Professional Documents
Culture Documents
5.1.1. Kh¸i niÖm vÒ c¸c gen c¬ ®Þnh (constitutive) vµ c¶m øng (inducible)
Mét sè s¶n phÈm cña hÖ gen, ch¼ng h¹n nh− c¸c tARN, rARN, c¸c protein thµnh
phÇn cña ribosome, cña ARN polymerase, cña ADN polymerase vµ nhiÒu enzym xóc t¸c
tham gia vµo c¸c qu¸ tr×nh trao ®æi chÊt c¬ b¶n (nh− chuyÓn hãa ®−êng glucose, tæng hîp
c¸c axit amin),... lµ c¸c thµnh phÇn thiÕt yÕu cho sù tån t¹i cña mäi lo¹i tÕ bµo. C¸c gen
m· hãa cho c¸c lo¹i s¶n phÈm nµy th−êng ®−îc biÓu hiÖn th−êng xuyªn vµ liªn tôc ë hÇu
hÕt c¸c tÕ bµo. Do vËy, chóng ®−îc gäi lµ c¸c gen c¬ ®Þnh (constitutive genes).
Ng−îc l¹i, nhiÒu s¶n phÈm kh¸c cña hÖ gen chØ cÇn cho tÕ bµo vµ c¬ thÓ vµo nh÷ng
thêi ®iÓm nhÊt ®Þnh hoÆc trong ®iÒu kiÖn m«i tr−êng ®Æc thï. ViÖc ho¹t ®éng theo kiÓu c¬
®Þnh ®èi víi nh÷ng gen nµy sÏ lµ sù l·ng phÝ vÒ n¨ng l−îng. Cã lÏ v× vËy, tr¶i qua hµng
triÖu n¨m tiÕn hãa, c¸c tÕ bµo ®· ph¸t triÓn c¸c c¬ chÕ ®iÒu hßa biÓu hiÖn gen sao cho
chóng chØ biÓu hiÖn c¸c gen cÇn thiÕt vµo tõng thêi ®iÓm vµ vÞ trÝ nhÊt ®Þnh cña c¬ thÓ;
134
Ch−¬ng 5. gen vµ sù ®iÒu hoµ biÓu hiÖn gen
vµ c¸c c¬ thÓ cã c¸c c¬ chÕ ®iÒu hßa hiÖu qu¶ sÏ cã −u thÕ chän läc cao h¬n so víi c¸c c¬
thÓ thiÕu c¸c c¬ chÕ nµy. Gi¶ thiÕt nµy gióp gi¶i thÝch v× sao hÇu hÕt mäi d¹ng sèng tån
t¹i hiÖn nay, kÓ c¶ vi khuÈn vµ virut, ®Òu cã c¸c c¬ chÕ biÓu hiÖn gen rÊt hiÖu qu¶.
E. coli vµ phÇn lín c¸c vi khuÈn kh¸c cã thÓ sinh tr−ëng trong m«i tr−êng cã nguån
n¨ng l−îng lµ c¸c lo¹i ®−êng kh¸c nhau. NÕu m«i tr−êng cã glucose, vi khuÈn cã xu
h−íng −u tiªn sö dông ®−êng nµy. Nh−ng, khi kh«ng cã glucose, vi khuÈn vÉn cã thÓ
sinh tr−ëng tèt nÕu cã mét trong c¸c lo¹i ®−êng kh¸c, nh− sucrose, galactose, arabinose
vµ lactose.
VÝ dô nh−, khi m«i tr−êng chØ cã lactose lµ nguån hydrat carbon duy nhÊt, c¸c tÕ
bµo E. coli sÏ tiÕn hµnh tæng hîp enzym β-galactosidase vµ protein permease cÇn thiÕt
cho viÖc sö dông lactose lµm nguån n¨ng l−îng (thay thÕ cho glucose). Permease lµ mét
protein vËn chuyÓn gióp “b¬m” lactose tõ ngoµi m«i tr−êng vµo trong tÕ bµo, cßn β-
galactosidase lµ enzym ph©n c¾t lactose thµnh glucose vµ galactose. Hai protein nµy hÇu
nh− kh«ng cã vai trß g× khi tÕ bµo E. coli ®−îc nu«i trong m«i tr−êng kh«ng cã lactose.
ViÖc tæng hîp hai protein nµy cÇn n¨ng l−îng (tõ ATP vµ GTP). V× vËy, c¬ chÕ ®iÒu hßa
cho phÐp c¸c tÕ bµo chØ tæng hîp m¹nh c¸c s¶n phÈm cÇn thiÕt cho chuyÓn hãa lactose
khi m«i tr−êng cã lactose (vµ kh«ng cã glucose), ®ång thêi h¹n chÕ tèi ®a sù ho¹t ®éng
cña chóng khi m«i tr−êng kh«ng cã ®−êng nµy (hoÆc cã glucose) sÏ ®¶m b¶o cho c¸c tÕ
bµo sö dông n¨ng l−îng hiÖu qu¶ cho ho¹t ®éng sèng cña chóng.
Trong m«i tr−êng tù nhiªn (vÝ dô: èng tiªu hãa ë ng−êi), vi khuÈn E. coli hiÕm khi
gÆp ®iÒu kiÖn thiÕu glucose vµ thõa lactose. Do vËy, c¸c gen m· hãa c¸c enzym chuyÓn hãa
lactose cña nã th−êng ë tr¹ng th¸i “t¾t” (thùc chÊt lµ biÓu hiÖn tèi thiÓu). Nh−ng nÕu vi
khuÈn ®−îc chuyÓn sang m«i tr−êng chØ cã lactose lµm nguån hydrat carbon, th× chóng
nhanh chãng (chØ sau kho¶ng 10 phót) tæng hîp c¸c enzym chuyÓn hãa vµ sö dông lactose.
Qu¸ tr×nh “bËt” sù biÓu hiÖn cña gen ®Ó ®¸p øng l¹i sù cã mÆt cña tÝn hiÖu nµo ®ã trong
m«i tr−êng ®−îc gäi lµ sù c¶m øng. C¸c gen ®−îc ®iÒu hßa theo kiÓu nµy ®−îc gäi lµ c¸c
gen c¶m øng (inducible genes). S¶n phÈm do gen nh− vËy m· hãa, nÕu lµ enzym th× ®−îc
gäi lµ c¸c enzym c¶m øng, cßn nÕu lµ protein th× ®−îc gäi lµ protein c¶m øng.
C¸c enzym tham gia vµo c¸c qu¸ tr×nh dÞ hãa, nh− chuyÓn hãa lactose, galactose,
hay arabinose, th−êng lµ c¸c gen c¶m øng ®iÓn h×nh. CÇn ph©n biÖt sù kÝch øng biÓu
hiÖn gen m· hãa c¸c enzym víi sù ho¹t hãa enzym, bëi hai hiÖn t−îng nµy kh¸c nhau vÒ
c¬ chÕ vµ ph−¬ng thøc thùc hiÖn. Sù kÝch øng biÓu hiÖn c¸c gen lµm thay ®æi tèc ®é tæng
hîp enzym, chø kh«ng lµm thay ®æi ho¹t tÝnh enzym. Ng−îc l¹i, sù ho¹t hãa c¸c enzym
th−êng liªn quan tíi sù t−¬ng t¸c gi÷a enzym vµ c¸c ph©n tö tÝn hiÖu lµm thay ®æi ho¹t
tÝnh enzym, nh−ng th−êng kh«ng lµm thay ®æi møc ®é biÓu hiÖn cña gen m· hãa enzym.
C¸c vi khuÈn cã thÓ tù tæng hîp phÇn lín c¸c ph©n tö h÷u c¬ cÇn cho sù sèng cña
chóng, nh− c¸c axit amin, c¸c nucleotide vµ vitamin. VÝ dô nh−, hÖ gen E. coli chøa 5 gen
m· hãa c¸c enzym tham gia sinh tæng hîp tryptophan (Trp). N¨m gen nµy biÓu hiÖn theo
kiÓu c¬ ®Þnh khi E. coli ®−îc nu«i trong m«i tr−êng thiÕu Trp. Nh−ng nÕu vi khuÈn ®−îc
nu«i trong m«i tr−êng d− thõa Trp, th× E. coli cã mét c¬ chÕ ®iÒu hßa gióp “t¾t” sù biÓu
hiÖn cña c¸c gen nµy. C¸c gen ®−îc ®iÒu hßa theo kiÓu nµy ®−îc gäi lµ c¸c gen bÞ nÐn,
hay gen bÞ øc chÕ. Khi c¸c gen bÞ nÐn ®−îc ho¹t hãa trë l¹i th× ®−îc gäi lµ sù gi¶i nÐn.
C¸c gen m· hãa enzym tham gia vµo c¸c qu¸ tr×nh ®ång hãa th−êng lµ c¸c gen
®−îc ®iÒu hßa biÓu hiÖn theo kiÓu bÞ nÐn. Gièng nh− kiÓu ®iÒu hßa c¶m øng, sù nÐn gen
®iÓn h×nh ®−îc thùc hiÖn ë b−íc phiªn m·. CÇn ph©n biÖt sù nÐn gen víi sù øc chÕ ph¶n
håi. Bëi øc chÕ ph¶n håi th−êng liªn quan ®Õn sù øc chÕ g©y ra bëi s¶n phÈm cuèi cïng
cña mét con ®−êng chuyÓn hãa ®èi víi ho¹t tÝnh cña enzym tham gia con ®−êng chuyÓn
hãa ®ã, mµ kh«ng ¶nh h−ëng ®Õn sù biÓu hiÖn cña gen m· hãa enzym.
135
§inh §oµn Long
136
Ch−¬ng 5. gen vµ sù ®iÒu hoµ biÓu hiÖn gen
kh«ng thÓ liªn kÕt ®−îc víi RPBS. KÕt qu¶ lµ, ARN polymerase kh«ng thÓ liªn kÕt ®−îc
víi promoter vµ sù phiªn m· gen cÊu tróc cã thÓ diÔn ra.
§iÒu hßa ©m tÝnh §iÒu hßa d−¬ng tÝnh
VÞ trÝ g¾n protein
®iÒu hßa VÞ trÝ g¾n protein
Gen ®iÒu hßa Promoter C¸c gen cÊu tróc Gen ®iÒu hßa ®iÒu hßa Promoter C¸c gen cÊu tróc
Phøc hÖ chÊt kÝch øng / protein øc chÕ kh«ng liªn Phøc hÖ chÊt kÝch øng / protein ho¹t hãa liªn kÕt
kÕt ®−îc vµo vÞ trÝ ®iÒu hßa ®−îc vµo vÞ trÝ ®iÒu hßa
Protein øc chÕ ë tr¹ng th¸i tù do kh«ng liªn Protein ho¹t hãa ë tr¹ng th¸i tù do liªn
kÕt ®−îc vµo vÞ trÝ ®iÒu hßa kÕt ®−îc vµo vÞ trÝ ®iÒu hßa
Phiªn m· kh«ng
ARN polymerase kh«ng liªn kÕt
diÔn ra
®−îc vµo promoter nÕu yÕu tè
ho¹t hãa kh«ng liªn kÕt ®−îc
ARN polymerase vµo vÞ trÝ ®iÒu hßa
Phøc hÖ chÊt ®ång øc chÕ / protein øc chÕ liªn Phøc hÖ chÊt ®ång øc chÕ / protein øc chÕ
kÕt ®−îc vµo vÞ trÝ ®iÒu hßa kh«ng liªn kÕt ®−îc vµo vÞ trÝ ®iÒu hßa
b) HÖ thèng ®iÒu hßa øc chÕ (repressible)
H×nh 5.1. §iÒu hßa ©m tÝnh vµ d−¬ng tÝnh cña c¸c gen biÓu hiÖn kiÓu kÝch øng hoÆc øc chÕ. C¸c protein ®iÒu
hßa cÇn liªn kÕt ®−îc vµo ADN ®Ó "bËt" gen trong ®iÒu hßa d−¬ng tÝnh vµ "t¾t" gen trong ®iÒu hßa ©m tÝnh (nguån:
Snudstad vµ Simmons, 2003)
137
§inh §oµn Long
§Ó hiÓu h¬n c¸c hÖ thèng ®iÒu hßa gen nªu trªn, cÇn ph©n biÖt ®−îc sù kh¸c biÖt
gi÷a chóng, bao gåm: 1) S¶n phÈm cña gen ®iÒu hßa lµ protein ho¹t hãa lµm t¨ng c−êng
biÓu hiÖn cña gen trong ®iÒu hßa d−¬ng tÝnh; nh−ng nÕu ®ã lµ protein øc chÕ, th× nã sÏ
liªn quan ®Õn sù k×m h·m hay øc chÕ biÓu hiÖn cña gen trong ®iÒu hßa ©m tÝnh; 2) ë c¶
hai hÖ thèng ®iÒu hßa ©m tÝnh vµ d−¬ng tÝnh, th× sù ho¹t hãa hay øc chÕ biÓu hiÖn gen
phô thuéc vµo viÖc protein ®iÒu hßa cã liªn kÕt hay kh«ng vµo c¸c vÞ trÝ RPBS.
5.2.1.1. BiÓu hiÖn gen ®−îc ®iÒu khiÓn bëi c¸c protein ®iÒu hßa
Nh− ®· nªu ë trªn, sù biÓu hiÖn cña nhiÒu gen ë c¶ prokaryote vµ eukaryote phô
thuéc chÆt chÏ vµo m«i tr−êng, cô thÓ h¬n lµ c¸c tÝn hiÖu cña m«i tr−êng. ë vi khuÈn, c¸c
tÝn hiÖu ®iÓn h×nh chÝnh lµ c¸c ph©n tö cã mÆt trong m«i tr−êng sèng. “Th«ng tin” tõ c¸c
tÝn hiÖu nµy ®−îc “truyÒn” tíi gen qua c¸c protein ®iÒu hßa. Chóng ta nhí l¹i c¸c b−íc
khëi ®Çu phiªn m· (ch−¬ng 3). §Çu tiªn, ARN polymerase liªn kÕt vµo promoter trong
phøc hÖ khëi ®Çu phiªn m· “®ãng”. Sau ®ã, phøc hÖ nµy chuyÓn thµnh d¹ng “më” víi hai
m¹ch cña ph©n tö ADN t¹i promoter gi·n xo¾n, t¸ch ra côc bé, råi ARN polymerase b¾t
®Çu sù phiªn m·. VËy, c¸c protein ®iÒu hßa ho¹t ®éng thÕ nµo? C¸c protein ho¹t hãa vµ
øc chÕ t¸c ®éng vµo b−íc nµo cña sù khëi ®Çu phiªn m·? §iÒu nµy thùc tÕ phô thuéc vµo
tõng promoter vµ protein ®iÒu hßa. Sau ®©y lµ hai vÝ dô ®iÓn h×nh.
5.2.1.2. NhiÒu promoter ®−îc ®iÒu khiÓn qua ¸i lùc gi÷a ARN polymerase víi ADN
Víi nhiÒu promoter, khi kh«ng cã c¸c protein ®iÒu hßa, ARN polymerase th−êng liªn
kÕt rÊt yÕu, bëi v× nh÷ng promoter nµy thiÕu mét trong c¸c yÕu tè cña tr×nh tù liªn øng,
hoÆc do chóng kh«ng hoµn chØnh. Nh−ng, do “kÏ hë” cña liªn kÕt yÕu, ®«i khi ARN
polymerase vÉn liªn kÕt ®−îc víi promoter vµ khëi ®Çu sù phiªn m·. §iÒu nµy dÉn ®Õn sù
biÓu hiÖn gen kiÓu c¬ ®Þnh, nh−ng chØ ë møc c¬ b¶n (tèi thiÓu). Sù liªn kÕt cña ARN
polymerase vµo promoter ë ®©y lµ mét kiÓu giíi h¹n tèc ®é biÓu hiÖn gen (h×nh 5.2a).
§Ó ®iÒu hßa ©m tÝnh mét promoter nh− vËy, chØ cÇn cã mét protein øc chÕ g¾n vµo
mét vÞ trÝ bªn trong hoÆc gèi lªn promoter. VÞ trÝ nµy ®−îc gäi lµ tr×nh tù ®iÒu hµnh
(operator). Do sù liªn kÕt cña protein øc chÕ vµo operator, ARN polymerase kh«ng g¾n
®−îc vµo promoter vµ sù phiªn m· kh«ng ®−îc thùc hiÖn (h×nh 5.2b). Ng−îc l¹i, ®Ó ®iÒu
hßa d−¬ng tÝnh promoter nµy, mét protein ho¹t hãa cã thÓ gióp ARN polymerase liªn kÕt
dÔ dµng h¬n víi promoter. HiÖn t−îng nµy x¶y ra mét c¸ch ®iÓn h×nh nh− sau: protein
ho¹t hãa dïng mét phÇn ph©n tö cña nã ®Ó liªn kÕt víi ADN t¹i vÞ trÝ gÇn promoter, cßn
phÇn kh¸c t−¬ng t¸c víi ARN polymerase, nhê vËy ®−a enzym nµy ®Õn gÇn promoter
(h×nh 5.2c). C¬ chÕ nµy ®−îc gäi lµ sù liªn hîp ADN/protein. Vai trß cña chÊt ho¹t hãa
ë ®©y chØ ®¬n thuÇn cã vai trß “®Ýnh kÕt” gi÷a ADN vµ ARN polymerase. Nãi c¸ch kh¸c,
138
Ch−¬ng 5. gen vµ sù ®iÒu hoµ biÓu hiÖn gen
vai trß cña nã lµ mang enzym tíi gÇn promoter. Mét khi yÕu tè ho¹t hãa cã mÆt, sù h×nh
thµnh phøc hÖ “më” t¹i promoter cã thÓ h×nh thµnh tù ph¸t vµ sù phiªn m· diÔn ra.
Operon lac ë E. coli ho¹t ®éng víi sù tham gia cña mét protein ho¹t hãa vµ mét
protein øc chÕ theo kiÓu trªn ®©y. Chóng ta sÏ xem ho¹t ®éng cña operon nµy ë phÇn sau.
5.2.1.3. Qui t¾c dÞ h×nh ®iÒu khiÓn sau b−íc ARN polymerase ®Ýnh kÕt vµo promoter
Kh«ng ph¶i mäi
promoter ®Òu ®−îc ®iÒu a)
khiÓn b»ng c¬ chÕ gièng ARN polymerase
nhau. Theo mét c¬ chÕ kh¸c,
ARN polymerase cã thÓ liªn
kÕt s½n víi mét phøc hÖ khëi
®Çu phiªn m· “®ãng”. Nh−ng
phøc hÖ nµy kh«ng tù chuyÓn
Operator
sang ®−îc tr¹ng th¸i “më” Phiªn m· ë
møc c¬ b¶n
khi kh«ng cã protein ho¹t VÞ trÝ liªn kÕt cña
hãa. Khi cã mÆt protein ho¹t protein ho¹t hãa Promoter
hãa, phøc hÖ “®ãng” chuyÓn
b) Protein øc chÕ
thµnh phøc hÖ “më”, vµ sù
Kh«ng cã
khëi ®Çu phiªn m· diÔn ra.
phiªn m·
§iÓn h×nh lµ c¸c protein ho¹t
hãa sau khi t−¬ng t¸c víi c)
phøc hÖ khëi ®Çu phiªn m· Protein ho¹t hãa
“®ãng”, chóng kÝch øng sù ARN polymerase
thay ®æi cÊu h×nh hoÆc cña
Phiªn m· ë møc
ARN polymerase hoÆc cña t¨ng c−êng
ADN theo qui t¾c dÞ h×nh,
vµ chuyÓn phøc hÖ “®ãng”
thµnh “më”. ë ch−¬ng 1,
chóng ta biÕt qui t¾c dÞ h×nh
H×nh 5.2. Ho¹t hãa gen bëi sù huy ®éng ARN polymerase.
lµ mét trong nh÷ng qui t¾c c¬ a) Khi kh«ng cã protein ®iÒu hßa, ARN polymerase cã thÓ liªn kÕt tù ph¸t víi
b¶n nhÊt trong ®iÒu hßa chøc promoter vµ khëi ®Çu phiªn m· (ë møc c¬ b¶n), b) Sù liªn kÕt cña protein øc
n¨ng vµ ho¹t tÝnh protein. chÕ vµo operator ng¨n c¶n ARN polymerase liªn kÕt vµo promoter, qua ®ã
øc chÕ sù phiªn m·, c) ARN polymerase ®−îc c¸c protein ho¹t hãa huy
Mét vÝ dô lµ c¸c protein ®éng ®Õn gen lµm t¨ng c−êng sù phiªn m· (gen biÓu hiÖn ë møc tèi ®a)
Cyclin ho¹t hãa c¸c enzym
Cdk tham gia ®iÒu khiÓn chu
tr×nh tÕ bµo. C¸c Cyclin ho¹t
hãa ®−îc enzym nµy b»ng c¸ch liªn kÕt vµo enzym vµ chuyÓn chóng tõ tr¹ng th¸i kh«ng
ho¹t ®éng sang tr¹ng th¸i ho¹t ®éng (h×nh 1.12). ë ®©y, chóng ta xem qui t¾c dÞ h×nh
®−îc vËn dông trong ®iÒu hßa phiªn m· ë hai promoter lµ glnA vµ metT. Trong tr−êng
hîp ë glnA, chÊt ho¹t hãa (NtrC) t−¬ng t¸c víi ARN polymerase vµ thóc ®Èy phøc hÖ khëi
®Çu phiªn m· “®ãng” chuyÓn thµnh “më”. Cßn trong tr−êng hîp metT, chÊt ho¹t hãa
(MerR) t¹o ra hiÖu øng t−¬ng tù nh−ng b»ng sù thay ®æi cÊu h×nh ADN (promoter).
Còng ph¶i nãi lµ sù ®iÒu hßa phiªn m· t¹i promoter trong thùc tÕ lµ ®a d¹ng h¬n.
Ch¼ng h¹n nh−, nhiÒu c¬ chÕ kh¸c nhau cã thÓ ®−îc kÕt hîp ®ång thêi, hoÆc sù k×m
h·m phiªn m· kh«ng nhÊt thiÕt ph¶i qua sù ng¨n c¶n liªn kÕt gi÷a ARN polymerase vµ
promoter.
139
§inh §oµn Long
H×nh 5.3. Sù t−¬ng t¸c gi÷a c¸c protein liªn kÕt ADN. a) T−¬ng t¸c gi÷a c¸c
protein ®iÒu hßa liªn kÕt gÇn nhau. b) T−¬ng t¸c gi÷a c¸c protein ®iÒu hßa liªn kÕt
xa nhau, h×nh thµnh "vßng th¾t" trªn ph©n tö ADN. c) "Protein bÎ cong ADN" gióp
®−a mét protein ho¹t hãa liªn kÕt ë xa ®Õn gÇn phøc hÖ khëi ®Çu phiªn m· vµ
ADN t−¬ng t¸c víi ARN polymerase.
5.2.1.4. Sù ®iÒu khiÓn biÓu hiÖn gen tõ kho¶ng c¸ch xa vµ cÊu tróc vßng th¾t ADN
C¸c protein ®iÒu hßa th−êng liªn kÕt ë vÞ trÝ gÇn promoter cña gen, nh−ng ®iÒu nµy
kh«ng ph¶i lóc nµo còng ®óng. §«i khi, protein ®iÒu hßa liªn kÕt vµo ph©n tö ADN t¹i vÞ
trÝ c¸ch gen rÊt xa. Lóc nµy, ®Ó protein ®iÒu hßa cã thÓ t−¬ng t¸c ®−îc víi gen, th−êng cã
sù h×nh thµnh c¸c “vßng th¾t” trªn ph©n tö ADN (h×nh 5.3b). Trong thùc tÕ, protein ho¹t
hãa phiªn m· NtrC (®· ®−îc nh¾c ®Õn ë trªn) ho¹t ®éng theo c¸ch nµy. VÞ trÝ liªn kÕt
ADN cña nã n»m ng−îc dßng promoter (vÒ phÝa ®Çu 5’ cña m¹ch m· hãa) 150 bp. Protein
nµy thËm chÝ cã thÓ ho¹t hãa gen ngay c¶ khi nã liªn kÕt ë vÞ trÝ xa h¬n (1 kb hoÆc h¬n).
Trong viÖc ®iÒu khiÓn biÓu hiÖn gen tõ xa nh− vËy, c¸c vßng th¾t ADN cã thÓ cã ®é dµi
®¹t ®Õn 3 kb. Mét c¸ch kh¸c ®Ó ®−a c¸c tr×nh tù ADN ë xa ®Õn gÇn nhau lµ nhê c¸c
protein liªn kÕt vµo ®o¹n tr×nh tù ë gi÷a (h×nh 5.3c). Nh÷ng protein “kÕt cÊu” nh− vËy
®−îc t×m thÊy trong c¬ chÕ t¸i tæ hîp ®Æc hiÖu (xem ch−¬ng 6). ë cuèi ch−¬ng, chóng ta
còng sÏ thÊy kiÓu ®iÒu khiÓn “tõ xa” ë eukaryote cßn phæ biÕn h¬n.
5.2.1.5. Qui t¾c dÞ h×nh vµ liªn kÕt ADN - protein trong ®iÒu hßa biÓu hiÖn gen
Trong nhiÒu tr−êng hîp, sù ho¹t hãa gen ®−îc thùc hiÖn b»ng sù t−¬ng t¸c ®¬n gi¶n
gi÷a c¸c ®¹i ph©n tö, vÝ dô nh− gi÷a ADN vµ ARN polymerase, tõ ®ã huy ®éng bé m¸y
phiªn m· tËp trung tíi promoter. Trong nh÷ng tr−êng hîp kh¸c, gen ®−îc ®iÒu hßa bëi
qui t¾c dÞ h×nh. NghÜa lµ, mét protein ho¹t hãa t−¬ng t¸c víi enzym ARN polymerase ®·
liªn kÕt s½n víi ADN vµ lµm thay ®æi cÊu h×nh hoÆc cña enzym vµ/hoÆc cña promoter,
qua ®ã sù khëi ®Çu phiªn m· cã thÓ diÔn ra.
C¶ hai qui t¾c liªn kÕt ADN-protein vµ dÞ h×nh ®Òu cã nh÷ng vai trß kh¸c n÷a trong
®iÒu hßa ho¹t ®éng cña gen vµ c¸ch t−¬ng t¸c gi÷a chóng cã thÓ phøc t¹p h¬n. VÝ dô nh−
hai hay nhiÒu protein ®iÒu hßa cïng t−¬ng t¸c víi nhau vµ víi ADN; qua ®ã, chóng hç trî
nhau cïng t¨ng c−êng liªn kÕt vµo vÞ trÝ gen ®−îc ®iÒu khiÓn. KiÓu t−¬ng t¸c nµy t¹o nªn
t¸c dông “hiÖp lùc” vµ cã thÓ nhanh chãng chuyÓn mét gen tõ tr¹ng th¸i kh«ng biÓu hiÖn
sang tr¹ng th¸i biÓu hiÖn tèi ®a. Sù “hiÖp lùc” cña c¸c protein ho¹t hãa cßn cã vai trß tÝch
hîp tÝn hiÖu. §ã lµ khi c¸c gen chØ biÓu hiÖn khi ®ång thêi cã mÆt nhiÒu tÝn hiÖu kh¸c
nhau. Mét vÝ dô vÒ kiÓu ®iÒu hßa nµy lµ sù biÓu hiÖn c¸c gen ë phag¬ λ (xem ch−¬ng 3).
140
Ch−¬ng 5. gen vµ sù ®iÒu hoµ biÓu hiÖn gen
5.2.1.6. Khëi ®Çu phiªn m· kh«ng ph¶i lµ c¬ chÕ ®iÒu hßa duy nhÊt ë tÊt c¶ c¸c gen
Nh− nªu ë trªn, sù ®iÒu hßa ho¹t ®éng cña c¸c gen th«ng qua b−íc khëi ®Çu phiªn
m· lµ mét c¬ chÕ ®iÒu hßa gen c¬ b¶n nhÊt, kh«ng chØ ë prokaryote mµ c¶ ë eukaryote.
Nh−ng, mét sè vÝ dô ë phÇn sau cho thÊy: ë vi khuÈn ngoµi c¬ chÕ ®iÒu hßa ho¹t ®éng gen
ë b−íc khëi ®Çu phiªn m· cßn cã c¸c c¬ chÕ ®iÒu hßa biÓu hiÖn gen kh¸c n÷a, bao gåm c¸c
b−íc kÐo dµi phiªn m·, hoµn thiÖn mARN, dÞch m· tæng hîp protein.
5.2.2.1. Operon Lac ®−îc ®iÒu khiÓn ®ång thêi bëi c¸c protein ho¹t hãa vµ øc chÕ
Operon Lac lµ mét côm gen
trong hÖ gen E. coli gåm 3 gen cÊu a)
tróc (lacZ, lacY vµ lacA) n»m liÒn lacZ lacY lacA
kÒ nhau (h×nh 5.4a). Gäi lµ VÞ trÝ CAP operator
operon bëi sù phiªn m· cña c¸c
gen nµy diÔn ra ®ång thêi do dïng promoter
chung mét promoter. Promoter b) ARN polymerase
cña operon Lac (promoter lac),
n»m gÇn ®Çu 5’ cña LacZ, ®iÒu
khiÓn sù phiªn m· tæng hîp mét
ph©n tö mARN duy nhÊt. Nh−ng,
ph©n tö mARN nµy chøa th«ng
tin m· hãa cña nhiÒu h¬n mét b1)
lacZ
gen, nªn ®−îc gäi lµ mARN ®a
cistron. Ph©n tö mARN nµy sau BiÓu hiÖn ë møc c¬ b¶n
®ã ®−îc dÞch m· cho ra ba lo¹i
protein kh¸c nhau. Gen lacZ m·
hãa enzym β-galactosidase. b2) LacI lacZ
Enzym nµy xóc t¸c ph¶n øng thñy
ph©n lactose thµnh glucose vµ Kh«ng biÓu hiÖn
galactose, ®Ó cung cÊp n¨ng l−îng
cho tÕ bµo. Ngoµi ra, β-
galactosidase cßn xóc t¸c ph¶n ARN polymerase
øng chuyÓn hãa mét phÇn lactose b3) CAP lacZ
(liªn kÕt β-1,4-D-glycoside cña
glucose vµ galactose) thµnh mét BiÓu hiÖn ë
®ång ph©n lµ allolactose (liªn kÕt møc cao(tèi ®a)
β-1,6-D-glycoside cña glucose vµ
galactose). Chóng ta sÏ thÊy ë H×nh 5.4. Sù biÓu hiÖn cña operon Lac. a) CÊu tróc cña operon
phÇn sau, allolactose (chø kh«ng Lac, víi ba gen cÊu tróc (lacZ, Y vµ A). Tr×nh tù liªn kÕt CAP vµ
ph¶i lactose) chÝnh lµ ph©n tö kÝch promoter dµi kho¶ng 20bp. Operator n»m gèi lªn promoter, cßn vÞ trÝ
CAP ngay phÝa tr−íc promoter. b) Sù cã mÆt hay v¾ng mÆt glucose
øng sù biÓu hiÖn cña operon Lac.
vµ lactose ®iÒu khiÓn møc biÓu hiÖn cña c¸c gen cÊu tróc. Møc biÓu
Gen lacY m· hãa protein vËn hiÖn cao (b3) cÇn cã lactose vµ kh«ng cã glucose; møc biÓu hiÖn c¬
chuyÓn permease. Permease n»m b¶n (b1) khi m«i tr−êng cã c¶ lactose vµ glucose; operon kh«ng ®−îc
xuyªn mµng tÕ bµo vi khuÈn vµ cã phiªn m· (b2) khi m«i tr−êng kh«ng cã lactose.
vai trß vËn chuyÓn chñ ®éng
lactose tõ m«i tr−êng ngo¹i bµo
141
§inh §oµn Long
vµo trong tÕ bµo. Gen lacA m· hãa enzym thiogalactoside transacetylase, cã vai trß gi¶i
®éc tÕ bµo ®èi víi c¸c hîp chÊt thiogalactoside còng ®−îc vËn chuyÓn vµo tÕ bµo khi
permease ho¹t ®éng.
Nh÷ng gen nµy chØ ®−îc biÓu hiÖn m¹nh khi trong m«i tr−êng cã lactose vµ kh«ng
cã glucose. Cã hai protein ®iÒu hßa tham gia ®iÒu khiÓn ho¹t ®éng cña operon Lac, ®ã lµ
protein ho¹t hãa CAP vµ protein øc chÕ LacI. LacI ®−îc m· hãa bëi gen lacI n»m
gÇn operon Lac vÒ phÝa ®Çu 5’, vµ lµ mét gen c¬ ®Þnh. CAP cßn cã tªn lµ CRP (cAMP
receptor protein; hay protein thô thÓ cña cAMP). Gen m· hãa CAP n»m xa operon Lac.
C¶ hai protein ®iÒu hßa CAP vµ LacI ®Òu lµ c¸c protein liªn kÕt ADN víi vÞ trÝ liªn kÕt
t−¬ng øng n»m gÇn ®Çu 5’ (víi CAP) vµ 3’ (víi LacI; vÞ trÝ nµy ®−îc gäi lµ tr×nh tù ®iÒu
hµnh, hay Operator) cña promoter lac (h×nh 5.4).
Mçi protein ®iÒu hßa “tiÕp nhËn” mét tÝn hiÖu kh¸c nhau tõ m«i tr−êng vµ “truyÒn
tin” tíi operon Lac. NÕu CAP truyÒn tÝn hiÖu vÒ viÖc m«i tr−êng kh«ng cã glucose, th×
LacI th«ng b¸o trong m«i tr−êng cã lactose. HÖ thèng ®iÒu khiÓn operon Lac ho¹t ®éng
nh− sau: LacI chØ liªn kÕt ®−îc vµo Operator vµ øc chÕ operon Lac khi m«i tr−êng kh«ng
cã lactose. Khi cã mÆt lactose, LacI bÞ “bÊt ho¹t” vµ operon Lac ®−îc “gi¶i nÐn” vµ biÓu
hiÖn. Ng−îc l¹i, protein CAP khi liªn kÕt vµo operon Lac l¹i cã vai trß thóc ®Èy operon
ho¹t ®éng. Tuy vËy, CAP chØ liªn kÕt m¹nh khi m«i tr−êng kh«ng cã glucose. V× vËy, sù
phèi hîp cña hai protein ®iÒu hßa CAP vµ LacI sÏ ®¶m b¶o cho operon chØ biÓu hiÖn
m¹nh khi trong m«i tr−êng cã lactose, ®ång thêi kh«ng cã glucose (h×nh 5.4b).
5.2.2.2. CAP vµ LacI cã ¶nh h−ëng ®èi lËp ®Õn liªn kÕt promoter - ARN polymerase
ë operon Lac, tr×nh tù ®iÒu hµnh O gåm 21 bp víi tr×nh tù ë hai ®Çu lÆp l¹i ®¶o
chiÒu, ®èi xøng qua cÆp nucleotide sè 11 (h×nh 5.5b). CÊu tróc ®èi xøng cña operator
®−îc nhËn biÕt t−¬ng øng bëi hai tiÓu phÇn cña LacI. Do tr×nh tù liªn kÕt cña LacI t¹i
operator phñ lªn promoter lac mét phÇn (h×nh 5.5a), nªn khi LacI liªn kÕt vµo operator,
nã ng¨n c¶n sù liªn kÕt cña ARN polymerase vµo promoter. Cßn ®èi víi CAP, khi thiÕu
v¾ng protein nµy, ARN polymerase chØ liªn kÕt ®−îc rÊt yÕu vµo promoter. Së dÜ nh− vËy,
v× promoter lac thiÕu tr×nh tù UP, ®ång thêi tr×nh tù liªn øng “-35” cña nã kh«ng hoµn
chØnh. Sù kh«ng hoµn chØnh cña c¸c tr×nh tù liªn øng lµ ®Æc ®iÓm ®iÓn h×nh cña nhiÒu
promoter ®−îc ®iÒu hßa biÓu hiÖn bëi c¸c protein ho¹t hãa.
142
Ch−¬ng 5. gen vµ sù ®iÒu hoµ biÓu hiÖn gen
Còng gièng nh− LacI, CAP lµ mét protein cã hai chuçi polypeptide liªn kÕt vµo
mét tr×nh tù ADN cã kÝch th−íc t−¬ng ®−¬ng tr×nh tù ®iÒu hµnh O, nh−ng kh¸c vÒ
tr×nh tù nucleotide. Khi CAP liªn kÕt vµo vÞ trÝ nµy, nã ®ång thêi thóc ®Èy vµ huy ®éng
ARN pol ®Ýnh kÕt vµo promoter. Sù liªn kÕt phèi hîp nµy lµm t¨ng tÝnh æn ®Þnh cña
liªn kÕt ®−îc h×nh thµnh gi÷a ARN pol vµ promoter. Sau ®©y, chóng ta xem chi tiÕt c¬
chÕ ®iÒu hßa bëi CAP.
5.2.2.3. CAP cã mét miÒn liªn kÕt ADN vµ mét miÒn ho¹t hãa
CAP ho¹t hãa operon Lac b»ng viÖc huy ®éng enzym ARN polymerase ®Õn
promoter. Mét sè ph©n tö CAP ®ét biÕn liªn kÕt ®−îc vµo promoter, nh−ng kh«ng ho¹t
hãa ®−îc operon. Nh÷ng ®ét biÕn nµy cho thÊy, sù ho¹t hãa cña CAP kh«ng phô thuéc
®¬n thuÇn vµo viÖc liªn kÕt víi operon, mµ yÕu tè kh«ng kÐm quan träng lµ CAP ®ång
thêi ph¶i cã mét miÒn ho¹t hãa (vÞ trÝ tiÕp xóc víi ARN polymerase) míi cã thÓ ho¹t
hãa ®−îc operon. Vïng ho¹t hãa nµy t−¬ng t¸c víi miÒn ®Çu C cña tiÓu phÇn α thuéc
ARN polymerase (αCTD).
§Õn ®©y, chóng ta nhí l¹i r»ng, ARN polymerase ë E. coli gåm 6 tiÓu phÇn
(polypeptide) víi 2 tiÓu phÇn α. Trong c¸c tiÓu phÇn α nµy cã mét ®o¹n tr×nh tù linh ho¹t
®Çu N, ®−îc gäi lµ ®o¹n nèi linh ho¹t αNTD. PhÇn chÝnh cña αNTD n»m s©u trong
ph©n tö, nh−ng mét ®o¹n ®Çu N cña chuçi polypeptide nµy béc lé ra ngoµi, gäi lµ αCTD,
vµ th−êng liªn kÕt víi yÕu tè
UP cña c¸c promoter. ë operon
α
Lac, v× kh«ng cã yÕu tè UP, αCTD β
NTD β’
nªn thay vµo viÖc liªn kÕt víi
promoter, αCTD sÏ liªn kÕt vµo
miÒn ho¹t hãa cña CAP (h×nh
5.6). V× vËy, khi CAP liªn kÕt CAP lacZ
vµo promoter, nã sÏ huy ®éng
ARN polymerase tËp trung t¹i VÞ trÝ liªn -35 -10
vÞ trÝ nµy. Mét c©u hái ®Æt ra kÕt CAP
lµ: B»ng c¸ch nµo c¸c protein
H×nh 5.6. Protein CAP ho¹t hãa operon Lac. CAP ®−îc ARN
®iÒu hßa, nh− CAP vµ LacI, polymerase nhËn biÕt bëi ®Çu αCTD thuéc chuçi α cña enzym. αCTD
nhËn ra ®−îc c¸c vÞ trÝ liªn kÕt ®ång thêi liªn kÕt víi ADN sau khi g¾n vµo CAP. B»ng c¸ch nµy, CAP
®Æc hiÖu cña chóng trªn ADN? huy ®éng ®−îc ARN polymerase tíi promoter lac.
5.2.2.4. CAP vµ LacI liªn kÕt ADN qua c¸c mÉu h×nh (motif) c¬ b¶n
C¸c nghiªn cøu cÊu tróc cña c¸c protein ®iÒu hßa ë vi khuÈn (bao gåm CAP vµ
LacI) cho thÊy, xÐt vÒ chi tiÕt c¸c protein nµy kh¸c nhau vÒ c¸ch ho¹t ®éng. Nh−ng, c¸ch
nhËn biÕt tr×nh tù ADN ®Æc hiÖu cña chóng th× t−¬ng ®èi gièng nhau.
Trong tr−êng hîp ®iÓn h×nh, c¸c protein ®iÒu hßa th−êng gåm hai chuçi polypeptide
gièng nhau. T−¬ng øng víi chóng, tr×nh tù liªn kÕt trªn ADN th−êng lµ c¸c tr×nh tù
ng¾n, lÆp l¹i ®¶o chiÒu (h×nh 5.5b). Mçi chuçi polypeptide cña protein ®iÒu hßa liªn kÕt
víi mét bªn cña ®o¹n tr×nh tù ADN nhËn biÕt. §Ó liªn kÕt vµo ADN, protein ®iÒu hßa
th−êng dïng cÊu tróc bËc 2 phæ biÕn lµ “xo¾n – uèn – xo¾n” vµ cµi mét chuçi xo¾n α vµo
khe chÝnh cña ph©n tö ADN sîi kÐp (h×nh 5.7a). Nh− nªu ë ch−¬ng 1, nhê cÊu h×nh t−¬ng
®ång nh− vËy, c¸c axit amin trªn bÒ mÆt ph©n tö protein cã thÓ t−¬ng t¸c ®−îc víi c¸c
gèc thuéc c¸c baz¬ nit¬. Sù t−¬ng t¸c nµy cã thÓ th«ng qua c¸c liªn kÕt hydro (trùc tiÕp
hoÆc gi¸n tiÕp qua c¸c ph©n tö n−íc), hoÆc bëi lùc Van de Van. §Æc ®iÓm cña nh÷ng liªn
kÕt nµy trong t−¬ng t¸c protein-ADN ®· ®−îc nªu ë ch−¬ng 1. H×nh 5.7b minh häa mét
vÝ dô vÒ sù t−¬ng t¸c gi÷a mét protein víi tr×nh tù ADN ®Æc hiÖu qua khe chÝnh.
143
§inh §oµn Long
144
Ch−¬ng 5. gen vµ sù ®iÒu hoµ biÓu hiÖn gen
tù ADN n»m ngoµi promoter (võa nªu trªn). Ngoµi ra, ®«i khi protein ®iÒu hßa sau khi
liªn kÕt cã thÓ vÆn xo¾n tr×nh tù ADN t¹i promoter theo chiÒu ngang trôc chuçi xo¾n.
Ph¶i nãi thªm r»ng, kh«ng ph¶i mäi protein ®iÒu hßa ë prokaryote ®Òu liªn kÕt
ADN bëi cÊu tróc “xo¾n-uèn-xo¾n”. Ch¼ng h¹n nh−, protein øc chÕ Arc ë phag¬ P22
(phag¬ nµy g©y nhiÔm ë Salmonella), còng dïng cÊu tróc protein kÐp (dimer) cña nã ®Ó
liªn kÕt vµo operator cã cÊu tróc lÆp l¹i ®¶o chiÒu, nh−ng nã kh«ng dïng chuçi xo¾n α ®Ó
cµi vµo phÇn khe chÝnh cña ADN, mµ thay vµo ®ã lµ sö dông cÊu tróc mÆt ph¼ng β.
5.2.2.5. CAP vµ LacI ®−îc c¸c ph©n tö tÝn hiÖu ®iÒu khiÓn theo qui t¾c dÞ h×nh
Khi lactose ®−îc permease vËn chuyÓn vµo trong tÕ bµo, nã ®−îc β-galactosidase
chuyÓn hãa thµnh allolactose. ChÝnh allolactose ®iÒu hßa sù tæng hîp LacI. Mét c©u hái
®Æt ra lµ: d−êng nh− lóc nµy operon Lac ch−a ®−îc ho¹t hãa, vËy β-galactosidase ë ®©u
mµ cã?
C©u tr¶ lêi lµ: sù ®iÒu hßa øc chÕ operon Lac cã “kÏ hë”. Ngay c¶ khi operon Lac ë
tr¹ng th¸i bÞ øc chÕ, th× vÉn lu«n cã mét Ýt ph©n tö mARN cña c¸c gen cÊu tróc ®−îc
phiªn m·. Së dÜ nh− vËy lµ do sù liªn kÕt cña ARN polymerase còng nh− cña c¸c protein
®iÒu hßa kh¸c vµo ADN lµ nh÷ng liªn kÕt yÕu, nghÜa lµ chóng ®−îc h×nh thµnh vµ ph¸ vì
ë møc c©n b»ng (xem ch−¬ng 1). Do ®ã, lu«n cã mét Ýt ph©n tö ARN polymerase cã thÓ
liªn kÕt ®−îc vµo promoter vµ tiÕn hµnh phiªn m· c¸c gen cÊu tróc. “KÏ hë” nµy gióp tÕ
bµo lu«n duy tr× ®−îc mét l−îng nhá β-galactosidase vµ permease, ngay c¶ khi m«i
tr−êng kh«ng cã lactose. §iÒu nµy gi¶i thÝch t¹i sao ngay khi cã lactose, lactose cã thÓ
®−îc vËn chuyÓn ngay vµo tÕ bµo vµ chuyÓn hãa thµnh allolactose ®Ó kÝch øng ho¹t ®éng
cña operon.
Allolactose liªn kÕt vµo LacI vµ lµm thay ®æi cÊu h×nh cña protein øc chÕ nµy, dÉn
®Õn sù “láng lÎo” trong liªn kÕt gi÷a nã vµ operator, vµ lacI “rêi khái” promoter; c¸c
ph©n tö LacI tù do kh¸c nÕu ®· liªn kÕt víi allolactose th× hÇu nh− kh«ng cã ¸i lùc víi
ADN. Lóc nµy, c¸c gen cÊu tróc cña operon Lac ®−îc “gi¶i nÐn”. Ch−¬ng 1 ®· ®Ò cËp
®Õn sù thay ®æi dÞ h×nh cña LacI víi ®Æc ®iÓm miÒn liªn kÕt allolactose n»m ngoµi miÒn
liªn kÕt ADN.
Ho¹t ®éng cña CAP ®−îc ®iÒu hßa bëi mét c¬ chÕ t−¬ng tù, trong ®ã ph©n tö cAMP
lµ ph©n tö kÝch øng dÞ h×nh cña CAP. NghÜa lµ, chØ khi cAMP liªn kÕt víi CAP, th×
protein nµy míi cã cÊu h×nh phï hîp ®Ó liªn kÕt víi ADN. MÆt kh¸c, trong tÕ bµo E. coli,
nång ®é cAMP cã t−¬ng quan nghÞch víi l−îng glucose cã trong m«i tr−êng. Nãi c¸ch
kh¸c, khi nång ®é glucose cao th× nång ®é cAMP thÊp vµ ng−îc l¹i. Së dÜ nh− vËy lµ do
c¸c ph©n tö glucose khi ®−îc vËn chuyÓn vµo trong tÕ bµo th−êng ®−îc phosphoryl hãa
bëi hÖ thèng phosphoryl hãa phô thuéc vµo PEP (phosphoenolpyruvate). HÖ thèng nµy
®−îc gäi t¾t lµ PTS (PEP-dependent phosphotransferase system, h×nh 5.9). Khi m«i
tr−êng cã glucose, protein xuyªn mµng EIIIg (®−îc phosphoryl hãa bëi PEP) sÏ chuyÓn
nhãm phosphat cho glucose ®Ó h×nh thµnh glucose-6-phosphate (nhê vËy, glucose sau khi
®· vµo tÕ bµo kh«ng thÓ bÞ vËn chuyÓn ng−îc trë l¹i). Nh−ng khi m«i tr−êng kh«ng cã
glucose, EIIIg sÏ ho¹t hãa enzym adenylate cyclase. §Õn l−ît m×nh, enzym nµy xóc t¸c
chuyÓn hãa ATP thµnh cAMP vµ lµm t¨ng nång ®é chÊt nµy trong tÕ bµo. Nh− vËy, khi
m«i tr−êng kh«ng cã glucose, nång ®é cAMP t¨ng cao, lµm t¨ng sù h×nh thµnh phøc hÖ
CAP-cAMP. Lóc nµy, CAP liªn kÕt m¹nh víi operon Lac vµ ho¹t hãa sù biÓu hiÖn cña
operon nµy. §iÒu ®¸ng chó ý lµ vÞ trÝ liªn kÕt víi cAMP cña CAP kh«ng n»m trong vïng
liªn kÕt ADN cña protein nµy.
145
§inh §oµn Long
Operon Lac lµ m« h×nh ®−îc hai nhµ sinh häc ng−êi Ph¸p lµ Francois Jacob vµ
Jacques Monod ®−a ra n¨m 1961 ®Ó chøng minh cho c¬ chÕ ®iÒu hßa ho¹t ®éng gen. Víi
c«ng tr×nh nµy, hai nhµ khoa häc ®· ®−îc trao gi¶i th−ëng Nobel y häc vµo n¨m 1965.
5.2.2.6. CAP ®iÒu khiÓn ®ång thêi nhiÒu gen theo kiÓu ®iÒu hßa tæ hîp
Operon Lac lµ mét vÝ dô vÒ c¬ chÕ ®iÒu hßa theo kiÓu tÝch hîp tÝn hiÖu. NghÜa lµ,
sù biÓu hiÖn cña c¸c gen ®−îc ®iÒu hßa ®ång thêi bëi hai ph©n tö tÝn hiÖu lµ allolactose
vµ cAMP qua hai protein ®iÒu hßa t−¬ng øng lµ LacI vµ CAP.
ë E. coli, cã mét operon kh¸c, lµ operon Gal, m· hãa cho c¸c enzym chuyÓn hãa
galactose. Operon nµy ho¹t ®éng khi trong m«i tr−êng cã galactose vµ kh«ng cã glucose.
Gièng nh− operon Lac, operon Gal còng ®−îc ®iÒu hßa bëi hai tÝn hiÖu, th«ng qua mét
protein ho¹t hãa vµ mét protein øc chÕ. Protein øc chÕ, do gen galR m· hãa, ®−îc ®iÒu
khiÓn bëi chÊt kÝch øng galactose, vµ protein ho¹t hãa ë ®©y mét lÇn n÷a lµ CAP. §iÒu
nµy cho thÊy CAP cã thÓ ®ång thêi ®iÒu khiÓn nhiÒu gen kh¸c nhau. KiÓu ®iÒu hßa nh−
vËy ®−îc gäi lµ ®iÒu hßa tæ hîp. Trong thùc tÕ, ë E. coli, CAP tham gia ®iÒu hßa ®ång
thêi sù biÓu hiÖn cña trªn 100 gen kh¸c nhau. Qua ph−¬ng thøc ®iÒu hßa tæ hîp, mét
ph©n tö tÝn hiÖu cã thÓ ®ång thêi tham gia ®iÒu khiÓn nhiÒu gen kh¸c nhau. Nh−ng, sù
®iÒu hßa cña mçi gen vÉn cã tÝnh ®Æc tr−ng bëi sù xuÊt hiÖn c¸c ph©n tö tÝn hiÖu ®Æc thï
cña nã (vÝ dô nh−, víi operon Lac lµ allolactose). Vµ, trong hÇu hÕt tr−êng hîp, c¸c ph©n
tö tÝn hiÖu chØ t−¬ng t¸c víi mét protein ®iÒu hßa riªng cña nã. ë phÇn sau, chóng ta sÏ
thÊy sù “tÝch hîp tÝn hiÖu” vµ “®iÒu hßa tæ hîp” ë eukaryote cßn phæ biÕn vµ linh ho¹t h¬n.
5.2.2.7. C¸c yÕu tè σ thay thÕ vµ sù “lËp tr×nh” biÓu hiÖn theo thø tù cña c¸c gen
ë ch−¬ng 3, chóng ta biÕt r»ng ARN polymerase nhËn biÕt ®−îc promoter lµ nhê
yÕu tè σ (sigma). Promoter lac còng nh− phÇn lín c¸c promoter kh¸c ë E. coli ®−îc
nhËn biÕt bëi ARN polymerase mang yÕu tè σ70. Nh−ng, ngoµi σ70, E. coli cßn cã mét sè
yÕu tè σ kh¸c (gäi lµ c¸c yÕu tè σ thay thÕ). Chóng ho¹t ®éng ë c¸c nhãm promoter ®Æc
thï riªng, v× vËy chØ khi cã mÆt chóng, ARN polymerase míi ®−îc huy ®éng ®Õn nh÷ng
promoter nµy.
Mét trong nh÷ng yÕu tè σ nh− vËy lµ yÕu tè σ sèc nhiÖt (σ32). Khi tÕ bµo E. coli gÆp
®iÒu kiÖn sèc nhiÖt, th× σ32 ®−îc tæng hîp m¹nh trong tÕ bµo; yÕu tè nµy thay thÕ σ70
trong thµnh phÇn ARN polymerase. C¸c ARN polymerase mang yÕu tè σ32 ®−îc huy ®éng
®Õn promoter thuéc c¸c gen vµ s¶n phÈm cña chóng cã vai trß b¶o vÖ tÕ bµo khái t¸c ®éng
cña c¸c yÕu tè sèc nhiÖt. L−îng σ32 trong tÕ bµo t¨ng lªn nhê hai c¬ chÕ. Mét lµ, sù t¨ng
146
Ch−¬ng 5. gen vµ sù ®iÒu hoµ biÓu hiÖn gen
c−êng dÞch m·, nghÜa lµ khi cã hiÖn t−îng sèc nhiÖt, ph©n tö mARN m· hãa σ32 ®−îc dÞch
m· víi hiÖu suÊt cao h¬n tr−íc. Hai lµ, ®é bÒn cña s¶n phÈm protein t¨ng lªn. Mét vÝ dô
kh¸c vÒ yÕu tè σ thay thÕ lµ σ54. YÕu tè σ54 nµy liªn quan ®Õn ho¹t ®éng cña ARN
polymerase tiÕn hµnh phiªn m· c¸c gen tham gia xóc t¸c sù chuyÓn hãa nit¬.
C¸c yÕu tè σ thay thÕ còng cã thÓ ®−îc sö dông trong viÖc “lËp tr×nh” biÓu hiÖn cña
nhiÒu gen theo mét trËt tù nhÊt ®Þnh. Ch¼ng h¹n nh−, hiÖn t−îng nµy xuÊt hiÖn trong
qu¸ tr×nh ph¸t sinh bµo tö ë vi khuÈn Bacillus subtilis hay trong qu¸ tr×nh g©y nhiÔm
cña phag¬ ë vi khuÈn nµy. Phag¬ SPO1 g©y nhiÔm vµ g©y tan vi khuÈn B. subtilis. Sù
g©y tan nµy ®ßi hái phag¬ ph¶i biÓu hiÖn c¸c gen cña nã theo mét trËt tù rÊt nghiªm
ngÆt. TrËt tù nµy ®−îc “lËp tr×nh” b»ng viÖc sö dông mét sªri (chuçi) c¸c yÕu tè σ thay
thÕ. Ban ®Çu, khi míi g©y nhiÔm, ARN polymerase cña vi khuÈn (mang yÕu tè σ70) sÏ chØ
nhËn ra c¸c promoter “sím” cña phag¬ vµ tiÕn hµnh phiªn m· c¸c gen m· hãa c¸c protein
cÇn thiÕt cho giai ®o¹n “sím” cña sù g©y nhiÔm. Trong sè nh÷ng gen ®−îc biÓu hiÖn sím,
cã mét gen m· hãa cho mét yÕu tè σ thay thÕ (gäi lµ gen 28). YÕu tè σ nµy cã thÓ ®Èy yÕu
tè σ70 cña vi khuÈn khái ARN polymerase vµ huy ®éng enzym nµy tíi mét nhãm promoter
thø hai cña phag¬. Nh÷ng promoter nµy thuéc nh÷ng gen ®−îc biÓu hiÖn ë giai ®o¹n
“gi÷a”. Mét trong nh÷ng gen biÓu hiÖn ë giai ®o¹n “gi÷a” l¹i m· hãa cho mét yÕu tè σ
kh¸c lµm nhiÖm vô huy ®éng ARN polymerase tíi c¸c promoter cña c¸c gen ®−îc biÓu
hiÖn “muén”. Cø nh− vËy, c¸c nhãm gen ®−îc biÓu hiÖn theo mét trËt tù nhÊt ®Þnh.
5.2.2.8. NtrC vµ MerR lµ c¸c protein ho¹t hãa phiªn m· theo qui t¾c dÞ h×nh
ë trªn, chóng ta thÊy phÇn lín protein ho¹t hãa phiªn m· ë prokaryote ho¹t ®éng
theo kiÓu huy ®éng ARN polymerase ®Õn promoter. Tuy vËy, còng cã c¸c tr−êng hîp
ngo¹i lÖ. Hai vÝ dô sau ®©y cho thÊy protein ho¹t hãa kh«ng ho¹t ®éng theo c¬ chÕ huy
®éng ARN polymerase, mµ thay vµo ®ã chóng sö dông qui t¾c dÞ h×nh. §ã lµ c¸c yÕu tè
ho¹t hãa NtrC vµ MerR. Tr−íc tiªn, chóng ta cÇn ph©n biÖt sù kh¸c nhau gi÷a hai c¬
chÕ “huy ®éng ARN polymerase” vµ “qui t¾c dÞ h×nh”. Trong c¬ chÕ thø nhÊt, c¸c protein
ho¹t hãa “thu hót” ARN polymerase tíi promoter; cßn ë c¬ chÕ thø hai, ARN
polymerase th−êng liªn kÕt s½n víi promoter nh−ng kh«ng ho¹t ®éng. Enzym nµy chØ
trë nªn ho¹t ®éng sau khi ®Ýnh kÕt víi protein ho¹t hãa vµ thay ®æi cÊu h×nh cña nã theo
qui t¾c dÞ h×nh.
NtrC ®iÒu khiÓn sù phiªn m· c¸c gen chuyÓn hãa nit¬, bao gåm glnA. T¹i gen glnA,
ARN polymerase liªn kÕt s½n vµo promoter nh−ng chØ ë d¹ng phøc hÖ khëi ®Çu phiªn m·
“®ãng”. Protein ho¹t hãa NtrC sau khi liªn kÕt vµo enzym lµm thay ®æi cÊu h×nh kh«ng
gian cña enzym vµ chuyÓn phøc hÖ khëi ®Çu phiªn m· “®ãng” sang tr¹ng th¸i “më”. Sù
ho¹t hãa ë ®©y dùa trªn sù thay ®æi dÞ h×nh cña enzym ARN polymerase.
MerR lµ protein ho¹t hãa gen merT. Gen nµy m· hãa enzym gióp tÕ bµo gi¶i ®éc
thñy ng©n. Còng gièng nh− NtrC, MerR kÝch øng sù thay ®æi cÊu h×nh cña phøc hÖ
promoter - ARN polymerase vµ chuyÓn chóng tõ tr¹ng th¸i “®ãng” sang “më”. Nh−ng
kh¸c víi NtrC, MerR lµm thay ®æi cÊu h×nh cña ADN (chø kh«ng ph¶i cña ARN
polymerase).
147
§inh §oµn Long
phÝa ®Çu 5’. T¹i mçi vÞ trÝ, NtrC liªn kÕt bëi mét cÊu tróc dimer, vµ th«ng qua t−¬ng t¸c
protein-protein gi÷a c¸c dimer, bèn ph©n tö NtrC liªn kÕt víi nhau theo kiÓu hîp lùc.
D¹ng ARN polymerase phiªn m· gen glnA chøa tiÓu phÇn σ54. Khi kh«ng cã NtrC,
enzym nµy liªn kÕt bÒn v÷ng víi glnA, nh−ng ë d¹ng phøc hÖ “®ãng”. Khi ë tr¹ng th¸i
ho¹t ®éng, NtrC (c¸ch promoter 150 bp) t−¬ng t¸c víi yÕu tè σ54 cña ARN polymerase. §Ó
cã ®−îc sù t−¬ng t¸c nµy, mét “vßng th¾t” ADN (cã kÝch th−íc kho¶ng 150 kb) ®−îc h×nh
thµnh (h×nh 5.10). Thùc
nghiÖm cho thÊy, NtrC cã thÓ
ho¹t hãa ®−îc gen glnA ngay NtrC
c¶ khi vÞ trÝ liªn kÕt ADN cña
nã c¸ch promoter ®Õn 1 - 2 kb. ARN polymerase
®©y, NtrC ®−îc minh häa nh− mét protein d¹ng phøc kÐp (dimer), nh−ng
nã chuyÓn phøc hÖ khëi ®Çu
thùc tÕ d¹ng phøc cña nã phøc t¹p h¬n.
phiªn m· tõ tr¹ng th¸i “®ãng”
(kh«ng ho¹t ®éng), sang “më”
(ho¹t ®éng).
5.2.2.10. MerR ho¹t hãa phiªn m· b»ng viÖc “vÆn xo¾n” ®o¹n promoter
Khi m«i tr−êng cã thñy ng©n (Hg2+), MerR ho¹t hãa gen merT. H×nh 5.11 cho thÊy
protein nµy liªn kÕt vµo c¸c vÞ trÝ “-10” vµ “-35” cña promoter merT (ARN polymerase
phiªn m· gen nµy mang σ70). MerR liªn kÕt vµo promoter qua mÆt ®èi diÖn víi mÆt liªn
kÕt cña ARN polymerase. Nhê vËy, c¶ ARN polymerase vµ MerR cã thÓ cïng liªn kÕt ®−îc
víi promoter. Promoter merT cã ®Æc ®iÓm lµ: ®o¹n tr×nh tù gi÷a hai vÞ trÝ “-10” vµ “-35” cã
19 bp (hÇu hÕt c¸c promoter kh¸c ho¹t ®éng víi σ70-ARN polymerase cã chiÒu dµi 15 – 17
bp). Do vËy, yÕu tè σ70 kh«ng ®ång thêi trùc diÖn ®−îc víi hai vÞ trÝ “-10” vµ “-35”, dÉn ®Õn
ARN polymerase th−êng chØ liªn kÕt “láng lÎo” víi promoter nµy. Ngoµi ra, khi kh«ng cã
Hg2+, MerR liªn kÕt vµo promoter, t¹o nªn cÊu h×nh kh«ng thuËn lîi cho sù liªn kÕt vµo
promoter cña ARN polymerase, a)
vµ sù phiªn m· kh«ng diÔn ra. MerT
148
Ch−¬ng 5. gen vµ sù ®iÒu hoµ biÓu hiÖn gen
§iÒu ®¸ng chó ý ë ®©y lµ ®Ó ho¹t hãa phiªn m·, protein MerR kh«ng t−¬ng t¸c víi
ARN polymerase; thay vµo ®ã, nã lµm thay ®æi cÊu h×nh cña ADN ®Ó ARN polymerase cã
thÓ liªn kÕt vµo. Mét ®iÓm n÷a lµ, ë MerR kh«ng cã hai miÒn liªn kÕt ADN víi miÒn ho¹t
hãa riªng biÖt. Thay vµo ®ã MerR liªn kÕt trùc tiÕp vµo ADN vµ ho¹t hãa phiªn m·.
5.2.2.11. Mét sè chÊt øc chÕ phiªn m· theo kiÓu "gi÷" ARN polymerase t¹i promoter
LacI øc chÕ sù biÓu hiÖn cña operon Lac theo mét c¬ chÕ rÊt ®¬n gi¶n lµ nã liªn kÕt
vµo mét tr×nh tù n»m gèi lªn promoter, lµm ARN polymerase kh«ng liªn kÕt ®−îc vµo vÞ
trÝ nµy. NhiÒu chÊt øc chÕ phiªn m· còng ho¹t ®éng theo c¬ chÕ t−¬ng tù. Nh−ng, còng cã
mét sè chÊt øc chÕ phiªn m· cã c¬ chÕ ho¹t ®éng kh¸c. Ch¼ng h¹n nh− mét sè protein øc
chÕ cã vÞ trÝ liªn kÕt hoµn toµn ë ngoµi promoter. V× vËy, thùc tÕ chóng kh«ng trùc tiÕp
ng¨n c¶n ARN polymerase liªn kÕt vµo promoter. Nh−ng, thay vµo ®ã, chóng liªn kÕt víi
ARN polymerase, lµm ®o¹n ADN ë gi÷a vÞ trÝ liªn kÕt cña protein øc chÕ vµ promoter
h×nh thµnh cÊu tróc “vßng th¾t”. Víi cÊu tróc nµy gen kh«ng ®−îc biÓu hiÖn, mÆc dï
ARN polymerase ®−îc gi÷ t¹i promoter. VÝ dô vÒ kiÓu ®iÒu hßa nµy lµ protein øc chÕ biÓu
hiÖn cña gen Gal ®· ®−îc nªu ë môc 5.2.2.6 trªn ®©y.
5.2.2.12. AraC vµ sù ®iÒu hßa operon araBAD b»ng c¬ chÕ chèng ho¹t hãa
Operon araBAD ë E. coli (gåm c¸c gen tham gia chuyÓn hãa ®−êng arabinose)
®−îc ho¹t hãa khi m«i tr−êng cã arabinose vµ kh«ng cã glucose. Lóc nµy, operon cã hai
protein ®iÒu hßa cïng ho¹t ®éng lµ AraC vµ CAP. Khi m«i tr−êng cã arabinose, AraC
liªn kÕt víi ®−êng nµy vµ cã cÊu h×nh phï hîp ®Ó liªn kÕt víi ADN t¹i hai vÞ trÝ araI1 vµ
araI2 (h×nh 5.12). N»m phÝa tr−íc c¸c vÞ trÝ nµy lµ vÞ trÝ liªn kÕt cña CAP (kh«ng vÏ trªn
h×nh). Gièng nh− ë operon Lac, khi kh«ng cã glucose, phøc hÖ CAP-cAMP liªn kÕt vµo vÞ
trÝ liªn kÕt CAP vµ thóc ®Èy sù phiªn m· cña ARN polymerase.
Khi m«i tr−êng kh«ng cã arabinose, operon araBAD kh«ng biÓu hiÖn, bëi lóc nµy
AraC cã mét d¹ng cÊu h×nh kh¸c vµ nã liªn kÕt víi ADN theo mét kiÓu kh¸c. Cô thÓ lµ,
mét tiÓu phÇn AraC liªn kÕt vµo vÞ trÝ araI1, nh−ng tiÓu phÇn thø hai liªn kÕt vµo mét vÞ
trÝ kh¸c c¸ch vÞ trÝ ®Çu tiªn 194 bp, gäi lµ araO2. Lóc nµy, mét “vßng th¾t” ADN ®−îc
h×nh thµnh gi÷a araI1 vµ araO2. §ång thêi, do thiÕu AraC liªn kÕt ë vÞ trÝ araI2, nªn
araO2 I1 I2
araPBAD
araI
b) Khi m«i tr−êng kh«ng cã arabinose araO2
I1 I2
H×nh 5.12. Sù ®iÒu khiÓn operon araBAD. a) Arabinose liªn kÕt vµo araC, lµm thay ®æi cÊu h×nh protein ho¹t hãa
nµy vµ nã liªn kÕt vµo c¸c vÞ trÝ araI1 vµ araI2. Nhê mét tiÓu phÇn cña araC gÇn ARN polymerase nªn gen ®−îc ho¹t
hãa phiªn m·. b) Khi kh«ng cã arabinose, phøc hÖ kÐp araC cã cÊu h×nh kiÓu kh¸c vµ nã liªn kÕt vµo c¸c vÞ trÝ araO2
vµ araI1. Lóc nµy, protein araC kh«ng ho¹t hãa ®−îc promoter araPBAD. Promoter nµy còng ®−îc ho¹t hãa bëi CAP
(nh−ng kh«ng ®−îc minh häa ë ®©y).
149
§inh §oµn Long
promoter kh«ng cã cÊu h×nh phï hîp cho sù khëi ®Çu phiªn m·. KÕt qu¶ lµ gen kh«ng
biÓu hiÖn.
HiÖu qu¶ kÝch øng biÓu hiÖn gen cña arabinose qua promoter araBAD lµ rÊt
m¹nh. V× vËy, promoter nµy ®−îc dïng lµm thµnh phÇn cña nhiÒu vect¬ biÓu hiÖn trong
kÜ thuËt di truyÒn. C¸c vect¬ biÓu hiÖn lµ cÊu tróc ADN ®¶m b¶o cho sù tæng hîp hiÖu qu¶
mét protein nµo ®ã, khi gen cña nã ®−îc “cµi” vµo vect¬ bªn c¹nh mét “promoter” m¹nh.
Khi sö dông vect¬ biÓu hiÖn chøa promoter araBAD, gen sÏ kh«ng ®−îc biÓu hiÖn cho ®Õn
khi bæ sung arabinose vµo trong m«i tr−êng. HÖ thèng biÓu hiÖn nµy thËm chÝ cho phÐp
biÓu hiÖn c¸c gen mµ s¶n phÈm cña chóng g©y ®éc víi tÕ bµo vi khuÈn.
5.2.3.1. C¸c operon sinh tæng hîp axit amin ®−îc ®iÒu khiÓn bëi c¬ chÕ phiªn m· kh«ng
hoµn chØnh (phiªn m· dë)
ë vi khuÈn E. coli, operon Trp gåm 5 gen n»m kÕ tiÕp nhau m· hãa cho c¸c enzym
tham gia tæng hîp axit amin tryptophan (Trp). C¸c gen nµy chØ ®−îc biÓu hiÖn m¹nh khi
l−îng Trp trong tÕ bµo lµ thÊp (h×nh 5.13). Operon Trp ®−îc ®iÒu khiÓn bëi protein øc
chÕ trpR theo kiÓu gièng víi LacI ë operon Lac. Tuy vËy, ë operon Trp, ph©n tö c¶m
øng (tryptophan) kh«ng ho¹t ®éng nh− mét chÊt kÝch øng, mµ lµ chÊt ®ång øc chÕ.
NghÜa lµ, khi m«i tr−êng d− thõa tryptophan, chÊt nµy sÏ liªn kÕt víi trpR vµ lµm thay
®æi cÊu h×nh protein nµy, gióp nã liªn kÕt ®−îc víi tr×nh tù ®iÒu hµnh (operator) vµ ng¨n
c¶n sù phiªn m·. Khi nång ®é Trp thÊp, chÊt øc chÕ trpR ®−îc gi¶i phãng vµ kh«ng liªn
kÕt ®−îc víi operator. Nhê vËy, sù phiªn m· gen cã thÓ diÔn ra.
Nh−ng, mét ®iÒu thó vÞ ë operon Trp lµ ngay c¶ khi ARN polymerase ®· khëi ®Çu
phiªn m·, th× kh«ng cã nghÜa lµ b¶n phiªn m· (mARN) ®Çy ®ñ sÏ ch¾c ch¾n ®−îc t¹o ra.
Trong thùc tÕ, phÇn lín c¸c b¶n phiªn m· ®−îc kÕt thóc sím, tr−íc khi tiÕp cËn ®−îc gen
®Çu tiªn (trpE), trõ khi cã “mét hÖ thèng ®iÒu hßa thø hai” cho biÕt tÕ bµo chØ cßn Ýt Trp.
“HÖ thèng ®iÒu hßa thø hai” nµy ®−îc gäi lµ sù phiªn m· kh«ng hoµn chØnh (cßn
®−îc gäi lµ sù kÕt thóc phiªn m· sím, hay c¬ chÕ phanh h·m). Khi nång ®é Trp cao,
enzym ARN polymerase (®· khëi ®Çu phiªn m·) sÏ dõng l¹i ë mét vÞ trÝ ®Æc biÖt, råi kÕt
thóc phiªn m· tr−íc khi tiÕp cËn ®−îc gen trpE. Nh−ng khi nång ®é Trp thÊp, ARN
polymerase sÏ kh«ng dõng l¹i mµ tiÕp tôc “®äc” ®Ó phiªn m· c¸c gen cÊu tróc cña operon.
C¬ chÕ ®iÒu hßa nµy x¶y ra ®−îc lµ nhê ë vi khuÈn, sù phiªn m· vµ dÞch m· th−êng x¶y
ra ®ång thêi, vµ ARN cã thÓ cã mét sè cÊu tróc ®Æc biÖt do sù t−¬ng t¸c néi ph©n tö gi÷a
c¸c nucleotide.
§iÓm mÊu chèt ®Ó hiÓu ®−îc c¬ chÕ ®iÒu hßa qua kÕt thóc phiªn m· sím lµ cÊu tróc
phÇn gÇn ®Çu 5’ cña ph©n tö mARN ®−îc phiªn m· tõ operon Trp. Ph©n tö mARN nµy cã
mét tr×nh tù dÉn ®Çu (ë ®Çu 5’ vµ kh«ng ph¶i tr×nh tù m· hãa) gåm 161 m· bé ba
(codon), n»m gi÷a promoter vµ gen trpE. §o¹n tr×nh tù nµy chøa 4 vïng: vïng I gåm c¸c
nucleotide tõ 50 ®Õn 68, vïng II gåm c¸c nucleotide tõ 75 ®Õn 92, vïng III gåm c¸c
nucleotide tõ 108 ®Õn 121 vµ vïng IV lµ c¸c nucleotide tõ 125 ®Õn 132. Sau vïng IV lµ
mét ®o¹n tr×nh tù gåm 8 nucleotide Uracil liªn tiÕp (gäi lµ tr×nh tù polyU), kÕt thóc ë
nucleotide sè 140 (h×nh 5.13b). Bèn vïng cÊu tróc nµy cã mét tÝnh chÊt ®Æc biÖt lµ: vïng
I vµ vïng II cã thÓ t¹o liªn kÕt bæ sung (liªn kÕt Chargaff) víi nhau; liªn kÕt bæ sung nµy
còng cã thÓ x¶y ra gi÷a vïng II vµ III, còng nh− gi÷a vïng III vµ IV. Víi tÝnh chÊt nh−
vËy, ®o¹n dÉn ®Çu cña ph©n tö mARN cã ®Æc ®iÓm lµ: khi vïng I liªn kÕt víi vïng II, th×
vïng III liªn kÕt víi vïng IV. Lóc nµy, ®o¹n tr×nh tù dÉn ®Çu trªn ph©n tö mARN cã
d¹ng cÊu tróc cÆp tãc kÐp (h×nh 5.13b vµ d). Nh−ng nÕu vïng I kh«ng liªn kÕt ®−îc
víi vïng II, th× vïng II liªn kÕt víi vïng III, vµ lóc nµy c¶ vïng I vµ IV ë tr¹ng th¸i tù
150
Ch−¬ng 5. gen vµ sù ®iÒu hoµ biÓu hiÖn gen
do, kh«ng liªn kÕt. Trong tr−êng hîp nµy, ®o¹n tr×nh tù dÉn ®Çu cã d¹ng cÊu tróc cÆp
tãc ®¬n (h×nh 5.13b vµ c).
a) CÊu tróc operon Trp
§o¹n dÉn ®Çu
trpE trpD trpC trpB trpA
Operator
Promoter
b) Tr×nh tù bèn vïng ®iÒu khiÓn thuéc ®o¹n dÉn ®Çu trªn mARN
D¹ng cÆp tãc ®¬n h×nh D¹ng cÆp tãc kÐp
thµnh khi vïng II vµ III h×nh thµnh khi
liªn kÕt víi nhau vïng I liªn kÕt
víi vïng II,
II vµ vïng III
2 bé ba liªn kÕt víi
m· hãa III vïng IV
Trp I
IV
Bé ba m·
kÕt thóc
c) §o¹n dÉn ®Çu khi m«i tr−êng thiÕu tryptophan – Operon Trp ®−îc biÓu hiÖn
Ribosome
Ribosome dõng ë ®©y
dõng ë ®©y
d) §o¹n dÉn ®Çu khi m«i tr−êng d− thõa tryptophan – Operon Trp kh«ng biÓu hiÖn
H×nh 5.13. §iÒu hßa phiªn mX ë operon Trp. a) CÊu tróc operon Trp, víi operator (vÞ trÝ liªn kÕt cña
protein øc chÕ trpR) n»m trong promoter. b) Bèn vïng (I, II, III vµ IV) thuéc ®o¹n dÉn ®Çu cã thÓ h×nh thµnh
hoÆc cÊu tróc cÆp tãc ®¬n (tr¸i) hoÆc cÆp tãc kÐp (ph¶i). c) Khi m«i tr−êng thiÕu trytophan, cÊu tróc cÆp tãc
®¬n h×nh thµnh, sù phiªn m· diÔn ra hoµn chØnh vµ c¸c gen cÊu tróc (trpE, trpD, trpC, trpB vµ trpA) ®−îc biÓu
hiÖn. d) Khi m«i tr−êng d− thõa tryptophan, cÊu tróc cÆp tãc kÐp h×nh thµnh, sù phiªn m· kÕt thóc sím vµ c¸c
gen cÊu tróc kh«ng ®−îc biÓu hiÖn (theo Peter Paolella, 1998).
151
§inh §oµn Long
Mét ®iÓm l−u ý n÷a trªn mARN cña operon Trp lµ gi÷a vïng I vµ II cã mét m· bé
ba kÕt thóc (UGA) n»m ë c¸c nucleotide 69 - 71. PhÝa tr−íc nã, cã hai bé ba m· hãa cho
tryptophan (5’-UGGUGG-3’) n»m ë vÞ trÝ tõ nucleotide 54 ®Õn 59. ChÝnh c¸c m· bé ba
nµy cã vai trß quyÕt ®Þnh cho sù kÕt thóc phiªn m· sím (®−îc m« t¶ d−íi ®©y). §Æc ®iÓm
nµy cã ë tr×nh tù dÉn ®Çu cña c¸c operon m· hãa c¸c enzym tham gia tæng hîp nhiÒu lo¹i
axit amin kh¸c, ch¼ng h¹n nh− operon Leu cã 4 bé ba m· hãa Leu liªn tiÕp, operon His cã
7 bé ba m· hãa His liªn tiÕp, operon Val cã 5 bé ba m· hãa Val liªn tiÕp, v.v...
VËy, sù ®iÒu hßa biÓu hiÖn gen bëi c¬ chÕ kÕt thóc phiªn m· sím diÔn ra thÕ nµo?
Chóng ta h·y xem ë m« h×nh operon Trp nh− sau:
- Khi nång ®é Trp trong m«i tr−êng thÊp, Trp (víi vai trß chÊt ®ång øc chÕ) gi¶i
phãng khái phøc hÖ Trp-trpR lµm cho protein øc chÕ nµy kh«ng liªn kÕt ®−îc vµo
operator. Nhê vËy, ARN polymerase cã thÓ liªn kÕt vµo promoter vµ khëi ®Çu phiªn m·.
Sau khi ARN polymerase ®· phiªn m· ®−îc mét ®o¹n mARN dµi kho¶ng 90 nucleotide th×
ribosome g¾n vµo gÇn ®Çu 5’ cña ph©n tö mARN ®ang ®−îc kÐo dµi vµ b¾t ®Çu dÞch m·,
tæng hîp mét chuçi peptide dÉn ®Çu (kh«ng thuéc chuçi polypeptide cña c¸c gen cÊu
tróc). Ribosome sÏ tiÕp tôc tr−ît däc ph©n tö mARN, ®Õn khi nã gÆp hai bé ba m· hãa
Trp (5’-UGGUGG-3’) ë vïng I. C¸c bé ba nµy sÏ chØ ®−îc dÞch m· khi m«i tr−êng cã s½n
Trp vµ c¸c ph©n tö tARNTrp cã thÓ l¾p ghÐp chóng vµo chuçi peptide ®ang kÐo dµi. Nh−ng
v× lóc nµy m«i tr−êng thiÕu Trp, c¸c m· bé ba nµy kh«ng ®−îc dÞch m·. Do ®ã, ribosome sÏ
dõng l¹i ë c¸c m· bé ba m· hãa Trp nµy. ViÖc ribosome dõng l¹i ë vïng I (®o¹n nucleotide
54 - 59) liªn quan ®Õn hai hiÖn t−îng: 1) ARN polymerase vÉn tiÕp tôc tiÕn vÒ phÝa tr−íc
®Ó kÐo dµi chuçi mARN ®ang ®−îc kÐo dµi; 2) ribosome dõng l¹i theo nguyªn t¾c vËt lý mµ
kh«ng rêi khái chuçi mARN, v× ®©y kh«ng ph¶i lµ tÝn hiÖu kÕt thóc dÞch m·. Khi
ribosome dõng l¹i ë c¸c nucleotide 54-59, vïng I sÏ kh«ng liªn kÕt ®−îc víi vïng II. Lóc
nµy, vïng II sÏ liªn kÕt víi vïng III vµ “gi¶i phãng” vïng IV (cÊu tróc cÆp tãc ®¬n). ë ®o¹n
dÉn ®Çu cña ph©n tö mARN ë d¹ng nµy, ARN polymerase tiÕp tôc kÐo dµi chuçi mARN vµ
tiÕp cËn ®−îc gen trpE còng nh− c¸c gen kh¸c cña operon Trp. Nãi c¸ch kh¸c, operon Trp
®−îc ho¹t hãa.
- Khi nång ®é Trp trong m«i tr−êng cao, mét mÆt Trp víi vai trß ®ång øc chÕ, sÏ
liªn kÕt víi protein øc chÕ trpR. Lóc nµy, phøc hÖ Trp-trpR sÏ liªn kÕt vµo operator vµ
ng¨n c¶n ARN polymerase liªn kÕt vµo promoter vµ tiÕn hµnh phiªn m·. Tuy vËy, do “kÏ
hë” cña c¬ chÕ ®iÒu hßa th«ng qua liªn kÕt cña ARN polymerase víi promoter (®· nªu ë
môc 5.2.2.5), mét tØ lÖ nhá ARN polymerase vÉn cã thÓ khëi ®Çu phiªn m·. Sau khi mét
phÇn ph©n tö mARN ®−îc h×nh thµnh, sù dÞch m· chuçi peptide dÉn ®Çu ®−îc b¾t ®Çu
nh− m« t¶ ë trªn. Ribosome sÏ tr−ît däc ph©n tö mARN ®Õn khi gÆp c¸c bé ba m· hãa
Trp ë cuèi vïng I. Nh−ng kh¸c víi tr−êng hîp trªn, lóc nµy do cã s½n tryptophan, c¸c axit
amin nµy ®−îc bæ sung vµo chuçi polypeptide ®ang kÐo dµi. KÕt qu¶ lµ, ribosome sÏ v−ît
qua ®−îc vÞ trÝ c¸c nucleotide 54 - 59 vµ tiÕp cËn ®Õn bé ba m· kÕt thóc (UGA) t¹i c¸c
nucleotide 69 - 71. T¹i ®©y, theo c¬ chÕ kÕt thóc dÞch m· th«ng th−êng (xem ch−¬ng 4),
ribosome rêi khái mARN. Lóc nµy, vïng I sÏ liªn kÕt víi vïng II vµ vïng III liªn kÕt víi
vïng IV, t¹o nªn cÊu tróc cÆp tãc kÐp. Cã mét ®iÓm ®¸ng chó ý lµ cÊu tróc cÆp tãc gi÷a
vïng III vµ IV cã lùc liªn kÕt lín (v× cã nhiÒu liªn kÕt G ≡ C). Lùc liªn kÕt nµy ®ñ ®Ó cã
thÓ ®Èy ph©n tö ARN polymerase ra khái mARN vµ m¹ch ADN lµm khu«n lóc nµy ®ang
tiÕp cËn ®Õn tr×nh tù polyU (nhí r»ng liªn kÕt A = U lµ liªn kÕt yÕu nhÊt trong c¸c liªn
kÕt nucleotide theo nguyªn t¾c bæ sung). ViÖc ARN polymerase t¸ch khái phøc hÖ phiªn
m· sÏ lµm qu¸ tr×nh phiªn m· kÕt thóc sím vµ c¸c gen cÊu tróc (n»m sau ®o¹n tr×nh tù
dÉn ®Çu) kh«ng ®−îc phiªn m·. Sù k×m h·m phiªn m· nh− vËy diÔn ra cho ®Õn khi l−îng
152
Ch−¬ng 5. gen vµ sù ®iÒu hoµ biÓu hiÖn gen
tryptophan trong tÕ bµo gi¶m xuèng ®Õn møc tryptophan trong phøc hÖ øc chÕ Trp-trpR
®−îc ®em ra sö dông, ®ång thêi ribosome sÏ dõng l¹i t¹i c¸c bé ba m· hãa Trp trong qu¸
tr×nh tæng hîp ®o¹n peptide dÉn ®Çu nªu trªn. NghÜa lµ, lóc ®ã operon Trp ®−îc biÓu
hiÖn trë l¹i.
ViÖc kÕt hîp hai c¬ chÕ ®iÒu hßa phiªn m· kiÓu øc chÕ (bëi protein øc chÕ trpR) vµ
phanh h·m (bëi c¬ chÕ kÕt thóc phiªn m· sím) nh− nªu trªn ®−îc vÝ nh− “chiÕt ¸p sinh
häc” cã thÓ “tinh chØnh” l−îng tryptophan trong tÕ bµo. ¦íc tÝnh, c¬ chÕ ®iÒu hßa kiÓu øc
chÕ lµm gi¶m møc ®é biÓu hiÖn gen kho¶ng 70 lÇn, cßn kiÓu k×m h·m lµm gi¶m møc biÓu
hiÖn gen thªm 8 - 10 lÇn n÷a. NghÜa lµ khi ho¹t ®éng, operon Trp cã møc biÓu hiÖn m¹nh
h¬n khi kh«ng ho¹t ®éng kho¶ng 600 lÇn. §èi víi mét sè operon tham gia tæng hîp c¸c
axit amin kh¸c, cã mét ®iÓm ®¸ng nãi lµ cã mét sè operon kh«ng ®−îc ®iÒu hßa theo kiÓu
øc chÕ (kh«ng cã protein øc chÕ), vÝ dô nh− c¸c operon His hay Leu. Thay vµo ®ã, nh÷ng
operon nµy ®−îc ®iÒu hßa ®¬n thuÇn dùa trªn sù kÕt thóc phiªn m· sím. Nh− vËy, kh«ng
ph¶i tÊt c¶ c¸c gen ®Òu cÇn protein ®iÒu hßa ®iÒu khiÓn sù biÓu hiÖn cña chóng.
5.2.3.2. C¸c protein ribosome tù øc chÕ sù biÓu hiÖn c¸c gen m· hãa chóng
C¬ chÕ ®iÒu hßa dÞch m· th−êng ho¹t ®éng theo kiÓu gièng víi sù øc chÕ phiªn m·,
nghÜa lµ mét protein øc chÕ sÏ liªn kÕt vµo vÞ trÝ khëi ®Çu dÞch m· vµ ng¨n c¶n sù dÞch
m·. Trong mét sè tr−êng hîp, sù liªn kÕt liªn quan ®Õn viÖc nhËn ra cÊu tróc bËc 2 ®Æc
thï cña mARN. ë ®©y, chóng ta sÏ xem sù ®iÒu hßa c¸c gen m· hãa cho protein
ribosome.
Sù biÓu hiÖn cña c¸c gen m· hãa protein ribosome cã ý nghÜa quan träng víi mäi tÕ
bµo. Mçi ribosome chøa kho¶ng 50 lo¹i protein kh¸c nhau ®−îc tæng hîp cïng lóc. H¬n
n÷a, tèc ®é biÓu hiÖn cña nh÷ng gen nµy cã liªn hÖ mËt thiÕt víi tèc ®é t¨ng tr−ëng cña
tÕ bµo. Mét thay ®æi nhá trong m«i tr−êng cã thÓ ¶nh h−ëng ®Õn sù tæng hîp c¸c thµnh
phÇn cña ribosome. VËy, c¸c gen nµy ®−îc ®iÒu khiÓn thÕ nµo?
ë E. coli, c¸c gen m· hãa protein ribosome tËp hîp thµnh mét sè operon. Cã operon
chøa tr×nh tù m· hãa ®Õn 11 lo¹i protein ribosome kh¸c nhau. Trong sè nµy, mét sè
operon cßn chøa nh÷ng gen kh¸c cã liªn quan chÆt chÏ víi sù sinh tr−ëng cña tÕ bµo, vÝ
dô nh− c¸c tiÓu phÇn α, β vµ β’ cña ARN polymerase; c¸c yÕu tè kÐo dµi chuçi dÞch m·
EF-G, EF-Tu, v.v... (h×nh 5.14). Còng gièng c¸c operon kh¸c, c¸c operon nµy ®«i khi
®−îc ®iÒu hßa ë b−íc phiªn m·. Nh−ng kiÓu ®iÒu hßa c¬ b¶n nhÊt cña chóng l¹i lµ ë b−íc
dÞch m·. ThÝ nghiÖm sau sÏ m« t¶ sù kh¸c biÖt gi÷a hai c¬ chÕ:
L11 L1
Operon L11
Promoter
L10 L7/12 β β’
Operon β
H×nh 5.14. C¸c operon mX hãa protein ribosome ë E. coli. C¸c protein ribosome ®−îc in ®Ëm (gen cña
nã ®−îc kÝ hiÖu b»ng dÊu chÊm) lµ c¸c protein cã vai trß øc chÕ dÞch m· c¸c operon t−¬ng øng. S lµ c¸c
protein cña tiÓu phÇn nhá ribosome, cßn L lµ cña tiÓu phÇn lín (Nguån: Nomura M et al, 1984).
153
§inh §oµn Long
154
Ch−¬ng 5. gen vµ sù ®iÒu hoµ biÓu hiÖn gen
quan ®Õn c¸c protein ho¹t hãa vµ øc chÕ. ë eukaryote, nh÷ng protein nµy còng lµ nh÷ng
protein liªn kÕt ADN vµ cã vai trß t¨ng c−êng hay øc chÕ sù biÓu hiÖn cña gen (sau khi
chóng tiÕp nhËn tÝn hiÖu tõ m«i tr−êng). Ngoµi kh¸c biÖt vÒ sù c¾t-nèi intron nªu trªn,
cã hai sù kh¸c biÖt næi bËt kh¸c trong ®iÒu hßa biÓu hiÖn gen ë eukaryote so víi
prokaryote, cã thÓ tãm t¾t nh− sau:
1) C¸c cÊu tróc nucleosome (thÓ nh©n) vµ c¸c d¹ng biÓn ®æi cña chóng ¶nh
h−ëng ®Õn sù biÓu hiÖn cña c¸c gen. Chóng ta biÕt r»ng, ADN hÖ gen eukaryote
th−êng ®−îc ®ãng gãi cïng víi c¸c protein histone trong cÊu tróc nucleosome. CÊu tróc
nµy lµm gi¶m (øc chÕ) kh¶ n¨ng biÓu hiÖn cña nhiÒu gen nÕu kh«ng cã sù “hç trî” cña c¸c
protein ho¹t hãa. C¸c tÕ bµo eukaryote th−êng cã mét l−îng lín c¸c enzym cã chøc n¨ng
t¸i cÊu tróc nucleosome, hoÆc c¶i biÕn (hãa häc) c¸c histone. Sù cã mÆt cña chóng th−êng
lµm thay ®æi cÊu tróc nucleosome, qua ®ã bé m¸y phiªn m· nãi riªng vµ c¸c protein liªn
kÕt ADN kh¸c nãi chung cã thÓ tiÕp cËn ®−îc c¸c gen cÇn biÓu hiÖn. Nh− vËy, ë
prokaryote, chóng ta kh«ng gÆp cÊu tróc nucleosome; cßn ë eukaryote, ®©y lµ mét c¬ chÕ
c¬ b¶n tham gia ®iÒu hßa biÓu hiÖn cña c¸c gen.
2) C¸c gen ë eukaryote th−êng ®ång thêi ®−îc ®iÒu khiÓn bëi nhiÒu yÕu tè
®iÒu hßa h¬n h¼n so víi c¸c gen prokaryote ®iÓn h×nh. NÕu ë vi khuÈn, vÞ trÝ liªn
kÕt cña c¸c protein ®iÒu hßa th−êng lµ c¸c tr×nh tù ng¾n, rêi r¹c ë gÇn gen trªn ph©n tö
ADN, th× ë eukaryote, mçi gen th−êng ®ång thêi cã nhiÒu vÞ trÝ liªn kÕt cña c¸c protein
®iÒu hßa kh¸c nhau vµ chóng cã thÓ n»m rÊt xa tÝnh tõ vÞ trÝ cña gen. Chóng ta gäi ®o¹n
tr×nh tù gÇn gen mµ ë ®ã bé m¸y phiªn m· liªn kÕt vµo vµ khëi ®Çu (khëi ®éng) sù phiªn
m· lµ promoter; vÞ trÝ liªn kÕt cña tõng protein ®iÒu hßa lµ tr×nh tù ®iÒu hßa; cßn tËp
hîp toµn bé c¸c vÞ trÝ ®iÒu hßa cña mét gen ®−îc gäi lµ c¸c tr×nh tù ®iÒu hßa. Kh¸i
niÖm “c¸c tr×nh tù ®iÒu hßa” phÇn nµo cho thÊy, xu h−íng c¸c gen ë eukaryote ®−îc ®iÒu
hßa ®ång thêi bëi nhiÒu protein ®iÒu hßa kh¸c nhau vµ cã sù tÝch hîp cña nhiÒu ph©n tö
tÝn hiÖu kh¸c nhau. ë trªn, chóng ta ®· gÆp mét sè c¬ chÕ ®iÒu hßa phèi hîp ë vi khuÈn.
Nh−ng th−êng th× ë vi khuÈn chØ liªn quan ®Õn hai protein ®iÒu hßa kh¸c nhau lµm
nhiÖm vô tÝch hîp th«ng tin tõ hai ph©n tö tÝn hiÖu kh¸c nhau (nh− glucose vµ lactose ë
operon Lac ch¼ng h¹n). Nh−ng ë eukaryote (®Æc biÖt ë sinh vËt ®a bµo), sù biÓu hiÖn cña
mét gen th−êng cÇn ph¶i diÔn ra ®óng thêi ®iÓm vµ ®óng vÞ trÝ nhÊt ®Þnh trong c¬ thÓ,
®ång thêi liªn quan ®Õn nhiÒu ph©n tö tÝn hiÖu kh¸c nhau. ë nÊm men, sù tÝch hîp tÝn
hiÖu nh− vËy kh«ng kh¸c nhiÒu so víi vi khuÈn vµ c¸c gen cña chóng còng cã Ýt c¸c tr×nh
tù ®iÒu hßa h¬n nhiÒu so víi c¸c loµi eukaryote bËc cao (h×nh 5.16).
Promoter
Vi khuẩn Trình tự điều hòa
155
§inh §oµn Long
ë eukaryote, c¸c tr×nh tù ®iÒu hßa cã thÓ c¸ch promoter ®Õn hµng ngh×n nucleotide
vÒ phÝa ®Çu 5’ hay 3’, vµ mçi gen cã thÓ cã ®Õn hµng chôc vÞ trÝ ®iÒu hßa kh¸c nhau.
Th«ng th−êng c¸c vÞ trÝ ®iÒu hßa nµy ®−îc tËp hîp thµnh c¸c ®¬n vÞ gäi lµ c¸c ®o¹n
tr×nh tù enhancer hoÆc ®o¹n tr×nh tù silencer (lµm “t¾t” gen). C¸c protein ®iÒu hßa
th−êng liªn kÕt víi c¸c ®o¹n tr×nh tù nµy ®Ó t−¬ng øng “bËt” hoÆc “t¾t” c¸c gen vµo
nh÷ng thêi ®iÓm vµ vÞ trÝ (tÕ bµo vµ m«) nhÊt ®Þnh trong qu¸ tr×nh sinh tr−ëng cña c¬ thÓ
sinh vËt.
ë eukaryote, vÞ trÝ ®iÒu hßa cã thÓ c¸ch gen ®−îc ®iÒu khiÓn ®Õn 50 kb hoÆc h¬n.
VËy, b»ng c¸ch nµo c¸c protein ®iÒu hßa cã thÓ ®iÒu khiÓn ®−îc gen tõ kho¶ng c¸ch xa
nh− vËy? C¸c vÝ dô vÒ ®iÒu khiÓn tõ xa ë vi khuÈn cho biÕt, ADN th−êng t¹o cÊu tróc
“vßng th¾t” ë gi÷a vÞ trÝ ®iÒu hßa vµ gen cÊu tróc. ë eukaryote, cÊu tróc nµy còng gióp
gi¶i thÝch sù ®iÒu hßa tõ xa trong phÇn lín tr−êng hîp. Nh−ng ë mét sè tr−êng hîp,
kho¶ng c¸ch nµy xa ®Õn møc mµ chi tiÕt cÊu tróc “vßng th¾t” ADN thÕ nµo ®Õn nay
ch−a râ.
Sù ho¹t hãa gen tõ xa trªn ph©n tö ADN ®Æt ra mét vÊn ®Ò n÷a lµ: khi liªn kÕt vµo
enhancer tõ mét kho¶ng c¸ch xa, protein ho¹t hãa cã thÓ ¶nh h−ëng ®Õn nhiÒu gen kh¸c
nhau. Nh−ng ®Õn nay, mét hiÖn t−îng phæ biÕn lµ hÇu hÕt mçi enhancer chØ liªn quan
®Õn sù ®iÒu khiÓn chØ mét (hoÆc mét sè Ýt) gen nhÊt ®Þnh. Ngoµi ra, cã mét nhãm c¸c
®o¹n tr×nh tù ®iÒu hßa kiÓu kh¸c, gäi lµ c¸c ®o¹n tr×nh tù c¸ch li (simulator) th−êng
®−îc t×m thÊy n»m ë gi÷a c¸c enhancer vµ promoter. C¸c ®o¹n tr×nh tù c¸ch li th−êng cã
vai trß ng¨n c¶n sù biÓu hiÖn gen, dï cho protein ho¹t hãa ®· liªn kÕt vµo enhancer. Nh−
vËy, mét vai trß cña c¸c yÕu tè c¸ch li lµ kiÓm so¸t ho¹t ®éng cña c¸c yÕu tè ho¹t hãa.
156
Ch−¬ng 5. gen vµ sù ®iÒu hoµ biÓu hiÖn gen
5.3.1.1. Protein ho¹t hãa ë eukaryote cã miÒn ho¹t hãa t¸ch biÖt víi miÒn liªn kÕt ADN
Gièng ë vi khuÈn, nhiÒu protein ho¹t hãa ë eukaryote cã c¸c trung t©m ho¹t hãa vµ
vÞ trÝ liªn kÕt ADN thuéc c¸c miÒn (domain) t¸ch biÖt nhau. Th«ng th−êng, hai bÒ mÆt
t−¬ng t¸c nµy cña protein thuéc vÒ hai miÒn chøc n¨ng kh¸c nhau. §«i khi, trung t©m
ho¹t hãa vµ vÞ trÝ liªn kÕt ADN thuéc vÒ c¸c chuçi polypeptide kh¸c nhau. B¶n chÊt t¸ch
biÖt gi÷a c¸c miÒn ho¹t hãa vµ liªn kÕt ADN ë c¸c protein ®iÒu hßa cña eukaryote cã thÓ
®−îc ph¸t hiÖn bëi kü thuËt ph©n tÝch t−¬ng t¸c protein-protein (ch−¬ng 11).
5.3.1.2. C¸c protein ®iÒu hßa ë eukaryote sö dông c¸ch nhËn biÕt tr×nh tù ADN gièng
prokaryote, nh−ng cã thÓ cã nhiÒu miÒn liªn kÕt ADN kh¸c nhau
ë trªn, chóng ta biÕt r»ng phÇn lín protein ®iÒu hßa ë vi khuÈn liªn kÕt víi tr×nh
tù ADN ®Ých bëi d¹ng phøc kÐp (dimer) cña protein; trong ®ã, mçi tiÓu phÇn cña nã
th−êng cµi mét chuçi α vµo khe chÝnh cña ph©n tö ADN sîi kÐp. KiÓu liªn kÕt nµy kh«ng
cÇn protein hay ADN ph¶i thay ®æi cÊu h×nh kh«ng gian cña nã. §Ó cã kiÓu t−¬ng t¸c
ADN-protein nµy, nhiÒu protein ®iÒu hßa ë vi khuÈn sö dông motif xo¾n-uèn-xo¾n.
Motif nµy th−êng cã hai chuçi xo¾n α nèi víi nhau bëi mét vßng th¾t ng¾n. Mét chuçi α
cµi “võa khÝt” vµo khe chÝnh cña ADN vµ nhËn biÕt c¸c baz¬ nit¬ ®Æc hiÖu. Chuçi α kia
liªn kÕt däc khung ph©n tö vµ lµm t¨ng c−êng lùc liªn kÕt gi÷a ADN vµ protein (h×nh
5.7).
KiÓu liªn kÕt nh− vËy còng ®−îc t×m thÊy ë eukaryote (mÆc dï xÐt vÒ chi tiÕt, cã
mét vµi kh¸c biÖt). NghÜa lµ, c¸c protein còng th−êng liªn kÕt vµo vÞ trÝ ®iÒu hßa ë d¹ng
phøc kÐp (dimer) vµ cµi chuçi α vµo khe chÝnh cña ADN (h×nh 5.18). Mét nhãm lín c¸c
protein ®iÒu hßa ë eukaryote cã chuçi xo¾n lµm nhiÖm vô nhËn biÕt ADN cã motif d¹ng
xo¾n-uèn-xo¾n; tuy vËy, mét sè kh¸c cã motif vïng nhËn biÕt ADN hoµn toµn kh¸c biÖt.
VÝ dô nh−, mét trong nh÷ng motif gÆp nhiÒu ë eukaryote, nh−ng ch−a gÆp ë prokaryote,
lµ motif dÞ phøc kÐp (heterodimer), hoÆc trong C Chuçi xo¾n α
mét sè tr−êng hîp lµ c¸c motif ®¬n ph©n (chØ nhËn biÕt ADN
cã mét chuçi polypeptide). CÊu tróc dÞ phøc kÐp
cho phÐp c¸c protein ®iÒu hßa më réng kh¶ MÆt ph¼ng β
n¨ng liªn kÕt ®Æc hiÖu cña chóng. Khi mçi ®¬n
His
ph©n cã tÝnh ®Æc thï liªn kÕt riªng, th× tÝnh ®Æc Cys
thï cña cÊu tróc dÞ phøc kÐp lµ kh¸c víi
nguyªn phøc kÐp (homodimer). D−íi ®©y lµ Zn
mét sè vÝ dô vÒ motif miÒn liªn kÕt ADN cña
protein ®iÒu hßa ë eukaryote.
MiÒn ®ång h×nh (homeodomain). “MiÒn His Cys
®ång h×nh” lµ kh¸i niÖm m« t¶ mét nhãm cÊu
tróc d¹ng “xo¾n-uèn-xo¾n” trong vïng liªn kÕt
ADN phæ biÕn ë c¸c yÕu tè phiªn m·; vÒ c¬ b¶n
chóng nhËn biÕt ADN theo kiÓu gièng ë vi
khuÈn. Nh−ng, nÕu motif “xo¾n-uèn-xo¾n” cña
c¸c protein ®iÒu hßa ë vi khuÈn kh¸c nhau vÒ N
cÊu tróc khi xÐt chi tiÕt, th× “miÒn ®ång h×nh” ë
c¸c protein ®iÒu hßa t×m thÊy ë hÇu hÕt c¸c loµi
H×nh 5.17. Mét vÝ dô vÒ miÒn liªn kÕt ADN
eukaryote l¹i rÊt gièng nhau. NhiÒu protein
chøa kÏm (Zn). Chuçi xo¾n α bªn tr¸i cã vai trß
cã miÒn ®ång h×nh liªn kÕt ADN ë d¹ng dÞ nhËn biÕt ADN. MÆt ph¼ng β bªn ph¶i t−¬ng t¸c
phøc kÐp. víi bÒ mÆt ph©n tö ADN. Nguyªn tö Zn liªn kÕt
MiÒn liªn kÕt ADN chøa kÏm. Mét sè víi hai Cys cña mÆt ph¼ng β vµ hai His cña chuçi
xo¾n α, t¹o nªn mét cÊu tróc æn ®Þnh cÇn thiÕt
miÒn liªn kÕt ADN cã chøa c¸c nguyªn tö kÏm cho protein ®iÒu hßa cã thÓ liªn kÕt vµo ADN
(Zn), trong ®ã bao gåm c¸c protein ngãn tay (theo Lee et al, 1989; Science, 254).
157
§inh §oµn Long
kÏm (nh− yÕu tè TFIIIA ®iÒu hßa phiªn m· c¸c gen m· hãa rARN) hay c¸c protein bã
kÏm (nh− yÕu tè Gal4 ë nÊm men). Trong protein ho¹t hãa Gal4, c¸c nguyªn tö Zn
t−¬ng t¸c víi c¸c axit amin His vµ Cys t¹o thµnh mét cÊu tróc cÇn cho sù liªn kÕt vµo
ADN cña protein (h×nh 5.17). ë ®©y, ADN còng ®−îc nhËn biÕt qua viÖc cµi chuçi α vµo
khe chÝnh cña ADN. Mét sè protein cã thÓ chøa nhiÒu bã kÏm kÕt ®u«i nhau, mçi bã
®Òu liªn kÕt víi ADN qua khe chÝnh vµ chuçi α. Víi chiÒu dµi më réng nh− vËy, tÝnh
®Æc hiÖu cña liªn kÕt t¨ng lªn.
Motif khãa kÐo leucine. Motif nµy th−êng gåm hai chuçi α dµi kÑp vµo ph©n tö
ADN nh− mét chiÕc “k×m”. Trong ®ã, mçi chuçi cµi vµo mét khe chÝnh (h×nh 5.18a). ë
motif khãa kÐo leucine, hai chuçi polypeptide th−êng ®−îc gi÷ víi nhau bëi t−¬ng t¸c kÞ
n−íc gi÷a c¸c axit amin Leu vµ sù lång vµo nhau cña 2 vßng xo¾n α. C¸c protein motif
khãa kÐo leucine cã thÓ hoÆc ë d¹ng dÞ phøc kÐp hoÆc nguyªn phøc kÐp (h×nh 5.18b).
Motif xo¾n-vßng-xo¾n - HLH (helix-loop-helix). Gièng motif khãa kÐo leucine,
motif nµy th−êng lµ phøc khÐp cña hai chuçi polypeptide (cã thÓ lµ dÞ phøc kÐp hoÆc
nguyªn phøc kÐp) gåm c¸c vßng xo¾n α cµi vµo khe chÝnh vµ cã vai trß nhËn biÕt ADN,
ngoµi ra cã c¸c vßng xo¾n α ng¾n h¬n cã vai trß cÊu tróc. Gi÷a hai vßng xo¾n α lµ mét
“vßng th¾t” linh ho¹t gi÷ chóng víi nhau (v× vËy ®−îc gäi lµ xo¾n-vßng-xo¾n). Do vïng
liªn kÕt ADN mang c¸c axit amin kiÒm, nªn c¸c protein cã motif nµy cßn ®−îc gäi lµ c¸c
HLH kiÒm.
a) b)
Chuçi xo¾n α
Khe chÝnh
ADN
ADN
H×nh 5.18. Motif khãa kÐo leucine. a) MiÒn liªn kÕt ADN cã motif nµy gåm hai chuçi xo¾n α kÝch th−íc lín lång
vµo nhau; mçi chuçi cµi t−¬ng øng vµo mét khe chÝnh. b) Hai chuçi xo¾n cã thÓ tån t¹i ë d¹ng nguyªn phøc kÐp
(hai chuçi gièng nhau), hoÆc dÞ phøc kÐp (hai chuçi kh¸c nhau)
158
Ch−¬ng 5. gen vµ sù ®iÒu hoµ biÓu hiÖn gen
159
§inh §oµn Long
kh«ng cÇn sù biÕn ®æi nµo cña chÊt nhiÔm s¾c. Sù cã mÆt cña SW15 gióp huy ®éng c¸c
yÕu tè c¶i biÕn nucleosome (nh− enzym histone acetylase vµ phøc hÖ t¸i cÊu tróc
nucleosome SWI/SNF). Nhê vËy, SBF liªn kÕt ®−îc vµo c¸c vÞ trÝ ®iÒu hßa cña nã, ®ång
thêi huy ®éng bé m¸y phiªn m· tíi gen vµ ho¹t hãa gen. Nh− vËy, gen HO chØ ®−îc biÓu
hiÖn khi cã ®ång thêi hai protein SW15 vµ SBF.
b) Sù phèi hîp cña c¸c protein ho¹t hãa gen β-interferon ë ng−êi. Gen m· hãa β-
interferon ë ng−êi ®−îc ho¹t hãa khi cã sù x©m nhiÔm cña virut. Sù x©m nhiÔm nµy kÝch
ho¹t ba protein ®iÒu hßa lµ NFκB, IRF vµ Jun/ATF. C¸c protein nµy liªn kÕt vµo c¸c vÞ
trÝ c¹nh nhau trong mét tr×nh tù enhancer c¸ch promoter 1 kb vÒ phÝa ®Çu 5’, vµ h×nh
thµnh mét phøc hÖ t¨ng c−êng (enhancing complex). Sù h×nh thµnh phøc hÖ t¨ng
c−êng lµ mét c¬ chÕ ®¶m b¶o cho sù tÝch hîp c¸c tÝn hiÖu: gen chØ biÓu hiÖn khi cã c¶ ba
protein vµ chØ khi cã phøc hÖ t¨ng c−êng bé m¸y phiªn m· míi tiÕn hµnh biÓu hiÖn gen.
5.3.2.2. §iÒu hßa tæ hîp lµ trung t©m cña tÝnh ®a d¹ng vµ phøc t¹p trong ®iÒu hßa biÓu
hiÖn gen ë eukaryote
Phøc hÖ t¸i cÊu tróc
Kh¸i niÖm ®iÒu hßa tæ hîp ®· ®−îc chÊt nhiÔm s¾c
chóng ta nh¾c ®Õn trong tr−êng hîp protein CAP Enzym
®−îc dïng ®Ó ®iÒu hßa ®ång thêi nhiÒu gen kh¸c SW15 histone acetylase
nhau ë vi khuÈn (vÝ dô c¸c operon Lac vµ Gal). HO
Sù tæ hîp nµy ë eukaryote thËm chÝ cßn phæ biÕn
h¬n. H×nh 5.21 minh häa mét vÝ dô vÒ ®iÒu hßa Gen kh«ng
tæ hîp. Gen A ®−îc ®iÒu khiÓn bëi bèn tÝn hiÖu biÓu hiÖn
(1, 2, 3 vµ 4), mçi tÝn hiÖu ho¹t ®éng qua mét
SBF
protein ho¹t hãa kh¸c nhau (a1 – a4). Gen B
®−îc ®iÒu khiÓn bëi 3 tÝn hiÖu (3, 5 vµ 6) vµ qua
c¸c protein ho¹t hãa a3 – a6. Nh− vËy, hai gen HO
nµy ®−îc ®iÒu khiÓn bëi cÆp “tÝn hiÖu – protein
VÞ trÝ liªn Gen
VÞ trÝ liªn
ho¹t hãa” chung lµ “3 – a3”. ë ®éng vËt, kiÓu kÕt SW15 kÕt SBF biÓu hiÖn
®iÒu hßa tæ hîp th−êng liªn quan ®Õn nhiÒu gen
H×nh 5.20. Sù ®iÒu khiÓn gen HO. SW15 cã
vµ nhiÒu protein ®iÒu hßa h¬n. VËy, b»ng c¸ch thÓ liªn kÕt vµo vÞ trÝ cña nã trªn ADN mµ kh«ng
nµo sù ®iÒu hßa tæ hîp kh«ng g©y “r¾c rèi” cho cÇn cã sù c¶i biÕn nµo, nh−ng SBF th× kh«ng. Sau
sù biÓu hiÖn cña mçi gen? khi liªn kÕt vµo ADN, SW15 huy ®éng histone
acetylase vµ phøc hÖ t¸i cÊu tróc nucleosome lµm
Nh− ®· nãi ë trªn, nhiÒu protein ®iÒu hßa c¶i biÕn vïng chÊt nhiÔm s¾c t¹i vÞ trÝ liªn kÕt SBF,
ho¹t ®éng theo kiÓu “tæ hîp”. ThËm chÝ, c¸c tiÓu nhê vËy protein ho¹t hãa SBF cã thÓ liªn kÕt vµo vÞ
phÇn kh¸c nhau cña chóng còng cã thÓ g©y nªn trÝ cña nã (gÇn promoter) vµ ho¹t hãa gen.
t¸c ®éng “tæ hîp”. §iÒu nµy gi¶i thÝch t¹i sao
nhiÒu protein ®iÒu hßa cã thÓ cïng ho¹t ®éng
trong c¸c tæ hîp kh¸c nhau. C¸c vÝ dô vÒ sù “tÝch 1 2 3 4
hîp tÝn hiÖu” nªu trªn (c¸c gen HO vµ β- Gen A
interferon) ®Òu liªn quan ®Õn mét sè protein
VÞ trÝ 1 VÞ trÝ 2 VÞ trÝ 3 VÞ trÝ 4
tham gia ®iÒu hßa tæ hîp. ë nÊm men, SW15
tham gia ®iÒu hßa nhiÒu gen kh¸c nhau; cßn ë 3 5 6
®éng vËt cã vó, NFκB kh«ng chØ ®iÒu hßa gen β- Gen B
interferon mµ cßn nhiÒu gen kh¸c, bao gåm
chuçi nhÑ κ cña immunoglobulin trong c¸c tÕ bµo VÞ trÝ 3 VÞ trÝ 4 VÞ trÝ 5
lympho B. T−¬ng tù nh− vËy, Jun/ATF khi tæ H×nh 5.21. VÝ dô vÒ ®iÒu hßa tæ hîp. Hai gen
hîp víi c¸c protein ho¹t hãa kh¸c cã thÓ tham nµy ®−îc ®iÒu khiÓn ®ång thêi bëi nhiÒu tÝn hiÖu
gia ®iÒu hßa nhiÒu gen kh¸c nhau. Chóng ta kh¸c nhau. Mçi tÝn hiÖu ®−îc "truyÒn t¶i" bëi mét
protein ®iÒu hßa. Protein 3 ho¹t ®éng ®ång thêi trªn
còng ®· m« t¶ mét sè protein liªn kÕt ADN cã c¶ hai gen. Nh−ng ë mçi gen, nã tæ hîp víi c¸c yÕu
thÓ ë d¹ng “dÞ phøc kÐp” hoÆc “nguyªn phøc tè ®iÒu hßa kh¸c nhau.
160
Ch−¬ng 5. gen vµ sù ®iÒu hoµ biÓu hiÖn gen
kÐp”. §©y còng lµ mét c¬ chÕ ®iÒu hßa tæ hîp kh¸c n÷a. §Õn nay, cã thÓ nãi c¬ chÕ ®iÒu
hßa tæ hîp ®−îc t×m thÊy phæ biÕn ë mäi eukaryote. §iÒu nµy ®Æc biÖt ®óng ®èi víi c¸c
gen ®Æc tr−ng cho toµn bé liªn giíi. V× vËy, nã ®−îc coi lµ trung t©m cña tÝnh phøc t¹p vµ
®a d¹ng trong ®iÒu hßa gen ë eukaryote.
161
§inh §oµn Long
ho¹t hãa NtrC (môc 5.2.2.8), tÝn hiÖu cña m«i tr−êng (nång ®é NH4+ thÊp) ho¹t hãa mét
enzym kinase; ®Õn l−ît m×nh, enzym nµy phosphoryl hãa vµ ho¹t hãa NtrC. KiÓu truyÒn
tÝn hiÖu gi¸n tiÕp (qua nhiÒu b−íc) nµy lµ mét vÝ dô vÒ mét con ®−êng truyÒn tÝn hiÖu.
Kh¸i niÖm “tÝn hiÖu” ë ®©y th−êng ®−îc hiÓu chÝnh lµ ph©n tö kÝch øng (ligand) ®Çu
tiªn. ë eukaryote, trong c¸c con ®−êng truyÒn tÝn hiÖu ®iÓn h×nh, c¸c ligand th−êng ®−îc
nhËn biÕt bëi c¸c thô thÓ bÒ mÆt tÕ bµo ®Æc tr−ng cña nã (ligand th−êng ®Ýnh kÕt vµo
miÒn ngo¹i bµo cña thô thÓ, råi tÝn hiÖu tiÕp tôc ®−îc thô thÓ truyÒn tíi miÒn néi bµo).
Tõ ®ã, tÝn hiÖu th−êng ®−îc truyÒn tíi c¸c yÕu tè ®iÒu hßa phiªn m· qua mét chuçi c¸c
enzym kinase. Mét c©u hái ®Æt ra lµ: b»ng c¸ch nµo viÖc ®Ýnh kÕt mét ligand vµo miÒn
ngo¹i bµo cña thô thÓ ®−îc “truyÒn t¶i” vµo miÒn néi bµo? §ã lµ do tÝnh chÊt “dÞ h×nh”
cña miÒn néi bµo ë c¸c thô thÓ. Ngoµi ra, c¸c ligand còng cã thÓ ho¹t ®éng theo kiÓu kÕt
hîp hai hay nhiÒu thô thÓ víi nhau. Sù t−¬ng t¸c gi÷a miÒn néi bµo cña c¸c thô thÓ kh¸c
nhau cã thÓ ho¹t hãa lÉn nhau. H×nh 5.23 minh häa mét vÝ dô ®¬n gi¶n vÒ mét con
®−êng truyÒn tÝn hiÖu. ë ®©y, mét enzym kinase th−êng xuyªn liªn kÕt vµo miÒn néi bµo
cña thô thÓ. Khi ligand (ë ®©y lµ mét cytokine) ho¹t hãa thô thÓ, nã “®−a” hai chuçi thô
thÓ ®Õn gÇn nhau vµ ho¹t hãa kinase xóc t¸c ph¶n øng phosphoryl hãa ë mét tr×nh tù
®Æc biÖt trong miÒn néi bµo cña thô thÓ. VÞ trÝ g¾n gèc ~ nµy ®−îc mét protein ®Æc biÖt
(STAT) nhËn ra vµ liªn kÕt vµo, sau ®ã thô thÓ truyÒn l¹i gèc ~ cho STAT. Sau khi
®−îc ho¹t hãa (nhËn gèc ~), protein STAT h×nh thµnh mét nguyªn phøc kÐp vµ ®−îc
vËn chuyÓn vµo nh©n tÕ bµo. T¹i ®©y, nã liªn kÕt víi ADN vµ ho¹t hãa sù biÓu hiÖn gen.
Trong thùc tÕ, c¸c con ®−êng truyÒn tÝn hiÖu ®Ó ho¹t hãa gen cã tÝnh phøc t¹p vµ møc ®é
tæ hîp cao h¬n. Nh×n chung, sù truyÒn tÝn hiÖu phæ biÕn nhÊt lµ qua sù phosphoryl hãa.
Tuy vËy, nh÷ng c¬ chÕ c¶i biÕn protein kh¸c, bao gåm sù ph©n gi¶i protein, lo¹i gèc
phosphate... còng ®−îc dïng ®Ó truyÒn tÝn hiÖu.
Cytokine
Ngo¹i bµo
b) C¸c yÕu tè ®iÒu hßa phiªn m· ë eukaryote ®−îc ®iÒu khiÓn bëi tÝn hiÖu nh− thÕ nµo?
Khi c¸c tÝn hiÖu ®· ®−îc truyÒn tíi c¸c yÕu tè ®iÒu hßa phiªn m·, th× ho¹t ®éng ®iÒu
khiÓn phiªn m· tiÕp theo nh− thÕ nµo? ë vi khuÈn, sù ®iÒu hßa qua qui t¾c dÞ h×nh lµm
thay ®æi “¸i lùc liªn kÕt” cña mét yÕu tè ®iÒu hßa trªn ADN lµ mét c¬ chÕ phæ biÕn.
Nh−ng ë eukaryote, c¸c yÕu tè ®iÒu hßa phiªn m· ®iÓn h×nh chñ yÕu kh«ng ho¹t ®éng
qua c¬ chÕ nµy (trõ mét sè ngo¹i lÖ). HÇu hÕt c¸c yÕu tè ®iÒu hßa phiªn m· ë eukaryote
ho¹t ®éng theo hai c¸ch c¬ b¶n sau:
- Béc lé vïng ho¹t hãa: C¬ chÕ nµy x¶y ra hoÆc qua sù thay ®æi cÊu h×nh cña yÕu
tè phiªn m· liªn kÕt s½n víi ADN (nh−ng ch−a h×nh thµnh phøc hÖ “më”), hoÆc qua sù
gi¶i phãng c¸c gen khái c¸c protein bÞt mÆt (masking protein) lµm bé m¸y phiªn m·
kh«ng tiÕp cËn ®−îc gen. Sù thay ®æi cÊu h×nh cña c¸c protein bÞt mÆt cã thÓ do sù liªn
162
Ch−¬ng 5. gen vµ sù ®iÒu hoµ biÓu hiÖn gen
kÕt trùc tiÕp cña c¸c ligand, hoÆc qua sù phosphoryl hãa ®−îc kÝch øng bëi c¸c ligand. Mét
vÝ dô vÒ tr−êng hîp nµy lµ yÕu tè ho¹t hãa Gal4. Khi kh«ng cã galactose, Gal4 liªn kÕt ®−îc
vµo gen GAL1, nh−ng nã kh«ng ho¹t hãa ®−îc gen nµy v× cã mét protein kh¸c (Gal80) liªn
kÕt vµo nã vµ lµm bÊt ho¹t vïng ho¹t hãa cña Gal4. §−êng galactose cã t¸c dông kÝch øng
gi¶i phãng Gal80, qua ®ã ho¹t hãa gen GAL1 (bëi v× lóc nµy Gal4 ®−îc tù do).
Trong nhiÒu tr−êng hîp, c¸c protein bÞt mÆt kh«ng chØ phong táa c¸c vïng ho¹t hãa
mµ b¶n th©n chóng lµ (hoÆc huy ®éng) mét deacetylase cã t¸c ®éng g©y øc chÕ m¹nh sù
biÓu hiÖn cña gen. Mét vÝ dô vÒ c¬ chÕ nµy lµ yÕu tè ho¹t hãa E2F ë eukaryote. YÕu tè
E2F th−êng xuyªn liªn kÕt phÝa tr−íc gen ®Ých cña nã. Mét protein øc chÕ (Rb) kiÓm so¸t
ho¹t ®éng cña E2F b»ng c¸ch liªn kÕt vµo nã. Rb võa cã t¸c dông khãa vïng ho¹t hãa cña
E2F, võa huy ®éng mét enzym deacetylase g©y øc chÕ biÓu hiÖn cña gen ®Ých. Sù
phosphoryl hãa Rb lµm gi¶i phãng Rb khái E2F, nhê vËy gen ®−îc biÓu hiÖn. E2F lµ yÕu
tè ho¹t hãa c¸c gen ®iÒu khiÓn tÕ bµo v−ît qua pha S cña chu tr×nh tÕ bµo (xem ch−¬ng
8). Nh− vËy, sù phosphoryl hãa Rb liªn quan ®Õn sù ®iÒu khiÓn ph©n bµo vµ c¸c ®ét biÕn
¶nh h−ëng ®Õn con ®−êng truyÒn tÝn hiÖu nµy th−êng liªn quan ®Õn ung th−.
- VËn chuyÓn ra vµ vµo nh©n tÕ bµo: Khi ë tr¹ng th¸i kh«ng ho¹t ®éng, hÇu hÕt
c¸c protein ®iÒu hßa biÓu hiÖn gen ®Òu ®−îc gi÷ ë tÕ bµo chÊt. C¸c ph©n tö tÝn hiÖu
th−êng ®ång thêi trùc tiÕp hoÆc gi¸n tiÕp kÝch øng sù vËn chuyÓn chóng vµo nh©n tÕ bµo.
§Ó thùc hiÖn qu¸ tr×nh nµy cã nhiÒu c¸ch kh¸c nhau. Ch¼ng h¹n, mét yÕu tè ®iÒu hßa cã
thÓ bÞ gi÷ ë tÕ bµo chÊt bëi sù liªn kÕt víi mét protein øc chÕ hoÆc víi mµng tÕ bµo; hoÆc
bëi nã ë d¹ng cÊu h×nh lµm che khuÊt tr×nh tù (peptide) tÝn hiÖu ®−îc bé m¸y vËn chuyÓn
nhËn biÕt. Sù vËn chuyÓn c¸c yÕu tè ®iÒu hßa vµo nh©n tÕ bµo cã thÓ ®−îc thùc hiÖn qua
sù ph©n gi¶i mét protein øc chÕ (hoÆc mét protein b¾t gi÷ yÕu tè ®iÒu hßa t¹i tÕ bµo chÊt)
hoÆc bëi sù biÕn ®æi “dÞ h×nh” cña c¸c protein cã liªn quan.
c) C¸c protein ho¹t hãa vµ øc chÕ ®«i khi cã tÝnh ph©n m¶nh
Nh×n chung, chóng ta th−êng m« t¶ c¸c protein ®iÒu hßa (ho¹t hãa vµ øc chÕ) ë
nh÷ng d¹ng ®¬n gi¶n nhÊt. Nh−ng thùc tÕ, chóng th−êng cã d¹ng phøc t¹p h¬n. Ch¼ng
h¹n, trong nhiÒu tr−êng hîp c¸c yÕu tè ho¹t hãa cã tÝnh ph©n m¶nh. NghÜa lµ, hai miÒn
liªn kÕt ADN vµ ho¹t hãa t¸ch biÖt nhau trªn hai chuçi polypeptide kh¸c nhau. Vµ, chØ
khi chóng cïng liªn kÕt trªn ADN th× yÕu tè ho¹t hãa hoµn chØnh míi h×nh thµnh. Ngoµi
ra, khi t×m hiÓu c¸ch thøc ®iÒu khiÓn cña mét sè yÕu tè ®iÒu hßa, mét ®Æc ®iÓm ®−îc
nhËn thÊy lµ: mét sè yÕu tè ®iÒu hßa cã tÝnh ho¹t hãa hay øc chÕ cßn phô thuéc vµo b¶n
chÊt vµ sù s¾p xÕp vÞ trÝ liªn kÕt trªn ADN cña chóng. H·y xem vÝ dô vÒ thô thÓ
glucocorticoid (GR) d−íi ®©y.
Khi kh«ng cã ligand, GR bÞ gi÷ l¹i tÕ bµo chÊt do liªn kÕt víi protein hsp90. Khi cã
ligand, GR ®−îc gi¶i phãng khái hsp90 vµ ®−îc chuyÓn vµo nh©n tÕ bµo. Khi ®· ë trong
nh©n, GR cã hai vÞ trÝ liªn kÕt. Khi GR liªn kÕt vµo vÞ trÝ thø nhÊt, chóng ho¹t hãa gen;
nh−ng khi liªn kÕt vµo vÞ trÝ thø hai, chóng øc chÕ sù biÓu hiÖn cña gen. VËy sù ho¹t hãa
vµ øc chÕ nµy x¶y ra thÕ nµo?
Khi liªn kÕt vµo vÞ trÝ thø hai, GR cã cÊu h×nh dÔ liªn kÕt víi histone deacetylase,
do vËy th−êng g©y øc chÕ c¸c gen l©n cËn. Nh−ng khi liªn kÕt víi vÞ trÝ thø nhÊt, GR cã
cÊu h×nh kh«ng liªn kÕt ®−îc víi histone deacetylase, mµ thay vµo ®ã, nã liªn kÕt víi mét
ph©n tö kh¸c lµ CBP. Phøc hÖ GR/CBP dÉn ®Õn sù ho¹t hãa mét sè gen gÇn kÒ, mét
phÇn bëi CBP cã ho¹t tÝnh histone acetylase, mét phÇn nã cã t¸c ®éng huy ®éng c¸c
thµnh phÇn cña bé m¸y phiªn m· (ë ®éng vËt cã vó, CBP tham gia ho¹t hãa nhiÒu gen,
trong ®ã cã β-interferon ë ng−êi).
C¸c kh¸i niÖm “yÕu tè ®ång ho¹t hãa” hay “yÕu tè ®ång øc chÕ” th−êng ®−îc dïng ®Ó
chØ c¸c protein kh«ng trùc tiÕp tham gia vµo bé m¸y phiªn m·, ®ång thêi kh«ng ph¶i lµ
163
§inh §oµn Long
c¸c yÕu tè ®iÒu hßa phiªn m· trùc tiÕp, nh−ng chóng cã liªn quan ®Õn ho¹t ®éng ®iÒu hßa
phiªn m·. ë ®©y, CBP lµ mét vÝ dô vÒ yÕu tè “®ång ho¹t hãa”. C¸c kh¸i niÖm nµy còng
®−îc dïng ®Ó chØ c¸c phøc hÖ c¶i biÕn nucleosome.
5.3.3.1. BÝt gen ë nÊm men ®−îc thùc hiÖn qua methyl hãa vµ lo¹i acetyl hãa histone
ë nÊm men Saccharomyces cereviseae, ®Çu mót lµ mét trong nh÷ng vïng gen bÞ bÝt
(h×nh 5.24). §ã lµ mét ®o¹n NST cã kÝch th−íc kho¶ng 1 – 5 kb, kÕt ®Æc vµ gÊp khóc.
C¸c gen khi ®−îc chuyÓn ®Õn vïng nµy th−êng bÞ bÊt ho¹t (®Æc biÖt ®èi víi c¸c gen vèn
®· ho¹t ®éng yÕu t¹i vÞ trÝ nguyªn thñy cña nã). ChÊt nhiÔm s¾c ë ®Çu mót ®−îc acetyl
hãa ë møc thÊp h¬n so víi c¸c vïng kh¸c cña NST vµ c¸c gen chØ ®−îc biÓu hiÖn yÕu.
164
Ch−¬ng 5. gen vµ sù ®iÒu hoµ biÓu hiÖn gen
Protein SIR2
H×nh 5.24. Sù bÝt gen t¹i ®Çu mót nhiÔm s¾c thÓ ë nÊm men. Protein RAP1 huy ®éng phøc hÖ SIR tíi ®Çu
mót. T¹i ®©y, mét thµnh phÇn cña phøc hÖ nµy (SIR2) xóc t¸c ph¶n øng lo¹i nhãm acetyl khái ®o¹n ®u«i cña
histone. §o¹n ®Çu mót mang c¸c nucleosome bÞ lo¹i acetyl nµy sau ®ã sÏ liªn kÕt víi SIR3 vµ SIR4, lµm phøc hÖ
SIR ngµy cµng trë nªn tËp trung h¬n. Trong ®iÒu kiÖn ®ã, SIR2 tiÕp tôc xóc t¸c ph¶n øng lo¹i acetyl ë c¸c
nucleosome l©n cËn. VÝ dô nµy minh häa cho hiÖu øng bÝt gen lan táa g©y ra bëi sù c¶i biÕn nucleosome (ë ®©y,
lµ sù lo¹i acetyl hãa ®o¹n ®u«i cña histone).
Cã ba gen m· hãa cho c¸c protein ®iÒu hßa g©y bÝt gen, cã tªn lµ SIR2, 3 vµ 4. Ba
protein ®−îc c¸c gen nµy m· hãa h×nh thµnh nªn phøc hÖ bÝt gen t¹i vïng chÊt nhiÔm s¾c
mµ chóng g¾n vµo. Trong c¸c protein nµy, SIR2 lµ mét histone deacetylase. Phøc hÖ bÝt
gen ®−îc huy ®éng tíi ®Çu mót bëi mét protein liªn kÕt ADN ®Æc hiÖu víi tr×nh tù lÆp l¹i
ë ®Çu mót (protein RAP1). Sù huy ®éng nµy khëi ®Çu cho ho¹t ®éng lo¹i nhãm acetyl t¹i
®o¹n ®u«i histone. C¸c histone bÞ lo¹i acetyl ®−îc “phøc hÖ bÝt gen” nhËn ra, råi sau ®ã
hiÖn t−îng lo¹i acetyl hãa lan táa däc theo NST, t¹o nªn mét vïng dÞ nhiÔm s¾c kÕt ®Æc.
Nh−ng, t¹i sao sù lan táa nµy chØ giíi h¹n ë vïng ®Çu mót (vµ c¸c vïng gen bÞ “bÝt”
kh¸c)? §ã lµ do cã mét sè c¬ chÕ kh¸c lµm c¶n trë sù sù lan táa hiÖu øng cña SIR2. Trong
®ã, ë ®©y sù methyl hãa ®o¹n ®u«i cña histone H3 ®−îc xem lµ nguyªn nh©n g©y nªn
hiÖn t−îng nµy. C¸c enzym histone methylase th−êng g¾n nhãm methyl vµo ®o¹n ®u«i
histone (cô thÓ, lµ t¹i mét axit amin Lys ®Æc thï thuéc ®o¹n ®u«i cña c¸c histone H3 vµ
H4). ë nÊm men S. cereviseae, ho¹t ®éng cña histone methylase ®−îc t×m thÊy cã liªn
quan ®Õn sù øc chÕ mét sè gen, vµ ng¨n c¶n sù lan táa hiÖu øng bÝt gen cña SIR2.
Nh−ng, c¸c nghiªn cøu vÒ enzym histone methylase ®èi víi ®iÒu hßa biÓu hiÖn gen
®Õn nay ®−îc biÕt râ h¬n ë loµi nÊm men Schizosaccharomyces pombe vµ mét sè loµi
eukaryote kh¸c. Nh×n chung, sù bÝt gen ®iÓn h×nh kh«ng chØ liªn quan ®Õn sù lo¹i nhãm
acetyl khái c¸c histone, mµ th−êng ®ång thêi liªn quan ®Õn sù methyl hãa. Tuy vËy, sù
methyl hãa cã thÓ g©y hiÖu øng biÓu hiÖn gen kh¸c nhau, tïy thuéc vµo vÞ trÝ ph¶n øng x¶y
ra. Ch¼ng h¹n, ë nÊm men S. pombe, nÕu sù methyl hãa Lys sè 9 cña ®o¹n ®u«i histone H3
th−êng ®i ®«i víi sù bÝt gen vµ lµ dÊu hiÖu h×nh thµnh vïng dÞ nhiÔm s¾c, th× sù methyl
hãa ë Lys sè 4 còng thuéc ®o¹n ®u«i nµy l¹i lµm t¨ng c−êng sù biÓu hiÖn cña gen.
5.3.3.2. Sù c¶i biÕn histone vµ gi¶ thiÕt m· histone
Cã ý kiÕn cho r»ng cã sù tån t¹i cña m· histone. Theo quan ®iÓm nµy, c¸c kiÓu
biÕn ®æi kh¸c nhau cña histone cã thÓ ®−îc “®äc” vµ “hiÓu” theo c¸c nghÜa kh¸c nhau.
H·y xem vÝ dô ë S. pombe liªn quan ®Õn Lys sè 9 cña ®o¹n ®u«i histone H3. Sù biÕn ®æi
kh¸c nhau t¹i vÞ trÝ nµy ®−îc “hiÓu” theo nghÜa kh¸c nhau. Khi axit amin nµy ®−îc g¾n
nhãm acetyl, c¸c gen th−êng biÓu hiÖn m¹nh. Lóc ®ã, axit amin nµy ®−îc mét sè enzym
histone acetylase nhËn biÕt vµ thóc ®Èy sù acetyl hãa c¸c nucleosome l©n cËn. Nh−ng khi
axit amin Lys 9 kh«ng ®−îc acetyl hãa, c¸c gen th−êng bÞ bÝt. C¸c histone kh«ng ®−îc
acetyl hãa cã xu h−íng huy ®éng c¸c enzym deacetylase (lo¹i nhãm acetyl), v× vËy t¨ng
c−êng sè c¸c histone kh«ng ®−îc acetyl hãa (gièng nh− kiÓu bÝt gen lan táa ë S.
165
§inh §oµn Long
cereviseae). ë mét sè loµi, viÖc axit amin Lys 9 bÞ methyl hãa lµ “dÊu hiÖu” ®Ó mét sè
protein ®Æc thï liªn kÕt vµo vµ duy tr× tr¹ng th¸i dÞ nhiÔm s¾c.
Sù c¶i biÕn ®o¹n ®u«i histone kh«ng chØ ¶nh h−ëng trùc tiÕp ®Õn chøc n¨ng
nucleosome, mµ cßn t¹o ra c¸c vÞ trÝ liªn kÕt cña protein. Cã hai lo¹i miÒn protein ®Æc
hiÖu ®iÒu hßa ho¹t ®éng t−¬ng t¸c nµy gäi lµ miÒn bromo vµ miÒn chromo. C¸c
protein chøa miÒn bromo th× t−¬ng t¸c víi ®o¹n ®u«i histone bÞ acetyl hãa, cßn c¸c
protein chøa miÒn chromo t−¬ng t¸c víi ®o¹n ®u«i histone bÞ methyl hãa. ¶nh h−ëng cña
sù c¶i biÕn ®o¹n ®u«i histone ®Õn sù biÓu hiÖn cña gen th«ng qua c¸c protein ®iÒu hßa
trung gian mang c¸c miÒn bromo vµ chromo sÏ ®−îc ®Ò cËp thªm ë ch−¬ng 7.
5.3.3.3. Methyl hãa ADN liªn quan ®Õn sù bÝt gen ë ®éng vËt cã vó
Mét sè gen ®éng vËt cã vó bÞ bÝt bëi hiÖn t−îng methyl hãa ADN. Thùc tÕ, phÇn lín
hÖ gen ®éng vËt cã vó ®−îc “ghi nhí” theo c¸ch nµy. Ngoµi ra, c¸c ®o¹n ADN bÞ methyl
hãa th−êng liªn quan tíi c¸c vïng dÞ nhiÔm s¾c. §ã lµ do c¸c tr×nh tù ADN bÞ methyl hãa
th−êng ®−îc mét sè protein ®Æc biÖt (nh− MeCP2) nhËn biÕt, råi chóng l¹i tiÕp tôc huy
®éng c¸c enzym histone deacetylase vµ histone methylase. Nh÷ng enzym nµy sau ®ã xóc
t¸c lµm biÕn ®æi c¸c vïng chÊt nhiÔm s¾c ë gÇn. KÕt qu¶ lµ sù methyl hãa cã tÝnh lan táa
vµ c¸c vïng bÞ methyl hãa th−êng chuyÓn thµnh vïng dÞ nhiÔm s¾c (h×nh 5.25).
HiÖn t−îng methyl hãa ADN lµ c¬ së cña hiÖn t−îng in vÕt ADN (DNA imprinting)
®−îc m« t¶ sau ®©y. Chóng ta biÕt r»ng, trong c¸c tÕ bµo l−ìng béi, hÇu hÕt c¸c gen ®Òu
tån t¹i víi hai b¶n sao (chóng n»m trªn cÆp NST t−¬ng ®ång). Mét b¶n sao cã nguån gèc
tõ bè, cßn mét b¶n sao cã nguån gèc tõ mÑ. Trong phÇn lín tr−êng hîp, hai b¶n sao (hoÆc
alen) nµy ®−îc biÓu hiÖn t−¬ng ®−¬ng. Bëi v×, c¸c b¶n sao cña cïng mét locut gen th−êng
mang c¸c tr×nh tù ®iÒu hßa gièng nhau vµ ®−îc ®iÒu khiÓn bëi c¸c protein ®iÒu hßa
chung. Ngoµi ra, trªn NST, vÝ trÝ cña chóng còng th−êng t−¬ng ®ång (nªn chóng cã xu
h−íng gièng nhau vÒ tr¹ng th¸i methyl hãa; hoÆc chÞu t¸c ®éng nh− nhau tõ c¸c enzym
c¶i biÕn histone). Nh−ng trong mét sè tr−êng hîp, chØ mét trong hai b¶n sao ho¹t ®éng,
cßn b¶n sao cßn l¹i bÞ “t¾t”. VÝ dô ®iÓn h×nh vÒ hiÖn t−îng “in vÕt ADN” nh− vËy ë ng−êi
lµ c¸c gen H19 vµ Igf2 n»m gÇn nhau trªn cïng NST sè 11. Trong mçi tÕ bµo, chØ mét
b¶n sao cña H19 (trªn NST xuÊt xø tõ mÑ) ho¹t ®éng, cßn b¶n sao kia (xuÊt xø tõ bè) bÞ
“t¾t”. Ng−îc l¹i, víi gen Igf2, b¶n sao tõ bè th× “bËt”, cßn b¶n sao tõ mÑ th× “t¾t”.
Trong sù chuyªn hãa biÓu hiÖn c¸c gen H19 vµ Igf2, cã hai tr×nh tù quan träng
(h×nh 5.26). §ã lµ mét tr×nh tù t¨ng c−êng n»m xu«i dßng gen H19, vµ mét tr×nh tù
c¸ch li n»m gi÷a hai gen. Tr×nh tù t¨ng c−êng (sau khi liªn kÕt víi yÕu tè ho¹t hãa cña
nã) cã thÓ ho¹t hãa c¶ hai gen H19 vµ Igf2. Nh−ng t¹i sao nã chØ ho¹t hãa gen H19 cã
nguån gèc tõ mÑ vµ gen Igf2 cã nguån gèc tõ bè? C©u tr¶ lêi lµ: do tr¹ng th¸i methyl hãa
cña tr×nh tù c¸ch li trªn hai NST cã nguån gèc tõ mÑ vµ bè lµ kh¸c nhau. Së dÜ tr×nh tù
t¨ng c−êng kh«ng ho¹t hãa ®−îc gen Igf2 tõ mÑ lµ v×: trªn NST nµy, mét protein (gäi lµ
yÕu tè c¸ch li CTCF) ®Ýnh kÕt vµo tr×nh tù c¸ch li, lµm c¶n trë sù t−¬ng t¸c gi÷a gen Igf2
víi yÕu tè ho¹t hãa liªn kÕt t¹i tr×nh tù t¨ng c−êng. Ng−îc l¹i, trªn NST tõ bè, c¸c tr×nh
tù c¸ch li vµ promoter cña gen H19 bÞ methyl hãa. ë tr¹ng th¸i nµy, bé m¸y phiªn m·
kh«ng liªn kÕt ®−îc víi promoter H19, ®ång thêi CTCF kh«ng liªn kÕt ®−îc víi tr×nh tù
c¸ch li. KÕt qu¶ lµ, tr×nh tù t¨ng c−êng cã thÓ ho¹t hãa ®−îc gen Igf2. Ngoµi ra, gen H19
cßn bÞ øc chÕ bæ sung bëi sù liªn kÕt cña protein MeCP2 vµo tr×nh tù bÞ methyl hãa trªn
NST tõ bè (ë trªn, chóng ta ®· biÕt MeCP2 cã vai trß huy ®éng histone deacetylase lµm
øc chÕ gen).
166
Ch−¬ng 5. gen vµ sù ®iÒu hoµ biÓu hiÖn gen
H×nh 5.25. BÝt gen bëi sù methyl hãa ADN vµ c¶i Protein liªn kÕt Gen kh«ng biÓu hiÖn
biÕn nucleosome. Khi kh«ng cã sù c¶i biÕn
vµo ®o¹n ADN
nucleosome, gen ®−îc "bËt" hay "t¾t" phô thuéc vµo sù
®−îc methyl hãa
cã mÆt cña c¸c yÕu tè ho¹t hãa vµ bé m¸y phiªn m·
(minh häa trªn hµng ®Çu tiªn). Tuy vËy, do "kÏ hë", gen
vÉn biÓu hiÖn ë møc ®é c¬ b¶n. §Ó lµm "t¾t" hoµn toµn
mét gen ë eukaryote th−êng liªn quan ®Õn sù methyl hãa
Gen kh«ng biÓu hiÖn
ADN vµ c¶i biÕn nucleosome. Khi mét gen kh«ng ®−îc
phiªn m·, ADN methylase cã thÓ methyl hãa cytosine
n»m trong promoter, trong gen hoÆc trong c¸c tr×nh tù Phøc hÖ t¸i cÊu
tróc nucleosome Histone
enhancer. Nh÷ng methylcytosine nµy ®−îc mét sè protein
(nh− MeCP2) nhËn ra vµ g¾n vµo. Nh÷ng protein nµy sau deacetylase
®ã huy ®éng enzym deacetylase vµ phøc hÖ t¸i cÊu tróc
nucleosom lµm t¾t hoµn toµn sù biÓu hiÖn cña gen
(Watson, 2004).
Gen hoµn toµn kh«ng biÓu hiÖn
YÕu tè c¸ch li
CTCF
Igf2 H19
Gen kh«ng biÓu hiÖn Tr×nh tù c¸ch li Gen biÓu hiÖn Tr×nh tù t¨ng c−êng
Me Me Me Me Me Me
Igf2
5.3.3.4. Mét sè tr¹ng th¸i biÓu hiÖn gen ®−îc di truyÒn qua ph©n bµo, kÓ c¶ khi kh«ng cßn
tÝn hiÖu kÝch øng biÓu hiÖn gen
§«i khi sù biÓu hiÖn cña mét gen ®−îc di truyÒn qua ph©n bµo. Trong qu¸ tr×nh
ph¸t triÓn c¸ thÓ, mét ph©n tö tÝn hiÖu ®−îc gi¶i phãng tõ mét tÕ bµo nhÊt ®Þnh cã thÓ
lµm “bËt” hoÆc “t¾t” mét sè gen ë c¸c tÕ bµo l©n cËn. Nh÷ng gen nµy cã thÓ duy tr× tr¹ng
167
§inh §oµn Long
th¸i “bËt” hoÆc “t¾t” t−¬ng øng qua nhiÒu thÕ ph©n bµo kÕ tiÕp, kÓ c¶ khi ph©n tö tÝn
hiÖu kh«ng cßn n÷a. Sù di truyÒn vÒ kh¶ n¨ng biÓu hiÖn cña gen nh− vËy ®−îc gäi lµ sù
di truyÒn ngo¹i sinh. Sù in vÕt ADN nªu trªn còng lµ mét vÝ dô vÒ di truyÒn ngo¹i
sinh.
Sù ®iÒu hßa biÓu hiÖn gen qua c¬ chÕ di truyÒn ngo¹i sinh d−êng nh− ng−îc l¹i c¸c
c¬ chÕ ®iÒu hßa biÓu hiÖn gen ®· ®−îc ®Ò cËp trªn ®©y. Theo ®ã, sù ho¹t hãa cña gen
th−êng liªn quan ®Õn sù cã mÆt cña mét ph©n tö tÝn hiÖu, truyÒn tin qua mét protein
ho¹t hãa. Nh− ë vi khuÈn, operon Lac chØ thùc sù ho¹t ®éng khi ®ång thêi cã hai tÝn hiÖu
lµ cã lactose vµ kh«ng cã glucose. ë nÊm men, gen GAL chØ biÓu hiÖn khi cã galactose
®ång thêi kh«ng cã glucose. ë ng−êi, gen β-interferon chØ ho¹t ®éng khi tÕ bµo bÞ virut
l©y nhiÔm. Khi kh«ng cã nh÷ng tÝn hiÖu nµy, c¸c gen trªn ë tr¹ng th¸i “t¾t”.
ë ®©y, sù c¶i biÕn ADN vµ nucleosome lµ c¬ së cña di truyÒn häc ngo¹i sinh. H·y
xem tr−êng hîp mét gen bÞ “t¾t” bëi sù methyl hãa histone côc bé. Khi vïng NST bÞ
methyl hãa ®−îc sao chÐp trong ph©n bµo, c¸c histone bÞ methyl hãa tõ c¸c ph©n tö ADN
bè, mÑ sÏ ph©n bè (t−¬ng ®èi) ®Òu vÒ hai tÕ bµo con. Nh− vËy, mçi ph©n tö ADN con ®Òu
mang mét sè nucleosome ®−îc methyl hãa vµ mét sè kh«ng ®−îc methyl hãa. C¸c
nucleosome ®−îc methyl hãa sÏ huy ®éng c¸c protein chøa miÒn chromo, bao gåm c¸c
histone methylase. Nh÷ng enzym nµy sÏ methyl hãa c¸c histone ch−a ®−îc methyl hãa ë
gÇn. Qua ®ã, mét m¹ch ADN con sinh ra sau t¸i b¶n ADN, nÕu cã Ýt histone ®−îc methyl
hãa sÏ huy ®éng ®−îc Ýt enzym methylase h¬n so víi m¹ch ADN cã nhiÒu histone ®−îc
methyl hãa. B»ng c¸ch nµy, tr¹ng th¸i methyl hãa cña chÊt nhiÔm s¾c ®−îc duy tr× qua
ph©n bµo.
H×nh 5.27 cho thÊy sù methyl hãa ADN cã thÓ di truyÒn æn ®Þnh h¬n qua c¬ chÕ
ho¹t ®éng cña c¸c enzym duy tr× methyl hãa. Nh÷ng enzym nµy xóc t¸c ph¶n øng
methyl hãa c¸c ph©n ®o¹n trªn ph©n tö ADN ®· ®−îc methyl hãa mét phÇn trong qu¸
tr×nh t¸i b¶n ADN ®Ó thu ®−îc ph©n ®o¹n methyl hãa hoµn toµn. Trong vÝ dô nµy, enzym
duy tr× methyl hãa nhËn ra ph©n ®o¹n ®−îc methyl hãa mét nöa vµ bæ sung nhãm
Me Me
5’ 3’ 5’ 3’
A C G T A T C G T AC G T A T C G T
methyl hãa
Sao chÐp ADN ADN
Cytosine (C) kh«ng T G C A T A G C A T G C A T A G C A
®−îc methyl hãa 3’ 3’ 5’
Me 5’
Me
5’ 3’
A C G T A T C G T
Enzym duy tr×
Enzym duy tr×
methylase kh«ng
methylase
nhËn ra C nµy
T G C A T A G C A
3’ 5’ Me
Me
5’ 3’ 5’ 3’
A C G T A T C G T AC G T A T C G T
methyl hãa
ADN
T G C A T A G C A T G C A T A G C A
3’ 5’ 3’ 5’
Me Me
H×nh 5.27. KiÓu methyl hãa ADN cã thÓ ®−îc duy tr× qua ph©n bµo (nguån: Alberts et al., 2002).
168
Ch−¬ng 5. gen vµ sù ®iÒu hoµ biÓu hiÖn gen
methyl vµo cytosine (C) ch−a ®−îc methyl hãa. Enzym nµy kh«ng nhËn biÕt ®−îc c¸c
nucleotide C ë ph©n ®o¹n kh«ng ®−îc methyl hãa. KÕt qu¶ lµ, hai ph©n tö ADN con cã
tr¹ng th¸i methyl hãa gièng nhau vµ gièng ph©n tö ADN gèc.
Trong tÕ bµo ®éng vËt cã vó, sù methyl hãa ADN lµ “dÊu hiÖu c¬ b¶n” cho biÕt mét
vïng hÖ gen cã ®−îc biÓu hiÖn kh«ng. Sau sù t¸i b¶n ADN, c¸c vÞ trÝ ®−îc methyl hãa
mét phÇn th−êng ®−îc chuyÓn thµnh tr¹ng th¸i methyl hãa hoµn toµn. Nh÷ng vïng nµy
®ång thêi ®−îc protein MeCP2 nhËn biÕt vµ huy ®éng c¸c enzym c¶i biÕn nucleosome
kh¸c lµm t¸i bÊt ho¹t sù biÓu hiÖn cña gen, thËm chÝ chuyÓn chóng thµnh dÞ nhiÔm s¾c
(h×nh 5.25).
5.3.4. §iÒu hßa biÓu hiÖn gen ë eukaryote qua khëi ®Çu phiªn m·
5.3.4.1. C¸c yÕu tè ho¹t hãa huy ®éng bé m¸y phiªn m· tíi c¸c gen
ë vi khuÈn, mét c¬ chÕ phæ biÕn lµ c¸c yÕu tè ho¹t hãa thóc ®Èy sù phiªn m· c¸c
gen qua viÖc ®ång thêi liªn kÕt víi ADN vµ ARN polymerase ®Ó huy ®éng enzym tíi vÞ trÝ
cña gen. C¸c yÕu tè ho¹t hãa ë eukaryote còng ho¹t ®éng theo c¸ch nµy, nh−ng rÊt hiÕm
khi cã sù t−¬ng t¸c trùc tiÕp gi÷a chóng víi ARN polymerase. Thay vµo ®ã, c¸c yÕu tè
ho¹t hãa th−êng huy ®éng ARN polymerase gi¸n tiÕp theo hai c¸ch. C¸ch thø nhÊt, c¸c
yÕu tè ho¹t hãa t−¬ng t¸c víi c¸c thµnh phÇn trung gian cña bé m¸y phiªn m· (chø
kh«ng ph¶i ARN polymerase), cßn ®−îc gäi lµ c¸c chÊt m«i giíi trung gian; sau ®ã, chÊt
m«i giíi trung gian huy ®éng ARN polymerase tíi promoter. C¸ch thø hai, c¸c yÕu tè
ho¹t hãa huy ®éng c¸c yÕu tè c¶i biÕn nucleosome vµ lµm thay ®æi chÊt nhiÔm s¾c ®Ó bé
m¸y phiªn m· dÔ dµng tiÕp cËn c¸c gen
Tr×nh tù
h¬n, nhê ®ã ARN polymerase cã thÓ liªn t¨ng c−êng
kÕt vµo promoter vµ khëi ®Çu phiªn m·.
Cã khi, c¸c yÕu tè ho¹t hãa ®ång thêi ho¹t YÕu tè
®éng theo c¶ hai c¸ch (h×nh 5.28). ho¹t hãa
ChÊt m«i giíi
Sù phiªn m· ë eukaryote th−êng trung gian (mediator)
cÇn mét sè lín c¸c thµnh phÇn kh¸c nhau.
Trong nhiÒu tr−êng hîp, bé m¸y phiªn
m· ®−îc huy ®éng tíi gen ë d¹ng phøc hÖ TFIID
ARN poiymerase II
duy nhÊt (gåm nhiÒu protein liªn kÕt víi
nhau) gäi lµ holoenzym. Phøc hÖ
holoenzym nµy th−êng ®ång thêi gåm c¸c Hép TATA
chÊt m«i giíi trung gian, ARN
H×nh 5.28. Ho¹t hãa sù khëi ®Çu phiªn mX ë
polymerase, vµ mét sè yÕu tè phiªn m· eukaryote qua sù huy ®éng phøc hÖ phiªn mX. ë ®©y,
kh¸c. ChØ mét sè Ýt c¸c yÕu tè cßn l¹i ®−îc yÕu tè ho¹t hãa cã thÓ huy ®éng trùc tiÕp yÕu tè khëi ®Çu
huy ®éng tíi gen mét c¸ch rêi r¹c (vÝ dô: phiªn m· TFIID, vµ gi¸n tiÕp huy ®éng ARN polymerase
II th«ng qua chÊt m«i giíi trung gian. Trong thùc tÕ, sù
TFIID hay TFIIE). Sù huy ®éng nh÷ng huy ®éng nµy cã thÓ liªn quan ®Õn nhiÒu h¬n mét protein
yÕu tè nµy cã thÓ trùc tiÕp do cña c¸c yÕu ho¹t hãa.
tè ho¹t hãa hoÆc do c¸c yÕu tè kh¸c thuéc
holoenzym.
5.3.4.2. C¸c yÕu tè ho¹t hãa huy ®éng c¸c yÕu tè c¶i biÕn nucleosome lµm t¨ng kh¶ n¨ng
tiÕp cËn promoter cña bé m¸y phiªn m·
Ngoµi c¬ chÕ huy ®éng trùc tiÕp, c¸c yÕu tè ho¹t hãa còng cã thÓ huy ®éng c¸c yÕu
tè c¶i biÕn nucleosome ®Ó ho¹t hãa c¸c gen bÞ “bÝt” trong chÊt nhiÔm s¾c. C¸c yÕu tè c¶i
biÕn nucleosome xuÊt hiÖn ë hai d¹ng. D¹ng thø nhÊt bæ sung c¸c nhãm chøc vµo ®o¹n
®u«i cña c¸c histone, vÝ dô nh− c¸c histone acetylase. D¹ng thø hai cã t¸c dông t¸i cÊu
169
§inh §oµn Long
tróc nucleosome, vÝ dô nh− phøc hÖ SWI/SNF (sö dông n¨ng l−îng tõ ATP). H×nh 5.29
m« t¶ hai m« h×nh c¬ b¶n gióp gi¶i thÝch b»ng c¸ch nµo sù c¶i biÕn nucleosom g©y nªn
bëi c¸c yÕu tè trªn ®©y cã thÓ ho¹t hãa ®−îc gen.
§Çu tiªn, sù t¸i cÊu tróc lµm béc lé c¸c vÞ trÝ liªn kÕt trªn ph©n tö ADN (tr−íc ®ã
n»m ë vÞ trÝ bÞ “bÝt” cña nucleosome). Sù t¸i cÊu tróc nµy hoÆc sù bæ sung nhãm acetyl vµo
®o¹n ®u«i cña histone vµ cña c¸c nucleosome l©n cËn cã thÓ lµm t¨ng sù “láng lÎo” cña c¸c
nucleosome vµ chÊt nhiÔm s¾c, dÉn ®Õn viÖc gi¶i phãng c¸c vÞ trÝ liªn kÕt trªn ADN.
Ngoµi ra, sù bæ sung nhãm acetyl vµo ®o¹n ®u«i c¸c histone cßn ®ång thêi lµm thay
®æi kh¶ n¨ng liªn kÕt cña bé m¸y phiªn m· theo mét c¸ch kh¸c, ®ã lµ nã t¹o ra vÞ trÝ liªn
kÕt trªn nucleosome víi c¸c protein mang miÒn bromo. Mét thµnh phÇn cña phøc hÖ
TFIID mang miÒn bromo, nªn nã liªn kÕt víi c¸c nucleosome ®−îc acetyl hãa tèt h¬n so
víi c¸c nucleosome kh«ng ®−îc acetyl hãa. Nh− vËy, mét gen cã promoter mang nhiÒu
histone ®−îc acetyl hãa th−êng cã ¸i lùc víi bé m¸y phiªn m· cao h¬n khi kh«ng ®−îc
acetyl hãa.
Cã mét sè c©u hái ®−îc ®Æt ra lµ thµnh phÇn nµo cña bé m¸y phiªn m· vµ yÕu tè c¶i
biÕn nucleosome nµo lµ thiÕt yÕu cho sù phiªn m· cña gen; thµnh phÇn nµo cÇn c¸c yÕu
tè ho¹t hãa huy ®éng trùc tiÕp? C©u tr¶ lêi lµ ch−a râ. Nh−ng, c¸c b»ng chøng nh×n
chung cho thÊy, mét sè thµnh phÇn cña bé m¸y phiªn m· (hoÆc c¸c yÕu tè c¶i biÕn
nucleosome) cã thÓ quan träng víi gen nµy, nh−ng Ýt quan träng víi gen kh¸c. Sù kh¸c
biÖt nµy ®«i khi còng kh«ng hoµn toµn râ rÖt. Nãi c¸ch kh¸c, trõ ARN polymerase lµ
thiÕt yÕu cho sù biÓu hiÖn cña mäi gen, th× víi c¸c gen kh¸c nhau, sù phô thuéc vµo c¸c
thµnh phÇn cña bé m¸y phiªn m·, còng nh− c¸c yÕu tè c¶i biÕn nucleosome cã thÓ rÊt
kh¸c nhau, hoÆc thËm chÝ hoµn toµn kh«ng phô thuéc vµo nh÷ng yÕu tè nµy. Ngoµi ra,
møc ®é yªu cÇu mét yÕu tè ®iÒu hßa cßn phô thuéc vµo hoµn c¶nh cô thÓ cña tÕ bµo, nh−
c¸c thêi ®iÓm kh¸c nhau cña chu tr×nh tÕ bµo, hay vµo c¸c giai ®o¹n kh¸c nhau cña qu¸
tr×nh ph¸t triÓn c¸ thÓ. Mét vÝ dô dÔ thÊy lµ trong nguyªn ph©n, khi c¸c NST ®ang co
YÕu tè Promoter YÕu tè
ho¹t hãa Promoter
ho¹t hãa
Histone Phøc hÖ
acetylase c¶i biÕn
nucleosom
170
Ch−¬ng 5. gen vµ sù ®iÒu hoµ biÓu hiÖn gen
xo¾n “cùc ®¹i”, sù ho¹t hãa gen hÇu nh− kh«ng thÓ x¶y ra trõ khi enzym acetylase ®−îc
huy ®éng ®Õn vÞ trÝ cña gen cÇn ®−îc biÓu hiÖn.
5.3.4.3. §iÒu hßa tõ xa: cÊu tróc vßng th¾t ADN vµ c¸c tr×nh tù c¸ch li
RÊt nhiÒu yÕu tè ho¹t hãa gen ë eukaryote ho¹t ®éng tõ mét vÞ trÝ rÊt xa so víi vÞ
trÝ cña gen. Ch¼ng h¹n, ë ®éng vËt cã vó, tr×nh tù enhancer cã thÓ n»m xu«i dßng hay
ng−îc dßng, c¸ch gen hµng tr¨m kb. ë vi khuÈn, chóng ta ®· biÕt sù tån t¹i cña kiÓu ®iÒu
hßa tõ xa. Nh−ng th−êng th× kho¶ng c¸ch tõ vÞ trÝ ®iÒu hßa ®Õn gen chØ vµi tr¨m bp vµ
th−êng liªn quan ®Õn sù h×nh thµnh vßng th¾t ADN. Kho¶ng c¸ch nµy ®ñ gÇn ®Ó c¸c
protein ®iÒu hßa t−¬ng t¸c ®−îc víi nhau. Nh−ng khi kho¶ng c¸ch nµy v−ît qu¸ vµi kb,
th× kh¶ n¨ng t−¬ng t¸c cña chóng mÊt ®i.
Cã mét sè m« h×nh ®−îc ®−a ra ®Ó gi¶i thÝch nhê ®©u ë eukaryote, gen cã thÓ ®−îc
ho¹t hãa tõ mét tr×nh tù t¨ng c−êng ë rÊt xa gen. Mét m« h×nh nh− vËy lµ viÖc t×m thÊy
nhiÒu protein liªn kÕt vµo vïng gi÷a tr×nh tù t¨ng c−êng vµ vïng m· hãa cña gen, dÉn
®Õn h×nh thµnh nhiÒu vßng th¾t liªn tiÕp, lµm tr×nh tù t¨ng c−êng ®−îc ®−a ®Õn gÇn
gen h¬n. Mét m« h×nh kh¸c cho thÊy, chÊt nhiÔm s¾c ®«i khi còng cã nh÷ng cÊu h×nh ®Æc
biÖt (vÝ dô: do sù c¶i biÕn cña c¸c histone vµ t¸i cÊu tróc nucleosome) gióp ®−a c¸c tr×nh
tù t¨ng c−êng ®Õn gÇn gen. Nh−ng, nh×n chung c¬ chÕ ph©n tö cña c¸c hiÖn t−îng nµy
®Õn nay ch−a hoµn toµn s¸ng tá.
NÕu mét tr×nh tù t¨ng c−êng cã thÓ ho¹t hãa mét gen c¸ch nã ®Õn 50 kb, th× yÕu tè
nµo ng¨n c¶n nã kh«ng ho¹t hãa c¸c gen gÇn h¬n? Cã sù xuÊt hiÖn cña mét sè tr×nh tù
®Æc biÖt, gäi lµ c¸c tr×nh tù c¸ch li. Nh÷ng protein liªn kÕt vµo tr×nh tù nµy (gäi lµ c¸c
yÕu tè c¸ch li) kiÓm so¸t ho¹t
®éng cña c¸c yÕu tè t¨ng c−êng. a) Gen biÓu hiÖn
Khi n»m gi÷a mét tr×nh tù t¨ng
c−êng vµ promoter, c¸c yÕu tè c¸ch Tr×nh tù Promoter
li sÏ øc chÕ sù ho¹t hãa gen bëi t¨ng c−êng
yÕu tè t¨ng c−êng. Nh− vÝ dô trªn b)
h×nh 5.30, yÕu tè c¸ch li kh«ng øc Gen kh«ng biÓu hiÖn
chÕ sù ho¹t hãa gen cña yÕu tè
Tr×nh tù Tr×nh tù Promoter
t¨ng c−êng nÕu nã kh«ng n»m t¨ng c−êng c¸ch li
gi÷a tr×nh tù t¨ng c−êng vµ
promoter; còng nh− nã kh«ng øc c)Gen biÓu hiÖn
Gen kh«ng biÓu hiÖn
chÕ yÕu tè t¨ng c−êng ho¹t hãa c¸c
gen kh¸c. Nh− vËy, xÐt vÒ b¶n Promoter Tr×nh tù Tr×nh tù Promoter
chÊt, c¸c yÕu tè c¸ch li kh«ng øc t¨ng c−êng c¸ch li
chÕ ho¹t ®éng cña promoter, còng
nh− kh«ng k×m h·m ho¹t ®éng cña d) Gen biÓu
hiÖn
c¸c yÕu tè t¨ng c−êng. Thay vµo
®ã, nã ng¨n c¶n sù t−¬ng t¸c gi÷a Tr×nh tù Tr×nh tù Promoter Tr×nh tù
c¸c yÕu tè nµy. §«i khi, c¸c yÕu tè t¨ng c−êng c¸ch li t¨ng c−êng
c¸ch li cã thÓ øc chÕ sù lan táa c¶i
H×nh 5.30. YÕu tè c¸ch li ng¨n c¶n sù ho¹t hãa gen cña yÕu tè
biÕn chÊt nhiÔm s¾c. ë ®Çu t¨ng c−êng. a) Gen ®−îc biÓu hiÖn nhê ho¹t ®éng cña yÕu tè
ch−¬ng nµy, chóng ta ®· biÕt, t¨ng c−êng liªn kÕt ®−îc víi tr×nh tù t¨ng c−êng (enhancer).
tr¹ng th¸i c¶i biÕn chÊt nhiÔm s¾c b) YÕu tè c¸ch li ng¨n c¶n sù t−¬ng t¸c gi÷a yÕu tè t¨ng c−êng víi
cã thÓ g©y ¶nh h−ëng ®Õn viÖc promoter, nªn gen kh«ng ®−îc biÓu hiÖn (dï cho yÕu tè t¨ng
biÓu hiÖn cña mét gen. “BÝt gen” lµ c−êng liªn kÕt ®−îc vµo enhancer. c) YÕu tè t¨ng c−êng vÉn cã
thÓ ho¹t hãa ®−îc gen ë phÝa ®èi diÖn tr×nh tù c¸ch li (hoÆc trªn
mét trong c¸c c¬ chÕ øc chÕ sù biÓu cïng m¹ch ADN hoÆc trªn m¹ch ®èi m·). d) YÕu tè c¸ch li ng¨n
hiÖn gen cã thÓ lan táa däc theo c¶n ho¹t ®éng cña yÕu tè ho¹t hãa n»m ng−îc dßng, nh−ng
chÊt nhiÔm s¾c, ®ång thêi lµm t¾t kh«ng ng¨n c¶n ho¹t ®éng cña yÕu tè ho¹t hãa n»m xu«i dßng.
171
§inh §oµn Long
nhiÒu gen, mµ kh«ng nhÊt thiÕt ph¶i cã c¸c protein øc chÕ. C¸c yÕu tè c¸ch li cã thÓ øc
chÕ ho¹t ®éng lan táa cña c¬ chÕ c¶i biÕn chÊt nhiÔm s¾c. Nh− vËy, c¸c yÕu tè c¸ch li cã
thÓ b¶o vÖ gen khái sù ho¹t hãa hay øc chÕ tuú tiÖn.
HiÖn t−îng nµy cã liªn quan ®Õn viÖc nhiÒu gen ®−îc biÕn n¹p trong thùc nghiÖm ë
eukaryote bÞ “bÝt”, do chóng bÞ cµi ngÉu nhiªn vµo c¸c vïng dÞ nhiÔm s¾c. Nh−ng, nÕu c¸c
yÕu tè c¸ch li n»m ngay tr−íc hoÆc sau gen ®−îc cµi th× nã cã thÓ gióp c¸c gen nµy kh«ng
bÞ “bÝt” do hiÖu øng lan táa cña sù c¶i biÕn chÊt nhiÔm s¾c.
5.3.4.4. Sù ®iÒu hßa biÓu hiÖn mét sè gen cÇn “vïng ®iÒu khiÓn locut” - LCR
Gen m· hãa globin ®−îc biÓu hiÖn trong c¸c tÕ bµo hång cÇu ë ng−êi tr−ëng thµnh
vµ trong mét sè dßng tÕ bµo gèc m¸u trong qu¸ tr×nh ph¸t triÓn c¸ thÓ. HÖ gen ng−êi cã 5
gen m· hãa globin kh¸c nhau (h×nh 5.31). MÆc dï kÕt côm, nh−ng nh÷ng gen nµy ®−îc
®iÒu khiÓn biÓu hiÖn riªng rÏ. Mçi gen ®−îc biÓu hiÖn vµo c¸c thêi kú kh¸c nhau cña qu¸
tr×nh ph¸t triÓn c¬ thÓ. §Çu tiªn lµ gen ε, sau ®ã lµ γ, råi ®Õn β vµ δ. TrËt tù biÓu hiÖn cña
c¸c gen nµy ®−îc ®iÒu khiÓn thÕ nµo?
Mçi gen ®Òu cã mét tËp hîp c¸c vÞ trÝ ®iÒu hßa ®Ó ®iÒu khiÓn “bËt” gen ®óng thêi
®iÓm vµ m«, tÕ bµo phï hîp trong qu¸ tr×nh ph¸t triÓn c¸ thÓ. Cô thÓ, gen β (tÕ bµo tñy
x−¬ng ng−êi tr−ëng thµnh) cã hai tr×nh tù t¨ng c−êng: mét n»m xu«i dßng gen, mét n»m
ng−îc dßng gen. ChØ cã tÕ bµo tñy x−¬ng ng−êi tr−ëng thµnh míi cã ®Çy ®ñ c¸c protein
®iÒu hßa phï hîp, xuÊt hiÖn ë tØ lÖ thÝch hîp, ®Ó liªn kÕt ®−îc vµo hai tr×nh tù t¨ng c−êng
nµy. Tuy vËy, ®Ó c¸c gen ®−îc biÓu hiÖn theo ®óng trËt tù, cßn cÇn mét nhãm c¸c yÕu tè
®iÒu hßa chung, gäi lµ vïng ®iÒu khiÓn locut - LCR (Locus Control Region), n»m
ng−îc dßng c¸ch côm gen globin 30 – 50 kb. C¸ch ho¹t ®éng cña LCR ®Õn nay ch−a s¸ng
tá, nh−ng nã lµ vÞ trÝ liªn kÕt cña c¸c protein ®iÒu hßa kh¸c nhau cã thÓ kÝch øng lµm
“më” cÊu tróc chÊt nhiÔm s¾c quanh côm gen globin, ®ång thêi cho phÐp mét chuçi c¸c
yÕu tè ®iÒu hßa cã thÓ ®iÒu khiÓn c¸c gen ®¬n lÎ theo mét trËt tù nhÊt ®Þnh.
LCR gåm nhiÒu tr×nh tù thµnh
phÇn. Trong ®ã, mét sè lµ c¸c tr×nh tù a)
t¨ng c−êng, mét sè lµ tr×nh tù c¸ch li, cßn Vïng ®iÒu khiÓn locut (LCR) ε γG γA δ β
l¹i lµ promoter. Sù ®a d¹ng vÒ chøc n¨ng
cña c¸c tr×nh tù nµy ®−îc xem lµ m« h×nh
gi¶i thÝch cho c¬ chÕ ho¹t ®éng cña LCR. Côm gen m· hãa globin
10 kb
Trong ®ã, c¸ch ®¬n gi¶n nhÊt lµ c¸c b)
protein ®iÒu hßa liªn kÕt vµo LCR vµ huy LCR Ey β h1 β maj β min
®éng phøc hÖ c¶i biÕn chÊt nhiÔm s¾c tiÕp
cËn vïng gen cÇn biÓu hiÖn. ViÖc c¸c LCR 10 kb
th−êng ë gÇn promoter cña gen ®−îc ho¹t
hãa lµ c¨n cø ñng hé cho c¸ch ®iÓu khiÓn H×nh 5.31. §iÒu hßa ho¹t ®éng gen bëi vïng
nµy. Tuy vËy, theo mét c¸ch kh¸c, toµn bé ®iÒu khiÓn locut - LCR. a) Côm gen m· hãa globin
ë ng−êi ®−îc ®iÒu khiÓn bëi mét LCR. Trªn h×nh kh«ng
bé m¸y phiªn m· ®−îc huy ®éng tíi LCR
minh häa gen α-globin, lµ gen ®−îc biÓu hiÖn trong
vµ xuÊt ph¸t tõ ®©y, c¸c ho¹t ®éng ®iÒu
suèt qu¸ tr×nh ph¸t triÓn. C¸c gen cßn l¹i (β, ε, δ, vµ γ)
hßa phiªn m· (bao gåm sù c¶i biÕn cÊu chØ biÓu hiÖn vµo nh÷ng giai ®o¹n kh¸c nhau cña qu¸
tróc chÊt nhiÔm s¾c vµ gi¶i phãng c¸c yÕu tr×nh ph¸t triÓn vµ theo mét trËt tù nhÊt ®Þnh. Chuçi α-
tè øc chÕ côc bé) b¾t ®Çu diÔn ra. ë globin kÕt hîp víi mét lo¹i chuçi globin kh¸c h×nh
eukaryote, cã mét sè côm gen còng ®−îc thµnh nªn c¸c d¹ng hemoglobin vµo c¸c giai ®o¹n
t×m thÊy cã kiÓu ®iÒu hßa qua LCR t−¬ng ph¸t triÓn kh¸c nhau cña c¬ thÓ. b) Côm gen m· hãa
tù gen m· hãa globin. globin ë chuét còng ®−îc ®iÒu khiÓn bëi mét LCR.
172
Ch−¬ng 5. gen vµ sù ®iÒu hoµ biÓu hiÖn gen
5.3.5. §iÒu hßa biÓu hiÖn gen ë eukaryote sau khëi ®Çu phiªn m·
5.3.5.1. Mét sè yÕu tè t¨ng c−êng biÓu hiÖn gen theo kiÓu kÐo dµi phiªn m·
C¸c bé m¸y phiªn m· ë eukaryote th−êng gåm nhiÒu protein cÇn cho sù khëi ®Çu
phiªn m·. §ång thêi nã còng chøa mét sè yÕu tè tham gia vµo giai ®o¹n kÐo dµi (xem
ch−¬ng 4). ë mét sè gen, n»m sau promoter cã c¸c tr×nh tù g©y t¹m dõng sù “tr−ît däc”
ph©n tö ADN cña ARN polymerase. ë nh÷ng gen nµy, sù cã mÆt hay v¾ng mÆt nh÷ng
yÕu tè kÐo dµi (chuçi polyribonucleotide ®ang tæng hîp) cã vai trß quyÕt ®Þnh møc biÓu
hiÖn cña gen.
VÝ dô gen HSP70 ë ruåi giÊm, gen nµy ®−îc ho¹t hãa bëi yÕu tè sèc nhiÖt vµ ®−îc
®iÒu khiÓn ®ång thêi bëi hai yÕu tè ho¹t hãa. YÕu tè liªn kÕt GAGA ®−îc xem lµ ®ñ ®Ó cã
thÓ huy ®éng bé m¸y phiªn m· tíi gen vµ khëi ®Çu phiªn m·. Song, nÕu kh«ng cã yÕu tè
thø hai lµ HSF th× ARN polymerase sÏ dõng l¹i ë mét vÞ trÝ sau promoter kho¶ng 100 bp.
Nh−ng, khi cã tÝn hiÖu “sèc nhiÖt”, HSF sÏ liªn kÕt vµo mét vÞ trÝ ®Æc hiÖu trªn promoter
vµ huy ®éng mét enzym kinase (pTEF) tíi vÞ trÝ bé m¸y phiªn m· ®ang dõng l¹i. Enzym
nµy phosphoryl hãa miÒn ®Çu C thuéc tiÓu phÇn lín nhÊt cña ARN polymerase vµ “níi
láng” enzym ë vÞ trÝ t¹m dõng; nhê vËy, sù kÐo dµi phiªn m· ®−îc tiÕp tôc. Nh− vËy,
ngoµi c¸c c¬ chÕ ®iÒu hßa chung, ®©y lµ mét kiÓu ®iÒu hßa bæ sung. Còng cã thÓ chØ cã
mét sè gen cã c¬ chÕ ®iÒu hßa bæ sung gièng HSP70.
HIV g©y héi chøng AIDS tiÕn hµnh phiªn m· c¸c gen cña nã tõ mét promoter ®−îc
®iÒu khiÓn bëi pTEF. Trong tr−êng hîp cña HIV còng vËy, polymerase (ë ®©y lµ reverse
transcriptase) khëi ®Çu phiªn m· t¹i promoter nh−ng ngay sau ®ã nã dõng l¹i. Lóc ®ã,
pTEF ®−îc vËn chuyÓn ®Õn enzym bëi mét protein liªn kÕt ARN (chø kh«ng ph¶i ADN)
cã tªn lµ TAT. TAT nhËn ra mét tr×nh tù ®Æc hiÖu gÇn vÞ trÝ ë ®Çu ph©n tö ARN cña HIV
vµ tr×nh tù t−¬ng øng trªn b¶n phiªn m· ®· ®−îc t¹o ra bëi polymerase ®ang dõng l¹i.
TAT cã mét vïng t−¬ng t¸c víi pTEF vµ nhê vËy huy ®éng ®−îc protein nµy ®Õn enzym.
5.3.5.2. C¸ch c¾t intron kh¸c nhau ë c¸c tÕ bµo cã thÓ t¹o ra c¸c protein kh¸c nhau
ë ch−¬ng 3 chóng ta ®· biÕt, hÇu hÕt gen ë eukaryote ®Òu cã tÝnh ph©n m¶nh: n»m
gi÷a c¸c tr×nh tù m· hãa (exon) lµ c¸c tr×nh tù kh«ng m· hãa (intron). Trong phiªn m·,
ban ®Çu toµn bé tr×nh tù gen (ADN) ®−îc chuyÓn thµnh tr×nh tù b¶n phiªn m· (tiÒn-
mARN). Sau ®ã, ph©n tö tiÒn-ARN ®−îc c¾t bá c¸c intron, vµ nèi l¹i c¸c exon thµnh ph©n
tö ARN hoµn thiÖn. ë eukaryote, c¬ thÓ cµng phøc t¹p, sè gen cã intron, sè intron trung
b×nh vµ kÝch th−íc c¸c intron ë mçi gen cµng cã xu h−íng t¨ng lªn.
Trong mét sè tr−êng hîp, c¸ch c¾t intron tõ cïng mét ph©n tö tiÒn-mARN cã thÓ
theo mét sè c¸ch kh¸c nhau, t¹o nªn c¸c ph©n tö mARN hoµn thiÖn kh¸c nhau (tõ ®ã, t¹o
nªn c¸c protein kh¸c nhau). Tuy vËy, ®iÒu ®¸ng chó ý lµ kiÓu c¾t bá intron l¹i cã tÝnh di
truyÒn vµ ®Æc tr−ng ë mçi lo¹i tÕ bµo (m«) vµ vµo nh÷ng thêi ®iÓm nhÊt ®Þnh cña qu¸
tr×nh ph¸t triÓn c¸ thÓ. Nãi c¸ch kh¸c, qu¸ tr×nh nµy còng ®−îc ®iÒu khiÓn chÆt chÏ.
ë khÝa c¹nh nµo ®ã, viÖc ®iÒu hßa c¸ch c¾t intron còng gièng nh− c¬ chÕ ®iÒu hßa
phiªn m·. §Ó c¾t c¸c intron vµ nèi c¸c exon, “bé m¸y c¾t intron” th−êng liªn kÕt vµo c¸c
vÞ trÝ c¾t intron vµ thùc hiÖn ph¶n øng c¾t-nèi. Cã hai yÕu tè chÝnh ¶nh h−ëng ®Õn ho¹t
®éng c¾t-nèi intron lµ ¸i lùc liªn kÕt víi c¸c vÞ trÝ c¾t-nèi cña bé m¸y c¾t intron vµ ho¹t
lùc cña c¸c protein tham gia ph¶n øng c¾t – nèi. NÕu vÞ trÝ c¾t-nèi cã ¸i lùc cao víi bé
m¸y c¾t intron, th× ho¹t ®éng c¾t intron ë vÞ trÝ ®ã cã thÓ ®−îc ®iÒu khiÓn theo kiÓu “c¬
®Þnh” (nghÜa lµ, th−êng xuyªn x¶y ra). Nh−ng nÕu nã bÞ øc chÕ bëi mét “yÕu tè k×m h·m
c¾t intron” (gièng nh− kiÓu LacI), th× bé m¸y c¾t intron kh«ng liªn kÕt ®−îc vµo vÞ trÝ c¾t
173
§inh §oµn Long
intron vµ ph¶n øng c¾t-nèi kh«ng x¶y ra. C¬ chÕ øc chÕ c¾t intron nh− vËy gièng víi c¬
chÕ øc chÕ phiªn m· vµ dÞch m· chóng ta ®· thÊy ë E. coli.
Theo mét c¸ch kh¸c, ng−êi ta t×m thÊy nh÷ng “tr×nh tù t¨ng c−êng c¾t intron” ë gÇn
c¸c vÞ trÝ c¾t-nèi. Nh÷ng tr×nh tù nµy ®−îc nhËn biÕt bëi c¸c protein ®iÒu hßa cã xu
h−íng huy ®éng bé m¸y c¾t intron tíi c¸c vÞ trÝ c¾t-nèi. Gièng nh− c¸c yÕu tè ho¹t hãa
phiªn m·, c¸c protein ®iÒu hßa nµy cã c¸c miÒn chøc n¨ng t¸ch biÖt nhau. Mét miÒn liªn
kÕt víi axit nucleic (ë ®©y lµ ARN), cßn mét miÒn liªn kÕt víi bé m¸y c¾t intron.
C¬ chÕ ®iÒu hßa c¾t intron bëi c¸c protein ho¹t hãa vµ øc chÕ c¾t intron lµ c¬ së cña
c¬ chÕ x¸c ®Þnh giíi tÝnh ë ruåi giÊm, ®−îc m« t¶ nh− sau:
- Giíi tÝnh ë ruåi giÊm ®−îc qui ®Þnh dùa trªn tØ sè gi÷a sè NST giíi tÝnh X trªn sè
bé NST th−êng (X/A). Con c¸i ®iÓn h×nh cã tØ sè nµy lµ 1,0 (2 NST X vµ 2 bé NST th−êng),
cßn con ®ùc ®iÓn h×nh cã tØ sè nµy lµ 0,5 (1 NST X vµ 2 bé NST th−êng). TØ sè nµy ban
®Çu ®−îc “®o” bëi møc phiªn m· cña mét sè gen ®−îc ®iÒu khiÓn bëi hai yÕu tè ho¹t hãa,
lµ SisA vµ SisB. C¸c gen m· hãa c¸c yÕu tè nµy ®Òu n»m trªn NST X. Nhê vËy, trong thêi
kú ®Çu ph¸t triÓn ph«i, con c¸i sÏ s¶n sinh SisA vµ SisB nhiÒu gÊp ®«i c¸c con ®ùc.
C¸c protein ho¹t hãa nµy liªn kÕt vµo c¸c vÞ trÝ ®iÒu hßa n»m ng−îc dßng gen qui
®Þnh giíi tÝnh SxI (h×nh 5.32). Mét protein ®iÒu hßa kh¸c còng liªn kÕt vµ ®iÒu khiÓn
biÓu hiÖn cña SxI lµ protein øc chÕ Dpn. Dpn ®−îc m· hãa bëi mét gen n»m trªn NST sè
2. Nh− vËy, ta thÊy tØ lÖ protein ho¹t hãa (SisA vµ SisB) vµ øc chÕ (Dpn) lµ kh¸c nhau ë
hai giíi. §iÒu nµy dÉn ®Õn gen SxI ®−îc t¨ng c−êng ë con c¸i vµ øc chÕ ë con ®ùc.
Gen SxI ®−îc biÓu hiÖn tõ hai promoter kh¸c nhau, gäi lµ Pm vµ Pe. Trong ®ã, Pe
®−îc ®iÒu khiÓn bëi SisA vµ SisB (nh− vËy, Pe chØ ho¹t ®éng ë con c¸i). Trong c¸c giai
®o¹n sau cña qu¸ tr×nh ph¸t triÓn, Pe kh«ng ho¹t ®éng; sù duy tr× ho¹t ®éng cña gen SxI
lµ nhê Pm. Pm ho¹t ®éng theo kiÓu c¬ ®Þnh ë c¶ con ®ùc vµ c¸i, nh−ng s¶n phÈm mARN
cña gen SxI ®−îc phiªn m· tõ Pm nhiÒu h¬n s¶n phÈm phiªn m· tõ Pe mét exon. NÕu
mARN hoµn thiÖn cã exon nµy, th× protein t¹o ra kh«ng cã ho¹t tÝnh (®iÒu nµy x¶y ra ë
con ®ùc). NÕu mARN ®−îc c¾t bá exon nµy, protein SxI ho¹t ®éng vµ duy tr× kiÓu h×nh
con c¸i. Nh− vËy, trong giai ®o¹n ph«i sím, Pe ho¹t ®éng ë con c¸i, dÉn ®Õn viÖc protein
Ruåi giÊm c¸i Ruåi giÊm ®ùc
2X : 2A 1X : 2A
SisA Dpn SisA Dpn
SisB 1x SisB 1x
2x 1x
H×nh 5.32. §iÒu hßa phiªn mX gen biÓu hiÖn sím SxI ë ruåi giÊm ®ùc vµ c¸i. C¸c gen sisA vµ sisB n»m
trªn NST X m· hãa cho c¸c yÕu tè ho¹t hãa ®iÒu khiÓn gen SxI. Dpn lµ yÕu tè øc chÕ biÓu hiÖn gen SxI cã gen m·
hãa n»m trªn NST sè 2. NÕu l−îng Dpn sinh ra tõ gen trªn NST th−êng lµ gièng nhau ë c¶ 2 giíi, th× c¸c yÕu tè ho¹t
hãa (SisA vµ B) ®−îc tæng hîp ë con c¸i nhiÒu gÊp ®«i con ®ùc. Sù kh¸c biÖt vÒ tØ sè [protein ho¹t hãa]/[protein øc
chÕ] quyÕt ®Þnh gen SxI chØ biÓu hiÖn ë con c¸i, nh−ng kh«ng biÓu hiÖn ë con ®ùc (nguån: Estes et al, 1995)
174
Ch−¬ng 5. gen vµ sù ®iÒu hoµ biÓu hiÖn gen
SxI cã ë con c¸i mµ kh«ng cã ë con ®ùc. Protein nµy trùc tiÕp ®iÒu khiÓn c¾t exon trªn
ph©n tö tiÒn-mARN ®−îc phiªn m· tõ promoter Pm. Nªn, ë con c¸i, “exon øc chÕ” nµy bÞ
c¾t bá.
5.3.5.3. Sù ®iÒu hßa biÓu hiÖn gen ®−îc ®iÒu khiÓn ë b−íc dÞch m·
Gcn4 lµ mét yÕu tè ho¹t hãa phiªn m· ë nÊm men. Nã tham gia ®iÒu khiÓn c¸c gen
m· hãa enzym xóc t¸c c¸c ph¶n øng tæng hîp c¸c axit amin. Dï lµ mét yÕu tè phiªn m·,
nh−ng sù tæng hîp protein nµy ®−îc ®iÒu hßa ë b−íc dÞch m·. Khi nång ®é c¸c axit amin
trong tÕ bµo thÊp, mARN cña Gcn4 ®−îc dÞch m·. Nh−ng, khi nång ®é axit amin trong tÕ
bµo cao, mARN cña Gcn4 kh«ng ®−îc dÞch m·. C¬ chÕ cña hiÖn t−îng nµy nh− thÕ nµo?
mARN cña Gcn4 chøa bèn khung ®äc më n»m ng−îc dßng gen Gcn4 (kÝ hiÖu
uORF). Trong ®ã uORF1 c¸ch gen xa nhÊt vµ ®−îc nhËn biÕt m¹nh nhÊt khi phøc hÖ
dÞch m· (ribosome) tr−ît däc mARN tõ ®Çu 5’. Khi khung ®äc uORF1 ®· dÞch m· xong,
mét thuéc tÝnh ®Æc biÖt cña khung ®äc nµy lµ nã cho phÐp 50% sè tiÓu phÇn nhá cña
ribosome tiÕp tôc duy tr× liªn kÕt víi mARN vµ t×m ®Õn m· më ®Çu (AUG) cña c¸c uORF
tiÕp sau nã.
Tr−íc khi khëi ®Çu dÞch m·, ë c¸c uORF tiÕp theo, tiÓu phÇn ribosome 40S (®iÒu
khiÓn sù tr−ît däc ph©n tö mARN cña ribosome) ph¶i liªn kÕt ®−îc víi yÕu tè dÞch m·
eIF2 (®· t¹o phøc s½n víi Met-tARN). Khi nång ®é axit amin thÊp, eIF2 bÞ phosphoryl
hãa, lµm gi¶m hiÖu qu¶ liªn kÕt cña nã vµo ribosome. §ång thêi lóc nµy sù s½n cã phøc
hÖ Met-tARN còng thÊp. Nh− vËy, khi hiÕm axit amin, tiÓu phÇn nhá cña ribosome cã xu
h−íng v−ît qua c¸c uORF 2 – 4 tr−íc khi liªn kÕt ®−îc trë l¹i víi eIF2-tARNMet (vèn vÉn
ë hµm l−îng thÊp). Nh− vËy, dï phøc hÖ dÞch m· kh«ng khëi ®Çu dÞch m· ®−îc ë c¸c
uORF2-4, nh−ng nã l¹i cã thÓ khëi ®Çu ë ORF cña gen Gcn4. Së dÜ nh− vËy, bëi v× ORF
cña Gcn4 n»m xa uORF1 h¬n, vµ ribosome cã ®ñ thêi gian “trèng” ®Ó liªn kÕt víi eIF2-
tARNMet vµ b¾t ®Çu dÞch m· gen nµy. Lóc ®ã, protein Gcn4 ®−îc h×nh thµnh vµ nã “bËt”
c¸c gen tham gia tæng hîp c¸c axit amin trong tÕ bµo.
Khi l−îng c¸c axit amin trong tÕ bµo cao, phøc hÖ eIF2-tARNMet sÏ liªn kÕt víi tiÓu
phÇn ribosome nhá ngay khi nã kÕt thóc dÞch m· uORF1, vµ sù dÞch m· sÏ ®−îc diÔn ra
víi c¸c uORF2, 3 vµ 4. Sau khi nh÷ng khung ®äc nµy ®−îc dÞch m· xong, ribosome sÏ t¸ch
khái ph©n tö mARN vµ kh«ng dÞch m· khung ORF cña gen Gcn4. Do vËy, Gcn4 kh«ng
h×nh thµnh.
5.3.6. C¸c vai trß kh¸c nhau cña ARN trong ®iÒu hßa biÓu hiÖn gen
ë ch−¬ng 2, chóng ta ®· thÊy c¸c chøc n¨ng ®a d¹ng cña ARN. Trong thùc tÕ, nhãm
ph©n tö nµy cßn cã vai trß quan träng trong ®iÒu hßa biÓu hiÖn cña nhiÒu gen kh¸c nhau.
Chóng ta cßn nhí ë E. coli, trong m« h×nh operon Trp, cÊu tróc bËc 2 cña mARN cña
opreron Trp ®· trùc tiÕp ®iÒu hßa biÓu hiÖn c¸c gen cña operon nµy.
ë eukaryote, vai trß cña ARN trong ®iÒu hßa ho¹t ®éng gen cßn linh ho¹t h¬n. Mét
trong nh÷ng c¬ chÕ ®ã lµ: nh÷ng ®o¹n ARN ng¾n cã thÓ trùc tiÕp øc chÕ sù biÓu hiÖn cña
c¸c gen cã tr×nh tù t−¬ng ®ång víi nã. Sù øc chÕ nµy, gäi lµ ARN can thiÖp (kÝ hiÖu
ARNi). C¸c ph©n tö ARNi cã thÓ g©y nªn c¸c hiÖu øng: (1) øc chÕ dÞch m· ®èi víi mARN,
(2) ph©n gi¶i mARN, vµ (3) øc chÕ sù phiªn m· cña gen ë trong nh©n. C¬ chÕ chi tiÕt cã
thÓ ®ång thêi g©y nªn c¸c hiÖu øng trªn cña ARNi ch−a biÕt ®Çy ®ñ. Nh−ng ë ®©y, chóng
ta sÏ xem m« h×nh ho¹t ®éng cña ARNi ®−îc t×m thÊy ë giun trßn C. elegans. HiÖn nay,
viÖc sö dông ARNi ®−îc ¸p dông nh− mét c«ng cô h÷u hiÖu khi cÇn “t¾t” mét gen nµo ®ã.
175
§inh §oµn Long
5.3.6.1. ARN sîi kÐp øc chÕ m¹nh sù biÓu hiÖn cña gen cã tr×nh tù t−¬ng ®ång víi nã
N¨m 2006, hai nhµ sinh häc ng−êi Mü lµ Fire vµ Mello ®· ®−îc trao gi¶i Nobel vÒ
c«ng tr×nh nghiªn cøu c«ng bè n¨m 1998 cña hä vÒ viÖc c¸c ph©n tö ARN sîi kÐp
(dsARN), sau khi biÕn n¹p vµo tÕ bµo C. elegans, g©y nªn hiÖu øng øc chÕ m¹nh sù biÓu
hiÖn cña c¸c gen cã tr×nh tù t−¬ng ®ång hoµn toµn hoÆc mét phÇn víi chóng. HiÖu øng
nµy sau ®ã ®−îc t×m thÊy ë nhiÒu eukaryote kh¸c. Tuy nhiªn, tr−íc khi cã nh÷ng nghiªn
cøu nµy, ng−êi ta ®· t×m thÊy hiÖn
t−îng c¸c gen bÞ “t¾t” khi biÕn n¹p ARN sîi kÐp
c¸c ®o¹n tr×nh tù t−¬ng ®ång cña (dsARN)
chóng vµo tÕ bµo thùc vËt. C¸c Mµng tÕ bµo
®o¹n gen biÕn n¹p ®−îc t×m thÊy cã
nhiÒu b¶n sao, mét sè liªn kÕt vµo YÕu tè TÕ bµo chÊt
hÖ gen nh©n víi tr×nh tù ®¶o chiÒu. xÐn
ë thùc vËt, ng−êi ta còng t×m thÊy (dicer)
Nh©n
c¸c tr×nh tù ARN t−¬ng ®ång trong
tÕ bµo
mét sè c¬ chÕ b¶o vÖ tÕ bµo khái sù siARN sîi kÐp
g©y nhiÔm cña virut. Ngoµi ra, cã (siARN duplex)
mét hiÖn t−îng lµ sù l©y nhiÔm cña
virut ARN mang mét b¶n sao gen ADN
cña thùc vËt th−êng lµm “t¾t” sù
biÓu hiÖn cña gen tÕ bµo chñ. TÊt T¸i cÊu tróc
c¶ c¸c hiÖn t−îng trªn ®©y cã c¬ chÕ chÊt nhiÔm s¾c RISC
liªn quan ®Õn nhau, ®ã lµ c¸c ph©n
tö ARN sîi kÐp cã thÓ lµm “t¾t” sù ATP
biÓu hiÖn cña gen. C¬ chÕ ®−îc m«
t¶ trong c¸c môc d−íi ®©y. ADP
176
Ch−¬ng 5. gen vµ sù ®iÒu hoµ biÓu hiÖn gen
silencing complex). Ngoµi siARN, RISC th−êng chøa mét sè thµnh phÇn lµ protein; trong
®ã, ®¸ng chó ý lµ mét sè protein thuéc hä Agronaut (liªn kÕt ARN).
Nh− m« t¶ trªn h×nh 5.33, sau khi siARN ®−îc t¹o ra (nhê dicer), nã liªn kÕt víi
phøc hÖ RISC vµ biÕn tÝnh thµnh m¹ch ®¬n (dïng n¨ng l−îng tõ ATP). Sù xuÊt hiÖn
m¹ch ®¬n ARN sÏ ho¹t hãa RISC (kÝ hiÖu lµ RISC*). ë tr¹ng th¸i ho¹t hãa, RISC* ®−îc
“®−a” ®Õn c¸c ph©n tö mARN ®Ých cã tr×nh tù bæ sung víi siARN cña nã. Lóc nµy, RISC*
sÏ c¾t ph©n tö mARN ®Ých vµ ng¨n c¶n sù dÞch m· tõ ph©n tö nµy. C¬ chÕ t¾t gen lóc
nµy mét phÇn phô thuéc vµo møc ®é t−¬ng ®ång gi÷a siARN vµ mARN ®Ých. NÕu sù
t−¬ng ®ång lµ hoµn toµn, ph©n tö ARN ®Ých cã xu h−íng bÞ ph©n gi¶i (do ho¹t tÝnh
nuclease cña RISC). NÕu chØ t−¬ng ®ång mét phÇn, xu h−íng x¶y ra lµ sù øc chÕ dÞch m·.
RISC* còng cã thÓ x©m nhËp ®−îc vµo nh©n tÕ bµo vµ kÕt cÆp víi tr×nh tù t−¬ng
®ång trªn ph©n tö ADN hÖ gen. Lóc nµy, RISC huy ®éng mét sè protein lµm c¶i biÕn chÊt
nhiÔm s¾c quanh vÞ trÝ promoter cña gen, dÉn ®Õn sù k×m h·m phiªn m· (ch¼ng h¹n, qua
c¬ chÕ “bÝt gen” do sù biÕn ®æi chÊt nhiÔm s¾c ®· ®−îc ®Ò cËp ë trªn).
Mét ®iÓm ®¸ng chó ý lµ c¬ chÕ “t¾t” gen bëi ARNi cã hiÖu qu¶ rÊt cao. ChØ cÇn mét
l−îng nhá siARN ®−îc ®−a vµo tÕ bµo cã thÓ ®ñ ®Ó lµm “t¾t” hoµn toµn sù biÓu hiÖn cña
mét gen nµo ®ã (vèn cã nhiÒu b¶n sao trong c¬ thÓ ®a bµo). C¬ chÕ g©y nªn hiÖu øng
m¹nh nh− vËy ch−a biÕt ®Çy ®ñ, nh−ng cã b»ng chøng cho thÊy siARN ®· ®−îc nh©n lªn
nhê c¸c enzym ARN polymerase dïng ARN lµm khu«n. Sù nh©n lªn cña c¸c siARN
®−îc ph¸t hiÖn nhê hiÖn t−îng sau: khi ph©n tö siARN liªn kÕt vµo mARN ®Ých, c¸c ph©n
tö siARN míi ®−îc h×nh thµnh cã tr×nh tù gièng víi tr×nh tù ph©n ®o¹n mARN n»m gÇn
tr×nh tù mARN ®Ých cña siARN gèc. V× vËy, cã lÏ enzym ARN polymerase dïng ARN lµm
khu«n ®· ®−îc c¸c siARN gèc huy ®éng ®Õn ph©n tö mARN ®Ých; vµ c¸c enzym nµy ®· sö
dông chÝnh c¸c ®o¹n siARN m¹ch ®¬n lµm “måi” ®Ó tæng hîp nªn c¸c ph©n tö siARN míi.
5.3.6.3. C¸c miARN ®iÒu khiÓn sù biÓu hiÖn gen trong qu¸ tr×nh ph¸t triÓn
Ngoµi c¬ chÕ ®iÒu hßa biÓu hiÖn gen b»ng siARN kÓ trªn, trong tù nhiªn cßn c¬ chÕ
®iÒu hßa biÓu hiÖn gen bëi mét nhãm ARN gäi lµ microARN (miARN). C¸c ph©n tö
miARN øc chÕ trùc tiÕp sù biÓu hiÖn gen theo kiÓu gièng víi siARN. miARN ®−îc t×m
thÊy ®Çu tiªn ë C. elegans, sau ®ã ®−îc ph¸t hiÖn vµ nghiªn cøu kü h¬n ë thùc vËt. C¸c
ph©n tö miARN ®iÓn h×nh cã chiÒu dµi 21 – 22 nucleotide, h×nh thµnh tõ c¸c tiÒn-ARN cã
kÝch th−íc 70 - 90 nucleotide (®−îc phiªn m· tõ c¸c ®o¹n ADN kh«ng m· hãa protein).
C¸c miARN ®−îc c¸c dicer nhËn biÕt vµ c¾t. Víi c¬ chÕ gièng siARN, c¸c miARN lµm
ph©n gi¶i c¸c ph©n tö mARN ®Ých (ë thùc vËt), hoÆc øc chÕ sù dÞch m· (ë giun trßn).
¦íc l−îng cã kho¶ng 120 gen m· hãa miARN ë giun trßn, cßn ë ng−êi cã kho¶ng
250 gen. Th«ng th−êng, c¸c gen miARN ®−îc ®iÒu hßa theo kiÓu chØ biÓu hiÖn vµo nh÷ng
thêi ®iÓm nhÊt ®Þnh vµ ë c¸c m« nhÊt ®Þnh trong qu¸ tr×nh ph¸t triÓn. Mét c¸ch ®iÓn
h×nh lµ chóng øc chÕ c¸c mARN m· hãa c¸c protein ®iÒu hßa tham gia ®iÒu khiÓn sù biÓu
hiÖn c¸c nhãm gen t−¬ng øng víi mét giai ®o¹n ph¸t triÓn cña c¬ thÓ sinh vËt. §¸ng chó
ý, 30% c¸c ph©n tö miARN ë giun trßn cã tr×nh tù rÊt gièng víi ë ruåi giÊm vµ ®éng vËt
cã vó. §iÒu nµy cho thÊy, d−êng nh− c¬ chÕ ®iÒu hßa biÓu hiÖn gen bëi miARN ®· cã
nguån gèc tõ l©u trong qu¸ tr×nh tiÕn hãa, vµ vai trß cña chóng trong viÖc “lËp tr×nh”
biÓu hiÖn cña hÖ gen lµ quan träng h¬n nh÷ng dù ®o¸n ban ®Çu.
177
§inh §oµn Long
Cã gi¶ thiÕt cho r»ng, trong qu¸ tr×nh tiÕn hãa, c¬ chÕ sö dông ARNi ®· xuÊt hiÖn
do nhu cÇu b¶o vÖ tÕ bµo chñ (eukaryote) khái c¸c virut vèn dïng c¸c ph©n tö dsARN lµ
d¹ng trung gian trong sù sinh s¶n cña chóng. Nh− chóng ta ®· biÕt, nhiÒu virut vµ c¸c
yÕu tè di truyÒn vËn ®éng (transposon) sao chÐp th«ng qua d¹ng trung gian dsARN. Lóc
nµy, ARNi lµm t¾t c¸c gen cña c¸c thÓ g©y nhiÔm, ®ång thêi ph¸ bá c¸c ph©n tö dsARN
trung gian. Mét ®iÓm ®¸ng chó ý lµ kiÓu ho¹t ®éng cña ARNi biÓu hiÖn râ ë thùc vËt.
NhiÒu virut thùc vËt còng ®· ph¸t triÓn c¬ chÕ chèng l¹i sù ®¸p øng tù vÖ nhê ARNi cña
vËt chñ. C¬ chÕ nµy ë virut ®−îc gäi lµ “sù øc chÕ t¾t gen bëi ARNi”, viÕt t¾t lµ VSGS
(viral suppression of gene silencing). ë c¸c c¬ thÓ chñ mµ con ®−êng ®¸p øng tù vÖ nhê
ARNi bÞ háng th× chøc n¨ng VSGS kh«ng cÇn thiÕt n÷a. ë giun trßn, mét sè ®ét biÕn lµm
háng bé m¸y ARNi cã liªn quan ®Õn sù t¨ng c−êng ho¹t ®éng cña c¸c yÕu tè di truyÒn
vËn ®éng.
178