Professional Documents
Culture Documents
VjeybaZ7ZOpytaZiZoralnaZbiohemija PDF
VjeybaZ7ZOpytaZiZoralnaZbiohemija PDF
PRIRUČNIK
ZA PRAKTIČNU I SEMINARSKU NASTAVU IZ MEDICINSKE BIOHEMIJE I HEMIJE
KVANTITATIVNA ANALIZA
ANALITIČKE TEHNIKE
U KLINIČKO-BIOHEMIJSKOJ LABORATORIJI
Mjerenje intenziteta elektromagnetnog zračenja i učinka tog zračenja obuhvata izuzetno važne
analitičke metode za kvalitativnu i kvantitativnu analizu supstanci. Fotometrija i
spektrofotometrija se baziraju na interakciji određenog jedinjenja sa elektromagnetskim
radijacijama, usljed čega dolazi do apsorpcije svjetlosti određene talasne dužine. Metode su
jednostavne, ne zahtijevaju izolovanje jedinjenja iz biološkog materijala i kao takve se vrlo često
koriste u kliničko-biohemijskim laboratorijama. Dodatni razlozi zbog kojih se danas,
spektrofotometrijske metode tako često upotrebljavaju su i dostupnost mjernog instrumenta svim
kliničko-biohemijskim laboratorijama, povoljne cijene reagensa koji se koriste, mogućnosti
automatizacije, itd.
Dodatkom nekog reagensa u pripremljeni biološki uzorak nastaje obojeni kompleks, koji apsorbuje
svjetlost određene talasne dužine. Obojeni rastvori apsorbuju svjetlo proporcionalno intenzitetu
boje, a intenzitet boje zavisi od količine jedinjenja u rastvoru. Ovaj princip korišten je u vizuelnim,
a zatim fotoelektričnim kolorimetrima. Kolorimetrija je metoda kojom se određuje koncentracija
nekog rastvora poređenjem sa bojom rastvora poznate koncentracije. Vizuelni kolorimetri se
oslanjaju na ljudsko oko, koje komparira boju rastvora sa obojenim diskovima. Dobijeni rezultati
Jasminka Nikolić • Branislav Vukanović • Milada Nalesnik
PRIRUČNIK
ZA PRAKTIČNU I SEMINARSKU NASTAVU IZ MEDICINSKE BIOHEMIJE I HEMIJE
Propustljivost obojenih rastvora za svjetlo je utoliko manja (a apsorpcija veća) ukoliko je njihova
koncentracija veća, tj. intenzitez boje veći. Sposobnost obojenih rastvora da u manjoj, ili većoj
mjeri, propuštaju svjetlost naziva se transmisija ili transparencija (T). Transparencija predstavlja
odnos između količine svjetla koju rastvor propusti (I) i količine svjetla koje pada na rastvor (I0).
T= I/I0
I0
log a b c log T
I
A = logT A = a bc
Kada je b = 1 cm, a c izraženo u mol/L, konstantu a mijenja ε (epsilon) i označava se kao molarna
apsorpcija.
A = a bc
Prema tome slijedi:
c = A/ab = A ·1/ab
Apsorptivnost (a) i put svjetlosti (b) ostaju konstante u datoj metodi analize; zato se 1/ab može
da zamijeni kalibracionom konstantom K
c=A·K
Dakle, koncentracija neke supstance u rastvoru (na pr. uzorku biološkog materijala) može da se
dobije iz očitane apsorpcije (A) bilo iz kalibracione krive ili računskim putem korištenjem
kalibracione konstante.
Osnovni dijelovi instrumenta koji mjeri apsorpciju zračenja su: izvor zračenja, monohromator ili
filter, kiveta za uzorak i detektor. Instrument može da ima i druge dijelove kao npr. uređaj za
cijepanje zrake (duble beam), motor za pokretanje monohromatora i dr. U spekrofotometru je
izvor zračenja (svjetla) lampa u kojoj se nalazi gas nekog elementa pod određenim pritiskom.
Dovođenjem energije (električne struje) gasu, ili parama metala, pobuđuju se elektroni koji
emituju određene kvante energije ultraljubičastog i/ili vidljivog zračenja. Najčešće lampe su:
živina, volframova, deuterijeva i kombinacije. Električna struja je izvor energije za lampu.
Sistem za izolovanje zračne energije željene talasne dužine, isključujući druge talasne dužine,
naziva se monohromator. Izolovanje spektra se može postići na više načina uključujući upotrebu
filtra, prizmi ili difrakcionih rešetki. Kombinacija sočiva i otvora može se postaviti ispred, ili iza
monohromatora, da bi svjetlosne zrake usmjerio paralelno, ili da bi izolovao uske dijelove
svjetlosnog zraka. Različiti otvori se mogu koristiti da bi čitavu zračnu energiju usmjerili ka
fotoćeliji.
Najjednostavniji tip filtera je tanko obojeno staklo. Izvjesni metalni kompleksi ili soli rastvoreni
ili suspendovani u staklu apsorbuju pojedinačne talasne dužine i propuštaju samo svjetlost
odabrane talasne dužine kroz filter. Jedinica za mjerenje talasne dužine je nm (10-9 m).
Jasminka Nikolić • Branislav Vukanović • Milada Nalesnik
PRIRUČNIK
ZA PRAKTIČNU I SEMINARSKU NASTAVU IZ MEDICINSKE BIOHEMIJE I HEMIJE
Stakleni filter nije pravi monohromator, pošto propušta svjetlost relativno širokog opsega talasnih
dužina. Spektralna čistoća filtera, ili nekog drugog monohromatora, obično se opisuje terminima
spektralnih linija. Definiše se kao širina u nm spektralne transmisione krive na tački koja je jednaka
polovini vrha transmisije. Najčešće korišteni stakleni filteri imaju spektralnu liniju oko 50 nm i
potpuno su adekvatni za brojne namjene. Nazivaju se i širokolinijski filteri, a praktičnu primjenu
su našli u kolorimetrima.
Prizme i refrakcione rešetke se široko primjenjuju kao monohromatori, jer proizvode kompletne
spektre umjesto pojedinačnih talasnih dužina. Izbor tipa monohromatora zavisi od svrhe
analiziranja.
Uzorak koji mjerimo nalazi se u kiveti mjernog instrumenta. Kivete se nazivaju i apsorpcione
ćelije, a mogu da budu okrugle, četvrtaste, ili pravougaone, napravljene od stakla, kvarcnog stakla,
ili plastike. U rutinskom kolorimetrijskom radu obično se koriste okrugle staklene kivete.
Četvrtaste ili pravougaone kivete imaju optičke površine sa konstantnim svjetlosnim putem.
Najčešće korištene imaju dužinu puta svjetlosti 1 cm.
Dva najčešće korištena detektora za mjerenje intenziteta svjetla u ultravioletnom i vidljivom dijelu
spektra su fotoćelije i fotomultiplikatorske cijevi. Fotoćelije se koriste u jeftinijim instrumentima
(npr. kolorimetrima), a fotomultiplikatorske cijevi u skupljim i kvalitetnijim (većina
spektrofotometara).
Apsorpciju (A) na kolorimetra očitavamo na skali, dok spektrofotometri imaju digitalni displej
za očitane vrijednosti apsorpcije (A), a često i pisač kao dodatak.
HROMATOGRAFIJA
Hromatografija je separacijska metoda kojom se razdvaja smjesa, manje ili više fizičko-hemijskih
sličnih, supstanci na grupe ili pojedinačne komponente. Nakon separacije može se obaviti
kvantifikacija razdvojenih supstanci pogodnom metodom. Pomoću hromatografije razdvajaju se
brojne supstance: neorganski joni, aminokiseline, šećeri, lipidi, droge, steroidi, nukleinske
kiseline, rastvorivi virusi i specifični materijali, kao što su subćelijski materijali i bakterije.
Razdvajanje se zasniva na dinamičkoj raspodjeli supstanci između dvije faze od kojih je jedna
pokretna (mobilna faza) u odnosu na drugu (stacionarna faza).
Separacija smjese supstanci obavlja se na osnovu nekih fizičko-hemijskih osobina kao što su npr.
lipofilnost (rastvorljivost u lipidima), jonski naboj, veličina molekule itd. Raspodjela se zasniva
na jednom od fizičkih principa: adsorpciji, raspodjeli supstanci između dva rastvarača koja se ne
miješaju, raspodjeli između tečne i gasovite faze, na izmjeni jona ili difuziji u pore određene
veličine. Prema tome, razlikujemo više vrsta hromatografija: adsorpcionu, podionu, gasnu, jonsko-
izmjenjivačku i gel-filtracijsku.
su silikagel ili aluminijum oksid, koji se nalaze u cijevi (koloni), kroz koju prolazi mobilna faza
sa rastvorenim supstancama.
Prema načinu rada razlikuje se silazna, uzlazna i radijalna hromatografija. Kod silazne
hromatografije filter papir se stavi jednim krajem u kadu sa rastvaračima da slobodno visi, tečnost
i nanijeti materijal putuju prema dole. Kod uzlazne hromatografije filter papir se objesi ili savije u
cilindar, da donjim krajem bude u posudi sa rastvaračem. Probe se apliciraju na donjem kraju
papira, a tečnost se kapilarnim silama penje papirom prema gore.
Slika 2. Hromatogram
a - udaljenost fronta rastvarača od starta – pređeni put rastvarača
b - udaljenost izdvojene supstance od starta – pređeni put komponente
Hromatografija na tankom sloju (TLC) je takođe diobena hromatografija. U TLC kao nosač
(stacionarna faza) koristi se čvrsti adsorbens. Najčešće su to celulozni prah ili silikagel naneseni u
tankom sloju (oko 0,2 mm debljine) na staklenu ploču. Nanošenje se vrši specijalnim aplikatorom.
Mogu se nabaviti već pripremljene ploče presvučene raznim sorbentima (silikagelom,
mikrocelulozom i dr). Princip i način rada su kao kod papirne hromatografije, samo se aplicira
manji volumen ispitivanog uzorka (1-5 μL) oko 1 cm od ruba ploče i obično se vrši uzlazna
hromatografija. Razdvajanje komponenti je brže i oštrije u odnosu na papirnu hromatografiju.
jonskog naboja supstance koja se eluira, ali su joni iz rastvarača u znatnom suvišku u odnosu na
supstancu koju treba odvojiti.
sastojaka i liganda. Ako je međudejstvo sastojka i liganda specifično, sastojak može biti pomjeren
u jednom koraku uz dodatak supstrata ili inhibitora, naizmjeničnom promjenom pH ili jonske
jačine, ili dodavanjem agensa za prekidanje vodoničnih veza. Značaj afinitetne hromatografije leži
u njenoj selektivnosti. U kliničko-biohemijskoj laboratoriji koristi se u preparativnom odvajanju
proteina i antitijela. Odvajanje glikoziliranog hemoglobina od ostalih hemoglobina afinitetnom
hromatografijom je značajna primjena ove analitičke tehnike.
signala (mV)
Intenzitet
vrijeme (min)
Slika 5. Hromatogram
Vizualni prikaz rezultata hromatografskog postupka.
Svakoj supstanci (A, B i C) odgovara određeni pik na hromatogramu
ANALIZA AMINOKISELINA
Guthrie-v test se izvodi u prvoj nedjelji života novorođenčeta, pod uslovom da je dijete prethodno
jelo barem 48 sati. Novorođenčetu se uzima kap krvi iz pete (zasjecanjem kože) na specijalni filter
papir, da bi se nakon određene pripreme, u uzorku odredile koncentarcije fenilalanina, tiroksina
(T4) i tireostimulirajućeg hormona (TSH). Guthrie-v test inhibicije bakterijskog rasta se izvodi na
agaru, koji sadrži inhibitor rasta specifičan za aminokiselinu, koja se određuje. Kao inhibitori za
otkrivanje fenilketonurije (L-fenilalanin) koristi se β-2-tienilalanin, za otkrivanje homocistinurije
(L-metionin) - metioninsulfoksin itd. Na agar, koji uz inhibitor sadrži i bakterijske spore Bacillus
subtilis, dodaje se krv ili urin i nakon inkubacije, posmatra rast bakterija. Ako je u uzorku povećana
koncentracija ispitivane aminokiseline, umanjuje se djelovanje inhibitora i dolazi do pojačanog
rasta bakterija. Kako bi se izbjegli lažno negativni rezultati, uzorak ne smije sadržavati antibiotike,
a svaki pozitivan nalaz treba potvrditi kvantitativnim fluorometrijskim i enzimatsko-
kolorimetrijskim testom (Quantase) ili hromatografski (HPLC), a moguća je i kombinacija sa
masenom spektrometrijom. Granična normalna vrijednost koncentracije fenilalanina, za Guthrie-
v test je 4 mg/dL (240 µmol/L) fenilalanina, odnosno za fluorometrijsko i enzimatsko-
kolorimetrijsko određivanje 2 mg/dL (120 µmol/L).
Jasminka Nikolić • Branislav Vukanović • Milada Nalesnik
PRIRUČNIK
ZA PRAKTIČNU I SEMINARSKU NASTAVU IZ MEDICINSKE BIOHEMIJE I HEMIJE
fenilalanin
Slika 6. Uzorak krvi za Guthrie-v test uzima se
zarezivanjem kože na peti novorođenčeta
ELEKTROFOREZA
Elektroforeza je proces u kome rastvorema supstanca, ili čestica efektivnog naboja (q), putuje u
viskoznom puferu, pod djelovanjem električnog polja, prema jednoj od elektroda, zavisno od
prirode njezinog naboja. Mnoge molekule posjeduju naelektrisanje i zahvaljujući tome migriraju
u rastvoru, kroz koji se propušta struja, ka elektrodi suprotnog naelektrisanja. Za elektroforezu
malih naelektrisanih jona koristi se naziv jontoforeza, tako da se pod nazivom elektroforeza obično
smatra putuvanje koloidnih naelektrisanih čestica, odnosno makromolekula, kao što su proteini.
Brzina putovanja molekule u električnom polju (v) može se izračunati iz jačine električnog polja
(E), naboja (naelektrisanja) molekule (q) i koeficijenta trenja (f).
E q
v=
f
Sila putovanja koja djeluje na molekulu, koja putuje stalnom brzinom, jednaka je otporu trenja
koji čestica mora da savlada u viskoznom puferu.
Jačina električnog polja (E) zavisi od razlike potencijala između elektroda (U) i udaljenosti između
elektroda (d):
Jasminka Nikolić • Branislav Vukanović • Milada Nalesnik
PRIRUČNIK
ZA PRAKTIČNU I SEMINARSKU NASTAVU IZ MEDICINSKE BIOHEMIJE I HEMIJE
U
E=
d
Koeficijent trenja (f) zavisi od oblika i veličine migrirajuće molekule i viskoznosti medija (η), za
molekulu sfernog oblika radijusa (r).
f = 6 πηr
U biohemiji se često koristi izraz elektroforetska pokretljivost (mobilnost) (μ). Pod određenim
uslovima elektroforetska pokretljivost čestica je fizička konstanta. Ona je direktno srazmjerna
naboju čestice, a obrnuto veličini molekule i viskoznosti pufera.
v q
μ= =
E f
Veličina molekula djeluje negativno na njihovu pokretljivost, ukoliko su veće, utoliko se sporije
kreću, usljed povećanja sile trenja i elektrostatske interakcije sa okolnom sredinom. Oblik
molekula takođe utiče na pokretljivost. Primjer su fibrilarni i globularni proteini iste molekulske
mase, a kreću se pri elektroforezi različitim brzinama. Brzina pokretljivosti direktno je
proporcionalna jačini struje, koja mora da bude konstantna u toku cijelog procesa razdvajanja
čestica. Količina električne struje koja se koristi u elektroforezi ograničena je zbog stvaranja
toplote. Porast temperature dovodi do porasta jonske pokretljivosti i slobodne difuzije, kao i
smanjenja viskoznosti pufera. Grijanje elektroforetskog sistema glavni je problem pri izvođenju
svih elektroforetskih tehnika.
Adsorpcija je svojstvo nekih elektroforetskih nosača, posebno papira i agara, koji slično „učinku
prosijavanja“ smanjuje elektroforetsku pokretljivost čestica koje se odvajaju. U rijetkim
slučajevima adsorpcija može da doprinese boljem odvajanju čestica.
Slika 7. (a) elektroforetska kada, sadrži dva puferska dijela, spojena s anodom i katodom
(b) papirna traka sa razdvojenim česticama
Jasminka Nikolić • Branislav Vukanović • Milada Nalesnik
PRIRUČNIK
ZA PRAKTIČNU I SEMINARSKU NASTAVU IZ MEDICINSKE BIOHEMIJE I HEMIJE
Budući da se elektroforetske tehnike primjenjuju za analizu više vrsta bioloških materijala, postoje
i različiti agensi za njihovu detekciju. Proteini nemaju boju (osim u slučaju kada sadrže prostetsku
grupu, kao što je npr. hem), i zato se njihov položaj na elektroforetskom nosaču ne može da vidi
neposredno. Elektroforetski razdvojeni proteini detektuju se nakon bojenja, imunofiksacije, ili
drugih postupaka. Enzimi se detektuju zimogramskim tehnikama (koristi se reakcija koju
katalizuje ispitivani enzim, da bi nastao proizvod koji može da se detektuje). Nukleinske kiseline
mogu da se detektuju bojenjem ili tehnikom molekularne hibridizacije. S RNA ili DNA probama.
Slika 8. Denzitometar
Nakon što su razdvojene frakcije, na traci za elektroforezu (papir, celogel i dr.) učinjene vidljivim,
moguće je da se dobiju i kvantitativni rezultati. Traka sa obojenim frakcijama analizira se u
denzitometru (Slika 8.). Pomjeranjem trake preko izvora monohromatske svjetlosti u denzitometru
obojene zone (razdvojene frakcije) apsorbuju monohromatsku svjetlost, a na pisaču se ispisuje
kriva koja se naziva elektroferogram (elferogram, u slučaju proteina proteinogram). Elferogram
predstavlja dijagramski prikaz frakcija, na kome svaki pik predstavlja jednu elektroforetsku
frakciju proteina. Pikovi mogu da predstavljaju desetine, i stotine, različitih proteina, koji pod
datim uslovima pH imaju istu brzinu migracije.
Primjena elektroforetskih tehnika u medicinsko-biohemijskim laboratorijama je mnogostruka.
Svakodnevnu primjenu ima elektroforeza na acetatnoj celulozi ili agarozi, koja omogućava
procjenu približne koncentracije serumskih bjelančevina ( albumin, α1-antitripsin, haptoglobin, α2-
makroglobulin, C3, transferin, IgA i IgG), tipiziranje lipoproteina, razdvajanje izoenzima laktat
dehidrogenaze, kreatin kinaze i drugih enzima, te detekciju patoloških hemoglobina.
Elektroforeza na akrilamidnom gelu primjenjuje se za analizu tjelesnih tečnosti s niskim
sadržajem bjelančevina kao što su urin, cerebrospinalna tečnost, saliva, eksudati i transudati i
analizi sastava bjelančevina ćelijskih i tkivnih homogenata.
Jasminka Nikolić • Branislav Vukanović • Milada Nalesnik
PRIRUČNIK
ZA PRAKTIČNU I SEMINARSKU NASTAVU IZ MEDICINSKE BIOHEMIJE I HEMIJE
Gel suzbija konvektivne struje nastale usljed malih temperaturnih gradijenata, što je neophodno
za postizanje efektivnog razdvajanja. Takođe, gel služi kao molekulsko sito. Molekule koje su
male u poređenju sa porama gela lako se kreću kroz gel, dok su molekule koje su veće od pora
gela gotovo nepokretne. Akrilamidni gel je termostabilan, transparentan i relativno hemijski
inertan. Nenaelektrisan je, tako da je efekat elektroendosmoze uklonjen. Veličina pora može da se
kontroliše izborom različitih koncentracija akrilamida i metilenbisakrilamida (reagens za poprečno
vezivanje) i vremena polimerizacije. Aparatura za gelsku elektroforezu prikazana je Slikom 9.
Slika 10. Nakon završenog elektroforetskog postupka na gelu proteini su obojeni bojom Coomassie blue,
koja se vezuje za proteine, ali ne i na gel.
Metodom nativne poliakrilamidne gelske elektroforeze proteini se razdvajaju na osnovu
naelektrisanja i veličine molekula. Pri tome se struktura proteinskih molekula ne mijenja, ona
ostaje nativna, što znači da proteini pri ovoj elektroforezi ne gube svoje biološke funkcije. Očuvana
ostaje i kvaternarna struktura proteina, tako da ova metoda nije povoljna za razdvajanje
podjedinica.
koja se analizira, kao i određivanje molekulske mase proteina, a u medicinskoj biohemiji koristi
se za razlikovanje tipa proteinurije.
Niski Visoki
pH pH
Kada dođu u zonu na gelu čiji je pH jednak njihovoj izoelektričnoj tački zaustaviće se. Kod tog
pH molekula proteina nema rezultirajući naboj i prestaje da se kreće u električnom polju. Ovim
postupkom mogu se razdvojiti proteini čiji se pI razlikuje za samo 0,0025. Proteini se pri
izoelektričnom fokusiranju izdvajaju u veoma uskim zonama, koje se nakon bojenja opažaju kao
oštre crte. Izoelektrično fokusiranje ima veliku primjenu u medicinskoj biohemiji. Primjenjuje se
za fenotipiziranje α1-antitripsina, razlikovanje patoloških hemoglobina, fenotipiziranje
apolipoproteina, ispitivanje polimorfizma pojedinih komponenata komplementa i drugo.