菌屬

列舉菌種
+ Staphylococcus
S. aureus S. pyogenes
Aerobic Gram(+) Cocci
Streptococcus
S. agalactiae S. pneumoniae
Enterococcus
E. faecalis, E. faecium
non-motile
共同特性 Capsule(+) Commented [u1]: Capsule(+)
抑制趨化作用(chemtoaxis)和吞噬作用
catalase(+)/兼性厭氧 catalase(-)/微好氧/fastidious
(polysaccharide slime layer) Carbonhydrate A Carbonhydrate B
Teichoic acidCRP Group D
Protein A >> bind IgG (Group-specific) Commented [u2]: 只有 coagulse (+)的 staphylococcus 才
Cell wall (C polysaccharide) glycerol Teichoic acid 有，Inhibit IgG124 可用於血清學診斷
polysaccharide A (teichoic acid) M、T、F proteins C protein
Autolytic amidase Peptidoglycan：吸引淋巴球過來
Peptidoglycan>>endotoxin-like (type-specific)
Hemolytic： β(大範圍) β(溶血性低;小範圍) α α/γ
Serologic： Group.A Group B No C-carbonhydrate Group D(已分家) Commented [u3]: 依 Lancefield grouping 來進行
group-specific 分類，鏈球菌對人類有感染力的有五種，其
carotenoid pigment 生化: PYR(+) CAMP(+) -- PYR(+)
中三種有此 antigen，即 C-carbonhydrate！
區分 10% NaCl durable
Coagulase(+) Optochin 敏感 高 NaCl durable Commented [u4]: 可以 optochin 區分出
Ferment Hippurate hydrolysis S.pneumoniae(susceptible)與
Bacitracin 敏感 Bile solubility test 在 Bile salt 下可生存
mannitol (紫色) S. viridans(resistant)
(bile 可活化 amidase) 抗 optochin、bacitracin 兩者因分子技術進步而分家

[Toxins]
1. Streptolysin O、S
1. Enterotoxins 1. Pneumolysin Commented [u5]:
>>溶血(白、紅血 1. Cytolysin >>溶血 和 TSST-1 同為 superantigen
2. Exfoliative toxins(ETA, ETB) >>破壞呼吸道的
球、血小板) 莢膜多醣 2. Gelatinase 刺激 T cell 增生
3. Toxic shock syndrome toxin-1 纖毛上皮 Enterotoxin 熱穩定(100 度 C 30mins)
(TSST-1)>>破壞表皮細胞 >>測到 ASO (type Ia, III, V) >>蛋白水解酶 抗胃酸消化液
Virulence 2. IgA protease
(type-specific) 3. Multiple plasmid 抗藥 Enterotoxin A 最毒
4. Cytotoxin 2. DNase B (∵黏膜多 IgA)
3. Streptokinase >>抑制補體 (β-lactam, vancomycin Commented [u6]: Anti streptolysin O
[Enzymes] 3.莢膜多醣 為新近感染 A 型鏈球菌的重要臨床證據
1. Coagulase： >>破壞凝血 resistance) O 表示易受氧破壞而不活化
(type-specific, 90)
促 Fibrinogen→fibrin 4. M protein Commented [u7]: 分解 C3b 另有 C5a peptidase 抵抗吞噬
作用
[Toxins] [Pyogenic]
1. Enterocolitis 食物中毒 1. pharyngitis Commented [u8]: 耐熱性腸毒素污染食物, 24hr 之內上
吐下瀉
2. Staphylococcal Scalded Skin 2. Scarlet fever 猩紅
支持性療法
Syndrome(SSSS) 3. 膿皮病、丹毒 [Neonates] 1. Pneumonia
>>脫皮、水泡 (嬰兒) 4. Cellulitis >>Meningitis 2. Sinusitis 鼻竇炎
3. Toxic Shock Syndrome(TSS) 5. Necrotizing 1. early-onset(7 天) Commented [u9]: 和 enterotoxin 同為 superantigen
3. Otitis media 中耳炎
>>擴散性紅斑疹 fasciitis 2. late-onset 1. UTIs 尿道感染 常見於女性陰道感染
4. Meningitis 腦膜炎 衛生棉條放置過久
(erythematous rash) 壞死性筋膜炎 2. Peritonitis 腹膜炎
Diseases 5. Bacteremia
(↑軟組織感染) [Pregnant women] 3. Endocarditis 合併
6. Fulminant sepsis
[Pyogenic] 6. Streptococcal toxic 1. puerperal sepsis bacteremia Commented [u10]:
產褥熱敗血症 (猛爆性膿毒症 Impetigo 膿疱瘡 衛生習慣差的小孩
1. cutaneous infections shock syndrome
血液疾患併發) Folliculitis 毛囊炎
2. Endocarditis + bacteremia 2. Endometritis Furuncles 癤 (侵犯 dermis 有痛感)
3. Pneumonia + empyema [Non-pyogenic] 子宮內膜炎 Carbuncles 癰 (全身性)化膿、致命
Bacteremia & endocarditis 菌血症 與心內膜炎 義肢與
4. Osteomyelitis 骨髓炎 1. Rheumatic fever 心導管
5. Purulent/Septic arthritis 2.glomerulonephritis Pneumonia & empyema 肺炎、蓄膿症 老幼與有過肺疾患
者、敗血休克
社區院內感染 MRSA(抗藥性) 腎絲球發炎(血尿)
Osteomyelitis 骨髓炎 多幹骺端
Purulent/ Septic arthritis 化膿性/敗血性關節炎 出現紅
共生菌：皮膚、黏膜正常菌叢 共生菌：口、咽 共生菌：上呼吸道 共生菌：腸胃道 斑與膿
1. 飛沫傳染 1.初期無症狀 1. 始於鼻咽、喉咽 Commented [u11]: EHEC 會傷害 glomerular endothelial
1. 人與人接觸傳染 2. 皮膚接觸傳染 2. 兒童、老人、病人 1. GI tract cell --> HUS
2.早發型新生兒 1.、2.都是遲發性抗體媒介導致
Epidemiology 2. 心導管、導尿管、義肢等外物 易感染 2. 院內感染 Rheumatic fever 為
CNS 感染
3. 抗生素濫用 CA-MRSA 3. 使用 cephalosporins autoimmunity type II
母親感染
4. 嬰幼兒(SSSS)、經期婦女(TSS) (廣效性抗生素)病人

傷口：顯微鏡(pyogenic infections) 1 傷口：顯微鏡 1. 顯微鏡

1.皮膚：顯微鏡
Culture: 7.5% NaCl+Mannitol 腦脊髓液、痰 2. 抗原偵測：
2.抗原偵 antibiogram:
羊血盤 (MSA)[選] 2. PCR-based assays 尿液、CSF 1. Bile solubility test Commented [u12]:
diagnosis - antistreptolysin O S. aureus：ferment mannitol(黃色)
Test: 1. coagulase test (孕婦) 3. Bile solubility test 2. optochin test
(+區分) (ASO) test Others staphylococcus：Not ferment mannitol (紅色)
2. antibiogram 3. CAMP test、hip. (Bile esculin agar) 7.5%NaCl inhibit other bacteria
- anti-DNase B test
3. phage typing Ag B 4. Optochin test
3.培養確定
4. nucleic acid analysis 4. 培養 5. 培養

抗 β-lactamase 的 Penicillin
Penicillin G Penicillin，若抗藥性
Antibiotic oxacillin Penicillin 抗 β-lactamase 的 Penicillin
(治療/分娩前 4hrs) Vancomycin
Treatment Vancomycin(最後)→針對 MRSA 抗 vancomycin
vancomycin 有 Vaccine
清創
※coagulase(-) Staphylococcus、Viridans streptococcus(α-溶血，不受 optochin 抑制)
 + Aerobic Gram(+)
Rods, without Mycolic Acid
─ Aerobic Gram(-)
Cocci (雙球菌 diplococci)
菌屬 Bacillus Listeria Erysipelothrix Neisseria
列舉菌種 B. anthracis (炭疽) B. cereus L. monocytogenes E.rhusiopathiae N. gonorrhoeae N. meningitidis
catalase(+) catalase(+) catalase(-) catalase(+)
Non-motile Motile Motile(37℃低) non-motile non-motile
兼氧性 兼氧性/絕對好氧 兼氧性 兼氧性(5~10%CO2)
oxidase(+)(有 acid 非 fermentation)
γ-溶血 β-溶血(weak) β-溶血(weak) α-溶血 Commented [u13]: Colony 大而溶血 area 小
共同特性 似 Group B streptococcus (agalactiae)、
polypeptide capsule(+) 耐 bile salt、低溫 易脫染 corynebacterium
(poly-D-glutamic acid) 6.5%NaCl、強酸 部分 Gram(-) 生長在潮濕、高 CO2(5%)的環境
(在活體內才有莢膜) 兼性胞內菌 產生 H2S (fastidious 挑剔)、diplococci

Spore CAMP(+)
Hippurate(+)
不耐乾燥、fatty acid
形狀 Kidney bean
1. Anthrax toxin 炭疽 1.腸胃炎： 1.可在 Mψ 內生長 幫助侵入細胞： Capsule(-) Capsule(+)
-質體 pOX1 -熱穩定腸毒素 2.致病 1. Hyaluronidase Glucose(+) Glucose(+)
-A-B toxin >>嘔吐型(emetic) -internalins (HA) Maltose(-) Maltose(+)
-保護性抗原 PA(B sub.) >>uptake by host 2. Neuraminidase 採樣：尿道、喉嚨、血 腦脊髓液 CSF
病程短
>>結合在宿主細胞 epi. (NA) 液
只有毒素(米)
- hemolysins 3. polysaccharide
-水腫因子 EF (A sub.) -熱不穩定腸毒素
Listerolysin O like capsule 1. Pilin >> 附著、抗吞噬 Commented [u14]: Ab developed against pilin protect
>>產生 cAMP (Ca2+) >>腹瀉型 reinfection with homologous strain, but not in heterologus
(LLO) 2. LOS >> 似 LPS(內毒素) strain
-致命因子 LF (A sub.) 病程長 phospholipase C (lipooligosaccharide)
>>切斷 MAPKs (Zn2+) 有細菌(菜肉) >>破壞 endosome
virulence -PA+EF 3.Por Protein (I) 3. capsule
進入細胞質
→水腫毒素(edema) 2.眼部感染 >>胞內生存 4. endotoxin(主要)
-Act A
>>cAMP↑破壞水平衡 -壞死性毒素 Opa>>附著
>>轉移至另一 cell
-PA+LF -cereolysin Rmp>>保護表面 Ag
→致死毒素(lethal) -phospholipase C 4.鐵蛋白：搶 Fe2+
>>巨噬細胞釋放 (lecithinase) Transferrin-binding
TNF-α、IL-1β，休克 protein
Lactoferrin --
死亡
Hemoglobin --
2. Capsule
5. IgA1 protease
-質體 pOX2

1.淋病 (gonorrhoeae)
1.皮膚型(inoculation) 1.腦膜炎 Commented [u15]: 外形 coccobacilli (short rods)、雙球，
男性：急性、明顯 血清型 B, C
>>無痛丘疹、焦痂 像
1.腸胃炎 2. Neonatal disease 1.類丹毒 -urethritis 尿道炎 1. Meningitis 1. enterococci
2.腸胃型(ingestion) 2.眼部感染 早期：(經胎盤) 2. streptococcus pneumonia
(erysipeloid) -dysuria 排尿困難 2.Meningococcemia 3. Neisseria meningitidis
>> 100%死(herbivore) (ocular infections) 敗血嬰兒肉芽腫 -局部皮膚感染 女性：症狀不明顯 腦膜炎球菌血症 (都會引發腦膜炎用染色區別)
3.吸入型(inhalation) 3.肺部疾病(pOX1) Granulomatosis infantiseptica 1、2-->catalase、CAMP(-)
Diseases -全身性皮膚感染 -cervicitis、vaginitis -血栓(thrombosis)
>>羊毛工人病 晚期：(生產過程) 2不耐 NaCl
-敗血症型 -PID (不孕、流產) -瘀斑(skin lesions) Listeriacatalase、CAMP(+)、NaCl
(wool sorter’s disease) 腦膜(腦)炎
少化膿 v.s. (小長到大;全身性) Commented [u16]:
3.腸胃炎 2.散佈性淋病 DGI 主要造成 urethritis 有兩種 bacteria
(胸縱膈淋巴、腦膜炎)
(healthy adults) S. pyogenes 丹毒 >>灰白色膿皰、紅腫 血清型 Y, W135: 1. Neisseria gonorrhoeae
>>盡快治療， 2. Chlamydia Trachomatis
4.菌血症 >>化膿性關節炎 1. Pneumonia 3.enterobacteriaceae
否則大部分會死掉
3.新生兒眼炎 Commented [u17]: PID：pelvic inflammatory disease
Commented [u18]: DGI： Disseminated Gonococcal
人畜共通：意外宿主 土壤 Ubiquitous：土壤 人畜共通&土壤 人類唯一 人類唯一 Infections
會造成 suppurative arthritis 有兩種菌
1.乳品(冰箱) 1. Neisseria gonorrhoeaa
Epidemio- 1. 接觸、吸入傳染 1. (眼部)傷口 2.母子垂直傳染 2. Straphylococcus aureus
1.職業病(人畜)
logy 2. 食物傳染 2. 食物傳染 3.腸道(少量共生) 1. sexual contact 傳染 1. 飛沫傳染(人人) Commented [u19]: (Ophthalmia neonatorum)
2.接觸傳染
3. 不會人人 3. 靜脈注射 4.sporadic/epidemic
(peak at 溫暖月份)
1. 顯微鏡 1. Fe2+ enriched medium
1.腦脊髓液 Gram(+) 2. Thayer-Martin Commented [u20]: 在腦脊髓液中，通常 gram stain 染不
2. 培養(低 CO2 有 spore) 1. culture： 1.腦脊髓液採樣！ 到 listeria monocytogenes 因為 conc. 太低
1.檢體(傷口、眼睛 2. Cold enrichment medium(VCN)
3. Capsule：(活體才有) 5~10% CO2 2. chocolate agar！ Commented [u21]: chocolate agar
selective culture： 3.可凝血
diagnosis 4. lysis by γ-phage 非糞便)染色 chocolate agar 含有 vancomycin，會抑制部分 gonorhoeae
4oC(冰箱) 4.核酸增幅分析 3. test 不明確
5. DFA testcell wall 2. Culture(食物) 2. TSI agar→H2S Commented [u22]: Vancomycin、Colistin、Nystatin
3. CAMP(+)
polysaccharide (triple sugar iron) 5.採樣位置：泌尿道、 對 dry、cold 敏感
4. Hippurate hydrolysis
6. PCR 子宮頸抹片

Ciprofloxacin Penicillin 抗
Penicillin
antibiotic Penicillin Vancomycin Penicillin 不能用 penicillin 可以用 penicillin
抗 vancomycin
幫動物打疫苗 支持、症狀治療
 菌屬
列舉菌種
+ Corynebacterium
C. diphtheria
Aerobic Gram(+) Rods, with Mycolic Acid (為 actinomycetes 放射菌類)
Nocardia
-- M. tuberculosis
Mycobacterium
M. leprae M. avium complex
catalase(+)、non-motile

Acid-Fast stain: (-) Acid-Fast stain: partial (+) Acid-Fast stain: (+) fuchin 染成 pink
mycolic acid: 20~30(短) mycolic acid: 50~65(中) Mycolic acid: 70~90(長)
兼氧性 絕對需氧性 兼氧性/絕對需氧性
-- 胞內菌(cord factor) O2 胞內菌(cord factor) O2
DNA 的 G+C content 比例高(61~71mol%)
共同特性 細胞壁富含 lipid(60% weight) ∴gram stain 難染 Commented [u24]: 抗殺菌劑(disinfectant)、清潔劑、抗生
methylene blue 可見異染顆粒 素、染劑
PPD (Purified Protein Derivative)
(metachromatic granules)
LAM (Lipoarabinomannan )(似 Gram(-) LPS 的 O-Ag)
醣類發酵 Ferments乳酸
氣生菌絲(aerial hyphae) Bacilli/rods 有細絲
Lipid-free media
橘色 Strictlly pathogenic (avium 為 usually)
 some lipophilic
(有些需要 lipid 才會長) 非結核分枝桿菌 NTM (Runyon 分類)
β-溶血(weak) Commented [u23]: Colony 大而溶血 area 小
似 Listeria、Group B streptococcus (agalactiae)
non-Runyon Group non-Runyon Group Runyon Group III

Exotoxin (A-B toxin)S-S 胞內生長(Mψ 內複製) I. Photochromogens(照光變色) Commented [u25]: Exotoxin：毒素在感染位置產生，藉

>> A fragment→EF2 Slow-glowing II. Scotochromogens(不照光就變色) 由血液擴散，細菌本身不需進入血液
-cord factor
抑制蛋白質合成 >>抑制 phagosome 和 light tan color III. Slow-growing; non-pigmented
B fragment→幫助附著 溶體的結合 IV. fast; non-pigmented
virulence
(Fe2+、DTxR 會形成 repressor -superoxide dismutase (SOD)
抑制 toxin 合成) >> 中 和 吞 噬 細 胞 產 生 的
1.在 Mψ 內複製生長 1.在胞內生長(Leprae 為絕對胞內寄生)
(tox gene：lysogenic β-phage) H2O2
-cord factor -cord factor
Gravis、mitis致病 biotypes
2.fibrin 造成休眠 2.宿主對感染的反應造成症狀

1.呼吸型白喉 1.肺支氣管炎 Tubersulosis 1.Tuberculoid form of 1.由 M. avium &

-白色的偽膜 (Bronchopulmonary disease) 1.活化的 Mψ 聚集形成 leprosy M. intracellulare 組成
(pseudomembrane) 多核體 giant cell (少菌、神經腫大) Commented [u29]: 類結核 tuberculoid：
少菌 paucibacillary、有 lepromin(毒素)
-心肌炎(myocarditis) 2.淋巴皮膚性感染 2.慢性肺部感染 (no acid-fast rods)
-神經毒性(neurotocoxity) (lymphocutaneous) 2. Fibrin 包圍多核體 2.Lepromatous form of 癩瘤 lepromatous：
單一肺結節(solitary 多菌 multibacillary
diseases 足菌腫(mycetoma) >>巨大壞死性芽種 leprosy
pulmonary nodule) (numberous acid-fast rods)
肉芽腫(granuloma) (多菌、組織破壞) 注：pauci 代表 few Cf. olig(o)
2.皮膚型白喉 乾酪性芽種
蜂窩性組織炎(cellulitis) >>斑點、無知覺 Commented [u26]: TB 進入肺泡中被 Mψ吞噬，但
-丘疹(papule) 1 TB 感染
st
3.肺部舌葉、中葉浸 phagsome 與 lysosome 的結合被抑制，因此 TB 開始複製，
-潰瘍(nonhealing ulcer) 紅斑(erythema) 2nd TB 休眠爆炸 刺激 Mψ活化，使 Mψ聚集形成 langhans giant cell。在
潤、支氣管擴張
granuloma 中的 Mψ稱為 epitheloid
Disseminated 擴散
3.腦膿瘡(brain abscess) Commented [u27]: 如果 caseous granuloma 小於 3mm，則
4.無症狀 可以侵入肉芽腫，並消滅。若太大則進入休眠。

共生菌：皮膚&唯一 resorvoir 土壤 唯一 reservoir 吸入、皮膚接觸 吃(ingestion) Commented [u28]: 典型病徵：有痰、咳嗽、咳血

1.吸入(inhalation) 1.1/3 人帶原(落後國)

1.飛沫傳染 1.水、食物傳染(ubi.)
epidemiology 2.皮膚創傷 2.飛沫傳染(人人) 結核型：不太傳染
2.皮膚接觸分泌物 2.70%AIDS 病患死於
3.伺機性感染 3. 10%可能發病 癩瘤型：傳染性強
3.伺機性感染(opportunistic) 此菌
4.移植 (有潛伏期 latency)

1. Loeffler’s serum agar(蛋清) 1.Tuberculinskin test

1. 皮膚測試
2. cysteine/serum tellurite agar 1.顯微鏡觀察分支 (打 PPD) 1.顯微鏡！ Commented [u30]: 台灣因為小時候有打卡介苗(BCG;
-結核型：測毒素 bacillus calmette-Guerin) PPD 可能會呈現偽陽性
可觀察到異染顆粒 2.BCYE agar(橘紅菌落) 2. QuantiFERON-TB 2.組織培養
2. 顯微鏡
diagnosis 3. Elek test(檢測外毒素) 3.表面有菌絲 test：測 INFγ
-癩瘤型：測菌量
4. Shick test 3. 顯微鏡：acid-fast Commented [u31]: hot(Ziehl-Neelsen)、cold(Kinyoun)、螢
3.無法人工 culture 光 acid-fast
5. PCR 4. culture LJ plate
6.Pharyngeal specimen[選分] 5. 胸部 X 光 (絕對胞內寄生) Commented [u32]: 有加 egg，需 3~4 週
還有 broth-based media(10~12 天)

餵藥 DOTS
1.rifampicin, dapsone 1.clarithromycin
(反覆治療易抗藥性)
三合一疫苗 DPT vaccine 2.結核型療程 6 月， 2. azithromycin
antibiotic 治療期長 6 weeks(像真菌) 合併治療法
盡快清除毒素 痲瘋型療程 12 月 3. rifabutin
Isoniazid(INH) Commented [u33]: 還有 ethambutol, pyrazinamide,
rifampin
多重抗藥性

※其他 Corynebacterium：C. urealyticum(溶尿)有 Urease，會造成腎結石(renal stone)和 C.jeikeium(傑氏)都需要 lipid 才會長得好，前兩者與 C.

amycolatum(無枝菌酸)都有很強的抗藥性。
 菌屬
─ Aerobic Gram(-), Rods
Enterobacteriaceae
列舉菌種 Escherichia coli Salmonella enterica Shigella Yersinia Klebsiella
Catalase(+) 耐 bile salt
發酵：glucose(+)(全)、lactose(+)(E. coli、Klebsiella，產酸) Commented [u35]: 可以用 lactose 發酵的會產生 acid。
Oxidase(-) 還原 Nitrate 不能用 lactose 發酵的就改用 pectone，會產生 ammonia。
LPS (lipopolysaccharide) =core polysaccharide + O antigen
Capsule(+) 胞內菌 Commented [u34]: 沒有 cytochrome oxidase 所以只能發
(core polysaccharide 為腸桿菌共同抗原 enterobacterial common Ag)
兼氧性 Bipolar staining 酵
共同特性
H antigen：from Flagella，熱不安定 (E. coli、salmonella 有)
細胞壁抗原：
K antigen：from Capsule，熱不安定(type-specific)
(由外而內)
O antigen：from LPS，熱安定，作為細菌分類的依據（加熱破壞 H、K）

區分 Lactose(+)、motile 還原 H2S、motile Lactose(+) Citrate(+)

CNS、GI tract、下呼吸道、泌尿
分布 GI tract 不存在 CNS、GI tract
道、blood

5. Type III secretion system(TTSS)：

1. endotoxin (lipid A)：LPS 釋放
穿孔蛋白將致病因子注入宿主細胞→胞內生長複製(細胞內毒素)
2.抗原變異(基因重組)：K, H antigen
6. 搶奪生長因子(Fe2+)：
3. resistant to serum killing：capsule
(1)結合力強：enterobaction、aerobactin
4.抗藥性
(2)破壞血紅素：hemolysin

1. Adhesins： 1.侵入 M cell(小腸) 1. 侵入 Peyer’s patch 1.在 Mψ 內生長 1.在 Mψ 內生長

pili、CFA、AAF >>囊(食)泡中複製 M cell(colon 大腸) 2.Fraction 1(F1) gene
Virulence
2. Exotoxin： 2.在 Mψ 內生長 >>在細胞質中複製 >> Capsule
STa, STb 熱穩定 3.PAI-1 >> Ssps 毒素 2. Endotoxin 3.Pla protease gene
TTSS >> IpaA~D >>破壞補體
LT-I, LT-II 熱不穩定 PAI-2 >>逃過免疫
(藉此進入胞內) 抑制調理作用
(似霍亂毒素 cholera toxin) 皆用 TTSS
(cytotoxicity) 3.Exotoxin: 破壞 fibrin clot
Stx-1, Stx-2(shiga toxin)
Hemolysin Hly A >>Shiga toxin TTSS：抵抗吞噬
4.cell-to-cell passage
(改變 actin 排列)
1. 腸胃炎(gastroenteritis) 1.無症狀 1.腸胃炎 / 痢疾 1. Y. pestis 1.K. pneumonia >>肺炎 Commented [u36]:
1.ETEC：
(1)腸毒性(ETEC)：STa、LT-1 >> S. typhi (Shigellosis) 鼠疫(plaque) K. oxytoca 糞口、腹瀉、Traveler
(2)腸病原性(EPEC)：人人 S. paratyphi >>watery diarrhea >>腺鼠疫 bubonic >>大葉性肺炎 2.EPEC：
2.腸熱病 Enteric fever Bacterial dysentery 嬰兒、water diarrhea
(3)腸聚集性(EAEC)：biofilm 肺鼠 pulmonary (肺泡間壞死、痰血) attachment/ effacement 附著/抹殺組織病理
>> typhoid fever 2.tenesmus 裡急後重 2. K. granulomatis [A/E]histopathology;
(4)腸出血性(EHEC) >>大腸
破壞 microvilli
paratyphoid fever 持續便意 2. Y. enterocolitica >>腹股溝芽腫
-出血性腸炎 HC(<100 致病) bundle forming pili (BFP)：幫助黏附
3.敗血症 3. HC、HUS (1)腸胃炎 (granuloma inguinale) locus of enterocyte (LEE)：幫助黏附 effacement(一種
(Hemorrhagic colitis)
4.腸胃炎 PAI)、TTSS
-溶血性尿毒症候群, HUS (2)假性盲腸炎 = 杜諾凡氏症
Translocated intimin receptor(Tir)： 插到別人身上，外來
(abdominal cramps) (Donovanosis) 的 receptor
-血清型 O157:H7 人人
Diseases (梅毒螺旋體也會造成) 3.EAEC：
- Stx-2(acquired S. dysenteriae) travler’s diarrhea、嬰兒
(5)腸侵入性(EIEC) >>colon 生長遲緩
重要： 重要： 重要： ※單核吞噬細胞質內有 Aggregative adherence fimbriae I(AAFI)：黏附用
2. 腸道外感染(extraintestinal) adhesion-->mucus secrection-->form thick biofilm
S. typhi S. dysenteriae Y. pestis Donovan bodies 4.EHEC
(1)敗血症(Sepsis)/菌血症 45% 5.EIEC：(colonic epithelium)
S. paratyphi (Giemsa：立克次體也
(2)UTIs (1) dysenteric form(痢疾)
此二者為 highly infectious Wright’s stain (2)入侵方式和 listeria 相同
(3)新生兒腦膜炎 (需要菌量最少)
Strict human pathogen (3) phenotypic, pathogenic 像 shigella
-E.coli / Group B streptococci
-K1 capsular antigen O Serotype 2500 Commented [u39]: 腸熱病：
藉由被巨噬細胞吃掉，移動到體內其他處
Commented [u37]: 溶血性尿毒症候群：
共生菌：腸道 人傳人 人傳人 人畜共通！ Hemolytic uremic syndrome(HUS)
1. PAIs(pathogenicity islands) 1. 人類唯一 1. 人類唯一 1.人與人空氣傳染！ 與 Stx-2 有關，損害 glomerular endothelial cellsRenal
failure
2. 伺機性傳染 (endogenous) 2. 糞口傳染 2. 糞口傳染！ 2.跳蚤叮咬(血傳)！
Commented [u38]:
Epidemiology 3. 食物傳染 (exogenously) 3. 食物傳染(蛋奶類) 3. 食物污染 3.食物、血液傳染 UTI：需 adhesin(不被水沖走)、HlyA
可發展為膀胱炎(cystitis)、急性腎盂腎炎(pyelonephritis)、
4. 社區院內感染 UTIs 的主因 Cold enrichment culture： 前列腺炎(prostatitis)
4oC Commented [u40]:
PAIs：能夠 acquire 致病力
含 lactose 的培養基： bacteriophage DNA
plasmid
1. EMB (Eosin Methylene Blue) agar：bile salt(-)、Methylene blue 抑制 Gram(+)，lactose 發酵後為粉紅~黑色(E. coli 墨綠色)
Commented [u41]:
Diagnosis 2. MacConkey agar：bile salt(+)抑制 Gram(+)，可分辨能不能用 lactose 發酵(+)為粉紅 (E. coli、K. pneumonia)，(-)黃、白 exogenously：strains causing gastroenteritis
(+區分) 3. Hektoen Enteric agar：maltose 發酵、產生 H2S (區分 Salmonella 黑色有 H2S、Shigella 綠色) 食物、水汙染：fecally contaminated
(feces-->fecal、faeces)
4. Citrate：E.coli (-) /Klebsiela (+) EHEC：菠菜、沒煮熟的食物
Commented [u42]:
streptomycin tetracycline UTIs：Uniary tract infections
antibiotic Antimicrobial resistance 不建議用抗生素，需先測試抗藥性(in vitro) 證明 E. Coli 為 pathogen，還有 80%敗血症驗出含 Gram(-)
rods、為主要發生 gastroenteritis 原因(developing country)
 菌屬
─ Vibrio
Aerobic Gram(-), Rods
Campylobacter Helicobacter Pseudomonas Haemophilus
V. parahaemolyticus P. aeruginosa
列舉菌種 V. cholera C. jejuni H. pylori (幽門) H. influenzea
V. vulnificus (綠膿)
彎曲狀 motile motile non-motile
1. oxidase(+) 5. Fermentative 1. oxidase(+) 1. oxidase(+)
1. DNA 的 G+C 比例較低
2. polar flagella(1 條) 6.嗜鹽性(halophilic) 2.無法 ferment 2.兼氧性
2.螺旋狀桿菌(S-shaped)
共同特性 3.兼氧性 7.不耐胃酸、乾燥 3.絕對需氧 3.fermetative
3.無法 ferment、oxidize carbohydrate
4.活在水中 8.耐鹼(pH6.5~9) / anaerobic 4.生長需要 Commented [u43]: Gram positive 皆不耐鹼
4.微好氧 (microaerophilic) (5~7%)
(1 、 2 是 和 enterobacteriaceae 差 別 ) 4. capsule(+) X-factor(hemin) Commented [u44]: 絕對好氧；無氧情況下，以 nitrite、
5.稍高濃度的 CO2 (5~10%) 5.4~42℃ arginine 作為替代 electron receptor
gastrointestinal disease V-factor(NAD)
前者 capsule(-) 非常小(0.2~0.5μm)
區分 capsule(-) catalase(+) β-hemolity Catalase(+)
後者 capsule(+) 和 Bordetella 一樣小
LPS (endotoxin)
1.霍亂毒素 V. parahaemolyticus 1.C. jejuni： 1.胃中製造大量 1. Adhesins 1. H. influenzea type B
(cholera toxin) 1. TDH/ kanagawa Hippurate hydrolase urease - capsule (HIB): Commented [u47]: 在 cystic fibrosis patient 病人上長
Thermostable - flagella -PRP mucoid capsule
- A-B toxin >> Hippurate(+) >>水解 urea
direct hemolysin - pilus (polyribitol phosphate) Commented [u49]: 一代疫苗：polysaccharide，保護 18
-A subunit： 產生 NH3 個月大以上的小孩
產生大量 cAMP， 溶血素 in capsulefor vaccine 二代疫苗：PRP，可保護 2 個月大以上的小孩
中和胃酸
>>溶人血， 2. exotoxin A -pilus
使人體腹瀉脫水
exotoxin S Commented [u46]: Streptococcus agalactae 、listeria
-B subunit： 不溶羊血 2.熱休克蛋白 monocytogenes 也是 hippurate hydrolysis (+)
2.無莢膜品系(現病多由
附著腸壁上的 (HspB) 3.色素 Commented [u48]: exotoxin A(ETA)：類似 C. diphtheriae
Virulence V. vulnificus：不明 此) 的 diphtheria toxin
ganglioside GM1 -pyocyanin 藍 (抑制 EF2、蛋白質合成)
receptor 3.Acid-inhibitory exoenzyme S、T：cytotoxicity toxin ADP-ribosyltransferase
-pyoverdin 黃綠
-血清型 O1、O139 protein
-CTXϕ 噬菌體獲得
4.catalase、 4.elastase
2.線毛 pili >> Commented [u45]: Toxin co-regulated pili 來自 tcp gene
(LasA/LasB)
superoxide complex
黏附腸壁、噬菌體 5. TTSS Chemotaxis proteins 來自 cep genes
mutase
6. phospholipid C
熱不穩定
7. Biofilm
1.霍亂(Cholera) 1.急性腸炎 1.胃炎(gastritis) 1.肺部感染 1.腦膜炎
>>watery diarrhea V. parahaemolyticus (self-limited) 2.消化性潰瘍 -囊腫纖維化 2.epiglottitis
(rice-water stool) 1.水狀腹瀉 2.腹瀉 -胃潰瘍 -慢性肉芽腫 會厭炎 Commented [u51]: 消化性潰瘍 Peptic ulcer、胃潰瘍
大量失水 2.腸胃炎 3.C. fetus -十二指腸潰瘍 -壞死性支氣管 3.肺炎 gastric ulcer

低血鉀 造成全身性疾病、 (duodenal ulcer) 肺炎

低血性休克 血管感染 Necrotizing
Diseases 腎衰竭 renal V. vulnificus (ex.敗血症、感染性 3.胃腺癌 H. ducreyi
bronchopenumonia
2.腸胃炎 1.原發性敗血症 血栓性靜脈炎) 4.MALT B-cell 2.皮膚軟組織感染 >>性行為傳染 Commented [u50]: Septicemia、Septic thrombophlebitis、
(高死亡率) 4.併發 淋巴瘤 >>燒傷、傷口 少見 endocarditis、meningoencephalitis、gastroenteritis

尤其肝病病人 Guillain-Barré (lymphomas) -壞疽性膿瘡 Commented [u52]:

Bacteremia ：為 systemic 擴散性感染，典型特徵為皮膚壞
2.腹瀉 syndrome 3.毛囊炎 死的壞疽性膿瘡 ecthyma gangrenosum
3.傷口感染 >>自體免疫疾病 (folliculitis)
>>大水皰 抗體→神經細胞 4.endocarditis Commented [u53]: 少見，intravenous-drug
abusers
1.食物、飲水傳染 1.傷口接觸 人畜共通 人為主要宿主 ubiquitous 共生菌
2.沒 salt 可生長 2.吃海水、甲殼類 1.食物、飲水傳染 1.人傳染人 1.伺機性感染 1.小兒科
Epidemiology 3.人傳人少 2.人傳染人少 2.糞口傳染 2.內源性感染
(高菌量：胃酸)

1.顯微鏡(創傷弧菌傷口檢體) 1.顯微鏡：糞便 1.顯微鏡 / 胃鏡 1.綠色菌落(BAP) 1.顯微鏡

2.以 Cary-Blair transport medium 來運送 >>S-shape 2.Urea breath (Pairs resemble a (CSF、下呼吸道)
(Not with glycerol-salin) 2.抗原檢測 test(UBT) single cell) 2.chocolate agar Commented [u55]: Francisella、Nocardia、Haemophilus
Diagnosis 3.selective agar: TCBS 3. CB transport 3.抗原檢測！ 2. β-溶血 3.菌落長在 S. aureus 周圍 都用 chocolate agar

(+區分) Commented [u54]: Not 20% glucose solution

Thiosulfate citrate Bile salt Sucrose agar 4.selective agar 4.糞便採樣 3. oxidase test(+) Satellite 現象
Campy-BAP、Preston TMPD/DMPD
plate、skirrow agar 4.MacConkey
agar(不發酵)

Combined β-lactamase 可以使用

Antibiotic 可以使用;支持療法
therapy！ Porin protein 突變 HIB vaccine Commented [u56]: Macrolide、β-lactam
For 2 weeks
※霍亂弧菌、白喉桿菌都從 bacteriophage 獲得毒素基因(A-B toxin)。
※Aeromonnas 和 Vibrio 菌屬的特徵、病狀相似
形態
─ Aerobic Gram(-)
Miscellaneous 雜菌
菌屬 Bordetella Brucella Francisella Legionella
菌種 B. pertussis(百日咳) B. melitensis F. tularensis L. pneumophila
共同特性
Catalase (+) non-motile
non-fermentative
絕對需氧
兼性胞內菌(intracellular pathogen)(例外 B.pertussis)
很小隻 O2
區分 capsule(+) capsule(-) capsule(+)
oxidase(+) oxidase(+) oxidase(-) oxidase(+)
氧化胺基酸 >>能量來源 catalase(+) 需要 cysteine 需要 L-cysteine、鐵鹽
非常小(0.2~0.5×1μm) 略小(0.5 × 0.6 to 1.5 μm) 小(0.2 × 0.2 to 0.7 μm) 氧化胺基酸>>能量來源
培養需碳、澱粉、血液、球蛋白 顯微鏡難觀察 細長~20μm
吸收毒素 有些需要 CO2
Vulence 1. Adhesins： 1. Smooth colonies L. pneumophila
-Pertactin >>有 LPS 的 O 抗原 serotype 1、6
-Filamentous hemagglutinin >致病力較強 造成 90%以上的感染
>>RGD motif
>呼吸道纖毛：sulfated integrins 2. Rough colonies
>巨噬細胞：CR3 >>沒有 LPS 的 O 抗原
2. Pertussis toxin： >致病力較弱
- A-B toxin (不會打洞)
- S1：抑制 Gi protein 3.Catalase、
>> cAMP↑，分泌物↑ superoxide dismutase (SOD)
>發作期 >>抵抗 phagosome
- S2：附著呼吸道纖毛 >中和 H2O2
- S3：附著巨噬細胞

Disease Pertussis Brecellosis Tularensis 兔熱病 1. Legionnaires’ disease

1.潛伏期 Incubation (7~8 天) 1.潛伏期 -type A, B 為主 >>肺炎、高死亡率
2.黏膜期 catarrhal stage (1~2Week) 2.初期非專一性症狀 1.肺炎性兔熱病 (最嚴重) 2. Pontiac fever
3.發作期 paroxysmal stage (肌、關節痛、乾咳、疲勞等) (pneumonic tularensis) >>無肺炎、self-limited
>>嚴重咳嗽 (2~4week) >>波浪熱(undulant fever) -肺炎
4.恢復期 convalescence stage >間歇週期性發燒 -敗血症
>>治療不當會有併發症 3. Advanced disease >>生化武器
(3~4week) (腸胃道、呼吸道、骨頭、關節) 2.根據感染路徑
4. chronic infection -oculoglandular(結膜炎)
>>生化武器 -ulceroglandular
(易傳播、高致死) -typhoidal
-pneumonic
-oropharyngeal
>>淋巴腫大
epidemology 唯一儲存宿主(reservoir host) (↑動物)人畜共通(動物、節肢↑) 存於水中
1.人與人傳染 1.接觸吸入傳染(生武) 1.接觸、吸入 1.空調系統-生鏽水塔
2.飛沫傳染 2.食物傳染 2.食物傳染 -加氯消毒
-copper-silver ionization
2. sporadic、epidemic、
nosocomial(醫院的)
診斷 -採樣： 1. culture 1.含 cysteine 培養基 1. BCYE agar
1.採鼻咽，非口咽 2.抗體增加 -chocolate agar >>含 L-cysteine, iron
2.使用 Calcium alginate >>初期 IgM， -BCYE agar 2. 偵測抗原：
Dacron fiber 後期 IgG, IgA >>對 serotype 1 敏感
>>不可使用棉花棒 3.Serum agglutination test (SAT) 2. Serology(確診) 3. PCR
3.接種到 Regan-Lowe agar (antigen：B.abortus 除了 B. canis -同 Brucella
-偵測抗體 IgA, M, G (ELISA) 都可以偵測到cross talk) -易和↑混淆
-single titer ≥ 1:160
-PCR
-fourfold in titer
antibiotic 支持性療法 doxycycline+ rifampin penicillin 抗 Newer macrolides
Fluoroquinolones

※ titer 可維持數年，影響染病時間的判讀 A Raymond Lin Production 2013 (first edi. By Haruko)

 菌屬
列舉菌種
+ C. perfringens
Anaerobic Gram(+) Rods, Spore-Forming

C. tetani
Clostridium
C. botulinum C. difficile
non-motile Motile
1.形成內孢子(endospore)：Bacillus, Clostridium

O2 2.絕對厭氧
3.無法將 sulfate (SO42-)還原成 sulfite (SO32-) Spore
Double zone hemolysis 難以培養 Botulinum toxin
共同特性
- θ-toxin：完全溶血 -Type A~G(七類)
- α-toxin：partial 溶血 -感染人類 Type A, B, E, F
Type A~E：
感染人類主要 Type A 依分泌毒素 Group I~IV：
易脫染部分 Gram(-) -造成人類疾病 Group I, II
複製快速 -不耐熱
Lethal toxin 1.Tentanolysin： 1. Botulinum toxin 1.黏附因子 SLPs
1. α-toxin： 熱穩定、對氧敏感 - A-B toxin (Surface-layer proteins)
- 即 lecithinase(phospholipase C) >>實際作用不明 -抑制乙烯膽鹼(Ach)釋放 -黏附腸上皮細胞
- partially hemolytic >>鬆弛性麻痺 2.外毒素：
- Type A 製造最多 2.Tetanospasmin： (Flaccid paralysis) - enterotoxin, toxin A
2. β-toxin： 熱不穩定 吸引
-壞死性腸炎 - A-B toxin neutrophilecytokines
3. ε, ι –toxin： >>肌肉舒張神經傳導物質不能釋放 >>腹瀉
Virulence - cytotoxin, toxin B
- lethal toxin (ε 由 trypin 活化) (GABA、glycine)
-增加血管通透性 >>痙攣性麻痹 >>破壞 actin filament
-引發壞死活性 (spastic paralysis) 3.強抗藥性
4. μ-toxin： 4.mutation strain
>>binary toxin
-溶解 ECM，幫助擴散

Enterotoxin
1.熱不穩定
2.造成 diarrhea

Type A：(α-toxin、enterotoxin) Tetanus 破傷風 Botulism(肉毒中毒)： 1. Antibiotic-associated

1. Soft-tissue infection 1.全身性 1. Food diarrhea 腹瀉
-蜂窩性組織炎 (a) 肌肉痙攣 -視線模糊(瞳孔擴張) 2.偽膜性結腸炎
-化膿性肌炎 -牙關緊閉(masseter muscles 收縮) -周邊兩側肌肉無力下降 (pseudomembraneous colitis)
-肌肉壞死 (Myonecrosis) -痙笑 (rusus sardonicus) 2. Infant：蜂蜜 -壞死黏膜細胞
2.原發性敗血症 -角弓反張 (opisthotonos) >>呼吸停止 -形成 whitish plaues
Diseases 3.食物中毒 (b) 影響自主神經系統 >1 歲↓嬰兒不能吃蜂蜜 -白色偽膜
-心律不整；血壓不規律 3. Wound (pseudomembranes)
Type B~E，其中 4. Inhalation：致死率高 -腹瀉、胃痙攣
-脫水、嚴重流汗
Type C (β-toxin)： >>生化武器
1.壞死性腸炎(腸穿孔、腹膜炎) 2.局部性-部分肌肉痙攣
(Necrotizing enteritis) 3.新生兒破傷風(剪斷臍帶時感染)
-致死率高

Ubiquitous：土壤(以孢子形式)、水 共生菌：小腸
Type A： 1.不會引起免疫反應 1.食物感染—自製罐頭 1.內源性感染(endogenous)
-存在土壤、水 2.保存於酸性環境中 -使用抗生素，減少競爭
epidemiology
Type B~E： 較不易產生孢子 2.外源性感染(exogenous)
-不存在土壤 -孢子傳染(院內)
-存在腸胃道
Nagler’s reaction 1.臨床症狀直接診斷 1.毒素鑑定 1.檢測糞便中毒素
>> C. perfringens 的特殊測驗 2.難以培養 2.血清糞便採樣 (enterotoxin、cytotoxin)
diagnosis >egg yolk agar 一半塗 α-toxin Ab
分解蛋黃/ 有 Ab 則不分解
opaqueprecipitate/ 透明

外科清創手術 botulinum antitoxin(抗 ABE)

Vancomycin
Metronidazole metronidazole/penicillin
antibiotic Metronidazole
☺不適用 penicillin 呼吸支持(ventilator support)
重複感染不用換藥
三合一疫苗 胃灌洗(gastric lavage)
 菌屬 + Actinomyces(放線)
Anaerobic、Gram(+)、Rods
Mobiluncus(動曲) Lactobacillus Propionibacterium
─ Anaerobic、Gram(-)

Bacteroid Prevotella
1.Fastidious 1.部分耐氧 1.部分耐氧 1. Adhesins
1.部分兼性厭氧
(生長緩慢) (Aerotolerant) 2.non-motile -capsule
2. Fastidious(生長緩慢)
2.易脫染 2.不具黏附力 3.catalase(+) -fimbriae
3.白色球形、沙粒菌落 2. 抗氧毒性：catalase、SOD
部分 Gram(-) 3.Ferment: 4.Ferment
共同特性/ (sulfur granule=
產醇、酸類 propionic acid 3. 抗吞噬：capsule、succinic acid
virulence hyphae+calcium phosphate) 5.Hyphae 4. B. fragilis toxin(BFT)
factors 4.菌落像臼齒 氣絲≒黴菌 (對高溫敏感、Zn metalloprotease)
5. Hyphae 氣絲≒黴菌

絕對厭氧
O2 B. fragilis P. melaninogenica

1.長期慢性疾病 Bacterial vaginosis 1.暫時性菌血症 1.Acne 青春痘 1.呼吸道感染

2.Actinomycosis 細菌性陰道炎 (transient) 2.伺機性感染 2.腦膿瘡
Granulomata (主要) 2.Endocarditis -foreign body 3.胃腸炎
suppurative 3.伺機性敗血症 4.腹腔內感染
abscess
5.婦科感染
(以廔管 sinus tract 相連)
Diseases 6.皮膚、軟組織
3.分部：
7.菌血症
顏面、頸部(Cervicofacial)
軀幹：胸、腹、骨盆
(Thoracic、Abdominal、Pelvic)
中樞神經(CNS)

Endogenous/ Opportunistic pathogens

共生菌：口腔、腸胃道、泌尿生殖道
Epidemiology
上呼吸道(only endogenous) 只在女性陰道喔! 上呼吸道

培養：BBE agar
Bacteroides Bile-esculin
-水解 esculin
Diagnosis unmentioned 菌落含黑色素
黑色沉澱
-bile salt 促進生長
抑制 Gram(+)

1.清創手術 1.抗 colistin 1.Penicillin+ ∵細菌感染 1.手術介入

(surgical debridement) Aminoglycoside 深層皮脂腺發炎 2.抗 penicillin&cephalosporins
—將感染部位切除 2.抗 vancomycin 洗臉沒用 抗 gentamicin
Treatment 2.Penicillin, clindamycin (通常萬古黴素對 用 benzoyl 可用 metronidazole
3.抗 metronidazole Gram+有效) peroxide Carbapenems
治療困難 Β-Lactamase
inhibitor

※Bifidobacterium(雙岐桿菌)、Eubacterium(真桿菌) ※Fusobacterium：
同樣是 Anaerobic, Gram(+), Rods, Spore(-)，但極少致病，常在以下地方找到： 紡錘狀，牙周致病菌
1. Oropharynx 口咽 2. Large intestine 大腸 3. Vagina 陰道 Anaerobic、Gram(-)：
※Mobiluncus 歸類為 Gram(+)的原因： Cocci：viellonella
Others
1. cell wall structure 同 gram+ Rods：Bacteroides
2. 沒有 LPS Fusobacterium
3. 對抑制細胞壁的抗生素敏感(vacomycin、clidamycin、erythromycin、ampicillin) Porphyromonas(紫單胞)
※Peptostreptococccus 是唯一一隻 Anerobic, Gram(+), Cocci，要記得！ Prevotella

※有菌絲(hyphae)的細菌：
Actinomyces、Propionibacterium、Nocardia、Mycobacterium
1.利用 acid-fast stain(-)
區分 Actinomyces 與 Nocardia、Mycobacterium

※易脫染導致部分 Gram(-)的細菌：
C. perfringens E. rhusiopathiae、Mobiluncus
 菌屬
─ Treponema 密螺旋體屬
Spirochetes Gram(-)
Borrelia(包氏) Leptospira(勾端)
列舉菌種 T. pallidum(梅毒) T. carateum(斑點病) B. burgdorferi

長很慢，很小、不能用 LM 觀察用暗視野顯微鏡(dark-field)、免疫螢光法(direct fluorescent antibody;DFA)、銀染法。

共同特性 1.厭氧、微好氧(sensitive to O2) 1.Motile：twist flagella 1.側邊兩條線毛

2.寄生(不能在 cell-free 環境生長)無法培養 2. Microaerobic(fastidious) 2.兩端各有一個鉤子
3.生長慢(30hrs/generation) 3.生長緩慢 3.生長緩慢

1.貼附在 fibronectin 上
Virulence factors 2.lipoprotein 接在細胞膜上(非在細胞壁上，無 Ag)
3. hemolysin、hyaluronidase
1.Venereal syphilis(全世界) 1. Lyme disease(萊姆病)，三期：
2.Endemic syphilis(地域性) 1.大多和緩、如感冒般發燒、肌肉
1st ：移行性慢性紅斑(ECM)
3.Yaws(雅司病)：granuloma 痠痛
(Erythema migrans)
(無痛感) Pinta(品他病;地域性) 2nd ：神經/心臟/關節 2.Weil syndrome：
組織傷害主要由宿主免疫反 3rd：慢性關節炎、腦病變 Thrombocytopenia(血小板減少)、
應造成 2.epidemic relapsing fever
vascular collapse、出血、肝腎功
Diseases (流行性回歸熱)
能低
梅毒的階段性(syphilis)：三期(3W-3M-3〜30Y) -熱週期一次
-波浪熱 3.aseptic meningitits(無菌腦膜炎)
1st (局部)：硬性下疳(hard chancre)(無痛感）、潰瘍(自癒)
2nd (全身)：硬性下疳擴散、黏膜皮膚紅疹、高度感染性 3.endemic relapsing fever glomerulonephritis(腎小球腎炎)
(地方性回歸熱) immune complex 引起
3rd (器官擴散)：慢性發炎、擴散各器官(神經、心血管)、
-熱週期可達十次(初次最嚴重)
肉芽腫病變(granulomatous lesions 即 gummas)
-週期性、非週期性

1.主要宿主：Rodents
Hard tickLyme disease 2.人畜共通(職業相關)
1. 人類為唯一宿主 2. 黏膜接觸傳染(不耐乾)
Epidemiology Louseepidemic relapsing fever 3.擦傷(small cut or abrasions)
3. 性行為、母子垂直傳染(Venereal syphilis)
Soft tickendemic relapsing fever 穿透黏膜層
4.水源汙染(動物尿液)

1.顯微鏡：anilaine 染色 1.顯微鏡：難檢測到細菌(量少)
2.PCR 2.Blood、CSF 培養 7~10 天
1st、2nd：dark-field、DFA 顯微鏡觀察
3.發熱時期才可在 3.urine 感染後一週
Diagnosis 2nd、3rd：serotype
血液中觀察到 Borrelia 4.MAT：精確少用
非專一性：VDRL，RPR 專一性：FTA-ABS、TP-PA
4.(Lyme)急性(acute)、恢復 (microscopic agglutination test)
(convalescent)間，血清中 IgM, IgG↑ 5.ELISA：較不準，常用
1.Tetracycline
Lyme：Amoxicillin、cefuroxime
1.Penicillin，Doxycycline
Treatment Penicillin、無疫苗 Relapsing：erythromycin
2.對家畜接種疫苗
2.避免昆蟲接觸
3.有疫苗：ImuLyme，LYMErix
 菌屬 Mycoplasma 黴漿菌 L-form bacteria Chlamydia Chlamydophila(類披衣菌)
列舉菌種 M. pneumoniae (肺炎) -- C. trachomatis(砂眼) C. pneumoniae C. psittaci

1. 絕對胞內寄生
1.能活體外生長(free-living)的 1.細菌生活史某個階段會
2. 像 G(-)，但沒有肽聚醣層，和胞壁酸(muramic acid)
最小細菌(比一些病毒小) 失去細胞壁，此時期稱為 3. Elementary bodies(EBs)：metabolism(-)、infectious form(不可複製)
2.沒有細胞壁 cell wall deficient(CWD)
Reticulate bodies(RBs)：metabolism(+)、noninfectious form(可複製)
3.細胞膜有 sterol(固醇類) 2.適當環境下可長出來
4. EBs：spore-like、環境耐受度高(雖然沒有 peptidoglycan layer)
4.長很慢(1~16hr/generation) 3.pleomorphic(多形性)
RBs：脆弱，但躲在細胞內，所以很安全
5.兼性厭氧 4.size 0.01μm顯微鏡
共同特徵 Inclusion bodies：EB 與 RB 同時出現、多個聚集在一起
(M. pneumoniae 絕對好氧) 5.群聚為球狀
5. 生活週期：
6.菌落圓形中間突起(fried egg) (coccoid bodies) 原質小體(element body)被吞入柱狀上皮細胞阻止溶酶體融
例外：M. pneumonia 6.在外界，可長成 thin、
合、變成 RBs 進行 binary fission 一些變回 EBs感染更多細胞
homogeneous granular biofilm filaments
6. Cell wall：LPS+major outer membrane protein(MOMP)[serovars]
colonies
高度保留的 MOMP：OMP2
7. strict human pathogen
18 serological variants 相似的 MOMP Homogeneous

1.Respiratory epithelium 1. Plasmid DNA

(extracellular pathogen) 2. 感染無纖毛的柱狀、
由於多形性，可以躲到
Virulence factors P1 adhesion protein 黏 cilia 立方、移形表皮細胞 • 1.Plasmid DNA
immune cell 內
2.M.pneumoniae 為 superantigen 3. 主要感染眼睛和生殖器
誘發強烈免疫反應、發炎 官

1. Trachoma：慢性、
-濾泡性結膜炎失明 1.Atypical pneumonia
-Adult inclusion
conjunctivitis(包涵性)
2. Neonatal conjunctivitis
1.輕微的上呼吸道感染 3. Infant pneumonia
2.Tracheobronchitis(支氣管炎) -斷音咳嗽(staccato cough)
3.Atypical pneumonia 4. Urogenital infections 2.引起嚴重的支
patchy bronchopneumonia >>mucopurulent discharge 氣管肺炎
Diseases
(X 光片很嚴重、但病人無感) -子宮頸炎、子宮內膜炎
3.感染超過 130 種
溫和、self-limited，病人不會覺 -尿道炎、輸軟管炎
鳥類，人類吸入帶
得自己生了大病，故稱為 5. 花柳性淋巴肉芽腫 2. Atherosclerosis
有披衣菌的羽毛
walking pneumonia (lymphogranuloma
或乾掉鳥糞上的
venereum;LGV)：
粉末而感染。
-可在單核球中複製
非典型肺炎
-無痛 ulcer(自己會好)
6. 貧窮國家多為 LGV
而非淋病尿道炎(NGU)

鳥類為主
Epidemiology 以人類為主
人為意外宿主

1. Fluorescent-stained EB
1. Molecule 分析DNA probe 2.抗原偵測：
2. Serology MOMP、LPS •
1.在同一種疾病中，可同
3. complement fixation titers Iodine-staining glycogen in
Diagnosis 時發現數種 L-from 的細
持續 4 週 to 6~12 月 inclusions
菌存在
誤判感染時間
4. Cold aggulutinins(冷凝集素) Inculosion bodies：
長的一樣、多顆/cell 形狀不一、多顆/cell
圓的、一顆/cell

∵無 cell wall
攻擊 cell wall antibiotic 失效 對 Sulfonamides(磺胺類藥 Doxycycline
Treatment
Erythromycin、Tetracycline 物)敏感 Erythromycin
(干擾蛋白質合成)

1. 分為 bacterial 的原因：
(1)binary fission Bacteria w/ cell wall
N-form (wild type)
(2)在人工 cell-free media 可長
備註 Bacteria w/o cell wall
(3)同時有 DNA、RNA
L-form
2. M.hominis 抗 erythromycin
 菌屬
─ 立克次體科 Rickettsia Gram(-)

Rickettsia/ Orientia

Spotted fever group(斑點熱群) Typhus group (斑疹傷寒群)

菌種 R. rickettsii (立克) R. akari(紅蟲) O. tsutsugamushi(恙蟲) R. typhi R. prowazekii

3.有自己的：carbonhydrate metabolism、lipid、nucleic acid、

1. 超小、絕對胞內寄生(逃避 host immune)
共同特徵 amino acid synthesis (R.Prowazekii 用宿主的)
2. Giemsa stain (Gram -弱)
4.Energy parasite：偷 ATP(儘管 bacterial 可以自己生產)僅限 R.Prowazekii

黏到宿主細胞上phagocytosis用 phospholipidase 在 phagosome membrane 上挖洞跑到 cytoplasm複製 binary fusionrelease

Virulence Spotted fever group Typhus group

Factors
在 cytoplasm、nuclear 長大continually release
在 cytoplasm 中持續累積到 lyse cellrelease
(intracellular motility; 影響 actin 排列)

Rocky mountain spot fever Rickettsialpox Scrub typhus 1.Endemic typhus Epidemic typhus
(洛磯山紅斑點熱) (立克次體痘疹) (叢林斑疹傷寒) 2.murine typhus(鼠類) (louse-borne typhus)

1.Vasculitis(血管炎) 1. Epidemic typhus(嚴重)

Disease -藉 OmpA 黏附 endothelium 2. Recrudescent(復發型)
-在 endothelium 內複製 Brill-Zinsser disease
2.Hypovolemia(血液量減少) (初感染沒事多年後發病)
3.Hypoproteinemia(低蛋白) 3.Sporadic typhus
4. Organ failure (松鼠fleas人)

1.腹痛、噁心、嘔吐、chill 1st：papuleulcer
2.macular rash(90%)  Eschar(焦痂)
3.在 tick 體內活化才會感染 咳嗽 1. Arthralgias(關節痛)
2 ：發燒、頭痛…
nd
2. Chill
-叮人活化(≥6hrs)叮人 photophobia(畏光)
symptom (中標) papulovesciular rash

共同症狀：
1. abrupt onset(突然發作) (例外：endemic typhus 慢慢發作)
2. 嚴重頭痛、發高燒 3.Myalgias(肌肉痠痛)

vector Tick 蜱 Mite 蟎 Flea 蚤 Louse 蝨

Epidemiology 人(主要)、松鼠、鼯鼠
Wild rodents
(reservoir) (squirrel fleas, flying squirrels)
1. Geography distribution
1.cosmpolitan distribution(世界性分布)
2. 流行季節(4~9 月) 1.未治療致死率：20%
2.人 accidental host
3. 未治療致死率：10~25%
1.用顯微鏡觀察(Giemsa/Gimenez 染色、活體切片染色-兂)
2. PCR(Nucleic-Acid-based test)
Diagnosis 3. Weil-Felix(Anitboty)：立克次體與變性菌(Proteus spp.)有相同的抗原，可進行 Weil-Felix。
懷疑被立克次體感染的病人的血漿(含抗體)+含變形菌抗原的乳膠粒—若有凝集反應則為陽性
4. Serology：Microimmunofluorescence test(MIF)(OmpA、LPS Antigen)
Treatment Tetracycline(一天內可以降燒)/Fluoroquinolones(替代)/Doxycline(對所有胞內菌都好用)
無疫苗/R. Prowazekii 有疫苗(inactivated vaccine)
誤認為病毒： (1)太小(0.3 ×1~2μm) (2)Gram stain 難染 (3)只能在真核細胞 cytoplasm 中生長

細菌之證據： (1)結構像 Gram(-) Rods (2)同時有 DNA、RNA，且能進行 Krebs、合成 protein

(3)binary fission (4)antibiotics 能抑制生長
備注
Coxiella burnetii(蒲氏考克斯菌)：與其他的立克次體性質不同
1.內胞子:可抗熱、乾燥、可存在於細胞外
2.不需靠節枝動物傳播！
3.Q fever(肺炎！)
※一批很小的細菌(跟很大的病毒差不多大): Spirochetes 螺旋體(密→梅毒，包式→萊姆、回歸熱，鉤端) Rickettsia(洛磯斑、地方斑疹傷寒、恙蟲)，
Chlamydia (砂眼、肺炎、鸚鵡熱)，Mycoplasma、
※絕對胞內寄生：立克次體&披衣菌，一定要竊取宿主細胞的 ATP 才能活。
※黴漿菌沒有細胞壁，所以作用在細胞壁上的抗生素殺不死，如：青黴素類。
 各式分類表

Nocardia、N. gonorrhoeae、Orientia Tsutsugamushi

※兼性胞內菌：Listeria monocytogenes、Legionella
分枝桿菌們：M. tuberculosis, M. lepra, M. avium
pneumophila
雜菌們：Bordetella, Brucella, Francisella,
※在 Mψ 中複製：
腸桿菌們(Enterobacteriaceae)：
胞內菌 Nocardia、M. tuberculosis、L. monocytogenes、Salmonella、
Salmonella typhi Shigella dysenteriae Yersinia pestis
Yersinia、Klebsiella
絕對胞內寄生：Rickettsia rickettsii、Chlamydia trachomatis

※胞內生長大多有下列特性：
catalase(+)、具有 cord factor、SOD(superoxide dismutase)

※catalase(+)： ※catalase(-)：
Corynebacterium、Nocardia、Mycobacterium、Listeria、Neisseria Streptococcus, Enterococcus, Erysipelothrix
Brucella melitensis、Enterobacteriaceae、H. pylori、Propionibacterium

※Oxidase(+)：皆 Gram(-)
Enzymes Neisseria、Vibrio、Aeromonas、Pseudomonas、Bordetella
酵素
Brucell
※Fermentation：
Non-fermentation G(-) rods：
Streptococcus、Enterococcus、C. diphtheria、Enterobacteriaceae、
Acientobacter、Burkholderia(B. pseudomallei)、Moraxella、
Campylobacter、Helicobacter、Aeromonas、lactobacillus、
Pseudomonas、Stenotrophomonas
Propionibacterium

※絕對需氧：can only reproduce in the presence of O2 ※兼氧性：可藉由呼吸作用與發酵分解養分

Nocardia、Mycobacterium、Neisseria、P. aeruginosa、雜菌們 C. diphtheria、L. monocytogenes、E.rhusiopathiae、
(Miscellaneous) Enterobacteriaceae、Vibrio、Aeromonas、H. influenzea
※絕對厭氧：die in the presence of O2、代謝得到的 ATP 極少 ※部分耐養：Aerotolerant anaerobes. 不使用 O2 氧化養分，
需氧性
Clostridium、幾乎大部分的 anaerobic 都是絕對厭氧 不會被 Oxygen 殺死
※需要一些 CO2 ： ※微好氧：
Erysipelothrix rhusiopathiae、Neisseria、B. anthracis(才會長 spore)、 Streptococcus、enterococcus、Campylobacter jejuni、
Campylobacter jejuni、Helicobacter pylori、Brucella melitensis(有些需要) Helicobacter pylori

※capsule(+)：
Staphylococcus、Streptococcus、Enterococcus、Bacillus、Erysipelothrix
N. meningitidis、B. pertussis(peptidoglycan)、F. tularensis Enterobacteriaceae、V. vulnificus
Pseudomonas aeruginosa、H. influenzea、Campylobacter fetus、Bacteroides fragilis、Cryptococcus neoformans(yeast)
結構特色
※有菌絲：actinomycetes 放線菌類
Corynebacterium、Nocardia、Mycobacterium(三隻有 Mycolic acid 的)
Propionibacterium (morphologically similar Nocardia)
Actinomyces
※人畜共通(zoonotic)：
※人傳人：
B. anthracis、E.rhusiopathiae、Brucella melitensis、Francisella tularensis
S. aureus、B. pertussis、Salmonella、Shigella、Yersinia
Vibrio parahaemolyticus、Yersinia、Campylobacter jejuni、Borrelia
M. tuberculosis、N. meningitidis、EHEC、EPEC
Leptospirosis、Rickettsioses
(C. jejuni、V. cholera)
傳染途徑 ※糞口傳染：
※共生菌：
ETEC、Salmonella、Shigella、H. pylori
S. aureus、S. pyogenes、S. pneumoniae、Enterococcus、C. diphtheria
※Strict pathogen：一定會造成人類疾病的病原體，只要感染
Escherchia coli、H. influenzea、C. difficile、spirochetes、mycoplasma
就會得病。E.g. Mycobacterium tuberculosis、M. leprosy
anerobic Gram(-) (Actinomyces、Mobiluncus、Lactobacillus、
Strict human pathogen：human 是唯一 resorvior
Propionibacterium、Bacteroid、Prevotella)、

※耐 bile salt：enterococcus、listeria、salmonella
MacConkey agar ※不耐 bile salt：sterptococcus pneumonia
Thiosulfate citrate Bile salt Sucrose agar TCBS
BBE agar Bacteroides Bile-esculin
各種耐受性
※耐鹽 NaCl：staphylococcus aureus、enterococcus、listeria monocytogenes
※耐低溫(4℃低溫生長)：listeria、Yersinia enterocolitica(refrigerated food)
※strict human pathogen：M. tuberculosis、M. leprae、Mycoplasma pneumoniae

※CAMP(+)：S. agalactiae、L. monocytogenes

檢測用 ※BCYE：Nocardia、Legionella pneumophila、Francisella tularensis
※Hippurative hydrolase：S.agalactiae、L. monocytogenes、Campylobacter
 ※無法培養：
Treponema、Mycobacterium leprae
難以培養：C. tetani
※易脫染，部分 Gram(-)：
C. perfringens E. rhusiopathiae、Mobiluncus
各種其他
※Chocolate agar：E.rhusiopathiae、Nocardia、Neisseria、Haemophilus、V. cholera、Francisella
※新生兒腦膜炎：S. agalatiae、Listeria、EHEC
※腦膜炎：S. pneumonia、N. meningitidis、B. anthracis、L. monocytogenes、Haemophilus、Leptospira(無菌)
※搶 Fe2+ ：C. diphtheria、N. gonorrhoea、Enterobacteriaceae
※TTSS：P. aeruginosa、Enterobacteriaceae

A-B toxin
細菌來源 毒素 Gene location 機制

Corynebacterium AEF2(catalyst 水解 GTP，

Diphtheria toxin A-B Phage
diphtheria 讓 ribosome 能夠在 mRNA 上移動)，受 DtxR+Fe2+抑制。

Pseudomonas
protein synthesis(-)

Pseudomonas exotoxin A A-B Chromosomal 和 Diphtheria 同樣抑制 EF2

aureginosa

A128S rRNA
Shigella dysenteriae Shiga toxin A-5B Chromosomal
5Bbind GB3(globotriaosylceramide)

Shiga toxin(Stx-1;Stx-2) A-5B Phage 同 shigella 的 Stx-1(identical)、Stx-2(60% homology)

Escherichia coli A：ADP-ribosyltransferaseGsadenylate cyclasecAMP↑

heat labile toxin(LT-I)
A-5B Plasmid B：GM1 gangliosides(與 cholera 相同 receptor，bind 在小腸
(似 cholera toxin)
內皮上
Chromosomal/
Vibrio cholera Cholera toxin A-5B 同 E. coli 的 LT-I
Bacteriophage CTXφ

PF ALF(MAPK(-))、EF(cAMP↑)
Bacillus anthracis anthrax toxin Plasmid
cAMP↑

LF、EF BPF
A(S1)：抑制 Gi 活性，使 adenylate cyclase 活化
cAMP↑respiatory secretion、mucose production↑
Bordetella pertussis Pertussis toxin A-5B Chromosomal S2：lactosylceramide(ciliated respiratory cell)
S3：receptorCR3↑(phagocytosis
cell)attachment↑phagocytosis↑
Bordetella adenylate
Bordetella spp. A-B Chromosomal cAMP↑
cyclase toxin
A：讓調控 neurotransmitters 釋放的蛋白失去活性
Neural toxin

Clostridium tetani Tetanospasmin A-B Plasmid

glycine、β-aminobutryic acid(GABA)spastic paralysis
Clostridium A：讓調控 neurotransmitters 釋放的蛋白失去活性
Botulinum toxin A-B Phage
botulinum acetylcholineFlaccid paralysis

※cAMP：Bacillus anthracis(edema factor)、Bordetella pertussis、Escherichia coli、V. cholera

cAMP↑：增加 Na+、Cl-1、K+、HCO3、H2O 分泌(hypersecrection)
減少 sodium、chloride 吸收

※比較：1. Vibrio cholerae、Bacillus anthracis、Bordetella pertussis 使用 calmodulin-dependent adenylate cyclasecAMP↑

2. E.coli (ETEC)：heat-stable toxin：STabind transmembrane guanylate cyclase receptorcGMP↑hypersecretion

※A-B toxin：B. anthracis, Pseudomonas aureginosa, C. diphtheria, E. coli (shiga toxin),

Shigella, V. cholera, B. pertussis, C. tetani, C. botulinum

A Raymond Lin Production 2013™

(first edi. By 方綾/ Second edi. By 開亮)
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微生物學中分類之基本單位為「種」
★「種」的定義為：一群具有相似特性 (如遺傳物質之相似性)菌株的
集合。相同菌種之間彼此不易區分，但可與不同菌種之間作明顯的區
別，此外將微生物歸類成同種之其它特徵尚包括細胞形態、營養需求
與生理代謝等。
在微生物的命名中又常出現型(Type)或菌株(Strain) 等名稱，這兩個名
稱均不屬分類單位。
微生物中所謂的「型」(Type)指在同種微生物之中
★ 因菌體間之某一項特性的差異，如生物型是根據菌體間生化特性之
不同進一步加以分型，分型有時亦稱為變種。
★「菌株」(strain)不是分類學上之單位，所謂菌株是指不同來源的同
種或同型微生物一般是得自純培養之獨立菌落(Colony) 的子代菌株
通常是以數字、字母或姓名附加於種名之後