Хелиион 6 (2020) е03933

Списак садржаја доступан на СциенцеДирецт

Хелиион
почетна страница часописа: ввв.целл.цом/хелиион

Истражи чланак

Термодинамички увид у вирусне инфекције: да ли вируси у литичком

циклусу отимају ћелијски метаболизам због своје мале Гиббсове
енергије?
*
Марко Поповић , Мирјана Минчева
Биотхермодинамицс, ТУМ Сцхоол оф Лифе Сциенцес Веихенстепхан, Технички универзитет у Минхену, Макимус-вон-Имхоф-Форум 2, 85354, Фреисинг, Немачка

ИНФОРМАЦИЈЕ О АРТИКЛУ АПСТРАКТАН

Кључне речи: Након адсорпције и продора, вирус отме ћелијски метаболички механизам и користи га као медијум за његову
Микробиологија репродукцију и раст умножавањем. Раст је конкурентан, јер исте прекурсоре и машине користе и вирус и његова
Биофизика ћелија домаћин. Али оно што тера вирус да ефикасније изводи свој животни циклусфинего његов домаћин? Гиббсова
Термодинамика
енергија представља покретачку снагу свих хемијских реакција у природи. Према томе, хипотетички Гиббсова
Кинетика хемијских реакција
енергија раста може представљати покретачку снагу вирусног литичког циклуса. Након хемијске карактеризације 17
Биофизичка хемија
Вирологија вируса и њихових домаћина, у овом раду су предложене реакције раста и израчунате су енталпија, ентропија и
Вирус Гиббсова слободна енергија формирања и раста. Упоређивањем Гиббсове енергије раста вируса и њихових домаћина,
Емпиријска формула организма утврђено је да вирус увек има негативнију Гиббсову слободну енергију раста од свог домаћина, што имплицира да је
Реакција раста синтеза вирусних компонената термодинамички повољнија. Стога се чини да физички закони објашњавају уочене
Гиббс ослобађа енергију раста биолошке појаве - отмицу машина за живот домаћина и високе ефективностифиактивност раста вируса.
Брзина раста

1. Представљање науке и биоинжењеринга омета недостатак података за термодинамичку

Током златног доба вирусологије откривено је неколико хиљада
вируса, морфолошки окарактерисаних и класификованихфиед [Норрби,
2008]. Вируси се састоје од нуклеинске киселине, омеђене протеинима
капсида, а понекад и липидна коверта. Стварна или замишљена
количина супстанце, одвојена од свог окружења, представља
термодинамички систем. Дакле, вирусна нуклеинска киселина омеђена
капсидом представља отворени (био) термодинамички систем [Вон
Берталанффи, 1950]. Примећено је да вирус изводи животни циклус,
отимајући виталну машинерију ћелије домаћина, извршавајући поступке
репликације, транскрипције, транслације и само-склапања. Међутим,
остаје отворено питање: шта покреће вирус да ефикасније изводи свој
животни циклусфинего његов домаћин? Да се зна покретачка сила
животног циклуса вируса, било би могућефлутичу на стопу
умножавања вируса и самим тим на њихову вируленцију.
Покретачка сила свих процеса у природи, укључујући раст
организама, је термодинамичко својство- Гиббсова енергија [Демирел,
2014; Вон Стоцкар, 2014]. Термодинамика је имала фундаменталну
улогу у развој науке, омогућавајући нам да разумемо широк спектар
природних феномена и дизајнирамо нове технологије. Потенцијал
термо-динамике у наукама о животу био јефипрво приметио Болтзманн
[1974], чији
идеје су проширили Сцхродингер€ [1944]. Међутим, његова употреба у
животу
анализу [Вон Стоцкар, 2010]. Дакле, да бисмо фундаментално разумели
живот и интеракције између организама (нпр. Паразитизам, инфекције,
имунски одговор итд.), Морамо их хемијски и термодинамички
окарактерисати, навести њихове покретачке снаге и развити формализме
који описују све физичке, информационе и хемијске процесе обједињени
у једној појави-живот. Међутим, за само неколико врста вируса
пријављена је делимична хемијска карактеризација (емпиријска
формула) [Јовер и сар., 2014]. Комплетна емпиријска формула
направљена је само за једног - тхе полиовирус [Молла и сар., 1991].
Термодинамички параметри целих вирусних честица никада нису
утврђени. Параметар од посебног интереса је Гиббсова енергија, која
представља покретачку силу свих процеса у природи, укључујући
процесе које изводе организми [Демирел, 2014; Вон Стоцкар, 2014].
Неки аспекти животног циклуса вируса већ су анализирани помоћу
термодинамике. Катен и Злотницк [2009] је анализирао термодинамику
капсидног склапања неколико вируса, третирајући је као реакцију
полимеризације и пружајући нове увиде у механизме склапања сферних
капсида вируса, као и у биологију животног циклуса вируса.Церес и
Злотницк [2002] користио термодинамику за анализу капсидног склопа
вируса хепатитиса Б и открио да има негативну Гиббсову енергетску
промену, што имплицира да је процес термодинамички

* Аутор за.
Адреса Е-поште: марко.поповиц@тум.де (М. Поповић).

хттпс://дои.орг/10.1016/ј.хелиион.2020.е03933
Примљено 7. фебруара 2020; Примљено у ревидираном облику 2. марта 2020 .; Прихваћено 1. маја 2020. 2405-8440 /©2020 Аутори. Објавио Елсевиер Лтд. Ово је чланак са
отвореним приступом под лиценцом ЦЦ БИ (хттп://цреативецоммонс.орг/лиценсес/би/4.0/).