TOPIK :

BIOINFORMATIKA

Tugas :

Anda diminta untuk mengindentifikasi spesies atau genus dari isolat berikut, selanjutnya buatlah
pohon filogeni dari semua isolat.

A. Gunakan program BLAST nukleotida pada web NCBI untuk mengetahui spesies masing-
masing isolat
B. Gunakan program Clustal Omega untuk membuat pohon filogeni / mengetahui hubungan
kekerabatan antar spesies.

1. ISOLATE A

AAATTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGT
AACAGGAAACAGCTTGCTGTTTCGCTGACGAGTGGCGGACGGGTGAGTAATGTCTGGGAAACTGCGTGAT
GCAGGCGGATAACTACTGGAAACGGTAGCTAATACCGCATAACGTCGCAAGACCAAAGAGGGGGACCTTC
GGGCCTCTTGCCATCGCATGTGCCCAGATGGGATTAGCTAGTAGGTGGGGTAACGGCTCACCTAGGCGAC
GATCCCTAGCTGGTCTGAGAGGATGACCAGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAG
GCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCGGCGTGTATGAAGAAGGCCT
TCGGGTTGTAAAGTACTTTCTGCGGGGATGAAGGGAGTAAAGTTAATACCTTTGCTCATTGACGTTACCC
GCAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAA
TTACTGGGCGTAAAGCGCACGCAGGCGGTTTGTTAAGTCAGATGTGAAATCCCCGGGCTCAACCTGGGAA
CTGCATCTCATACTGGCAAGCTTGAGTCTCGTAGTGGGGGGTAGAATTCCAGGTGTAGCGGTGAAATGCG
TAGAGATCTGGAGCAATACCGGTGGCGAAGGCGGCCCCCTGGACGAAGACTGACGCTCAGGTGCGAAAGC
GTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTATACGATGTCGACTTGGAGGTTGTGCC
CTTGAGGCGTGGCTTCCGGAGCTAACGCGTTAAGTCGACGGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAAC
TCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAACAACC
TTACCTGCTCTTGACATCCACGCAAGTTTTCAGAGATGAGAATGTGCCTTCGGGAACCGTGAGAGAGGTG
CTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCC
TTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCACTGATAAACTGGAGGAAGGTGGGGATG
ACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGACCAGGGCTACACACCTGCTACAATGGCGCATACAAAGAGAAGCG
ACCTCGCGAGAGCAAGCGGACCTCATAAAGTGCGTCGTAGTCCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCAT
GAAGTCGGAATCGCTAGAAATCGTGGATCAGAATGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACC
GCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACT
TTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCT
TA

2. ISOLATE D

AATGAAATACTACTGTTTAAGATTAAGCCTGCATGTCTAAGTATAAGCACTTTATACTGTGAAACTGCGA
ATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGATAGTACCTTACTACATGGATACCTGTGGTAATTCTAGA
GCTAATACATGCTGAAAACCTCGACTTCGGAAGGGGTGTATTTATTAGATAAAAAACCAATGCCCTTCGG
GGCTCCTTGGTGAATCATAATAACTTAACGAATCGCATGGCCTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTT
CTGCCCTATCAACTTTCGATCGTAGGATAGTGGCCTACCATCGTGGCAACGGGTATCGGGGAATTAGGGT
TCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCC
AATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACGGGGCTCTTTTGGGTCTCGTAATTGGAATG
AGTACAATCTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCC
AGCTCCAATAGCGTATTTTAATGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGTCTGGCTGGCC
GGTCCGCCTCACCGCGAGGTACTGTTCGCAGAATTCCTTTGGGGAATTCTCATGGCCTTTCATTTGCTTG
AGGGGGAACCAGACTTTACTGTGAAAAAAATTAGAGTTCAAAGCAGGCCTTGCTCGAATACATTAGCATG
GAATAATAGAATAGGACGTGCGGTTCTATTTGGTTGGTTCCTAGGACCGCGGTAATGATAAATAGGGATA
GTCGGGGGCGTCAGTATTCAGGTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTGCTGAAGACTAACTACTGCGAAA
GCATTCGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAGGGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTC
GTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGACGGTGTTTCTATTATGACCCGTTCGGCACCTT
ACGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGATATTGACGG
AAGGGCACCACCAGGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACTCGGGGAAACTCACCAGGTCCAGAC
AAAATAAGGATTGAGAGATTGAGAGCTCTTTCTAGATCTTTTGGATGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTT
GGTGGAGTGATTTGTCTGCTTAATTGCGATAACGAACGAGACCTCGGCCCTTAAATAGCCCGGTCCGCAT
TTGCGGGCCGCTGGGTTCTTAGGGGGACTATCGGCTCAAGCCGATGGAAGTGCGCGGCAATAACAGGTCT
GTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGACAGGGCCAGCGAGTACATCACCTTGGC
CGAGAGGTCTGGGTAATCTTGTTAAACCCTGTCGTGCTGGGGATAGAGCATTGCAATTATTGCTCTTCAA
CGAGGAATGCCTAGTAGGCACGAGTCATCAGCTCGTGCCGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCC
CGTCGCTACTACCGATTGAATGGCTCGGTGAGGCGTTCGGACTGGCTCAGGAGGGTTGGCAACGACCCCC
CAGAGCCGGAAAGTTGGTCAAACCCGGTCATTAGAGGAAGAAAAGCAACCTTTATTTCACACAAAAAATC
CCT

3. ISOLATE G

TTGACAGGTCAACTAGTTCAGTATGGACGACACCGCCAGCGCAGAAGCTATGCTCGCATTAGCGAAGTGT
TAGAATTACCAAATCTCATTGAAATTCAAACCTCTTCTTATCAGTGGTTTCTTGATGAGGGTCTTAGAGA
GATGTTTCAAGACATATCACCAATTGAGGATTTCACTGGTAACCTCTCTCTTGAGTTCATTGATTATAGT
TTAGGTGAGCCTAAATATCCTGTAGAGGAATCAAAAGAACGTGATGTGACTTACTCAGCTCCGCTAAGAG
TGAAGGTTCGTTTAATTAACAAAGAAACTGGAGAGGTAAAAGACCAAGATGTCTTCATGGGTGATTTCCC
TATTATGACAGATACAGGTACTTTTATCATTAACGGTGCGGAACGTGTTATCGTTTCCCAGCTTGTTCGG
TCTCCAAGTGTATATTTCAGTGGTAAAGTAGACAAAAACGGTAAAAAAGGTTTTACCGCAACTGTCATTC
CAAACCGTGGCGCATGGTTAGAATACGAAACTGATGCGAAAGATGTTGTTTATGTCCGCATTGATCGCAC
ACGTAAGTTGCCGGTTACGGTTCTTTTGCGTGCTCTCGGCTTCGGCTCCGATCAAGAGATTCTTGATCTC
ATAGGAGAAAACGAATACCTGCGAAATACGCTTGATAAAGATAACACAGAAAACAGCGACAAAGCGTTGC
TGGAAATTTACGAGCGTCTCCGTCCTGGAGAGCCGCCTACAGTAGAAAATGCGAAAAGCTTGCTTGATTC
TCGTTTCTTTGATCCGAAACGATACGATCTTGCCAATGTAGGACGCTATAAAATTAATTTAAAACTTCAT
ATTAAGAATCGCCTCTTCAATCAGAGACTTGCTGAAACGCTTGTTGATCCTGAAACAGGAGAAATCCTTG
CTGAAAAAGGCCAGATTCTTGATAGAAGAACGCTTGATAAAGTACTGCCATACTTAGAAAACGGAATCGG
TTTTAGAAAGCTGTATCCGAATGGCGGCGTTGTTGAAGATGAAGTGACTCTTCAATCAATTAAAATCTTT
GCTCCGACTGATCAAGAAGGAGAACAGGTTATCAATGTAATCGGCAATGCTTACATCGAAGAAGAGATTA
AAAACATCACGCCTGCTGATATTATTTCTTCAATCAGCTACTTCTTCAACCTGCTGCACGGAGTAGGCGA
CACAGATGATATCGATCATCTTGGAAACCGCCGTTTACGTTCTGTAGGCGAGCTTCTCCAGAACCAATTC
CGTATCGGTTTAAGCCGTATGGAGCGTGTGGTTCGTGAGAGAATGTCAATTCAAGATACGAATACAATTA
CGCCTCAGCAGCTGATCAATATTCGTCCTGTTATTGCGTCCATTAAAGAGTTCTTTGCAAGCTCACAGCT
TTCTCAATTCATGGATCAGACGAACCCGCTTGCTGTATTAACGCACAAGCGTCGTCTGTCAGCATTAGGA
CCGGGCGGATTGACACGTGAGCGTGCCGGAATGGAAGTGCGTGACGTTCACTACTCCCACTATGGCCGTA
TGTGTCCGATTGAAACGCCTGAGGGCCCGAACATCGGTTTGATCAACTCACTATCATCTTATGCAAAAGT
AAACCGTTTTGGCTTTATTGAAACGCCATATCGCCGCGTTGACCCTGAAACAGGGAAGGTAACGGGCAGA
ATCGATTACTTAACTGCTGATGAAGAGGATAACTATGTTGTCGCTCAAGCGAATGCTCGTCTTGATGACG
AAGGCGCCTTTATTGATGACAGCATCGTAGCTCGTTTCCGCGGGGAGAACACCGTTGTTTCCAGAAATCG
TGTAGACTACATGGATGTATCGCCTAAGCAGGTTGTATCTGCTGCGACAGCATGTATCCCGTTCTTAGAA
AACGATGACTCCAACCGTGCCCTCATGGGAGCGAACATGCAGCGTCAGGCTGTGCCTTTGATGCAGCCGG
AAGCGCCATTTGTTGGAACTGGTATGGAATACGTATCAGGAAAAGACTCTGGTGCCGCTGTTATTTGTAA
ACACCCTGGTATCGTTGAACGCGTAGAAGCCAAAAACGTTTGGGTTCGCCGTTATGAAGAAGTAGACGGT
CAAAAAGTAAAAGGAAACCTGGATAAATACAGCCTGCTGAAATTTGTCCGCTCTAACCAAGGTACGTGCT
ACAACCAGCGTCCGATCGTAAGTGTCGGCGATGAAGTGGTAAAAGGAGAAATCCTTGCTGACGGTCCTTC
TATGGAGCTTGGTGAACTTGCACTTGGCCGTAACGTAATGGTCGGCTTCATGACGTGGGATGGCTACAAC
TATGAGGATGCCATCATCATGAGTGAACGCCTAGTGAAGGATGATGTTTATACATCTATCCACATTGAAG
AATACGAATCAGAAGCACGTGATACGAAACTTGGACCTGAAGAAATCACTCGCGATATTCCAAACGTCGG
TGAAGATGCGCTTCGCAATCTTGATGACCGCGGAATCATCCGTATTGGGGCAGAAGTAAAAGACGGAGAT
CTTCTTGTTGGTAAAGTAACGCCTAAAGGCGTAACTGAACTGACTGCCGAAGAACGCCTTCTTCACGCCA
TCTTTGGCGAGAAAGCCCGCGAGGTTCGTGATACTTCTCTTCGTGTGCCTCATGGCGGCGGCGGAATTAT
CCATGACGTTAAAGTCTTCAACCGTGAAGACGGAGACGAACTTCCTCCAGGTGTTAACCAGTTAGTACGC
GTATATATCGTTCAGAAACGTAAGATTTCTGAAGGGGATAAAATGGCCGGTCGTCACGGTAACAAAGGTG
TTATCTCTAAGATTCTTCCTGAAGAGGATATGCCTTACCTTCCTGACGGCACACCAATTGATATCATGCT
TAACCCGCTGGGCGTACCATCACGTATGAACATCGGGCAGGTATTGGAACTTCACATGGGTATGGCCGCT
CGTTACCTTGGCATTCACATTGCATCTCCTGTATTTGACGGAGCGCGAGAAGAGGATGTCTGGGAAACAC
TTGAAGAAGCCGGCATGTCTCGTGACGCCAAAACAGTGCTTTACGACGGACGTACTGGAGAGCCGTTTGA
TAACCGTGTATCTGTCGGTATCATGTACATGATCAAACTGGCTCACATGGTTGACGATAAACTTCATGCA
CGCTCTACAGGCCCTTACTCACTTGTTACGCAGCAGCCTCTTGGCGGTAAAGCGCAATTTGGCGGACAGC
GTTTTGGTGAGATGGAGGTTTGGGCACTTGAAGCTTACGGTGCGGCTTACACTCTTCAAGAAATTCTGAC
TGTTAAGTCTGATGACGTGGTTGGACGTGTGAAAACATACGAAGCCATCGTTAAAGGCGACAATGTTCCT
GAACCAGGTGTTCCGGAATCATTCAAAGTATTAATCAAAGAACTTCAAAGCTTAGGTATGGATGTCAAAA
TCCTTTCTGGTGATGAAGAAGAAATAGAAATGAGAGATTTAGAAGACGAAGAAGATGCGAAACAAGCTGA
CGGCCTGGCATTATCAGGTGATGAAGAGCCGGAAGAAACAGCATCTGCAGACGTTGAACGCGATGTAGTA
ACAAAAGAATAA

4. ISOLATE B

GAACGGGTGAGTAACGCGTAGGTAACCTACCTCATAGCGGGGGATAACTATTGGAAACGATAGCTAATAC
CGCATAAGAGAGACTAACGCATGTTAGTAATTTAAAAGGGGCAATTGCTCCACTATGAGATGGACCTGCG
TTGTATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCTCACCAAGGCGACGATACATAGCCGACCTGAGAGGGTGATC
GGCCACACTGGGACTGAGACACGGCGCAGACTCCTACGGGAGGCTGCAGTAGGGAATCTTCGGCAATGGG
GGCAACCCTGACCGAGCAACGCCGCGTGAGTGAAGAAGGTTTTCGGATCGTAAAGCTCTGTTGTTAGAGA
AGAATGATGGTGGGAGTGGATAATCCACCAAGTGACGGTAACTAACCAGAAAGGGACGGCTAACTACGTG
CCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTCCCGAGCGTTGTCCGGATTTATTGGGCGTAAAGCGAGCGCAGGCG
GTTTTTTAAGTCTGAAGTTAAAGGCATTGGCTCAACCAATGTACGCTTAGGAAACTGGAGAACTTGAGTG
CAGAAGGGGAGAGTGGAATTCCATGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATATGGAGGAACACCAGTGGCGA
AAGGGGCTCTCTGGTCTCTAACTGACGCTGAGGCTCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCT
GGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAGTGCTAGGTGTTAGGCCCTTTCCGGGGCTTAGTGCCGGAGCTAACG
CATTAAGCACTCCGCCTGGGGAGTACGACCGCAAGGTTGAAACTCATAGGAATTGACGGGGGCCCGCACA
AGCGGTGGAGCATGTCGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCCGATGCCC
GCTGTAGAGATAGAGTTTTACTTCGGTACATCGGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCG
TGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTATTGTTAGTTGCCATCATGAACTTGGGCACT
CTAGCGAGACTGCCGGTAATATACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGACC
TGGGCTACACACGTGCTACAATGGTTGGTACAACGAGTCGCAAGCCGGTGACGGCAAGCTAATCTCTTAA
AGCCAATCTCAGTTCGGATTGTAGGCTGCAACTCGCCTACATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGGAT
CAGCACGCCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGAGAGAATGTAACA
CCCGA

5. ISOLATE E

ATGTCTAAGTATAAGCAATTTATACAGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGA
TAGTTCCTTTACTACATGGTATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTTAAAATCTCGACCCTTT
GGAAGAGATGTATATATTAGATAATTAATCAATGTCTTCGGACTCTTTGATGATTCATAATAACTTTTCG
AATCGCATGGCCTTGAGCTGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAG
TGGCCTACCATGGTTTCAACGGGTAACGGGGAATAAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGG
CTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTAATTCAGGGAGGTAGTGACAATAA
ATAACGATACAGGGCCCATTCGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATGTAAATACCTTAACGAGGAACA
ATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTATAGTTGTTGC
AGTTAATAAGCTCGTAGTTGAACTTTGGGCCCGGTTGGCCGGTCCGATTAATTCGTGTACTGGATTTCCA
ACGGGGCCTTTCCTTCTGGCTAACCTTGAGTCCTTGTGGCTCTTGGCGAACCAGGACTTTTACTTTGAAA
AAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCGTATTGCTCGAATATATTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGTTTGG
TTCTATTATGTTGGTTTCTAGGACCATCGTAATGATTAATAGGGACGGTCGGGGGCATCAGTATTCAATT
GTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGACGTTTTCAT
TAATCAAGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGATGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCC
GACTAGGGATCGGGTGGTGTTTTTTTAATGACCCACTGGGCACCTTACGAGAAATCAAAGTCTATGGGTT
CTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCC
TGCGGCTTAATATGACTCAACACGGCGAAACTCACCAGGTCCAGACACAATAAGGATTGACAGATTGAGA
GCTCTTACTTGATTTTGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTCCTTAAT
TGCGATAACGAACGAGACCTTAACCTACTAAATAGTGGTGCTAGCATTTGCTGGTTATCCACTTCTTAGA
GGGACTATCGGTTTCAAGCCGATGGAACTTTGAGGCATTAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGACGTTCTGG
GCCGCACGGGCGCTACACTGACGGAGCCAGCGAGTCTAACCTTGGCCGAGAGCTCTTGGTAATCTTGTGA
AACTCCGTCGTGCTGGGGATAGAGCATTGTAATTATTGCTCTTCAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGCAAG
TCATCAGCTTGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTAGTACCGATTGAATGGC
TTAGTGAGGCCTCAGGATCTGCTTAGAGATGGGGGCAACTCCATCTCAGAGCGGAGAATTTGGACAAACT
TGGTCATTTAGAGGAACTAAAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACC

6. ISOLATE H

CTATTTCTTATCGTCGGTACTGTTGGCAGACTTACCGTCAGTTGCTTGTGCTGCGGCTTCGTGAGCCTTC
TTTTCTTCCTGCTGAGCAGCAAACTTCGCCAAGGCATCGACAGAAACAATGTCATCCTCGTCGTCGTCCA
TATCCCGCAGTTCAATTTCTTTTTTATCCGCGCCAAGGACCTTCATATCCAGACCCAGTGCTTGCAATTC
TTTGACAAGCACACGGAAGGATTCTGGTACACCCGGCTTAGGAATCGGTTCGCCCTTAACGATGGCTTCA
TAGGTCTTAACCCGGCCAACCACGTCATCGGACTTGTACGTCAGGATTTCCTGCAAAGTATAAGCCGCGC
CATAAGCTTCAAGGGCCCAAACTTCCATTTCACCAAAACGCTGACCACCAAACTGAGCTTTACCACCAAG
TGGCTGTTGGGTAACTAAACTGTAAGGTCCAATGGAACGAGCATGAATCTTATCGTCAACCATGTGAGAC
AGTTTCATGTAGTACATGATTCCGACAGAAACACGGTTTTCGAATGGTTCACCAGTTCGACCATCATACA
AGACAGACTTACCATCAGATGCCATACCGGCTTCCTTAACGGTTGCCCACAGATCTTTATCGTTGGCGCC
ATCGAAAACAGGCGTTGCAACATGAATGCCCAAGTTACGTGCAGCCATCCCCAGATGCAATTCCAGCACC
TGTCCGATGTTCATACGACTTGGCACACCCATTGGTGACAAGCAGATGTCAACTGGGGTACCGTCTGGCA
AGTATGGCATGTCCTCTTCAGGCACAACGACGGAAACCCTCCCTTTGTTCCCGTGACGACCGGCCATCTT
ATCACCGACCTGAATCTTCCGTTTCTGCGTAATATAAACGCGGACCATCATATTCACACCAGGAGACAGC
TCATCGCCGGCTTCACGAGTAAAGATCTTAACGTCTTGAATGATCCCGCCGCCGCCATGGGGAACCCGCA
GCGAGGTGTCACGTACTTCACGTGCTTTCTCACCAAAGAACGCATGCAGTAACCGTTCTTCAGCTGACAA
TTCAGTAACGCCCTTAGGTGTAACCTTGCCGACCAAAATATCACCGTCACGCACTTCAGCGCCGACACGA
ACGACACCAAATTCATCCAGATCCTTAAGGGCTTCTTCACCGACGTTTGGAATTTCACGCGTTACTTCTT
CAGGCCCAAGCTTGGTGTCACGTGCTTCAGATTCATATTCAACAATATGGATTGAGGTGTAAACATCATC
TTTAACGAGTCGTTCGGAGAGCACAATCGCATCTTCGTAGTTGTACATGTTCCAAGTCATGAAGGCGATG
ATCGGGTTTTGTCCCAATGCCAATTCACCATTTTGCATGGCTGGTCCATCAGCGATGATTTCGTCAACAT
CAACATGATCGCCGATGGTCACGATTGGCCGCTGGTTGTAGTTTTTACCGGCGTTACTACGCTTGAATTT
CATCAAGTTGTAGGCATCCAAGGCGCCATCTTCACGACGAACCCGAATTTGCTTAGCATCAACATATTCA
ACGGTACCAGCGTTATTAGCCAAAACCGCTGTCCCGGAGTCATGGGCTGCCTTGTATTCCATCCCAGTCC
CAACAAGTGGGGCATGCGGATTAACCAACGGCACAGCCTGACGTTGCATGTTCGCACCCATCAAAGCACG
GTTGGAGTCATCGTTTTCCAAGAAAGGAATGCAAGCCGTTGCGACCGCAACAACCTGTTTAGGTGAAACG
TCCATGTAGTCAACTTTGTCTGGAGAGATTTCAATGTTGTTATCCTTGTGACGAGCCAGAACGGTTTCGT
CAACAAAGGAACCATCGTCGTTCAAAGGCGAGTTCGCCTGCGCAACGATGTAGTTATCTTCTTCATCGGC
AGTCAAATAGTCGATTTTGTCGGTAACTTTATGCGTATCCCAAGAAACACGACGATATGGCGTTTCAATA
AAACCATAAGGATTAACAACCGCATAAGAAGCAAGGCTGTTAATCAACCCGATGTTCGGGCCTTCAGGCG
TTTCAATCGGACACATACGGCCATAATGGGTGTAGTGAACGTCCCGGACTTCATAACCGGCACGGTCACG
CGTCAACCCACCAGGTCCAAGAGCAGACAGACGGCGCTTATGCGTTAACTCACCAAGCGGATTCGTCTGA
TCCATAAACTGCGACAGTTGGGAACTGCCGAAGAATTCCTTGATAGAAGCTACAACTGGCCGAATGTTGA
TCAATTGTTGCGGTGTTACCGTAGCGGTATCTTGAATGGACATCCGCTCACGGACAACACGTTCCATCCG
AGAAAGCCCGATCCGGAATTGGTTTTGCAACAGTTCACCAACGGAACGAATCCGCCGGTTACCCAAGTGA
TCAATGTCATCAATTGAACCCAAGCCTTCCTGAAGATTCAGGAAGTAGTTCATTGATGCCAAAACATCAG
CTGGGACGATGTGCTTCACTTTTTTACCAATATGACCGTTACCAATCAAATTGATTTCTTTATCAGGGGT
CACTTGTGAGTATACTTTGATACTCTGTAATTCGATCGGATCAGTGACAACGCCTTGATCGGAAGGTTGG
TAGGTGATGGTCTTGAAATCATCGCGGTCAAGATATGGTGCCAACTTGTCCATCACTTGACGATCAACCT
TGGTGCCCTTTTGCGCAATGACTTCACCAGTATCAGGATCGGCCAGTGTTTCTGCCAAAACCTGATTCAA
AAGCCGGGTCTTAAGGCTCAGCTTCTTATTCACTTTGTAACGACCAACCGAAGCAAGATCATAACGCTTC
GGGTCGAAGAAGCGGGCATACAAAAGAGACCGCGATGAATCGGCTGTTTTTGGTTCGCCAGGACGTAGAC
GTTCGTAGATATCCTTCAACGCTTCGTCCGTACGGGAATCATCCGTATTCTTATGCACATCTTTTTCAAG
CGTAAGCATCAAGGAATCATTGTCACCAAACATGTTGATAATGTCTTGATCGGAACCGAAGCCCAACGCC
CGAACCAATTCGGTCAGCGGAATCTTCCGTGTCCGATCGATTCGGACATACGCGATATCTTTGGCGTCAG
TTTCATATTCAAGCCAAGCGCCCCGGTTAGGAATCACGGTTGTGCCATAAGTGACACGTGAGTTCTTGTC
TGTTTCGCTATGGAAATAAACGCCAGGTGAACGGACCAACTGAGAAACGATGACCCGTTCGGCACCATTA
ATAATAAACGTCCCTTGTTTGGTCATCAGCGGGAAGTCGCCAAAGAACACATCTTGGCTCTTAATCTCGC
CTGTTTCATGGTTGGTTAAACGCAAGGTCACATGCAACGGTGCAGAGTAGTTTGCATCGTGTTGGCGTGC
TTCCTCAACAGTATATTTTGGTTCCAGCAGTTGATAGCCGACAAATTCCAGTGACAGTTTCCCTTGAAAG
TCATCGATCGGCATAATATCGTCGAACATTTCTTTGAGACCTTCATCGAGGAACCATTGGTAAGAATTCG
TTTGGATCTTGATCAGATTAGGAAGATCCAAAACTTCCTTGATCCGGGCATAGGACCGGCGTGTCCGGTG
CTTACCATAATTCACTAAGTGTCCTGCCAA
 7. ISOLAT C

TAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCACCTTCCGATACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCC
AATCATCTGTCCCACCTTCGGCGGCTGGCTCCTAAAAGGTTACCTCACCGACTTCGGGTG
TTACAAACTCTCGTGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCGGGAACGTATTCACCGCG
GCATGCTGATCCGCGATTACAAGCGATTCCAGCTTCACGCAGTCGAGTTGCAGACTGCGA
TCCGAACTGAGAACAGATTTGTGGGATTGGCTTAACCTCGCGCTTTCGCTGCCCTTTGTT
CTGTCCATTGTAGCACGTGTGTAGCCCAGGTCATAAGGGGCATGATGATTTGACGTCATC
CCCACCTTCCTCCGGTTTGTCTCCGGCAGTCACCTTAGAGTGCCCAACTGAATGCTGGCA
ACTAAGATCAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATCTCACGACACGAGCTG
ACGACAACGATGCACCACCTGTCACTCTGCCCCCGAAGGGGACGTCCTATCTCTAGGATT
GTCAGAGGATGTCTAGACGTGGAAAGGTTGTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCT
CCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCCTATGAGTTTCAGTGTTGCGACCGTACTCCC
CAGGCGGAGTGCTTAATGCGTTAGCTGCAGCACTAAGGGGCGGAAACCCCCTAACACTTA
GCACTCATCGTTTACGGCCTGGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTCGCTCCCCACGCTT
TCGCTCCTCAGCGTCAGTTACAGACCAGAGAGTCGCCTTCGCCACTGGTGTTCCTCCACA
TCTCTACGCATTTCACCGCTACACGTGGAATTGCACTCTCCTCTTCTGCACTCAAGTTCC
CCAGTTTCCAATGACCCTCCCCGGTTGAGCCGGGGGCTTTCACATCAGACTTAAGAAACC
GCCTGCGAGCCCTTTACGCCCAATAATTCCGGAAAACGCTTGCCTCCTACGTATTACCGC
GGCTGCTGGCACGTAGTTAGCCGTGGCTTTCTGCTTAGGTACCGTCAAGGTACCGCCCTG
TTCGAACGGTACTTGTTCTTCCCTAACAACAGAGCTTTACGATCCGAAAACCTTCATCAC
TCACGCGGCGTTGCTCCGTCAGACTTTCGTCCATTGCGGAAGATTCCCTACTGCTGCCTC
CCGTAGGAGTCTGGGCCGTGTCTCAGTCCCAGTCTGGCCGATCACCCTCTCAGGTCGGCT
ACGCATCGTTGCCTTGGTGAGCCGTTACCTCACCAACTAGCTAATGCGCCGCGGGTCCAT
CTGTAAGTGGTAGCCGAAGCCACCTTTTATGTTAGAATCATGCGGTTCAAACAACCATCC
GGTATTAGCCCCGGTTTCCCGGAGTTATCCCAGTCTTACAGGCAGGTTACCCACGTGTTA
CTCACCCGTCCGCCGCTAACATCAGGGAGCAAGGTCCCACCTGTCCGCTCGACTTGCATG
TATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCGTCCTGTGCCAGGATCAAACTCTCCGATAAAT

8. ISOLATE F

AACCTGGTTGATCTTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCAAGTGAAAGTATATGC
ATATTTTATATGTAGAAACTGCGAACGGCTCATTAAAACAGTTATAATCTACTTGACATTTTTTCTATAA
GGATAACTACGGAAAAGCTGTAGCTAATACTTGATTTAACACTCTTGATTAAGTTCTTGAGTGTGTACTT
GTTAAGCCTATTAAGAAAAAAGTTATTAACTTAAGGAATTATAACAAAGAAGCAACACGTAAATGGATTT
TCCATTTATTAGTGTGTATCAATCGAGTTACTGACCTATCAGCTTTTGATGTTAGGGTATTGGCCTAACA
TGGCTATGACGGGTAACGGGGAATTAGAGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAATAGCTACCACATC
TAAGGAAGGCAGCAGGCGCGTAAATTACCCAATTCTAAAGAAGAGAGGTAGTGACAAGAAATAACAATAC
AAGGCCAATCTGGCTTTGTAATTGGAATGATGGCAATTTAAAACCTTCCCATAACTCAATTGGAGGGCAA
GTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAATTGTTGCAGTTAAAACGCT
CGTAGTTGAATTTCAAAGAATCGATATTTTAAGTAGCACTTTGTACATTAATCCACATAACTGATACTAC
GTATCGACTTTGTGCGCATTTTTCTACTTATGTGTTCTTTTAATTAAAATGATTCTTTTTAAGATCTTTC
TTTATTGCTTCGGCATTTTAGGAGATCTTGTTACTTTGAGTAAATTAGAGTGTTCAAAGCAAACAGATTA
TAGCATCTTTATGCGTTTGAATACTACAGCATGGATTAACAAAATTCAACAAGTCAGAATTTTGTTCTTT
TTTCTTATTTTGGCTTAGTTACGATTAATAGGAGTAGCTTGGGGGCATTTGTATTCAGATGTCAGAGGTG
AAATTCTTAGATTTTCTGGAGACTAACAACTGCGAAAGCATTTGCCTAAAATACTTCCATTAATCAAGAA
CGAAAGTTAAGGGAGTGATGACGATCAGATACCGTCGTAATCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGCCT
TGGATGAATGATTTTAAAATAAGAGTTTTTTCTCTGAGGAGTTAAAAGTCTTAGATTGCTTCCTTCAGTG
CCTTATGACAAATCAAAGTCTTTGGGTTCTGGGGCGAGTATTCGCGCAAGCGAGATAGTTAAAAGAACTG
ACGGAAGGGCACCACCAGGCGTGGAGCTTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACTAGTTTA
AGACATGAGTAGGATTGACAGATTAATAGCTCTTTCTTGATTTCTTGGATGGTGATGCATGGCCGTTTTT
AGTTCGTGAATATGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGATCTTAACCTGCTAATTAGCGGCAA
ATACGATATATTCTTATGTGGAATTGAATATAGTTGATTTGCTTATTTTGAAGAAAATATTGGGATACGT
AAATGTATCCCTATCCCTTATCTACTTAATTTGCTTATCATACTATTTCTTTTTTGCGTAAGAATGTATT
TGCTTGATTGTAAAGCTTCTTAGAGGAACGATGTGTGTCTAACACAAGGAAGTTTAAGGCAACAACAGGT
CTGTGATGTCCTTAGATGAACTAGGCTGCACGCGTGCTACACTGATATGTATAACGAGTATTATAAAATT
ACGTTTGTGCTTGCAGATTCGTACTTATCCTCCACTGAAAAGTGTAGGTAATCTTTATCAATACATATCG
TGATGGGGATAGATTATTGCAATTATTAATCTTGAACGAGGAATGCCTAGTAAGCATGATTCATCAGATT
GTGCTGTCTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTGAAAGATATGATGAATT
GTTTGGACAAGATGAAAGGAGATTATATCTTCTTTTTTCTGGAAAAACCGTAAATCCTATCTTTTAAAGG
AAGGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTA

9. ISOLATE I

TTATTTTGTTGCATTATATAATTCGTCAACTTTTTCCCAGTTAACTACATTCCAAAATGCGCCAATGTAG
TCAGGGCGTTTGTTTTGATATTTTAGGTAATAAGCGTGTTCCCATACGTCTAAACCTAAAATAGGTGTTT
TACCCTCAGTTAATGGATTATCTTGGTTTGGTGTAGTCACAATTTCTAACTGGCCATTGTTTACGACTAA
CCAAGCCCAACCTGAACCAAAGCGTGCAGCTGCTTTGTCAGCAAATTCTTTTTTAAATTCTTCTAAAGAA
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