Semakin dekat kepolaran antara sampel dengan eluen

maka sampel akan semakin terbawa oleh fase gerak

tersebut. Prinsip pemisahan noda adalah berdasarkan
kepolarannya sehingga menghasilkan kecepatan yang
berbeda-beda saat terpartisi dan terjadilah
pemisahan.Untuk memisahkan noda dengan sebaik-
baiknya maka digunakan kombinasi eluen non polar dan
polar.