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Duane R.

 Hickling MD, FRCSC
University of Ottawa

URINARY TRACT INFECTIONS

Outline
• Definitions and Classification
• Epidemiology
• Pathogenesis
• Treatment
• Prophylaxis
• Weird and Wonderful UTIs
Definitions
• Urinary Tract Infection
– Symptomatic urothelial inflammation secondary to bacterial 
adhesion and internalization within the urinary tract
• Symptoms: frequency, urgency, dysuria, suprapubic pain/pressure, 
fever, flank pain
• Positive urine culture: >105 cfu/ml or >102 cfu/ml

VS.
• Asymptomatic Bacteriuria
– 2 consecutive midstream urine specimens with isolation of the 
same bacterial strain in quantitative counts ≥ 105
– ABSENCE OF SYMPTOMS

UTI Classification
• Anatomical
– Lower: bladder &/or urethra “CYSTITIS”
– Upper: kidneys &/or ureters “PYELONEPHRITIS”

• Degree of Complexity
– Uncomplicated
• Healthy individuals with no structural or functional 
abnormality
– Complicated
Complicated UTI
General Urological

Male Gender Nosocomial Urinary Tract Infection
Children Foreign Body
Diabetes Mellitus Indwelling catheter or Renal/Bladder 
Calculi
Renal Insufficiency
Anatomical Abnormalities
Immunosuppression
Polycystic or Medullary sponge kidney
Pregnancy
Diverticuli
Neurologic disease or injury
Vesicoureteric reflux
Ureteral or urethral obstruction
Renal artery stenosis or thrombosis
Voiding Dysfunction
Surgery of the Urinary Tract
Antimicrobial Resistance

UTI Classification
• Recurrent (vs. Sporadic)
≥ 3 culture proven infections within 12 months or 2 
culture proven infections within 6 months

– Reinfection: different infecting uropathogen, 
negative culture between infections or infection 
occurs > 2 weeks after successful treatment

– Persistence: recurrence within 2 weeks of 
treatment and identical uropathogen
Outline
• Definitions and Classification
• Epidemiology
• Pathogenesis
• Treatment
• Prophylaxis
• Weird and Wonderful UTIs

Epidemiology of UTI
• Most common human bacterial infection

• >8 million outpatient visits / year and 
>200,000 hospitalizations / year
Schappert,  1997

• Direct and indirect costs ~ 3.5 billion/year
Foxman, 2010
Epidemiology of UTI

Najar et al. 2009

Epidemiology of UTI
Female UTI
• Foxman et al. 2000
– 2000 women
– 10.8% (95% CI 9.4‐12.1) self‐reported UTI in past 12 
months
– Extrapolated lifetime prevalence 60.4%

• NHANES III
– Incidence 13,320 cases per 100,000 women
– Lifetime prevalence 53, 067 per 100,000 women
Epidemiology of UTI
Male UTI
• 20% of all UTI

• NHANES III
– Lifetime prevalence 13, 689 per 100,000 men

• Increases with age
– BPH
– Detrusor underactivity

Bacteriology

Flores‐Mireles et al  Nature Reviews 2015


Bacteriology

Conclusions
almost all women with 
typical UTI symptoms and 
negative culture still have 
an infection with E. coli

Epidemiology of rUTI
• UTI recurrence is common

– 20% college aged women had at least 1 culture confirmed UTI within 6 
months1

– 179 women followed for 1 year after index E.coli infection
• 44% had at least one recurrence
• 5% had > 3 UTIs2

– Natural history of recurrence
• Cluster within the first 3‐4 months
• Most likely time 30‐60 days
• Frequency of recurrence declines with time3

1. Foxman et al. 2000
2. Ikaheimo et al. 1996
3. Stamm et al.. 1991
Epidemiology of rUTI
• Nosocomial UTI
– 80% occur in catheterized patient
– By 2 weeks 100% colonization
• 10‐25% risk of symptomatic infection
• 1‐5% risk of progressing to bacteremia

Saint S. Am J Infect Control 2000

Outline
• Definitions and Classification
• Epidemiology
• Pathogenesis
• Treatment
• Prophylaxis
• Weird and Wonderful UTIs
UTI Pathogenesis

Nielubowicz GR and Mobley HL. Host‐
pathogen interactions in urinary tract 
infection. Nat Rev Urol. 2010; 7(8): 430.

UTI Pathogenesis: 
Host Factors
• Genetic factors
– Positive female family history strongly predictive of UTI
– Greater binding of uropathogenic coliforms
• ABH blood group non‐secretor status
• P1 status
– Alterations in HSPA1B, CXCR1&2, TLR2&4 and TGF‐β1 genes
– Alternations in toll‐like receptors, anti‐microbial peptides (defensins and cathelicidin), anti‐bacterial 
adherence factors (eg. Tamm‐Horsfall protein) and growth factors (eg. TGF‐β1 and VEGF)

• Behavioral factors
– Sexual intercourse
– Spermicide use
– Recent antibiotic use

• Anatomic Variations
– females:  perineal and urethral anatomy are important ONLY in absence of other risk factors
– obstructed  urine flow: 
• medullary sponge kidney, calyceal diverticula, ureteral obstruction, ureteropelvic junction 
obstruction vesicoureteric reflux, bladder outlet obstruction (primary bladder neck, urethral 
stricture, or benign prostatic hyperplasia)
UTI Pathogenesis: 
Host Factors
• Physiologic Factors
– Diabetes mellitus
• 1.2‐2.2 fold increased risk
• Theories: hyperglycosuria, increased glycosylation of uroplakin Ia, less effective urinary 
glycoproteins and impaired bladder contractility and emptying (diabetic cystopathy)
– Pregnancy
• Prevalence of bacteriuria is similar to non‐gravid females 
• However, 22‐35% progression to pyelonephritis
– Secondary to hydronephrosis of pregnancy
– Dysfunctional voiding
– Neurologic diseases
• Detrusor‐external sphincter dyssynergia
– Postmenopausal Female
• Atrophic vaginitis
– Decreased levels of lactobacilli, antimicrobial peptides
• Incontinence
• Cystocele
• Elevated post‐void residual

UTI Pathogenesis: 
Bacterial Factors
• Pathogenicity islands
– Large DNA blocks encoding virulence factors
– Disseminate b/w distinct strains

• Virulence factors
– Adhesins: Fim‐H, P‐pili
– Toxins: hemolysin
– Proteases
– Invasins
– Serum resistance factors
– Motility mediators
– Iron acquistion systems
– Acid polysaccharide capsule  

• Biofilm Min et al. 2006
UTI Pathogenesis: Biofilm
• deposition of a “conditioning layer” of 
reactive host proteins

• adhesin‐mediated microorganism 
attachment

• microorganisms change phenotypically
– produce exopolysaccharides
• Secure microorganisms to the catheter 
surface 
• protected against exogenous 
antimicrobials and innate host defenses

• Formation of organized microcolonies
– shed daughter cells and biofilm 
aggregates seeding other sections of 
the catheter and urinary tract. 

UTI Pathogenesis
• Routes of infection: 
– Ascending (majority)
• From extra urinary sources such as the distal gut or vaginal 
epithelium (majority)
– Hematogenous (rare)
• Increased with ureteral obstruction
• Staphylococcus bacteremia or Candidal fungemia
– Quiescent intracellular reservoirs
• Dormant uropathogenic bacteria residing within urothelial
cells
• Evade host immune responses and can emerge at any given 
time to reinfect host
UTI Pathogenesis

Kaper et al. Nature Reviews Microbiology 2004

Intracellular Bacterial Communities

Dhakal BK et al. 2008
rUTI Pathogenesis

O’Brien VP. et al. Nat Microbiol. 2016

Diagnosis
History and Physical Exam
Laboratory Testing

• Urinalysis
– Leukocyte esterase 
• Sensitivity 68‐98% and Specificity 59‐96%
• Positive predictive value 19‐86% and Negative predictive value 91‐97%
– Nitrite
• Sensitivity 19‐45% and Specificity 95‐98%
• Positive predictive value 50‐78% and Negative predictive value 82‐89%
– Leukocyte esterase and Nitrite
• Sensitivity 35‐84% and Specificity 98‐100%
• Positive predictive value 84% and Negative predictive value 98%

• Microscopy
– Bacterial counts >30,000 cfu/ml for detection
– ≥ 1 bacteria per hpf (uncentrifuged urine) correlates to ≥ 105 cfu/ml via culture
– Pyuria: ≥ 10 WBCs/hpf
Diagnosis
Laboratory Testing con’t

• Urine culture and sensitivities (Gold Standard)
• Obtain prior to initiation of empiric therapy if:
– atypical symptoms
– negative urinalysis
– recent antibiotic use,
– Complicated

• ≥ 105 cfu/ml urine is the classic definition of a positive urine culture
• ≥102 cfu/ml urine can be used for UTI diagnosis in a symptomatic patient

Diagnosis
Additional urologic investigation
• upper tract imaging, cystoscopy, urodynamics

• generally unnecessary during initial diagnostic testing

• Indications
– Complicated UTI
– persistent fever (72 hours after initiation of treatment)
– suspected urolithiasis (urine pH ≥ 8.0, history of calculi)
– unexplained/persistent hematuria
– bacterial persistence
– analgesic abuse
– urinary retention
Outline
• Definitions and Classification
• Epidemiology
• Pathogenesis
• Treatment
• Prophylaxis
• Weird and Wonderful UTIs

Treatment: 
Antimicrobial Resistance

MAJOR threat to public health

CDC 2013/WHO 2014

Approaching a post‐antibiotic age
Davies and Davies 2010

CDC 2013
Treatment: 
Antimicrobial Resistance

CDC 2013

Treatment: 
Antimicrobial Resistance

http://www.reactgroup.org/
Treatment: Acute UTI
RESULTS
Pilot study = NON‐INFERIORTY

2/3  treated with ibuprofen had 
complete resolution without 
antibiotics and less recurrence

HOWEVER
‐ Higher rate of pyelonephritis
‐ 1 episode GI hemorrhage

Bleidorn et al. BMC Medicine 2010
Gágyor et al. BMJ 2015

Treatment: Acute UTI
• Individualized to patient and 
local community resistance 
prevalence

• Suspect complicated UTI
– urine specimen prior to 
treatment
– treatment duration should be 
adjusted to 10‐14 days

• Signs of urosepsis
– broad spectrum intravenous 
antimicrobials such as 2nd or 3rd
generation cephalosporins
– consider urinary tract imaging

Gupta et al. 2011
Antimicrobial Agents
in Urology
• Testable!
– Mechanism of action
– Spectrum of activity
– Side effects
– Contraindications
– Antimicrobials in Pregnancy

• Potential side effects applicable to all
– Allergic reaction, hypersensitivity, rash, yeast 
infection, GI upset, pseudomembranous colitis

Outline
• Definitions and Classification
• Epidemiology
• Pathogenesis
• Treatment
• Prophylaxis
• Weird and Wonderful UTIs
Antimicrobial Prophylaxis
• Standards
– Antimicrobial administration
• Guidelines
– Asymptomatic bacteriuria
– Genitourinary procedures
– Endocarditis
• AUA Best Practices
– Joint replacements
– Prostate biopsy
– Genitourinary prostheses
• Recurrent UTI

Antimicrobial Prophylaxis
Standard
• < 1 hour prior to incision
– 2 hours if vancomycin

• OR attending to document if patient not 
eligible
Antimicrobial Prophylaxis
Guidelines
Asymptomatic bacteriuria

IPE, 2013

Antimicrobial Prophylaxis
IDSA Guidelines
Asymptomatic bacteriuria
– Screening and treatment indicated in two 
populations
• Pregnant women
– 20‐30x higher risk of pyelonephritis
» Pre‐term labor and low birth weight
– Screening to begin 12‐16 weeks
• Urologic procedures
– If mucosal bleeding anticipated
» Eg. TURP, TURBT, Ureteroscopy
Gupta et al. 2011
Antimicrobial Prophylaxis
AHA Guidelines
Infective endocarditis
– American Heart Association
• Infective endocarditis is much more likely from 
random bacteremias associated with daily activities
• Therefore endocarditis prophylaxis not recommended 
for GU procedures 

Wilson et al.  Circulation. 2007

Antimicrobial Prophylaxis
AUA Best Practice
• Total Joint Replacements
– Prophylaxis NOT indicated for most healthy 
urologic patients with
• Placement of pins, plates, and/or screws
• Total joint replacements

– Consider prophylaxis
• < 2 years after joint replacement
• At risk patients undergoing high risk procedures
Total Joint Replacement 
Prophylaxis
At Risk Population High Risk GU Procedures
• < 2 years after joint  • Stone manipulation
– NOT ESWL
replacement • Transmural incision
• Immunocompromised or  • Upper endoscopy
immunosuppressed • Transrectal biopsy
• Procedure includes bowel 
• Previous prosthetic joint  segment
infection • Entry into urinary tract if 
colonization likely
• Malnourished – Catheterization
– Stent
• Hemophilia – Recurrent UTIs
• Malignancy – Urinary diverstion

Total Joint Replacement 
Prophylaxis
Suggested Regimens

• Single system quinolone dose
– Ciprofloxacin 500 mg
– Levofloxacin 500 mg
– Ofloxacin 400 mg

• Ampicillin 2g IV (or vancomycin 1 g IV) plus gentamycin 1.5 
mg/kg IV
Antimicrobial Prophylaxis
AUA Best Practice
Transrectal Prostate Biopsy
– Quinolones (oral or IV)
– Aminoglycoside plus metronidazole or 
clindamycin*
– Cephalosporins (1st, 2nd, 3rd generation)*
– Aztreonam plus metronidazole or clindamycin

* May be better in some communities owing to 
high fluoroquinolone resistance rates

Antimicrobial Prophylaxis
AUA Best Practice
Implanted Prosthesis
Antimicrobial Prophylaxis 
Recurrent UTI
Cochrane Review

1. Reduce number of rUTI while taking medication


0-0.9 vs. 0.8-3.6 recurrence per patient-year
NNT 2.2

2. Once prophylaxis d/c’d


NO DIFFERENCE b/w GROUPS

3. RR of severe side effects 1.58 (95% CI 0.47-5.28)

Albert et al. Cochrane Database Syst Rev. 2004

Antimicrobial Prophylaxis 
Recurrent UTI

AUA Update Lesson 12 2012
Non‐antimicrobial Prophylaxis 
Recurrent UTI
Cranberry Extract or Juice
‐Proanthocyanidin inhibits Fim‐H binding to urothelium
‐Cranberry juice (240 ml) reduced rUTI 39%
Maki et al.  Am J Clin Nutr. 2016
Vaginal Estrogen
‐restore innate immunity and lactobacilli (lower pH)

D‐mannose
‐inhibit FimH – Uroplakin Ia binding
INSUFFICIENT EVIDENCE
Methanamine salts
‐ hydrolyzed   ammonia & formaldehyde
Formaldehyde = bacteriostatic

Outline
• Definitions and Classification
• Epidemiology
• Pathogenesis
• Treatment
• Prophylaxis
• Weird and Wonderful UTIs
Acute Bacterial 
Prostatitis (NIH Category I)
• Rare

• Acute onset symptoms: perineal pain, irritative storage 
and obstructive voiding symptoms, fever, chills, malaise

• Physical exam: boggy, hot, tender, very tender prostate

• Bacteriology
• 65‐80% E. coli
• 5‐10 % Enterococcus
• Pseudomonas, Enterobacter, Klebsiella

Acute Bacterial 
Prostatitis (NIH Category I)
• Risk factors:
– UTI
– condom or indwelling catheter
– unprotected penetrative and rectal intercourse
– transurethral surgery
– prostate biopsy
– dysfunctional voiding  intraprostatic ductal 
reflux
• anatomic or neurophysiologic
Acute Bacterial
Prostatitis (NIH Category I)
• Diagnosis
– U/A and urine culture
– Note:  expression of prostatic fluid is unnecessary and 
perhaps harmful 

• Treatment
• Ampicillin+gentmicin, 2nd or 3rd generation cephalosporin, 
fluoroquinolone
– Duration 2‐6 weeks
• Transrectal ultrasound if not improvement within 36 hours 
 rule out prostate abscess

Chronic Bacterial 
Prostatitis (NIH Category II)
• 5‐15% of prostatitis cases

• > 3 months

• Important clue:
– Asymptomatic between episodes (although can have CPPS)
– Recurrent UTIs
• 25‐43%

• Physical exam: 
– Unremarkable with the except of pain
– DRE only after preprostatic massage urine specimens collected
Chronic Bacterial
Prostatitis (NIH Category II)
Diagnosis
Mandatory
– history & physical exam (DRE and pelvic floor)
– Urinalysis and urine culture

Recommended
– 2 glass test
– NIH‐Chronic Prostatitis Symptom Index (CPSI)
– Sexual function assessment
– Uroflow/PVR
– Urine cytology

Not Recommended for Routine Evaulation (Optional)
– Meares‐Stamey Test / 4 Glass Test
– Seimn analysis and culture
– STI testing or urethral swab
– UDS
– Transrectal U/S or pther pelvic imgaing
– PSA

Chronic Bacterial
Prostatitis (NIH Category II)

Category II diagnosed if 
10‐fold increase in 
bacteria in EPS or VB3 
vs. VB1 and VB2
Chronic Bacterial
Prostatitis (NIH Category II)

Chronic Bacterial
Prostatitis (NIH Category II)
Treatment

Fig 13.9 Campbell’s Urology
Emphysematous
Pyelonephritis
• Urologic emergency with high mortality rate 
(19‐43%)

• Acute necrotizing parenchymal and perirenal
infection  by gas forming microorganisms
– E.coli > Klebsiella and Proteus

Emphysematous
Pyelonephritis
• Presentation
– Adults
– Diabetic 
• Obstructed urinary tract: 
calculi, papillary necrosis
– Triad: fever, vomiting and 
flank pain
– Radiologic findings (how 
diagnosis is established)
• CT preferred over plain film
– Streaky or mottled gas 
with or without bubbly and 
loculated gas

Campbell’s 11th edition
Emphysematous
Pyelonephritis
• Treatment
– Medical management
• Broad spectrum antimicrobials and fluid resuscitation
• + Catheter drainage if obstructed

• Note: ONLY if normally functioning/non‐obstructed kidney

– Nephrectomy
• Not responding to medical therapy
• Non‐function kidney

Xanthogranulomatous
Pyelonephritis
• Rare, severe, chronic renal infection with 
diffuse renal destruction
– Associated with:
• Obstruction secondary to nephrolithiasis (Staghorn)
• Poor renal function
• Infection: Proteus > E.coli and ~ 10 % mixed culture
• Accumulation of lipid‐laden foamy 
macrophages
Xanthogranulomatous
Pyelonephritis
• Treatment
– Stabilize the patient with antimicrobial therapy
– Nephrectomy and removal of entire inflammatory 
mass
• Perinephric fat
• Diaphram
• Great vessels
• bowel

Malakoplakia
• “soft plaques”

• Originally described in bladder
– GU and GI tract, skin, lungs, bones and mesenteric LN

• Defect in intraphagosomal bacterial digestion

• Presentation: > 50 years, 4:1 female to male ratio, 
immunosuppressed with other chronic diseases
Malakoplakia
• Diagnosed by biopsy
– Large histiocytes “von 
Hansemann cells”
– Small basophillic, extra‐
or intracytoplasmic
calculospherules
“Michaelis‐Gutmann
bodies”

Malakoplakia
Treatment
– Long term antimicrobial therapy to eradicate 
intracellular bacteria
• Sulfonamides and/or TMP
• Doxycycline
• Rifampin
• Quinolones
– Surgical intervention if disease progression
Genitourinary Tuberculosis
• Mycobacterium tuberculosis

• 2‐10% of patients with pulmonary TB in the developed world
– HIV/AIDS or foreign born

• Kidney and epididymis most common GU sites

• Renal TB progression
– Calyceal stricture/destruction
– Calcification
– Decreased blood flow
– Seeding:  Ureter  stricture,  Bladder starts at ureteric orifice  
stricutre/reflux

Genitourinary Tuberculosis
Diagnosis
– Symptoms: often minimal and/or vague
• Frequency
• Malaise, weight loss, lethargy, low‐grade temp
• Hypertension
• Painful epididymal or scrotal swelling
• Hematospermia

– Urine studies (CRITICAL)
• 3‐5 first void urine samples for acid‐fast bacilli and culture
– Done ASAP
– Culture results within 3‐4 weeks
• In future
– PCR method
– Mass spectrometry
Genitourinary Tuberculosis
Diagnosis
– PPD skin test
• Does not differentiate b/w active and latent disease
• Cannot rule out disease with negative test
• Therefore not used in GU TB
– Cystoscopy rarely indicated
– Radiology
• Plan film: punctate calcifications within parenchyma, 
intraluminal in ureter
• IVU 
• CT Urogram scan preferred and replaced IVU

Genitourinary Tuberculosis
Radiologic findings
– Irregular “moth‐eaten” calyces

– Hydrocalyx, hydronephrosis, hydroureter

– Superiorly displaced “hiked –up” UPJ 

– Nonvisualization of calyx from infundibular stenosis or entire kidney 


(“autonephrectomy”)

– Ureteral stricture
• Most common site: distal ureter
• Can be multiple
Genitourinary Tuberculosis
Treatment  (CDC Guidelines)
– Medical therapy for 6 months
• First 2 months 4 antimicrobial agents: isoniazid, rifampin, 
pyrazinamine, ethambutol
• Next 4 months: isoniazid and rifampin

– Surgery (nephrectomy, partial nephrectomy, ureteral 
stricture, augmentation cystoplasty, epididymectomy)
• Persistent symptoms
• Extensive disease with HTN, UPJO
• Suspicious for malignancy

APPENDIX

Antimicrobial Agents
In
Urology
Ampicillin or Amoxicillin
• MoA
– Inhibit bacterial cell wall synthesis

• Spectrum
– Strep, Enterococcus, Proteus, E. coli

• Disadvantages
– 40% E.coli resistance in some areas
– Can disrupt normal vaginal flora (ie. Lactobacilli)
– Acute interstitial nephritis

Ampicillin + Clavulanate
• MoA
– Inhibits bacterial beta‐lactamase
– Less resistance

• Spectrum
– Strep, Enterococcus, Proteus, E. coli

• Disadvantages
– disrupt normal vaginal flora 
– GI side effects
Vancomycin
• MoA
– Inhibits bacterial cell wall synthesis 

• Spectrum
– Gm +ve including most MSRA

• Disadvantages
– Potential oto‐ or nephrotoxicity
– Nonspecific mast cell degranulation and histamine 
release “Red‐man syndrome”

Extended‐Spectrum Penicillins
• Examples: piperacillin, ticarcillin, mecillinam

• MoA
– Inhibit bacterial bacterial cell wall synthesis
– Usually combined with beta‐lactamase inhibitor
• Ticarcillin/clavulanic acid
• Pip/Tazo

• Spectrum
– Variable (reference individual agents)

• Disadvantages
– Same as ampicillin/amoxicillin
– High sodium load
Cephalosporins
• MoA
– Inhibit bacterial cell wall synthesis

• Spectrum
– 1st: Strep, Staph (not MRSA), some Gm –ve
– 2nd: Strep, some Gm –ve, some anaerobes
– 3rd: Strep, most Gm –ve, some cover Pseudomonas 
(Ceftazidime)
– 4th: Strep, Staph, most Gm –ve including Pseudomonas

• Disadvantages
– Similar to penicillins
– 10% cross reactivity in penicillin allergic patients

Cephalosporins

* Oral agents
Trimethoprim/Sulfamethoxazole
• MoA
– Inhibits bacterial folate metabolism

• Spectrum
– Strep, Staph, Gm –ve rods except Pseudomonas

• Disadvantages
– E. coli resistance > 20 % in some areas
– Interact with warfarin
– Affect fetal development
– Hematologic problems: AIDS, G6PD deficiency 

Nitrofurantoin
• MoA
– Inhibits several bacterial enzymes
– Damages bacterial DNA

• Spectrum
– E.coli, Klebsiella, Enterococcus, Staph saprophyticus

• Disadvantages
– Neurotoxicity
– Interstitial pneumonitis
– Poor tissue penetration
– Require longer treatment 
Tetracyclines
• MoA
– Inhibit ribosomes and therefore protein synthesis

• Spectrum
– Broad
– STIs

• Disadvantages
– Tooth and bone toxicity in pregnancy, childhood
– Photosensitivity
– Resistance

Fluoroquinolones
• MoA
– Inhibit bacterial DNA gyrase

• Spectrum
– Most Gm –ve including Pseudomonas
– Some Strep coverage

• Advantages
– Good tissue penetration (prostate, kidney)
Fluoroquinolones
• Disadvantages
– Drug interactions
• Warfarin
• Benzodiazepine withdrawal
– Lower seizure threshold
– Cartilage development (avoid in pregnancy)
– Tendinitis/tendon rupture
• Eg. Achilles tendon
• At risk: elderly, steroid use, transplant patients
– Clostridium difficile colitis 

Aminoglycosides
• MoA
– Inhibit ribosomal protein synthesis

• Spectrum
– Most Gm –ve including Pseudomonas

• Disadvantages
– Oto‐ and nephrotoxicity
– Neuromuscular blockade (high concentration)
• Avoid in myasthenia gravis
• Contraindication to botulinum toxin use
Antimicrobial Agents in 
Pregnancy

Avoid in 3rd Trimester

Sulfonamides
• Hemolytic anemia in G6PD patients
• Neonatal jaundice

Nitrofurantoin
• Hemolytic anemia due to immature 
enzymes
• Also avoid in G6PD patients

Campbell’s Urology 11th ed.

Genitourinary Tuberculosis
Antimicrobial Agents
Isoniazid
– MoA
• inhibits synthesis of mycolic acids (cell wall) 
• Kills rapidly dividing bacteria

– Adverse reactions:
• Liver toxicity (higher if also drink alcohol)
• Neurotoxicity (give pyridoxine supplement)
• May increase levels of phenytoin and carbamazepine
Genitourinary Tuberculosis
Antimicrobial Agents
Rifampin
– MoA
• Inhibits bacterial RNA polymerase
• Works on dividing and semi‐dormant bacteria

– Adverse reactions: uncommon
• All get orange discoloration of body fluids

– Drug interactions
• Induces cytochrome P450 enzymes
• Many drugs reduced to subtherapeutic levels, including
anti‐HIV protease inhibitors and non‐nucleoside reverse
transcriptase inhibitors

Genitourinary Tuberculosis
Antimicrobial Agents
Pyrazinamine
– MoA
• unknown
• Works on dormant and semi‐dormant bacteria

– Adverse reactions
• Arthralgias 40%
• Increase in uric acid
– Cannot use if patient has gout
– Xanthine oxidase inhibitor
Genitourinary Tuberculosis
Antimicrobial Agents
Ethambutol
– MoA
• unknown
• Works on actively dividing bacteria

– Major adverse reaction
• Retrobulbar neuritis  
– Follow visual acuity and red‐green color discrimination

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