Professional Documents
Culture Documents
Ipi 393801
Ipi 393801
Variasi Genetik Jagung (Zea mays L.) Berdasarkan Karakter Fenotipik Tongkol
Jagung yang Dibudidaya di Desa Jono Oge
Genetic Variation of Maize (Zea mays L.) Cultivated in Village of Jono Oge Based on the Cob
Phenotypic Characters
Abstract
This study aims to determine the genetic variation in maize varieties cultivated in the
village of Jono Oge. The method used is descriptive method of cob phenotypic
characters included 24 quantitative and qualitative characters. The samples used were 6
varieties of Octora, Lamuru, Jaya 2, Kumala, Bonanza and local Pulut. The data were
analyzed using the formula of average (mean) and standard deviation, and then were
further tested using MVSP program (Multivariate Statistical Package). Data were edited
by using PFE program (Program File Editor) and the Clustering based dendogram was
constructed to show the genetic relationship among varieties or individual relationships
between varieties by UPGMA algorithm. Similarity index was calculated by using
Simple Matching existing coëficient on MVSP. The results showed that there were
variation on the quantitative and qualitative characters of maize cultivated in Jono Oge.
This data was reinforced by the support of similarity index varied between varieties and
between individuals that occur in Lamuru and local Pulut varieties with the support of
similarity index between 0.65% - 1%.
Abstrak
Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui variasi genetik varietas jagung yang
dibudidayakan di Desa Jono Oge. Metode yang digunakan adalah metode deskriptif
dengan menggunakan 24 karakter fenotipik tongkol jagung yaitu meliputi karakter
kuantitatif dan kualitatif. Sampel yang digunakan adalah 6 varietas jagung yaitu
varietas jagung Octora, Lamuru, Jaya 2, Kumala, Bonanza dan Pulutlokal. Data
dianalisis menggunakan rumus rata-rata (mean) dan standar deviasi serta diuji lanjut
menggunakan program MVSP (Multivarian Statistical Package). Data diedit dengan
program PFE (Program File Editor) dan dendogram dikonstruksi berdasarkan
Clustering yang menunjukkan hubungan kekerabatan antar varietas atau hubungan
individu antar varietas menggunakan algorithm UPGMA. Indeks similaritas dihitung
menggunakan metode Simple Matching Coefficient yang ada pada MVSP. Hasil
penelitian menunjukkan bahwa secara kuantitatif dan kualitatif jagung yang
dibudidayakan di Jono Oge menunjukkan adanya variasi. Data yang bervariasi antar
varietas dan antar individu yang terjadi pada varietas Lamuru dan Pulut lokal
diperkuat oleh dukungan indeks similaritas antara 0,65 % - 1%.
penelitian untuk melihat sifat-sifat fenotifik variasi genetik, digunakan 24 karakter fenotip
beberapa varietas jagung dengan mengamati tongkol jagung yang meliputi karakter
sifat/ karakter morfologi tongkol pada tanaman kuantitatif dan karakter kualitatif tongkol.
jagung. Sehingga dapat diketahui tingkat Analisis data menggunakan rumus
variasi atau keragaman genetik pada masing- rata-rata (mean) dan standar deviasi serta diuji
masing varietas jagung dengan melihat lanjut dengan menggunakan program MVSP
karakter morfologi tongkol jagung. (Multivarian Statistical Package). Data diedit
Penelitian ini bertujuan untuk dengan program PFE (Program file Editor)
mengetahui variasi genetik jagung berdasarkan dan dendogram dikonstruksi berdasarkan
karakter fenotifik tongkol yang dibudidayakan Clustering yang menunjukkan hubungan
di Desa Jono Oge. kekerabatan antar varietas atau hubungan
individu antar varietas menggunakan
METODE PENELITIAN algorithm UPGMA. Indeks similaritas
dihitung menggunakan metode Simple
Metode penelitian yang digunakan Matching Coeficient yang ada pada MVSP.
adalah metode deskriptif, yaitu suatu
penelitian yang dilakukan dengan tujuan untuk HASIL DAN PEMBAHASAN
memberikan gambaran atau deskripsi tentang
suatu keadaan secara objektif (Aditya, 2009). 1. Karakter Kuantitatif
Penelitian deskriptif tidak menuntut adanya Hasil pengukuran pada karakter
perlakuan atau manipulasi, karena gejala dan kuantitatif (Tabel 4.1) selalu muncul dengan
peristiwanya telah ada dan peneliti tinggal nilai yang berbeda-beda, walaupun terkadang
mendeskripsikannya (Soendari, 2013). ada juga yang sama namun hal ini jarang
Penelitian ini dilaksanakan pada bulan dijumpai. Hasil pengukuran tersebut jika
Desember 2012 sampai Februari 2013 dengan dibandingkan dengan sifat aslinya (Nuning
lokasi penelitian di Kebun Rakyat Desa Jono dkk 2007, Adnan 2010 dan Anton 2010),
Oge, Kecamatan Biromaru, Kabupaten Sigi, kebanyakan karakter tersebut memiliki nilai
Propinsi Sulawesi Tengah. Teknik yang sesuai atau tidak berbeda jauh antara nilai
pengambilan sampel secara acak. Alat dan hasil penelitian dengan sifat aslinya.
bahan yang digunakan dalam penelitian yaitu: Keberagaman hasil nilai tersebut
cangkul, tugal, ember, parang/sabit, jangka menandakan bahwa sifat kuantitatif tidak
sorong, mistar/ meteran, patok sampel, hanya dikendalikan oleh satu gen, melainkan
kamera, label, alat tulis menulis, kalkulator, 6 oleh banyak gen sebagai penyusun
varietas jagung (varietas Bonanza, Lamuru, fenotipenya. Karena itu, sifat kuantitatif sering
Octora, Kumala, Jaya 2 dan Pulut lokal), disamakan dengan sifat poligenik. (Kusumah,
pupuk, air dan racun marsal 200cc. 2012). Penampakan suatu tanaman atau
Prosedur penelitian dimulai dengan fenotipe ditentukan oleh interaksi genotip
pengoleksian benih dari beberapa varietas dengan faktor lingkungan (Jusuf, 1998).
yang diperoleh dengan metode jelajah di
wilayah kota Palu. Selanjutnya pengolahan 2. Karakter kualitatif
tanah dilakukan dengan pembajakan dan Hasil pengamatan pada karakter
pencangkulan. Benih ditanam pada bedengan kualitatif (Tabel 4.2) menunjukan adanya
dengan kedalaman 3-5 cm (Barmin, 2001). karakter yang relatif sama antar varietas,
Masing-masing varietas ditanam dalam satu namun ada juga yang berbeda.
bedengan dengan jarak tanam 80x20 cm Perbedaan dan persamaan pada
dengan 1 tanaman/lubang (Siswadi, 2006). masing-masing karakter kualitatif tersebut
Jarak masing-masing bedengan yaitu 80 cm ditentukan oleh masing-masing gen dengan
dan jarak antar varietas 100 cm. Pemupukan melibatkan pengaruh lingkungan yang ada.
dilakukan sebanyak 3 tahap, yaitu: saat Berdasarkan fenomena yang ada, dapat
penanaman, saat berusia 4 minggu dan saat disimpulkan bahwa timbulnya karakter yang
berusia 8 minggu (Pracaya dan Kahono, 2010). sama antar varietas kemungkinan disebabkan
Pengukuran dan pengamatan dilakukan saat oleh adanya gen penyusun fenotip yang sama
tanaman berumur 8 minggu, 9 minggu dan 10 dan dipengaruhi oleh lingkungan sehingga
minggu. Pengamatan dilakukan sebanyak 5 memunculkan fenotip yang relatif sama.
kali ulangan tiap pengamatan. Untuk melihat Begitu pula dengan timbulnya perbedaan
8 Diameter janggel (cm) 3,07 ± 0,31 3,14 ± 0,30 3,17 ± 0,31 3,10 ± 0,28 3,18 ± 0,27 3,05 ± 0,30
9 Diameter rakhis (cm) 1,28 ± 0,08 2,31 ± 0,07 2,33 ± 0,08 2,12 ± 0,08 2,13 ± 0,07 1,53 ± 0,07
10 Indeks janggel/ rakhis (cm) 2,39 ± 0,59 1,36 ± 0,55 1,36 ± 0,55 1,46 ± 0,61 1,49 ± 0,61 1,49 ± 0,61
16,00 ± 17,00 ± 18,00 ± 16,00 ± 18,00 ±
11 Jumlah baris biji (baris) 2,25 2,05 1,45 2,25 1,45
13,00 ± 1,05
35,00 ± 39,00 ± 39,00 ± 37,00 ± 40,00 ±
12 Jumlah biji per baris (biji) 4,52 4,21 4,21 4,01 4,33
31,00 ± 4,01
Varietas
No. Karakter 1 2 3 4 5 6
Octora Lamuru Jaya 2 Kumala Bonanza Pulut lokal
Warna tangkai
1 hijau hijau hijau hijau hijau hijau
tongkol
2 Penutupan kelobot sedang sedang bagus bagus bagus bagus
3 Warna kelobot hijau tua hijau tua hijau tua hijau tua hijau tua hijau muda
4 Kerusakan tongkol sedikit sedikit tidak ada tidak ada tidak ada tidak ada
panjang & panjang & panjang &
5 Bentuk tongkol silindris silindris silindris
silindris silindris silindris
6 Warna janggel putih putih Putih putih putih coklat
Sudut keberadaan
7 kecil kecil Kecil kecil kecil kecil
tongkol
semi
8 Tipe biji mutiara mutiara semi mutiara mutiara mutiara
mutiara
9 Warna biji kuning kuning Kuning putih kuning putih
10 Susunan baris biji teratur lurus Lurus lurus lurus teratur
Penutupan biji pada
11 full full Full full full tidak full
ujung tongkol
Bentuk permukaan
12 datar bundar Bergerigi datar bundar bundar
butir teratas
3. Pengujian Variasi dengan MVSP yang pertama antar varietas dan kedua
(Multivarian Statistical Package) melibatkan semua sampel pada masing-masing
Berdasarkan data kuantitatif dan varietas jagung yang diteliti.
kualitatif tongkol jagung, secara kasat mata Hasil analisis dendogram,
dapat dilihat bahwa masing-masing varietas menunjukkan bahwa terdapat keragaman antar
jagung menunjukkan variasi atau keragaman 6 varietas jagung yang mana keenam varietas
genetik antar varietas. Selanjutnya, untuk jagung membentuk 5 klaster (Gambar 1.).
memperkuat hasil (Tabel 1. dan Tabel 2.), Setiap klaster akan menunjukkan tingkat
diamati melalui pengujian dengan keragaman pada masing-masing varietas, hal
menggunakan software MVSP yaitu dengan ini diperkuat oleh adanya indeks similaritas
dilakukannya penghitungan koefisien pada matriks koefisien gabungan (Tabel 3.)
similaritas dan analisis klasifikasi bertingkat. yang menunjukkan nilai persamaan pada
Pengujian MPSV dilakukan dua kali yakni masing-masing varietas.
Hubungan terdekat terjadi pada varietas yang telah melewati proses rekayasa
Bonanza dan Jaya 2 yang terletak pada Node persilangan, sehingga varietas Pulut lokal akan
1, kedua varietas ini merupakan varietas yang tetap memunculkan fenotip aslinya sedangkan
banyak memiliki persamaan karakter baik kelima varietas lainnya telah memiliki
kuantitaif maupun kualitatif dengan didukung perpaduan fenotip dari dua induk yang
oleh Indeks similaritas tertinggi yaitu 0,868 disilangkan.
atau 86,80 %. Semakin tinggi nilai indeks Analisis keragaman tanaman jagung
similaritas, maka semakin dekat hubungan dalam penelitian ini juga melibatkan seluruh
kekerabatan, bilamana indeks similaritas lebih sampel yang digunakan yaitu untuk menguji
besar dari 70% menggambarkan bahwa kestabilan dendogram sebelumnya (Gambar
variteas yang dibandingkan memiliki 1.) dan untuk mendeteksi perbedaan/variasi
kesamaan yang dekat (Singh, 1999), sehingga antar individu dalam satu varietas.
variasi genetik semakin rendah, hal ini Berdasarkan analisis dendogram
disebabkan oleh tingginya persamaan dan seluruh sampel (Gambar 2.), masing-masing
kemiripan karakter pada varietas tersebut, individu pada setiap varietas tetap
karena semakin tinggi persamaan karakter mengelompok berdasarkan varietasnya dengan
antar varietas, maka semakin rendah tingkat indeks similaritas 1 atau 100% (Tabel 2.), hal
keragaman/ variasinya. Persamaan dan ini menegaskan bahwa variasi yang terjadi
kemiripan karakter pada varietas Bonanza dan pada masing-masing individu tetap tidak akan
Jaya 2 terutama terdapat pada karakter panjang mempengaruhi pengelompokan pada
tangkai tongkol, diameter tangkai tongkol, varietasnya, hal ini dimungkinkan karena gen
bentuk tongkol, diameter tongkol, diameter sebagai salah satu penyusun fenotip adalah
janggel, tipe biji dan jumlah biji perbaris. sama sehingga setiap individu akan tetap
Varietas Pulut lokal merupakan varietas mengelompok pada varietasnya. Namun,
yang memiliki nilai kesamaan paling rendah terdapat variasi pada varietas Lamuru dan
dengan indeks similaritas 0,628 atau 62,80 %, Pulut lokal dengan membentuk cabang dengan
dibanding dengan kelima varietas lainnya. indeks similaritas 0,982 atau 98,20% (Tabel
Nilai tersebut menandakan bahwa varietas 4.) yang berarti bahwa indeks similaritas Pulut
Pulut lokal berkerabat paling jauh dibanding lokal 5 sangat mendekati nilai 1 %, sehingga
dengan varietas-varietas lainnya, sehingga masih tetap tergabung pada kelompok varietas
tingkat variasi pada pulut lokal sangat tinggi Pulut lokal. Begitu juga yang terjadi pada
dibanding dengan kelima varietas lainnya. Lamuru 5. Pengaruh lingkungan atau mutasi
Jauhnya kekerabatan Pulut lokal ini gen dapat juga terjadi sehingga dapat merubah
kemungkinan disebabkan karena jagung Pulut penampakan pada fenotip, hal seperti ini
lokal merupakan jagung lokal yang belum dimungkinkan yang terjadi pada varietas
mengalami rekayasa persilangan, sedangankan lamuru dan Pulut lokal, sehingga ada 1
kelima varietas lainnya merupakan jagung F1 individu yang agak berbeda.
Berdasarkan penelitian ini, karakter Anton, A. (2010). Jagung Manis Varietas Bonanza.
fenotipik sangat baik digunakan dalam Univ. Sumatera Utara: PT East West Seed
mengidentifikasi dan menganalisis variasi Indonesia.
antara 6 varietas tanaman jagung. Sebagaimana
Allard, R. W. (1960). Principles of Plant Breeding.
yang telah diungkapkan Yatim (1986), bahwa
New York: John Wley and Sons, Inc:
salah satu cara untuk mengetahui ragam genetik
adalah dengan mempelajari ragam fenotipnya. Barmin. (2001). Budidaya Tanaman Pangan (padi
Variasi tersebut merupakan variasi berdasarkan dan Jagung). Jakarta Selatan: CV Ricardo.
karakter fenotip sehingga hasil yang diperoleh
juga merupakan gambaran hasil dari keadaan Jusuf, M. (1998). Genetika I: Struktur dan Ekspresi
fenotip di lapangan. Penelitian ini merupakan Gen. Bogor: Institut Pertanian Bogor.
penelitian sederhana terhadap variasi dan
keanekaragaman antara varietas tanaman Kasryno, F., Effendi P, Suyamto & Made O.A.
jagung yang diperoleh dari hasil pengamatan (2007). Gambaran Umum Ekonomi Jagung
dan pengukuran terhadap karakter morfologi Indonesia. [Online]. Tersedia http://pustaka
tanaman. .litbang.deptan.go.id/bppi/subyek_konten_j
agung.php? subyekID=F. [2 November
2012].
KESIMPULAN dan SARAN
Kusumah, D. A. (2012). Pewarisan Karakter
Kesimpulan Kuantitatif. [Online]. Tersedia http://
taniyoook.blogspot.com/2012/06/pewarisan
(1) karakter kuantitatif dan kualitatif dari -karakter-kuantitatif.html. [15 Mei 2013].
keenam varietas jagung meliputi varietas
Octora, Lamuru, Kumala, jaya 2, Bonanza dan Lusiana, S. 2012. Pertumbuhan dan Perkembangan.
Pulut lokal adalah bervariasi. (2) Hubungan [Online]. Tersedia http://sumberajaran.
kekerabatan antar varitas terdekat terjadi pada blogspot.com/2012/06/pertumbuhan-dan-
varietas Jaya 2 dan Bonanza dengan indeks perkembangan. html. [28 Juni 2012].
similaritas 0,868 atau 86,80 % dan hubungan Mangoendidjojo, W. (2007). Dasar-Dasar
kekerabatan paling jauh adalah dengan varietas Pemuliaan Tanaman. Yogyakarta: Penerbit
Pulut lokal dengan indeks similaritas 0,628 atau Kanisius.
62,80 %. (3). Variasi pada varietas Lamuru dan
Pulut lokal ada yang membentuk cabang Nuning A.S., Syafruddin, Roy E. & Sri S. (2007).
tersendiri akan tetapi kedua varietas ini tetap Morfologi Tanaman dan Fase
merupakan varietas yang sama sesuai dengan Pertumbuhan Jagung. [Online]. Tersedia
kelompoknya karena memiliki indeks http://pustaka.litbang.deptan.go.id/bppi/sub
yek_konten_jagung.php?subyekID=C. [2
similaritas yang rendah (98,20 %).
November 2012].
Saran Pracaya & Kahono P.C. (2010). Kiat Sukses
Budidaya Palawija. Kalimantan Barat: PT.
Untuk memperkuat hasil penelitian ini, Maraga Borneo Tarigas.
diharapkan adanya penelitian lebih lanjut
dengan bukti taksonomi lainnya seperti Siswadi. (2006). Budidaya Tanaman Palawija.
fisiologi, anatomi, kimiawi dan genetika Yogyakarta: PT Citra Aji Pratama.
molekuler mengenai hubungan kekerabatan
filogenik. Singh, G. (1999). Plant Systematics Science
Publisher, New Hampshire: Inc.
DAFTAR PUSTAKA Soendari, T. (2013). Penelitian Deskriptif. [Online].
Tersedia http://file.upi.edu/Direktori/fip/
Aditya, S. (2009). Penelitian Deskriptif. [Online]. jur._pend._luar_biasa/195602141980032-
Tersedia www.pdffactory.com./http:// tjutju_soendari/Power_Point_ Perkuliahan/
adityasetyawan.files.wordpress.com/2009/1 Metode_ppkkh/Penelitian__Deskriptif.ppt_
0/penelitian-deskriptif1.pdf. [11 Mei 2013]. %5BCompatibility_Mode%5D.pdf. [11
Mei 2013].
Adnan A. M, Costance R. & Zubachtirodin. (2010).
Deskripasi Varietas Unggul Jagung.
Maros: Balai Penelitian Tanaman Serealia.
Suryati, D. (2008). Penuntun Pratikum Genetika Tracy, W. F. (1994). Sweet corn. In: A. R. Halleuer
Dasar. Bengkulu: Lab. Agronomi (Ed.) Specialty corns. USA: CRC Press Inc.
Universitas Bengkulu.
Yatim, W. (1986). Genetika. Edisi ke-5. Bandung:
Suryo. (2004). Genetika Strata 1 Cet. 10. Tarsito.
Yogyakarta: Gajah Mada University Press.