Energi dan enzim: pengantar jalur metabolisme.

Dalam bab ini Anda akan belajar bagaimana enzim

menggunakan energi untuk menggerakkan kimia kehidupan, melihat pada pertanyaan energi, apa yang dengan
senang hati memberi energi pada reaksi kimia, dapatkah energi kimia mendorong reaksi nonspontaneus, melihat
enzim, bagaimana enzim membantu mempercepat laju reaksi kimia , faktor apa yang mempengaruhi fungsi
enzim, bagaimana enzim bekerja bersama dalam jalur metabolisme.

Sel bersifat dinamis, vesikel memindahkan muatan dari alat golgi ke membran plasma dan
tujuan lain, enzim mengkatalisasi sintesis susunan makromolekul yang kompleks, dan jutaan
protein mengangkut ion dan molekul melintasi membran sel. Aktivitas ini berubah secara
konstan sebagai respons terhadap sinyal dari sel lain atau lingkungan. Apa yang mendorong
semua tindakan ini? jawabannya adalah energi dua kali lipat dan enzim. Karena tetap hidup
butuh kerja, tidak ada kehidupan tanpa energi. Kehidupan, pada tingkat paling dasar, terdiri
dari reaksi kimia yang dikatalisis oleh enzim. Dengan menggunakan enzim untuk
mengarahkan reaksi mana yang terjadi dan mana yang tidak, kehidupan memiliki ciri
pembeda dari urutan keteraturan dari lingkungan yang tidak teratur secara alami.
Bab ini adalah tentang bagaimana enzim bekerja untuk membantu sel memperoleh dan menggunakan energi. Ini
juga merupakan pengantar jalur metabolisme Anda untuk memerintahkan serangkaian reaksi kimia yang
membangun atau memecah molekul tertentu.
1. Apa yang terjadi pada energi dalam reaksi kimia?
Ketika ahli biologi mempertimbangkan energi dalam reaksi kimia, mereka sering menggunakan istilah energi
bebas untuk menggambarkan jumlah energi yang tersedia untuk melakukan pekerjaan. Ingatlah bahwa ada dua
jenis energi: energi kinetik dan potensial.
Energi kinetik adalah energi gerak. Ada beberapa bentuk energi kinetik yang berbeda pada tingkat molekuler,
energi gerak disebut thermal ebergy. Energi potensial adalah energi yang dikaitkan dengan posisi atau
konfigurasi. Dalam molekul, ini disebut sebagai energi kimia dan disimpan dalam posisi elektron.
2. Reaksi kimia melibatkan transformasi energi
keberadaan dua jenis energi tidak berarti bahwa energi dikunci menjadi tipe kinetik, atau potensial. Energi
sering diubah dari satu jenis ke jenis lainnya. Untuk mengantar titik ini pulang, pertimbangkan molekul air yang
duduk di atas air terjun.
Langkah 1: molekul memiliki energi potensial, karena posisinya.
Langkah 2: ketika molekul melewati air terjun, energi potensinya dikonversi menjadi energi gerak kinetik.
Langkah 3: ketika molekul mencapai batuan di bawahnya, ia mengalami perubahan energi potensial karena telah
mengubah posisi. Perbedaan energi potensial ditransformasikan ke dalam jumlah yang sama dari energi kinetik
yang dimanifestasikan dalam berbagai bentuk: energi mekanik, yang cenderung memecah batuan, panas (energi
thernal). Yang meningkatkan temparatur batu dan air itu sendiri, dan suara.

Jumlah energi potensial dalam elektron didasarkan pada posisinya relatif terhadap elektron
lain dan proton dalam inti atom terdekat. Jika sebuah elektron dekat dengan muatan negatif
pada elektron lain dan jauh dari muatan positif dalam inti, ia memiliki energi potensial tinggi.
Secara umum, energi potensial dari suatu molekul adalah fungsi dari cara elektronnya
dikonfigurasikan atau positloned.
Sebuah elektron di kulit elektron terluar analog dengan molekul air di atas air terjun. Jika
elektron jatuh ke kulit yang lebih rendah, energi potensial diubah menjadi energi gerak
kinetik. Setelah elektron menempati kulit elektron yang lebih rendah, ia mengalami
perubahan energi potensial. Seperti yang ditunjukkan panel 3 pada Gambar 3.1, perubahan
energi potensial diubah menjadi energi kinetik dalam jumlah yang sama, biasanya energi
termal tetapi kadang-kadang ringan.
Contoh-contoh ini menggambarkan hukum termodinamika pertama, yang menyatakan
bahwa energi dilestarikan. Energi tidak dapat dibuat atau dihancurkan, tetapi hanya
ditransfer dan diubah. Energi total dalam suatu molekul disebut sebagai entalpi-nya.
Enthalpy termasuk energi potensial dari molekul. Seringkali disebut sebagai kandungan
panas, ditambah efek molekul pada lingkungannya dalam hal tekanan dan volume.

Konstribusi panas, tekanan, dan volume entalpi molekul paling baik dipahami dengan
mengamati perubahan entalpi dalam reaksi kimia. Sebagai contoh, mari kita periksa reaksi
yang bertanggung jawab atas ledakan eksplosif cairan panas mendidih yang dapat
dihasilkan oleh kumbang pembombardir ketika terpancing.
Dalam reaksi ini, hidrogen peroksida dipecah menjadi air dan gas o2, yang mengembang
hingga lebih dari 500 kali volume asli H2O2. Panas yang dilepaskan dari reaksi juga
meningkatkan suhu cairan secara dramatis. Peningkatan suhu dan volume yang sangat
besar ini menghasilkan tekanan yang mendorong cairan mendidih keluar dari lubang di
ujung perut kumbang

Perubahan entalpi dalam reaksi kimia dapat diukur dan diwakili oleh H. (delta huruf besar
Yunani, sering digunakan dalam notasi kimia dan matematika untuk mewakili perubahan).
Nilai oh #H terutama didasarkan pada perbedaan dalam kandungan panas, karena selain
dari reaksi pada kumbang bombardier-kebanyakan reaksi biologis tidak menghasilkan
perubahan substansial dalam tekanan dan volume. Ketika suatu reaksi melepaskan energi
panas (produk memiliki lebih sedikit energi potensial daripada reaktan), ia eksotermik dan
#H negatif. Jika energi panas digunakan selama reaksi, menghasilkan produk yang memiliki
energi potensial lebih tinggi daripada reaktan, reaksinya adalah endotermik dan H adalah
positif.
Faktor lain yang berubah selama reaksi kimia adalah jumlah gangguan atau entropi. Ketika
produk-produk reaksi kimia menjadi kurang teratur daripada molekul-molekul reaktan,
entropi meningkat dan #S adalah positif. Sebenarnya, hukum termodinamika kedua
menyatakan bahwa total entropi selalu meningkat dalam sistem yang terisolasi. Perlu diingat
bahwa sistem terisolasi dalam hal ini adalah alam semesta, yang meliputi lingkungan serta
produk-produk dari reaksi.

Untuk menentukan apakah reaksi kimia spontan, perlu untuk menilai kontribusi gabungan
dari perubahan panas dan gangguan. Kimiawan melakukan ini dengan kuantitas yang
disebut perubahan energi bebas gibbs.
Dengan kata lain, perubahan energi bebas dalam suatu reaksi sama dengan perubahan
entalpi dikurangi perubahan entropi dikalikan dengan suhu. Istilah TS secara sederhana
berarti bahwa entropi menjadi lebih penting dalam menentukan perubahan energi bebas
ketika suhu molekul meningkat. Energi termal meningkatkan jumlah gangguan dalam
sistem, sehingga semakin cepat molekul bergerak, semakin penting entropi dalam
menentukan perubahan energi bebas secara keseluruhan. Reaksi kimia bersifat spontan
ketika G kurang dari nol. Reaktor semacam itu dikatakan eksergonik. Reaksi tidak spontan
ketika G lebih besar dari nol.