavidad corporal o
biorreactor) acoplado a una cmara de alta veloci-
do) lo que permiti obtener imgenes en video
del sistema trifsico en agitacin, en diferentes
lugares dentro del tanque.
Los resultados indicaron que en las
zonas cercanas al sistema de agitacin
(llamadas paletas o impulsores) los
tamaos de las gotas de aceite y de
las burbujas de gas, son muy simi-
lares y tienen el menor tamao de-
tectado dentro del biorreactor. Sin
embargo, dentro del reactor existen
zonas caracterizadas por un mez-
clado deficiente dentro del tanque
(por ejemplo, lejos de las paletas y
en zonas cercanas a la superficie del
lquido y en el fondo del recipiente).
Biotecnologa
 Equipo de video-
Adems, se encontr que la presencia del endoscopa
gas produce una mejora en la dispersin del aceite acoplado a
una cmara de alta
(esto es, se generan gotas de dimetro menor) y
velocidad.
que la presencia de aceite produce una mejora en
la dispersin del gas, es decir, se obtienen menores
dimetros de burbujas (lo que es deseable, ya que
mientras ms pequeas son, ms capacidad tienen
de transferir oxgeno del gas al lquido).

Los resultados de este proyecto son tiles para el

diseo de mejores fermentadores y de sistemas de
cultivo que maximicen la produccin de compues-
tos de inters.

Este nuevo conocimiento sobre el comportamien-

to de sistemas trifsicos, fue la contribucin prin-
cipal de la tesis de maestra de Axel Falcn Rojas,
concluida a finales de 2014, dirigida por el Dr. En-
rique Galindo (galindo@ibt.unam.mx).

Te gustan las araas y las tarntulas?

El IBt cuenta con un
aracnario donde se
pueden admirar
diferentes especmenes
de estos interesantes
animales, en condiciones
de completa seguridad,
manipulados por su
curadora, la M. en B.
Herlinda Clment.

Se reciben (previa cita) visitas

del pblico, preferentemente
de jvenes y nios a partir
de nivel preescolar.

Contacto:
linda@ibt.unam.mx

EN MOVIMIENTO 17
 Evolucin
de una protena en el laboratorio

En este trabajo se utiliz el anticuerpo

mutagnesis Diversidad 1F7 que adems de unir una molcula,
aleatoria (genoteca)
2 presenta una pequea capacidad para
gene parentales 1 transformarla. Nuestro objetivo fue in-
recombinacin mutacin crementar esa capacidad por medio del
siguiente proceso de evolucin dirigida. Para ello
generacin se modific de manera aleatoria el anti-
cuerpo para encontrar una variante con
clona(s) ganadora(as)
mayor actividad transformadora. El anti-
clonacin y transformacin
de microorganismo 3 cuerpo se modific alterando la secuen-
cia del ADN que lleva la informacin para
crecimiento de colonias fabricar la protena.
6
5 El anticuerpo 1F7 une una molcula lla-
4 mada corismato y la transforma en otra
llamada prefenato, que la clula utiliza
seleccin o busqueda (screening) para fabricar los aminocidos fenilalanina
y tirosina.
Proceso de evolucin dirigida
La estrategia para seleccionar anticuerpos con mayor
actividad transformadora, consisti en acoplar la
M.C.B. Perla Amalia Ros Flores funcin de transformacin deseada a otra protena

M
uchas de las reacciones bioqumicas de
los seres vivos se llevan a cabo gracias
a la accin de las protenas (enzimas)
que favorecen la transformacin de los
compuestos a otros productos; stas actuan al unir
una molcula y transformarla de manera especfica.
Actualmente se busca modificar las protenas para
mejorar sus propiedades.
Existen protenas en el sistema inmune que son ca-
paces de unir molculas sin transformarlas. A estas
protenas del sistema inmune se les conoce como
anticuerpos y nos ayudan a defendernos de las en-
fermedades.
Los anticuerpos se han utilizado para construir en-
zimas ya que son capaces de unir una molcula y
solamente les falta que adquieran la capacidad para
transformarla.
cuya actividad puede detectarse de manera sen-
cilla.
Se realizaron varios ciclos de recombinacin y se-
leccin para obtener anticuerpos con mayor activi-
dad transformadora. Las variantes seleccionadas de
cada ciclo se utilizaron como inicio para el siguiente
ciclo. De esta manera es posible selecccionar de
manera gradual anticuerpos con mejor actividad
de transformacin. A este proceso reiterativo que
imita el proceso de evolucin que ocurre en la na-
turaleza se le conoce como evolucin dirigida (ver
figura).
Este sistema permiti seleccionar anticuerpos con
mejores caractersticas, aunque desafortunada-
mente no mostraron mayor actividad enzimtica.
Esto indica que se deben mejorar otras propie-
dades de anticuerpo para incrementar su capaci-
dad de transformar sustratos.

El rea que estudia la modificacin de las protenas

para que adquieran nuevas caractersticas o capaci- A finales del 2014, Perla Amalia Ros Flores obtuvo
dades se le conoce como Ingeniera de protenas. el ttulo de Maestra en Ciencias Bioqumicas bajo
la tutora del Dr. Joel Osuna (joel@ibt.unam.mx).

18 Biotecnologa

Seccin a cargo de Carlos Pea (carlosf@ibt.unam.mx)
El IBt tiene una muy importante capacidad de generacin
de conocimiento y una parte de l tiene el potencial de
ser explotado comercialmente, para lo que requiere de la
proteccin de los derechos de propiedad intelectual. La
propiedad intelectual es un elemento fundamental de la
innovacin y nuestro Instituto es la entidad acadmica de
la UNAM que ms patentes genera. Por otro lado, la for-
macin de empresas de base tecnolgica contina siendo
un tema pendiente en nuestro pas. Especficamente en el
caso de la Biotecnologa, la brecha es muy amplia, con los
Emprender?
Enchlame otra!
Dr. Alejandro Torres Gaviln
E
l ttulo Emprender? Enchlame otra!, tiene todos conocen la sensacin que produce la capsaici-
dos sentidos. El primero, hace referencia
al refrn mexicano para hacer enchiladas,
una tarea sencilla que consiste en pasar por
salsa una tortilla para despus dorarla (o al revs)
y servirla. Es decir que convertirse en pasante de
empresario no requiere de mucho ms que tener
el atrevimiento de cambiar de una actividad a la
comercializacin de una propuesta de valor. El
otro motivo es porque estoy inciando en los
negocios con productos relacionados con el chile,
en particular, con anlogos de capsaicina. Seguro
EN MOVIMIENTO
Propiedad Intelectual, Tecnologa
y Empresa
pases desarrollados.
Aunque cada vez son ms los programas que apoyan este
tipo de acciones, estamos lejos de alcanzar los niveles que,
como pas, requerimos para un desarrollo competitivo.
Esta seccin pretende compartir con nuestros lectores di-
versas experiencias del IBt orientadas al emprendimiento
de base cientfica, desde la creacin de nuevas empresas
en diferentes campos de la biotecnologa, as como la pro-
teccin intelectual del conocimiento generado.
na y ms de alguna vez nos ha hecho sudar
cuando por gusto o por equivocacin le pone-
mos una salsa picosa a nuestra comida. La capsaici-
na pertenece a una familia de molculas conocidas
como capsaicinoides y ellas son las responsables
del efecto pungente (picante) de los chiles. El pi-
cor de estas molculas se cuantifica gracias a una
prueba sensorial desarrollada por Wilbur Scoville
(Scoville Heat Units, SHU). La capsaicina, la molcu-
la natural ms picante, tiene un valor de 16,000,000
SHU; mientras que la homocapsaicina, la prima her-
19
 mana de la capsaicina es menos picante, y tiene un
valor de 8,600,000 SHU. Gracias a esta escala
podemos calificar a los chiles en funcin del picor
y podemos encontrar que los chiles considerados
dulces, como el pimiento morrn, tienen de 100 a
200 SHU; mientras que, los habaneros se encuentran
entre 100,000 y 350,000 SHU. Las aplicaciones ms
comunes de los capsaicinoides son en la industria
de alimentos, tecnologas no letales como el gas
pimienta, pesticidas y rodenticidas e incluso en el
recubrimiento de barcos para evitar el fouling o la
incrustacin de algas y moluscos en los cascos de
los barcos y tuberas. Tambin estas molculas son
empleadas en la industria farmacutica dado que
producen analgesia y se han reportado como po-
tenciales agentes que previenen ciertos tipos de
cncer. Su forma ms comn de comercializacin
es en forma de oleorresina, una mezcla compleja de
cidos carboxlicos, carotenoides, y dems compo-
nentes del chile dentro de los que se encuentran
los capsaicinoides y aunque es posible encontrar
a la capsaicina en forma pura y cristalina, su costo
es elevado y su disponibilidad limitada. La sntesis
qumica de estas molculas es un poco complicada
dado que se requieren varias etapas de proteccin
La escala Scoville
Se usa para medir el picante de de los distintos tipos de chile
UNIDADES
SCOVILLE
EXTREMO Trinidad
Moruga Scorpion
Naga viper Hasta 2 millones
Hasta 1.3 millones
Apartir de 2 millones
FUERTE
Pimienta
Rocoto
de cayena
30.000/50.000
100.000/350.000
MEDIO
Chile
jalapeo
2.500/5.000
Pimiento de padrn
2.500/5.000
Chile
poblano
1.000/1.500
GRFICO ISABEL TOLEDO
20
y desproteccin de grupos funcionales, activacin
y purificacin de compuestos intermedios y se
generan algunos subproductos.
Mi historia comienza alrededor del 2005 con la
publicacin de mi trabajo de maestra en la que,
por motivos inherentes al objetivo particular de la
tesis, tuve que llevar a cabo la sntesis enzimtica
de aproximadamente 16 compuestos estructural-
mente relacionados entre ellos y muy parecidos a
la capsaicina. En el estudio de la bioqumica de unos
de ellos, entrada la madrugada, despus de tomar
varias muestras y dndome de cachetadas para no
dormir por el cansancio, me llev las manos a los
ojos y no los pude volver a abrir por los prximos 15
minutos a pesar de los extensos lavados con agua.
A pesar de que ahora me resulta obvio, fue en ese
momento que me di cuenta que estaba producien-
do CAPSAICINOIDES!!, molculas sumamente
irritantes y picantes. Derivado de esta picante
experiencia y gracias a una colaboracin con la
Facultad de Qumica de la UNAM, se llev a cabo un
anlisis organolptico formal en el que encon-
tramos que algunos de estos compuestos tienen
una pungencia similar a la de la capsaicina e incluso
mayor a la de algunos capsaicinoides naturales. Para
darles una idea sobre lo picante de estas molculas,
y sobre el potencial de la tecnologa, imaginen que
de un bocado ingieren un puo de chile habanero
(~ 5 chiles habaneros naranjas de ~5.4 gr c/u). Lo
inmediato sera una sensacin caliente en la lengua
con extrema irritacin, acompaado del sudor en la
frente y nuca, quiz un molesto piiiiiiiii en los odos y
algunos, adems de mareos, podran estar al borde
o inmersos en alucinaciones.
Spray de
pimienta Ms tarde, me involucr en un doctorado e inclu-
so, realic dos estancias postdoctorales. Fue hasta
entonces cuando hice una pausa en mi prometedo-
ra carrera como investigador para preguntarme so-
Chile
habanero bre mis posibilidades de desarrollo en otras reas.
200 000/350 000
Decid entonces explorar mis capacidades de
pasante de empresario y convertirme en emprende-
Chile dor.
serrano
10.000/23.000
Existen 10 errores comunes en los que cae cual-
quier pasante de empresario; yo, he cado en varios.
En el primer intento, ca en los primeros tres de
Salsa tabasco
2.500/5.000 un jaln. Recuerdo bien que en una sala de juntas
del IBt haba logrado reunir a 5 lderes acadmicos
para conformar un equipo en el que habra una
lluvia de ideas del sper producto con el que nos
lanzaramos a crear una empresa, que tena el
potencial de generar cero millones de pesos en los
prximos 5 aos. Error nmero 1, desarroll algo
que nadie quiere; nmero 2, los contrat ms que
Biotecnologa
pobremente y nmero 3, no tena ni idea de lo que
quera llevar a cabo. Con suma amabilidad y con
mucho aliento por parte del equipo, me di cuenta
de que difcilmente iba a convencer a alguien de
aventurarse conmigo, sobre todo tratndose de l-
deres acadmicos, ya que no todos tienen inters en
la creacin de una empresa. Siguiendo el lema de:
Falla pronto, falla barato y recomienza ya, prcti-
camente en la misma semana de aquella reunin
y revisando las bitcoras, encontr en los anlogos
de caspsaicina una puerta abierta. Tambin, hubo
que reducir el nmero de integrantes y a partir de
entonces encontr en los doctores Agustn Lpez,
Edmundo Castillo e Ignacio Regla, adems de la
frmula correcta, el invaluable apoyo para novatear
en los negocios.
...existen 10 errores comunes en los que
cae cualquier pasante de empresario...
No hubo que esperar mucho cuando una empresa
nos contact con el inters de conocer la tecnologa
y sus capacidades. En un par de semanas ya haba-
mos hecho contacto con los inversionistas y haba-
mos acordado someter una propuesta al Programa
de Estmulos a la Innovacin (PEI) de CONACyT. En
aquel entonces los apoyos a los inscritos en el RE-
NIECyT eran casi de la totalidad y la aportacin de
capital por parte de la empresa era simblica. Como
buenos investigadores, orgullosos de la tecnologa,
a los inversionistas les presumimos y dimos toda
la informacin con la que contbamos. Despus
de aproximadamente 6 meses de trabajo y co-
laboracin, con el presupuesto solicitado al PEI
completamente aprobado, surgi el problema! A
dos das de firmar el convenio de asignacin de
recursos con el CONACyT, los inversionistas nos in-
formaron que no contaban con el capital simblico
que el PEI exiga como inversin; pero nos presen-
taran a un socio capitalista que pondra lo que el
PEI requera y ms si era necesario. Por supuesto,
haba muchos cambios en esta nueva negociacin
y rompa con todo lo que previamente habamos
acordado. Las nuevas condicionantes nos ponan en
una posicin de mucha desventaja por lo que tuvi-
EN MOVIMIENTO
mos que rechazar el apoyo y agradecer la amabili-
dad de los inversionistas y la de su desinteresado
conocido. Esta experiencia fue el error nmero 4,
nos asociamos con co-fundadores inadecuados.
En retrospectiva, y despus de discutir mucho
el hecho con el equipo, esta parte de la his-
toria potenci nuestro empeo en hacer
de la tecnologa un negocio. En aquel mo-
mento entend que hay en el mercado un
espacio para los anlogos de capsaicina.
Impulsados por el fracaso anterior y
con el apoyo de los investigadores del
equipo, quienes hicieron un esfuerzo
por aportar los sobrantes casi nulos
de presupuestos de otros proyectos y con la
libertad que me dio mi jefe de aquel entonces,
el Dr. Enrique Rudio, seguimos trabajando en la
optimizacin de la tecnologa. Conocamos bien
algunos detalles de la tecnologa que tenan que
ser mejorados por lo que empezamos a trabajar en
ello a pequea escala. Por esas fechas, la UNAM firm
un convenio de confidencialidad con una empresa
interesada en vincularse con los investigadores del
alma mter. Con este convenio, la universidad abra
sus puertas para que la empresa echara un vistazo
a las tecnologas desarrolladas en la academia y
evaluara la posibilidad de invertir o adquirir una de
ellas. Nuestro caso fue uno de los que decidieron
explorar y llegamos a entrevistarnos con quien
tomaba la decisin importante. Para nuestra sor-
presa, independientemente de su decisin, fue el
consejo que amablemente y basado en su amplio
conocimiento sobre las oportunidades de mercado,
nos propin! Aunque a Mr. Big-Shot le agradaba la
tecnologa, l no vea como segmento de mercado
el que nosotros proponamos y nos invito a explorar
si los anlogos de capsaicina podran servir como
potenciales frmacos contra el cncer, a lo que
nos pidi desviar, slo un poquito, los limitados
recursos y la lnea de investigacin. Si bien las
conclusiones de esta experiencia en aquel momen-
to recayeron en la falta de visin de la persona que
nos entrevist, ahora considero que nuestro fracaso,
y error nmero 5, residi en la poca claridad y la
falta de marketing o poder de convencimiento
que tenamos. Aunque suene atrevido y osado,
21
 debimos haber sido nosotros quienes intentramos
convencer a los dirigentes de la empresa interesada
en nuestras invenciones, de hacer lo que nosotros
queramos y no al revs.
...actualmente, la vinculacin entre In-
no-Ba, GAFISA y el IBt es fuerte y gracias a ello con-
tamos con un apoyo del programa FINNOVA...
Sin desilusionarnos, continuamos con la optimi-
zacin de la tecnologa y ms tarde, nos acercamos
a la Dra. Karla Cedano a quin le presentamos el
proyecto. La energa de Karla y la de Inno-Ba (Oficina
de Transferencia de Conocimiento OTC certificada
por CONACyT), pronto nos llevaron a entablar una
pltica con un empresario a quien Karla, convenci
para que nos escuchara. Prcticamente la mesa esta-
ba puesta y slo habramos de ponernos de acuerdo
en cmo y cunto. Sorprendentemente, a la semana
de haberle presentado el proyecto al inversionista
y a Inno-Ba, la OTC ya estaba sometiendo una pro-
puesta al Programa de Estmulos a la Innovacin
(PEI) con una visin y ambicin mucho ms amplia
de la que habamos estimado los acadmicos. Con
el PEI aprobado y con Inno-Ba articulando y aceitan-
do los engranes, los acadmicos logramos escalar
y optimizar la tecnologa para las demandas que
CHILE
BELL POBLANO JALAPEO SERRANO
SHUs
0 1,000-2,5000 2,500-8,000 7,000-25,000
CHILE
SCOTCH
CHILTEPINS HABANERO
BONNET
200,000- 200,000-
SHUs
70,000
300-000 300-000
22
sugera el mercado. Por su parte, el empresario puso
al alcance los recursos necesarios para que aquello
ocurriera. Con este apoyo logramos consolidar la
tecnologa y protegerla. Ahora considero que lo ms
importante fue que, entre los actores involucrados,
logramos estrechar vnculos y entender las necesi-
dades de cada uno. De hecho, en ese momento fue
cuando empec a saber el significado de pasante
de empresario y marc el nacimiento de la empre-
sa Grupo Alimentario Farmacutica Industrial SAPI
de CV., Sociedad Annima Promotora de Inversin
(GAFISA) modalidad capsaicinoides.
Actualmente, la vinculacin entre Inno-Ba, GAFISA
y el IBt es fuerte y gracias a ello contamos con un
apoyo del programa FINNOVA. Como parte de
GAFISA considero que estamos en el camino ade-
cuado y para mi es de suma importancia que nues-
tra empresa se encuentre en contacto permanente
con la academia, y en particular, con la institucin
que desarroll la tecnologa y que dio pi a que
GAFISA modalidad capsaicinoides naciera. Esto
no slo como estrategia para la optimizacin
constante de la tecnologa; sino como pilar funda-
mental del desarrollo e innovacin en los siguientes
pasos de GAFISA. Por otro lado, el cobijo, el respal-
do y articulacin de Inno-Ba ha sido fundamental.
Aunque han sido mucho ms que eso, su funcin
de intrprete y traductor de la comunicacin entre
GAFISA y el IBt evitaron el desgaste de los vincu-
lados e incluso, en momen-
tos crticos, el rompimiento
de la relacin. Hoy, al cabo
de un tiempo, me encuentro
ms cerca de lograr la meta.
El camino no ha sido sencillo
CAYENNE pero tampoco nada fuera de
lo comn. De los 10 errores
50,000 tpicos que comete cualquier
emprendedor yo he cado en
varios y de todos, bien o mal,
me he levantado. De hecho,
con creatividad e innovacin,
estoy colaborando a que los
NAGA
prximos emprendedores no
JOLOKIA
caigan en los mismos errores,
855,000-
caern quiz, en otros, ha!
1,041,427
Biotecnologa

Seccin a cargo de Adn Guerrero (adanog@ibt.unam.mx)
El IBt cuenta con seis unidades que dan las facilidades tc-
nolgicas de avanzada, necesarias para el desarrollo de
los proyectos de investigacin. Asimismo, contamos con
tres laboratorios, de carcter universitario o nacional, cuyos
servicios de apoyo a la investigacin y a la docencia son
Unidad de
Secuenciacin
Masiva y Bioinformtica,
a la vanguardia de la ciencia
Dr. Alejandro Snchez Flores
U
no de los grandes problemas que ha
afectado el desarrollo cientfico del pas,
ha sido el rezago a nivel tecnolgico en
diferentes reas. Gracias al fenmeno de
globalizacin que vivimos actualmente, los costos
de la tecnologa de vanguardia se han reducido
considerablemente, permitiendo cerrar la brecha
tecnolgica que exista en la ciencia en Mxico.
Ejemplo de ello es la Unidad de Secuenciacin Ma-
siva y Bioinformtica (USMB), que tiene como sede
al IBt de la UNAM (www.uusmd.unam.mx). Esta
unidad se encarga de brindar servicios a usuarios
tanto dentro como fuera de la UNAM, incluyendo
aquellos del extranjero. Los servicios que se brin-
dan estn enfocados a resolver problemas en diver-
sas reas de la ciencia y la tecnologa como son la
biologa, la ecologa, la medicina y la biotecnologa,
entre otras, relacionadas con la informacin que se
puede obtener a partir del ADN y que gracias a las
nuevas tecnologas, es posible caracterizar y estudiar
en tiempos cortos a precios relativamente bajos.
El ADN es una cadena formada principalmente por
4 bloques (bases) que normalmente son represen-
tados por las letras A, T, G y C. Estas largas cadenas
no slo son las molculas responsables de la heren-
cia en los seres vivos, tambin contienen mensajes
o instrucciones que definen a cada organismo. Por
lo tanto, lo que se desea es determinar la secuencia
-el orden- en el que se encuentran estos bloques en
EN MOVIMIENTO
Unidades y Laboratorios que apoyan
a la investigacin y a la industria
cruciales para la comunidad universitaria y empresarial.
En esta seccin, los acadmicos adscritos a las Unidades/
Laboratorios nos comparten sus experiencias en el traba-
jo cotidiano desde sus trincheras.
la molcula del ADN y por esto el proceso se llama
secuenciacin.
La cantidad de informacin a secuenciar depender
de cada organismo. Por ejemplo, una bacteria
puede tener toda la informacin gentica en un
milln de bases, mientras que el ser humano tiene
3 mil millones de estos bloques. Este compendio
de informacin gentica, es lo que se conoce como
el genoma de un organismo y al estudio de los
genomas se le denomina genmica. Analizar esta
cantidad de informacin no es posible de manera
manual. Sin embargo, la ventaja de poder represen-
tar los bloques o bases que conforman la molcula
de ADN en letras de nuestro alfabeto, hace posible
crear textos que contienen toda la informacin de
un genoma.
Dichos textos pueden ser almacenados, proce-
sados, filtrados, analizados e interpretados de
manera digital, haciendo uso de herramientas
computacionales. Esto es lo que se conoce como
Bioinformtica.
...gracias al fenmeno de globalizacin que
vivimos actualmente, los costos de la tecnologa de
vanguardia se han reducido considerablemente,
permitiendo cerrar la brecha tecnolgica que
exista en la ciencia en Mxico...
23
Cluster con capacidad
de analisis de 280 com-
putadoras trabajando
simultneamente
Como su nombre lo indica, la unidad se especializa
en la secuenciacin masiva de ADN y en la Bioin-
formtica, reas inseparables para poder analizar e
interpretar la informacin generada. La secuenciacin
del genoma humano comenz en el ao de 1990.
...nuestros servicios estn a disposicin
para contribur a resolver, en medida de los
posible, problemas que afecten a la sociedad...
Diez aos despus, se logr determinar la secuencia
del genoma con un costo aproximado de 1,000
millones de dlares americanos. Adems, dicho ge-
noma an no se termina de analizar por completo;
sin embargo, gracias a la bioinformtica, no slo fue
posible reconstruir el genoma, sino estudiarlo en un
periodo de tiempo razonable. Actualmente, gracias
a la infraestructura con la que cuenta la USMB, es
posible repetir la misma hazaa en cuestin de das y
a un precio menor a los 10 mil dlares, debido a que
contamos con tecnologa de punta y la experiencia
de un grupo de cientficos con amplio conocimiento
en las reas de genmica y bioinformtica.
La USMB, adems de brindar los servicios de se-
cuenciacin de ADN y de bioinformtica, asesora a
sus usuarios para resolver las preguntas biolgicas,
mdicas o biotecnolgicas, detrs de sus proyec-
tos. Por mencionar algunos ejemplos, realizamos
anlisis de ADN de poblaciones indgenas mayas
24
con enfermedades
tales como la diabetes,
donde se estudian las
variantes genticas de
los miembros de una
familia que presenta
la patologa. En otro
proyecto, en colabo-
racin con el Servicio
Nacional de Sanidad
Inocuidad y Calidad
Agroalimentaria (SE-
NASICA), se desarroll
un mtodo para la
deteccin de elemen-
tos transgnicos (ADN
que no pertenece a
una especie y que al
ser introducido en otra
especie le transfiere
capacidades que fa-
vorecen su crecimiento
o productividad) pre-
sentes en diferentes
tipos de cultivo.
Esto es muy importante debido al control que se
requiere para cumplir con las leyes de uso de
organismos genticamente modificados en nues-
tro pas. Tambin hemos participado en resolver
problemas de acuicultura, como es la muerte de los
cultivos de camarn blanco en el norte del pas, el
cual parece estar relacionado con el virus de la man-
cha blanca y con especies bacterianas del gnero
Vibrio. Estos patgenos estn siendo caracterizados
actualmente en la USMD para posteriormente tratar
de encontrar mtodos de prevencin, con el fin
de reducir prdidas de produccin. Por lo tanto, la
USMB tiene una fuerte participacin en la resolucin
de problemas que afectan a distintos sectores de la
sociedad.
Finalmente, la USMB, al ser un pionero y referente
en las reas de genmica y bioinformtica, forma
parte del Laboratorio Nacional de Respuesta a
Enfermedades Emergentes, la cual tuvo una par-
ticipacin muy importante en la caracterizacin
de la epidemia del virus de influenza que afect a
nuestro pas en el 2009. Todo esto ha sido posible
gracias al apoyo de nuestra mxima casa de estudios
(UNAM), del IBt y del Consejo Nacional de Ciencia y
Tecnologa (CONACyT), por lo cual tenemos un gran
compromiso moral y social; nuestros servicios estn
disponibles para contribur a resolver, en medida de
lo posible, problemas que afecten a la sociedad.
Contacto: alexsf@ibt.unam.mx
Biotecnologa
 Cursos y tpicos en el IBt

Seccin a cargo de Georgina Ponce (geop@ibt.unam.mx),

Miguel Cisneros (miguelc@ibt.unam.mx) y Jos Luis Reyes (jlreyes@ibt.unam.mx)
En el IBt se imparten anualmente alrededor de 25 cursos, actualizada en la frontera de los temas cientficos y tec-
tanto bsicos como diferentes tpicos selectos, para nolgicos.
estudiantes de posgrado. Los tpicos selectos estn siem- En esta seccin se describe brevemente el contenido de
pre relacionados con temas de vanguardia y tienen la algunos de estos cursos.
finalidad de mantener a nuestra comunidad estudiantil Contacto: docencia@ibt.unam.mx

Del gen
al producto

Dra. Clarita Olvera Carranza y

Dra. Marcela Ayala Aceves

L
a biotecnologa moderna combina una serie
de herramientas tericas y experimentales
para el desarrollo de un bioproceso. En el
curso Del gen al producto, se proporcionan
los fundamentos tericos y prcticos de los biopro-
cesos modernos, mediante un anlisis secuencial
de las etapas que conforman un bioproceso
"tpico" moderno, basado en microorganismos o
clulas genticamente modificadas.

El curso se divide en tres grandes mdulos:

Ingeniera Gentica, Bioprocesos y Procesos de
purificacin. Cada mdulo incluye sesiones con
diferentes investigadores en donde se revisan
los principios bsicos del manejo de organismos
modelo para la produccin de protenas y las
condiciones adecuadas de funcionamiento de un
biorreactor (por ejemplo: de transferencia de masa,
momentum o calor; cintica microbiana; operacin
de un biorreactor; balance de materia; criterios de
purificacin de una protena; operaciones unitarias).
Se hace tambin una revisin de las metodologas
ms relevantes para manipular y caracterizar el
ADN, as como para introducir segmentos de ADN
en clulas, microorganismos u organismos para la
produccin de protenas recombinantes o manipu-

EN MOVIMIENTO 25
 lacin de vas metablicas para favorecer
la produccin de un determinado me-
tabolito (producto) de inters comercial.

En cada mdulo se lleva a cabo una sesin

prctica con duracin de una semana,
donde se aplican los conceptos revisados
en las sesiones tericas. Durante este
curso los alumnos unen un segmento de
inters de ADN (gen) en un segmento
largo de ADN (vehculo de clonacin)
que contiene todos los elementos
para producir la protena en algn
organismo; con esa construccin, transforman
una bacteria para generar un microorganismo
recombinante. Ms tarde, los alumnos produ-
cen una protena recombinante en un fermen-
tador de 10 L. y purifican la protena obtenida,
utilizando tcnicas como cromatografa de
intercambio inico.

Las prcticas del curso de realizan en las insta-

laciones de la Planta Piloto del IBt. Este curso
terico-prctico es coordinado por la Dra. Clarita
Olvera Carranza (clarita@ibt.unam.mx) y la Dra.
Marcela Ayala Aceves (maa@ibt.unam.mx).

26 Biotecnologa
 En la voz de nuestros ex-alumnos

Seccin a cargo de Georgina Ponce (geop@ibt.unam.mx),

Miguel Cisneros (miguelc@ibt.unam.mx) y Jos Luis Reyes (jlreyes@ibt.unam.mx)
En los primeros 30 aos de trabajo, el IBt ha formado cerca cientfico bien desarrollado y mucho entusiasmo, con-
de 700 licenciados, 650 Maestros y 350 Doctores. Esta tribuyen a la ciencia, la tecnologa, la educacin y el de-
riqueza en recursos humanos de muy alta calidad, gener sarrollo empresarial, tanto en el pas como en el extranje-
la idea de invitar a los ex-alumnos del Instituto a regre- ro. En esta seccin presentamos experiencias de algunos
sar a casa y a finales del 2014 se efectu el Primer da de los ex-alumnos del IBt que han destacado en diferentes
del ex-alumno IBt, un encuentro lleno de ancdotas de reas profesionales.
profesionistas que desde su bastin y con un pensamiento

El papel de la nutricin en
la desaparicin de las abejas:
causas y soluciones (2da. parte)
Dr. Miguel Corona Villegas
Departamento de Agricultura
de los Estados Unidos de Amrica

El Dr. Corona se gradu de Doctor en el IBt.

En el nmero uno de Biotecnologa en Movimiento se
resumieron las causas del problema y en esta segunda
parte se analizan las posibles soluciones.
Imagen:
http://w w w.
imagui.com/a/
panal-abe-
jas-TkebgbELb

A
Posibles soluciones
unque es claro que el estrs nutricional cau-
sado por destruccin del hbitat es un factor
importante asociado a la disminucin de las
poblaciones de abejas y otros polinizadores,
la solucin de este problema constituye un reto for-
midable. Resulta paradjico que la revolucin verde
caracterizada por el uso de la agricultura industrial que
ha incrementado sustancialmente la produccin de
alimentos (incluyendo cereales como el trigo, maz, soya
y arroz, que no dependen de la polinizacin de insectos)
al mismo tiempo resulte en la reduccin de poblaciones
de insectos que impactan principalmente la produccin
de frutas y verduras que tambin son sustanciales para
la nutricin humana. De la solucin de esta paradoja
depende nuestro futuro: debemos solucionar la nutricin
de las abejas para asegurar nuestra propia nutricin.

EN MOVIMIENTO 27

Fotografa Andrew Ulsamer
Existen diferentes estrategias que podran ser usadas
para ayudar a mejorar la nutricin de las abejas,
aunque su implementacin a gran escala es muy
compleja. As, por ejemplo, la sustitucin de mono-
cultivos por policultivos que florezcan a diferentes
tiempos y produzcan plenes cuyo valor nutricional
sea complementario, aunque posible, actualmente
es utpico. Es quiz ms realista, la idea de establecer
reas de amortiguamiento ecolgico entre monocul-
tivos donde se deje crecer plantas de manera natural
o incluso se cultiven especies de plantas con plenes
de alto contenido nutricional (aunque el costo de esta
ltima opcin es elevado). De igual manera, ha sido
propuesto que el uso de cultivos orgnicos libres de
herbicidas, podra ayudar al crecimiento de hierbas
(mala hierbas o malezas) dentro de los cultivos que
suministren una fuente de polen y nctar. Sin embar-
go, el efecto de la competencia de estas plantas sobre
los cultivos, seguramente disminuira su produccin,
la que ya est afectada por otros factores tales como
la creciente erosin de los suelos. As, la presin de
incrementar la produccin de los monocultivos para
sostener la creciente poblacin mundial, en muchos
casos se contrapone con la necesidad de implemen-
tar estrategias encaminadas a restablecer el equilibrio
nutricional de los polinizadores.
Aunque en principio las perspectivas parecen ser
desoladoras para el futuro de las abejas y otros
polinizadores principalmente en los pases de-
sarrollados, es imperativo la bsqueda de soluciones
que representen un compromiso entre la demanda
de incremento de la produccin de monocultivos y
estrategias agrcolas que tomen en consideracin la
supervivencia de los polinizadores y las plantas que
dependen de ellos. De no ser as, en el mediano plazo
se podra esperar un incremento en la tendencia
ya existente de la especializacin de los pases
desarrollados en la produccin de cereales y de los
pases subdesarrollados en la produccin de hortalizas
(frutas y verduras).
En conclusin, hasta ahora es difcil visualizar una
estrategia que rescate el equilibrio nutricional de las
abejas sin realizar una profunda reorganizacin de
28
las polticas y estrategias asociadas a la agricultura
industrial, lo cual bien podra constituir una segunda
revolucin verde.
Un segundo frente, encaminado, no tanto a solucio-
nar de manera definitiva el problema de la desnu-
tricin de las abejas, sino a cubrir sus deficiencias,
lo constituye el uso de sustitutos de polen y suple-
mentos nutricionales. Aunque su uso no es nuevo,
en general stos se han enfocado ms en la cantidad
que en la calidad de sus componentes (contenido
total de protenas y lpidos) con resultados limitados.
Una segunda generacin de suplementos alimen-
ticios, que incluyen la totalidad de aminocidos
y cidos grasos esenciales para la nutricin de las
abejas, han sido recientemente elaborados tanto por
compaas privadas como por el Departamento de
Agricultura de los Estados Unidos (USDA). Resultados
preliminares con el uso de estos suplementos, son
favorables en la disminucin de la mortalidad de las
colonias, aunque el xito de dicha suplementacin
depende de varios factores incluyendo el periodo del
ao cuando esta se realiza. As, una suplementacin
nutricional realizada en primavera, que apoya el
periodo natural de multiplicacin de la colonia y
resulta en colonias con gran poblacin, es de mayor
efectividad comparada con la suplementacin nutri-
cional en el otoo, cuando la colonia ha disminuido
la produccin de cra. En conclusin, aunque la suple-
mentacin alimenticia no es una solucin compatible
con una apicultura autosustentable, su desarrollo y
implementacin es una necesidad urgente mientras
no existan soluciones de fondo a este problema.
Cuando veas las barbas de tu vecino cortar, pon
las tuyas a remojar
En Mxico, la situacin nutricional de las abejas es
diferente a la existente en los Estados Unidos por
varias razones. Primero, las extensiones de mono-
cultivos no son tan amplias. De hecho, la naturaleza
montaosa de gran parte del territorio, se presta
poco para el desarrollo de grandes superficies agrco-
las. Segundo, la gran diversidad de ecosistemas con
diferentes microclimas permiten una mayor diversi-
dad de plantas.
As, aunque en Mxico no hay indicaciones de una
disminucin general de las poblaciones de abejas,
podra ser esperado un impacto negativo especfico
en las reas del pas con mayor uso de monocultivos
(tales como el Bajo y el noreste). Particularmente
en estas regiones, debemos tomar nota de las con-
secuencias desastrosas para la salud de los poliniza-
dores derivadas del uso intensivo de los monocultivos
experimentadas por nuestros vecinos del norte.
Biotecnologa

Seccin a cargo de: Enrique Reynaud (enrique@ibt.unam.mx)
El transcurrir del tiempo ha dejado en cada miembro de
nuestra comunidad, vivencias y emociones que, compar-
tidas, nos permiten echar una mirada a la percepcin de
El Departamento de Biologa Molecular del Instituto de Investigaciones Biomdicas y
los inicios del IBt (2da. parte)
Dr. Mario Zurita Ortega
En el nmero uno de Biotecnologa en Movimiento,
presentamos el inicio de esta historia que ahora con-
cluye.
E
n mi caso particular, tuve un proyecto de
tesis de licenciatura hasta que regres Xavier
Sobern. Dentro de sus ideas y planes,
Xavier quera saber cmo funcionaban los
promotores para dar inicio a la transcripcin en E.
coli. Siendo Xavier un experto en sntesis qumica de
ADN, ya haba construido un promotor consenso
que tena en la posicin -35 la secuencia TTGACA y
EN MOVIMIENTO
Historias de nuestra comunidad
los eventos que han escrito la historia del IBt. Esta seccin
pretende divulgar experiencias de inters general de los
miembros de nuestra comunidad.
exactamente a 17 nucletidos la secuencia TATAAT,
secuencias que son esenciales para que la RNA
polimerasa inicie la sntesis del ARN mensajero en la
bacteria. El punto es que no sabamos si funcionaba
y es ah donde entr yo en el proyecto. Hicimos
construcciones en las que pusimos enfrente de este
promotor el gen de resistencia a tetraciclina y el de
resistencia a cloranfenicol como reporteros, era el
29

Dr. Mario Zurita y Dr. ao 1982. Entre tantas construcciones tambin de-
Francisco Bolivar cidimos ponerle la secuencia de ADN que reconoce
el represor de lactosa, el cual impide la activacin
del metabolismo de lactosa en E. coli para ver si
tambin se poda regular, aunque lo pusimos ro
arriba del promotor (en el operon lac, el operador
sobrelapa con el promotor en el sitio de inicio de la
transcripcin), adems se nos clon por duplicado
y en orientacin invertida y nos dimos cuenta hasta
que secuenciamos nuestras construcciones (todo
era manual, no haba kits, nosotros preparbamos
las mezclas de nucletidos, etc.). De cualquier
manera, funcion como promotor y era regulado
por el operador lac, estando ste en otra posicin
y en sentido invertido. Este trabajo fue mi tesis de
licenciatura que defend en 1982 y nunca publica-
mos. Aos despus salieron varios artculos de otros
grupos y en buenas revistas, en las que comuni-
caban resultados parecidos.
Hago referencia a mi proyecto porque ste era un
proyecto de ciencia bsica en un grupo cuya pun-
ta de lanza era un proyecto aplicado. Frecuente-
mente, los estudiantes que tenamos en algn
punto un proyecto de ciencia bsica, estbamos ms
actualizados con la literatura general y la de biologa
molecular. Esto inclua nuevas tcnicas, las cuales
tratbamos de implementar si nos servan para el
proyecto e iban desde hacer mejores preparaciones
de plsmidos en pequea escala (mini-preps), has-
30
ta mejorar la secuencia de ADN. Por ejemplo, cuan-
do hice la secuencia del operador lac y el promotor
sinttico, estbamos implementando el uso del fago
M13 como vector de cadena sencilla, lo que facilita-
ba la secuencia tipo Sanger y no le sala bien a na-
die. No recuerdo en qu artculo lo le, pero fue uno
publicado en Cell o en Nature, en el que mostraban
un gel de secuencia en M13 (impecable) y en el ma-
terial y mtodos recomendaban aumentar el incu-
lo de E. coli al momento de la infeccin con el fago
y dejar sta ms tiempo problema solucionado y
con algo tan simple. As pas con otros compaeros
y esta actitud benefici ampliamente a todo el gru-
po, incluyendo a los proyectos aplicados.
La mstica
Uno de los mejores recuerdos que tengo de ese
tiempo es que por razones obvias, los estudiantes
que estbamos ms comprometidos con la ciencia
bsica, tenamos ms afinidades. En algunos de
ellos como Luis Covarrubias, Mario Rocha, Alejan-
dro Garcarrubio, Irene Castao, Guillermo Oliver
y yo, nos atraa obsesivamente la biologa molecu-
lar de eucariotes, en particular, cmo se regulan
los genes durante la diferenciacin celular y el de-
sarrollo. No haba en ese momento en Mxico un
grupo que realmente fuera experto en el tema. As
que organizbamos journal clubs en los que slo
participbamos los estudiantes y discutamos estos
temas, revisando la literatura en las revistas de van-
guardia de la poca (que prcticamente siguen sien-
do las mismas ahora, con alguna que otra nueva) y
sobamos cundo podramos hacer investigacin
en estos temas.
Otro recuerdo interesante, es aquel de encontrarnos
los viernes a las diez de la noche en el laboratorio
de Xavier Sobern corriendo un gel y ver que en el
laboratorio del Dr. Bastarrachea, en el de Francisco
Bolvar y en el de Alejandra Covarrubias, tambin
estaban corriendo geles o purificando plsmidos
y escuchar ese hermoso sonido de las micro-cen-
trfugas en todos los laboratorios del segundo piso
de Biomdicas. En algunas ocasiones, al salir ya tar-
de el viernes o el sbado tambin visitbamos algn
bar para platicar de nuestros experimentos exitosos
y sobre todo de los fallidos haba mstica
En conclusin, fue un momento extraordinario para
los estudiantes de aquel entonces, en el inicio de lo
que sera el IBt. As mismo, para algunos de nosotros
qued muy clara la importancia de estar rodeados
de gente que hace ciencia bsica de buena calidad
para que los proyectos aplicados, que no son trivia-
les, sean exitosos.
Contacto: marioz@ibt.unam.mx
Biotecnologa

Seccin a cargo de Enrique Reynaud (enrique@ibt.unam.mx)
La observacin es un acto fundamental de la conciencia y
es la accin la que mueve la propela de la creatividad. As,
cientficos-artistas o artistas-cientficos se interesan en los
aspectos de la vida en los que se busca, se experimenta y
se revalora la vida misma. Esta seccin recibe colabora-
ciones de miembros de la comunidad del IBt, interesados
Pobreza en la abundancia
del siglo
XXI
Dr. Enrique Reynaud Garza
N
uestra visin del mundo est determinada
por la escasez. A lo largo de la historia de
la humanidad, todo ha sido escaso, las
protenas, las caloras, la informacin, la
educacin, el agua, todo. La escasez determin la
condicin humana y nuestro concepto de moralidad,
al grado que la gula es un pecado mortal porque
en tiempos de escasez, lo que t te atragantas hace
hambriento a otro. En los ltimos 100 aos, todo
cambi, no existe escasez, vivimos en una era de
abundancia como nunca habamos visto. Gracias a
la automatizacin, el trabajo es cada vez ms innece-
sario. Segn Wikipedia, en 1870 entre el 70 y el 80
% de la poblacin de Estados Unidos se dedicaba a
la agricultura; ahora, slo el 2 % de la poblacin lo
hace. Cuando se compara la produccin de alimen-
tos actual con la de 1950, los granjeros modernos
producen 262 % ms comida con 2 % menos in-
versin por hectrea. El aumento en el rendimiento
y la productividad y la reduccin del trabajo est
sucediendo en todas las reas de la economa. En
este momento existen vehculos automatizados
como los de Google que van a desplazar a choferes y
transportistas, drones que desplazarn a los pilotos
y controladores, robots bodegueros y los sistemas
EN MOVIMIENTO
Ciencia y Cultura
en compartir sus lecturas e intereses en la ciencia y la cul-
tura. En este nmero, el Dr. Enrique Reynaud nos describe
la contradiccin que representa la probreza dentro de la
abundancia de la sociedad en la que vivimos y hace referen-
cia a tres obras de reciente publicacin.
de inteligencia artificial cada da hacen trabajos ms
intelectuales que muy pronto desplazarn a miles
de contadores y abogados. Los mdicos no son
una excepcin, Watson de IBM, un sistema de inteli-
gencia artificial famoso por haber ganado el juego
Jeopardy a campeones humanos, est siendo
entrenado para hacer diagnstico clnico y los ro-
bots quirrgicos estn por minimizar el nmero de
cirujanos necesarios, es clarsimo que la economa y
la sociedad van a ser profundamente transformadas
por la automatizacin.
En pocas palabras, el trabajo humano se est volviendo
innecesario. A pesar de todo esto, la sociedad sigue
programada para vivir en la escasez y no sabemos
administrar la abundancia. Se calcula que, optimi-
zando la distribucin de bienes y servicios con el
objetivo de minimizar el trabajo, slo el 5 % del traba-
jo y las actividades econmicas que se desarrollan
actualmente seran necesarios, es decir, la semana
laboral se reducira de 40 hrs a 2 hrs. Si aceptamos
esta tendencia, nos tenemos que preguntar: Qu
tipo de sociedad vamos a querer? Un mundo donde
gracias a la abundancia generada haya suficiente de
todo para todos, algo as como un hotel todo inclui-
31
 do para toda la humanidad. O, un mundo en donde
todos estos bienes generados por la automatizacin
estn disponibles para unos pocos y la mayora no
tenga prcticamente nada, algo as como un campo
de refugiados.
Esta pregunta tan fundamental para el futuro de
nuestra especie se plantea en tres libros que quiero
comentar. El primero se llama La Singularidad est
cerca escrito por Ray Kurzweil quien invent el sin-
tetizador digital entre otras muchas cosas y trabaja
actualmente como director de Ingeniera en Google.
Este libro propone la naturaleza del crecimiento ex-
ponencial del conocimiento y la hiptesis se apoya
en el crecimiento de la capacidad de cmputo a lo
largo de los aos. Con una serie de premisas bien
fundamentadas, predice que alrededor del ao
2020, una computadora de mil dlares tendr la mis-
ma capacidad de cmputo que un cerebro humano,
lo que permitira disear mquinas tan inteligentes
o ms que los humanos que a su vez podran disear
muy rpidamente mquinas an ms inteligentes global de impuestos con una tasa progresiva a la
que repetiran el ciclo, eventualmente causando una
explosin de la inteligencia.
Lo que sucede despus de esta explosin es tan
complejo y dinmico que sencillamente no po-
demos imaginarlo (de ah el trmino singularidad).
Kurzweil es bastante optimista, pero, hay que
tener claro que las mquinas superinteligentes
posteriores a la singularidad pueden ser benignas,
malignas o indiferentes con respecto a la humani-
dad. Si son benignas, el futuro de la humanidad va
a ser paradisiaco, si son malignas o indiferentes
nuestra especie se extingue inexorablemente en
este siglo. La actitud que tomen las mquinas super-
inteligentes depender quiz, de la actitud que la
humanidad tome con respecto a s misma.
El siguiente libro tambin es muy optimista, se
llama, Abundancia: el futuro es mejor de lo que
esperas y est escrito por Peter Diamandis quien
es el director de la X PRIZE Foundation. Diamandis
se apoya en las tesis de Kurzweil y argumenta muy
exitosamente y con abundantes ejemplos que la
naturaleza exponencial de la innovacin tecnolgi-
ca va a crear un mundo de abundancia en donde
32
la mayor parte de los problemas de la humanidad
se pueden resolver (agua, alimentacin, materias
primas, etc.). Sin embargo, no queda totalmente
claro qu sucede con la disparidad social que sufri-
mos actualmente. Bsicamente propone que en un
mundo donde hay tanta abundancia hasta los ms
pobres, son ricos.
El tercer libro es de Thomas Piketty y se llama El
capital en el siglo XXI. Ya hay quien dice que va a
ser el libro de economa ms influyente del siglo.
Piketty argumenta que el retorno a la inversin en
capital (inters), es mayor que el valor del trabajo
y mayor que el crecimiento econmico a largo
plazo, lo que genera acumulacin de la riqueza por
unos cuantos y una profunda disparidad social que
causa inestabilidad social y econmica. Piketty, no
es nada optimista y afirma que, si se mantiene el
status quo, vamos directamente a una catstrofe
social y econmica y sostiene que, la nica forma
de resolver el problema es mediante un sistema
riqueza para generar una mejor distribucin del
capital y disminuir la disparidad social.
El mensaje de los tres libros es el siguiente: la cien-
cia, el conocimiento y la riqueza estn creciendo de
manera exponencial y se retroalimentan mutua-
mente acelerando an ms el crecimiento. Estamos
entrando a una era donde habr una enorme abun-
dancia de bienes y servicios en la que el trabajo hu-
mano va a ser cada vez ms innecesario. La riqueza
est muy mal distribuida y esta enorme disparidad
social causa inestabilidad social y econmica. En
consecuencia, para la supervivencia y bienestar de
nuestra especie es fundamental preguntarnos: En
qu tipo de mundo queremos vivir?
Bibliografa:
-The Singularity is Near, Raymond Kurzweil; Viking
Press, 2005, ISBN 0670033847.
-Abundance: The Future Is Better Than You Think,
Peter H. Diamandis and Steven Kotler; Free Press,
2012, ISBN 1451614217
-El Capital en el Siglo XXI, Thomas Piketty, Fondo de
Cultura Econmica, 2014, ISBN 9788437507231
Biotecnologa
 Primer lugar
Ttulo: Vbora
Autor: Edgar Enrique Neri Castro

Sptimo Lugar.
Ttulo: Ojo de gato
Autor: Edgar Enrique Neri Castro

Concurso de fotografa La imagen para la ciencia

dentro del festejo del decimoquinto aniversario de la
Revista Digital Universitaria
Evaporacin de gotas y geometra de sus sedimentos
Superposicin de 112 imgenes obtenidas durante la evaporacin de una gota de agua
que contiene partculas esfricas microscpicas suspendidas.

Durante la evaporacin, estas partculas son arrastradas debido al flujo del lquido en
evaporacin formando complejos patrones de singular belleza.

La fotografa resume todo este proceso.

Como una aplicacin potencial, los patrones pro-

ducidos por los glbulos rojos en una gota de
sangre evaporada, pueden diferenciar entre
una persona anmica o con dislipidemia,
de una sana.

Foto ganadora del Concurso de Fotografa Cientfica 2015,

organizado por la Coordinacin de la Investigacin Cientfica y
la Direccin General de Divulgacin de la Ciencia de la UNAM

Autores: Dr. Gabriel Corkidi, Instituto de Biotecnologa, UNAM y

Dr. Eduardo Ramos, Instituto de Energas Renovables, UNAM