Kelompok 5 : - Elvira Harum Permatasari (160341606012)

- Zaha Husnul Khitami (160341606074)

Offering C

Chapter 20
Extrachromosomal Inheritance

Extrachromosonal Inheritance
DNA nuklear adalah bahan genetik universal yang paling penting. Sebagian besar contoh
awalnya berhubungan dengan warisan extranuclear akhirnya telah dijelaskan oleh gen nuklear.
Beberapa kasus yang pada mulanya bergantung pada gen sitoplasma dan diklasifikasikan
berdasarkan warisan matematis ditunjukkan oleh penyelidikan furuher yang terkait dengan gen
induk. Fenotip dinyatakan dalam keturunannya, dan kasus ini direklasifikasi sebagai efek
induk. Kriteria untuk mengidentifikasi kelompok sifat heterogen ini adalah konsekuensi dari
definisi warisan extranuclear atau cytoplasmic dan juga jenis organisme dan mekanisme yang
terlibat.
Kriteria Untuk Pewarisan Intranuklear
Lima kriteria utama dapat digunakan untuk membedakan antara sifat yang dikendalikan oleh
gen nuklear dan sifat yang dikontrol oleh gen extranuclear.
1. Perbedaan dalam hal hasil dari reciprocal crosses akan menyebabkan penyimpangan
dari pola transmisi gen autosom Mendelian.
2. Sel reproduktif betina umumnya memiliki lebih banyak sitoplasma dan organel
sitoplasmik daripada sel jantan dan akan diperluas untuk mempengaruhi sifat non-
Mendelian.
3. Gen kromosom menempati lokus tertentu dan memetakan di tempat-tempat tertentu
berkenaan dengan gen lainnya. Kegagalan menemukan keterkaitan dengan gen nuklear yang
diketahui dapat menyingkirkan pewarisan
4. Kekurangan pemisahan Mendelian dan karakteristik rasio Mendelian yang tergantung
pada transmisi kromosomal pada meiosis akan mendukung transmisi ekstrakromosomal.
5. Substitusi eksperimental nuklei bisa memperjelas pengaruh nukleus dan sitoplasma.

Organel Sitoplasmik dan Simbions

Kontrol seluler lokal, yang kurang lebih inde pendent telah menguntungkan beberapa fenotipe
tertentu. Perlu dicatat bahwa organel gtoplasmic sangat penting dan mempunyai fungsi
mendasar. Enzim untuk respirasi dan energi seluler misalnya, masuk dan bahan makanan
teroksidasi untuk menghasilkan adenosine triphosphate (ATP), bahan bakar untuk reagen
biokimia, klorofil dan pigmen tanaman lainnya merupakan gen yang disintesis pada
mitokondria dan plastida yyang terkait dengan DNA. Margulis menemukan adalah bahwa
mitokondria adalah bakteria yang hidup bebas. Setelah beberapa periode, mereka membuktikan
simbion pewarisan dengan inang sel eukariot dan akhirnya ditempelkan dalam organel sel
hewan dan tumbuhan. Mereka mengambil dari unit hidup bebas pada DNA mereka dan alat
lain untuk mekanisme genetik.

Gambar 1 : Mitokondria

Gambar 2: Bagian-bagian mitokondria

DNA di Mitokondria
Mitokondria biasanya merupakan organel sitokromik kecil yang timbul sebagai invaginasi dari
membran mitokondina bagian dalam. Ukurannya sama dengan bakteri dan terjadi pada sel-sel
eukariota itu tapi tidak pada bakteri dan vinus. Mitokondria memberi hewan dan tanaman yang
lebih tinggi dengan energi sel yang menopang kehidupan melalui proses oksida dari proses
sitrat serta proses fosforilasi oksidativ dan transpor elektron. Mitokondria mengandung
peralatan sintesis protein yang berbeda dengan ribosom khusus, tRNA dan anynoacyl tRNA
sintesis. Aparatus ini menunjukkan kepekaan terhadap antibiotik seperti bakteri dari sintetis
protein mitokondria berbeda secara signifikan dari sitoplasma. Sebagai contoh, ribosom dalam
aparatus sintesis protein mitokondria sama seperti yang ditemukan pada bakteri namun sangat
berbeda dari sitoplasma sel eukariota.
Organisasi Genom Mitokondria
Genom mitokondria seluruh mamalia ditranskripsi sebagai salah satu unit dari sisi promotor
tunggal, dan transkrip primer raksasa membelah endonucleolytically untuk memproduksi
masing-masing molekul tRNA, rRNA, dan mRNA. Dengan demikian, seluruh mtDNA,
berlaku, setara dengan satu operon pada bakteri.

DNA Pada Plastida

Carl Correns (tahun 1908) mengamati perbedaan hasil persilangan timbal balik dan merupakan
yang pertama untuk menggambarkan penyimpangan dari keturunan Mendelian. Nuansa warna
yang berbeda dari putih (albino) menjadi hijau tua Di beberapa tanaman daun diinvestigasi.
Pewarisan yang sama dari biji induk dan serbuk sari, seperti yang ditunjukkan oleh Mendel In
garden peas, Correns menunjukkan pada penelitian Mirabilis Jalapa, bahwa pewarisan sifat
tertentu datang sepenuhnya dari induk benih. Perbedaan warna berhubungan dengan plastik
plasmit, yang terpenting adalah chloroplas yang membawa klorofil. Chloroplas timbul dari
sitoplasma yang disebut pro plastida yang mengandung DNA dan menduplikat dirinya sendiri
terlepas dari bagian sel lainnya. Mereka didistribusikan lebih atau kurang sama selama
pembelahan sel.

Gambar 3: Struktur Kloroplas

DNA Kloroplas dan Obat Pertahanan
Ketika Ruth Sager menempatkan sel ganggang Chlamydomoras pada medium kultur yang
mengandung mucin enuoioucsueploh Iesistan, sebagian besar sel terbunuh, namun satu per
seribu bertahan dan berlipat ganda, masing-masing terbentuk. sebuah strep resistan koloni.
Mutan dengan resistansi terhadap streptomisin strited dipilih dari ganggang predominan
predominan strepomisin predominan. Tentang Su Per sr untuk persen dari mutan yang
melibatkan gen nuklear (sr-1), dan mutasi sensitif semacam itu hanya ditunjukkan oleh
tantangan antibiotik. Akhirnya, kuman nonchromosomal ditemukan kembali dari hampir setiap
koloni.

Gambar 4: Pewarisan resistensi nuklear

Organisasi pada genome plasmid

plastid genom dimiliki oleh 200 spesies tanaman tinggi.dalam spesies tertentu genom dari
beberapa tipe seperti plastid,klroplast,amiloplas,dan kromoplast identik dengan organisme
yang telah diteliti.diskusi tentang plasmid genom ini berkaitan dengan DNAs kloroplas
(cpDNAs) yang merupakan bagian pentning dari plastid.
Semua genom kloroplas pada dasarnya memiliki gen yang sama,namun gen ini disusun dengan
cara yang berbeda pada cpDNA.gen yang ada pada cpDNA dapat dibedakan mejadi dua
yaitu:1)komponen pengkodean protein kloroplas biosintetik aparatus dan 2)komponen
perlengkapan untuk fotosintesis.
Genom kloroplas untuk tumbuhan tinggi memiliki ukuran 21 sampai 31. Pada prokariotik
dipercaya telah berkembang, kloroplas telah kehilangan materi genetik. Informasi dari nenek
moyang sangat bergantung pada gen nuclear dari sekumpulan sel untuk banyak komponen
esensial. Komponen dari mitokondria yang terakhir disintesis pada ribosom sitoplasma dan
disalurkan ke dalam kloroplas dengan bantuan peptide amino terminal yang diangkut dan
membelah selama transportasi berlangsung di dalam membran sitoplasma
Fotosintesis yang terjadi pada kloroplast menyediakan sumber energi yang mendukung
kehidupan semua makhluk hidup yang ada dibumi.karena genom kloroplas menyediakan
banyak komponen kunci dari fotositem I dan II,dan rantai transport elektron maka pengetahuan
tentang struktur dan fungsi cpDNA sangat penting.
Bakteria Symbiont Pada Paramecium Sitoplasma
Paramecium merupakan organisme yang disukai untuk penyelidikan genetik.paramecium
adalah protozoa berukuran besar uiseluler yang bereproduksi baik secara asexual atau sexual.
Reproduksi aseksual terjadi akibat pembelahan sel dari sel yang serupa secara genetik ke hasil
kloning. Tahap seksual, paramecium berkonjugasi secara periodik dan mentransfer materi
genetik dari satu sel ke sel lain. Paramecium dan Ciliate yang lain mempunyai dua macam
nuclei, yaitu makronukleus vegetative besar dan mikronukleus kecil. Ini mungkin untuk
laboratorium membuat persilangan seksual. Meiosis berikutnya, menghasilkan sel haploid,
tetapi sampai autogami menjadi homozigot diploid. Hal ini menyediakan sebuah tempat untuk
pembanding ekstraselular dan nuclear warisan, dan untuk memperlihatkan bahwa progeny
dapat berbeda dari wild type pada ciri yang dikendalikan oleh gen nuclear dan ekstranuklear.
T. M. Sonnoborn dan yang lain mempunyai investigasi sebuah efek presisten eksraselular pada
Paramecium. Beberapa strain dari P.aurelia menghasilkan sebuah unsur yang mempunyai
pengaruh yang mematikan dari anggota strain lain pada beberapa spesies. Paramecium dari
strain yang mampu memproduksi unsur racun yang disebut “killer”. Efek racun juga
mengurangi divisi sel setelah mengalami pengulangan. Pemisahan elemen pada sitoplasma
telah menerima hasil dari subtansi racun. Killer kemudian diamati dengan menggunakan
mikroskop dan partikelnya disebut “kappa”. Partikel ini yang diperlihatkan utuk menjadi
bacteri symbiotic, yang diberi nama Caedobacter taeniospirales (bakteri pembunuh dengan
ribbon spiral).
Sebuah “subtantasi toxic” (Paramecin), dihasilkan oleh bakteri pembunuh, yang difusikan ke
medium cair. Paramecin tidak mempunyai efek pada killer, yang berasosiasi dengan semacam
partikel semacam kappa yang terjadi pada lebih dari 20 persent populasi kappa. Virus toxic
pada paramecium sensitif tapi tidak beracun pada “nonbright” bakteri.
Bakteri kappa hanya mengabdikan diri pada organismee yang membawa nuclear alel k
dominan, yang memetapkan lingkungan yang diperlukan untuk bakteri bereproduksi. Ketika
killer konjugasi dengan sensitif dibawah kondisi yang tepat (untuk menghidari membunuh
pasangan) dan tidak terjadi pertukaran sitoplasmik. Ada dua macam clones mucul, yaitu satu
dari sel killer asli yang mengandung alel K (Kk) dan bakteri kappa, dan yang lain dari sel
sensitive asli, yang membwa alel K (Kk) dan kekurangan kappa. Autogami selanjutnya, separuh
keturunan dari killer adalah killer dan separuh [paramecium sensitive. Selama tidak ada
sitoplasmik yang ditransfer pada konjugasi, hanya sel dari killer asli yang menerima wariasan
dari bakteri kappa. Kappa tidak dapat bereproduksi di sel. Autogami menghasilkan sel
homozigot KK dank k, yang yang menghasilkan clone killer atau nonkiller, secara respective.
DNA Plasmid dan Transformasi Tumor
Molekul ekstrakromosom DNA dapat mereplikasi dengan bebas dan mempertahankan dirinya
sendiri di dalam sitoplasma sel tumbuhan yang disebut dengan plasmid. Plasmid biasanya
berada bersamaan dengan kromosom mitokondria dan plastid, tetapi plasmid tidak dapat
diorganisasikan menjadi organel yang vital di dalam sel inangnya. Plasmid memiliki
kemampuan dapat melakukan replikasi dengan bebas untuk melakukan kombinasi dengan
DNA lain, dan membawa DNA inti sel untuk melekukan aktifitas sinsesis, plasmid digunakan
untuk rekayasa genetika.
Sebuah plasmid yang disebut TI membawa sekuens DNA yang mentransformasikan sel
tanaman dikotil ke sel tumor.transformasi tumor dikaitkan dengan penyakit tumor.penyakit ini
diwujudkan sebagai pertumbuhan tumor yang diinduksi oleh bakteri Agrobacterium
tumefaciens.

Steliritas Sitoplasma Pada Tanaman

Contoh lain dari pewarisan sitoplasma adalah dihubungkan dengan kegagalan polen. Ini terjadi
pada banyak bunga pada tanaman dan mengakibatkan sterilnya jantan. Sterilitas jantan
meupakan bagian yang penting ketika melelui proses pembentukan biji. tanaman hybrid
diproduksi secara komersial pada jagung, timun, bawang merah, sorghum, dan tanaman hybrid
yang lain.

Jantan Steril ketika melewati Proses Polinasi Tanaman

Contoh mekanisme pewarisan meteri adalah transmit jantan steril pada jagung,yang diteliti dan
dianalisa dengan hati-hati oleh M.M. Rhoades. Polen digugurkan pada kepala putik pada
tanaman jagung, mengakibatkan polen menjadi jantan yang steril. Tetapi struktur betina masih
normal. Gen nuclear tidak mengontrol macam sterilnya, meskipun gen ditransmisasikan dari
generasi ke generasi berasal dari telur sitoplasma.
Fakta dari varietas jantan steril diproduksi hanya dari keturunan jantan steril ketika diadakan
fertilisasi dengan polen dari tanaman jagung normal. Jantan steril pada tanaman biji akan terus
mengalami perulangan dalam bentuk polen hingga terbentuk jantan yang fertil. Dalam genetika
bentukan steril dirubah, jantan steril tetap terbentuk, menunjukkan bahwa pewariasan materi
tidak dapat dikontrol oleh gen kromosom. Dalam pemeriksaan berkembang, diantara bagian
kecil polen didapatkan dari bentukan jantan yang steril. Membuat resiprok sangat mungkin. Ini
semua melewati pembentukan keturunan dari jantan steril pada biji tanaman kemuadian
berubah menjadi jantan yang fertile. Keturunan dari materi jantan steril tanpa memperhatikan
pembentukan pada umumnya.
Besar sekala menngunakan jagung jantan yang steril untuk pembentukan biji membawa
penyakit dalam kelompok hasil pertanian jagung di tahu 1970. Karena keuntungan
keseragaman jagung dan keuntungan besar jantan steril dalam pembentukan biji, sumber
pertama sitoplasma, diketahui di Texas (T0 sitoplasma jantan steril, yang telah digunakan
dalam produksi biji untuk hibrid jagung ditanam tahun depan.

Bahaya Keseragaman
Apa yang menyebabkan penyakit pada hasil jagung? Sebuah mutans baru berbentuk jamur
Helminthosporium maydis (nisikado dan miyake) mulai menjadi pathogen yang mematikan
pada khusus jagung hibrida. Jamur ini merusak jagung dengan (T) sitoplasma jantan steril. Ahli
pathogen dan keturunan tanaman memenukan wabah ini berasal dari varietas jagung yang
resistan dengan jamur. Karena sebelumnya, muncul penyakit daun tanaman yang berwarna
kuning, tahun 1970 produksi biji telah digeser dengan jagung tanpa T sitoplama. Jagung ini
dibutuhkan detasseling tetapi secara luas digunakan untuk tanaman musim dingin tahun 1971.
Ini juga memproduksi beberapa biji yang resistens untuk tanaman umum pertanian. Beberapa
tanaman diprediksi sekitar 20-30 persen hasil pertanian mati bahkan resiko lebih banyak lagi
tanaman hybrid mudah rentan.
Sebagian besar produksi biji tahun 1971 diselesaikan tanpa menggunakan steril jantan dan T
sitoplasma. Penyebaran T pada H. maydis tidak terlalu parah pada tahun 1972. Perkembangan
H.maydis yang lain dapat muncul atau salah satu penyakit tamanan jagungdapat menjadi
ancaman untuk jagung hibrida dengan T jantan steril sitoplasma. Beberapa varietas dari jagung
resistan dengan persebaran T pada H. maydis yang sekarang telah diidentivikasi dan telah
tersedia untuk produksi benih.

Efek maternal
Telur dan embrio diharapkan dapat dipengaruhi oleh lingkungan ibu ditempat mereka
tinggal.bahkan yang dikeluarkan dari tubuh ibu pada tahap awal menerima sitoplasma dan
nutrisi dari ibu dan pengaruh khusus pada aksi gen mungkin berlaku.potensi tertentu dari telur
diketahui ditentukan sebelum fertilisasi dan dipengaruhi oleh linkungan ibu disekitarnya.hal
ini disebut sebagai efek maternal.
Efek maternal pada ulir cangkang siput
Salah satu efek maternal yang paling terkenal adalah gambaran melingkar pada cangkang siput
Limnaea peregra.beberapa strain dari spesies ini memeiliki cangkang dekstral yang
melengkung ke kanan dan yang lain memiliki cangkang sinistral yang melengkung ke kiri.
Karakteristik ini di pisahkan oleh genotipe ibu (bukan fenotipenya) dan bukan oleh gen
berkembang dari bekicot.alel s+ untuk melingkar kekanan dominan terhadap alel s yang
melingkar kekiri.

ketika persilangan dilakukan antara betina bergulung ke kanan dan jantan bergulung kiri, siput
F1 semua melingkar ke kanan. yang biasa 3: 1 rasio tidak diperoleh di F2 karena fenotip ss
tidak diekspresikan. sebaliknya, pola ditentukan oleh gen ibu (P) (s+s+) diekspresikan dalam
F1 dan genotipe ibu F1 (s+s) diekspresikan dalam F2. Ketika gen ss maka semua keturunan
bergulung kekiri, sedangkan jika s+s+ atau s+s semua keturunan bergulung kekanan.

Investigasi yang dilakukan pada pola penggulungan siput ini menerangkan bahwa orientasi
benang spindel pada pembelahan pertama setelah fertilisasi menentukan pola penggulungan
siput. Orientasi spindel ini dikontrol oleh gen maternal yang beraksi pada pematangan telur di
ovarium. karakteristik fenotipik yang sebenarnya, dipengaruhi langsung oleh ibu, dengan tidak
ada hubungannya langsung dengan gen dalam sel telur, sperma, atau keturunan. Namun,
sebagian besar ciri-ciri siput lainnya tidak menunjukkan pola maternal-effect .

Efek Maternal pada Drosophila

Di University of Texas terdapat Drosophila melanogaster yang mengalami pertumbuhan tak
normal pada daerah kepala yang muncul pada sampel populasi yang diambil di Acahuizotla,
Mexico. Proporsi lalat yang mengekspresikan “trait” dengan nama “tumorous head” (tu-h) ini
meningkat kira-kira 76% pada suhu 22°C ketika lalat dibesarkan pada media jagung dan
molase. Ketika dilakukan penyilangan resiprokal maka efek maternal terlihat.
Tu-h betina dikawinkan secara terpisah dengan 3 jantan liar, dan 11 jantan dari laboratorium,
dihasilkan 14-52% dari lalat abnormal pada generasi I. Dari persilangan resiprokal antara
jantan Tu-H dan 3 type liar serta 11 betina dari laboratorium, didapatkan 0-1% yang mengalami
abnormal. Penelitian lebih lanjut menunjukkan efek maternal. Gen dari ibu yang membawa
pengaruh ke arah pertumbuhan abnormal pada kepala keturunan selama 22 jam pertama dari
pertumbuhan. Dua gen utama yang ditemukan mengendalikan sifat tumor pada kepala yaitu :
1. Gen yang terpaut seks di 64,5 map unit pada kromosom X mengendalikan efek maternal. 2.
gen struktural pada 58 map unit pada kromosom ketiga mengendalikan fenotip tumor pada
kepala.
Pertanyaan :
Elvira Harum Permatasari (160341606012)
1. Apa perbedaan DNA mitokondria dengan DNA inti:
 Letak DNA mitokondria terletak di dalam mitokondria, mitokondria adalah
organel sel. Sedangkan DNA inti sel terletak di dalam inti sel. mtDNA terletak
di matriks mitokondria berdekatan dengan membran dalam mitokondria, tempat
berlangsungnya reaksi fosforilasi oksidatif yang menghasilkan radikal oksigen
sebagai produk samping (Richter, 1988).
 Laju Mutasi lebih cepat Laju mutasi DNA mitokondria lebih tinggi sekitar 10-
17 kali dibandingkan DNA inti. Karena mtDNA tidak memiliki mekanisme
reparasi yang efisien (Bogenhagen, 1999)
 DNA polimerase yang dimiliki oleh mitokondria adalah DNA polimerase γ
yang tidak mempunyai aktivitas proofreading (suatu proses perbaikan dan
pengakuratan dalam replikasi DNA). Tidak adanya aktivitas ini menyebabkan
mtDNA tidak memiliki sistem perbaikan yang dapat menghilangkan kesalahan
replikasi. Replikasi mtDNA yang tidak akurat ini akan menyebabkan mutasi
mudah terjadi.
 Tidak memiliki protein histon. Pada DNA inti, disusun dalam bentuk yang khas,
dengan adanya beberapa macam protein histon sehingga bentuknya seperti
berpilin-pilin.
 Jumlah Lebih Banyak dan Ukuran genom lebih kecil DNA mitokondria
mempunyai jumlah lebih banyak jika dibandingkan DNA inti, karena jumlah
mitokondria banyak di dalam sel. Dari segi ukuran genom, genom DNA
mitokondria relatif lebih kecil.
 Hanya diwariskan dari Ibu DNA mitokondria diwariskan hanya dari ibu,
sedangkan DNA inti dari kedua orang tua (dari DNA ayah dan ibu). Pada saat
pembuahan sel, sel sperma hanya berpusi materi DNA saja, sedangkan
sedangkan bagian-bagian sel sperma lain tidak. Sehingga DNA mitokondria
pada anak hanya dari ibu.
 Bentuknya Lingkaran dan sirkuler DNA mitokondria berbentuk lingkaran,
berpilin ganda, sirkular, dan tidak terlindungi membran (prokariotik).
Sedangkan bentuk DNA inti panjang tidak sirkuler, duble helik, pada saat akan
pembelahan sel berbentuk kromosom.
 Tidak memiliki intron DNA mitokondria tidak memiliki intron dan semua gen
pengkode terletak berdampingan,sedangkan pada DNA inti terdapat ekson dan
intron, pada saat sintesis protein terjadi pemotongan intron yaitu pada
pemerosesan mRNA
2. Bagaimana struktur dan replikasi DNA pada kloroplas?

Struktur dari genom kloroplas sama dengan struktur genom mitokondria. Seperti diketahui,
DNA tersusun atas utas ganda, berpilin, dan terdiri dari struktur protein. DNA kloroplas lebih
besar dari pada DNA mitokondria hewan, dengan ukuran antara 80 kb hingga 600 kb. Barisan
DNA dari genom kloroplas dari setiap individu sudah terdeteksi. Sebagai contoh genom
Tembakau adalah 155,844 bp dan genom Padi adalah 134,525 bp. Semua genom kloroplas
terdiri dari banyak barisan DNA yang tidak bertenda. Jumlah tiruan dari DNA kloroplas pada
setiap kloroplas bervariasi setiap spesies. Dalam hal mi ada tiruan ganda dari setiap kloroplas,
semua ditemukan pada daerah nukleus ganda yang juga menghasilkan tiruan ganda. Pada
individu uniseluler seperti alga hijau Chlomydomonos, satu kloroplas dalam sel terdiri antara
500 sampai 1500 molekul DNA kloroplas.

Zaha Husnul Khitami (160341606074)

1.jelaskan mengapa plasmid TI dapat menciptakan DNA rekombinan pada tanaman melalui
Agrobacterium Tumefaciens?
Plasmid TI merupakan vektor (pembawa) alamiah yang digunakan untuk mentransfer DNA ke
dalam sel tanaman.BakteriAgrobacterium Tumefaciens merupakan salah satu jenis bakteri
yang membawa plasmid Ti yang dapat menyebabkan tumor pada tanaman yang disebut crown
gall, terutama tanaman dikotil. penyisipan DNA target ke plasmid Ti ini akan menciptakan
DNA rekombinan yang nantinya akan ditransfer ketanaman sasaran melalui bakteri
Agrobacterium Tumefaciens.
2.jelaskan mengapa keseragaman dapat berbahaya?
Jawab.jika banyak terjadi keseragaman akibat rekayasa genetika maka akan terbentuk mutan
baru yang lebih mematikan contohnya yang terjadi pada tanaman jagung Sebuah mutans baru
berbentuk jamur Helminthosporium maydis (nisikado dan miyake) mulai menjadi pathogen
yang mematikan pada khusus jagung hibrida. Jamur ini merusak jagung dengan (T) sitoplasma
jantan steril. Ahli pathogen dan keturunan tanaman memenukan wabah ini berasal dari varietas
jagung yang resistan dengan jamur.