26. Bombas iénicas y canales de membrana 362 La Nav-K--ATPesa Wabgja en modo antiporte 26.7 Los gradientes de iones impulsen el ansporte ce materia @ través de las membranas 26.2 Los transportadores de protones eliminan el lastre de H° celular 25.< Los transportadores ABC llevan iones,lipi- dos y farmacos a través de 2s membranas 26.5 Los canales ignicos forman pores temporales en las membranas 26.0 Los canales iGricos requlados por potencial detectan los cambios de potencial 25,7 El receptor niotinico de Ia acetilcolina es un canal de iones regulado por igando 26.2 Los ligandos regulan la apertura de canales de los receptores 25.9 Los poros celulares permiten el intercambio de materla entre culas vecinas 27. Bases moleculares de la excitacién neuronal 377 En la membrana celuar se orgira un potencal de repase 27.2 El gradiente de K+ decide predominantemente el potencial de reposo 27.3 Las clulas newviosas pueden, tras un impulse, responder con un potencial de accién 27-4 Los potencies de accién progresan unidirecicnalmente,estereaipados y @ menudo sakando 27-5 Los neurotransmisores transfieren los mensajeros ala sinapsis quimica 27.6 Los neurotransmisores pueden actuar como exctadres o inhibidores 27.7 Los neuropéptidos y las toxinas ‘modulan la actvided singptica 28, Principios de la comunicacién intercelular mediante hormonas 392 La comunicacin intercelularutiiza diversas modalidades 28.2 Los sistemas de sefiales endoctines son selectvos, amplificada- resy flexibles 28.3 Los receptoresintracelulares actian como factores de transcripcign 2°." El monéxida de ritrogeno es un men- sajero gaseoso Las proteohormonas se liberan de precursores inactivos Los receptores de la superficie celular activan las cascadas de sefalzaciin intracelulates 25.7 Las proteinas que se unen a GTP enlazen cadenas de sefalzecdn 28.8 Los efectores integran sefiales de diferentes eceptores 29. Transduccién de sefial mediante receptores acoplados a proteinaG 403 1 Los receptares acoplados a proteina G cruzan siete veces fa membrana 2°. Las proteinas G modulan fa actividad de [a adeniia- tocicasa 29.3 Las quinasas fosforlan y desensibilizan los receptores acoplados a proteinas G 29.4 La endocitosis de receptores uti lige vesiculas cubiertas de clatrina 79.5 eI cAMP aumenta la expresién genética mediante factores de transcripcién 29.5 Las células sensorales utizan rutas de sefal dependientes de prateina G 29.7 inostl trifostato deja libre el Ca'* de la reserva intracelular BEICa* y la calmodulina tabsjan a dio 79.9 El diacilglicerol activa la proteina quinasa C 30, Transduccién de sefial mediante receptores acoplados a enzimas 419 Los receptores acoplados @ enzimas poseen en general actividad tasina quinasa 20.2 Los ligands inducen dimerizaci6n y autotostotilacién 30.3 Los receptores acoplados a enzimas acivan proteina G menoméica 20.4 GIP-Ras activa la ruta de sefal de las MAP quinasas 30.5 Las proteinas mutadas tienen un potencial oncogénico 70.6 Las ctoquines usan receptores asociados tiosina quinasa 0 7 Las integtnas son receptores asociados ala mati celular 31. Estructura y dinamica del citoesqueleto 437 ‘Tres tipos de filamentos proteicos constituyen el citoesqueleto ‘Los microtibulos son estructuras dinémicas del citoesquele to 31.2 Los filamentos intermedios proporcionan soporte mecdnico 3/4 La agregaci6n de actina 2 los filamentos esta estricta mente regulada Las proteinas que unen actina se agrupan y conectan los filamentos en una red Los filamentos de acti ‘na constituyen un andamio para la célula Las estructuras proteicas estabilizan las membranas de los eritrocitos Las fila mentos de actina y los microtdbules forman carriles para las proteinas motores Las selectinas y las proteinas CAM median la adhesion celular XVIIL Indice de conteios 32. Ciclo celular y muerte celular programada 447 32.) Las cicinas y las quinasas dependientes de cidinas regulan el ciclo celular eucartico 37.2 La activacién de CDK inica ta mitosis 32.3 CDK4 controla el punto de restriccién en la fase G1 32.4 El supresor de tumores p53 modula la actividad de COK 32.5 Una cascada enzimaica causa la muerte celular programada 37.5 Las caspasas rompen proteinas de funcisn espectias de ta céhula 33, Bases moleculares del sistema inmunitario 458 33.1 El sistema del complemento ataca a los invasores bacterianos 33.2 El complejo terminal forma poros en la membrana bacteria~ na 33.3 El sistema inmunitario natural utiliza receptores de gran similtud 33.4 Las proteinas MHC presentan antigenos sobre la superficie celular 23.5 Los linfoctos forman el nodo central del sistema inmunitario adaptativo 22 6 Las células T organizan la defensa inmunitaria mediada por céiulas 33.7 Las célulasT colaboradoras estimulan las c#lulas B 33.8 Las células Tcitotdnicas empujan las céluls infectadas ala muerte 33.9 Las cSlulas B organizan la respuesta inmunitaria humoral 23.10 Las cadenas de anticuerpos constan de dominios variables y constantes 33.1 La hipermutacién somética conduce a la maduraciin de afinidad de las células B Parte V: Conversion de energia y biosintesis 34. Principios basicos del metabolismo 479 34. Las reacciones bioguimicas obedecen 2 las leyes de la termodinimica 24.2 £1 ATP es el portador universal de energia 34 3 ELNADH y el FADH, son los portadores de elecrones mas importantes 24.4 La coenzima A es el portador de grupos acilo més importante 3.5 Las rutas catabdlicas desembocan en el ciclo de Krebs 3.6 La regulacion de los procesos metabslicos tiene lugar muttlateralmente 35. La glucdlisis, el prototipo de una ruta metabdlica 489 35.) Lamuta gluceltica recorte diez etapas 35.2 La formaciin de gliceraldehido-3-fosfato cuesta ATP 35.3 La axidacién de gle: raldehido-3-fosfato aporta ATP 25.4 La produccién de piruvato genera ATP 25.5 El balance energético de la glucdlsis es positivo 35.6 Otios hidratos de carbono entran en la ruta glucoltica 35.7 La glucdlisis esté sujeta a un estricto control 36. El ciclo de Krebs, el elemento central del metabolismo 499 36. La descarborilacién oxidativa de piruvato libera acetilCoA 36.2 El ciclo de Krebs es una secuencia cerrada de nueve reacciones individuales 26.3 Las axidomredactasas liberan equivalentes de reduccién NADH y FADH, 36.4 El ciclo de Krebs sinve para rutas catabdlicas y anabélicas. 26.5 El ciclo de Krebs esta sujeto a un contral rgurosa 37. Fosforilacién oxidativa: transporte electrénico y sintesis de ATP 507 37.4 EL NADH citosdlco akanza la cadena de respiracin mediante una desviacidn 27.2 Dos accesos alimentan la cadena del tars: porte electidnico 37.2 El complejo | transfiere electrones desde el NADH a la cadena respitateria 37.4 Diferentes deshidrogenasas dependientes de FAD consttuyen otra entrada a la cadena respiratoria 37.5 La ctocromo ¢ reductasa transfiere electrones al ctocro- moc 31.6 La Gtocromo ¢ oxidasa transfiere electrones al oxigeno molecular 37.7 El transporte electrénico y la fosforilacién estan acoplados 37 § Un nanomotor de rotecién sinetiza ATP 37.9 Una translocasa dee fur los nuclestidos a través de las membrenas 37.10 Los desacoplantes causan un “cortocircuito” en la baterla de protones hhasta 30 mol de ATP 37.11 La “combustiéa” de 1 mol de glucosa genera 38, Ruta de los fosfatos de pentosas: un médulo metabdlico adaptative 522 38.1 La ruta de los fosfatos de pentosas transcurre en dos fases 38.2 La fase oxidatva libera NADPH y rbulosa-5-fosfato 38.3 La fase no oxidativa interconvierte hidratos de carbon 38. La ruta de los fosfatos de pentosas sirve para necesidades celulares cambiantes 39, Gluconeogénesis y ciclo de Cori 528 La gluconeogénesis transcutre en diez etapas enzimaticas la via del oxalacetato regulan reciprocamente El cio de Cor os fosfatasas son las enzimas clave de la gluconeogénesis, celaciona la glucdlisis muscular y la gluconeogénesis hepstica, lncice de contenidos = XIK Una carbonilacin vansitoria da lugar a fosfoerlgiruvato por "4 La glucdlissy la gluconeogenesis se 40. Biosintesis y degradacién del glucégeno 535 El glucdgeno es un polimero de glucosa ramificado 40.3 La te de giucdgeno glucogerdisis 4 a enfermedades de reserva 4). Sintesis de acidos grasos y f-oxidacion 549 La estructura de los dcides grasos determina sus propiedades a @5 el medio de transporte de los dcidos grasos os enzimas adicionales permiten la degradacién de écidos grasos insaturadas fibres 1.3 La acter los dcidos grasos ta excesiva de acetl-CoA se generan cuerpos cetdnicos 41.7 La cid 41.8 La Scido graso sintasa es una enzima mubifuncional ple de unidades C, el precursor de las prostaglandinas y de los tiomboxanos En el ctosol se producen dcidos grasos de cadena larga e insaturados La sintesis de glucégeno se realizs en cuatro etapas enziméticas ucdgeno sintasa es la enzima clave para la produccién de glucégeno a glucogendlsis incluye cinco etapas enzimaticas Una enzima bifuncional destamific el glucégeno Las seiiales hormonales regulan e! metabolismo del glucogeno 1 Una transglucosilasa ramifica la cadena crecien La glucégena fosforiasa es la enzima dave dela 6 Tiastornos de la degtadacin del glucdgene conducen Las lipasas hidrolizan wiacilglicéridos a dcidos grasos La frosidacin separa sucesivas unidades C; de En caso de una ofer ntests de dcidos grasos no és una simple inversion de le foxida- Los acidos grasos se producen por una condensaciin mil Acido araquidénico es 42. Biosintesis de colesterol, esteroides y lipidos de membrana 562 1 El colesteral se produce por condensaciin miltiple de aceti-CoA La HMG-CoA reductasa regula la biosintesis de colesterot, diario react 4 zacién dal colesteral 4 colestetolconducen a hipetipidemias biliares son detergentes naturales fosfatidico es el precursor comin de todos los fosfogiévidos de fostoipidos os esfingolipidos as LDL se interalizan por endoctosis mediada por un receptor Los dcidosbiliaresy las hormonas esteroideas se ox ginan del colesterol La progesterona es el precursor comin de todas las hornonas esteroideas ? La COP-colina es un intermediario activado para la fostatidilcolina Alteraciones en la degradacicn de esfingolipidos conducen a enfermedades de reserva lipidica Api t de isopenteniipirofosfato se genere un inte Las lipoproteinas regulan el transporte y la util: Alteraciones en la utlizacin de Los dcidos E acido EI CDP-diacillicerol es un intermediavio activado ce la sintesis La ceramida es el precursor de todos 43, Degradacién de los aminoacidos y ciclo de la urea 587 13.) Las transaminaciones retiran los grupos e-amnino de los aminoscidos El esqueleto carbonado de los aminodcidos alcanza el ciclo de Krebs 4) a degradacién de la familia C, converge en el ptuvato la deshicrogenasa de cadena tamificada forma intermediarios dela familia C, ia en la degradacién de la familia C; un gasto energético principal de la famita C, fumarato son intermediarios de la fama C, £1 eroxoglutarato es un punto de coincide El ciclo de la urea recicta los iones amonio con La acetil-CoA es el producto El oxalacetato, el succinato y el 44, Biosintesis de los aminodcidos y delhemo 592 £! grupo craming se origina a partir del nitrégeno molecular :mediatos del metabalismo un precursor de la serna, la glcine y la cisteina hormonas y neurotransmisores 41 bilirubina y biliverdina Sencillas reacciones producen ocho aminodcides no esenciales Las rutas del corismato y el antranil {2 homaserina es el companente para la metionina, la veonina y ta isoteucina La porfiina se origina de la glitina y el succin-CoA 1 esqueleto carbonado de los aminosidos se obtiene de £13-fosfogicerato es conducen a aminodcides arométicos Los aminodcidos son precursares de las 14.9 La degradacién del hemo genera 45. Preparacién y utilizacion de nucledtidos 605 15.1 Ena sintesis de novo de nuclestidos de purina participan diez reacciones La biosintes's de nuciedtidos de purina se controla estrictamente sistema de anillo de putina to y PRPP son los componentes de la biosintesis de pirimiinas desoxéribonuclestides se originan de los nucledsides difosfato sa 4 En [a segunda fase se forma gradualmente el 4 Carbamolfosfato, asparta- Los nucleétidos trifostato se originan utiizando ATP Los El flvorouracilo es un inhibidoritreversibie de la timidilato sinta- ta urea y el dcido irico son importantes productos de la degradacién de los nudedtidos xx indice de contaridos 46, Coordinacién e integracion del metabolismo 614 46.) Las estiategias metabéilicas de las células son universales 4 puntos nodales metabalicos con adaptaciones de! metabolism La glucosa-6-fostato, el piruvato y el aceti-CoA marcan los Los metabolsmas del higado, el miscule e teido adiposoy el cerebro estan coordinados Las hormenas orquestan ef metabolismo conjunto del organismo + El organismo reacciona ante las situaciones de estids Los detectas en el metabolismo de |a glucosa conducen a enfermedades graves Parte |: La arquitectura molecular de la vida Sobre la Tierra existe un niimero inmenso de formas de vida diferentes. Las ciencias biol6gicas procuran poner orden en esta fascinante variedad de vida. Actualmente se conocen y se han clasificado casi dos millones de formas diferentes, pero de hecho existen muchas mas. Todas son formas vivas, pero como se define la vida? Encontrar una definicién universal es dificil; es mas facil nombrar las caracteristicas impor- tantes que distinguen a los seres vivos: capacidad para el crecimiento y el desarrollo siguiendo tas reglas de un programa genético, posibilidad de rege- neracién y reproduccién, movimiento, delimitacién con respecto al entarno y un elevado orden interior, reaccién y adaptacion al entorno, asi como -en las formas mas desarrolladas- percepcién, memoria y con- ciencia. Los organismos vivos Modelo de un ribosoma, El modelo, que se realizd con criomicroscopia electronica, muestra un il ma de levadura que se une al canal proteico Sec6l se diferencian claramente de la materia inorganica inanimada, como las rocas, el agua o ¢l aire. Sin embargo, la vida siempre esta ligada a la materia inanimada: se basa en sencillas uniones quimicas y complcjas macromoléculas bioquimicas que siguen las leyes fisicas, sin disponer, no obstante, de las propie- dades cruciales de la vida. Es en realidad la organiza- cidn de estas moléculas la que produce la unidad biisi- ca de la vida: la eélula, La bioquimica se mueve como ciencia en Ia amplia area entre dtomos, mokéculas, células y organismos: explora los procesos moleculares sobre los que se basa todo ser vivo, ¢ indaga en la estructura, funcién y actuacion de las macromoléculas que facilitan el proceso de la vida. En los capitulos de introduccién queremos anali- 2ar esta arquitectura molecular de la vida en detalle, (rojo) del reticulo endoplasmitica (gris: membrana del RE). (Humbotdt-Uni Por cottesia de Rol itt Berlin), Joachim Frank (State Beckmann University of New York, Albany) y Gunter Blobel (Rockefeller University, New York). Quimica, la base de la vida Toda la vida se basa en la quimica, y todos los orga- nismos vivos estin constituidos por enlaces quimi- cos. Por ello, empezamos nuestro viaje a través del imperio de la bioquimica meditando sobre los com- ponentes quimicos mas sencillos: los étomos y las moléculas. Las moléculas simples se forman, al igual que las complejas macromoléculas biolégicas, mediante diversas reacciones a partir de un reducido niimero de elementos quimicos, y obedecen a las leyes fisicas. Se debe dedicar una especial atencién a los enlaces qui- micos, especialmente a las interacciones no covalen- tes entre mokéculas en disoluciones acuosas. Cuatro elementos dominan la naturaleza viva Desde la perspectiva quimica, los seres vivos destacan al principio por su enorme complejidad: diez mil tipos diferentes de moléculas constituyen de manera alta~ mente organizada una célula viva. Por el contrario, | materia inanimada es bastante sencilla y esta const tuida por unos pocos componentes. Se puede apreciar tun orden jerarquico ascendente en la formacién de los seres vivos a partir de la materia inanimada: las par- / 1.4 Ondenacion jerdrquica de la vida, A partir de las particulas elementales, Ia complejidad va aumentando continuamente desde los étamos, tas moleculas sencillas como ef H,0, as macromoléculas bialdgicas como una doble hélice de DNA, las cé las aisha ddas, los teidos, los onganismos pluricelulares, hasta Hegar al ecosistema de nuesteo planeta, Las células son las mas pequefias unl dades funcionales de la vida, 4 1. Quimica, la base de la vida ticulas subatémicas, como electrones, protones y neu- trones, forman los atomos, que # su vez se unen mediante reacciones quimicas para generar moléculas (figura 1.1). Mediante concatenacién se originan las macromokéculas, que a su vez son la base de la eélula como la mas pequefia unidad capaz de vivir, Las eélu- las se ordenan para formar los tejidos y generar orga nismos pluricclulares, como las plantas y los anima- les, que son la altima parte del complejo ecosistema de nuestro planeta, Empezaremos en el escalén mis bajo de esta jerarquia, Los dtomos (del griego atomon, “aquello que mo se puede ") 2 no se ven ya segin la vision de la fisica nuclear como los comporentes biisicos de la materia; han perdido ese estatus a favor de las parti~ culas elementales, como los quarks o los leptones, Sin embargo, para nuestros fines es suficiente tratar con protones, electrones y neutrones como los componen- tes basicos del dtomo, pues todas las demds particu- las slo desempenan un papel directo en reacciones nucleares y no en reacciones quimicas, Una caracte= ristica de un elemento quimico ~ es su numero ato- mico, que indica la cantidad de protones eristentes en ef micleo. El nimero atémico determina de manera decisiva las propiedades quimicas de un elemento. De un elemento existen a menudo diversas “variantes”: son los isétopos ~%, que se diferencian entre si por su namero méasico {la suma de protones y neutrones), pero no por sus propiedades quimicas. Sin embargo, los isétopos son importantes, ya que tienen una gran utilidad en el diagnéstico médico y Ia terapia, pero también en la investigacién bioquimiea (digresion 1.1). Digresi6n 1.1: Los isétopos en bioquimice Muchos experimentos de bioguimica se realizan con molé- culas marcadas con isstopas (tabla 1.1). De esta forma, entre un elevado nimero de moléculas no marcadas se puede sequir el “destina* de unas pocas malécules marca- das. Con este técnica de trazado se pueden identificar intermedianios del metabolism, localizar biemoléculas en células y tejidos, as! como analizar procesos de transporte y relaciones de proporcicnalidad. Si se alimentan ratas con acetato marcado con el isotopo de carbono MC y a conti- nuacién se aisla colesterol del higado, se encuentra el isoto- Tabla 1.1 Is6topos escogidos con relevancla bloquimica, Algunos isétopos son radioistopos, que se desinte- gran emitiendo radiacién, Otros isétopos representan, ‘tes estables de un elemento, La masa de un topo se Indica con un superindice, por ejemplo "C, De los casi 90 elementos quimicos naturales que existen, cuatro de ellos constituyen el “fundamento” del mundo vivo: ef hidrégeno (Hi), ef oxigeno (0), ef carbono (C) y cl nitrégeno (N) forman casi ef 96% de ta masa corporal de tos humanos, Estos cuatro ele- mentos son ademés, junto con el helio y el nedn, los principales elementos del universo, aunque a diferen~ cia de estos gases nobles “prefieren” enlaces (quitni- cos} covalentes (figura 1.2). La proparcidn elevada de hidrégeno y oxigeno contenida en la biomasa se refleja en la relevancia que el agua (HO) tiene para Ta vida. Los siguientes elementos se encuentran en la materia viva en proporcién menor (juntos con: yen aproximadamente el 39% de la masa corporal humana}: los metales alealinos y alcalinotérreos sodio (Na), potasio (K), magnesio (Mg) y calcio (Ca), el haldgeno loro (Cl), el azufre (5) y el féstoro (P}.. Estos tiltimos forman también enlaces covalentes: el azufre tiene un papel importante en la estructura de las proteinas, y el fésforo es indispensable para el intercambio de energia celular (seccién 3.10) y el control del aument de la sefal. El sodio y el potasio estén presentes como cationes monovalentes (Na*, K+]; el magnesio y el calcio como cationes divalentes (Mg?*, Ca®); el eloro como anién monovalente (CI+). Entre otros aspectos, estos jones son los encargados de la formacién del potencial de membrana eléctrico (seceidn 27.1) y forman parte de la sefializacién de la po radiactive ali de nuevo. De esta forma se ha podide observar que todos los Stamos de C del colesteral provienen del intermediario del metabolismo acetil-CoA (seccién 42.1) Los radioisotopos pueden verse mediante autorradiogratia © ser cuantifcados con un contador de centelleo ~», Las moléculas marcadas con isdtopos no raciactivos se diferen- cian en su masa de las moléculas no marcadas. La base de esta diferencia de masa pudo demostrar la replicacién semi- conservativa del DNA (seccién 2.18). Las isdtopos no radiace tivos, como el °C y el 'SN, tienen ademas un papel impor- tante en la espectroscopia de resonancia magnética nuclear (seccion 7.5), s 0 tefosfatas P-uclesti \sdtopo Aplicacién actual 1 (rritio) Mareaje de proteinas con leucina marcada con 5 (acute) Marcaje de proteinas con metionina 0 clsteina que cantiene P (Fosfor0) Marcaje de dcidos nucteicos construido con “'N (carbone, nitrgeno) Mareaje de proteinas cla magnética uictear ra la determinaciin de In estructura mediante expectioscopla de resonan- 1.1 Cuatro elementos dominan la natureleza viva 5 12 Sistema periodico de los elem tos. Encima de los simbolas de tos elementos se encuentra el numero de onden y debajo el peso atd- milco relative en dalton, Los elementos 57-71 (lantinides) y 89-103 [actinkdos) no se presentan por scparado, Los cuatro elementos Il. C, Ny 0 {rojo} constituyen alrededor del 96% de La masa de las céhulas vivas. Otros sicte elementos (rosa) conostituyen el 3%, Un ra 1 de clementos (principalmente metales) se encuentran en trazas (amarillo) y su proporeion en conjunto es <0,1%. Por arden de mayor 4a menor relevancla (indicado en el propio numero de orden) se encuentran Jos elementos menos importantes biologicamente. célula (seccién 29.6). La tercera categoria incluye los elementos traza ~, de los cuales la biomasa posee una proporcin >0,01%. Los elementos traza son principalmente metales, como el hierro (Fe) y el zinc La pave He Ho! 0° CH,-CH-COO™ 1.3 Hemoglobina y tiroxina. La hemoglobina requiere para el transporte de 0 Jones Fe" que estan Vigados a la proteina mediante grupos hemo. La tiroxina (T,) se forma en tas células foliculares de 1a gldnduta tiroides por yodaciin de los restos de trosina de Ia proteina de almacenamiento tirogobull- nna (seeeldn 44.7). (Zn), pero algunos también son elementos no metili- cos, como el yado (I) y el selenio (Se). En caso de que falte alguno de estos elementos, pueden producirse deficiencias graves (digresion 1.2). Digresion 1.2: Deficiencias debido a una falta de elementos traza Cuatro cationes de hierro (Fe"*) son el componente central de |a hemoglobina, la proteina transportadora de oxigen de la sangre (figura 1.3). Nuestro cuerpo produce diariamen- te alrededor de doscientos mil millones de pequetios cuerpos sanguineos rojos, cada uno repleto de hemoglobina. En este proceso se reutiliza el hierro de las células viejas; una parte mas pequefia se elimina a través del intestino o en hemorra- 12s y debe ser reemplazada. La anemia con descenso del ren- dimiento fisico esta producida por pérdidas crbnicas de san- gre, interrupcidn de la resorcién o deficiencia en el contenido de hierro en la alimentacion. Las consecuencias de una falta de yodo, el componente de las hormonas de la glindula tirci- des trivodotironina (T5) tiroxina (T.), san serias. Los adultos desarrollan una reserva de yodo en la que almacenan por completo la pequeia cantidad de yodo que poseen. Si una mujer embarazada tiene falta de yodo, el feto puede suftir trastornos ireversibles de carécter fisico y mental debido a la falta de hormonas de la glindula tiroides. Como regia profi- lactica, es prefenble utilzar sal yodada en las comidas para prevenir el cretinismo endémico. 6 1. Quimica, a base de la vida 1.2 Los modelos moleculares representan los enlaces y el orden de los atomos en el espacio Los ato nos forman moléculas mediante enlaces quimi- cos “2, Las moléculas interesantes desde el punto de vista de la bioquimica ofrecen un amplio espectro, desde las uniones mas sencillas como en el H,0, pasan- do por las moléculas ongiinicas de medida “intermedia” ta las macromoléculas como las como los aziicares, hi proteinas, Como es pasible “hacerse una idea” de estas moléculas? Los que mas se acercan a la realidad son los modelos de bolas 0 esferas, que presentan la disposi- cidn y la expansién de los atomos en el espacio (figura 1.4), La medida y la forma de los dtomos en los mode- los de bolas se determinan mediante su comportamien- to en el enlace y su radio de Van der Waals. El radio de Van der Waals marca la “esfera privada” de cada atomo, cs decir, Ia distancia a la cual no puede acercarse otro tomo cuando se une a éste sin que la nube elected @ Ho" 1.4 Modelos moleculares del colesterol. al Un modelo de bolas muestra la molécula en que los radios de Van der Waals de los ‘lomos estin definidos coma un espacio tena, b) En el modelo dde bolas y varillas se pueden observar mejor los atomtos Indivi- duales y sus correspondientes uniones, ¢) La presentacton de la formula ¢s 1a mas Facil y la mas clara, aunque no ofrece una ‘buena presentacion espacial de ka molécula, d) En la presemta= chin de ta formula reducida no se muestran en Ios enlaces C-C {os atomos individuales de C y de HI, Una cuna negra indica un cenlace hacka delante del plano del papel, mientras que una cuna con rayas discontinuas Indica hacia atris ca cargada equitativamente cause una fuerte repulsion. No tan reales, pero ms claros, son los modelos de bolas y varillas, en los que se representan los étomos uniendo bolas pequefas con varillas. Estos modelos permiten reconocer mejar el comportamiento del enlace y la posi- cin relativa de los atomos en las moléculas complejas.. Una representacién ms “minimalista” de las mokécu- las se expresa con la formula estructural, donde las uniones se dibujan simplemente mediante una o mas lineas entre los simbolos de los elementos. En repre~ sentaciones extremamente reducidas se llega a elimi- nar los simbolos en los enlaces entre no, La letra “R” en el lugar de un elemento significa resto, es decir, una parte de la molécula que para la vision de ésta no es explicitamente necesaria. Para macromoléculas bioldgicas como las proteinas apren- deremos otras formas de representacién que mostrarin estas estructuras sumamente complejas. mos de catbo~ Los sustituyentes en el atomo de carbono ignificado funcional En cantidad, el hidrdgeno y el oxigeno son los clemen- tos dominantes de la vida. Asi, los humanos estan fun- damentalmente compuestos por agua (aproximad: mente un 70% de su peso corporal), Sin embargo, en su “peso en seco” predomina otro clemento: los enla~ ces quimicos que forma la materia organica en la célu- la constan de mas de un 50% de carbono. El atributo “orginico” referido a estas mokéculas se utilizé inicial- mente de modo erréneo en el sentido en que se enten- poseen un " nee HeG-H conc 4 OH Gis HsC-E-CHs " matcrar 1.5 Hidrocarburos simples. EI metano €8 el hidrocarburo: mas simple, El eteno posce dos uniones, via el doble enlace, a dto- mos de C, y cs un material de partida para la sintesis de mate- ta, EI Isobutano es el hidrocarburo ramificade mis sencillo y se utiliza como medio de refrigeracion, El benceno es un hidrocar- bburo cictico cuyas electrones de los dobles enlaces estar deslo~ calizados a lo largo de todo el anillo, por To que se simboliza menudo como un hexagono con un “anillo de electrones" 1.3 Los sustituyentas en e! dtomo de carbono poseen un significado funcional 7 dia que estos enlaces sdlo podian ser sintetizados por los organismos vives. Casi todas las biomoléeulas son moléculas orginicas: el carbono fue, obviamente,“el” elemento elegido en ta evolucién quimica de ta vida, Las moléculas sencillas de carbono son hidrocarburos My es decir, moléculas de carbono cuyo “joven acom- pafante” ¢s el hidrégeno. Los hidrocarburos pueden ser moléculas lincales 0 encadenadas, ramificadas 0 anulares, y pueden contener enlaces sencillos, dobles 0 triples (figura 1.5). El carbono posee una muy rica posibilidad de combinacién quimica: mento es capaz de unirse con tal mult tamahos y geometrias A pesar de su multiplicidad, los hidrocarburos puros son “aburridos” desde el punto de vista biog mico: constan de carbono € hidrogeno, sus electrones de unin son pricticamente “pacificos” y las molécu- las no muestran una especial tendencia a producir reacciones quimicas adicionales. Las moléculas reacti- vas se originan cuando el atomo de carbono posee como sustituyentes otros atomos en el lugar del hidrégeno. Los elementos que sustituyen mis a menu- do son el oxigeno y el nitrégeno, y mas raramente el azufre, Los grupos funcionales “) mas importantes de las moléculas organicas son los grupos hidroxilo, car- bonilo, carboxito, amino y también el til (figura 1.6). El iitomo de oxigeno “mueve” los electrones de un enlace C-O hacia un lado: hablamos de una electrone- gatividad del oxigeno mus alta. Un caso extremo de una de estas polarizaciones ~ es la lonizacion de ambos alo~ mos, como ocurre por ejemplo en la reaccién del sodio con el gas cloro para generar cloruro de sodio (Na‘Cl-, sal comin). En este caso se trata de un enlace iénico, la ‘e RSH ™ 1.6 Grupos funcionales sencillos. De relevancia bioquimica son el hidroxilo o sgrupo alcobol, el grupo cartanilo extremo e inter- na (aldehido o cetona), el grupo carbaxilo y el grupo amino que contiene nitrogeno, y el grupo tol, tambi¢n denominado grupo sulthidrito, que contiene azufte. Sz. z 1U7 Estados de oxidaclon del carbono, Con el ndimero de oxida- clin inferior =4 se encuentea el carbono formando hidrocarbu- ros saturados. En alcaholes, aminas, tioles y éteres posee una oxidacion -2; en aldchidos, cetonas, acelales y hemiacetales el ‘nfimera de oxidacidn es 0, y para dicldos carboxilicos, ésteres y anhidridos de éidos carboxilicos ef numero de oxidacion es +2. La forma de oxidacion mas elevada con niimero de oxidaciin +4 se encuentra en el CO, y la urea, solucién mis radical pars aproximarse a ta estructura del gas noble: los electrones cambian simplemente de “propietario’: El atom que cede (donador de electrones) se oxidaré, mientras que el étomo que capta (aceptor de ‘electrones) se reduciri. Indudablemente, entre el carbo- no y el oxigeno no se produce un intercambio de carga completo. Sin embargo, para los iitomos se describe una carga formal o estado de oxidacién que se denomina numero de oxidacin. Para una molécula sin carga, la suma de los niimeros de axidacién de cada uno de los ‘itomos es igual a cero. El carbono puede adoptar cinco estados de oxidacién diferentes, otra de las facetas de su Aexibilidad quimica (figura 1.7). Los grupos funcionales abren un nuevo espectro qui- mico a la reactividad (tabla de grapos funcionales). Generalmente interaccionan y se enlazan para generar otros grupos funcionales (figura 1.8a). De esta forma, los grupos hidroxilo y carbonilo reaccionan para gene- rar un hemiacetal, mientras que el grupo hidroxilo y el carboxilo forman un éster; dos grupos carboxilo for- man un anbidrido, mientras que el carboxilo y el amino se funden en una amida, El tipo de reaccién mas fre- cuente 5 la condensacién, esto cs, la formuacién de un enlace con eliminacidn de agua (figura 1.8b). La inver- sidn de este proceso es la hidrélisis. La condensacién y 8 1, Quimica, a base de la vida ® ae vile. ® hon + Ha¥) #,07[)S1,0 icionales. a) A través de una catboxilico 0 el grupo amino, forman un conjunto de grupos funcionales. b) Férmula general para ta condensaciéa 0 la hhidrilisis, e) Machas biomoléeulas contienen mis de un grupo funcional (sencilla © complejo). La vitamina icido pantoténie participa, a través de la coenzima A, en la sintesis det neuro rransmisor acetilcolina y de los Acidos grasos (figura 41.17). la hidrdlisis describen sélo la reaccién conjunta; por lo general, detrs del proceso se esconden mecanismos de reaccién de mayor o menor complejidad. La mayoria de las biomoléculas disponen de varios grupos funcionales diferentes y son, por cllo, “multifuncionales” (figura 1.8¢). Cada grupo confiere a una molécula determina- das propiedades y reactividades. Los grupos funcionales dan a la molécuia o “ * y la preparan inica wn “candcter’ para las tareas bioguimicas. —————————_{ , § 9 4 (OH HO, ~ 19 Isomeria cis-rrans. Mediante el dab enlace fijo del centro de la molécula, los dos grapes carboxilo quedan fijados en el espacio, El scido funitico es un intermediario del ciclo det sitrato (figura 36.10). Los isémeros de constitucién se diferencian por su conectividad, es decir, por la secuencia de las uniones. Los estereoisémeros tienen Ia misma conectividad, pero sus dtomos estin dispuestos de forma diferente en el espacio, Al fijar la estereoisomeria en la compo- sicidn de una molécula se habla de isomeria de confi- guracién, Veamos una unién alquil de C, con un doble enlace central que, a diferencia del enlace sencillo, no puede rotar ficilmente. Los sustituyentes en los ato- mos vecinos del doble enlace se encuentran bien en el mismo lado (cis) o en lades opuestos (trans) del doble enlace, como en el caso de los acidos maleico y fuma- rico (figura 1.9). Estos dos acidos dicarboxilicos ~de idéntica constitucién- se diferencian persistentemente por sus propiedades fisicas y quimicas. Describimos este tipo de isomeria de configuracién como isomeria cis-trans, La naturaleza ha creado la isomeria cis- trans como “interruptor molecular” utilizable en cl proceso de la visién (seceién 29.13). Otro tipo de isomeria de configura én se encuentra en la quiralidad ~©, que significa “forma de mano’: En realidad, la mano detecha y la izquieda se parecen