DEGENERACY AND WOBBLE

All the amino acids except methionine and tryptophan are specifi ed by more than one codon (Table
10.1). Three amino acids—leucine, serine, and arginine—are each specifi ed by six different
codons. Isoleucine has three codons. The other amino acids each have either two or four codons.
The occurrence of more than one codon per amino acid is called degeneracy (although the usual
connotations of the term are hardly appropriate). The degeneracy in the genetic code is not at
random; instead, it is highly ordered. In most cases, the multiple codons specifying a given amino
acid differ by only one base, the third or 3 base of the codon. The degeneracy is primarily of two
types. (1) Partial degeneracy occurs when the third base may be either of the two pyrimidines (U
or C) or, alternatively, either of the two purines (A or G). With partial degeneracy, changing the
third base from a purine to a pyrimidine, or vice versa, will change the amino acid specifi ed by
the codon. (2) In the case of complete degeneracy, any of the four bases may be present at the third
position in the codon, and the codon will still specify the same amino acid. For example, valine is
encoded by GUU, GUC, GUA, and GUG (Table 10.1).

DEGENERACY DAN WOB

Semua asam amino kecuali metionin dan triptofan ditentukan oleh lebih dari satu kodon (Tabel
10.1). Tiga asam amino-leusin, serin, dan arginin-masing-masing ditentukan oleh enam kodon
berbeda. Isoleusin memiliki tiga kodon. Asam amino lainnya masing-masing memiliki dua atau
empat kodon. Terjadinya lebih dari satu kodon per asam amino disebut degenerasi (walaupun
konotasi biasa dari istilah ini hampir tidak sesuai). Degenerasi dalam kode genetik tidak acak;
Sebagai gantinya, ini sangat diperintahkan. Dalam kebanyakan kasus, beberapa kodon yang
menentukan asam amino tertentu hanya berbeda satu basis, dasar ketiga atau 3 kodon. Degenerasi
terutama terdiri dari dua jenis. (1) Degenerasi parsial terjadi bila basis ketiga dapat berupa salah
satu dari dua pirimidin (U atau C) atau, sebagai alternatif, salah satu dari dua purin (A atau G).
Dengan degenerasi parsial, mengubah dasar ketiga dari purin menjadi pirimidin, atau sebaliknya,
akan mengubah asam amino yang ditentukan oleh kodon. (2) Dalam kasus degenerasi lengkap,
salah satu dari empat basa dapat hadir pada posisi ketiga dalam kodon, dan kodon tersebut masih
akan menentukan asam amino yang sama. Sebagai contoh, valin dikodekan oleh GUU, GUC,
GUA, dan GUG (Tabel 10.1).
Scientists have speculated that the order in the genetic code has evolved as a way of minimizing
mutational lethality. Many base substitutions at the third position of codons do not change the
amino acid specifi ed by the codon. Moreover, amino acids with similar chemical properties (such
as leucine, isoleucine, and valine) have codons that differ from each other by only one base. Thus,
many single base-pair substitutions will result in the substitution of one amino acid for another
amino acid with very similar chemical properties (for example, valine for isoleucine). In most
cases, conservative substitutions of this type will yield active gene products, which minimizes the
effects of mutations.

Para ilmuwan telah berspekulasi bahwa urutan kode genetik telah berkembang sebagai cara untuk
meminimalkan mutasi mematikan. Banyak substitusi dasar pada posisi ketiga kodon tidak
mengubah asam amino yang ditentukan oleh kodon. Selain itu, asam amino dengan sifat kimiawi
serupa (seperti leusin, isoleusin, dan valin) memiliki kodon yang berbeda satu sama lain hanya
dengan satu basis. Jadi, banyak substitusi pasangan basa tunggal akan menghasilkan substitusi satu
asam amino untuk asam amino lain dengan sifat kimia yang sangat mirip (misalnya, valin untuk
isoleusin). Dalam kebanyakan kasus, substitusi konservatif jenis ini akan menghasilkan produk
gen aktif, yang meminimalkan efek mutasi.

Because of the degeneracy of the genetic code, there must either be several different tRNAs that
recognize the different codons specifiying a given amino acid or the anticodon of a given tRNA
must be able to base-pair with several different codons. Actually, both of the occur. Several tRNAs
exist for certain amino acids, and some tRNAs recognizemore than one codon. The hydrogen
bonding between the bases in anticodon of tRNA and the codon of mRNA appears to follow strict
base-pairing rules only for the first two bases of codon. The base-pairing involving the third base
of codon is apparently less stringent allowing what crick has called wobble at this site

Karena degenerasi kode genetik, pasti ada beberapa tRNA berbeda yang mengenali kodon berbeda
yang menentukan asam amino tertentu atau antikodon tRNA tertentu harus dapat
memasangkannya dengan beberapa kodon yang berbeda. Sebenarnya kedua hal tersebut terjadi.
Beberapa tRNA ada untuk asam amino tertentu, dan beberapa tRNA dikenali lebih dari satu kodon.
Ikatan hidrogen di antara basa dalam anticodon tRNA dan kodon mRNA nampaknya mengikuti
aturan pasangan pepatah yang ketat hanya untuk dua basis pertama kodon. Pasangan dasar yang
melibatkan dasar ketiga kodon tampaknya kurang ketat sehingga membuat kriket disebut
goyangan di situs ini