NMR structural determination of unique invertebrate
glycosaminoglycans endowed with medical properties
Los glicosaminoglicanos (GAG) son polisacáridos sulfatados de estructura compleja dotados de numerosas funciones biomédicas. Aunque se distribuyen de manera ubicua en vertebrados, los GAG también pueden ocurrir en ciertos invertebrados terrestres o marinos. La espectroscopia de resonancia magnética nuclear (RMN) ha sido la técnica analítica empleada principalmente en la caracterización estructural de GAG de cualquier fuente. El objetivo de esta revisión es ilustrar la aplicación de la RMN en la determinación estructural de algunos ejemplos representativos de GAG de invertebrados de estructuras únicas y dotados de acciones terapéuticas. Se trata del sulfato de condroitina fucosilado holotúrico, el sulfato de acharan aislado del caracol Achatina fulica, los sulfatos de dermatan con distintos patrones de sulfatación extraídos de las especies ascidianas, el sulfato de heparan sulfurónico sulfatado aislado del gastrópodo Nodipecten nodosum y la heparina hibrida Molécula de heparán sulfato obtenida del camarón Litopenaeus vannamei. Estos GAG de invertebrados exhiben estructuras distintas en comparación con los extraídos de GAG de mamíferos. Las distintas estructuras de los GAG de invertebrados conducen también a diferentes mecanismos de acción en comparación con los estándares GAG de mamíferos. Los GAG de invertebrados comprenden candidatos terapéuticos prometedores en la lucha contra las enfermedades. La solución NMR ha desempeñado un papel fundamental en esta investigación, descubrimiento y desarrollo de fármacos basados en carbohidratos. Al igual que en los análisis estructurales de GAG de mamíferos, la solución por espectroscopia de resonancia magnética nuclear (RMN) sola o combinada con otras técnicas ha sido el método preferido utilizado para caracterizar las moléculas de invertebrados. Aquí, se analiza este análisis basado en RMN de GAG de estructuras únicas encontradas exclusivamente en animales invertebrados con el fin de ofrecer una guía técnica directa a futuras investigaciones en el área. También se proporciona una discusión sobre las implicaciones medicinales de estas distintas estructuras de GAG de invertebrados para resaltar sus beneficios potenciales en tratamientos futuros y la profilaxis de ciertas enfermedades. Holothurian FucCS La primera evidencia que describe la existencia de que los pepinos de mar (Echinodermata, Holothuroidea) podrían sintetizar un GAG diferente en su pared corporal parece provenir de la referencia 24. A través de los análisis de composición de monosacáridos, se informó que se compuso el nuevo GAG extraído de la especie holotúrica Ludwigothurea grisea de cantidades equimolares de unidades de aL-fucopiranosa (Fucp), bD-GlcA y bD-GalNAc. En un trabajo adicional del mismo grupo, los investigadores ampliaron la caracterización estructural de este GAG holotúrico mediante el uso de espectroscopía de RMN combinada con análisis de metilación. En este trabajo, los autores han confirmado inequívocamente que este nuevo GAG de L. grisea está compuesto por unidades Fucp con ramificación 3 ramificadas a las unidades GlcA, que junto con las unidades GalNAc forman un esqueleto similar a CS como se ve comúnmente en CSs de mamíferos ( Figura 1). Este nuevo GAG holoturiano se denominó entonces sulfato de condroitina fucosilado (FucCS). La evidencia que respalda la aparición fisiológica de FucCS vinculada a un núcleo proteico como se ve en los proteoglicanos compuestos por GAG se incrementó de manera inclusiva. Se observó que la estructura de FucCS de L. grisea era muy heterogénea, y la propuesta definitiva para su estructura se alcanzó solo en dos trabajos adicionales del mismo grupo. Una revisión exhaustiva sobre los antecedentes y la historia de este GAG de pepino de mar se ha publicado recientemente. La composición y las cantidades de unidades actualmente aceptadas para FucCS de L. grisea así como para FucCS obtenidos de otras especies de pepino de mar estudiadas hasta ahora se muestran en la Tabla 1. Estas estructuras de FucCS se determinaron principalmente mediante espectroscopia de RMN en estado líquido. A continuación, ilustro la caracterización estructural basada en RMN de FucCS de tres de estas especies holoturias, en base a la referencia pendiente 15. Se presenta una breve discusión sobre las actividades médicas y los requisitos estructurales de FucCS en algunas de estas actividades después del análisis de RMN. La Fig. 1 muestra los espectros de RMN unidimensionales (1D) 1H (paneles AeC) y 13C (paneles DeF) asignados parcialmente de FucCSs aislados de tres especies de pepinos de mar: Isostichopus badionotus, Stichopus tremulus y Holothuria vagabunda. Las señales a 1.21 y 1.89 ppm se derivan respectivamente de los protones de metilo de Fucp (CH3) y grupos acetilo de GalNAc (COCH3). Las señales entre 5.1 y 5.6 ppm pertenecen a los átomos anoméricos de las unidades de Fucp con diversos sulfatos. El espectro de RMN 1H de FucCS de I. badionotus muestra señales anoméricas a 5.23 y 5.56 ppm (Fig. 2A). Esto indica la presencia de unidades Fucp 4-mono-sulfatadas (Fuc4S) y 2,4-di-sulfatadas (Fuc2,4S) (Tabla 2). Los valores integrales de estos picos muestran que el contenido de sulfatación es de 4.1% y 95.9% para unidades mono y disulfatadas, respectivamente (Tabla 1). El espectro 1H de FucCS de S. tremulus muestra tres señales claras en la región anomérica (Fig. 2B). Los picos de 5.23 y 5.56 ppm pertenecen a las unidades Fuc4S y Fuc2,4S, respectivamente (Tabla 2). La señal a 5,33 ppm se asignó al Fucp 3,4-disulfatado (Fuc3,4S) en base a los estudios de FucCS obtenidos de Stichopus japonicus y L. grisea. FucCS fromS. el trémulo se compone de 24.8%, 22.4% y 52.8% de Fuc4S, Fuc2,4S y Fuc3,4S, respectivamente (Tabla 1). En la región 1H anomérica de FucCS de H. vagabunda (Fig. 2C), los picos a 5.17 y 5.23 ppm pertenecen a la unidad Fuc4S, mientras que los de 5.33 y 5.56 ppm pertenecen a las unidades Fuc3,4S y Fuc2,4S, respectivamente. La señal a 5.09 ppm se asigna a una unidad de fucosa no sulfatada (Fuc0S). En base a los valores integrales de estos picos, el patrón de sulfatación de las unidades de Fucp de cadena lateral en FucCS de H. vagabunda es 25.6%, 50.2%, 15.8% y 8.4% para Fuc0S, Fuc4S, Fuc2,4S y Fuc3,4S ( Tabla 1). Los diferentes patrones de sulfatación de las ramas de Fucp pueden afectar los desplazamientos químicos de los protones de metilo en esta unidad propia, pero también en unidades GalNAc adyacentes (paneles de inserto superiores de la Fig. 2). Por ejemplo, I. badionotus FucCS tiene una señal principal de protones de metilo a 1.19 ppm (Fig. 2A), que puede asignarse fácilmente a un Fuc2,4S. Los FucCS de S. tremulus y H. vagabunda presentan un perfil de señal de metilo de Fucp complicado (Fig. 2B y C) similar a sus señales de protones anoméricos, lo que indica patrones de sulfatación complejos de sus unidades de Fucp. Las señales de protones de metilo de los acetilos de GalNAc (1.8e2.0 ppm) también son diferentes entre los tres FucCS. Se encontró un pico importante en 1.89e1.93 ppm en los espectros de FucCSs de S. tremulus y I. badionotus, lo que indica que comparten un patrón de sulfatación similar en las unidades GalNAc dentro de sus esqueletos de columna vertebral. Sin embargo, H. vagabunda FucCS proporciona señales de metilo de GalNAc más complejas debido al complejo patrón de sulfatación de sus unidades de GalNAc de composición, como se explica a continuación. Los espectros 1D 13C RMN de FucCSs (Fig. 2DeF) no muestran ninguna diferencia aparente en los patrones de sulfatación de las ramas de Fucp. Sin embargo, las señales principales fueron útiles para asignar la secuencia del esqueleto CS ya que estas señales de carbono son muy similares a las presentes en el espectro de un condroitín sulfato E estándar (CS-E), 33 y en el FucCS de S. japonicus37, que contiene el CS-E como su columna vertebral (Tabla 1). En CS E, el GalNAc está sulfatado en 4 y 6 Oposiciones. Una señal a 67.5 ppm, presente en los tres espectros, proviene de la 6-sulfatación en GalNAc. La señal relacionada con la 4-sulfatación es difícil de asignar ya que se encuentra en la región de superposición de 70e80 ppm. H. vagabunda FucCS da un espectro complejo (Fig. 2F) y la señal adicional a 62.5 ppm se indica de un C6 no sulfatado en las unidades GalNAc de composición. En la región de señal 13C anomérica, I. badionotus FucCS (Fig. 2D) muestra tres señales claras con dC a 97.6, 99.8 y 104.1 ppm, derivadas de los tres tipos de monosacáridos constituyentes, Fucp, GalNAc y GlcA, respectivamente. Esto es consistente con el informe anterior.14 Sin embargo, aunque las señales de GalNAc y GlcA también fueron claramente reconocibles en los espectros de los otros dos FucCS (Fig. 2E, F), sus señales anoméricas de Fucp fueron bastante complicadas ya que los patrones de sulfatación son más Ncomplex en estos FucCSs que en I. badionotus FucCS. FucCS de los pepinos de mar puede exhibir efectos beneficiosos en varios sistemas biomédicos como la coagulación, 14,15,27,38,39 trombosis, hemodiálisis 39e44, 45 aterosclerosis, 46,47 crecimiento celular, 48 angiogénesis, 49 fibrosis, 50 tumores e inflamación. , 51 infecciones virales, 52,53 hiperglucemia, 54 enfermedades infecciosas (malaria), 55 y nefropatía diabética.56 En la mayoría de estos sistemas, las unidades Fucp sulfatadas desempeñan un papel esencial. La defucosilación puede abrogar muchas de estas funciones. Además de la presencia de Fucp, sus patrones de sulfatación también parecen contribuir a la función. Sin embargo, la anticoagulación y la antitrombosis son las únicas actividades de FucCS en las que se han identificado los patrones de sulfatación de las unidades de composición de Fucp para la mejor respuesta. El esclarecimiento de este requisito estructural solo en las actividades relacionadas con el sistema cardiovascular parece ser una consecuencia natural de la gran cantidad de trabajo relacionado con los efectos de FucCS en este sistema. La gran demanda de nuevos anticoagulantes y antitrombóticos es proporcional al número de muertes y los pacientes reportados con complicaciones relacionadas con el sistema de corazón y sangre. teniendo el patrón de 2,4-di-sulfatación. La Tabla 1 muestra el potencial anticoagulante de las FucCS estudiadas hasta ahora. Las mediciones se realizaron a través del método del tiempo de tromboplastina parcial activada (aPTT). Los tiempos más largos logrados a través de este experimento in vitro representan los mejores potenciales anticoagulantes. Es evidente que las FucCS de la especie I. badionotus, Thelenata ananas y Apostichopus japonicus tienen las mejores respuestas. Los niveles de unidades de Fuc2,4S en estos tres FucCS son altos cuando se comparan con los FucCS de las otras especies holoturias. Fig. 1. Representación estructural de los FucCS holoturios (monosacáridos negros y rojos) y los CS regulares (monosacáridos negros) como se ve en los mamíferos. Son a-L-fucopiranosa (L-Fucp) en rojo, ácido b-D glucurónico (D-GlcA) y N-acetil-b-Dgalactosamina (D-GalNAc). Tenga en cuenta que la GAG holoturiana se diferencia de la contraparte de los mamíferos solo por la adición de la unidad de fucosilo sulfatado resaltada en rojo (para la interpretación de las referencias al color en la leyenda de esta figura, el lector hace referencia a la versión web de este artículo). Fig. 2. Espectros de RMN de 1D 1H (AeC) y 13C (DeF) de FucCS de tres especies de pepinos de mar: Isostichopus badionotus (A y D), Stichopus tremulus (B y E) y Holothuria vagabunda (C y F). Modificado con permiso del trabajo. Tabla 1. Desplazamientos químicos de RMN 1H de los residuos de fucosa en FucCSs.