pee ee A) i Illustrated Reviews Bee tile) USM eeeee Ture UTES ETT] Reviews Biokimia Ua Le UTE Dee ea ee ee ea Se ee ae ae eee ne ee ee To banyak informast yang krtkal dan kompleks. Selama lebih deri dua dekade, gece ee area ea Ur Tue cee a et at ac eee ces Tes nae! Cee tere ee ery Sot eee eet a ee a et ae Ra cu eeu) rooney Pat eT ee eee re ca ‘tahuan yang telah Anda pelajar serta menghemat waktu Anda. ace er es eco Perea tae ee ee ee) ea oe ete Lee Sa eee ecg et eer OE Oy [ BINARUPA AKSARALippincott’s Illustrated Reviews Biokimia E aE ES RE Denise R. Ferrier, Ph.D. Department of Bachem and Molclar Biology Drexel University College of Medicine Priladephia, Pennsylvania Al Bahasa: Dr. Winarsi Rudiharso, Sp.Bkm, Dr, Andry Hartono, Sp.GK. Stl Perr aan Bick Fut editor rivets Tso (Unwersias Fela Harpn, Univestas Keston Kida Wana Dr, Lyndon Saputra Jporaedonesa Editor: DR, Eti Yerizel, ns/ Harliansyah, Ph.D. Dr, Yahwardiah Siregar, Ph.D. eta Baan Biokimia Dosen Seror Bok Desen Boks Fahuts Redoiteran Fakta Kedoltran FalutasKedolteran Univers Anas dan Universitas YARS~ arta Universitas Sustera Utara Seletars PerhimpuranBikimia dan Indonesa Biomoelser Indonesia PEAY) Padang — Indonesia | CGiricl Edtor and Proofreader: Dr, Lyndon Saputra BINARUPA AKSARA Publishersc LUpncott' Mustrated Reviews Biokimla Els ko, Jd Satu ‘Ah Bahasa, Wari Rohaeo, Sp. 8k 1 Any Hato, SK. ¢ Lyndon Sapura Eton DR. Es Yl, MS. Dr Yarmardah Soar, PRD, Haslaneyah Ph. Cina Ector an Proteade: Or. ymdon Sapa Layout Santy Fotiyani {©2014 BINARUPAAKSARA Publisher SahsaaIedonesia) ek Cpt Diindungi Undang-undang Dilrang memparbanyak, mencelak laupn renertkan sebagian maypun slo isi bin ‘anpe iz tert dar pone (tet), BINARUPAAKSARA Publisher (Kelonpsk KARISMA Publishing) ‘Gedung Karsma, J Me. Toha No.2 Pondok Cabo Pamulang - Tangerang Sella 15418 Wali dons binspapubishaenaiicom Webete!wenutokobukkarma com Far (021) 74709201, Top. 021-7444555 ot 201129,Daftar Isi UNIT Bab Bab 2: jtruktur dan Fungsi Protein Asam Amino © Struktur Protein 27 Bab: Protein Globular 45 Bab 4: Protein Florosa 73 Bab Enzim 88. UNIT Il: Bioenergetika dan Metabolisme Karbohidrat Bab 6: Bioenergetika dan Fosforilasi Oksidatit 112 Bab 7: Pendahuluan Karbohidrat 134 Bab 8: Pendahuluan Mengenai Metabolisme dan Glikolisis 147 Bab 9: Siklus Asam Trikarboksitat dan Kompleks Piruvat Dehidrogenase 174 Bab 10: Glukoneogenesis 186 Bab 11: Metabolisme Glikogen 199 Bab 12: Metabolisme Monosakarida dan Disakarida 217 Bab 13: Jalur Pentosa Fosfat dan NADPH 229 Bab 14: Glikosaminoglikan, Proteoglikan, dan Glikoprotein 248, UNIT HI: Metabolisme Lipid Bab 15 Metabolisme Lipid dalam Makanan 271 Bab 16: Metabolisme Asam Lemak, Benda Keton dan Triasiigliserol 264 Bab 17: Metabolisme Fosfolipid, Glikosfingolipid dan Eikosanoid 315 Bab 18: Metabolisme Kolesterol, Lipoprotein dan Steroid 341Asam Amino LTINAUAN UMUN Protein merupakan molekul terbanyak dengan fungsi yang sangat berbeds pada sua sistem kehidupan. Hampir setap proses kehidupan bergantung pada molekal ni, Msalays, enzim dan hormon polipeptida ‘mengarablean dan mengatur metabolisme di dalam tubub, sementara protein kontraktil di dalam otot memungkinkan ceyjadinya perge- Been ae sles paces beers eee ‘pengendapan krstal kalsium fosft yang bekerja seperti kawat baja yang, ‘memperkuat beton bertulang. Di dalam alrsn dasah, protein seperti ‘pada hemoglobin dan albumin plasma, menganghut mole yangsangat ibucubkan untuk kehidupan, sementara imunoglobulin memerangi bakteri dan virus yang infeksius. Pada prinsipnya, protein memper: lihackan keragaman fangsi yang Ivar biasa, dan memiliki eampilan secuktur yang seropa, ystu rangksian polimer sam amino. Pada Bab 1 akan menjelaskan sifat asim amino. Bab 2 menjelaskan secara rinei enggabungan struktur pembangua yang sederhana ini unsult mem: bentuk protein dengan strukeurtiga-dimens yang unik, yang memboat protein mampu mengerakanfungsi biologi yang spesifik. IL STRUKTUR ASAM AMINO \Walaupun endapat lebih dari 300 jenis asim amino berbeds yang telah ixemukan di slam, hanya 20 jens yang wmumays ditemukan sebagai UNIT I: Struktur dan Fungsi Protein SS oe dalam ikatan Gambart Tampa sruktur asam amino (erthat slam bond trans por).10 > Lippineot’stustated Reviews Bikini, Jit Satu bagian dari protein mamalia, [Catatan: Asam amino cersebut adalah sam amino yang dikode oleh DNA, materi gentik yang terdapat di dalam sel (hat Bab 28). Setiap asam amino (kecuali prolin, yang _memiliki gugus amino sekunder) mempunyai sebuah juss bavbolil sebuah 0505 sono primer dan sebuah ranaisamping yang berbeda (cpus 1°) yang trikat pads atom karbon-ct (Gambar 1-1A). Pada DH fisiologis (mendekati pH = 7,4), gugus Karboksil tersebut ter disosias, membeatulcion karboksilt yang bermuatan negatif COO} ddan gugss amino mendspatkan proton (-NH) Pada protein, hampir semua gugus karboksil dan gugus amino ini ‘bergabung dalam ikatan peptida, dan unumnya tidak dapat mengadakan reaks kimia kecuali untek pembenrokan ikatan hidrogen (Gambar 1-1B). Jad secara alami, rantai samping yang akhimya berperan smenentuksn kerja sustu asam amino di dalam protein, Karena itu penggolongan asim amino berdasarkan ranta samping yang dimilki asim amino tersebut akan berguns—yait,apakah ranai sampingnya. bersifat nonpolar (mempunysi elektron yang distribusinya mera) atau betsfar polar (empunyai elektron yang distibusinya tidak) ‘meats eperti asam dan basa). Lihat Gambar 1-2 dan 1-3 ‘A. Asam amino dengan rantai samping nonpolar Setiap asam amino jens ini mempunyai sebuah rantai samping non polar yang take mengikat atau memberikan proton atau berperan| dalam ikatan jon atau ikatan hidrogen (What Gambar 1-2). Rana samping pada asim amino ini dapar dikatakan “bersfat seperti swinyak atau mirip-lipid, suaty sft yang membanta teradinya] ineral drofobi hat Garnbar 2-10. 1, Leake asam amino nonpolar di dalam protein; Pada protein yang] licemukan i dalam larutan yang mengandung six lingkungan polar—rantai samping ssam amino nonpolar cende+ rng untuk berimpol di bagian dalam protein (Gambar 1-4) FFenomena semacam ini dihasilkan oleh sifathidrofobik gugus-R| cost ‘nonpolar, yang aelalcukan hal seperti yang dilakukan oleh tetsu rminyalc yang berkumpul menjadi sau di dalam lingkungan bers CGogus-R nonpolae kennudian mengsibagin dalam protein yang] rmelipatsehingga membants memberikan bentuk tiga dimensi Pada protein yang terdapar di lingkungan hidrofobik, sepertiab 1+ Asam Amino >< 11 sebuah membran, gugus-R nonpolar akan dijump di pemukaan luar protein, yang berinterksi dengan lingkungan lipid (lihor Gambar 1-9), Peningnyaineraksihidvofobik ini dalam mensta- bilkan sere protein akan dijelaskan pada Bab 2 ‘Anemia sicko call, yatssuatu penyakt yang mem- at sel darah meran berbenuk sepert sabi (sickle), ‘eras Karena gltarnat polar diganti dengan alin oapoar pada posit keenam dalam subunit homo siobin (hat Bab 3) ‘lasts! 20 esam amino yang dtemukan dl dalam prosn,bardasarkan musta dan polars rani samping pada pH asa, ‘iunjukkan pada Garba 2 dan paca Ganbar 1-3 Selap asamarino ctunjukican dalam beruk eran penuh dengan trogn yang pat berlsosias|(Soeiak moa) Nia pK una gugustarboksi-a dan gugus anino-a pada asam ano nonpoar ‘Serupa dengan nis pK yang stunk Unk plin Beant ke Gamba 5),12 > Lippincott’ Hstated Reviews Biokimia, Jd Satu [RANTAISAMPING POLAR TIDAK BERMUATAN RANTAI SAMPING BASA2, Pro imengandung sebuah rant samping dan gusus N amino, sultur cincin beranggots-lima yang kaleu (Gambar 1-5). Jodi, pprolin memiliki gugus amino sekunder (bukan primes). Asam amino ini sering diberi nama sebagai “asam imino". Strktur gsometri prolin yang unik eriebut berperan dalam pembentukan seruktur fbrosa kolagen (liar Bab 4) dan seringkali memotong haelks-c. yang terdapat pada protein globular that Bab 3). Prolin berbeda dengan asim amino Ininnya karena B, Asam amino dengan rantai samping polar yang tidak hermuatan ‘Assm amino jens ini mempuayai muatan neto beri nol pada pH fisilogs, walaupun rani samping stein dan trosn dapat kebilangan satu proton pada pH alkali (har Gambar 1-3), Sern, teonin dan sirosin masing-masing mengandung satu gugus idroksil polar yang berperan dalam pembearukan iat hidsos (Gambar 1-6). Ranta samping asparagn dan glutamin masing masing memiliki satu gugus Tkarbonil dan satu gugus amid, dan keduanya juga dapar out serea dalam pembentskanikatanhidzogea. 1, Thatan disulfida: Ranta smping sscin mengandung sat 0505 solfhidel (iol) (SH), yang merupakan Komponen penting tempat-aktif sebagian besa enzim. Pada protein, gugut -SH dua sistin dapat mengalami olsidasi untuk membentuk save dimer, in yang mengandung ikatan slang kovalen yang disebut ‘katan dislfids (-S-S-), Dua ikatandislfda ssteindirajul seb si “sisin’. (Liar Bab 2 untuk penjelasan yang lebily mendalam _mengenai pembentukan ikstan disulid) ‘anyak poten eksrasel cust stabil melalui katan lsufida. Aburin yat poten éarah yang berungs! ‘sebagalransporerbrhagal mole merupakan sah 1g sebagai tempat melekarnya Komponen lain: serin, teonin, dan tirsin (walaypsn jrang), mengandeng 000 boidrolol polar yang dapat berfungs sebagai tempat melekatnya Gambari aka sam emo nonpolar pada pean yang apa ln dan protein memban, A SZ Gamba ts Poteaningan gus amino slander eng dapat pada prin dengan gugos ino prine: Jara rp en anemone we oper amber 6 Tkatan trogen antara gugus hiro fool Pda Sosa dan mola is yang manga ing gue baron14% Uipineats strate Ed terme yang ui anion) = oe = 6 Ports aera a BB ccs shine yang pang ‘ering muneu: Gino) = ch = Fp Nama yang pengucapannya mirp: = a= cai) inge— Aen= Cnn ‘met’ sep =D Cope (ee > ie = Car) ine n> a foe Seo F crn “rates = yr = ¥ cf) ‘wn = Te = Wiens ‘snc DD fi pare ltoenyabarte: ‘eatan dengan hur portama: npeotams = hex ~ Biaat) oo Lie tre) = os Ket ‘Gembart-7 Singatondn sinbolunukasar arsine yang Gambari Bont alaninD den Lmarupakanbayarcan ddan gugus hidroksil serin atau treonin, dapat berfungsi seb tempat melekataya rantai olgosikarida pada glikoprotein (li Bab 14) C. Asam amino dengan rantai samping yang bersifat asam ‘Asam amino aspartat dan asam glutamat merupakan dir prolong Pada pH fisiologik, rani samping asam amino ini sepenubny terionisas, dan mengandung jus bavbolsilot bermuatan nega C00}, Karena iu, asam amino joi disebutaspartat atau gluta untuk menekankan baba asim amino tersebut bermuatan negat pada pH fisiologs (har Gambar 1-3) 1. Asam amino Ranta samping asam amino basa snes) proton (Whar Gamb sigan rantai samping yang bersifat hasa 13), Pada pH fsiologs, gogus-R dav isin dan arginin sepenubny terionisst dan bermuatsn postf. Sebalinya,histidin merupaka basa lemah, dan asim amino bebasnya tidak bermuatan pada fisilogis. Namen, bila histidin bergbung dengan sua prote fgugus-R dapat bermustan posiif maypun netral,tergantung pi lingkongan ion yang dsediakan oleh protein, Hal ini merupakan s eating hisidin yang berperan sebagai buffer dalam fangs sua protein seperti pada hemoglobin (ar Bab 3). (Cataran: Hisii adalah satusatunys asam amino santal samping yang dapat melaki ‘kan ionisasi pada suatu pH fsiologis E, Singkatan dan simbol untuk asam amino yang sering muncul uf dan sib Seviap nama ssam amino mempunyaisingkatan tiga satuchuraf yang beshubungan (Gambar 1-7), Kode satu-huraf te seb divenvulean berdasarkan aturan sebagai ber: 1, Huruf pertama yang uni ‘yangdimula dengan sar huruf terteny, huruftersebut digunal Tike hanya terdapat satu asam amin sebagai simbol.Sebagai contob, V = vain, 2, Prioritas diberikan kepada asam amino yang paling serin muncul: Jka terdapa lebih davisaruasam amino yang dil dengan satu hur tertent, asam amino yang paling ume diha od “4 bal a ing lai dati asamasam amino inlah yang akan mendapatkan huruf tersebut srbagai simbolnya. Scbagai contob, glisn lebih sering, muncul “vel atau atom arbon sang ale scars optih. Clisin merupaean pengecuaian Karena karbon-a yang dimilkinya mempunyai dua stom hidrogen subsitsi, Asim amino yang mempuaysi pusst yang asimetris pala karbon-a. dapat muncul dalam dua bentuk, dalam posis dan . yang merupakan bayangan cerm sam sama Lanny (Gambar 1-8), Dua bentuk tersebur dengan pasangannya masing rasing dinamakan s\oscoivomer, omer opti ata Seluruh asam amino yang dtemukan di dalam protein berada dalam Dencuk konfigursi-L, Namun, 00 2/n0-1) dtemukan pada bebe: apa jens anibioik dan di dinding sl baker. (Liha Bab 19 unt penjelisan mengenai metabolsme ssam amino-D), ‘Asam amino dalam larutan aqueous mengandung gugus karboksil-a Yang bersfat asm lemah den gugus amino-c yang bersifat basa leah. Selin it, asam amino yang bersfatasam dan basa mengandung gugus yang dapat terionsasi di bagian rantaisampingnya. Jad, asam amino ab 1+ Asam Amina >< 1846 % Uppincot’ststrated Reviews Bikini, Jd Satu ‘bebas dan beberspa jens asam amino yang berikatan melalui peptida dapat berfungsi sebagai penapar (7). Inga, asam Aiantkan sebagai donor procon dan bas sebagai aksepror proton. {atau bas) yang disebt sebagai asam (atau bas) “ema” akan terion hanya sampaisuatu tara yang terbats, Konsentrasi proton dalam ara aqueous ickspreskan sebagai lai pH, di mana pl los 1/1 | “io, (1) | Hubungan kuantittif ancara pH cairan dan Konsent asam lemah (HA) dan basa konjugatnya (A) dapat dielskan d persamaan Henderson-Hiasselbale. ‘A. Turunan persamaan ‘Perhatkan pelepasin sebuah proton oleh asam lemah yang div oleh HA: ry pes iG ‘sam ema proton bok gam say asa onigat t Garam’ atau bass konjugat Ay merupalan bentuk asa lemah ya ‘erioniss,Berdssarkan definisi, Konstantadisosias asa, K,, adalah “eeu eis (Catatan: Semakin besar Ky, kessamanaya semakin kat, ks sebagian bear HA telah verdisosiasi menjadi H° dan A’, Sebalikm semakin kel nilaiK,, semakin sedikit asam yang terdisosiasi di Jkarena itu, kessamanaya semalkin lemah]. Dengan menycles persamaan di atas untuk (H1", menambabkan logaritma pada sisi persamaan, dan mengalikan kedua sisi persamaan dengan ~ Jog & persama sera mengganti pH = -log (H1"] dan pK, Henderson-Hasselbalch akan diperoleh: B. Butter oops (hoe adalaarutan yang menahan perubahan pH set penambshan asa atau bas. Buffer dapat diperleh dengan meacarmpsdf ioe asm enh (HA) dengan bas Kosjpnys, (A), ik ac pe] sper HCl diambablan ke dla tan blr A” dapat etal Saget lian proms boape jai TIA Taba eg) cite dale leven ey FIA daar mene base real ecu, Sgn mela proves konwersi IA mead A SO birt la mabe a eer aera Caterer a ees i ep berare eb flr yang ck il 0 wan rca Hera oda nit mendstai 1 oni pH dap Hl juke ee eae reel en eel enteric fin (FA = CH)-COOHD dan wee (= CHi-COO) engin PSs scbear 4 dopst menthin pervbabaa pH de 38etmpe5 6 BE pce belies pl lp 14, Bada ped et eg eet ee (001) merupatan jenis yang predominan dalam larutan. Pada silsi pH. yang lebih besar dari pK, bentuk bass yang eeilangan proton (pio) (Cs-CO0) mrerupakan jenis ‘yang predominan di dslam laruan, .Titrasi asam amino gugus harbolsil: Kurva titasi asim amino dapat di- analisis dengan cara yang sama seperti yang celah dijlaskan vunruk asam aseta. Sepertialanin, yang mempunyai gugus ter Bab 1+ Asam Amine 17 Sembar 1-10 | penton elnin delar lartan asam, neal don basa16 % Uppincot’s tustatod Reviews Bikini, Jd Sate Kua tira lin Hatton Oy CH, gugus-R adalah nonionisai). Pada pH yang « (Gsum),kedua gogus ini terprotonas (dirunjukkan pada Gam 1-10) Seialan dengan peningkatan pH larutan, gugus -COO} bentuk I dapa berdisosiasi dengan mendonorkan sebuah pr tke dalam media. Pelepasin sebuah proton menyebabkan tukays gugus karboksilat, -COO~ Struktur ini ditunjuld sebagai Bentuk Il, yang merupakan bentule (tar Gambar 1-10). Bent ini, dsebut juga akan slanin, yaive beatuk yang meni sustannettosebest nl Konstan sas guguskarbokslasam amino dsebut Ke, dan bukan Ky, ka smolekulrerscbut mengandung gugus hedua yang dapat dts Persamaan Henderson-Hasselbalch dapat digunakan untae analisisdisosisi gugus karbokilalann dengan cara serupa yang telah dielaskan unc asim asetat. dengan Tyang bentuk slaninterprotonai enh, dan I me alanin dalam bentuk ioelekri (lar Gambar 1-10). Pers ini dapat citata wang dan dikonversi menjadi bent logartmil sehingga menghasillan: at) Gugus kedua yang dapat diieasi d alanin adalah gugus sino (-NH,") yang ditunjulckan pada Ga bar 1.10, Gugus ini merupakan asam yang lebih lemab dib dingkan gugus ~COOH sehingga mempunyai konstanta dso Ky yang lebih ec, [Cattan:pK tentunya lebih bessr}- Pele sebuah proton dari gugus amino bentuk IL yang terproto ‘menghasilhan bentuk IL, yaicu bentuk alanin yang kebilang proton penuh (thar Gambar 1-10).Ie isc pons yg bern ac igs hcl tn ug amin dln drangkum pda Gamba 1-10,Sep payungdapn das meniikipR,yangwesramuneicert [Py gpaycengO) Mpa lp koa ep spurvh prconya la lenghan es Fer en idmayicn equ yang beni [Spee tam CCOOH) asah pk, setngkan pK var gugs yang |] 6 Omaspaamennaaan persfarasam selanjutnya (-NH,") adalah pK. [Catatat: pK, dari ‘myooettan prc ‘hue ada rept gugus Iarboksi-a: dari asam amino adnlah sekitar 2, sedanghan dati amino-c adalah sear 9, 5, Kurva tras alanin: Dengan menerapkan persimaan Henderson~ “Hasselbalch pada setiap qugus bersifat asam yang dapat berdiso- sas, kurva titi yang lengkap dar asm Iemah dapac dicung. Gambar 1-11 meaunjukdean perubahon pH yang trad selama penambahan basa ke bentuk teprotonasi penuh dari alin @) [le pup rig Qe 1 ‘untuk memproduksi benruk (I) yang tidak mengandung proton sama skal. Perhatkan hal Berkut in a, Pasangan buffer: Pasangan -COOH/-COO™ dapat berpe- an sebagai buffer di daersh pH sekiar pK, dan pasangan Si) N41 dapat menjadi buffer di daerah sekitar pK, b. Ket nilat pH ~ pK: Keka nial pH sama dengan pK (2 terdapat aanin bentok I dan I dalam jumlah yang seara di dalam laruan, Kika nil pH sama dengan pK @,1),terdapat sania bentul II dan HE dela jonah yang setara di dalam Tata, . Titik isoclclerik: Pada pH netel, alanin biasanya terdapat dalam bentuk II dipolar dengan gugus amino dan karboksl yang erionisasi, rai mustan netwonya sama dengan nol. Titik isoelktrik (pl) adalah nisi pH Ketika sebuah asam amino bersifar netral-yaru, jumlah muatan postf setara dengan jumlah mustannegatf, Unrukasam amino, seperti slain, yang, hanya memilki dua hidrogen yang dapac berdisosas| (atu eras dari gugus karboksil-a dan saru berssal dari gugus ciio-o\\ ptayaireiae! adil pees PRCT ACSS® | — eee aT 1/297 thar Gamba 1-11). Karena ir, pl adalah ila pertengahan antara pK; 28) dan pKs (1). Nila pl sesuai Prtrnsan Henderon-Hasselbch untuk fremores A Ponvbapan pH kata kon- {erwasi HD, eta CO, brute; atu. dengan ila pH Ketika bentuk 1 (lengan muatan netto sama eniukionk bat20% Uppincot' stated Reviews Bikini, si Satu dengan nol) mendomsiasi, dan juga Ketika verdapat bo (euatan netto= +1) dan benvulc I (matan neto =~ dala jumlah sera. pace pH anlara ip protin juiama, dal, mstn pada pron trabut dala nega. Dalam mado dei rot akan Dergerak He afaheletods posi dengan Kaos patan yang dtetskan dh mustan nega et ta, Vai paca pla mebitasnya menuruckan penal ttn. 6, Mustan netto asam amino pada pH netral: Pada pH fisiology seluruh gogus asam amino mempunyai gugus bermuatan nega (-COO} dan gugus eam amino yang bermuatan posiif NH," ‘keduanya menempel pada karbon- [Cartan gutamst, asp histiin, arginin dan lisin mem i gugus tambshan potensial brmustan di santa sampingnya). Bahan-bahan sam amino yang dapat bertindak sebagai asam ataupun bi lefinisikan saga so fotorh, dan disebu juga sebagai (i (clekirolit amfoterik). . Penerapan persamaan Henderson-Hassolbalch lainnya Persumaan Henderson-Hasselbalch dapat digunakan untuk: men ‘hcung bagnimana pH suatu laratanfsiologs dalam menanggapi pen ban Konsentrasiasam lema, dan/atau bentule “garam™ays ses Contoh pada ssien Terbikarbonat, persamaan Henderson Hasselbalch memperkirskan bagaimana pergeseran konsentrisi ion bikarbonat, [HCO,"] dan COs mempengaruhi nilai pH (Gamba 1-120), Persiaan ini juga bermaniaat unruk menghitung kelimd ppahan bentuk ionike pada obst-obatan yang bessifatasam dan bi ‘Sebagai conto, sebagian besar obat adalah asam lemah atau bas lemah (Gambar 1-128). Obar-obatan yang bersifat asim (HA) me paskan sebuah proton (T°) sehinggn menyebabkan terbentuk snion hermustan(A°) uncule membentuk WA Wek‘Basa Jem (BH) dapat juga melepaskan sebuah H1’. Namun bentuk bat dasar yang terprontomasihiasanya bermuatan, dan hilangnya sebuah proton menghasilkan basa yang tidak bermuatan (B) BH B +H ‘Obat lebih mudah melewati membranjika obattersebut tidak ber- fmustan. Karena ie, uacuk asam lemah seperti apirin, HA yang, tidak bermuatan dapat menembus membran, sedangkan A” tidak. ‘Untuk basa lema seperti morfin, entuk yang tidak bermuatan,B, menembus membran sl, sedangkan BH tidak. Karena itu, kon: senctasi efektf setiap bearuk obat yang permeabel di tempat bsorpsinya ditentukan oleh konsentrasirelatif bentuk yang ber ‘muatan (impermeant) dan y 3g tidak bermuatan (permeant). Per pandingan antara dus bentuk tersebue pada akhirnya ditentukan ‘oleh pH di tempat absorpsi, dan oleh keluatan asam lemah atau thasa lemal, yang divakili oleh pK, gugus yang dapat terionisas ‘ersebut, Persimaan Henderson-Hasselbalch bermanfsar dalam me- entulsin seberapa banyak obst yang ditemukan pada kedua ssi sebuah membran yang memisahkan dua kompartemen yang pE-aya berbeda, sebagai coal dilambung (pI 0-1 5; dan plasma dara @H74). I, PETA KONSEP “Terkadang para sow memandang biokimia sebagai fakta atau persamaan ‘yang kabur uncuk biss dings, davipada sebagai swatu konsep untuk di phan. Perincian yang diberikan watuk memperkaya pemahaman konseptersebut secara tidak segajaberubah menjadi pengalih perhatian, ‘Tampakaya, yang hilang adalah suatu peta jalur-pembimbing yang meayediakan peagersian initif untuk para sswa tentang cara berbagai embshasan yang sling berkeserusian age lebih masuk aka. Ja, para penulis menciptskan scrsyihaian pets honsep biokimia unruk mem- berikan gambaran secaragrafis hubungan ancar ide yang ditampilkan di sebuah hab, dan wntuk menunjulkan car agar informasi terebut dapat Gikclompokan dan disusun. Karen ity, peta konsep adalah alatuntule ‘menggambarkan hubsagan antar konsep. Matei ditampilkan dalam ‘92 hicarki, dengan konsep yang paling inklusf, yang paling urmum (Bab 1+ Asam Amino 2 Kotak Konsep yan berhubungan Som f+ comma | Sie Konsep yang beaut sang {engonBb an en uke n ‘Se setts22 % Uppincot’s tustated Reviews Bikini, Jd Satu ltampilkan di aas peta, dan konsep yang lebih spesifik, atau y Teurang umum, disusun di bawahaya. Peta koasep ideslaya berfu sebsgai template stow pemandu untuk informasi yang terorgais schingga siswa dapat menemukan cara yang terbaik untuk mengi sgratikan informasi yang baru ke dalam pengetahuan yang sudah mes alk Bagaimana peta konsep ini dibuat? 1. Kotak konsep dan penghubung: Para pend: mendefinis konsep sebagai ‘keterstiran yang dipahami dalam peristiwa a cobyek.’ Dalam pets biokimia, komseptersebut meliputi abstr (Gebagai contoh,energi eb), proses (misalya, fosforilasi daa), dan seayawa (misalaya, (ojos s/s). Konsep ya terdefinisi scars Iuss ini diprortaskan dengan ide sental yan akan kita pelajri. Konsep yang timbul setelah ide sentra smudian digambarkan pada Kotak (Gambar 1-13A). Ukuran jenis Kotak mengindikaskan kepentingan yang relatif pada sts ide Garie-gaisdibuat di antara Kotak konsep untuk menu kan bagian yang berhubungon, Label pada gais mendefinisik Inubungan antara dua konsep, sehingga terbaca sebagai perm: ‘yang valid artinys, hubungan tersebut meaeiptakan pengert Garis dengan anak panah mengindikasikan arsh pembscs Inubungan tersebur scharusays triad (Gambar 1-14) 2. Taut silang (Crositink): Tidak seperti pada diagram alur a Dagan, peta konsep dapat memvst taut-silang yang memangki ‘kan pembacany’s untuk membayangkan hebungan yang komple antara ide yang ditampilkan pada bagan yang berbeda di peta (Gambar 1-19B) atau antara peta dengan bab lain yang tt dapat dalam buku ini (Gambar 1-130). Dengan demikian, tau silang dapat mengidenifkasi konsep yang menjadi senteal ba lebih dari satu copik biokimia, dan memberdayakan siswa faif dalam scuasi Kins, dan pada Ujan Negara ata ujan Ii _yang menjembacanibstaan disiplin isu, Para sew besjar uns secara visual memahani hubungan non lier amar fkta, berkebalikan dengan perujukan siting di dalam teks lnier.Bab 1+ Asam Amino > 28 p asm amino menilki gugus karboksil~s dan gugus amino-a primer (keeval prolin yang -seemilki gugus amino sekunder). Pada pH fsiologis, gugus Karboksl-a terdisosasi, mem ~betulsion karboksilar (COO) yang bermuatan negai, dan gugus amino-a. yang terprotonasi (NEL, Seiap asin amino oga mengandung ste dari 20 rantai samping becbeda yang melekat ‘pada atom Kasbon-a. Sifa kimia gugue-R ini menentukan fungi asam amino di dalam protein, "dan memberikan dasar untuk Klasfkasi asam amino sebagai bentuk nonpolar, polar tidak -ermatan, hersifatasam (polar negati), atau basa (polar posit). —Seluru asam amino bebas, ditambah asam amino bermuatan pada rants pepids, dapat | berfa sebagai buffer. Hubungon uanttatifantars pH daviuratan dan konsentrasiasam lemah (FA) dan bass konjngaeay’ (A) dielaskan melalui persamaan Henderson-Hlasselbalch.Proses buffer (apa) teiadi di dalam reotang #1 nit pH pada pK, dan menjadi maksimal etka nila pH = pK, pada [A"] =[FIA]. Karbon-a setiap asam amino (kecuali glsin)tersambung dengan. ‘empat goguskimia yang berbeda, sehingea merupakan suatukirl (chiral) tau atom karbon yang, secataoptik tif, Hanya asm amino bencuk-L yang ditemuzan di dalam protein yang disintsis ‘oleh tubub manusia| 24 > UUpincot ustrated Reviews Bikinis sd Sata | |ASAM AMINO I rc saan coat Gugus karboksil~« |{ Gugus amino~a Ramis? | (7 aeipani (coon) eas. (2ojenls yang berbeda) an soba!Bab 1» Asam Amino = 25 jawaban yang epat yyataan manakah di antara seumlah pernyataan ni yang benar dalam kaitannya dengan kurva j untuk sebuah asam amino nonpolar? Hur A D menunjulan regio tertentu pada hurva di Jawaban yang tepat = © C menyatakan tk isoelerk aca pl, dan sebagai tk isoelekvik ‘erletale pada cl engoh atari py dan ‘pK, unl stim amina nonpolar. Asim amino smengalami protons penuh pada Ti A. Tite 29 © BB menyatakan sebuah regio dengan pendaparan maksimal sper alays Titik D. iia merups en asa amino yang bene alkali, dan me 10 z ilk ana saping yang aps trons A. Tikik A menyotakan regio tempat teradinys eprotonissiasam amino. B, Titik B menyatakan regio pendaparan_ mini- smal . Titik C menyatskan regio tempat muatan netto pada asam amino adalah nol , Titik D menyatskan slat pK gugus Iarboksil TE, Asam amino tersebut dapat berupa isn. Pernystsan manakah di antarasejumlah pernyataan berikut ini yang benar dalam kaitannya dengan pep- ‘ida yang diperinatkan di bawab ini? Jawaban yang tepat = © Gugus hidroksl sam amino seri dapat menerina gugus fos. Aspadalah asparat.Prolin mengandung sebuah _gegus amino sskunder, Dva resid stein dala ondisi teroksidasi dapat membentuk ikstan ValLoye-Giu-Ser-Asp-Wo-Cye A, Peprida tersebut mengandung aparagia,‘26% Uppincot's usteated Reviews Bikini, Jud Satu 13 B, Peprida terscbut mengandung rantai samping dengan sebuah gugus amino sekunder. G. Peptida tersebur mengandung rantai samping yang dapat menglamsfosorlas . Peprida tereebut tidak dapat membentuk:ikatan isla itera. Pept tersebut akan bergerak ke arah katoda (lkstods nega selamaeleteoforesis pada pHS. Seorang anak perempvan berusia 2 hun dtemukan alam kontisi asdosis metabolik setlah anak ita ‘memakan tablet aspirin beraroma harum dengan jumlah yang tidak diketabui, Pads sat diperiks, nila ‘pHtnya adalah 7,0, Dengan iat pK, aspirin (sam alist) =3, hitunglah rasio bentuk erionisasi aspirin ‘erhadap bentok takterionisas pada pH7,0. islfida (hovalen). Matan net pada dengan pli 5 adalah negify dan peptia i akan bergerak ke ara anod Jawaban yang tepat = 1009 cba pH =pK, + loglA"]/ FIA} Sehings7 =3 danse Ja aso A" (rion ead (Ga trons) adalah 10.000 bets ere log 1000 alah 4185 Iellsh abel di bawsh ab 1 agi storang pasiendefsensi 2i-achidroksilase yang klasik dbandingkan orang, normal ‘Berapa besar perubahan yang mungkin terjad jk pasien terebut mengslami defsiensi enzim 17-a- hideolsilase dan bukan 21-a-hidroksilase? Metabotisme Kolsterol, Lipoprotein dan Steroid » 379 Defiiensi 21-a-hidroksilase akan menyebab- kan hormon mineralokorikoid (aldosteron) an glakokorsikid koniso) pada akebat nya tidak tedapat, Karena aMosteon meninghat- ‘kan tekanan darh dan korisol meningkarkan kadar ghuikosa darah, maka defsiensi kedua ‘hormon ini masingmasng akan menurunkan tekanan dah din kadar lskosa darsh, Kor ‘sol normalnya akan memberikan umpan balk untuk menghambst pelepaan ACTH ‘leh Kelenae hipoise dan dengan demikisn elinan vidal adanya hormon tersebut akan ‘mengakibatkan Kenaikan produksi ACTH. "Tidak adanya 21-a-bidrokslase akan mendo- rong progesteron dan pregnenolone dalam prosts sntsis hormon androgen, dan dengan dlenikian menyebabkan kenaikan kaa andeo- ssonedion ads defisiensi 17-a-hidroksilase dak esd ‘nhbissintesis horton seks, Prods mine- salokortkoid akan meninghaseinggatimbl hipertensi.