Professional Documents
Culture Documents
Asam Amino
Asam Amino
O O O O
H2O, H +
NHCHC NHCHC H2NCHCOH
2H + H 2NCHCO 2H
H
kalor
R R' R R'
H 2N C H
Gugus α-amino
R variasi struktur terjadi
dalam rantai samping
CHO CO 2H
HO C H H 2N C H
CH 2OH R
CO2H
Dalam Asam
Dalam Basa
Klasifikasi asam amino menurut fungsi biologisnya
NH2
arginina* arg H2NCNHCH 2CH2CH2CHCO 2H
NH2 NH2
O
NH2
Nama Singkatan Struktur
asam aspatat asp HO2CCH 2CHCO 2H
NH2
sisteina cys HSCH 2CHCO 2H
(cysteine)
NH2
glu HO2CCH 2CH2CHCO 2H
asam glutamat
O NH2
NH2
NH2
lisina* lys H2NCH 2CH2CH2CH2CHCO 2H
NH2
NH2
Nama Singkatan Struktur
pro CO2H
pirolina N
H
thr OH
treonina*
CH3CHCHCO 2H
NH2
Nama Singkatan Struktur
CH2CHCO 2H
triptofan* try
N NH2
H
tirosina tyr
(tyrosine) HO CH2CHCO 2H
NH2
NH2
ikatan peptida
O O O O
-H2O
H2NCHCOH + H2NCH2COH H2NCHC NHCH2COH
CH3 CH3
CH3 CH3
alanilglisina glisilalanina
Asam amino dengan gugus amino bebas biasanya ditaruh
pada ujung kiri struktur itu. Asam amino ini disebut asam
amino N-ujung.
Asam amino dengan gugus karboksil bebas ditaruh diujung
kanan disebut asam amino C-ujung.
C-ujung di kanan
N-ujung di kiri
O O O
CH3 CH2 OH
alaniltirosilglisina
suatu tripeptida
STRUKTUR PROTEIN
PRIMER, SEKUNDER (HELIKS), TERSIER (GLOBULER) ATAU KUARTERNER
(POLIGLOBULER
URUTAN ASAM AMINO
STRUKTUR
PRIMER
ATAU
STRUKTUR
SEKUNDER
KUMPARAN TAK BERATURAN
α HELIKS
ATAU
LEMBARAN BERLIPAT
SUB UNIT
MIOGLOBIN HEMOGLOBIN
H Protein Secondary Structure:
N
C H Helix
C
O N
C H
C
H
O N +
C -
N C H O H O
C H
O H N C N C OH
C C C
O N
C
H H
O C H C H C H
H H HO H
H N
C
N C
C O
O
H Protein Secondary Structure:
N
C
C
H
N
Helix
O C
C
H
O
H N - +
C C H O H O
N O
C H
H N C N C OH
C C C
O N H H
C
C H C H C H
O H H HO H
H N
C
N C
C O
O
Protein Secondary Structure:
Helix
R
R
R groups stick out R
R
from the helix R
influencing higher R
R
levels of protein R
R
organization R
R
R
R
R
Protein Secondary Structure:
Pleated Sheet
O H O H O H O H
C C C C
C C N C C N C C N C C N
N C N C N C N C
H O H O H O H O
O H O H O H O H
C C N C C N C C N C C N
N C C N C C N C C N C C
H O H O H O H O
Protein Secondary Structure:
Pleated Sheet
O H O H O H O H
C C C C
C C N C C N C C N C C N
N C N C N C N C
H O H O H O H O
O H O H O H O H
C C N C C N C C N C C N
N C C N C C N C C N C C
H O H O H O H O
O H O H O H O H
C C C C
C C N C C N C C N C C N
N C N C N C N C
H O H O H O H O
Protein sequencing
1a. Apa yang dimaksud dengan sifat dipolar dari asam amino?
b. Mengapa asam amino bersifat amfoter, tuliskan reaksinya
dengan asam dan basa.
c. Apa yang dimaksud ikatan peptida .
d. Tuliskan struktur tripeptida dari Alanin-Tirosin-Sistein
e. Jelaskan perbedaan struktur primer, sekunder, tersier, dan kuartener dari protein
H H
H3C C COOH HSH 2C C COOH
NH 2 NH 2
Alanin sistein
H
HO CH2 C COOH
NH 2
tirosin