Molekul Epidemiologi Ascariasis: Sebuah Perspektif Global pada Dinamika Penularan Ascaris di People

dan Babi. Martha Betson, 1,4 Peter Nejsum, 2 Richard P. Bendall, 3 Rinki M. Deb, 4 dan J. Russell
Stothard4. Penulis informasi ► catatan Pasal ► Hak Cipta dan Lisensi informasi ►. Artikel ini telah
dikutip oleh artikel lainnya di PMC. Pergi ke:

abstrak

Latar belakang. Para lumbricoides cacing gelang Ascaris menginfeksi 0,8 miliar orang di seluruh dunia,
dan Ascaris suum menginfeksi babi tak terhitung di seluruh dunia. Luasnya alam lintas transmisi Ascaris
antara babi dan host manusia dalam pengaturan geografis yang berbeda tidak diketahui, penjamin
penyelidikan.

Metode. Organisme Ascaris dewasa diperoleh dari manusia dan babi di Eropa, Afrika, Asia, dan Amerika
Latin. Barcode ditugaskan untuk 536 parasit berdasarkan analisis urutan sitokrom c oksidase I gen
mitokondria. Genotip 410 cacing juga dilakukan dengan menggunakan panel penanda mikrosatelit.
Filogenetik, populasi genetik, dan penugasan Bayesian metode yang digunakan untuk analisis.

Hasil. Ada ditandai pemisahan genetik antara cacing yang berasal dari host manusia dan orang-orang
yang berasal dari babi host. Namun, infeksi Ascaris manusia di Eropa adalah babi asal, dan ada bukti-
lintas transmisi antara manusia dan babi di Afrika. Diferensiasi genetik yang signifikan antara populasi
parasit dari berbagai negara, desa, dan host.

Kesimpulan. Dalam melakukan analisis terhadap variasi dalam populasi Ascaris dari babi dan host
manusia di seluruh dunia, kami menunjukkan bahwa silang-transmisi terjadi di negara berkembang dan
maju, bergantung pada potensi epidemiologi dan filogeografi lokal. Hasil kami memberikan wawasan
baru ke dalam dinamika transmisi dan spesiasi cacing Ascaris dari manusia dan babi yang penting untuk
program pengendalian.

Kata kunci: Ascaris, cacing gelang raksasa, genetika populasi, cacing soil transmitted, zoonosis, diabaikan
tropis penyakit, mikrosatelit, barcode

Ascariasis disebabkan oleh infeksi dengan raksasa lumbricoides cacing gelang Ascaris, dengan sekitar
760 juta kasus di seluruh dunia [1]. Meskipun infeksi yang sangat umum di negara-negara berkembang
di mana sanitasi dan kebersihan yang buruk, ascariasis menunjukkan distribusi kosmopolitan, dengan
kasus juga dijelaskan di negara maju [2-4]. Baru-baru ini memperkirakan bahwa ascariasis kontribusi
1,31 juta disability-adjusted tahun hidup dengan beban global penyakit [1, 5]. Terkait erat parasit Ascaris
suum menginfeksi babi tak terhitung di seluruh dunia dan sangat umum dalam sistem pertanian organik
dan luas [6, 7]. Infeksi pada babi yang terkait dengan kerugian produksi karena berkurangnya
pertumbuhan dan efisiensi konversi pakan rendah, dengan hati layak untuk konsumsi manusia [7].

Karena dewasa A. lumbricoides dan A. cacing suum secara morfologis dibedakan, ada banyak
perdebatan mengenai apakah mereka mewakili sama atau berbeda spesies [8, 9]. Selain itu, tingkat
alami lintas transmisi cacing antara babi dan host manusia tidak jelas [10]. Eksperimental cross-infeksi
telah menunjukkan bahwa A. suum dapat menginfeksi manusia dan bahwa A. lumbricoides dapat
menginfeksi babi, dengan preferensi tuan rumah dalam efisiensi infeksi pendirian [10, 11]. Meskipun
tidak ada penanda molekuler yang pasti telah ditemukan bahwa jelas bisa membedakan antara apa yang
disebut cacing manusia dan cacing babi, kombinasi penanda telah terbukti berguna [11]. Studi molekuler
telah menunjukkan bahwa infeksi Ascaris manusia di negara-negara maju sebagian besar adalah dari
babi asal [2-4, 12], sedangkan di negara-negara berkembang dari manusia ke manusia bersifat lebih
dominan transmisi [13-16]. Namun, di Cina, 14% cacing manusia berasal dari babi (yaitu, yang asal
zoonosis), menunjukkan bahwa silang-transmisi di daerah endemisitas mungkin lebih umum daripada
yang diperkirakan [17]. Hibrida antara manusia dan cacing babi telah terdeteksi, menunjukkan kawin
yang dapat terjadi antara Ascaris dari 2 spesies inang [18].

Penanda molekuler telah digunakan untuk menyelidiki perbedaan geografis dalam struktur populasi
Ascaris pada macroscale dan mikro. Secara keseluruhan, dukungan struktur data populasi Ascaris antar
negara [13, 18-21]. Namun, hasil yang lebih bervariasi pada skala lokal [14, 19, 20, 22], yang mungkin
mencerminkan perbedaan metodologi dan variasi dalam dinamika transmisi, migrasi, dan praktik
pertanian. Sampai saat ini, sampling Ascaris dari Afrika belum luas. Mengingat bahwa manusia muncul di
benua ini [23], adalah masuk akal bahwa telah terjadi hubungan yang panjang antara manusia dan
Ascaris parasit di sini.

Dalam penelitian ini, kami menggunakan mitokondria dan mikrosatelit spidol untuk menandai koleksi
besar cacing Ascaris dewasa diperoleh dari host manusia dan babi di daerah di mana A. lumbricoides
dianggap endemik atau nonendemic. Tingkat Ascaris lintas transmisi antara babi dan host manusia
diselidiki, seperti penataan geografis populasi parasit. Hasil penelitian ini memberikan wawasan baru ke
dalam asal-usul evolusi Ascaris pada manusia dan babi.

BAHAN DAN METODE

Ascaris Sampel, Etika Persetujuan, dan Persetujuan Informasi

Tuan rumah dan pengambilan sampel lokasi cacing dirangkum dalam Tabel Table1.1. Banyak sampel
dikumpulkan selama penelitian sebelumnya. Cacing tambahan diperoleh dari manusia di Inggris, Kenya,
dan Bangladesh dan dari babi di Inggris, Denmark, dan Tanzania. Persetujuan etika dan informed
consent diperoleh untuk koleksi cacing dari manusia [13, 14, 19, 20, 24, 26]. Enam belas cacing dari
manusia telah disampaikan kepada Laboratorium Mikrobiologi Klinis, Rumah Sakit Royal Cornwall, untuk
identifikasi rutin.

Tabel 1.

Tabel 1.

Karakteristik Ascaris Sampel Termasuk dalam studi ini

DNA Ekstraksi

Genomic DNA diekstraksi dari gonad worm atau jaringan otot [4, 19], dengan menggunakan metode
CTAB [27], yang Genomic Isolasi DNA Kit untuk Tissue dan Sel (nexttec, Hilgertshausen, Jerman), atau
DNeasy Darah dan Tissue Kit (Qiagen , Manchester, United Kingdom).

COX1 Sequencing dan mikrosatelit Amplifikasi

Sebuah fragmen 450 bp dari gen Ascaris COX1 diamplifikasi menggunakan primer As-Co1F dan As-Co1R
[15], dan fragmen disekuensing [19]. Delapan lokus mikrosatelit (ALAC07, ALAC09, ALGA48, ALTN04,
ALGA31, ALGA15, ALAC32, dan ALAC08) secara individual diperkuat oleh polymerase chain reaction dari
subset dari sampel (Tabel (Table1), 1), dan ukuran fragmen ditentukan, seperti diterbitkan di tempat lain
[28].

Analisis urutan
urutan COX1 berkumpul dan manual diedit menggunakan Sequencher v4.8 (Gene Kode Corporation,
Ann Arbor, MI). Urutan konsensus 383-bp diperoleh untuk setiap sampel dan selaras dengan MacClade
v4.08 (Sinauer Associates, Sunderland, MA). Runtuhnya v1.2 digunakan untuk mengidentifikasi sampel
dengan haplotipe identik. BLAST digunakan untuk mencari urutan yang tepat sesuai di GenBank dan
haplotipe baru diserahkan ke GenBank (nomor aksesi KF719094-151). Sebuah jaringan kekikiran-
merentang minimum dibangun di TCS v2.1. jModeltest v2.1.3 digunakan untuk menentukan yang
terbaik pas Model substitusi nukleotida [29], dengan menggunakan satu set data yang berisi semua
haplotipe yang unik dan pilihan haplotipe diidentifikasi sebelumnya (CavHap1, CavHap3, CavHap5, dan
CavHap13-9) [12] yang diperoleh dari GenBank. Model yang dihasilkan (Hasegawa-Kishino-Yano, dengan
tingkat gamma didistribusikan) digunakan untuk pembangunan pohon kemungkinan maksimum dalam
v5.05 MEGA, dengan dukungan yang diberikan oleh cabang bootstrap (1000 ulangan). Perangkat lunak
yang sama digunakan untuk menentukan p-jarak antara cluster.

Analisis mikrosatelit

Ukuran alel mikrosatelit ditentukan dengan menggunakan PeakScanner v1.0 (Terapan Biosystems).
PowerMarker v3.25 [30] digunakan untuk menentukan jumlah alel per lokus (NA), mengamati
heterosigositas (HO), dan diharapkan heterosigositas (HE). Jumlah alel swasta (NP) dan kekayaan alel
(RA) dihitung menggunakan fstat v2.9.3.2 [31]. Untuk memperhitungkan keterkaitan potensi parasit dari
individu host yang sama, perbedaan genetik antara populasi dianalisis dengan menggunakan analisis
hirarki prosedur varians molekul di Arlequin v3.5.1.2 [32]. Perkiraan berpasangan FST (ukuran
diferensiasi genetik) antara populasi yang dihasilkan, dan tes permutasi diferensiasi genetik (101 000
permutasi) dilakukan. Jarak genetik antara populasi parasit (Cavalli-Sforza dan jarak chord Edwards ')
[33] diperkirakan di PowerMarker dan divisualisasikan menggunakan tetangga bergabung algoritma
klasterisasi dengan bootstrap (1000 ulangan) untuk menentukan keandalan phenogram. Consense
(program PHYLIP v3.65) digunakan untuk menghitung pohon konsensus, yang divisualisasikan
menggunakan DrawTree (program PHYLIP v3.65). Hal ini dilakukan untuk populasi Ascaris dari berbagai
jenis tuan rumah, negara, desa, atau individu (di mana jumlah cacing per desa / host adalah ≥6).

Struktur penduduk juga disimpulkan dari kumpulan data mikrosatelit menggunakan analisis Bayesian
dalam STRUKTUR v2.3.4 [34, 35]. Model campuran asumsi frekuensi alel berkorelasi digunakan (burn-
panjang, 50 000, menjalankan panjang, 100 000). Nilai K dari 1 sampai 14 diuji, dan 20 berjalan
independen dilakukan untuk setiap K. Untuk menentukan kemungkinan paling benar nilai K, mean Ln P
(D) Nilai (perkiraan probabilitas posterior) ditentukan untuk masing-masing K dan bersekongkol K. Jika
tidak ada puncak yang jelas dalam plot, ΔK dihitung dan diplot terhadap K [36]. Analisis ini menunjukkan
bahwa 2 adalah kemungkinan paling benar nilai K. Untuk menguji apakah substructuring lanjut ada,
sampel ditugaskan untuk salah satu dari 2 kelompok berdasarkan nilai Q dari> 0,5 dalam output
STRUKTUR. Simulasi dijalankan lagi untuk masing-masing kelompok secara terpisah, pengujian nilai K
dari 1 sampai 10, dengan menggunakan burn-in dari 100 000 dan panjang lintasan dari 1 000 000 untuk
meningkatkan stabilitas antara berjalan. Kehadiran lintas transmisi dan hibrida antara babi dan cacing
manusia diselidiki menggunakan STRUKTUR, NewHybrids [37], dan BAPS [38], seperti yang dijelaskan di
tempat lain [17, 18].

Pergi ke:

HASIL

COX1 haplotype
Kami menganalisis urutan COX1 dari 319 cacing Ascaris dikumpulkan dari manusia dan 217 cacing
dikumpulkan dari babi (Tabel (Table1) .1). Sebanyak 75 haplotype yang berbeda diidentifikasi, 43 di
antaranya baru. Tabel Table22 merangkum haplotype kelimpahan oleh tuan rumah dan lokasi. H1
adalah yang paling banyak haplotype, khususnya di cacing dari manusia. H3 juga umum di Ascaris
manusia. Sebaliknya, H7, H28, H52, H64 dan berlimpah dalam cacing babi, tapi ini hanya H64 adalah unik
untuk Ascaris dari babi.

Tabel 2.

Tabel 2.

COX1 haplotype Kelimpahan, oleh Negara dan Host

Dalam mencakup jaringan kekikiran minimal semua haplotipe, 3 kelompok utama dapat diamati
(Gambar (Gambar 1) .1). Urutan Cluster C berbeda dengan> 8 pasangan basa dari haplotipe lain dan
tidak terhubung ke jaringan utama. Tidak ada pemisahan yang jelas haplotipe berdasarkan lokasi
geografis. Cluster A dan B yang terkandung haplotipe dari kedua babi dan cacing manusia, tapi ada
kecenderungan haplotipe dari Ascaris manusia mengelompok di sekitar H1 dan H3 dan orang-orang dari
babi Ascaris mengelompok di sekitar H7, H28, H52 dan. Cluster C hanya berisi 1 urutan dari cacing
manusia (dari Inggris). Sebuah pohon kemungkinan maksimum dibangun atas dasar haplotipe ini dan
termasuk tambahan, baru-baru ini diterbitkan urutan Ascaris COX1 [12] (Tambahan Gambar 1). Pohon
itu mengungkapkan hal yang sama 3 kelompok urutan Ascaris dengan dukungan bootstrap kuat untuk
pemisahan antara 3 kelompok. Berarti p-jarak yang 2,8% antara kelompok A dan B, 5,4% antara
kelompok A dan C, dan 4,2% antara kelompok B dan C. Tak satu pun dari urutan dari ascarids lainnya
jatuh ke kelompok-kelompok ini. Sedangkan kelompok A dan B yang terkandung urutan dari Ascaris
dikumpulkan dari kedua spesies inang dan semua 4 benua, kluster C hanya berisi urutan dari Eropa dan
Afrika.

Gambar 1.

Mencakup jaringan TCS minimum dari semua haplotype COX1 diidentifikasi. Sebuah baris menunjukkan
1 perubahan dasar. Sebuah titik hitam menunjukkan haplotype nonsampled atau punah. Ukuran oval
merupakan perwakilan dari jumlah sampel dengan haplotype tertentu. Biru ...

Analisis mikrosatelit

Data mikrosatelit yang dianalisis dari 246 manusia dan 164 cacing babi (Tabel (Table1 .1)). Keragaman
mikrosatelit alel dikelompokkan berdasarkan lokus, spesies tanaman inang, dan lokasi yang diringkas
dalam Tabel 1. Tambahan kekayaan alel Berarti agak lebih tinggi pada Ascaris dari host manusia
daripada yang dari babi (P = 0,062; 15 000 permutasi); ini lebih jelas ketika Ascaris dari manusia di
Inggris diklasifikasikan sebagai babi Ascaris (P = 0,041). Tidak ada perbedaan dalam diamati atau
diharapkan heterosigositas antara manusia dan babi Ascaris (HO, P = 0,426; HE, P = 0,200).

Aliran genetik antara populasi Ascaris dari host dan lokasi yang berbeda diselidiki melalui estimasi nilai
FST berpasangan dan uji permutasi diferensiasi genetik (Tabel (Table3) .3). Ada bukti diferensiasi genetik
antara hampir semua populasi Ascaris. Namun, perbedaan antara cacing dari babi sympatric dan host
manusia lebih tinggi dibandingkan antara populasi dari host yang sama di wilayah geografis yang
berbeda, kecuali cacing manusia dari Inggris. Ketika jarak genetik antara populasi Ascaris divisualisasikan
menggunakan pohon konsensus tetangga-bergabung, populasi babi dari host berkumpul bersama-sama
dan populasi dari manusia dikelompokkan bersama-sama, terlepas dari Inggris cacing manusia, yang
bergerombol dengan cacing babi (Gambar (Figure22A). Populasi adalah kemudian dibagi lagi atas dasar
desa atau host individu, dan jarak genetik ditentukan (Gambar (Figure22B). pembagian utama yang
sama antara cacing dari babi dan host manusia diamati, dengan pengelompokan lebih lanjut oleh Ascaris
lokasi. dari manusia di Uganda dibagi menjadi 2 kelompok utama, satu berisi cacing dari Habutobere dan
Musezero dan cacing yang mengandung dari desa lain. cacing dari Bangladesh dikelompokkan dengan
orang-orang dari Zanzibar. cacing Ascaris dari manusia di Inggris muncul paling mirip dengan cacing dari
babi di Tanzania dan Denmark. populasi Ascaris dari babi host yang berbeda di Inggris dibedakan secara
genetik.

Tabel 3.

Tabel 3.

Berpasangan Diferensiasi Antara Ascaris Populasi Dari Host berbeda dan Negara, Berdasarkan data
mikrosatelit

Gambar 2.

Gambar 2.

A-B, Cavalli-Sforza dan Edwards 'chord jarak antara populasi Ascaris dari jenis host yang berbeda dan
lokasi direpresentasikan dalam tetangga konsensus bergabung pohon berdasarkan 8 penanda
mikrosatelit. A, Populasi dikelompokkan berdasarkan jenis host dan ...

Analisis Bayesian

Analisis Bayesian dari data mikrosatelit, menggunakan STRUKTUR, digunakan untuk menetapkan cacing
untuk cluster tanpa pengetahuan sebelumnya dari jenis host atau lokasi pengambilan sampel. Atas
dasar probabilitas posterior, nilai sebenarnya dari K (yaitu, jumlah cluster) kemungkinan besar 2. bar
petak dari perwakilan STRUKTUR run ditunjukkan pada Gambar Figure22C. Itu jelas bahwa 2 cluster
berhubungan dengan tuan rumah jenis, selain cacing dari manusia di Eropa, yang terutama
mengelompok dengan cacing dari babi. Untuk menyelidiki substructuring lebih lanjut dalam kumpulan
data, cacing yang ditunjuk untuk salah satu dari 2 kelompok berdasarkan output STRUKTUR, dan
simulasi dijalankan lagi untuk masing-masing kelompok secara terpisah. Struktur tambahan itu jelas,
dengan K kemungkinan 4 untuk masing-masing kelompok. 4 cluster untuk cacing manusia longgar
berhubungan dengan lokasi (Tabel (Tabel 4): 4): Uganda (Musezero dan Habutobere), Uganda (desa
lain), Zanzibar, dan Bangladesh. Namun, cluster 3 dan 4 keduanya mengandung cacing dari Zanzibar dan
Bangladesh. Untuk kelompok terutama terdiri dari cacing babi (Tabel (Tabel 4), 4), cluster juga
berhubungan dengan wilayah geografis: Inggris (cluster 1), Denmark (cluster 2), Uganda (cluster 3), dan
Tanzania (cluster 4 ). Cacing manusia dari Denmark dan Inggris bersama genom terutama dengan cacing
babi dari Denmark (cluster 2), dan cacing manusia dari Uganda terutama dengan cacing babi dari
Uganda (cluster 3).

Tabel 4.

Tabel 4.

Proporsi Setiap Ascaris Penduduk Berasal Dari Terutama Manusia dan Babi Itu Apakah Ditugaskan untuk
Setiap 4 Cluster Diidentifikasi di STRUKTUR
Untuk menyelidiki apakah ada kasus cross-transmisi dan hibridisasi antara cacing dari host manusia dan
cacing babi asal, simulasi menggunakan BAPS, NewHybrids, dan STRUKTUR dilakukan (Tabel (Table5) .5).
Hibrida diidentifikasi oleh STRUKTUR tetapi tidak oleh BAPS atau NewHybrids, menunjukkan bahwa ini
mewakili positif palsu. Semua program diidentifikasi 12 cacing dari manusia di Inggris dan Denmark dan
1 cacing dari manusia di Uganda sebagai milik cluster babi. Selain itu, 2 Ascaris babi di Inggris dan 1
cacing dari Uganda ditugaskan untuk cluster manusia. Cacing ini kemungkinan merupakan contoh silang
transmisi antara manusia dan babi (Tambahan Tabel 2).

Tabel 5.

Tabel 5.

Ringkasan STRUKTUR, BAPS, dan NewHybrids Analisis

Pergi ke:

PEMBAHASAN

Di sini, kita menggambarkan analisis molekuler skala besar pertama manusia dan babi Ascaris dari lokasi
yang berbeda di seluruh dunia menggunakan mitokondria dan penanda mikrosatelit termasuk
pengambilan sampel yang lebih baik dari isolat Afrika. Kami menemukan perbedaan genetik yang kuat
antara Ascaris berasal dari host manusia dan babi. Namun, ada juga bukti lintas transmisi Ascaris antara
babi dan manusia, dengan hampir semua infeksi Ascaris manusia Eropa yang berasal dari babi dan
zoonosis sporadis dan transmisi anthroponotic di daerah endemisitas.

Para haplotype COX1 diidentifikasi menambah database tumbuh urutan Ascaris COX1 dari manusia dan
babi host [12, 15, 19, 20, 39, 40]. Mereka jatuh ke dalam 3 kelompok, yang sesuai dengan cluster A-C,
diidentifikasi sebelumnya [12, 40]. P-jarak antara klaster C dan kelompok B dan A yang sangat tinggi
tetapi masih lebih rendah dari 10% yang biasanya terlihat untuk urutan COX1 antara spesies cacing yang
berbeda [41]. Selain itu, perlu dicatat bahwa keberadaan 3 cluster taksonomi tidak didukung oleh data
mikrosatelit, menyoroti sifat kompleks warisan mitokondria dan perangkap yang terkait dengan
penggunaan penanda tunggal untuk studi epidemiologi molekuler [42]. Sampling sangat sering H1 dan
posisi sentral dalam klaster A menunjukkan bahwa ini mungkin merupakan haplotype leluhur, yang
berasal di Afrika, yang kemudian menyimpang dan menyebar. Selain itu, kami tidak menemukan
pemisahan tegas antara haplotype COX1 dari cacing manusia atau babi asal. Namun demikian, ada
konstelasi haplotipe Ascaris berasal terutama dari 1 spesies inang, menunjukkan bahwa ada hambatan
lokal untuk pertukaran materi genetik antara babi dan Ascaris manusia dan adaptasi terhadap spesies
host tertentu. Menariknya, haplotipe dari Ascaris manusia di Inggris dan Denmark klaster praktis secara
eksklusif dengan cacing babi, menunjukkan asal zoonosis untuk infeksi ini.

Menggunakan pendekatan yang berbeda untuk analisis data mikrosatelit, kami mengamati perbedaan
genetik antara manusia dan babi Ascaris di negara berkembang. Hasil ini sesuai dengan temuan dari
sejumlah penelitian yang diterbitkan [4, 13, 16-18, 43]. Sebaliknya, Ascaris dari manusia di Eropa
berkumpul dengan cacing babi daripada cacing manusia dari daerah lain, memberikan bukti lebih lanjut
bahwa infeksi Ascaris adalah zoonosis di negara maju [2-4, 12]. Dengan menggunakan analisis Bayesian,
tidak ada cacing babi asal ditemukan pada manusia dari Zanzibar atau Bangladesh, yang mengejutkan
karena keduanya adalah negara-negara Muslim di mana ternak babi jarang. Di Uganda, di mana sekitar
18% dari rumah tangga memelihara babi [44], 1 dari 143 cacing manusia (0,7%) adalah babi asal dan 1
dari 56 cacing babi (1,8%) adalah berasal dari manusia. Di Cina, 13,9% cacing (n = 137) pada manusia
yang zoonosis dan 0,8% cacing pada babi (n = 121) yang anthroponotic [17]. Perbedaan tingkat
penularan zoonosis antara 2 negara kemungkinan merupakan variasi praktik pertanian, kotoran
pembuangan, dan kontak manusia-babi. Menariknya, ada 2 cacing pada babi dari Inggris yang
bergerombol dengan cacing manusia, meskipun satu memiliki COX1 haplotype babi seperti (H64).
Parasit Ascaris tersebut berasal dari rumah potong hewan organik di Bedfordshire, tapi lokasi
peternakan (s) di mana babi dipelihara tidak diketahui. Ada kemungkinan bahwa siklus penularan Ascaris
manusia ada pada babi, hasil yang sangat mengejutkan yang menjamin penyelidikan lebih lanjut. Tidak
ada contoh hibridisasi antara babi dan cacing manusia ditemukan di setiap lokasi. Sebaliknya, 7,8%
cacing di Cina (n = 258) dan 4% di Guatemala (n = 24) diidentifikasi sebagai hibrida menggunakan 23
penanda mikrosatelit, yang menunjukkan potensi untuk pertukaran materi genetik antara populasi babi
dan Ascaris manusia [17, 18]. Fakta bahwa kami tidak menemukan bukti hibridisasi mungkin
mencerminkan variasi dalam dinamika penularan cacing Ascaris di lokasi yang berbeda. Atau, 8 penanda
kita gunakan tidak dapat memberikan resolusi yang cukup untuk mengidentifikasi hibrida.

Sebagai antisipasi [4, 13, 18, 20], kami menemukan perbedaan genetik yang signifikan antara populasi
Ascaris dari berbagai negara. Penataan tambahan populasi parasit di tingkat desa atau tuan rumah
masing-masing juga jelas, terutama di Uganda di mana sampel terbesar cacing berasal. Hal ini mungkin
berkaitan dengan distribusi overdispersed terdokumentasi dengan baik dan pengelompokan infeksi
Ascaris pada tingkat rumah tangga [22, 45]. Substructuring genetik di tingkat tuan rumah masing-masing
juga telah diamati di Guatemala dan Denmark [4, 14]. 4 cluster diprediksi oleh analisis Bayesian untuk
cacing manusia terutama berhubungan dengan negara, meskipun cacing Uganda juga berkerumun oleh
desa. Menariknya, sedangkan klaster 4 terkandung terutama cacing dari Bangladesh, cacing dari
Zanzibar juga ditemukan di sini. Demikian pula, Zanzibar dan beberapa cacing Bangladesh ditugaskan
untuk klaster 3. ini mungkin mencerminkan sejarah panjang dan lalu lintas yang sedang berlangsung
antara Zanzibar dan anak benua India.

Karena pengambilan sampel yang lebih besar, penelitian kami memberikan gambaran yang lebih baik
dari keragaman genetik Ascaris di Afrika. Karena evolusi hominid awal diperkirakan memiliki tempat
diambil di sini [23], adalah mungkin bahwa telah terjadi lama hubungan antara manusia dan ascarids di
benua ini dan bahwa manusia bermigrasi dari Afrika memfasilitasi penyebaran proto-Ascaris . Telur
ascarid tertua yang ditemukan sejauh ditemukan di Perancis [46]. Namun, Afrika kurang terwakili dalam
catatan arkeologi dan studi phylogeographical sejarah lebih lanjut diperlukan untuk menentukan di
mana Ascaris berasal. Jelas bahwa, ascariasis telah sangat terkait dengan manusia selama ribuan tahun,
baru-baru ini ditunjukkan oleh infeksi ditemukan dalam tubuh Raja Richard III [47].

Semakin tua asal usul evolusi Ascaris pada host manusia dan babi yang dilombakan. Tidak jelas apakah
A. lumbricoides dan A. suum adalah spesies terpisah yang berasal dari satu nenek moyang, beberapa
peristiwa kolonisasi tuan rumah terjadi setelah pembagian geografis populasi tuan rumah [18], atau A.
lumbricoides dan A. suum benar-benar satu spesies dengan varian daerah [8]. Diskusi ini tergantung
pada definisi yang konsisten dari "spesies." Mendefinisikan spesies sebagai "kelompok aktual atau
potensial kawin silang populasi alami yang reproduktif terisolasi dari kelompok lain seperti" [48], kami
sarankan A. lumbricoides dan A. suum 2 terpisah spesies, karena ada tingkat tinggi diferensiasi genetik
antara babi dan cacing manusia di daerah sympatric. Meskipun hibrida antara cacing babi yang
diturunkan dan manusia berasal telah diidentifikasi, ini jarang dan cenderung memiliki penurunan
kebugaran, jika penataan penduduk antara tuan rumah tidak akan diamati [11]. Mengenai beralih tuan
rumah, hasil kami kurang meyakinkan. Seperti Anderson et al, tetapi berbeda dengan Criscione et al,
kami menemukan bahwa, dalam arti luas, perbedaan antara cacing didasarkan terutama pada afiliasi
tuan rumah, dengan diferensiasi lebih lanjut berdasarkan lokasi geografis [13]. Ini bisa menunjukkan
host beralih sejarah tunggal populasi Ascaris menginfeksi babi atau manusia. Namun, data mitokondria
dan fakta bahwa tidak ada penanda diagnostik tunggal telah diidentifikasi untuk membedakan antara A.
lumbricoides dan A. suum mendukung model alternatif beberapa switch tuan rumah dari waktu ke
waktu, dengan penggabungan selanjutnya populasi cacing dalam 2 host [18] . Penjelasan ini mungkin
lebih konsisten dengan sejarah domestikasi babi di seluruh Eurasia [49].

Andalan saat ini program pengendalian terhadap ascariasis pada manusia adalah kemoterapi preventif,
yang melibatkan pengobatan periodik prasekolah dan usia sekolah anak-anak di komunitas Ascaris-
endemik dengan obat anthelmintik, dan ada prospek nyata bagi penghapusan lokal penyakit dengan
pengobatan skala-up [50 ]. Di daerah di mana itu adalah umum bagi rumah tangga untuk menjaga babi
dan / atau di mana kotoran babi digunakan sebagai pupuk, bagaimanapun, kemajuan ke arah
penghapusan dapat terhambat jika ada signifikan cross-over transmisi. Dengan demikian, dengan skala
up mendatang kemoterapi preventif, sangat mungkin bahwa sumber penularan zoonosis akan menjadi
semakin penting, dan, jika demikian, mereka harus diperhitungkan oleh model matematika saat ini
sedang dikembangkan untuk mengeksplorasi stabilitas dan dinamika titik akhir kontrol.

Kesimpulannya, hasil kami memberikan wawasan baru ke dalam dinamika transmisi dan spesiasi Ascaris
dari manusia dan babi. Meskipun A. lumbricoides dan A. suum tampak 2 spesies yang terpisah atas
sebagian dari jangkauan mereka, proses spesiasi tidak begitu jauh maju bahwa mereka sepenuhnya tuan
rumah tertentu atau dapat bertukar informasi genetik, dan lintas-transmisi antara babi dan manusia
host terjadi di seluruh dunia. Tingkat lintas transmisi cenderung bergantung pada pertanian dan
kebersihan setempat. Namun, ada kemungkinan bahwa kita meremehkan potensi zoonosis A. suum,
karena kami hanya menganalisis cacing dewasa (yaitu, Ascaris yang menyelesaikan migrasi hepato-
trakea dan didirikan pada usus). Besar kemungkinan A. suum umumnya mengalami migrasi larva visceral
pada manusia, tetapi karena preferensi tuan rumah yang paling larva dikeluarkan pada kembali ke usus.
Transmisi zoonosis dan anthroponotic dapat menyebabkan morbiditas yang lebih besar karena host
kurang baik disesuaikan dengan parasit. Selain itu, pertukaran potensi informasi genetik antara A.
lumbricoides dan A. suum dapat memungkinkan penyebaran obat-resistensi dan virulensi gen antara
populasi parasit pada host yang berbeda, meskipun tidak tertutup kemungkinan bahwa jika manusia
diperlakukan tapi babi yang tidak, populasi parasit tidak diobati akan bertindak sebagai tempat untuk
berlindung, menipiskan alel terkait dengan perlawanan.