Potential pharmacological applications of enzymes associated with

bacterial metabolism of aromatic compounds

Makalah ini dibuat untuk memenuhi tugas Review Jurnal pada mata kuliah Mikrobiologi
Industri

Disusun Oleh:

Rizki Romadhon 11151020000009

PROGRAM STUDI FARMASI

FAKULTAS KEDOKTERAN DAN ILMU KESEHATAN

UIN SYARIF HIDAYATULLAH JAKARTA

2017
 KATA PENGANTAR

Alhamdulillah, puji dan syukur saya panjatkan ke hadirat Allah swt, karena atas ridho
dan limpahan ilmu-Nya, saya dapat menyelesaikan Makalah Review Jurnal tentang
“Potential pharmacological applications of enzymes associated with bacterial
metabolism of aromatic compounds”. Solawat serta salam semoga tercurah kepada Nabi
Muhammad saw. Karena atas jasa beliaulah kita menjadi masyarakat yang beradab dan
berilmu pengetahuan.

Makalah Review yang ada di hadapan kalian ini merupakan tugas mikrobiologi
indusri, tujuan makalah ini agar kalian dapat belajar dan memahami tentang mikrobiologi
industry penerapannya dalam ilmu farmasi. Penyajian makalah ini sangat lengkap, dimulai
dengan gambar dan wacana yang disajikan dengan bahasa yang komunikatif serta mudah
dipahami. Pada akhir dari makalah ini terdapat kesimpulan dari hasil makalah ini.

Kebenaran dan kesempurnaan adalah milik Allah swt, semata. Penyusun menyadari
bahwa makalah ini masih jauh dari sempurna. Apabila ada kesalahan kata dari penyusun,
saya mengucapkan mohon maaf kepada pembaca.

Selamat belajar, semoga bermanfaat.

Jakarta, …. / .… / 2017

Penyusun

i
 DAFTAR ISI

KATA PENGANTAR ..............................................................................................i

DAFTAR ISI........................................................................................................... ii

BAB I LATAR BELAKANG .................................................................................. 3

BAB II METODE ....................................................................................................8

BAB III HASIL DAN PEMBAHASAN .................................................................9

BAB IV KESIMPULAN DAN SARAN ............................................................... 15

DAFTAR PUSTAKA ............................................................................................ 16

ii
 BAB I
LATAR BELAKANG
Bakteri fototrofik anoksigenik sebaiknya tumbuh dengan metabolisme fotoheterotrofik
dengan zat organik sebagai donor elektron selama aktivitas fotosintesisnya. Namun,
bakteri non-sulfat ungu bermotif phototrophic (PNSB)1 termasuk dalam kelompok
fisiologis fotosintesis prokariota, dan didistribusikan dalam empat filum yang berbeda
yang mampu tumbuh dalam kondisi anaerobik dan melakukan fotosintesis tanpa
pembebasan oksigen. Bakteri ini tersebar luas di habitat anoksik dari berbagai ekosistem
(Bertoldi et al., 1999). Bakteri ini kekurangan fotosistem-II dan melakukan fotosintesis
tanpa pembebasan oksigen. Mereka memiliki fleksibilitas metabolik dan bergantung
pada donor elektron senyawa sulfur, hidrogen dan senyawa organik, yang semakin
berkurang dibanding air. Bakteri non sulfur ungu mampu memetabolisme berbagai
senyawa organik alifatik dan berguna dalam menginduksi rute metabolik sebagai respons
terhadap perubahan gizi di lingkungan. Katabolisme L-fenilalanin / L-tirosin terjadi
melalui beberapa rute aerobik atau anaerobik (Rother et al., 2002). Katabolisme L-
fenilalanin / L-tirosin oleh bakteri ini dilakukan oleh jalur perifer sehingga terbentuk
homogenitas. (Gambar 1).
Homogensitatedioxygenase terlibat dalam pembukaan dari cincin aromatic dari
homogenitas produksi maleylacetoacetate dan fumarylacetoacetate. Substrat ini
dihidrolisis oleh hidrolase spesifik membentuk fumarat dan acetoasetat. Dalam
fotosintesis bakteri, katabolisme L-tirosin juga penting sejak homogentisate adalah
prekursor dalam biosintesis pigmen fotosintesis.
Langkah utama dalam katabolisme L-fenilalanin / L-tirosin adalah transaminasi atau
proses amonia lyase. Di Rhodobactercapsulatus dan Pseudomonas Putida, L- fenilalanin
dan L-tirosin diubah menjadi2 fenilpiruvat dan 4-hidroksipiruvat yang tidak spesifik
aromatik aminotransferase. Umumnya, L-fenilalanin diubah menjadi L-tirosin dari
adanya fenilalanin hidroksilase (Copeland et al., 2005). Selain itu, asam trans-cinnamic
dan asam phydroxycinnamic adalah produk dari katabolisme L-fenilalanin ketika reaksi
dikatalisis oleh L-phenylalanine / L-tirosin amonia lyase (PAL / TAL; EC 4.3.1.25)
(Kevin et al., 2006). Di R. capsulatus dan Rhodobactersphaeroides, asam p-
hidroksikinamat biosintesis dari L-tirosin telah dikatalisis oleh TAL (Duran et al., 1983).
3,4-dihidroksifenilalanin (DOPA) biosintesis dari L-tirosin. Beberapa methanogen
mengubah L-tirosin menjadi p-cresol dan fenol. Pengolahan L-phenylpyruvate terjadi
melalui fenil asetaldehida menyebabkan pembentukan fenil asetat, fenil Glyoxylate yang

3
berpuncak pada biosintesis benzyl CoA (Gambar 1) (Lee et al., 2004; Herrera dan
Ramos, 2007). Amonia-lyases mengkatalisis deaminasi asam amino. Yang dipelajari
dengan baik enzim L-fenilalanin / L-tirosin amonia lyase (PAL / TAL) dan L-histidine
amonia lyase (HAL). Deaminasi tirosin menjadi asam p-hidroksikinamat (PHCA)
dikatalisis oleh enzim PAL / TAL. Fenilalanin amonia lyase (PAL; EC 4.3.1.24) telah
ditemukan di kedua tanaman yang lebih tinggi dan beragam mikroorganisme. Enzim ini
bifungsional, menggunakan tirosin juga sebagai substrat, dan oleh karena itu juga disebut
TAL. Diantara berbagai enzim PAL / TAL mikroba (Samaha et al., 1997), enzim dari
jamur, Rhodotorulaglutinis (RgTAL) memiliki aktivitas TAL tertinggi. amonia lyase
mengandung asam amino "Ala, Ser, Gly" motif (Tabel 1) yang mengalami siklisasi
autokatalitik menghasilkan 3,5-dihidro-5-metilidena-4H-imidazol-4-satu (MIO) dan
bertindak sebagai elektrofil katalitik eliminasi amonia dan non-asam β-proton dari
substrat asam amino (Samaha et al., 1997). Mekanisme ini telah didukung oleh kristal
sinar-X struktur Pseudomonas-HAL dan Rhodotorulaglutinis-PAL (Juana et al., 1997).
bahwa sebagian besar enzim PAL dan TAL sangat terhambat oleh produksinya.
Pada tanaman, enzim ini mengkatalisis reaksi pertama dari jalur fenilpropanoid dan
mengubah fenilalanin menjadi Asam trans-cinnamic (CA). Selanjutnya hidroksilasi asam
transkinamik menghasilkan asam para-hidroksikinamat (PHCA), yang berperan penting
dalam produksi beragam tanaman sekunder. PAL dari beberapa bakteri dan tanaman
deaminasi fenilalanin untuk trans-cinnamic acid (CA), yang akhirnya dikonversi ke
metabolit sekunder seperti lignin, flavonoid dan coumarin di tanaman dan beberapa
senyawa antibiotic pada bakteri. Fenilalanin rekombinan manusia Amonia lyase telah
dieksplorasi untuk pengobatan Fenilketonuria (PKU) dengan cara metabolisme kelebihan
Fenilalanin (Li et al., 2003). Enzim ini sangat selektif untuk L-tirosin dan mensintesiskan
asam dehidroksikinamik (asam 4-koumarat, pHCA) sebagai Protein co-factor atau
prekursor antibiotik Mikroorganisme. Enzim TAL dari Bakteri fotosintetik R.
sphaeroides telah diidentifikasi, dikloning dan secara fungsional diekspresikan ke
Escherichia coli. Asam 4-koumarat berfungsi sebagai antibiotic Prekursor dalam
mikroorganisme dan sebagai kofaktor untuk Sintesis protein larut air sebagai protein
kuning foto aktif (PYP) di Indonesia : Ectothiorhospirahalophilia,
Rhodospirillumsalexigens dan Chromatiumsalexigenes. Banyak kelompok penelitian
melaporkan bahwa, teknik metabolisme TAL flavonoid dan jalur biosintesis resveratrol
membutuhkan asam 4-coumaric sebagai prekursor (Regina et al., 2004). Sejak TAL
membentuk asam 4-koumarat langsung dari L-tirosin dan menggunakannya dalam sistem

4
ekspresi heterolog, ia perlu mengekspresikan asam PAL dan 4-koumarat Hidroksilase,
membran terikat sitokrom P450 untuk konversi L-fenilalanin sampai asam 4-koumarat.
Studi struktural dan fungsional TAL mengidentifikasi residu histidin di tempat aktif,
yang penting untuk mengendalikan preferensi substrat untuk L-tirosin di atas
Lphenylalanine (Bartling et al., 1994). Fenilalanin Ammonia lyase dan tirosin amonia
lyase telah terjadi dalam beberapa mikroorganisme dengan kemungkinan keterlibatan
dalam biosintesis metabolit sekunder mirip dengan tanamannya (Bartling et al., 1994).
Senyawa ini menarik karena potensinya digunakan sebagai bahan awal untuk bahan
kimia dan enzimatik konversi ke berbagai macam komersial berharga Biomekanik
termasuk, rasa, wewangian, Obat-obatan, biokosmetika dan metabolit sekunder lainnya
(Hoshino et al., 1990). Dua potensi Rute mikroba untuk biosintesis pHCA dari Asam
amino aromatik telah ditampilkan (Gambar 1). Reaksi seperti itu, enzim ini telah
ditetapkan sebagai Tirosin amonia lyase dan produk reaksi dari asam 4- koumarat, Ada
laporan tentang identifikasi, Karakterisasi, kloning dan ekspresi fungsional TAL dari
bakteri fototrofik anoksigenik di E. coli. Itu PAL / TAL telah diidentifikasi pada R.
capsulatus (terpadu Nomor akses genomik RRC01844) R. sphaeroides (Nomor aksesi
genomik terpadu YP-355075) Dan di Saccharothrixespanaensis (aksesi gen Gene Nomor
ABC88669) (Tabel 1). Urutannya adalah Homolog untuk menanam PAL dari
Petroselinumcrispum (CAA57056, 30% identik dan 48% serupa) (Hoshino et Al., 1990).
Namun, ia memiliki lebih banyak homologi untuk bakteri Histidin amonia lyase (HAL;
EC 4.3.1.3) dari Pseudomonas putida (A35251, 36% identik dan 54% Serupa). Asam
amino amonia lyases diperkirakan Gunakan dehidroalanin sebagai elektrofil dalam reaksi
Mekanisme namun struktur tiga dimensi PAL Dan HAL menunjukkan bahwa enzim ini
memiliki kelompok MIO3 untuk aktivasi substrat Senyawa seperti Fenil piruvat, asam
indol piruvat dan keto lebih dari enam atom karbon secara rantai lurus berfungsi sebagai
substrat untuk dekarboksilase, dan langkah selanjutnya adalah pembentukan fenil
Asetaldehida dari fenil asetat, reaksi Dikatalisis oleh dehidrogenase dimana NAD ±
adalah Kofaktor Phenyl acetate adalah zat antara yang dikenal Dalam metabolisme
mikroba berbagai aromatic Substrat termasuk fenilalanin (Wolfram dan Oliver, 2002).
Thauera aromatik dan Rhodobacter sp. RHA1, fenil asetat adalah Teroksidasi di bawah
kondisi anoksik menjadi benzyl CoA melalui phenyl acetyl CoA (Wolfram dan Oliver,
2002). Phenyl acetyl CoA adalah terbentuk dari fenil asetat dengan fenil spesifik Asetat
CoA ligase baik dalam aerobik maupun Jalur anaerobik (Chen et al., 2005).
Fenilgoksoksilat dioksidasi menjadi benzil CoA oleh Fenilglikoksilat: akseptor

5
oksidoreduktase Enzim kompleks, yang akhirnya transfer Elektron ke NAD ±
Deaminases adalah kelompok Enzim yang mengkatalisis eliminasi ammonia Dari
pengganti organik dan memainkan yang penting Peran dalam siklus nitrogen. Asam L-
amino mikroba Deaminases yang diidentifikasi sejauh ini meliputi: L-tirosin,
Lphenylalanine, Dan L-arginin. Dalam rute, Asam 4-koumarat terbentuk dari L-
fenilalanin dalam dua langkah dimana PAL menghapus (pro3S) Hidrogen dan NH3 dari
fenilalanin untuk menghasilkan Asam trans-cinnamic (CA). Pada langkah selanjutnya,
Sitokrom P450 enzymesystem hydroxylates CA Untuk menghasilkan asam 4-koumarat.
Enzim PAL / TAL paling alami4 dari tanaman atau sumber mikroba Lebih memilih
untuk menggunakan L-fenilalanin daripada L-tirosin sebagai Substratnya Selain
kemampuannya untuk mengubah L-phenylalanine Untuk asam trans-cinnamic, juga
menerima Ltyrosine, Tamate, serin dan sitosin sebagai substrat. Berpacu Pada
mekanisme ini, selanjutnya diklasifikasikan sebagai: Oksidatif, reduktif dan hidrolitik
deaminasi (Nieminen et al., 2002). 3,4- dihidroksifenilalanin Dekarboksilase yang
dimurnikan dari mutan E. coli adalah Enzim homodimerik pyridoxal- Enzim 5-fosfat
Selama katalisis, ada juga Generasi amina aromatik. DOPA dekarboksilase
Mengkatalisis tidak hanya dekarboksilasi L-aromatik Asam amino tapi juga reaksi
samping termasuk halftransamination Asam amino aromatik dan oksidatif Deaminase
amina aromatik. Dekarboksilasi asam amino L-aromatik adalah yang utama
Reaksi dimana enzim telah diidentifikasi Mengkatalisis reaksi samping yang bersifat
oksidatif Deaminasi amina aromatik dan setengahnya Transaminasi asam amino
aromatik disertai oleh Sebuah reaksi spherler pictet. Kekhususan reaksi DOPA
dekarboksilase tidak berubah bila ada atau tidak adanya oksigen Enzim ini mengkatalisis
reaksi Antara 3, 4-dihidroksifenilalanin dan 2-oksoglutarat Untuk membentuk 3, 4-
dihidroksifenil piruvat asam dan L-glutamat. Enzim ini dari hewan Dan bakteri yaitu
Alcaligenesfaecalis IAM 1015 dan Enterobacter cloacae. Dekarboksilase fenilpiruvat
(EC 4.1.1.43) dan fenil asetaldehida dehydrogenase Enzim mengkatalisis reaksi fenil
piruvat menjadi Fenil asetat melalui fenil asetaldehida dan juga Mengkatalisis
dekarboksilasi non-oksidatif fenil Piruvat dimana diphosphothiamin (DPT) dan Mg2 ±
bertindak sebagai Kofaktor Sedangkan berbagai macam transformasi kimia Terkait
dengan degradasi aerobik L-triptofan dan Sebagian besar gen dan enzim terkait terlibat
Di dalamnya telah didominasi karakteristiknya Eukariota, relatif sedikit yang diketahui
tentang Jalur ini pada bakteri (Gambar 2). E. coli dan banyak lainnya Bakteri, degradasi
non-oksidatif dari L-triptofan ke Indol, piruvat dan amonia terjadi oleh piridoksal 5-

6
Triptofanase bergantung pada phospahte (Tryptophan indolelyase EC 4.1.99.1).
Degradasi oksidatif Triptofan eksogen melalui jalur anthranilate Telah terlibat sebagai
sumber tunggal karbon dan nitrogen. Gen mengkodekan kynureninase (KYN, EC
3.7.1.3) telah diklon dari Pseudomonas fluorescens Dan enzim yang sesuai homolog
dengan eukariotik KYN telah dicirikan. Triptofan 2, 3- Aktivitas dioksigenase (EC
1.13.11.42) telah dijelaskan Pada beberapa bakteri dan gen yang sesuai telah terjadi
Diidentifikasi Enzim fenilalanin hidroksilase mengubah Fenilalanin sampai tirosin.
protein yang mengandung zat besi Yang membutuhkan co-faktor, (6R) -L-eritro-5, 6, 7,
8- Tetrahydrobiopterin (pterine) (Schneider et al., 1997). Tyrosine / fenilalanin
aminotransferase (EC 2.6.1.5) Dari Bacillus caldolyticuscatalyzes konversi dari Tirosin
menjadi asam 4-hydroxyphenylpyruvic dan juga Fenilalanin sampai fenilpiruvat.
Transformasi dari 4-hydroxyphenylpyruvate ke homogentisate dikatalisis Oleh 4-
hydroxyphenylpyruvate dioxygenase. DOPA adalah Disintesis f l-tirosin
Erwiniaherbicola dalam Reaksi oksidasi satu langkah yang dikatalisis oleh tirosin
phenollyase (EC 4.1.99.2). Pada E. coli, lyase histidin ammonia Enzim tampaknya ada di
mana-mana (Kodach et al., 2006). enzim berwarna merah, yang mengubah histidin
menjadi Asam urocanic dan amonia. Enzim ini mengkatalisis Eliminasi non-oksidatif
dari gugus α-amino dari Histidin dan erat kaitannya dengan tanaman Enzim, fenilalanin
amonia lyase dan selanjutnya Dimetabolisme menjadi glutamat (Srinivas et al., 2002). Ini
Didistribusikan secara luas di tanaman dan bakteri yang lebih tinggi. Pseudomonas
fluorescens, Pseudomonas aerusinosa, Pseudomonas putida, Pseudomonas testosteron
dan Aerobacteraerogenes, jamur filamen dan ragi. Itu Seluruh urutan genom bakteri
fotosintesis Enzim Rhodobactersphaeroides menunjukkan adanya Dari kemungkinan
amina lyase histidin.

7
 BAB II
METODE

Tryptophan amonia lyase (Kumavathet al., 2015) Menambah pengetahuan penelitian

tentang metabolisme triptofan ke daftar amonia lyase (L-fenilalanin Amonia lyase (PAL;
EC 4.3.1.24), ammonia tiroksin Lyase (TAL; EC 4.3.1.23), PAL / TAL (EC 4.3.1.25)
Lserine Amonia lyase (SAL; EC 4.3.1.17) dan L-histidin7 Amonia lyase (HAL; EC
4.3.1.3) untuk pemurnian dan karakterisasi enzim triptofan amonia lyase. Tryptophan
amonia lyase itu Terisolasi, dimurnikan dan dicirikan sebagai ~ 225 KDaheterotetramer
Kebaruan WAL dikonfirmasi Melalui analisis sidik jari MALDI-TOF (MS / MS). Di
antara keempat subunit tersebut, subunit 55 kDa memiliki ~ 54% Skor dengan protein
hipotetis di Rhodobactersphaeroides 2.4.1 sedangkan sisanya tiga Memiliki kecocokan
yang kurang signifikan dalam database (NCBS, MSDB Dan SwissPort), urutan N-
terminal parsial dari WAL Dicocokkan dengan kemungkinan amonia lyase histidin
Rhodobactersphaeroides 2.4.1.

8
 BAB III
HASIL DAN PEMBAHASAN
Tryptophan indole-lyase adalah piridoksal-5-fosfat Enzim dependen ditemukan pada
banyak bakteri. mengkatalisis Dekomposisi hidrolitik yang reversibel dan α, β- Eliminasi
L-triptofan yang menyebabkan pembentukan indol, Piruvat dan amonia. Tryptophanase
adalah Protein homotetrametic dimana masing-masing monomer terikat Satu molekul
PLP, dan membentuk sebuah aldimine terikat Residu lisin (Srinivas et al., 2002). Telah
ditunjukkan Bahwa gen tnaA yang mengkodekan triptofan diperlukan Untuk
pembentukan biofilm di E. coli. Telah diklon dari virulen Haemophilesinfluenzae, dan
Produksi indole telah berkorelasi dengan kemampuannya menyebabkan beberapa
penyakit menular yaitu. Septikemia, epiglotitis dan meningitis. Karena itu,
Tryptophanase adalah target yang tepat untuk elaborasi Penghambatan efisien, dan dapat
digunakan untuk pengobatan Meningitis Tryptophan aminotransferase (EC 2.6.1.27)
Enzim termasuk dalam transferase, dan Mengkatalisis konversi L- triptofan menjadi
indole-3- Asam piruvat dengan adanya 2-oksoglutarat (Gambar 3) Dan pyridoxal-5-
phasphate pada Enterobacter cloacae (Tabel 1). Pada tanaman dan Binatang. Di jalur
asam anthranilic, triptofan adalah Pertama kali dikonversi menjadi formilkynurenine oleh
enzim, Tryptophan 2,3-dioxygenase dan yang terakhir terlibat dalam Pembentukan
kynurenin dan asam antraksilat oleh Kynurenineformidase (Gambar 2). Asam Indole-3-
piruvat Dekarboksilase mengkatalisis konversi indole-3- Asam piruvat sampai indole-3-
asetaldehida dan Terisolasi dari Azospirillumbrasilense dan Paenibacillspolymyxa E681
(Gambar 2).
Asam Indole-3-piruvat juga bisa diubah menjadi indol Asetaldehida non-enzimatik
(Panke et al., 2004). Ltryptophan Juga diubah menjadi indole-3-acetaldehyde Dan IAA
melalui tryptapmine perantara (Gambar 2). Metabolisme awal triptofan menjadi
tryptamine dikatalisis Dengan tryptophan decarboxylase diikuti dengan konversi
Tryptamine ke indole-3-acetaldehyde dengan tryptamine Oksidase. Indole lactate
dehydrogenase (EC 1.1.1.110) Enzim telah diisolasi dari Clostridium saprogenik.
Mengkatalisis konversi asam indole-3-piruvat ke Asam indol-3-laktat, reaksi reversibel
dan NAD ± Digunakan sebagai kofaktor Indole-3-asetonitril diubah menjadi IAA
dinitrilase (Gambar 3). Enzim ini Telah diidentifikasi di tanaman yang lebih tinggi
Cruciferae, GramineaeMusaceae dan juga mikroba (Klebsiellaozonae,
Alcaligenesfaecalis dan Rhodococcusrhodochrous). Nitril bisa dihidrolisis Langsung ke
asam yang sesuai diNitrilase tertentu atau melalui proses dua langkah yang melibatkan

9
Konversi awal ke amida oleh nitril hidratase diikuti Dengan hidrolisis amida menjadi
asam oleh amidase atau oleh Acetamide hydrolase (Gambar 2) (Koga, 1995). Indole-3-
Jalur biosintesis asam asetat (IAA) pada bakteri Telah dipelajari. Identifikasi zat antara
menyebabkan Lima jalur berbeda menggunakan L-tryptophan sebagai precursor Untuk
biosintesis IAA (Gambar 2).
Penemuan asam Indole-3-acetic sebagai tanaman tumbuh Regulator bertepatan dengan
indikasi pertama Mekanisme molekuler yang terlibat dalam tumorigenesis yang
diinduksi Oleh Agrobacterium Kemudian ditemukan bahwa tidak hanya tanaman Tetapi
juga mikroorganisme termasuk bakteri dan jamur Mampu mensintesis asam indole-3-
asetat (Phi et al., 2008). Produksi IAA oleh Enterobacter dan Pseudomonas menyimpan
gen untuk indole-3- Asam piruvat dekarboksilase lebih tinggi dari pada Diproduksi oleh
yang sama tanpa gen (Elsa et al., 2004). Sejumlah penelitian telah menunjukkan bahwa
IAA dapat melakukannya Menjadi molekul pensinyalan dalam mikroorganisme untuk
kedua IAA Memproduksi dan spesies non-penghasil IAA. Katabolisme L- triptofan
menjadi asam indole-3-asetat terjadi melalui lima Rute yang berbeda Jalur
indoleacetamide melibatkan Triptofan 2-monooksigenase (EC 1.13.12.3) dan Hidrolase
indoleacetamide (EC 3.1.1.51). Tryptophan Jalur oksidase rantai samping dan rantai
samping triptofan Aktivitas oksidase (EC.4.1.1.43) telah ditemukan di6 Pseudomonas
fluorescens CHA0. Di jalur ini Triptofan langsung dikonversi menjadi indole-
3acetaldehyde Melewati asam indole-3-piruvat, yang dapat dioksidasi IAA. Dalam
Alcaligenesfaecalis, jalur indole-3-acetonitrile Diketahui dan konversi indole-3-
asetonitril menjadi IAA Oleh nitrilase tertentu (David et al., 2001). Pada jalur indole-3-
piruvat, langkah awalnya adalah Konversi triptofan menjadi asam indole-3-piruvat oleh
Aminotransferase. Pada langkah pembatas laju, indole-3-piruvat Asam didekarboksilasi
menjadi indole-3-asetaldehida oleh indole Enzim piruvat dekarboksilase. Pada langkah
terakhir, indole- 3-asetaldehida dioksidasi dalam IAA di Azospirillumbrasilense,
Pseudomonas putida dan PaenibacillspolymyxaE681.5. Jalur Tryptamine Telah
diidentifikasi di Azospirillum dan Bacillus cereus dimana Konversi tryptamine eksogen
ke IAA berlangsung (Gambar 2). Di sisi lain, triptofan-independen Jalur biosintesis asam
indole-3-asetat telah terjadi Ditunjukkan di Azoperillumbrasilense dengan memberi
makan Percobaan dengan prekursor berlabel (Duran et al., 1994). Produksi asam indole-
3-asetat di Indonesia Beberapa bakteri fototrofik anoksigenik.
Rhodopseudomonaspalustris, Rhodobactersphaeroides, Rubrivivaxgelatinosus dan

10
Rubrivivaxtennius) di Ltryptophan Tumbuh kultur dimana produksi triptofan Terjadi
tidak hanya dari L-triptofan tetapi juga dari indole Dan glisin.
Asam Indole-3-acetic telah terbukti terlibat dalam Aktivasi cahaya / lobak peroksidase
(HRP) dan disarankan sebagai terapi kanker photodynamic baru Dengan membentuk
radikal bebas seperti indolil, statolil dan Radikal perxoyl yang dapat menyebabkan
peroksidasi lipid (Hoshino et al., 1990). Kombinasi IAA dan HRP Menunjukkan
sitotoksisitas pada sel mamalia termasuk G361 Sel melanoma manusia dan kanker
pankreas manusia BXPC-3 sel. Di Agrobacterium tumefaciens dan Rhizobium sp.,
Aktivitas nitril hidratase dan amidase Telah diidentifikasi menunjukkan konversi indole-
3- Asetonitril sampai asam indole-3-asetat melalui indole-3- Acetamide.
Enzim dan produknya
Produksi metabolit sekunder telah terjadi dari asam amino aromatik. Metabolisme dari
Asam amino aromatik dalam mikroorganisme telah berevolusi sekunder Jalur
metabolisme dengan kapasitas untuk berproduksi Senyawa farmakologis yang meliputi
pigmen, Toksin, inhibitor enzim, pestisida, herbisida, Antiparasit, mycotoxins, agen
antitumor, antibiotic Aktivitas sitotoksisitas dan pertumbuhan promoter hewan dan
Tanaman (Bourinbaiar dan Hung, 1994).
Indoles dan turunannya
Indoles dikenal dengan aktivitas antimikroba. Molekul seperti indole-3-acetic acid (IAA)
dan indole-3- Asam propionat (IPA), adalah auxins alami. Ester dari indole Asam asetat,
ester indolemyoinositol; Sphestrin dan Rhodestrin memiliki aktivitas phytoharmonal.
Terisolasi rhodetrin juga menunjukkan fenol ester Adalah kelompok penting dari
molekul bio-genic yang Dari tanaman, lebah propolis (Kumavathet al., 2011), ragi
Seperti Candida dan dari bakteri laut; Microbulbifer. Alkil ester fenol bersifat
bioteknologi Signifikan karena memiliki antioksidan (Ranjith et al., 2008), antikanker,
anti HIV dan aktivitas antimikroba. Sitotoksisitas rhodophestrol U937 ( Leukemia jalur
sel limfoma monosit) ditentukan (Pembentukan tubuh apoptosis) pada jalur sel kanker ini
genap Pada konsentrasi rendah (50 nM). Ini memiliki COX-I dan COX-II Aktivitas
penghambatan Rhodophestrol adalah potensial antikanker Dan dengan demikian layak
dieksploitasi dari Rubrivivaxbenzoatilyticus (Fonnum dan Larsen, 1965). Literatur
menyarankan Produksi fenol lainnya selama proses bioproses Asam amino aromatik
seperti L-fenilalanin oleh Rubrivivaxbenzoatilyticus. Padahal sebagian besar fenol bebas,
yang banyak peneliti Telah diidentifikasi sebagai produk mikroba Fenol terpenoid
diproduksi mikroba dan yang terKonjugasi adalah molekul bio baru, yang layak

11
Mengeksploitasi Indoles diproduksi secara luas oleh Industri kimia untuk berbagai
aplikasi termasuk, Obat-obatan, pestisida dan pewarna. Digunakan sebagai analgesik,
agen antiinflamasi Antihipertensi, senyawa anti HIV dan Phytohormones (Ahn et al.,
2004). Banyak ester indol Ditemukan sebagai inhibitor enzim selektif COX-2.
Ditemukan memiliki aktivitas peroksidasi anti lipid dan antisuperoksida pembentukan.
Ester Indole juga ditemukan Memiliki aktivitas phytohormonal.
Rhodethrin
Rhodethrinhas Massa molekul m / z 279 [M ± H] ± dan Dinamakan sebagai rhodethrin
(3-hydroxy-6- (1H-indole-33-Yloxy) -4-metil-heksanoat). Senyawa ini berbeda Dari
sphestrin atau rhodestrin dalam eter Bukan ester dari panjang Rantai samping terpenoid.
Ester dari myoinositol-indole Asetat hanya dari tanaman. Metabolit ini Bukan produk L-
fenilalanin. LC-MS Analisis menunjukkan berbagai indoles yang lebih luas termasuk
Yang dimurnikan (m / z 279 m / z dan 129m / z) dan yang lainnya Metabolit yang
diidentifikasi meliputi indole-3-acrylaldehyde, Idola-3-karboksaldehida, asam indole-3-
asetat dan Rhodethrin Ini memperkirakan massa molekul 171 (m / z) Sebagai indole-3-
acrylaldehyde; Senyawa ini tidak tersedia Dalam literatur, tapi senyawa terkait indole-3-
akrilik Asam diketahui Ekskresi asam indole-3-akrilat di Urin dan kotoran hewan yang
diberi triptofan adalah Dikaitkan dengan intervensi mikroorganisme. Jadi, indole-3-
acrylaldehyde bisa menjadi perantara L-triptofan metabolisme dalam
Rhodobactersphaeroides. Produksi indole-3-carboxaldehyde Sebelumnya dari
Acetenobacter sp. Dan yang tidak dikenal jamur. Produksi mikroba asam indole-3-asetat
sudah baik Diketahui bahkan dari beberapa bakteri ungu lainnya Bakteri
(Rhodopseudomonaspalustris,Rhodobactersphaeroides, dan Rubrivivaxtenuis) Tumbuh
di L- triptofan atau dari indole ± glisin oleh Rhodobactersphaeroides. Tingkat rendah
beberapa Metabolit dalam kultur yang diinduksi L-triptofan Supernatan juga diamati
dengan tidak adanya Ltryptophan, Yang terkenal adalah indole-3-acetic acid. Sedangkan
dengan tidak adanya 2-oxoglutarat, tidak ada satupun Metabolit di atas diamati pada LC-
MS profil One Biasanya mengharapkan produksi indole oleh Tindakan enzimatik
tryptophanase (EC 4.1.99.1) dikodekan Oleh gen tnaA (Kar et al., 1999), yang tidak
diamati Seperti yang dikonfirmasi melalui uji LC-MS dari enzim.
Violacein
Chromobacteriumviolaceum pertama kali sebagai isolate Dari pasta beras basah Salah
satu karakteristik Mikroorganisme ini adalah kemampuan menghasilkan pigmen ungu
Dikenal sebagai violacein dalam kondisi aerobik. Peran violacein dalam

12
Chromobacteriumviolaceum, dan juga Jalur biosintesisnya dan peran triptofan dan
Turunan indol lainnya Tampaknya menjadi satu-satunya molekul prekursor di violacein
Biosintesis. Produksinya sangat penting Produksi pigmen di
Chromobacteriumviolaceum. Itu Nama IUPAC dan massa molekul violacein adalah (3-
[1,2- Dihidro-5- (5-hidroksi-1H-indol-3-yl) -2- okso-3H-pirok 3-Ylidene] -1,3-dihydro-
2H-indol-2-satu) dan 343,34, Beberapa aktivitas biologis dan potensi farmakologis
seperti antibiotik, bakterisida, antitumoralgenotoksik (Forrest et al., 1993). Efisiensi
antioksidan melawan oksigen dan nitrogen yang reaktif Spesies sebagai hidroksil,
superoksida dan radikal nitrat Oksida. Selain itu, ia mampu menginduksi apoptosis
Dalam kultur sel kanker dan efektif terhadap panel Garis sel neoplastik termasuk
leukemia.
Indolmycin
Indolmycin adalah metabolit sekunder yang dihasilkan oleh Streptomyces griseus ATCC
1248 (secara formal Streptomyces albus BA 3972A), yang diisolasi dari tanah Afrika.
Indolmycin benar-benar menghambat Bakteri TrpRS (tryptophanyltRNAsynthetase)
enzim Dan menunjukkan aktivitas antimikroba terhadap gram positif Dan bakteri gram
negatif. Baru-baru ini peneliti Menunjukkan bahwa indolmycin aktif melawan
mycobacteria dan Helicobacter pylori.
Phenols dan turunannya
Alkil ester asam galat
Sumber utama untuk mendapatkan asam galat adalah melalui Hidrolisis produk berbasis
tanaman seperti tanin (Ahn et al.,2004). Produksi mikroba asam gallic Menggunakan
asam tanat sebagai substrat. Ester iso-amil- (iAG), namyl-(NAG), iso-butil (iBG), n-
butil- (nBG) dan isopropilGallate (iPG) telah disintesis secara kimia dari Asam gallic.
Asam gallic (3,4,5-trihydroxybenzoic acid) adalah Fenol di Berbagai bidang Alkil ester
dari gallate membentuk kelompok penting Dari molekul biogenik yang dari tanaman,
Propolis lebah dan ragi yaitu Candida (Forrest et al.,1993). Molekul-molekul ini
memiliki arti bioteknologi Karena ini diketahui memiliki anti-oksidan, antikanker, anti
HIV dan antijamur / mikroba (Forrest et al., 1993). Alkil ester asam gallic memiliki
antivirus, antibakteri, Sifat antijamur khusus terhadap gram positif Bakteri (Kuniyoshi et
al., 2003). L-fenilalanin Asimilasi sebagai sumber nitrogen tidak melalui deaminasi
Proses dan karenanya kemungkinan untuk transaminase adalah Aktivitas
aminotransferase aromatik telah terjadi dengan L-fenilalanin, L-tirosin dan DOPA
sebagai Substrat dengan adanya 2-oksoglutarat dan substrat telah dianalisis dengan

13
menggunakan HPLC. Aktivitas enzim telah menjadi 6, 10 dan 21 Units.mg protein-
1.min-1. Peningkatan transaminase Aktivitas dengan substrat L-fenilalanin <L-tirosin <
DOPA menyarankan agar transaminasi terjadi pada tingkat DOPA. Konsumsi DOPA
mengalami stagnasi karena tidak adanya Dilengkapi akseptor keto, yang dipulihkan
hanya di Adanya 2-oksoglutarat (Gambar 3). Transaminasinya Produk DOPA telah
diekstraksi menjadi etil asetat, Terkonsentrasi dan dianalisis menggunakan LC-MS.
Massa 196 (M / z) menunjukkan produk sebagai asam 3,4-dihydroxyphenylpyruvic.
3, 4-dihydroxyphenylalanine reductive deaminase
Amonia, produk deaminase, telah diamati dengan tidak adanya penambahan 2-
oksoglutarat. Itu Produk deaminasi DOPA diekstraksi (setelah Pengasaman; PH 4)
menjadi etil asetat, terkonsentrasi dan Dianalisis menggunakan LC-MS. Massa 182 (m /
z) menunjukkan Produk sebagai 3,4-dihydroxyphenylpropionic acid (DPPA) Dan enzim
sebagai deaminase reduktif. Enzim L9 fenilalanin amonia lyase (PAL; EC 4.3.1.24),
yang Mengubah L-fenilalanin menjadi trans-cinnamate paling banyak Umumnya diamati
pada tanaman dan juga di prokariota.

14
 BAB IV
KESIMPULAN DAN SARAN
KESIMPULAN
3,4-Dihydroxyphenylalanine sebagai zat L-phenylalanine Metabolisme melalui
intermediate Ltyrosine Di Rhodobactersphaeroides. Sedikit enzim dalam amonia
metabolisme 3,4- Dihidrofenilalanin 2-oksoglutarat aminotransferase; 3,4-dihidroksi-
fenilalanin reduktif deaminase dan 3,4-dihidroksi fenilalanin oksidatif deaminase
(Sunayana et al., 2005) dimurnikan menjadi homogenitas. Enzim diidentifikasi dalam
Hilir triptofan di Indonesia Rubrivivaxbenzoatilyticus. Rhodethrin (Fonnum dan Larsen,
1965) adalah salah satu molekul baru yang memiliki Aktivitas penghambatan Cox-2,
sitotoksisitas terhadap sel kanker, aktivitas phytoharmonal dan aktivitas antimikroba.
Rubrivivaxin adalah molekul fenol terpenoid baru, yang Memiliki aktivitas
penghambatan Cox-1, sitotoksisitas terhadap kanker Garis sel (U937; leukemia manusia
limfoma monosit Garis sel) dan aktivitas antimikroba.
SARAN
Artikel ini menyarankan agar produksi dari berbagai macam indoleterpenoid, dan fenol
selama Bioproses dari asam amino aromatik seperti LTryptophan, L-fenilalanin dan L-
Tirosin oleh Rubrivivaxbenzoatilyticus. Padahal kebanyakan fenol bebas, dan indoles
yang paling banyak Dari para peneliti telah diidentifikasi sebagai mikroba Produk enzim
yang diproduksi mikrobiologi fenol Terpenoid dan konjugat terkait indoleterpenoid
Biomolekul novel, yang layak untuk dieksploitasi Obat berbasis mikroba.

15
 DAFTAR PUSTAKA
Kumavath, Ranjith N, dkk,. 2017. Potential pharmacological applications of enzymes
associated with bacterial metabolism of aromatic compounds Journal of Microbiology
and Antimicrobials Vol 9. India : Department of Genomic Sciences, School of Biological
Sciences, Central University of Kerala, P.O. Central University,
Kasaragod- 671314.

16