srarzote artikel: ARTIKEL SIOINFORMATIKA,
(FG Lainnya log Berit»
Bust Blog Masuk
artikel
Minggu, 06 April 2014
Pengikut
ARTIKEL BIOINFORMATIKA
Artikel Biolnformatika
Bioinformatica merupakan ilmu terapan yang lahir dari perkembangan teknologlinformasi
dlbidang molokular, Pembahasan dibidang bioinformatikiniidak terlepas dari perkembangan
biologi molekular modern, salah satunya peningkatan pemahaman manusia dalam bidang
‘geriomic yang terdapat dalam rolekul DNA,
pada arte! kal ni saya akan membahas tentang bioInformatika
Boinformatka merupakan ilu trapan yang aie dati perkembangan tkvolog inoemas
Aibidang molekula, Pembehasan dibidang bioinformatk ini ik terepas dart perkembangan biol’
rmolekular moder, salab sutunys peningkatan pemahaman manvsia dalam bidang genomic yang
‘erdapat dalam moekal DNA,
Kemampuan untuk memahami dan memanipulasi Kode genetik DNA ini sangatdidukung
‘le teknolgi informasi melalui perkembangan hardware dan sfTware, Baik pitak pabrikan sofware
«dan harwore maupun pts ketgn dalam prodoki perangkat lant, Selah sat contobny dopa iat
pada upaya Celera Genomics, perusahaan bioteknologi Amerika Serikat yang melakukan pembacean
slcien genom manusia yong secare maksimal miemanfatkan teknologi informs schingga bisa
‘melakukan pokerjaannya dalam waktu yang singhat (anya beberapa tahun}
Perkembangan teknologi DNA rekombinan memainkan peranan penting dalam lays
bioinformatka. Teknologi DNA rekominan memuneulkan suats pengtahusn baru dalam rkayasa
genetika organisme yang dikenala bioteknologi. Perkembangan bioteknologi dari biotcknologi
radisional ke boteknologi modren salah satunya ditnéainya dengan kemampuan manusia dalam
silakukan analisis DNA organisme,sekuensing DNA dan manipulasi DNA.
Sekuensing DNA satu orgaisme, misalnys sua virus memsliki Kurang, Ici 5.000,
sukleotda atau molekul DNA atau skits 11 gen, yang telah bethasil dacs scars menyelaruh pada
‘ahun 1977, Kemudia Sektenselurub DNA manasa teri dari 3 milyarnukleotds yang menyusi|
100.000 gen dapat petakan dalam wake 3 tahun, walsupan semua ini Blum tela engsp, Seat in
tsrdapat milyaran data nukleotida yang tersimpan dalam database DNA, GenBank di AS yang
ican tahun 1982
Bioinformatkailahilmw yang mempelsari penerapan tekaikKomputasi untuk mengelo
dan menginalsis informasi bayatBiding ni mencakup —penerapanmetode-
smetode matematica, statistika, dan informatika untuk memecahkan masalah-masalah biologi erstama
yang terkait dengan penggunatn sckuens DNA dan sam amino, Contob topik wtama bidang in
‘melipus pangkalandatauntuk mengeola informs hayati,penyjajaransckuens (sequence alignment),
sekunder_ RNA,
prediksistruktur untuk meramalkan stukeur protein ata pun stu
nals ilogenctik, dan analisis ekspresigen
Bioinformatika peramskalidkemkakan pada ertongahan 1980an untuk mengacu kepada
ppeerapan ima komputer dalam bidang biologi. Meskipan demikien, penerapan bidang-bidang dalam
biinformatka seperti pembuatan pangkslan data dan pengembanganalgoritma untuk azaisis seks
biologi tela dlakukan sak tahun 1960an,
Kemajuan teknk biologi molekuler dalam mengungkap sekuens biologt protein (jak
‘sval1950un) dan esr nukleat (sek 1960an) mengawaliperkembangan pangkalan dita dan tek
analisis sokvens biologi, Pangkalan data sckuens protein mulai dikembangkan peda tahun 1960an,
4i Amerika Serkst,sementara panglalan dita sehuens DNA dikembangkan pada akhir 1970an di
Amerika Serikat dan Jerman pada Loboraorism Biologi Molekuler Exope (European Molecular
Biology Laboratory)
Penemuan teknik sckuensing DNA yang Iebib cepat pada pertengahan 1970an menjadi
Jandasenterjadinya ledakanjumish sekuens DNA yang dapat diungkapkan pada 1980an dan 1990an,
Hal ini menjadi salah satu pembuka jalan bagi proyek-proyek pengunghapan genom, yang
smeninghatkan Kebutuhan skan pengelolsan dan analiss sekuens, dan pada abhimya menyebabken
lahisya bioinformatia,
Perkembangan jaringan interne: juga mendukung berkembangnya bioinformatika,
Pengkalan data bioinformatika yang teshubungkan melalui intemet memudabkan imuwan dalam
mengumpulkan basil sekueasing ke dalam pangkalan data tersebut svta momperolehsckuens biologi
-ntpsrund12 blogspot co 141201 4/04/atko boinformatka-bioinformatika him!
Pengikut (1)
5
Arsip Blog
> 2015(1)
¥ 2014 (4)
Y Apri (4)
ARTIKEL
TENTANG
WEBSITE
ARTIKEL
BIOINFORMATI
KA
perkembangan
komputer dari
generasi 1-5
perkembangan
emptor dar
generas 5
» 2013 (1)
> 201216)
> 201419)
» 2010(9)
Mengenai Saya
rund
Lihat proft
lengkapku
18srarzote artikel: ARTIKEL SIOINFORMATIKA,
sebagai bahan analisis. Selain ita, penyebaran progiam-program aplikast boinformatika melalui
internet memudabkan ilmowan dalam mengakses propram-program ersebut dan kemudian
-memudaan pengembengannya
Pangkalan Data seiuens biologi dapat berupa pangkalan data primer untuk menyimpan
Ssckuens primer asam nuklea dan protia, pangkalan deta sskunder untuk menyimpan motif sekusns
protein, dan panpkalan data stuktur untuk menyimpan data truktur protein dan aan nukleat
Pngkalan dat lame untuk sekvens sam nukleat saat ini adalsh GenBiek (Amerika
Seriat), EMBL (the European Molecular Biology Laboratory Erop}, dam DDBS (DNA Data Bank of
Japan, Jepang). Ketiga pangkalan data tersebutbekerja sama dan berzkar data secara haran untole
‘menjaga keluasan cekupan masing-masing pangkslan data, Sumber wtams data sekuensasam nukleet
dala submasi (pengumpulan) langsung dart peneliiindvidusl, proyek seiwensing genom, dan
pendaflaan psten. Selsin berstsekvens asam oklet, enti dalam pangkalan dala sekuens asam
suklest pada umumnye mengandung informasi tenting jenis asim nukleat (DNA. ata RNA},
amaorgansme sumber asam nukleat tescbut, dan segalasesuatu yang betkaitan dengan sekuens
sam nulla esebut
Slain asam nukleat, beberapa contoh pangkalan data penting yang menyimpan sekuens
primer protein adalah PIR (Protein Information Resource, Ameriks Serkat), Swiss-Prot (Eropa),
ddan TrEMBL (Eropa), Ketigapangkalan data trseba telah digabungkan dalam UniProt, yang diansi
‘erutama oleh Amerika Seika. Eni dalam UniProt mengandung informasi tentang sekuens protein,
‘ama organisme sumber protein, pustaka yang bevksitn, dan komentar yang pada umumnye bers
penjelasan mengensi fangs’ protein tesebut
Perangkatbioinformatika yang berkatan erat dengan penggunaaa pangkalan data sekuens
Biolog ialah BLAST (Basic Local Alignment Search Too). Penelisuran BLAST (BLAST search pads
pangkalan data sckuens memungkinkan ilmuwan untuk mencari sekuens bak asam nukleat maupun
rotin yang misip dengan sckuens terenta yang dinilikinya. Hal ini berguna misalnya untule
‘menemukan gen sejenis pada beberapa organisme atau untuk memeriksa Keabsahan
hal sekuensingatau untuk memerkst fangs gen asi sekvensing. Algritma yang mendasari kerja
BLAST adalsh penyejaaranseaens
PDB (Protein Data Bank, Bank Data Protein) ialah pangkslan data tunggal yang
‘menyimpan model stukcu tiga dimensi proscin dan asam mukleat hail penentan cksperimental
(ongankristlogratisinar-X, spekaoskopi NMR, dan milroskopi elskvon). PDB eenyimpan data
steuktur sebagai Kooriat tiga dimensi yang menggamberkan possi stom-slom dalam proein atau
pun asam nuklea.
Diposting oleh und di 04.48 o
Tidak ada komentar:
Posting Komentar
Nasukkan komentar Anda...
Beri komentar sobagai
vt
Select profile... ¥
Posting Lebin Baru Beranda Posting Lama
Langganan: Posting Komentar (Atom)
1 Sekali
erdayakan oleh Blogger
-ntpsirund12 blogspot co 141201 4/04/artko boinformatka-bioiformatika him!srarzote ake: ARTIKEL BIOINFORMATIKA
hiupsrund2 blogspot co.id2014/04%artkol-bioinformatka-bioinformatka irl 39