Nama : Alkawi

NIM :17101102056

Tugas : Bioinformatika

A. Sekuens COI
>AP018398 Apis nigrocincta Sangihe island North Sulawesi
TTTTTAATCGGAGGTTTTGGAAATTGATTAATTCCATTAATATTAGGATCTCCTGA
TATAGCATTTCCTCGAATAAATAATATTAGATTCTGATTACTACCTCCATCATTAT
TTTTATTATTACTAAGAAATTTATTTTATCCAAGACCAGGAACAGGATGAACAGT
ATACCCCCCCCTATCTGCATACCTATATCATTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAG
TATTTTCACTTCATATATCTGGAATCTCATCAATTATAGGATCATTAAATTTAATG
GTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCATTAAATTATGATCAAATTTCTTTATT
TCCATGATCAGTATTTATTACAGCTATTCTATTAATTATATCTCTTCCAGTATTAG
CTGGAGCAATTACAATATTACTTTTTGATCGAAATTTTAATACT
>NC038114 Apis nigrocincta Sangihe island North Sulawesi
TTTTTAATTGGAGGTTTTGGAAATTGATTAATTCCATTAATATTAGGATCTCCTGA
TATAGCATTTCCTCGAATAAATAATATTAGATTCTGATTACTACCTCCATCATTAT
TTTTATTATTACTAAGAAATTTATTTTATCCAAGACCAGGAACAGGATGAACAGT
ATACCCCCCCCTATCTGCATACCTATATCATTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAG
TATTTTCACTTCATATATCTGGAATCTCATCAATTATAGGATCATTAAATTTAATG
GTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCATTAAATTATGATCAAATTTCTTTATT
TCCATGATCAGTATTTATCACAGCTATCCTATTAATCATATCTCTTCCAGTATTAG
CTGGAGCAATTACAATATTACTTTTTGATCGAAATTTTAATACT
>KY799147 Apis nigrocincta Labuan Bajo Central Sulawesi
TTTTTAATTGGAGGTTTTGGAAATTGATTAATTCCATTAATATTAGGATCTCCTGA
TATAGCATTTCCTCGAATAAATAATATTAGATTCTGATTACTACCTCCATCATTAT
TTTTATTATTATTAAGAAATTTATTTTATCCAAGACCAGGAACAGGATGAACAGT
ATACCCCCCCCTATCTGCATACCTATATCATTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCTG
TATTTTCACTTCATATATCTGGAATCTCATCAATTATAGGATCATTAAATTTAATA
GTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCATTAAATTATGATCAAATTTCTTTATT
TCCATGATCAGTATTTATTACAGCTATCCTATTAATTATATCTCTTCCAGTATTAG
CTGGAGCAATTACAATATTACTTTTTGATCGAAACTTTAATACT
>KY834222 Apis nigrocincta Islamabad Pakistan
TTCCTAATTGGAGGTTTTGGAAATTGATTAATTCCTTTAATATTAGGATCTCCAGA
TATAGCATTTCCTCGAATAAATAATATTAGATTCTGATTGCTTCCTCCTTCATTAT
TTATATTATTATTAAGAAATTTATTTTATCCAAGACCAGGAACAGGATGAACAGT
TTATCCTCCATTATCTGCATATTTATATCATTCATCCCCTTCAGTTGATTTTGCAAT
TTTCTCCTTACATATATCTGGAATCTCATCAATTATAGGATCATTAAATTTAATAG
TTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCATTAAATTATGACCAAATTTCTTTATTT
CCATGATCAGTATTTATTACAGCAATCTTATTAATTATATCTCTTCCAGTTCTAGC
TGGAGCAATTACAATATTATTATTTGATCGAAATTTTAATACT
>CAL01 MK880239 Apis nigrocincta Mahakeret Manado North Sulawesi
TTTTTAATTGGAGGTTTTGGAAATTGATTAATTCCATTAATATTAGGATCTCCTGA
TATAGCATTTCCTCGAATAAATAATATTAGATTCTGATTACTACCTCCATCATTAT
TTTTATTATTACTAAGAAATTTATTTTATCCAAGACCAGGAACAGGATGAACAGT
ATACCCCCCCCTATCTGCATACCTATACCATTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAG
TATTTTCACTTCATATATCTGGAATCTCATCAATTATAGGATCATTAAATTTAATG
GTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCATTAAATTATGATCAAATTTCTTTATT
TCCATGATCAGTATTTATTACAGCTATCCTATTAATTATATCTCTTCCAGTATTAG
CTGGAGCAATTACAATATTACTTTTTGATCGAAATTTTAATACT
>KM593938 Apis cerana Bangalore India
TTCTTAATTGGTGGTTTTGGAAATTGATTAATTCCATTAATATTAGGTTCTCCAGA
TATAGCATTTCCTCGAATAAATAATATTAGATTTTGATTACTTCCTCCTTCATTAT
TTTTATTATTATTAAGAAATTTATTTTATCCAAGACCAGGAACAGGATGAACAGT
ATACCCACCATTATCAGCATATTTATATCATTCGTCACCTTCAGTTGACTTTGCAA
TTTTTTCATTACATATATCTGGAATTTCATCAATTATAGGATCATTAAATTTAATA
GTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCTTTAAATTATGATCAAATTTCTTTATT
TCCTTGATCAGTATTTATTACAGCTATTTTATTAATTATATCTCTTCCAGTTTTAGC
TGGAGCAATTACAATATTATTATTTGATCGAAATTTTAATACA
>MH331013 Apis cerana indica Kerala India
TTCTTAATTGGTGGTTTTGGAAATTGATTAATTCCATTAATATTAGGTTCTCCAGA
TATAGCATTTCCTCGAATAAATAATATTAGATTTTGATTACTTCCTCCTTCATTAT
TTTTATTATTATTAAGAAATTTATTTTATCCAAGACCAGGAACAGGATGAACAGT
TTACCCACCATTATCAGCATATTTATATCATTCGTCACCTTCAGTTGACTTTGCAA
TTTTTTCATTACATATATCTGGAATTTCATCAATTATAGGATCATTAAATTTAATA
GTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCTTTAAATTATGATCAAATTTCTTTATT
TCCTTGATCAGTATTTATTACAGCTATTTTATTAATTATATCTCTTCCAGTTTTAGC
TGGAGCAATTACAATATTATTATTTGATCGAAATTTTAATACA
>AP017985 Apis cerana japonica Kyoto Japan
TTCCTAATTGGAGGTTTTGGAAATTGATTAATTCCTTTAATATTAGGATCTCCAGA
TATAGCATTTCCTCGAATAAATAATATTAGATTCTGATTGCTTCCTCCTTCATTAT
TTATATTATTATTAAGAAATTTATTTTATCCAAGACCAGGAACAGGATGAACAGT
TTATCCCCCATTATCTGCATATTTATATCATTCATCCCCCTCAGTTGATTTTGCAA
TTTTTTCCTTACATATATCTGGAATCTCATCAATTATAGGATCATTAAATTTAATA
GTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCATTAAATTATGATCAAATTTCTTTATT
TCCATGATCAGTATTTATTACAGCAATTTTATTAATTATATCTCTTCCAGTTCTAG
CTGGAGCAATTACAATATTATTATTTGATCGAAATTTTAATACT
>AP017941 Apis cerana japonica Kagoshima Japan
TTCCTAATTGGAGGTTTTGGAAATTGATTAATTCCTTTAATATTAGGATCTCCAGA
TATAGCATTTCCTCGAATAAATAATATTAGATTCTGATTGCTTCCTCCTTCATTAT
TTATATTATTATTAAGAAATTTATTTTATCCAAGACCAGGAACAGGATGAACAGT
TTATCCTCCATTATCTGCATATTTATATCATTCATCCCCCTCAGTTGATTTTGCAAT
TTTTTCCTTACATATATCTGGAATCTCATCAATTATAGGATCATTAAATTTAATAG
TTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCATTAAATTATGATCAAATTTCTTTATTT
CCATGATCAGTATTTATTACAGCAATTTTATTAATTATATCTCTTCCAGTTCTAGC
TGGAGCAATTACAATATTATTATTTGATCGAAATTTTAATACT
>AP018157 Apis nuluensis Mount Kinabalu Malaysia
TTTTTAATTGGAGGTTTTGGAAATTGATTAATTCCTTTAATACTAGGATCTCCAGA
TATGGCATTCCCTCGAATAAATAATATTAGGTTTTGACTACTTCCTCCATCATTAT
TTATATTATTATTAAGAAATTTATTTTATCCAAGACCAGGAACGGGATGAACAGT
TTACCCTCCACTATCTGCATATTTATATCATTCATCACCTTCAGTTGATTTTGCAA
TTTTTTCATTACACATATCTGGTATCTCATCAATTATAGGATCATTAAATTTAATA
GTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCATTGAATTATGATCAAATTTCCTTATT
TCCATGATCAGTTTTTATTACAGCCATTTTATTAATTATATCACTTCCAGTTCTAG
CTGGAGCAATTACAATATTATTATTTGATCGAAATTTTAATACT
>KC294229 Apis dorsata Yunnan China
TTTTTAATTGGAGGATTTGGAAATTGATTAATTCCTTTAATATTAGGGTCCCCAGA
TATAGCATTTCCTCGAATAAATAATATTAGATTTTGATTATTACCTCCTTCACTAT
TTATACTTCTATTAAGAAATATATATTATCCAAGTCCAGGAACAGGATGAACAGT
TTATCCTCCATTATCTGAATATATATATCACTCTTCACCTTCAGTTGATTTTGCAA
TTTTTTCTCTTCATATATCAGGTATTTCTTCAATTATAGGCTCATTAAATTTAATA
GTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCATTAAATTATGATCAAATTTCTTTATT
TCCATGATCAGTATTTATTACAGCTATTTTATTAATTATATCATTACCAGTTTTAG
CAGGAGCAATTACTATATTATTATTTGATCGAAATTTTAATACT
>KY614238 Apis mellifera scutellata Ruttner Bee Collection Germany
TTTTTAATTGGAGGATTTGGAAATTGGCTTATTCCTTTAATACTAGGATCACCTGA
TATAGCATTTCCTCGAATAAATAATATTAGATTTTGATTACTTCCTCCCTCATTAT
TTATACTTTTATTAAGAAATTTATTTTATCCAAGACCAGGAACTGGATGAACAGT
ATATCCACCATTATCAGCATATTTATATCATTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAA
TTTTTTCTCTTCATATATCAGGAATTTCCTCAATTATAGGATCATTAAACTTAATA
GTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCTATAAATTATGACCAAATTTCATTATT
TCCATGATCAGTTTTTATTACAGCAATTTTATTAATTATATCACTACCTGTATTAG
CTGGAGCAATTACTATACTATTATTTGATCGAAATTTTAATACA
>KX870183 Apis mellifera capensis South Africa
TTTTTAATTGGAGGATTTGGAAATTGGCTTATTCCTTTAATACTAGGATCACCTGA
TATAGCATTTCCCCGAATAAATAATATTAGATTTTGATTACTTCCTCCCTCATTAT
TTATACTTTTATTAAGAAATTTATTTTACCCAAGACCAGGAACTGGATGAACAGT
ATATCCACCATTATCAGCATATTTATATCATTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAA
TTTTTTCTCTTCATATATCAGGAATTTCCTCAATTATAGGATCATTAAACTTAATA
GTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCTATAAATTATGATCAAATTTCATTATT
TCCATGATCAGTTTTTATTACAGCAATTTTATTAATTATATCACTACCTGTATTAG
CTGGAGCAATTACTATACTATTATTTGATCGAAATTTTAATACA
>KM458618 Apis mellifera intermissa Yunnan China
TTTTTAATTGGAGGATTTGGAAATTGGCTTATTCCTTTAATACTAGGATCACCTGA
TATAGCATTTCCCCGAATAAATAATATTAGATTTTGATTACTTCCTCCCTCATTAT
TTATACTTTTATTAAGAAATTTATTTTACCCAAGACCAGGAACTGGATGAACAGT
ATATCCACCATTATCAGCATATTTATATCATTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAA
TTTTTTCTCTTCATATATCAGGAATTTCCTCAATTATAGGATCATTAAACTTAATA
GTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCTATAAATTATGACCAAATTTCATTATT
TCCATGATCAGTTTTTATTACAGCAATTTTATTAATTATATCACTACCTGTATTAG
CTGGAGCAATTACTATACTATTATTTGATCGAAATTTTAATACA
>L06178 Apis mellifera ligustica
TTTTTAATTGGAGGATTTGGAAATTGGCTTATTCCTTTAATACTAGGATCCCTGAT
ATAGCATTCCCCCGAATAAATAATATTAGATTTTGATTACTTCCTCCCTCATTATT
TATACTTTTATTAAGAAATTTATTTTATCCAAGACCAGGAACTGGATGAACAGTA
TATCCACCATTATCAGCATATTTATATCATTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAAT
TTTTTCTCTTCATATATCAGGAATTTCCTCAATTATAGGATCATTAAACTTAATAG
TTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCTATAAATTATGACCAAATTTCATTATTT
CCATGATCAGTTTTTATTACAGCAATTTTATTAATTATATCATTACCTGTATTAGC
TGGAGCAATTACTATACTATTATTTGATCGAAATTTTAATACA
>KP163643 Apis mellifera syriaca Syria
TTTTTAATTGGAGGATTTGGAAATTGACTTATTCCTTTAATACTAGGATCACCTGA
TATAGCATTTCCTCGAATAAATAATATTAGATTTTGATTACTTCCTCCCTCATTAT
TTATACTTTTATTAAGAAATTTATTTTACCCAAGACCAGGAACTGGGTGAACAGT
ATATCCACCATTATCAGCATATTTATATCATTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAA
TTTTTTCTCTTCATATATCAGGAATTTCCTCAATTATAGGATCATTAAACTTAATA
GTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCTATAAATTATGATCAAATTTCATTATT
TCCATGATCAGTTTTCATTACAGCAATTTTATTAATTATATCATTACCTGTATTAG
CTGGAGCAATTACTATACTATTATTTGATCGAAATTTTAATACA
>KX908208 Apis laboriosa Himalaya
TTTTTAATTGGCGGATTTGGAAATTGATTAATTCCATTAATACTTGGATCTCCAGA
TATAGCATTTCCACGAATAAATAATATTAGGTTTTGATTACTTCCTCCATCACTTT
TAATATTATTATTAAGAAATTTATTTTATCCAAGACCCGGAACAGGATGAACAGT
ATACCCACCTCTATCAGAATATTTATATCATTCTTCTCCTTCAGTAGATTTTGCAA
TTTTTTCACTTCATATATCAGGAATTTCATCAATTATAGGATCATTAAATTTAATA
GTAACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCATTAAATTTTGATCAAATTTCTTTATT
TCCTTGATCAGTATTTATTACAGCAATTTTATTAATTATATCATTACCAGTATTAG
CTGGAGCAATTACAATATTACTATTTGATCGAAATTTTAATACT
>KY348372 Apis koschevnikovi Malaysia
TTTTTAATTGGAGGATTTGGTAATTGATTAATTCCATTAATACTTGGATCTCCAGA
TATAGCATTTCCTCGTATAAATAACATTAGATTTTGATTATTACCACCTTCATTAT
TAATATTATTATTAAGAAATTTATTTTACCCAAGACCAGGAACAGGATGAACTGT
TTATCCTCCACTATCAGCTTATTTATATCATTCTTCACCATCAGTAGATTTCGCAA
TTTTTTCTTTACATATATCTGGAATTTCATCAATTATAGGATCATTAAATTTAATA
GTAACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCTTTAAATTATGATCAAATTTCATTATT
TCCTTGATCAGTATTTATTACAGCTATTTTATTAATTATATCATTACCTGTTTTAGC
TGGAGCAATTACAATATTATTATTTGATCGAAATTTTAATACA
>KF736157 Apis andreniformis Gwangju Korea
TTTTTAATTGGAGGATTTGGAAATTGATTAATTCCATTAATATTAGGATCTCCTGA
TATGGCATTTCCTCGAATAAATAATATTAGATTTTGATTATTACCTCCATCTTTGT
TACTTTTATTATTAAGAAATTTATTTTATCCAAGTCCAGGTACTGGATGAACTGTA
TATCCTCCTTTATCTGCATATTTATATCATTCATCTCCATCTGTAGATTTTGCAATT
TTTTCACTTCATATATCTGGAATATCATCTATTATAGGTTCATTAAATTTAATAGT
AACTATTATAATAATAAAAAATTTTTCATTAAATTATGATCAAATTTCATTATTTC
CATGATCAGTATTTATTACAGCTATTTTATTAATTATATCATTACCAGTTCTTGCT
GGAGCTATTACTATATTATTATTTGATCGTAATTTTAATACA
>KC170303 Apis florea Yunnan China
TTTTTGATTGGAGGATTCGGAAATTGATTAATTCCATTAATATTAGGATCTCCTGA
TATAGCATTTCCACGAATAAATAATATTAGATTTTGATTACTTCCCCCATCATTAA
TTCTTTTATTATTAAGAAATTTATTTTACCCATCACCAGGAACAGGATGAACTGTT
TATCCACCTTTATCAGCTTATTTATATCATTCATCTCCATCAGTAGATTTTGCAAT
TTTTTCATTACATATATCAGGAATTTCATCAATTATAGGTTCATTAAATTTAATAG
TAACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCATTAAATTATGATCAAATTTCATTATTT
CCATGATCAGTTTTTATTACAGCAATTTTACTTGTTATATCTTTACCAGTTCTCGC
AGGAGCAATTACTATATTATTATTTGATCGAAATTTTAATACA
>DQ020233 Apis nigrocincta Bogani Nani Wartabone North Sulawesi
TTTTTAATTGGAGGTTTTGGAAATTGATTAATTCCATTAATATTAGGATCTCCTGA
TATAGCATTTCCTCGAATAAATAATATTAGATTCTGATTACTACCTCCATCATTAT
TTTTATTATTACTAAGAAATTTATTTTATCCAAGACCAGGAACAGGATGAACAGT
ATACCCCCCCCTATCTGCATACCTATACCATTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAG
TATTTTCACTTCATATATCTGGAATCTCATCAATTATAGGATCATTAAATTTAATG
GTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCATTAAATTATGATCAAATTTCTTTATT
TCCATGATCAGTATTTATTACAGCTATCCTATTAATTATATCTCTTCCAGTATTAG
CTGGAGCAATTACAATATTACTTTTTGATCGAAATTTTAATACT
>DQ020219 Apis nigrocincta Kebon Kopi Central Sulawesi
TTTTTAATTGGAGGTTTTGGAAATTGATTAATTCCATTAATATTAGGATCTCCTGA
TATAGCATTTCCTCGAATAAATAATATTAGATTCTGATTACTACCTCCATCATTAT
TTTTATTATTACTAAGAAATTTATTTTATCCAAGACCAGGAACAGGATGAACAGT
ATACCCCCCCCTATCTGCATACCTATATCATTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAG
TATTTTCACTTCATATATCTGGAATCTCATCAATTATAGGATCATTAAATTTAATG
GTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCATTAAATTATGATCAAATTTCTTTATT
TCCATGATCAGTATTTATTACAGCTATCCTATTAATTATATCTCTTCCAGTATTAG
CTGGAGCAATTACAATATTACTTTTTGATCGAAATTTTAATACT
>DQ020232 Apis nigrocincta Bogani Nani Wartabone North Sulawesi
TTTTTAATTGGAGGTTTTGGAAATTGATTAATTCCATTAATATTAGGATCTCCTGA
TATAGCATTTCCTCGAATAAATAATATTAGATTCTGATTACTACCTCCATCATTAT
TTTTATTATTACTAAGAAATTTATTTTATCCAAGACCAGGAACAGGATGAACAGT
ATACCCCCCCCTATCTGCATACCTATATCATTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAG
TATTTTCACTTCATATATCTGGAATCTCATCAATTATAGGATCATTAAATTTAATG
GTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCATTAAATTATGATCAAATTTCTTTATT
TCCATGATCAGTATTTATTACAGCTATTCTATTAATTATATCTCTTCCAGTATTAG
CTGGAGCAATTACAATATTACTTTTTGATCGAAATTTTAATACT
>DQ020228 Apis nigrocincta Tangkoko North Sulawesi
TTTTTAATTGGAGGTTTTGGAAATTGATTAATTCCATTAATATTAGGATCTCCTGA
TATAGCATTTCCTCGAATAAATAATATTAGATTCTGATTACTACCTCCATCATTAT
TTTTATTATTACTAAGAAATTTATTTTATCCAAGACCAGGAACAGGATGAACAGT
ATACCCCCCCCTATCTGCATACCTATATCATTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAG
TATTTTCACTTCATATATCTGGAATCTCATCAATTATAGGATCATTAAATTTAATG
GTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCATTAAATTATGATCAAATTTCTTTATT
TCCATGATCAGTATTTATTACAGCTATTCTATTAATTATATCTCTTCCAGTATTAG
CTGGAGCAATTACAATATTACTTTTTGATCGAAATTTTAATACT
>DQ020226 Apis nigrocincta Manado North Sulawesi
TTTTTAATTGGAGGTTTTGGAAATTGATTAATTCCATTAATATTAGGATCTCCTGA
TATAGCATTTCCTCGAATAAATAATATTAGATTCTGATTACTACCTCCATCATTAT
TTTTATTATTACTAAGAAATTTATTTTATCCAAGACCAGGAACAGGATGAACAGT
ATACCCCCCCCTATCTGCATACCTATATCATTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAG
TATTTTCACTTCATATATCTGGAATCTCATCAATTATAGGATCATTAAATTTAATG
GTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCATTAAATTATGATCAAATTTCTTTATT
TCCATGATCAGTATTTATTACAGCTATCCTATTAATCATATCTCTTCCAGTATTAG
CTGGAGCAATTACAATATTACTTTTTGATCGAAATTTTAATACT
>DQ020227 Apis nigrocincta Tangkoko North Sulawesi
TTTTTAATTGGAGGTTTTGGAAATTGATTAATTCCATTAATATTAGGATCTCCTGA
TATAGCATTTCCTCGAATAAATAATATTAGATTCTGATTACTACCTCCATCATTAT
TTTTATTATTATTAAGAAATTTATTTTATCCAAGACCAGGAACAGGATGAACAGT
ATACCCCCCCCTATCTGCATACCTATATCATTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAG
TATTTTCACTTCATATATCTGGAATCTCATCAATTATAGGATCATTAAATTTAATG
GTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCATTAAATTATGATCAAATTTCTTTATT
TCCATGATCAGTATTTATTACAGCTATCCTATTAATCATATCTCTTCCAGTATTAG
CTGGAGCAATTACAATATTACTTTTTGATCGAAATTTTAATACT
>DQ020229 Apis nigrocincta Palolo Central Sulawesi
TTTTTAATTGGAGGTTTTGGAAATTGATTAATTCCATTAATATTAGGATCTCCTGA
TATAGCATTTCCTCGAATAAATAATATTAGATTCTGATTACTGCCTCCATCATTAT
TTTTATTATTATTAAGAAATTTATTTTATCCAAGACCAGGAACAGGATGAACAGT
ATACCCCCCCCTATCTGCATACCTATATCATTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAG
TATTTTCACTTCATATATCTGGAATCTCATCAATTATAGGATCATTAAATTTAATA
GTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCATTAAATTATGATCAAATTTCTTTATT
TCCATGATCAGTATTTATTACAGCTATCCTATTAATTATATCTCTTCCAGTATTAG
CTGGAGCAATTACAATATTACTTTTTGATCGAAACTTTAATACT
>DQ020222 Apis nigrocincta Mamuju South Sulawesi
TTTTTAATTGGAGGTTTTGGAAATTGATTAATTCCATTAATATTAGGATCTCCTGA
TATAGCATTTCCTCGAATAAATAATATTAGATTCTGATTACTGCCTCCATCATTAT
TTTTATTATTATTAAGAAATTTATTTTATCCAAGACCAGGAACAGGATGAACAGT
ATACCCCCCCCTATCTGCATACCTATATCATTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAG
TATTTTCACTTCATATATCTGGAATCTCATCAATTATAGGATCATTAAATTTAATA
GTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCATTAAATTATGATCAAATTTCTTTATT
TCCATGATCAGTATTTATTACAGCTATCCTATTAATTATATCTCTTCCAGTATTAG
CTGGAGCAATTACAATATTACTTTTTGATCGAAACTTTAATACT
>DQ020220 Apis nigrocincta Parigi Central Sulawesi
TTTTTAATTGGAGGTTTTGGAAATTGATTAATTCCATTAATATTAGGATCTCCTGA
TATAGCATTTCCTCGAATAAATAATATTAGATTCTGATTACTGCCTCCATCATTAT
TTTTATTATTATTAAGAAATTTATTTTATCCAAGACCAGGAACAGGATGAACAGT
ATACCCCCCCCTATCTGCATACCTATATCATTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAG
TATTTTCACTTCATATATCTGGAATCTCATCAATTATAGGATCATTAAATTTAATA
GTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCATTAAATTATGATCAAATTTCTTTATT
TCCATGATCAGTATTTATTACAGCTATCCTATTAATTATATCTCTTCCAGTATTAG
CTGGAGCAATTACAATATTACTTTTTGATCGAAACTTTAATACT
>DQ020225 Apis nigrocincta Karaenta South Sulawesi
TTTTTAATTGGAGGTTTTGGAAATTGATTAATTCCATTAATATTAGGATCTCCTGA
TATAGCATTTCCTCGAATAAATAATATTAGATTTTGATTATTACCTCCATCATTAT
TTTTATTGTTATTAAGAAATTTATTTTATCCAAGACCAGGTACAGGATGAACAGT
TTACCCCCCCCTATCTGCATATCTATATCATTCATCACCTTCAGTAGATTTTGCAG
TATTTTCATTACATATATCTGGAATTTCATCAATTATAGGATCATTAAATTTAATA
GTAACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCATTAAATTATGATCAAATTTCTTTATT
TCCATGATCAGTATTTATTACAGCTATTTTATTAATTATATCACTTCCAGTACTAG
CTGGAGCAATTACAATATTATTATTTGATCGAAACTTTAATACT
>DQ020221 Apis nigrocincta Parepare South Sulawesi
TTTTTAATTGGAGGTTTTGGAAATTGATTAATTCCATTAATATTAGGATCTCCTGA
TATAGCATTTCCTCGAATAAATAATATTAGATTTTGATTATTACCTCCATCATTAT
TTTTATTGTTATTAAGAAATTTATTTTATCCAAGACCAGGTACAGGATGAACAGT
TTACCCCCCCCTATCTGCATATCTATATCATTCATCACCTTCAGTAGATTTTGCAG
TATTTTCATTACATATATCTGGAATTTCATCAATTATAGGATCATTAAATTTAATA
GTAACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCATTAAATTATGATCAAATTTCTTTATT
TCCATGATCAGTATTTATTACAGCTATTTTATTAATTATATCACTTCCAGTACTAG
CTGGAGCAATTACAATATTATTATTTGATCGAAACTTTAATACT
>DQ020223 Apis nigrocincta Bantinmurung South Sulawesi
TTTTTAATTGGAGGTTTTGGAAATTGATTAATTCCATTAATATTAGGATCTCCTGA
TATAGCATTTCCTCGAATAAATAATATTAGATTTTGATTATTACCTCCATCATTAT
TTTTATTGTTATTAAGAAATTTATTTTATCCAAGACCAGGTACAGGATGAACAGT
TTACCCCCCCCTATCTGCATATCTATATCATTCATCACCTTCAGTAGATTTTGCAG
TATTTTCATTACATATATCTGGAATTTCATCAATTATAGGATCATTAAATTTAATA
GTAACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCATTAAATTATGATCAAATTTCTTTATT
TCCATGATCAGTATTCATTACAGCTATTTTATTAATTATATCACTTCCAGTACTAG
CTGGAGCAATTACAATATTATTATTTGATCGAAACTTTAATACT
B. Pohon Filogenetik Maksimum Neighbord Joining

53 NC038114 Apis nigrocincta Sangihe island North Sulawesi

46 DQ020226 Apis nigrocincta Manado North Sulawesi

35 DQ020227 Apis nigrocincta Tangkoko North Sulawesi

DQ020219 Apis nigrocincta Kebon Kopi Central Sulawesi

8134
CAL01 MK880239 Apis nigrocincta Mahakeret Manado North Sulawesi
68 DQ020233 Apis nigrocincta Bogani Nani Wartabone North Sulawesi

DQ020228 Apis nigrocincta Tangkoko North Sulawesi

100 AP018398 Apis nigrocincta Sangihe island North Sulawesi
66
33 DQ020232 Apis nigrocincta Bogani Nani Wartabone North Sulawesi

KY799147 Apis nigrocincta Labuan Bajo Central Sulawesi

96 DQ020229 Apis nigrocincta Palolo Central Sulawesi

76
DQ020222 Apis nigrocincta Mamuju South Sulawesi
64
DQ020220 Apis nigrocincta Parigi Central Sulawesi
DQ020225 Apis nigrocincta Karaenta South Sulawesi
70
100 DQ020221 Apis nigrocincta Parepare South Sulawesi
43 DQ020223 Apis nigrocincta Bantinmurung South Sulawesi

100 KM593938 Apis cerana Bangalore India

MH331013 Apis cerana indica Kerala India
52
51 AP018157 Apis nuluensis Mount Kinabalu Malaysia
KY834222 Apis nigrocincta Islamabad Pakistan
68
100 AP017985 Apis cerana japonica Kyoto Japan
65 AP017941 Apis cerana japonica Kagoshima Japan
KX908208 Apis laboriosa Himalaya
KC294229 Apis dorsata Yunnan China
KP163643 Apis mellifera syriaca Syria
56
KY614238 Apis mellifera scutellata Ruttner Bee Collection Germany
100
L06178 Apis mellifera ligustica
61
43 KX870183 Apis mellifera capensis South Africa
45 KM458618 Apis mellifera intermissa Yunnan China
KY348372 Apis koschevnikovi Malaysia

47 KF736157 Apis andreniformis Gwangju Korea

75 KC170303 Apis florea Yunnan China

0.0100
C. Pohon filogenetik Maksimum likelihood
DQ020232 Apis nigrocincta Bogani Nani Wartabone North Sulawesi
56
DQ020228 Apis nigrocincta Tangkoko North Sulawesi
AP018398 Apis nigrocincta Sangihe island North Sulawesi
DQ020219 Apis nigrocincta Kebon Kopi Central Sulawesi
76
CAL01 MK880239 Apis nigrocincta Mahakeret Manado North Sulawesi
70 DQ020233 Apis nigrocincta Bogani Nani Wartabone North Sulawesi

DQ020227 Apis nigrocincta Tangkoko North Sulawesi

98 NC038114 Apis nigrocincta Sangihe island North Sulawesi

49
DQ020226 Apis nigrocincta Manado North Sulawesi
KY799147 Apis nigrocincta Labuan Bajo Central Sulawesi
DQ020229 Apis nigrocincta Palolo Central Sulawesi
90
DQ020222 Apis nigrocincta Mamuju South Sulawesi
69
DQ020220 Apis nigrocincta Parigi Central Sulawesi
DQ020225 Apis nigrocincta Karaenta South Sulawesi
64
DQ020221 Apis nigrocincta Parepare South Sulawesi
98
DQ020223 Apis nigrocincta Bantinmurung South Sulawesi
AP018157 Apis nuluensis Mount Kinabalu Malaysia

99 KM593938 Apis cerana Bangalore India

41
MH331013 Apis cerana indica Kerala India
43 KY834222 Apis nigrocincta Islamabad Pakistan

99 AP017985 Apis cerana japonica Kyoto Japan

71 AP017941 Apis cerana japonica Kagoshima Japan

KY348372 Apis koschevnikovi Malaysia

34 KF736157 Apis andreniformis Gwangju Korea

79 KC170303 Apis florea Yunnan China
KX908208 Apis laboriosa Himalaya
KC294229 Apis dorsata Yunnan China
14
KP163643 Apis mellifera syriaca Syria
51
KX870183 Apis mellifera capensis South Africa
100
KM458618 Apis mellifera intermissa Yunnan China
70
38 KY614238 Apis mellifera scutellata Ruttner Bee Collection Germany
32 L06178 Apis mellifera ligustica

0.020
 D. Tabel Jarak Genetik

AP018398_Apis_nigrocincta_Sangihe_island_North_Sulawesi
NC038114_Apis_nigrocincta_Sangihe_island_North_Sulawesi 0,009
KY799147_Apis_nigrocincta_Labuan_Bajo_Central_Sulawesi 0,014 0,014
KY834222_Apis_nigrocincta_Islamabad_Pakistan 0,085 0,085 0,080
CAL01_MK880239_Apis_nigrocincta_Mahakeret_Manado_North_Sulawesi 0,007 0,007 0,012 0,083
KM593938_Apis_cerana_Bangalore_India 0,075 0,080 0,075 0,057 0,078
MH331013_Apis_cerana_indica_Kerala_India 0,077 0,083 0,077 0,055 0,080 0,002
AP017985_Apis_cerana_japonica_Kyoto_Japan 0,078 0,083 0,078 0,012 0,080 0,052 0,050
AP017941_Apis_cerana_japonica_Kagoshima_Japan 0,080 0,085 0,080 0,009 0,083 0,052 0,050 0,002
AP018157_Apis_nuluensis_Mount_Kinabalu_Malaysia 0,091 0,096 0,091 0,060 0,093 0,073 0,070 0,058 0,055
KC294229_Apis_dorsata_Yunnan_China 0,114 0,120 0,114 0,096 0,117 0,098 0,096 0,093 0,090 0,104
KY614238_Apis_mellifera_scutellata_Ruttner_Bee_Collection_Germany 0,114 0,119 0,114 0,103 0,117 0,093 0,095 0,103 0,103 0,106 0,095
KX870183_Apis_mellifera_capensis_South_Africa 0,117 0,122 0,117 0,111 0,119 0,095 0,098 0,106 0,106 0,109 0,098 0,007
KM458618_Apis_mellifera_intermissa_Yunnan_China 0,119 0,125 0,119 0,109 0,122 0,098 0,101 0,109 0,109 0,111 0,101 0,005 0,002
L06178_Apis_mellifera_ligustica 0,122 0,128 0,122 0,111 0,125 0,101 0,103 0,111 0,111 0,109 0,098 0,007 0,009 0,007
KP163643_Apis_mellifera_syriaca_Syria 0,119 0,125 0,119 0,114 0,122 0,098 0,101 0,109 0,109 0,111 0,095 0,014 0,012 0,014 0,016
KX908208_Apis_laboriosa_Himalaya 0,090 0,096 0,090 0,106 0,093 0,083 0,085 0,101 0,101 0,095 0,103 0,098 0,098 0,101 0,098 0,098
KY348372_Apis_koschevnikovi_Malaysia 0,117 0,122 0,117 0,101 0,119 0,080 0,077 0,096 0,093 0,101 0,103 0,101 0,098 0,101 0,103 0,095 0,088
KF736157_Apis_andreniformis_Gwangju_Korea 0,117 0,122 0,117 0,117 0,119 0,114 0,117 0,111 0,109 0,114 0,114 0,122 0,125 0,128 0,125 0,122 0,109 0,101
KC170303_Apis_florea_Yunnan_China 0,136 0,141 0,136 0,111 0,139 0,106 0,103 0,103 0,103 0,119 0,133 0,119 0,114 0,117 0,119 0,114 0,109 0,101 0,093
DQ020233_Apis_nigrocincta_Bogani_Nani_Wartabone_North_Sulawesi 0,007 0,007 0,012 0,083 0,000 0,078 0,080 0,080 0,083 0,093 0,117 0,117 0,119 0,122 0,125 0,122 0,093 0,119 0,119 0,139
DQ020219_Apis_nigrocincta_Kebon_Kopi_Central_Sulawesi 0,005 0,005 0,009 0,080 0,002 0,075 0,077 0,078 0,080 0,091 0,114 0,114 0,117 0,119 0,122 0,119 0,090 0,117 0,117 0,136 0,002
DQ020232_Apis_nigrocincta_Bogani_Nani_Wartabone_North_Sulawesi 0,002 0,007 0,012 0,083 0,005 0,072 0,075 0,075 0,078 0,088 0,111 0,111 0,114 0,117 0,119 0,117 0,088 0,114 0,114 0,133 0,005 0,002
DQ020228_Apis_nigrocincta_Tangkoko_North_Sulawesi 0,002 0,007 0,012 0,083 0,005 0,072 0,075 0,075 0,078 0,088 0,111 0,111 0,114 0,117 0,119 0,117 0,088 0,114 0,114 0,133 0,005 0,002 0,000
DQ020226_Apis_nigrocincta_Manado_North_Sulawesi 0,007 0,002 0,012 0,083 0,005 0,078 0,080 0,080 0,083 0,093 0,117 0,117 0,119 0,122 0,125 0,122 0,093 0,119 0,119 0,139 0,005 0,002 0,005 0,005
DQ020227_Apis_nigrocincta_Tangkoko_North_Sulawesi 0,009 0,005 0,009 0,080 0,007 0,075 0,077 0,078 0,080 0,091 0,114 0,114 0,117 0,119 0,122 0,119 0,090 0,117 0,117 0,136 0,007 0,005 0,007 0,007 0,002
DQ020229_Apis_nigrocincta_Palolo_Central_Sulawesi 0,014 0,014 0,005 0,078 0,012 0,072 0,075 0,075 0,078 0,088 0,114 0,111 0,114 0,117 0,119 0,117 0,088 0,117 0,117 0,133 0,012 0,009 0,012 0,012 0,012 0,009
DQ020222_Apis_nigrocincta_Mamuju_South_Sulawesi 0,014 0,014 0,005 0,078 0,012 0,072 0,075 0,075 0,078 0,088 0,114 0,111 0,114 0,117 0,119 0,117 0,088 0,117 0,117 0,133 0,012 0,009 0,012 0,012 0,012 0,009 0,000
DQ020220_Apis_nigrocincta_Parigi_Central_Sulawesi 0,014 0,014 0,005 0,078 0,012 0,072 0,075 0,075 0,078 0,088 0,114 0,111 0,114 0,117 0,119 0,117 0,088 0,117 0,117 0,133 0,012 0,009 0,012 0,012 0,012 0,009 0,000 0,000
DQ020225_Apis_nigrocincta_Karaenta_South_Sulawesi 0,048 0,053 0,043 0,075 0,050 0,067 0,065 0,067 0,070 0,070 0,101 0,111 0,114 0,117 0,119 0,117 0,090 0,090 0,093 0,109 0,050 0,048 0,045 0,045 0,050 0,048 0,043 0,043 0,043
DQ020221_Apis_nigrocincta_Parepare_South_Sulawesi 0,048 0,053 0,043 0,075 0,050 0,067 0,065 0,067 0,070 0,070 0,101 0,111 0,114 0,117 0,119 0,117 0,090 0,090 0,093 0,109 0,050 0,048 0,045 0,045 0,050 0,048 0,043 0,043 0,043 0,000
DQ020223_Apis_nigrocincta_Bantinmurung_South_Sulawesi 0,050 0,055 0,045 0,078 0,053 0,070 0,067 0,070 0,072 0,073 0,103 0,114 0,117 0,119 0,122 0,114 0,093 0,093 0,095 0,111 0,053 0,050 0,048 0,048 0,053 0,050 0,045 0,045 0,045 0,002 0,002
E. Analisis data

Pohon filogenetik dibentuk dari 32 sequens nukleotida menggunakan metode

Maksimum Neighbord Joining dan maksimum Likelihood. Kedua metode tersebut pada
umumnya sama. Neighbord Joining merupakan algoritma pembuatan pohon filogenetik yang
menggunakan metode jarak, dimana metode ini memanfaatkan banyaknya perbedaan antara
dua sekuens untuk membuat pohon filogenetik. Metode ini mempunyai kelebihan, yaitu
merupakan metode yang menggunkan jenis data character based yang cukup akurat dengan
waktu perhitungan yang relatif lebih cepat dari metode character based. Metode Likelihood
merupakan metode yang menggunakan prinsip bahwa perubahan-perubahan diantara seluruh
basa nukleotida dianggap sebanding. Metode ini memiliki kelemahan yaitu membutuhkan
waktu yang lama untuk menghitung. Metode ini digunakan dalam menghitung sekuens yang
pendek.
Kedua metode yang digunakan menunjukan hasil yang tidak tidak jauh berbeda, akan
tetapi metode yang paling sering digunakan yaitu metode Neighbord Joining karena metode
ini lebih akurat dibandingkan dengan metode likelihood. Hal ini diperkuat data dari analisis
jarak genetik, dimana pada tabel jarak genetik menunjukan jarak genetik terdekat terdapat
pada Apis nigrocincta, Bogani Nani Wartabone North Sulawesi dan Apis nigrocincta,
Mahakeret Manado North Sulawesi, Apis nigrocincta, Karaenta South Sulawesi dan Apis
nigrocincta, Parepare South Sulawesi. Serta Apis nigrocincta yang berasal dari Palolo
(Central Sulawesi), Mamuju (South Sulawesi) dan Parigi (Central Sulawesi) juga
menunjukan kedekatan jarak genetic. Semakin dekat jarak genetik suatu spesies dangan
spesies lainnya maka semakin dekat kesamaan gen COI-nya.
Sedangkan pada metode Likelihood menunjukan bahwa Apis nigrocincta Bogani
Nani Wartabone North Sulawesi dan Apis nigrocincta Mahakeret Manado North Sulawesi
berada bada cluster yang berbeda.