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BIOQUÍMICA METABÓLICA
ÍNDICE
I. Introducción
II. Fundamento
III. Objetivos
V. Manejo de RPBI
1. Metabolismo de Carbohidratos
2. Ciclo de Krebs
Práctica N° 4: Determinación de la actividad succinato deshidrogenasa.
Práctica N° 5: Respiración aerobia
Práctica N° 6: Respiración en células vegetales
Práctica N° 7: Respiración celular en plantas y animales
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Manual de laboratorio de bioquímica metabólica
INTRODUCCIÓN
OBJETIVO
JUSTIFICACIÓN
Las prácticas de laboratorio en la enseñanza de la Bioquímica, tienen un rol
importante en el proceso de aprendizaje, a través del cual se busca motivar al
estudiante en la investigación con el desarrollo de experimentos y lograr con
ello promover el desarrollo del análisis y razonamiento vinculando teoría y
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Manual de laboratorio de bioquímica metabólica
B) REGLAS DE SEGURIDAD:
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Tabla No 2.
TIPO DE RESIDUOS ESTADO ENVASADO COLOR
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FISICO
Sangre Líquidos Recipientes Rojo
herméticos
Cultivos y cepas de Sólidos Bolsas de Rojo
agentes infecciosos polietileno
Sólidos Bolsas de Amarillo
polietileno
Patológicos
Líquidos Recipientes Amarillo
herméticos
Residuos no Sólidos Bolsas de Rojo
anatómicos polietileno
Líquidos Recipientes Rojo
herméticos
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II. Prácticas
1. METABOLISMO DE CARBOHIDRATOS
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PRÁCTICA No. 1
OBJETIVO:
Observar de forma cualitativa la existencia de los grupos aldehÍdos y cetonas.
Visualizar la demostración colorimétrica, que se basa en la variación de color
de diferentes sustancias químicas por el poder reductor del grupo carbonilo.
GENERALIDADES:
Una característica fundamental de los aldehídos y de las cetonas, es la
existencia en su estructura del grupo funcional carbonilo (C = O). Cuando el
carbonilo está asociado a un carbono primario forma los aldehídos, y cuando
está en un carbono secundario da lugar a las cetonas.
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Glucosa Fructosa
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PRUEBA DE BENEDICT
Algunos azúcares tienen la propiedad de oxidarse en presencia de agentes
oxidantes suaves como el ion Fe3+ o Cu2+. Esta característica radica en la
presencia de un grupo carbonilo libre, el cual es oxidado y genera un grupo
carboxilo. Por lo tanto, aquellos azúcares con un grupo carbonilo libre son
llamados azúcares reductores y aquellos en los que el grupo carbonilo se
encuentra combinado en unión glicosídica se conocen como azúcares no
reductores. Existen varias reacciones químicas que permiten determinar si se
está en presencia de un azúcar reductor o no. La prueba de Benedict es una de
ellas y se basa precisamente en la reacción o no de un azúcar con el ion Cu2+.
El reactivo de Benedict contiene soluciones de carbonato de sodio, sulfato de
cobre, y citrato de sodio. El Na2CO3 confiere a la solución un pH alcalino
necesario para que la reacción pueda llevarse a cabo. El citrato de sodio
mantiene al ion Cu2+ en solución ya tiene la propiedad de formar complejos
coloreados poco ionizados con algunos de los metales pesados. Con el cobre
produce un complejo de color azul.
Si se le agrega al reactivo una solución de azúcar reductor y se calienta hasta
llevar la mezcla a ebullición, el azúcar en solución alcalina a elevadas
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MATERIALES Y REACTIVOS
1. -Reactivo de Benedict
a. Soluciones de carbohidratos al 2% (100 mL)
2. Glucosa
3. Fructosa
4. Galactosa
5. Sacarosa
6. Maltosa
7. Lactosa
8. 1 gradilla o vaso de precipitado
9. 6 tubos de ensayo de 15 x 150
10. 6 pipetas de 5 ml. y 6 de 2 ml.
11. 1 Tripie
12. 1 Tela de asbesto
13. 1 mechero
14. 1 vaso de precipitado de 500 ml
15. Pinzas para tubo
16. Perilla
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PROCEDIMIENTO:
RESULTADOS:
-Elaborar un cuadro con los carbohidratos que utilizó, si se formó un precipitado
y de qué color es el mismo.
PREGUNTAS:
-¿Concuerdan sus resultados con lo esperado teóricamente sobre
carbohidratos reductores? Explique.
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PRACTICA NO. 2
OBJETIVO:
Comprobar la producción de piruvato, acetaldehído y etanol durante la
fermentación de la glucosa.
GENERALIDADES:
La fermentación se define como un proceso de obtención de energía mediante
el cual las moléculas orgánicas servir como donantes de electrones y
aceptadores de electrones. (3)
En la fermentación las moléculas de ácido pirúvico se convierten en algo de
"residuos" de productos, y un poco de energía (sólo dos moléculas de ATP por
molécula de glucosa - en realidad cuatro son producidos en la glucólisis, pero
dos se utilizan) se produce. (4)
En muchos microorganismos que viven en condiciones anaeróbicas (sin
oxígeno), sirve como la principal vía productora de energía por catabolismo de
carbohidratos, lo que da por resultado la formación de productos metabólicos
finales específicos, como etanol, ácido láctico, glicerol y CO2.
El piruvato está situado en una verdadera encrucijada metabólica, y su destino,
entre otros factores, depende de las condiciones aerobias o anaerobias
existentes, así como de las características de las células donde se produce o
llega. (5)
De muchos tipos posibles de los procesos de fermentación, dos de los tipos
más comunes son la fermentación ácido láctica y la fermentación del
alcohol. (4)
+
2 ATP + glucosa + 4 ADP + 2 Pi + 2 NAD 2 ADP + 2 piruvato + 4 ATP + 2 NADH
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REACTIVOS:
. Solución de glucosa al 1%
. Reactivo de Benedict.
. Levadura de panadero seca activa.
PROCEDIMIENTO:
1.- En un vaso de precipitado de 25 ml. Pipetear 10 ml de la solución de
glucosa y añadir 0.3 g (la punta de una espátula) de levadura. Mezcle
perfectamente hasta que la mezcla sea homogénea. Incubar a 37 grados
centígrados. Realizar una prueba de Benedict a esa mezcla a los 30 min., y a la
hora y media de incubación.
2.- Para verificar que la solución de glucosa es un azúcar reductor, realizar una
prueba de Benedict a la solución de glucosa.
INTERPRETACION:
1. Muestra no fermentada: reacción de Benedict positiva (rojo ladrillo)
RESULTADOS:
OBSERVACIONES:
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CONCLUSIONES:
PREGUNTAS:
1.-¿Qué es la glucólisis?
PRACTICA No.3
FERMENTACIÓN DEL VINO
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OBJETIVO:
Estudiar el efecto de la concentración de sacarosa en la fermentación del vino.
GENERALIDADES:
La fermentación alcohólica del vino es muy antigua y ya en la Biblia se hacen
numerosas referencias al proceso. Los griegos atribuían el descubrimiento de
la fermentación al dios Dionisio. (6)
MATERIAL DE LABORATORIO:
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MATERIAL BIOLÓGICO:
- Levadura activa del vino seco
- Cepas de Saccharomyces ellipsoideus
REACTIVOS:
- Jugo de uva o de otra fruta
- Sacarosa
EQUIPO:
- Alcoholímetro (hidrómetro).
- Balanza
PROCEDIMIENTO:
1. Prepare el cultivo iniciador de levadura
• Mezcle 1 g del cultivo de levadura de vino seco en 100 mI de jugo de
uva. Vea la Nota 1.
• Deje la levadura crecer en un envase sin apretar a temperatura
ambiente por 24 horas.
2. Fermentación primaria
• Agregue bastante azúcar al jugo de uva para preparar los 4 substratos
como se muestra en la tabla 1.3, un litro por cada un
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Sustrato Concentración de
Sacarosa
extra adicionada
A 0.0 g/l
B 100.0 g/l
C 200.0 g/l
D 300.0 g/l
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• Mida los valores del PA como antes cuando esté listo para consumir.
4. Pruebe el vino.
5. Pruebe con otros jugos de fruta.
NOTA 1. Las uvas frescas pueden ser machacadas para obtener el jugo. La
mayoría de los lagares agregan el dióxido de sulfuro como gas o como sal
sólida para prevenir el crecimiento de otras levaduras y bacterias que causen
los desperdicios. El dióxido de sulfuro también es producido por
Saccharomyces durante la fermentación. La fuente más simple del jugo es el
estante del supermercado. Utilice “Todo Natural” la variedad sin preservativos o
azúcar agregados.
Hoja de resultados
C
D
RESULTADOS Y OBSERVACIONES
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CONCLUSIONES
PREGUNTAS:
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2. CICLO DE KREBS
El ciclo toma su nombre en honor del científico anglo-alemán Hans Adolf Krebs,
que propuso en 1937 los elementos clave de la ruta metabólica. Por este
descubrimiento recibió en 1953 el Premio Nobel de Medicina
Regulación del ciclo de Krebs. Por el hecho de que entrega NADH y FADH2 a
la cadena respiratoria y recibe de ella las mismas coenzimas oxidadas, el ciclo
de Krebs funciona bajo el control de la cadena respiratoria y depende en última
instancia de la fosforilación oxidativa. Sin embargo, el ciclo de Krebs responde
a moduladores alostéricos generados en el propio ciclo y también en otras vías
del metabolismo; son moduladores negativos NADH, ATP, citrato, succinil-CoA
y oxaloacetato y modulador positivo ADP.
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PRACTICA No. 4
DETERMINACIÓN DE LA ACTIVIDAD SUCCINATO DESHIDROGENASA
OBJETIVO:
Comprobar el funcionamiento del Ciclo de Krebs por medio de la actividad de
una de las enzimas involucradas en dicho ciclo.
GENERALIDADES:
La conversión de succinato a fumarato, la tercera oxidación del ciclo del ácido
cítrico, es catalizada por la succinato deshidrogenasa, una flavoproteína y
oxidoreductasa que contiene FAD. ()
La parte final del ciclo consiste en la reorganización de moléculas a cuatro
átomos de carbono hasta la regeneración del oxalacetato. Para que eso sea
posible, el grupo metilo presente en el succinato tiene que convertirse en un
carbonilo. Estos tres pasos, además de regenerar oxalacetato, permiten la
extracción ulterior de energía mediante la formación de FADH2 y NADH. (11)
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MATERIAL DE LABORATORIO:
- Baño María
- 1 Mortero
- 1 Gradilla
- 2 Tubos de ensaye
- 2 Pipetas de 5 ml
- 1 Pipeta de 1 ml
- 1 Termómetro de 0 a 100°C
- Arena de vidrio.
MATERIAL BIOLÓGICO:
- Aceite vegetal, 10 ml
- Músculo fresco de res o pollo, 1g
REACTIVOS:
(Para su preparación véase la preparación de soluciones).
- Ácido succínico al 3% neutralizado con hidróxido de sodio al 10% hasta pH
7.4, 50 ml
- Azul de metileno al 0.001%, 25 ml
- Ácido tricloroacético al 20%, 10 ml
PROCEDIMIENTO:
1. Triture cuidadosamente con arena de vidrio 1 g de músculo en un mortero,
añadiendo de 3 a 4 ml de la disolución de ácido succínico y filtre a través de
una gasa la mezcla.
2. El líquido homogeneizado se reparte en dos porciones iguales, las cuales se
pondrán en tubos de ensaye.
3. En el tubo control se añade 1 ml de disolución de ácido tricloroacético para
destruir la enzima.
4. Añada a ambos tubos de 1 a 2 gotas de azul de metileno y agítelos.
5. Sobre la superficie del líquido de cada tubo se vierten de 0.5 a 1 ml de aceite
con el fin de aislar el oxígeno del aire.
6. Los tubos se incuban en baño maria a 50° C durante 10 minutos.
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RESULTADOS:
2.- Explica ¿Por qué el azul de metileno puede actuar como indicador cuando
la enzima está presente y activa?
OBSERVACIONES:
CONCLUSIONES
PREGUNTAS:
1.-¿Por qué se utiliza músculo como material biológico de experimentación?
2.-Nombra las enzimas del ciclo de Krebs e indica el tipo de reacción que
cataliza cada una. Indica ¿cuáles actúan como oxido-reductasas y cuál es su
cofactor?
3.-En la reacción en la cual la succinil-CoA es convertida a succinato una
molécula de GTP es producida. Es sabido que la producción de GTP es
equivalente a la de ATP. ¿Cómo puedes explicar esto considerando los
siguientes cambios de reacción?
GTP+ADP = GDP+ATP
4.-¿Qué es la succinato deshidrogenasa y en qué vía metabólica ejerce su
acción?
5.-¿Cuáles son los productos de su actividad?
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PRACTICA No 5
RESPIRACIÓN AEROBIA
GENERALIDADES:
La respiración celular incluye todas las vías metabólicas que degradan
carbohidratos y otros metabolitos para la obtención de ATP. Cuando una
molécula de glucosa de seis carbonos se rompe, se transforma en moléculas
de ácido pirúvico de tres carbonos. Este proceso aerobio es denominado
glicólisis. La glicólisis se lleva a cabo en el citoplasma de las células y no
requiere de oxígeno; sin embargo, si hay oxígeno presente, el proceso de
liberación de energía continúa, ocurriendo la respiración aerobia que sucede en
la mitocondria.
En la respiración aerobia existen dos pasos después de la glicólisis. En el
primero se transforma el ácido pirúvico de tres carbonos en acetil coenzima A
de dos carbonos; el tercer carbono se ha transformado en CO2. El segundo
paso de la respiración aerobia es el ciclo del ácido cítrico que continúa
liberando moléculas de CO2 durante el proceso y formando moléculas de ATP.
Si no hubiera oxígeno disponible en el proceso de la respiración después de la
transformación del ácido pirúvico, se presenta un proceso anaerobio llamado
fermentación.
MATERIAL Y EQUIPO
-3 vasos de precipitado de 100 ml
-3 pipetas Pasteur con bulbo
-Indicador fenolftaleína
-NaOH 0.1 N (50 ml)
-Popotes
-Agua destilada
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PROCEDIMIENTO
1. Rotula 3 vasos de precipitado de 100 ml y agrégales agua a la mitad de
su capacidad de agua destilada. Adiciónales unas 5 gotas de solución
de NaOH y agita. A continuación agregar 3 gotas de fenolftaleína y
agitar.
2. Toma la frecuencia cardiaca (pulso) de alguno de tus compañeros de
equipo en reposo y anota tus resultados. Haz que exhale el aliento de
una respiración en el vaso 1 ayudándose con un popote.
3. Pide a tu compañero que camine durante un minuto y vuelve a medir su
frecuencia respiratoria. Anota tus resultados y haz que exhale el aliento
de una respiración en el vaso de precipitado 2.
4. Pide ahora que realice ejercicio fuerte como correr o subir y bajar
escaleras durante 3 minutos, vuelve a tomar su frecuencia respiratoria y
haz que exhale el aliento de una respiración en el vaso de precipitado 3.
5. Compara tus observaciones
RESULTADOS:
OBSERVACIONES:
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CONCLUSIONES:
PREGUNTAS:
1.- ¿Qué es la respiración?
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PRACTICA No. 6
OBJETIVO:
Comprobar el evento de la respiración a través de la formación de un
subproducto natural como es el bióxido de carbono.
GENERALIDADES:
Ba(OH) 2 + CO 2 BaCO 3 + H 2 O
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MATERIAL Y EQUIPO
Probeta graduada de 50 ml
Balanza granataria
1 Bureta
Gasas
Hilo
REACTIVOS:
Fenolftaleína
PROCEDIMIENTO:
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REPORTE DE LABORATORIO
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RESULTADOS:
OBSERVACIONES:
CONCLUSIONES:
Preguntas:
1.- Mencione cuales son los productos finales en la respiración en plantas
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PRACTICA No. 7
RESPIRACIÓN CELULAR EN PLANTAS Y ANIMALES
GENERALIDADES:
En la siguiente actividad, se comparará el proceso de respiración celular en
varios organismos que viven en agua dulce. El CO2 que producen estos
organismos durante la respiración celular se convierte en un ácido (ácido
carbónico), cuya concentración se medirá por medio de una titulación2 usando
un indicador de pH (fenolftaleína). Con este indicador se observará el punto de
cambio en pH, donde se obtiene el equilibrio entre pH ácido y básico. Este
cambio en pH sucede al añadirle una solución básica de NaOH a la muestra
ácida, y se observa por un cambio en color; de esta forma se podrá calcular la
producción de CO2 para cada organismo. Se estudiará una planta acuática
para determinar si lleva a cabo la respiración celular en la oscuridad y en
presencia de luz.
MATERIAL Y REACTIVOS:
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MATERIAL BIOLOGICO
-Peces de agua dulce
-Caracoles de agua dulce
-Elodea fresca
PROCEDIMIENTO:
RECUERDE
· Hay que tratar el agua con anticloro antes de añadir los
animales. Siga las indicaciones del producto.
· NO deje morir los peces y los caracoles después del experimento;
devuélvalos a la pecera.
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3. Tape la boca de los vasos con papel de aluminio, excepto el vaso 4 que se
cubrirá por completo para mantener la Elodea en oscuridad.
12. Calcule la producción de CO2 para cada vaso mediante esta ecuación:
RESULTADOS:
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2 Caracol
3 Elodea en luz
4 Elodea en
oscuridad
5 Agua (control)
PREGUNTAS:
1.- ¿Qué organismo tiene el metabolismo más alto? ¿Por qué?
3.- ¿Por qué la planta lleva a cabo fotosíntesis y también respiración celular?
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PRACTICA No 8
ESTUDIO DEL BOMBEO DE PROTONES
POR LEVADURAS; EFECTO DE LOS INHIBIDORES
DE LA CADENA DE TRANSPORTE DE ELECTRONES Y DE LOS
DESACOPLANTES
OBJETIVOS:
Ø Que el alumno relacione el consumo de glucosa con los cambios de pH
producidos por las levaduras.
Ø Que el alumno describa las vías por las cuales la glucosa genera los
cambios de pH.
Ø Que el alumno interprete el efecto de los inhibidores y los desacoplantes
sobre la salida de protones.
GENERALIDADES:
En los organismos aerobios es esencial que las enzimas del ciclo de
Krebs estén asociadas con las del sistema de transporte de electrones. Es a
través de esta oxidación que los nucleótidos de la piridina (NADP y NAD) y el
FAD, reducidos en el ciclo de Krebs, son devueltos a su forma oxidada.
La energía cedida en estas oxidaciones es utilizada en la síntesis de ATP.
El sistema transportador de electrones esta constituido por una serie
secuencial de enzimas del grupo de los citocromos, capaces de pasarse
electrones de uno a otro. Los electrones, tomados por aceptores de hidrógeno
(NADP, NAD, FAD) a partir de los pasos oxidativos de la respiración, acaban
pasando al sistema trasportador de electrones, en donde van “descendiendo” a
lo largo de la cadena de los citocromos.
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enzimas citocrómicas. Para cada par de electrones que pasan por este
sistema, se forman 3 moléculas de ATP. La síntesis de ATP tiene lugar en la
oxidación del NADH, en la oxidación de dos citocromos b y en la oxidación de
dos citocromos a.
Cuando alcanzan su nivel de energía más bajo, los electrones son pasados al
oxígeno desde el citocromo a3 reducido, activando así el oxígeno. En este
estado, el oxígeno puede aceptar iones libres de hidrógeno para formar agua.
REACTIVOS:
- Suspensión celular de Saccharomyces cerevisiae en agua destilada (2g/10
mL). Pesar lo necesario para 30 mL.
-Solución de glucosa al 10%
-Solución de azida de sodio (NaN3) 500 mM.
MATERIAL:
-2 vasos de precipitados de 30 mL
-Potenciómetro y amortiguadores de referencia para calibrar.
-1 parrilla con agitador magnético.
-1 cronómetro
-Micropipetas de 200 y 1000.
-Puntas para micropipeta
-Piceta con agua destilada
-1 Balanza granataria
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PROCEDIMIENTO:
(Pardo y Martínez, 2009)
con agitador magnético (En caso de no contar con esto, realizar la agitación
solución cada 5 minutos cuatro veces, y luego cada 10 minutos dos veces más.
con agitador magnético (En caso de no contar con esto, realizar la agitación
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solución cada 5 minutos dos veces, y luego cada 10 minutos dos veces más.
con agitador magnético (En caso de no contar con esto, realizar la agitación
solución cada 5 minutos dos veces , y luego cada 10 minutos dos veces más.
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HOJA DE RESULTADOS
1.- Haga una gráfica de cada uno de los experimentos; utilizar los valores de
las lecturas de pH contra tiempo.
2.- Analizar el significado de los cambios de pH en el experimento control con
dinitrofenol como desacoplante y con azida de sodio.
3.- Hacer una relación de las vías que producen estos cambios; tomar en
cuenta que las levaduras poseen una ATPasa de protones en la membrana
mitocondrial que se encarga de sintetizar ATP y que tienen otra ATPasa de
protones en la membrana plasmática cuya función es similar a la bomba de
Na+/K+ en las células de los mamíferos.
DISCUSIÓN DE RESULTADOS
CONCLUSIONES
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PREGUNTAS:
7.- ¿Cuáles son las vías metabólicas que catabolizan a los carbohidratos?
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Las células obtienen energía a partir de los ácidos grasos, los cuales pueden
proceder de diversas fuentes: grasas de la dieta, grasas almacenadas en las
células en forma de gotitas de lípidos y grasas sintetizadas en un órgano y que
se exportan a otro. (16)
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PRACTICA No. 9
RADICALES LIBRES (LIPOPEROXIDACION)
OBJETIVOS:
Ø Mediante la determinación de malondialdehído el alumno constatará el
efecto de los radicales libres en la peroxidación de los lípidos
(lipoperoxidación).
Ø El alumno revisará algunos de los mecanismos protectores contra los
radicales libres.
Ø El alumno destacará la importancia de los antioxidantes naturales del
organismo para protegerse de los radicales libres.
GENERALIDADES:
Los radicales libres son átomos o grupos de átomos que tienen un electrón(e-)
desapareado en capacidad de aparearse, por lo que son muy reactivos.
Una vez que el radical libre ha conseguido robar el electrón que necesita para
aparear su electrón libre, la molécula estable que se lo cede se convierte a su
vez en un radical libre, por quedar con un electrón desapareado, iniciándose
así una verdadera reacción en cadena que destruye nuestras células.(18)
Las reacciones químicas de los radicales libres se dan constantemente en las células de
nuestro cuerpo y son necesarias para la salud, pero el proceso debe ser controlado con
una adecuada protección antioxidante.
Todas las células están rodeadas por una membrana celular que las separa del medio
extracelular. La membrana celular contiene enzimas, canales, receptores y antígenos
que juegan papeles vitales en la interacción de la célula con otras células, hormonas y
otros agentes reguladores del líquido extracelular. (19)
El proceso de oxidación de los ácidos grasos se denomina lipoperoxidación. Se
trata de una reacción en cadena o autocatalítica, es decir que, una vez
comenzada, continúa desarrollándose por sí misma. Por lo tanto el proceso
consta de tres etapas: iniciación, propagación y terminación.
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R. + O2 ROO.
ROO.+ RH ROOH+ R.
La lipoperoxidación sigue propagándose de esta manera y llega a su termino
cuando dos ROOH reaccionan entre sí dando un tetróxido o cuando son
neutralizados por los antioxidantes.
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La presente práctica tiene como objeto medir el nivel de MDA (uno de los
productos de los lipoperóxidos), el cual ha sido considerado desde hace varios
decenios como un marcador de la presencia de la lipoperoxidación en los
tejidos. Para ello se utilizará el peróxido de hidrógeno, el cual se descompone
fácilmente en dos radicales libres llamados hidroxilos que son altamente
reactivos:
H2O2 => 2 •OH
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.
BHT-OH + R02. => BHT – O + RO2 H
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MATERIAL Y REACTIVOS:
- 8 tubos de ensayo de 13 x 100 marca pirex o kimax
- 4 Pipetas graduadas de 1 ml
- 4 Pipetas graduadas de 5 ml
- 1 Pipeta Pasteur con bulbo
- 8 tapones de hule
- 1 mortero con pistilo
- 1 tripie
- 1 tela de asbesto
- 1 mechero Bunsen
-1 vaso de precipitado de 250 ml
-1 vaso de precipitado de 100 ml
BIOLÓGICO:
- Homogeneizado de hígado de pollo
REACTIVOS:
- Ácido tiobarbitúrico a 0.8% (TBA)
- Cloruro de potasio al 2%
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EQUIPO:
- Centrífuga clínica
- Fotocolorímetro con filtro verde
PROCEDIMIENTO:
1. Homogeneizar aproximadamente 1 gr. de hígado de pollo en 9 ml de agua
destilada.
2. Filtrar el homogeneizado con una gasa.
3. Preparar la serie de tubos, como se indica en la tabla
Tubo 1 2 3 4
Antioxidante -- -- -- 2 gotas
H 2O 2 -- -- 2 gotas 2 gotas
4. Detener la reacción con 1.5 ml de ácido acético en cada uno de los tubos.
Agitar y agregar 1.5 ml de ácido tiobarbitúrico.
5. Tapar los tubos con canicas e incubar en baño María a ebullición durante 30
minutos.
6. Sacar los tubos y enfriar en el chorro de agua. Agregar 1 ml de KCI a 2% y
agitar. Observar la coloración y determinar cualitativamente la producción de
MDA.
7. En caso de que la coloración de la solución en los tubos no sea
suficientemente evidente para apreciar la diferente cantidad de MDA en cada
uno de ellos, continuar con el paso siguiente, el cual consiste en solubilizar en
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Manual de laboratorio de bioquímica metabólica
RESULTADOS Y OBSERVACIONES
CONCLUSIONES:
PREGUNTAS:
1.- ¿Qué es la lipoperoxidación?
5.- ¿Qué otras biomoléculas son afectadas por la formación de radicales libres
a nivel intracelular?
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PRÁCTICA No. 10
CONVERSIÓN DE LÍPIDOS A CARBOHIDRATOS
OBJETIVO:
Demostrar que en los vegetales se puede dar la conversión de lípidos a
carbohidratos.
GENERALIDADES:
Las plantas y algunas bacterias pueden usar la Acetil-ScoA derivada del
catabolismo de los lípidos (o de cualquiera otra sustancia) no sólo como fuente
de energía, sino también como fuente de carbono para la formación de casi
todas las otras clases de compuestos.
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MATERIAL DE LABORATORIO:
- 2 Pipetas de 10 ml
- 2 Pipetas de 5 ml
- 1 Pipeta de 1 ml
- 2 Vasos de precipitados de 50 ml
- 10 Tubos de ensaye
- 4 Frascos de boca ancha
- 1 Bandeja
- Papel filtro
- Papel aluminio
- Gasa
MATERIAL BIOLÓGICO:
- Semillas de ajonjolí y de soya
REACTIVOS:
(Para su preparación véase la preparación de soluciones).
- Mezcla cloroformo-metanol 2:1
- Fenol al 5%
- H2SO4 concentrado
- Solución amortiguadora de fosfatos 0.1M, pH 7.5, 3 mM de MgCl2
- Reactivo de Biuret
- Solución patrón de glucosa 100 μg /ml
- Solución patrón de caseína 20 mg/mI
- Solución de NaCl al 1%
- Sol. de hipoclorito de sodio al 1%
- Sulfato de sodio anhidro
EQUIPO:
- Estufa a temperatura constante 30° C y 28° C
PROCEDIMIENTO:
I.- Germinación de las Semillas.
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Soya:
1. Pesar 3 lotes de semillas de soya de 2.5 g cada uno.
2. Lavar las semillas con 25 ml de solución de hipoclorito de sodio al 1% y
enjuagarlas con agua hervida y fría hasta que ya no huelan a cloro.
3. Colocar cada lote de semillas en un frasco de boca ancha y taparlo con gasa
detenida por una liga.
4. En una bandeja con un poco de agua colocar los dos frascos boca abajo a
manera de que las semillas estén en contacto con el agua.
5. Tapar los frascos con papel aluminio y guardar los lotes sobre la charola
durante 4 días a 30° C.
6. El día que se realizará la sesión experimental pesar otros 3 lotes de semillas
de 2.5 g cada uno, estos serán los controles (semillas sin germinar).
Ajonjolí:
1. Pesar 3 lotes de semillas de ajonjolí de 0.5 g cada uno.
2. Lavar las semillas con 25 ml de solución de hipoclorito de sodio y
enjuagarlas con agua previamente hervida y fría hasta que ya no huelan a
cloro.
3. Colocar cada lote de semillas en un frasco estéril de boca ancha cubierto
con papel aluminio, que contiene un disco de papel filtro humedecido.
4. Ponerlos en la estufa a 28° C durante 4 días
5. El día que se realizará la sesión experimental pesar otros 3 lotes de semillas
de 0.5 g cada uno, estos serán los controles (semillas sin germinar).8
a) Proteínas
1. Homogenizar en un mortero, por separado y en frío, 2 lotes de semillas (1
lote sin germinar y 1 lote germinado) con 10 ml de solución amortiguadora de
fosfatos pH 7.5, MgCl2 3mM.
2. Centrifugar a 15000 rpm durante 15 minutos. Si es necesario, filtrar los
sobrenadantes a través de varias capas de papel filtro, a que los filtrados
salgan claros. Guardar los extractos en frío mientras se utilizan.
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Determinación de Proteínas
Tubos 1 2 3 4 5 6 7 8 9
(ml)
Solución 0.25 0.5 0.75 1.0 ---- ---- ---- ---- ----
Patrón de
caseína
Extracto ---- ---- ---- ---- 1.0 ---- ---- ---- ----
enzimático
sin
germinar
Extracto ---- ---- ---- ---- ---- 1.0 ---- ---- ----
enzimático
germinado
Extracto ---- ---- ---- ---- ---- ---- 1.0 ---- ----
enzimático
sin
germinar
diluido
1:10
Extracto ---- ---- ---- ---- ---- ---- ---- 1.0 ----
enzimático
germinado
diluido
1:10
Cloruro de 5.75 5.5 5.25 5.0 5.0 5.0 5.0 5.0 6.0
sodio 1%
Reactivo 4.0 4.0 4.0 4.0 4.0 4.0 4.0 4.0 4.0
de Biuret
b) Carbohidratos
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Tubos (ml) 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
Agua 0.9 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 1.
5 9 8 7 6 9 9 9 9 0
destilada
Ext.Enz. sin ---- --- --- --- --- 0. --- --- --- ---
germinar1:20 - - - - 1 - - - -
Ext.Enz. ---- --- --- --- --- --- 0. --- --- ---
germinado1:2 - - - - - 1 - - -
0
Ext.Enz. sin ---- --- --- --- --- --- --- 0. --- ---
germinar - - - - - - 1 - -
diluido 1:50
Ext.Enz. ---- --- --- --- --- --- --- --- 0. ---
germinado - - - - - - - 1 -
diluido 1:50
Tubos 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
Fenol 0.3 0.3 0.3 0.3 0.3 0.3 0.3 0.3 0.3 0.3
5%(ml)
Tubos 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
Ac. 1.8 1.8 1.8 1.8 1.8 1.8 1.8 1.8 1.8 1.8
sulfurico
conc.
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8. Colocar los tubos en un baño de hielo y dejar hasta que se enfríen. Leer a
485 nm en el colorímetro. El tubo 10 corresponde al blanco.8
c) Lípidos
1. Lavar y secar perfectamente dos vasos de precipitado de 50 ml, pesarlos y
rotularlos.
- Vaso 1:Lípidos de semillas germinadas.
- Vaso 2:Lípidos de semillas sin germinar.
2. Tomar los dos lotes de semillas restantes (uno sin germinar y otro
germinado) y pasar cada grupo de semillas por separado a un mortero para
macerarlas con 10 ml de solución de cloroformo-metanol fría. (Evitar que las
semillas germinadas lleven agua).
3. Separar el sobrenadante pasándolo a un tubo para centrífuga y rotúlelo.
4. Volver a homogenizar las semillas con 5 ml de cloroformo-metanol y pasar el
sobrenadante a su respectivo tubo de centrífuga.
5. Centrifugar a 3000 rpm durante 5 minutos.
6. Si se observa agua en el sobrenadante, agregar una cantidad conocida de
sulfato de sodio anhidro.
7. Pasar los sobrenadantes a sus respectivos vasos y eliminar los solventes
mediante calentamiento en baño maria y pesar los vasos.
8. Por diferencia de pesos entre los vasos vacíos y los vasos con los lípidos
después de eliminar los solventes, calcular la cantidad de lípidos en cada lote
de semillas (si uso sulfato de sodio, descuente su peso del peso final de su
vaso).
Hoja de trabajo
1.-Observe los resultados obtenidos y compare los lotes de semillas
germinadas contra los obtenidos en los lotes de semillas sin germinar.
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Germinadas
Sin germinar
2.- Compare los resultados con los obtenidos por sus compañeros.
3. Utilizando los resultados obtenidos y los datos siguientes proporcionados en
la tabla, identifique el tipo de vías metabólicas activas durante la germinación
de las semillas utilizadas en esta prácticas.
Tiempo de germinación 0 4
(días)
Condición de germinación - Oxalato + Oxalato
Enzima μg de producto/min/mg de proteína
α-cetoglut-deshidrogenasa 25 25 60
Malato sintasa 10 120 18
Malico deshidrogenasa 25 50 50
Trans GP* 35 60 150
PEPcinasa* 8 75 75
* Transaminasa glutámico pirúvica ** Fosfoenolpiruvato cinasa
DISCUSIÓN DE RESULTADOS
CONCLUSIONES
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PREGUNTAS:
1.-¿Es posible convertir ácidos grasos a otros lípidos sin intermediarios de acil-
CoA?
6.- ¿Qué permite utilizar a las plantas y a los microorganismos dicho ciclo?
7.- ¿Cuáles son las dos enzimas características del ciclo del glioxilato.
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Los aminoácidos (aa) son moléculas orgánicas pequeñas con un grupo amino
(NH2) y un grupo carboxilo (COOH). La gran cantidad de proteínas que se
conocen están formadas únicamente por 20 aa diferentes. Se conocen otros
150 que no forman parte de las proteínas. (21)
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Manual de laboratorio de bioquímica metabólica
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PRÁCTICA No. 11
TRANSAMINACIÓN
OBJETIVO:
Obtener un extracto crudo de piruvicotransaminasa a partir de un producto
vegetal para medir la actividad de transaminación de la enzima por colorimetría
y determinar sus parámetros cinéticos.
FUNDAMENTO:
Una reacción de transaminación es la primera etapa de la desasimilación de los
aminoácidos, y sirve para encauzar los grupos amino hacia el α-cetoglutarato,
para transformarlo en glutamato que posteriormente será sometido a una
reacción de desaminación oxidativa, catalizada por la glutamato
deshidrogenasa, formándose un ión amonio que será utilizado para generar
urea.
aminoácido (1) + α-cetoácido (1) <==> α-cetoácido (2) + aminoácido (2) (24)
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MATERIAL DE LABORATORIO:
- 1 Anillo de hierro
- 1 Bisturí
- 1Pipeta Pasteur
- 2 Cristalizadores
- 2 Pipetas de 1 ml
- 2 Pipetas de 5 ml
- 1 Pipeta de 10 ml
- 1 Probeta graduada de 50 ml
- 1 Termómetro -10 a 200° C
- 10 Tubos de ensaye
- 2 Vasos de precipitados de 250 ml
- Tela de asbesto
- Soporte universal
- Botella lavadora de 500 ml
- Bulbo 1 ml para pipeta Pasteur
- Embudo de vidrio de talle largo
- Gasa 4 cuadros de 10 x 10 cm
- Gradilla
- Hielo
- Mechero Bunsen
- Mortero con pistilo
MATERIAL BIOLÓGICO:
- Chícharos frescos 10 g
REACTIVOS:
(Para su preparación véase la preparación de soluciones).
- Solución ácida de 2,4-dinitrofenilhidrazina 1.5 mM
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EQUIPO:
- Colorímetro
- Celdas de 1 cm
- Parrilla de agitación
PROCEDIMIENTO:
A) Obtención de extracto crudo de enzima
1. Coloque el tubo para homogeneizado o el mortero en una cama de hielo.
Coloque dos tubos de ensaye en la cama de hielo.
2. Con el bisturí pique finamente los chícharos y coloque el picado en el tubo
para homogeneizado o en el mortero.
3. Agregue 20 ml de la solución TRIS-HCl 40 mM pH 7.5. Homogenice el
picado manteniendo el tubo dentro del baño de hielo.
4. Coloque el embudo dentro de un tubo de ensayo de la cama de hielo,
coloque 4 capas de gasa sobre el embudo y filtre el homogeneizado a través
de las 4 capas de gasa.
5. Vierta el filtrado en un tubo de centrífuga y centrifugue a 3500 rpm durante 5
minutos.
6. Vierta el sobrenadante en un tubo de ensayo frío, mantenga el tubo de
ensayo en un baño de hielo.
B) Cinética de la transaminación
1. En un vaso de precipitados de 250 ml prepare un baño a 37° C.
2. Arme el soporte universal con el anillo de hierro y la rejilla de asbesto, ponga
a hervir agua destilada en un vaso de precipitados de 250 ml.
3. Tome 8 tubos de ensayo, etiquete los tubos del 1 al 8, en el tubo No. 8
agregue 1 ml de substrato, 0.2 ml de extracto y hierva el tubo a baño maria
durante 5 min.
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Volumen ml
Tubo Sustrato Tris-HCl
Extracto
1 0.00 1.00 0.2
2 0.05 0.95 0.2
3 0.10 0.90 0.2
4 0.20 0.80 0.2
5 0.40 0.60 0.2
6 0.80 0.20 0.2
7 1.00 0.00 0.2
Volumen ml
Tubo Agua Patrón Sustrato
1 0.2 0.0 1.0
2 0.2 0.1 0.9
3 0.2 0.2 0.8
4 0.2 0.4 0.6
5 0.2 0.8 0.2
6 0.2 1.0 0.0
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HOJA DE TRABAJO
1.- Grafique la curva de calibración de A vs [ác. Pirúvico].
2.- Calcule la concentración de ácido pirúvico obtenido con cada concentración
de sustrato.
3.- Calcule la velocidad inicial de la reacción enzimática:
v = micromoles de ácido pirúvico/min y las unidades internacionales por
mililitro:
u.i. = micromoles/ml min
4.- Elabore la gráfica de Michaelis de [substrato] vs [ác. Pirúvico]
(micromoles/min).
5.- Calcule la Km y la Vmáx de la enzima.
6.- Interprete el significado de los valores de Km y de Vmáx.
7.- Explique el resultado obtenido en el tubo No. 8 de la cinética.
DISCUSIÓN DE RESULTADOS
CONCLUSIONES
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Manual de laboratorio de bioquímica metabólica
PREGUNTAS:
1.-¿Qué es la transaminación?
2.-¿Cuál es su importancia?
3.- Nombra los α-cetoácidos que se forman por transaminación de cada uno de
los siguientes aminoácidos:
a) Alanina d) Leucina
b) Aspartato e) Fenilalanina
c) Glutamato f) Tirosina
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