Professional Documents
Culture Documents
ENZYM
2. Naêng löôïng hoaït hoaù - traïng thaùi chuyeån tieáp
3. Caáu taïo - chöùc naêng cuûa TTHĐ
4. Tính ñaëc hieäu cuûa enzym
5. Caùc yeáu toá aûnh höôûng ñeán hoaït ñoäng cuûa enzym
6. Đoäng hoïc vaø söï öùc cheá cuûa enzym
7. Kieåm soaùt hoaït ñoäng cuûa enzym
TS Ngoâ Kieán Ñöùc
1 2
ĐẠI CƯƠNG
ĐẠI CƯƠNG
Enzym
Chất xúc tác Baûn chaát caùc enzym laø nhöõng protein
Gia tăng vận tốc PƯHH: 107 lần Vaøi phaân töû ARN cuõng coù taùc ñoäng xuùc taùc
3 4
1
ĐẠI CƯƠNG
Taùc ñoäng coù theå ñöôïc ñieàu hoøa thöôøng nhaïy caûm vôùi
noàng ñoä cô chaát hay vôùi moät soá phaân töû khaùc
5 6
- Moïi phaûn öùng ñeàu phaûi vöôït qua moät haøng raøo naêng löôïng
- Haøng raøo naêng löôïng: naêng löôïng caàn thieát ñeå chuyeån caùc
phaân töû cuûa cô chaát sang traïng thaùi chuyeån tieáp
- Traïng thaùi chuyeån tieáp
daïng hoùa hoïc khoâng beàn
traïng thaùi trung gian coù naêng löôïng töï do cao nhaát
S
Söï thay ñoåi naêng löôïng trong moät phaûn öùng hoùa sinh
7 8
2
S +……. P +…….
Naêng löôïng töï do
Söï thay ñoåi naêng löôïng trong moät phaûn öùng hoùa sinh
9 10
Thí duï veà möùc naêng löôïng hoaït hoùa cuûa phaûn öùng
trong ñieàu kieän coù vaø khoâng coù chaát xuùc taùc: Thí duï veà möùc naêng löôïng hoaït hoùa cuûa phaûn öùng
trong ñieàu kieän coù vaø khoâng coù chaát xuùc taùc :
Saccarose + H2O Glucose + Fructose
H2O2 H2O + 1/2 O2
11 12
3
Söï thay ñoåi naêng löôïng töï do
Enzym laøm gia taêng toác ñoä phaûn öùng nhöng khoâng aûnh S
G ??
höôûng ñeán söï thay ñoåi naêng löôïng chung cuûa phaûn öùng
P
Söï thay ñoåi naêng löôïng trong moät phaûn öùng hoùa sinh
13 14
Cho bieát moät phaûn öùng coù thuaän lôïi veà maët naêng löôïng G döông: phaûn öùng khoâng thuaän lôïi veà maët naêng löôïng vaø caàn phaûi
hay khoâng. ñöôïc cung caáp naêng löôïng môùi coù theå thöïc hieän theo chieàu chæ ñònh
Heä thoáng sinh hoïc : naêng löôïng thöôøng ñöôïc cung caáp baèng vieäc keát
Bieán thieân naêng löôïng toång coäng aâm thì phaûn öùng thuaän
hôïp moät phaûn öùng khoâng thuaän lôïi vôùi moät phaûn öùng thuaän lôïi veà maët
lôïi veà maët naêng löôïng naêng löôïng (caùc caëp phaûn öùng)
Ví duï: Söï thuûy giaûi ATP ñeå thaønh laäp ADP vaø Pi töï do
ATP + H2O ADP + Pi
Go = - 30,5kJ mol –1 (thuaän lôïi)
15 16
4
Caân baèng hoùa hoïc
10 –4 /giaây
G khaùc vôùi G*.
A B
G*: aûnh höôûng ñeán vaän toác phaûn öùng
10 –6 /giaây
G: khoâng cho bieát thoâng tin gì veà vaän toác phaûn
öùng vaø khoâng leä thuoäc vaøo chieàu phaûn öùng ÔÛ traïng thaùi caân baèng, tyû leä cuûa noàng ñoä cô chaát vaø cuûa saûn
phaåm laø moät haèng soá khoâng ñoåi haèng soá caân baèng K.
Haèng soá K ñònh nghóa theo nhieät ñoäng hoïc laø:
Phaûn öùng hoùa sinh: haèng soá caân baèng cuõng baèng vôùi tyû leä giöõa Trung taâm hoaït ñoäng (TTHÑ)
vaän toác cuûa phaûn öùng ban ñaàu kf vaø vaän toác cuûa phaûn öùng ñaûo kb Vuøng enzym keát hôïp vôùi cô chaát vaø chuyeån ñoåi thaønh saûn phaåm
cuûa phaûn öùng
kf 10-4 Vuøng nhoû cuûa phaân töû enzym ñöôïc thaønh laäp bôûi caùc acid amin
K= = = 100 (coù theå ôû raát xa nhau treân chuoãi polypeptid)
kb 10-6
Caùc acid amin cuûa TTHÑ: Serin, Histidin, Tryptophan, Cystein,
Lysin, Arginin, Glutamat
Ở traïng thaùi caân baèng cuûa phaûn öùng treân, noàng ñoä cuûa B gaáp
100 laàn A duø coù hay khoâng coù maët cuûa enzym.
Enzym khoâng laøm thay ñoåi traïng thaùi caân baèng thuùc ñaåy
phaûn öùng nhanh choùng ñaït caân baèng
- Khoâng coù enzym, caàn khoaûng moät giôø ñeå ñaït ñeán caân baèng
- Coù maët cuûa enzym, phaûn öùng coù theå ñaït ñeán caân baèng
trong voøng moät giaây.
19 20
5
Trung taâm hoaït ñoäng (TTHÑ)
Moät khe nöùt/raõnh treân beà maët phaân töû enzym thaønh laäp moät
Phöùc hôïp enzym – cô chaát
khoaûng khoâng gian (khoâng phaân cöïc) taïo thuaän lôïi cho vieäc
lieân keát giöõa enzym vaø cô chaát Caùc goác xuùc taùc coù hoaït tính/ TTHÑ
Caùc cô chaát + TTHÑ = töông taùc yeáu
Cô chaát ôû traïng thaùi chuyeån tieáp
+ phaân töû cô
chaát môùi khaùc
21 22
23 24
6
Tính ñaëc hieäu cuûa enzym
Tính ñaëc hieäu roõ reät vaø cao hôn nhieàu so vôùi caùc chaát voâ cô
Tính ñaëc hieäu cuûa enzym
Theå hieän
+ ñaëc hieäu phaûn öùng: trong kieåu phaûn öùng xuùc taùc
+ ñaëc hieäu cô chaát: trong söï choïn loïc ñoái vôùi cô chaát
tham gia phaûn öùng
25 26
Enzym chæ xuùc taùc cho moät trong voâ soá nhöõng chuyeån hoùa Urease chæ xuùc taùc quaù trình thuûy phaân ure: ñaëc hieäu
coù theå coù ñöôïc ñoái vôùi moät cô chaát. tuyeät ñoái
Thí duï: 3 phaûn öùng cuûa acid amin Lactate dehydrogenase ngoaøi vieäc taùc duïng vaøo lactat,
- Acid amin bò oxy hoùa nhôø oxydase cho acid -cetonic vaø NH3
coøn coù theå taùc duïng vaøo nhieàu chaát khaùc cuõng coù nhoùm-
CHOH- nhö lactat: ñaëc hieäu töông ñoái
- Acid amin bò khöû carboxyl nhôø decarboxylase cho amin
töông öùng vaø CO2
- Acid amin :Chuyeån nhoùm amin sang moät acid -cetonic
khaùc nhôø transaminase
27 28
7
Tính ñaëc hieäu keùp Danh phaùp vaø phaân loaïi
Aminoacyl-synthetase trong quaù trình toång hôïp protein taùc
duïng leân hai cô chaát coù caáu truùc hoaøn toaøn khaùc nhau:
• Gắn với acid amin : hoaït hoùa a.a Danh phaùp
• Gaén vaøo ARNt : vaän chuyeån a.a Urease laø enzym xuùc taùc söï thuûy giaûi ureâ
Fructose 1,6-di phosphatase thuûy giaûi fructose 1,6-di phosphat.
Moät soá caùc enzym khaùc coù teân goïi khoâng lieân quan gì ñeán cô chaát như
Tính ñaëc hieäu laäp theå trypsin vaø chymotrypsin laø hai enzym thuûy phaân caùc lieân keát peptid cuûa
chuoãi polypeptid.
Caùc enzym chuyeån hoùa acid amin chæ taùc duïng leân L-acid
Moät soá caùc enzym laïi ñöôïc goïi döôùi nhieàu teân khaùc nhau.
amin maø khoâng taùc duïng leân D-acid amin.
29 30
Heä thoáng danh phaùp quoác teá: LOAÏI TEÂN ENZYM KIEÅU PHAÛN ÖÙNG XUÙC TAÙC THÍ DUÏ
1 Oxydoreductase Chuyeån vaän ñieän töû A- + B A + B- Alcol
- Caùc enzym ñöôïc chia thaønh saùu loaïi chính döïa theo kieåu dehydrogenase
phaûn öùng xuùc taùc cuûa chuùng. 2 Transferase Chuyeån vaän caùc nhoùm chöùc A-B + C A+ B-C Hexokinase
3 Hydrolase Phaûn öùng thuûy phaân A-B+H2O A-H + B-OH Trypsine
- Xaùc ñònh bôûi moät maõ soá xeáp loaïi goàm boán soá: 4 Lyase Phaân caét lieân keát C-C, C-O, C-N vaø caùc lieân Pyruvat
•
keát khaùc ñeå thaønh laäp thöôøng laø moät lieân keát decarboxylase
soá thöù nhaát chæ loaïi enzym ñoâi
• soá thöù hai chæ nhoùm A-B A=B + X-Y
| |
• soá thöù ba chæ phaân nhoùm X Y
• soá thöù tö chæ thöù töï cuûa enzym ñoù trong phaân nhoùm. 5 Isomerase Chuyeån ñoåi caùc nhoùm chöùc noäi phaân töû
(chuyeån ñoàng phaân)
Maleat
isomerase
A-B A-B
| | | |
X Y Y X
EC 1.17.3.2: Xanthin oxidase 6 Ligase Xuùc taùc caùc phaûn öùng toång hôïp coù keát hôïp vôùi Pyruvat
(hay synthase) söï thuûy giaûi cuûa ATP carboxylase
A+B A-B
31 32
8
Ví duï:
CAÙC YEÁU TOÁ AÛNH HÖÔÛNG ÑEÁN HOAÏT ÑOÄ CUÛA ENZYM
Trypsin mang maõ soá EC (Enzyme Classification) 3.4.21.4
Coù theå ñöôïc thöïc hieän döïa theo taùc ñoäng xuùc taùc cuûa chuùng töông
+ soá thöù hai (soá 4) cho bieát noù thuoäc nhoùm protease thuûy phaân
öùng vôùi vieäc chuyeån ñổi moät cô chaát thaønh moät saûn phaåm.
caùc lieân keát peptid
+ soá thöù ba (21) cho bieát ñaây laø moät serin protease coù chöùa goác
serin quyeát ñònh trong trung taâm hoaït ñoäng
(E)
S + ….. P
Ø+ soá thöù tö (4) cho bietá ñaây laø enzym ñöôïc xeáp thöù tö trong
nhoùm naøy.
33 34
CAÙC YEÁU TOÁ AÛNH HÖÔÛNG ÑEÁN HOAÏT ÑOÄ CUÛA ENZYM Ñònh löôïng enzym : ño toác ñoä xuaát hieän cuûa saûn phaåm hoaëc
Ñeå ñònh löôïng enzym caàn phaûi:
toác ñoä bieán maát cuûa cô chaát .
- bieát phöông trình caân baèng cuûa phaûn öùng ñöôïc xuùc taùc
- thieát laäp qui trình phaân tích cho pheùp ñònh löôïng hoaëc laø Neáu cô chaát (hay saûn phaåm) haáp thu aùnh saùng ôû moät
söï maát ñi cuûa cô chaát, hoaëc laø söï xuaát hieän cuûa saûn phaåm. böôùc soùng nhaát ñònh, söï bieán thieân cuûa noàng ñoä cuûa nhöõng
- chuù yù vai troø cuûa caùc chaát ñoàng phoái hôïp (cofactor), pH, chaát naøy coù theå ñöôïc ño baèng caùch khaûo saùt söï bieán thieân
vaø nhieät ñoä. Ô ûloaøi höõu nhuõ, caùc enzym thöôøng hoïat ñoäng cuûa ñoä haáp thu ôû böôùc soùng ñoù.
trong khoaûng nhieät ñoä töø 25 – 37 ñoä C
Vaän toác cuûa phaûn öùng cuõng aûnh höôûng ñeán vieäc ño löôøng Maät ñoä quang hoïc tyû leä vôùi noàng ñoä; toác ñoä bieán thieân cuûa
hoaït ñoä cuûa enzym (cung caáp ñaày ñuû cô chaát ñeå vaän toác ñoä haáp thu tyû leä vôùi toác ñoä phaûn öùng enzym ñöôïc bieåu thò
phaûn öùng ban ñaàu tyû leä vôùi noàng ñoä enzym) baèng soá mol cô chaát ñöôïc tieâu thuï (hay soá mol saûn phaåm
ñöôïc taïo thaønh) trong moät ñôn vò thôøi gian.
35 36
9
Ñònh löôïng enzym keát hôïp
NADH vaø NADPH laø hai phaân töû thöôøng ñöôïc söû duïng ñeå ño söï thay Glucose + O2 + H2O
ñoåi ñoä haáp thu trong caùc ñònh löôïng hoaït ñoä enzym vaø chuùng haáp thu
trong vuøng töû ngoïai ôû böôùc soùng 340 nm. Glucose oxydase
Thí duï: ño hoaït ñoä cuûa lactat dehydrogenase vôùi cô chaát laø lactat. Acid Gluconic + H2O2
Hoaït ñoä enzym coù theå ñöôïc ñònh löôïng baèng caùch ño söï gia taêng cuûa Hôïp chaát khoâng maøu
ñoä haáp thu ôû 340 nm vôùi phöông trình phaûn öùng sau: Peroxydase
(E)
CH3-CH(OH)-COO- + NAD+ CH3-CO- COO- + NADH + H+ Hôïp chaát coù maøu
Lactat Pyruvat H 2O
Ñònh löôïng keát hôïp enzym giöõa glucose oxydase vaø peroxydase coù
theå ñöôïc söû duïng ñeå ño noàng ñoä glucose trong maùu
37 38
Ñònh löôïng enzym keát hôïp CAÙC YEÁU TOÁ AÛNH HÖÔÛNG ÑEÁN HOAÏT ÑOÄ CUÛA ENZYM
Neáu muoán ñònh löôïng chính xaùc hoaït ñoä cuûa enzym ñaàu tieân
(glucose oxydase) thì enzym thöù hai (peroxydase) vaø nhöõng Vaän toác phaûn öùng enzym
Vaän toác cuûa phaûn öùng ñöôïc xuùc taùc bôûi enzym thöôøng ñöôïc
ñoàng cô chaát cuõng nhö caùc coenzym cuûa chuùng phaûi coù moät
löôïng thöøa ñeå khoâng rôi vaøo “böôùc chaäm” laøm aûnh höôûng goïi laø toác ñoä cuûa phaûn öùng.
ñeán vaän toác cuûa enzym keát hôïp.
Vaän toác phaûn öùng enzym thöôøng lieân quan ñeán giaù trò cuûa
vaän toác khôûi ñaàu, ôû thôøi ñieåm zero (bieåu thò Vo, mol/phuùt)
Trong nhöõng ñieàu kieän naøy, toác ñoä taïo ra hôïp chaát coù maøu tyû Vo: vaän toác cao nhaát (chöa coù saûn phaåm ñöôïc thaønh laäp ôû
leä vôùi toác ñoä taïo H2O2 vaø chính toác ñoä naøy tyû leä vôùi hoaït ñoä thôøi ñieåm ñoù)
cuûa glucose oxydase.
39 40
10
Saûn phaåm
(mol) Bieåu thò ñôn vò hoaït ñoä enzym
Vo töông öùng vôùi ñoä doác cuûa ñöôøng
Vo thaúng tuyeán tính ñi qua toïa ñoä goác
°
° Baèng vaän toác ban ñaàu (Vo) cuûa phaûn öùng ñöôïc xuùc taùc
(thí duï: baèng mol cô chaát ñöôïc chuyeån hoùa trong 1 phuùt)
°
°
Đôn vò tieâu chuaån cho hoaït ñoä cuûa enzym laø ñôn vò enzym (U)
°
°
Đơn vị enzym (U) laø löôïng enzym caàn thieát ñeå xuùc taùc vieäc chuyeån
°
°
t (min)
1 mol cô chaát trong 1 phuùt ôû 25 ñoä C
Söï lieân quan giöõa vieäc taïo thaønh saûn phaåm theo thôøi gian trong phaûn trong nhöõng ñieàu kieän toái öu cuûa enzym naøy.
öùng ñöôïc xuùc taùc bôûi enzym
41 42
- Hoaït ñoä (hay hoaït ñoä toång coäng) laø toång soá ñôn vò hoaït 35-40 U/L
ñoäng enzym cuûa moät maãu.
400 U/L
Ví dụ: ASAT 40U/L
43 44
11
Bieåu thò ñôn vò hoaït ñoä enzym
Bieåu thò ñôn vò hoaït ñoä enzym
- Katal laø ñôn vò tieâu chuaån quoác teá SI ño hoaït ñoä enzym
ñöôïc ñònh nghóa nhö laø taùc ñoäng xuùc taùc laøm taêng toác ñoä
phaûn öùng cuûa moät mol/giaây trong moät heä thoáng ñaëc hieäu. - Hoaït ñoä ñaëc hieäu laø soá ñôn vò hoaït ñoäng enzym töông öùng
vôùi 1mg protein (U/mg).
- Hoaït ñoä ñaëc hieäu duøng ñeå ñaùnh giaù möùc ñoä tinh khieát
Söï chuyeån ñoåi giöõa nhöõng ñôn vò cuûa enzym. Trong quaù trình tinh cheá enzym, hoaït ñoä ñaëc
1 mol/phuùt = 1U = 16,67 nanokat
hieäu cuûa noù taêng vaø tieán tôùi toái ña vaø khoâng ñoåi khi
enzym hoaøn toaøn tinh khieát.
45 46
{S}
Moái lieân quan giöõa {S} vaø Vo
47 48
12
Nhieät ñoä
Vo
Nhieät ñoä
Taùc ñoäng chung cuûa söï gia
taêng nhieät ñoä treân vaän toác
Hai khaû naêng: phaûn öùng cuûa enzym taïo ra
hai hieäu öùng ngöôïc nhau.
Gia taêng nhieät ñoä: taêng naêng löôïng nhieät cung caáp cho
caùc phaân töû cô chaát gia taêng vaän toác cuûa phaûn öùng
ÔÛ nhöõng nhieät ñoä quaù cao nguy cô phaù vôõ caùc lieân
keát laøm oån ñònh caáu truùc khoâng gian ba chieàu cuûa
enzym bieán tính enzym.
oC
4 37 50
Taùc ñoäng cuûa nhieät ñoä phaûn öùng treân hoaït ñoä enzym
Ñoái vôùi loaøi höõu nhuõ, nhieàu enzym hoaït ñoäng ôû nhieät ñoä gaàn 37oC.
49 50
Moãi moät enzym coù moät pH toái öu maø ôû pH naøy vaän toác
Pepsin laø moät enzym tieâu
Enzym 1 hoùa hoaït ñoäng trong daï
daøy ôû pH acid (pH 2)
Vo
cuûa phaûn öùng xuùc taùc seõ ñaït toái ña.
phuï thuoäc vaøo moâi
Moät thay ñoåi nhoû cuûa pH so vôùi giaù trò toái öu cuõng daãn tröôøng hoaït ñoäng.
ñeán söï giaûm hoaït ñoä enzym do noù laøm thay ñoåi söï ion hoùa Enzym 2
cuûa caùc nhoùm chöùc trong TTHÑ cuûa enzym.
Moät söï thay ñoåi lôùn pH coù theå laøm bieán tính protein
enzym do aûnh höôûng ñeán caùc lieân keát yeáu khoâng ñoàng
hoùa trò duy trì caáu truùc 3 chieàu cuûa enzym. pH
4 5 6 7 8 9
Söï thay ñoåi cuûa vaän toác Vo theo pH döôùi daïng hình chuoâng
51 52
13
Moät soá coenzym, chaúng haïn NAD+ , ñöôïc gaén vôùi enzym roài tieáp
Coenzym vaø caùc nhoùm ngoaïi ñeán laïi ñöôïc giaûi phoùng ra khoûi enzym trong quaù trình xuùc taùc vaø
ñoùng vai troø nhö laø moät chaát ñoàng cô chaát.
Ñeå xuùc taùc moät phaûn öùng, nhieàu enzym caàn coù söï hieän dieän
cuûa nhöõng tieåu ñôn vò khoâng phaûi laø protein ñöôïc goïi laø
chaát coäng taùc hay cofactor.
Caùc chaát coäng taùc naøy coù theå laø moät hay nhieàu ion voâ cô
nhö Zn 2+ hay Fe2+, hoaëc coù theå laø moät phöùc hôïp caùc phaân
töû höõu cô ñöôïc goïi laø coenzym: nhoùm ngoaïi (như hem trong
phaân töû hemoglobin).
Holoenzym: daïng coù hoaït tính xuùc taùc hoaøn chænh cuûa moät
enzym phoái hôïp vôùi coenzym cuûa noù hay vôùi ion kim loaïi
cuûa chuùng.
COENZYM + APOENZYM HOLOENZYM
(Phaàn protein)
53 54
Nhieàu coenzym laø nhöõng daãn xuaát töø caùc tieàn chaát laø caùc vitamin
14
2eø + H+
NAD+ luaân phieân töø traïng thaùi khöû sang traïng thaùi oxy hoùa
NADP+
Chöùc naêng gioáng nhau: hoaït ñoäng nhö nhöõng chaát vaän chuyeån ñieän
töû vaø tham gia vaøo caùc phaûn öùng oxy hoùa khöû. 57 58
2eø + 2H+
ISOENZYM
2eø + 2H+ Isoenzym (isozym) : daïng khaùc nhau cuûa moät enzym xuùc taùc
cuøng moät phaûn öùng
Tính chaát ñoäng hoïc vaø vaät lyù khaùc nhau
ñieåm ñaúng ñieän
pH toái öu
FMN aùi löïc ñoái vôùi cô chaát hay ñoái vôùi nhöõng taùc ñoäng cuûa
ADENIN caùc chaát öùc cheá
Nhöõng isoenzym khaùc nhau cuûa moät enzym nhaát ñònh ñöôïc
Caáu truùc cuûa coenzym toång hôïp do nhöõng gen khaùc nhau vaø thöôøng taùc ñoäng trong
FAD FAD vaø FMN nhöõng moâ khaùc nhau cuûa cô theå.
59 60
15
Ví duï:
Lactat dehydrogenase (LDH): caáu taïo bôûi boán tieåu ñôn vò xuaát phaùt töø
hai loaïi tieåu ñôn vò khaùc nhau goïïi laø H vaø M.
H vaø M: coù nhöõng khaùc nhau nhoû trong trình töï chuoãi acid amin cuûa Ví duï:
chuùng.
H vaø M keát hôïp moät caùch ngaãu nhieân ñeå taïo
neân 5 isoenzym: H4, H3M, H2M2, HM3 vaø M4.
61 62
M coù nhieàu trong cô xöông (cô vaân) vaø gan caáu truùc moãi isoenzym ñaëc tröng cho moät moâ ñaëc hieäu
• moät coâng cuï ñeå chaån ñoaùn (duøng chaån ñoaùn nhoài maùu cô
tim, theo doõi tieán trieån cuûa quaù trình trò lieäu)
H4 : tim
H3M: hoàng caàu
H2M2: naõo
HM3 : gan
M4: cô xöông
63 64
16
ÑOÄNG HOÏC VAØ SÖÏ ÖÙC CHEÁ ENZYM
Nghieân cöùu ñoäng hoïc cuûa moät soá enzym
Ởû nhöõng noàng ñoä cô chaát thaáp: Vo tỉ leä tröïc tieáp vôùi [S]
Đoái vôùi nhöõng noàng ñoä cao cuûa cô chaát: vaän toác coù xu höôùng
Moâ hình Michaelis-Menten
Moâ hình Michaelis-Menten toùm taét khaùi nieäm sau ñaây veà ñaït ñeán giaù trò toái ña Vmax (mol.min–1) vaø khoâng phuï thuoäc
söï xuùc taùc cuûa moät phaûn öùng bôûi enzym vaøo [S].
Caùc haèng soá vaän toác k1, k2 vaø k3 bieåu thò cho vaän toác ôû moãi
böôùc khaùc nhau trong quaù trình xuùc taùc. Phöông trình ñöôïc bieåu thò döôùi daïng ñoà thò hyperbol
65 66
Lieân quan giöõa noàng ñoä cô chaát |S] vaø vaän toác ban ñaàu Vo
k1
k3
Vo
E+S ES E+P
k2
Vmax
k2 + k 3
Km =
k1
Vmax/2
- Km duøng ñeå ño ñoä beàn cuûa phöùc hôïp ES vaø baèng toång
vaän toác cuûa söï phaân raõ ES chia vaän toác cuûa söï taïo
Km
thaønh ES.
[S]
67 68
17
Km coù theå ñöôïc xaùc ñònh baèng thöïc nghieäm döïa vaøo phöông
k1 k3 trình Michaelis vaø Menten : Km chính laø noàng ñoä cô chaát khi
E+S ES E+P toác ñoä phaûn öùng baèng Vmax/2.
k2
Vmax. [S]
Vo =
Ñoái vôùi moät soá caùc enzym: k2 thöôøng cao hôn nhieàu so vôùi k3. Km + [S]
Trong nhöõng tröôøng hôïp naøy Km trôû thaønh moät haèng soá ño aùi löïc
cuûa enzym ñoái vôùi cô chaát bôûi vì giaù trò cuûa noù luùc naøy phuï thuoäc Vmax. [S]
vaøo giaù trò töông ñoái cuûa k1 vaø k2 , haèng soá vaän toác töông öùng vôùi söï Vmax/2 =
thaønh laäp vaø phaân ly ES.
Km + [S]
[S]
1/2 =
Moät giaù trò Km lôùn cho thaáy enzym coù aùi löïc yeáu ñoái vôùi cô chaát (k2 Km + [S]
>> k1) vaø Km thaáp cho thaáy enzym coù aùi löïc maïnh ñoái vôùi cô chaát
(k1>>k2).
Km = [S]
69 70
Vmax vaø Kmax coù theå ñöôïc xaùc ñònh baèng thöïc nghieäm
baèng caùch ño Vo vôùi nhöõng noàng ñoä khaùc nhau cuûa cô chaát
döïa vaøo nghòch ñaûo cuûa 2 veá cuûa phöông trình Michaelis vaø
Menten sau:
1 = 1 Km 1 -1/Km 1/Vmax
+ x
Vo Vmax Vmax [S]
1/[S]
71 72
18
Chuù yù:
Moâ hình cuûa Michaelis vaø Menten ñöôïc xem nhö laø moät moâ ÖÙc cheá enzym
hình raát toát lieân quan ñeán haàu heát caùc soá lieäu thöïc nghieäm
cuûa phaàn lôùn caùc enzym
Caùc chaát öùc cheá taùc ñoäng tröïc tieáp treân enzym
Vaãn coù moät soá enzym khoâng phuø hôïp vôùi ñoäng hoïc cuûa laøm giaûm vaän toác xuùc taùc cuûa enzym
Michaelis vaø Menten: aspartat transcarbamoylase (ATCase)
ñöôïc goïi laø caùc enzym dò laäp theå (enzym allosteric)
73 74
Moät soá chaát öùc cheá enzym laø caùc saûn phaåm chuyeån hoùa cuûa Nhöõng chaát öùc cheá cuõng coù theå laø nhöõng taùc nhaân laï beân
teá baøo bình thöôøng. ngoaøi: caùc loaïi ma tuùy, ñoäc toá
Caùc saûn phaåm naøy seõ öùc cheá moät enzym ñaëc tröng ----> gaây ra nhöõng taùc ñoäng öùc cheá enzym coù theå daãn ñeán tình
traïng beänh lyù döõ doäi hoaëc cheát ngöôøi.
---> taùc nhaân kieåm soaùt thoâng thöôøng cuûa söï chuyeån hoùa.
75 76
19
Hai caùch öùc cheá enzym: öùc cheá khoâng thuaän ÖÙc cheá khoâng thuaän nghòch
nghòch hoaëc thuaän nghòch.
Caùc chaát öùc cheá lieân keát moät caùch khoâng thuaän nghòch vôùi
- Ức cheá thuaän nghòch : öùc cheá caïnh tranh vaø khoâng caïnh
enzym thöôøng baèng caùc lieân keát coäng hoùa trò vôùi moät goác
acid amin laøm baát hoaït enzym.
tranh. Söï öùc cheá thuaän nghòch coù theå ñöôïc ñaûo ngöôïc laïi
baèng caùch loaïi boû chaát öùc cheá enzym baèng con ñöôøng Nhöõng goác acid amin naøy thöôøng laø goác Ser vaø Cys coù caùc
thaåm taùch chaúng haïn. nhoùm chöùc töông öùng laø –OH vaø –SH.
- Ức cheá khoâng thuaän nghòch: khoâng theå ñaûo ngöôïc
77 78
ÖÙc cheá khoâng thuaän nghòch ÖÙc cheá khoâng thuaän nghòch
Diisopropylphosphofluoridat (DIPF), moät hôïp chaát khí taùc Iodoacetamid laøm thay ñoåi goác Cys của enzym
ñoäng höôùng thaàn kinh
O
DIPF phaûn öùng vôùi goác Ser trong trung taâm hoaït ñoäng cuûa
enzym acetylcholinesterase Enzym-CH2SH + ICH2 C NH2
----> öùc cheá khoâng thuaän nghòch enzym
----> ngaên caûn vieäc daãn truyeàn xung ñoäng thaàn kinh.
Enzym-CH2OH + DIPF O
Enzym-CH2 S CH2 C NH2 + HI
-HF
Iodoacetamid coù theå ñöôïc söû duïng nhö laø moät taùc nhaân chaån ñoaùn
Enzym-CH2-O-DIPF để xaùc ñònh soá goác Cys caàn thieát cho taùc ñoäng cuûa enzym
79 80
20
ÖÙc cheá caïnh tranh thuaän nghòch
ÖÙc cheá khoâng thuaän nghòch
Chaát öùc cheá caïnh tranh coù caáu truùc gaàn gioáng cô chaát
Khaùng sinh Penicilline öùc cheá khoâng thuaän nghòch enzym ----> caïnh tranh vôùi cô chaát ñeå lieân keát vôùi TTHĐ enzym.
glycopeptid transpeptidase baèng caùc lieân keát coäng hoùa trò vôùi
goác Serin trong trung taâm hoaït ñoäng cuûa enzym Enzym coù theå lieân keát vôùi hoaëc laø cô chaát hoaëc laø chaát öùc cheá
nhöng khoâng theå lieân keát ñoàng thôøi caû hai.
(enzym coù vai troø xuùc taùc vieäc thaønh laäp nhöõng lieân keát cheùo
trong thaønh teá baøo vi khuaån)
S
E ES E + P
I
EI
81 82
S
E ES E + P
I
EI
Chaát öùc cheá caïnh tranh lieân keát theo caùch thuaän nghòch vôùi trung taâm
hoaït ñoäng.
Toác ñoä phaûn öùng enzym tuøy thuoäc vaøo noàng ñoä töông ñoái cuûa chaát öùc
cheá vaø cô chaát.
Neáu taêng noàng ñoä cuûa cô chaát vöôït xa noàng ñoä cuûa chaát öùc cheá thì coù
theå laøm cho phaûn öùng ngöôc trôû laïi, vaø khaéc phuïc ñöôïc hieän töôïng öùc
cheá, ngöôïc laïi neáu taêng noàng ñoä cuûa chaát öùc cheá leân thì coù theå laøm cho
enzym bò öùc cheá hoaøn toaøn.
83 84
21
Ñoà thò Lineweaver-Burk cho thaáy aûnh höôûng cuûa chaát öùc
cheá caïnh tranh treân Km vaø Vmax
Succinat dehydrogenase laø moät thí duï ñieån hình cuûa söï öùc
cheá caïnh tranh. - laøm taêng ñoä doác cuûa ñöôøng bieãu dieãn
Enzym naøy söû duïng cô chaát laø succinat vaø bò öùc cheá caïnh
1/Vo - laøm thay ñoåi giao ñieåm vôùi truïc hoaønh
(bôûi vì Km taêng)
tranh bôûi malonat (khaùc vôùi succinat: chæ coù moät nhoùm - khoâng laøm thay ñoåi tung ñoä goác (vì
metylen trong phaân töû thay vì 2) Vmax vaãn laø moät haèng soá khoâng thay ñoåi)
1/[S]
85 86
22
Ñoà thò Lineweaver-Burk cho thaáy aûnh höôûng cuûa chaát öùc
cheá khoâng caïnh tranh treân Km vaø Vmax
°
° °
-1/Km ° °
°
° °
° Khoâng öùc cheá
1/[S]
89 90
91 92
23
Quaù trình chuyeån hoùa bò phaân nhaùnh: öùc cheá ngöôïc töøng daõy
Caùc saûn phaåm cuoái cuøng cuûa moät quaù trình chuyeån
hoùa bao goàm nhieàu phaûn öùng xuùc taùc bôûi caùc
D Y enzym thöôøng ít khi töông ñoàng vôùi hôïp chaát ban
E4’ En’
ñaàu cuûa quaù trình veà maët caáu truùc phaân töû
E3’
A B C
E1 E2
E3 ---> saûn phaåm cuoái cuøng seõ coù theå ñöôïc lieân keát vôùi
E Z enzym ôû moät vò trí kieåm soaùt khaùc vôùi vò trí cuûa
E4 En trung taâm hoaït ñoäng cuûa enzym.
---> enzym loaïi naøy ñöôïc goïi laø caùc enzym dò laäp theå.
ÖÙc cheá bôûi cô cheá feed-back töøng daõy trong quaù trình bieán döôõng
93 94
Ñöôøng bieåu dieãn cuûa vaän toác phaûn öùng ban ñaàu Vo theo [S] Ñöôøng bieåu dieãn naøy cho thaáy moät ñoaïn doác ñöùng ôû khoaûng giöõa cuûa
cuûa moät enzym dò laäp theå coù daïng sigma thay vì daïng noàng ñoä cô chaát
---> phaûn aûnh moät söï gia taêng nhanh choùng toác ñoä phaûn öùng cuûa enzym
hyperbol (Michaelis-Menten)
xaûy ra trong moät khoaûng giôùi haïn cuûa noàng ñoä cô chaát.
---> Ñieàu naøy cho pheùp caùc enzym dò laäp theå ñaëc bieät nhaïy vôùi nhöõng
Vo
thay ñoåi nhoû cuûa noàng ñoä cô chaát trong khoaûng giôùi haïn naøy.
Vo
[S] (mM)
10 20 30 40
[S] (mM)
10 20 30 40
95 96
24
Enzym dò laäp theå: lieân keát cuûa moät phaân töû cô chaát vôùi trung taâm
hoaït ñoäng aûnh höôûng ñeán lieân keát cuûa nhöõng phaân töû cô chaát vôùi
caùc trung taâm hoaït ñoäng khaùc trong phaân töû enzym. Lieân keát cuûa cô chaát vôùi moät trung taâm hoaït ñoäng laøm caûm
öùng thay ñoåi caáu hình trong phaân töû protein vaø gaây aûnh
Nhöõng trung taâm hoaït ñoäng khaùc nhau naøy ñöôïc goïi laø ñoàng hoaït höôûng ñeán nhöõng trung taâm taùc ñoäng khaùc
ñoäng ñoái vôùi lieân keát vaø taùc ñoäng treân phaân töû cô chaát.
----> laøm thay ñoåi aùi löïc cuûa caùc trung taâm ñoù ñoái vôùi caùc
----> enzym dò laäp theå thöôøng laø caùc protein caáu taïo bôûi nhieàu tieåu
phaân töû cô chaát.
ñôn vò vôùi moät hay nhieàu trung taâm hoaït ñoäng treân moãi tieåu
ñôn vò.
97 98
Enzym dò laäp theå: ñöôïc kieåm soaùt bôûi caùc chaát taùc ñoäng (hoaït Aspartat transcarbamoylase
hoùa vaø öùc cheá). (aspartat carbamoyl transferase, ATCase)
---> lieân keát vôùi enzym taïi moät vò trí khaùc vôùi trung taâm hoaït ñoäng
(treân cuøng moät tieåu ñôn vò hay treân moät tieåu ñôn vò khaùc)
---> gaây ra moät söï thay ñoåi caáu hình cuûa trung taâm hoaït ñoäng vaø
Enzym then choát trong quaù trình sinh toång hôïp pyrimidin
laøm thay ñoåi vaän toác cuûa phaûn öùng cuûa enzym. ---> ví duï ñieån hình trong cô cheá ñieàu hoøa dò laäp theå
Chaát hoaït hoùa dò laäp theå laøm taêng vaän toác phaûn öùng cuûa enzym
coøn chaát öùc cheá dò laäp theå laøm giảm taùc ñoäng cuûa enzym
99 100
25
CO2 + Glutamin + ATP
ATCase
H2PO4-
N-carbamoylaspartat
ATCase
Öùc cheá
CTP
Söï thaønh laäp N-carbamoylaspartat bôûi ATCase laø böôùc giôùi haïn söï sinh toång hôïp
pyrimidin vaø laø ñieåm kieåm soaùt chuû yeáu cuûa quaù trình
101 102
Vo
+ATP Söï thay ñoåi caùc lieân keát coäng hoùa trò thuaän nghòch
• Taïo thaønh vaø caét ñöùt moät lieân keát coäng hoùa trò giöõa moät nhoùm
khoâng phaûi laø protein vaø moät nhoùm laø phaân töû enzym.
Khoâng coù taùc ñoäng dò laäp theå
• Nhoùm khoâng phaûi laø protein coù theå lieân keát thuaän nghòch vôùi
enzym vaø taùc ñoäng ñeán hoaït ñoä cuûa enzym thöôøng hay gaëp laø
+CTP
nhoùm phosphat
103 104
26
Söï thay ñoåi caùc lieân keát coäng hoùa trò thuaän nghòch
Söï thay ñoåi caùc lieân keát coäng hoùa trò thuaän nghòch
Enzym
Enzym Pi Protein –OH ATP
Pi Protein –OH ATP
Protein Protein
Protein Protein phosphatase kinase
phosphatase kinase O
O H2O
- O- P = O
- -
Protein ADP
H2O
- O- P = O
- -
Protein ADP
O
O
Söï theâm vaøo vaø laáy ñi moät nhoùm phosphat ----> thay ñoåi caáu truùc baäc
Söï phosphoryl hoùa vaø dephosphoryl hoùa thuaän nghòch ôû enzym ba cuûa enzym ----> thay ñoåi taùc ñoäng xuùc taùc
105 106
Protein Protein
phosphatase kinase
O
H2O
- O- P = O
- -
Protein ADP
O
• Moät loaïi protein kinase chuyeån nhoùm phosphat ñaëc hieäu ñeán nhoùm OH
cuûa goác Serin hay Threonin cuûa enzym ñích.
• Loại thöù hai chuyeån nhoùm phosphat ñaëc hieäu ñeán nhoùm OH cuûa goác
Tyrosin (Tyrosin kinase).
• Caùc protein phosphatase xuùc taùc söï thuûy giaûi nhoùm phosphat cuûa protein
ñeå taùi taïo laïi nhoùm OH nguyeân thuûy cuûa acid amin vaø phoùng thích Pi
107 108
27
Ñieàu hoøa ñoàng hoùa trò
ATP
Glycogen
Pi phosphorylase
Protein Protein
phosphatase kinase
O
H2O
- O- P = O
- -
GP ADP
O
Daïng hoaït ñoäng
109 110
Trypsinogen
Enteropeptidase
Trypsin
Chymotrypsinogen Proelastase
Chymotrypsin Elastase
111 112
28
Chiết xuất và tinh chế enzym Enzym và thuốc
Chiết xuất
Nguyên liệu: mô tế bào ĐV – TV – Môi trường nuôi cấy VSV Thuốc tác động trên enzym
Giải phóng enzym khỏi tế bào: Thuốc hoạt hóa enzym: cảm ứng làm tăng hoạt động
Phá vỡ TB Thuốc ức chế enzym: làm giảm hđ
Hòa tan enzym: điều kiện thích hợp (pH, nhiệt độ...)
Kết tủa enzym: to < 15oC Enzym tác động trên thuốc
Tinh chế Chuyển hóa thuốc
Chiết lại nhiều lần
Sắc ký cột
113 114
Hết
115
29