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§1. 族群遺傳學
族群遺傳學領域在哈帝(Hardy)和溫柏格(Weinberg)提出相關的定理後,投身
研究的科學家漸增,成果也日益豐富。
假設一族群中針對某一性狀由兩個對偶基因A和a所控制。
對偶基因: A a
基因頻率: p q
由於僅有這兩個對偶基因來決定此性狀,故 p+q=1
若知對偶基因的基因頻率,即可計算出相對應的基因型頻率:
(p+q)2 =1 → p2+2pq+q2 = 1
達到哈溫平衡時,AA=p2、Aa=2pq、aa=q2
假設平衡時,對偶基因頻率和基因型頻率都不再隨時間而改變,則對偶基因頻率將
在族群中“保持不變”。
令 A 為正常對偶基因,a 為致病對偶基因,則
q2(即得病機率)=1 / 2000,故 q=(1 / 2000)1/2=1 / 44,而 p=43 / 44,
2pq(帶有致病基因而不發病的機率)=2(43 / 44)(1 / 44)≒0.044=1 / 22,這
代表人類族群中約有 5%的人口帶有此致病基因而沒有症狀。
為什麼像囊腫纖維症這類疾病仍舊在某些族群中普遍盛行呢?一般認為帶有此致病
基因而不發病的人(即基因型 Aa)較不易感染霍亂,因此對偶基因“a”得以在該
族群中保留下來。
§2. 生化遺傳學
最初有科學家 Archibald Garrod 從酵素的缺陷來探討遺傳疾病的發生情形,而生化
遺傳學正是從實驗遺傳學來分析生物化學的一門學問。
實驗系統:
酵母菌:單細胞真菌,為真核生物(具有細胞核)。
取少量的酵母菌培養於培養皿中,經過一段時間其中的每個細胞都會長成一群肉眼
可見的小聚落,每個聚落都是由同一個細胞發展而來,該細胞的每個子代都會長在
同一個位置。
酵母菌的生命週期
酵母菌可分為二倍體(2n)與單倍體(n)兩種形態,其中n為染色體數,酵母菌
有 16 對染色體。酵母菌的生命週期如下圖所示:
生長條件
酵母菌可生長的培養皿環境的最低營養限度為:具有碳水化合物(可醱酵糖,如葡
萄糖、果糖、乳糖)、氮鹽、磷鹽,培養皿可為液態或固態。
酵母菌可將上述這類物質透過生物合成的過程來形成它們所需要的養分。
酵母菌也可以生長在營養豐富的培養皿中,這類培養皿可能包含一些常見的巨分子,
酵母菌會直接從培養皿中汲取它所需要的養分,而不用再另外合成。
換言之,酵母菌是透過「酵素的控調」來控制它是否需要啟動生物合成的機制來合
成它所需要的養分,或是只要進行從外界汲取養分的機制即可。
為深入了解其中的生物合成過程,科學家透過某些方法使酵母菌的一些關鍵酵素失
去作用,這類酵母菌也因此不能在特定的環境下生存。舉例來說,如果想要找出參
與胺基酸合成過程(如精胺酸的合成)的基因或是蛋白質,可以透過無法合成精胺
酸的酵母菌來進行研究,那麼讀者可能就需要從培養的酵母菌中找找是否有這類沒
有精胺酸就無法生存的酵母菌存在。
一旦找出突變株,接著就必須找出此突變株需要何種營養素才能在最基本培養皿中
生存。舉例來說,若要找出不能合成精胺酸的突變株,可按照下列步驟來進行:將
酵母菌培養於豐富培養皿上→轉移至最基本培養皿中培養→轉移至含精胺酸的最基
本培養皿中培養。
所有酵母菌都能在豐富培養皿上生存,但生物合成路徑有缺陷的突變株不能在最基
本培養皿上生長,比如說,無法正常合成精胺酸的酵母菌就只能在含精胺酸的最基
本培養皿上生存,或無法在缺乏精胺酸的豐富培養皿中生存。
透過上述方法在豐富培養皿和最基本培養皿中交錯測試,即可找出各類突變株,這
些酵母菌稱為營養缺陷體(auxotroph)。
※名詞定義
原營養體(prototroph):能在最基本培養皿中生存的正常菌種。
營養缺陷體(auxotroph):無法在最基本培養皿中生存的突變菌種。
若由這些方法分離出的突變株不能生長於最基本培養皿中,但可生長於含有精胺酸
的最基本培養皿中,則這類細胞稱為精胺酸營養缺陷體(arginine auxotroph)。然
而,需要一次分析大量細胞時,上述方法卻不適用,此時通常會改用一種稱為複製
平皿(replica plating)的方法來進行突變株的測試與篩檢。
有兩種方法可找出我們所需要的菌落:
1) 遺傳篩選(Genetic Screen):透過先前所介紹的方法找出無法在特定培養皿中
生長的菌落,再篩檢出「喪失某功能」就不能在特定環境條件下生長的突變株。
2) 遺傳選擇(Genetic Seletion):透過前述方法找出能夠在特定培養皿上生長的
菌落,接著篩選出「獲得某功能」而得以在一般菌株無法生存的環境下生長的菌
株,例如帶有盤尼西林抗生素抗性的菌株則可在含有盤尼西林的培養皿中生長。
為研究缺乏精胺酸就無法生存的酵母菌突變株,需要準備大量的精胺酸營養缺陷體
(arginine auxotroph),即最基本培養皿至少要含有精胺酸才能使這類突變株生存
其上。
若要取得這類突變株,需利用到單倍體酵母菌(haploid yeast),這類酵母菌僅含
有每個基因的其中一個複本(copy)。另外需要特別注意的是,不宜使用二倍體酵
母菌(diploid yeast),因其具有每個基因的兩個複本,即使其中一個複本發生突
變,另一個正常基因複本一樣可產生酵素來維持正常功能。
※比較單倍體酵母菌與二倍體酵母菌:
--單倍體酵母菌:精胺酸合成酵素基因發生一個突變即可造成精胺酸營養缺陷(arg
auxotrophy)。
--二倍體酵母菌:精胺酸合成酵素基因發生一個突變不能造成精胺酸營養缺陷,因
為另一個基因複本仍可發揮正常功能。二倍體酵母菌要成為精胺酸營養缺陷體,必
須精胺酸合成酵素基因中的兩個複本都發生突變,但二倍體的同一個基因的兩個複
本皆產生突變的例子並不常見。
1) 隱性測試(Test of Recessivity):
--酵素功能的喪失通常相對於正常表現型為隱性。
--兩個基因複本中只要有一個複本是正常的,就可以產生正常表現型。
2) 互補測試(Test of Complementation):
互補測試可用以決定兩個不同的突變是否發生於同一基因中。首先先將兩個單倍體
酵母菌彼此交配以產生二倍體酵母菌,接著觀察此二倍體酵母菌的表型。
一般說來,不同基因中的突變由於其對應的正常基因複本皆可產生正常的酵素,而
能夠彼此補足對方的不足,使得二倍體酵母菌可以維持原營養體(protoph,即正
常的營養體),即每個突變體彼此互相修補缺陷。
對各個不同的單倍體酵母菌進行互補測試的結果可製表如下所示:
責任編譯:清華生科 莊雅善