3/20/2018

PERBEDAAN ANTARA
RIBOSA DENGAN DEOKSIRIBOSA

STRUKTUR DNA & RNA

(Pertemuan 3)

Oleh :
Alis Mukhlis, S.Pi., M.Si

Program Studi BUDIDAYA PERAIRAN

Universitas Mataram

1 4

Apa yang anda ketahui tentang : Basa nukleat : Purin & Pirimidin
 Yaitu basa nitrogen (Adenin, Guanin, Cytosin,
 Basa Nukleat (Nukleobasa) Thymin dan Uracil) yang terdapat dalam asam
 Gula Ribosa (RNA) & Deoksiribosa (DNA) nukleat (nukleobasa).
 Nukleosida
 Terdiri atas dua jenis nukleobasa yaitu :
 Nukleotida
 Asam Nukleat 1. PURIN : Adenin, Guanin (merupakan fusi
 Ikatan Fosfodiester dari cincin 5 dan cincin 6 ----- terdapat
 Ikatan hidrogen dalam DNA dan RNA)
 Polinukleotida 2. PYRIMIDIN : Cytosin ----- terdapat dalam
 Kromosom DNA dan RNA; Thymin ----- dalam DNA;
 Genom Uracil ----- hanya dalam RNA. (Pyrimidin
2
adalah cincin 6) 5

STRUKTUR BASA NUKLEAT (NUKLEOBASA)

Purin

STRUKTUR
ASAM NUKLEAT

Pirimidin

3 6

Materi III : Pengantar Biotek 2016/2017 --

Alis Mukhlis, PS.BP UNRAM 1
 3/20/2018

NUKLEOSIDA = pentosa + basa nitrogen

 Ribonucleosida yang mengandung basa
Adenine = adenosine; Guanine =
guanosine; Cytosine = Cytidine; Urasil =
uridine; Thymine = thymidine. Contoh :
deoxyadenosine, deoxyguanosine, dll.

7 10

NUKLEOSIDA :
pentosa + nukleobasa
 Adalah suatu senyawa
yang terdiri dari basa
purin atau pirimidin
yang terikat secara
kovalen dengan gula
pentosa –berupa ribosa
(membentuk
ribonucleosida) atau
deoksiribosa (membentuk
deoksiribonuclesida); 8 11

PERBANDINGAN ANTARA
Nukleotida : nukleosida + fosfat NUKLEOSIDA DENGAN NUKLEOTIDA

 Satu nukleosida yang

membawa satu atau
lebih gugus fosfat;
 Nukleotida merupakan
unit penyusun asam
nukleat.

Pada gambar di atas, Nukleotida bermuatan positif ataukah negatif?

9 12
2’-deoxyadenosine-5’-triphosphate

Materi III : Pengantar Biotek 2016/2017 --

Alis Mukhlis, PS.BP UNRAM 2
 3/20/2018

Asam Nukleat Perhatikan :

Fosfat berikatan pada
 Merupakan polinukleotida
karbon no 3’ dan 5’
(RNA atau DNA) utas tunggal membentuk tulang
atau utas ganda dimana punggung gula-fosfat
posisi 3’ satu gula nukleotida (sugar-phosphate
terhubung ke posisi 5’ satu backbone).
gula nukleotida berikutnya
oleh satu jembatan
fosfodiester. Pada asam
nukleotida utas tunggal, salah
satu ujungnya terdapat satu
gugus 5’-fosfat bebas dan
ujungnya yang lain terdapat
satu gugus 3-hidroksil
bebas..
13 16

IKATAN FOSFODIESTER
MOLEKUL DNA ADALAH DOUBLE-HELIX
YANG BERPASANGAN SECARA KOMPLEMEN DAN ANTI PARALEL

 Dalam suatu polinukleotida, asam fosfat

membentuk ikatan ester dengan dua gula
nukleosida
 Ikatan ester terbentuk melalui penggantian satu
atau lebih atom hidrogen.
 Masing-masing gula dapat diesterifikasi dengan 2
asam fosfat membentuk tulang punggung gula-
fosfat (sugar-phosphate backbone).
 Fosfat berikatan pada karbon no 3’ dan 5’
membentuk tulang punggung gula-fosfat (sugar-
phosphate backbone).
14 17

IKATAN FOSFODIESTER

Ikatan ester terbentuk oleh

penggantian satu atau lebih
atom hidrogen pada suatu
asam oleh suatu gugus organik

IKATAN
FOSFODIESTER

Masing-masing gula dapat diesterifikasi

dengan 2 asam fosfat membentuk tulang
punggung gula-fosfat (sugar-phosphate
backbone)
15 18

Materi III : Pengantar Biotek 2016/2017 --

Alis Mukhlis, PS.BP UNRAM 3
 3/20/2018

MOLEKUL DNA DIKEMAS MENJADI KROMOSOM

5’-A B C D E F G H I J K L M-3’
! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! GENOM
3’-N O P Q R S T U V W X Y Z-5’

5’-Z Y X W V U T S R Q P O N-3’
! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! !
3’-M L K J I H G F E D C B A-5’
19 22

5’-A B C D E F G H I J K L M-3’ Review :

! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! Apa yang anda ketahui tentang :
3’-N O P Q R S T U V W X Y Z-5’
 Basa Nukleat (Nukleobasa)
Utas DNA yang memiliki makna (“kode urutan asam amino”) disebut utas positif (+)  Gula Ribosa (RNA) & Deoksiribosa (DNA)
 Nukleosida
5’-SATUNUKLEOSIDAMEMBAWASATUGUGUSFOSFAT-3’  Nukleotida
!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
 Asam Nukleat
3’-FNGHAHXYRBFVQNZRZONJNFNGHTHTHFSBFSNG-5’
 Ikatan Fosfodiester
Utas DNA yang komplementer dengen utas (+) disebut utas negatif (-), sehingga  Ikatan hidrogen
untuk menghasilkan utas (+) maka harus menggunakan utas (-) sebagai cetakan,
begitu juga sebaliknya
 Polinukleotida
 Kromosom
 Genom
20 23

IKATAN HIDROGEN ANTARA BASA PIRIMIDIN DAN PURIN MUDAH

DIPISAHKAN DENGAN PEMANASAN SUHU 94-95oC

3 ikatan hidrogen

2 ikatan hidrogen

21

Materi III : Pengantar Biotek 2016/2017 --

Alis Mukhlis, PS.BP UNRAM 4