ADN polimerasa

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Este aviso fue puesto el 26 de febrero de 2020.

ADN polimerasa ADN-dirigida

DNA polymerase.png

Estructura tridimensional de los motivos hélice-giro-hélice de unión al ADN de una ADN

polimerasa beta humana (basada en el archivo PDB 7ICG )

Estructuras disponibles

PDB

Estructuras enzimáticas[mostrar]

Identificadores

Identificadores

externos

Bases de datos de enzimas[mostrar]

Número EC 2.7.7.7

Número CAS 9012-90-2

Ontología génica[mostrar]

Ortólogos

Especies

Humano Ratón

PubMed (Búsqueda)

[1]

PMC (Búsqueda)

[2]

vte

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Las ADN polimerasas son enzimas (celulares o virales) que intervienen en el proceso de
replicación del ADN. Llevan a cabo la síntesis de la nueva cadena de ADN emparejando los
desoxirribonucleótidos trifosfato (dNTP) con los desoxirribonucleótidos complementarios
correspondientes del ADN molde. Los dNTP que se usan en la replicación del ADN contienen
tres fosfatos unidos al grupo hidroxilo 5' de la desoxirribosa y dependiendo de la base
nitrogenada serán dATP, dTTP, dCTP o dGTP. La reacción fundamental es una transferencia de
un grupo fosfato en la que el grupo 3'-OH actúa como nucleófilo en el extremo 3' de la cadena
que está en crecimiento. El ataque nucleofílico se produce sobre el fosfato a (el más próximo a
la desoxirribosa) del desoxirribonucleósido 5' trifosfato que entra, liberándose pirofosfato
inorgánico y alargándose el ADN (al formarse un nuevo enlace fosfodiéster). A diferencia de la
mayoría de procesos biológicos que ocurren en la célula en los que solo se separa un grupo
fosfato (Pi), durante la replicación se separan los dos últimos grupos fosfato, en forma de
grupo pirofosfato (PPi)

Este proceso se puede resumir en una ecuación química:

(DNA)n + dNTP ? (DNA)n+1 + PPi

A pesar de que la ADN polimerasa solo tiene un sitio activo para emparejar los cuatro dNTPs
diferentes, la unión correcta de los pares de bases A:T, C:G es posible basándose en la
geometría de estos: si la unión es incorrecta se produce un desplazamiento del fosfato a
haciendo más difícil su unión al extremo 3'-OH y ralentizando así el ritmo de catalísis, lo que da
lugar a que la ADN polimerasa añada preferentemente las bases correctas.

Las ADN polimerasas pueden añadir hasta 1000 nucleótidos por segundo. Esto es debido a su
naturaleza, es decir, el número de nucleótidos que son capaces de añadir cada vez que se
asocian al molde de ADN que van a copiar. Dado que la adición de los nucleótidos es un
proceso que dura unos milisegundos, la velocidad de catálisis va a depender del tiempo que la
ADN polimerasa permanece unida al ADN, esto es, de su procesividad.

Función correctora exonucleasa 3' ? 5' de las ADN polimerasas.

El crecimiento de la cadena se produce en dirección 5' ? 3', ya que se requiere de un grupo 3'-
OH libre para el inicio de la síntesis puesto que este es el que realiza el ataque nucleofílico
sobre el fosfato a del dNTP, de forma que las ADN polimerasas requieren de un iniciador 3'-OH
(que puede ser de ADN o ARN) llamado cebador que es sintetizado por la ARN primasa. El
extremo 3' del cebador se denomina extremo cebador.

Las ADN polimerasas también realizan otras funciones durante el proceso de replicación.
Además de participar en la elongación, desempeñan una función correctora y reparadora
gracias a su actividad exonucleasa 3', que les confiere la capacidad de degradar el ADN
partiendo de un extremo de este. Es importante que existan estos mecanismos de corrección
ya que de lo contrario los errores producidos durante la copia del ADN darían lugar a
mutaciones.

Índice

1 Funciones

1.1 Estructura

1.2 Procesividad

2 Reacción en cadena de la polimerasa

3 Familias de ADN polimerasas

4 ADN polimerasas procariotas

4.1 Pol I

4.2 Pol II

4.3 Pol III

4.4 Pol IV

4.5 Pol V

4.6 Familia D

4.7 Transcriptasa inversa (RT)

5 ADN polimerasa en eucariotas

5.1 Polimerasas ß, ?, s, µ (beta, lambda, sigma, mu) y TdT

5.2 Polimerasas a, d y e (alfa, delta y épsilon)

5.3 Polimerasas ?, ? y ? (eta, iota y kappa)

5.4 Polimerasas Rev1 y ? (zeta)

5.5 Polimerasas ?, ? y ? (gamma, theta y nu)

5.6 Transcriptasa inversa (RT)

5.7 Telomerasa

6 ADN polimerasas virales

7 Referencias

8 Bibliografía

Funciones

Las ADN polimerasas pueden agregar nucleótidos libres solo al extremo 3 ' de la cadena de
ADN en formación. Esto provoca que el alargamiento de la cadena en formación se realice en
la dirección 5'-3 '. Ninguna ADN polimerasa conocida puede iniciar una hebra de ADN
nuevamente, es decir, no puede colocar el primer nucleótido en la hebra, luego de unir el
segundo, luego el tercero, y así sucesivamente. Todo lo que pueden hacer es alargar una
cadena existente por su extremo 3'-OH, por lo que siempre debe haber un fragmento inicial ya
formado. Esta es la razón por la que la ADN polimerasa necesita un cebador pre-formado al
que agregar nucleótidos. Los cebadores pueden estar formados por ARN o ADN. En la
replicación del ADN, las dos primeras bases son siempre ARN y son sintetizadas por otra
enzima llamada primasa. También se requiere una enzima llamada helicasa para desenredar el
ADN y deshacer en esa región su estructura de doble hebra y formar la estructura de dos
hebras simples bifurcadas (esta región es la horquilla de replicación), lo que facilita la
replicación de cada una de las hebras siguiendo el modelo semiconservador de replicación del
ADN.

Otra propiedad que tienen algunas ADN polimerasas, pero no todas, es la corrección de
errores. Este proceso corrige los errores producidos durante la formación del ADN
neosintetizado. Cuando se reconoce un par de bases incorrectamente colocado, la ADN
polimerasa invierte la dirección de su movimiento al retrasar un par de bases. Esta actividad
exonucleasa 3'-5' de la enzima permite eliminar el par de bases incorrecto para luego ser
reemplazado por el correcto, la propia polimerasa que continuará la replicación. Esta actividad
se llama corrección de pruebas. Las ADN polimerasas se utilizan ampliamente en experimentos
de biología molecular.

Las ADN polimerasas tienen una estructura muy conservada, lo que significa que sus
subunidades catalíticas varían muy poco de una especie a otra. Las estructuras conservadas
generalmente realizan funciones importantes e insustituibles en la célula, cuyo mantenimiento
produce una serie de ventajas.

Estructura

Las ADN polimerasas conocidas tienen una estructura muy conservada, lo que significa que sus
subunidades catalíticas generales varían muy poco de una especie a otra, independientemente
de sus estructuras de dominio. Las estructuras conservadas suelen indicar funciones
importantes e insustituibles de la célula, cuyo mantenimiento proporciona ventajas evolutivas.
La forma se puede describir como una mano derecha con dominios de pulgar, dedo y palma. El
dominio de la palma parece funcionar catalizando la transferencia de grupos fosforilo en la
reacción de transferencia de fosforilo. El ADN se une a la palma cuando la enzima está activa.
Se cree que esta reacción está catalizada por un mecanismo de iones de dos metales. El
dominio de los dedos funciona para unir los nucleósidos trifosfatos.con la base de la plantilla.
El dominio del pulgar juega un papel potencial en la procesividad, la translocación y el
posicionamiento del ADN.

Procesividad
La rápida catálisis de la ADN polimerasa se debe a su naturaleza procesiva. La procesividad es
una característica de las enzimas que funcionan sobre sustratos poliméricos. En el caso de la
ADN polimerasa, el grado de procesividad se refiere al número medio de nucleótidos añadidos
cada vez que la enzima se une a una plantilla. La ADN polimerasa promedio requiere
aproximadamente un segundo para localizar y unir una unión cebador / molde. Una vez que se
une, una ADN polimerasa no procesadora agrega nucleótidos a una velocidad de un nucleótido
por segundo. Sin embargo, las ADN polimerasas procesivas agregan múltiples nucleótidos por
segundo, lo que aumenta drásticamente la velocidad de síntesis de ADN. El grado de
procesividad es directamente proporcional a la tasa de síntesis de ADN. La tasa de síntesis de
ADN en una célula viva se determinó primero como la tasa de elongación del ADN del fago T4
en bacterias infectadas con bacteriófagos. Durante el período de aumento exponencial del
ADN a 37 ° C, la tasa fue de 749 nucleótidos por segundo.

La capacidad de la ADN polimerasa para deslizarse a lo largo de la plantilla de ADN permite una
mayor procesividad. Hay un aumento dramático en la procesividad en la bifurcación de
replicación. Este aumento se ve facilitado por la asociación de la ADN polimerasa con proteínas
conocidas como abrazadera deslizante de ADN. Las pinzas son múltiples subunidades de
proteínas asociadas en forma de anillo. Utilizando la hidrólisis de ATP, una clase de proteínas
conocidas como proteínas de carga de abrazadera deslizante abren la estructura de anillo de
las abrazaderas deslizantes de ADN permitiendo la unión y liberación de la hebra de ADN.
Interacción proteína-proteínacon la pinza evita que la ADN polimerasa se difunda desde la
plantilla de ADN, lo que garantiza que la enzima se una a la misma unión cebador/plantilla y
continúe la replicación. La ADN polimerasa cambia de conformación, aumentando la afinidad
por la pinza cuando se asocia con ella y disminuyendo la afinidad cuando completa la
replicación de un tramo de ADN para permitir la liberación de la pinza.

Reacción en cadena de la polimerasa

Artículo principal: Reacción en cadena de la polimerasa

La propiedad de las ADN polimerasas para replicar hebras de ADN se utiliza para la reacción en
cadena de la polimerasa, conocida como PCR por sus siglas en inglés, para obtener un gran
número de copias de un fragmento de ADN particular, amplificándolo para propósitos de
investigación. En los procesos de PCR se requiere la utilización de polimerasas termoestables,
como la polimerasa Taq, debido a que es necesario aplicar altas temperaturas para
desnaturalizar la molécula de ADN.

Familias de ADN polimerasas

Según la homología de su estructura y la secuencia de aminoácidos las ADN polimerasas se

pueden clasificar en 6 familias. Las ADN polimerasas de los virus de ADN son difíciles de
clasificar en los siguientes grupos debido a la alta divergencia de las secuencias virales.

Familia A: Incluye las ADN polimerasas eucariotas ?, ?, ?, la procariota I y la viral T7.

Familia B: Incluye las ADN polimerasas eucariotas ?, a, d, e y la procariotas II. También se ha
propuesto la inclusión de algunas ADN polimerasas virales.

Familia D: Incluye la ADN polimerasa procariota D y también se ha propuesto la inclusión de

algunas ADN polimerasas virales.

Familia X: Incluye las ADN polimerasas eucariotas ß, s, ?, µ, TDT y la procariota III.

Familia Y: Incluye las ADN polimerasas eucariotas ?, ?, ? y las procariotas IV y V.

Familia RT: Incluye la telomerasa exclusiva de los eucariotas y las transcriptasas inversas
virales, eucariotas y procariotas.

ADN polimerasas procariotas

Holoenzima ADN Pol III de E. coli.

Actividad correctora exonucleasa 3' ? 5' de la subunidad e de la holoenzima ADN Pol III.

Las ADN polimerasas de los procariotas (arqueas y bacterias) son: las Pol I, II, III, IV, V, B, D y la
RT cada una de ellas está especializada en una o más de éstas funciones según cuál sea su
papel en la replicación. Las polimerasas procarióticas existen en dos formas: polimerasa
central y holoenzima. La polimerasa central sintetiza ADN a partir de la plantilla de ADN, pero
no puede iniciar la síntesis sola o con precisión. La holoenzima inicia la síntesis con precisión.

Pol I

Las polimerasas procariotas de la familia A incluyen la enzima ADN polimerasa I (Pol I), que
está codificada por el gen polA y es ubicua entre los procariotas. Esta polimerasa reparadora
participa en la reparación por escisión con actividad exonucleasa 3'-5 'y 5'-3' y en el
procesamiento de fragmentos de Okazaki generados durante la síntesis de la hebra
retrasada.1? Pol I es la polimerasa más abundante y representa> 95% de la actividad
polimerasa en E. coli; sin embargo, se han encontrado células que carecen de Pol I, lo que
sugiere que la actividad de Pol I puede ser reemplazada por las otras cuatro polimerasas. Pol I
agrega ~ 15-20 nucleótidos por segundo, mostrando así una pobre procesividad. En cambio,
Pol I comienza a agregar nucleótidos en el cebador de ARN: unión de plantilla conocida como
el origen de replicación (ori). Aproximadamente 400 pb aguas abajo del origen, la holoenzima
Pol III se ensambla y se hace cargo de la replicación a una velocidad y naturaleza altamente
procesivas.2?

La polimerasa Taq es una enzima termoestable de esta familia que carece de capacidad de
corrección de pruebas.3?

Pol II
La ADN polimerasa II es una polimerasa de la familia B codificada por el gen polB. Pol II tiene
actividad de exonucleasa 3'-5 'y participa en la reparación del ADN , el reinicio de la replicación
para evitar lesiones, y su presencia celular puede pasar de ~ 30-50 copias por célula a ~ 200-
300 durante la inducción de SOS. También se cree que Pol II es una copia de seguridad de Pol
III, ya que puede interactuar con proteínas holoenzimáticas y asumir un alto nivel de
procesividad. Se cree que el papel principal de Pol II es la capacidad de dirigir la actividad de la
polimerasa en la bifurcación de replicación y ayudó a detener los desajustes terminales de
derivación de Pol III.4?

Pol III

La holoenzima de la ADN polimerasa III es la enzima principal involucrada en la replicación del

ADN en los procariotas y pertenece a la familia de las polimerasas C. Consta de tres conjuntos:
el núcleo pol III, el factor de procesividad de la abrazadera deslizante beta y el complejo de
carga de la abrazadera. El núcleo consta de tres subunidades: a, el centro de actividad de la
polimerasa, ?, corrector de pruebas exonucleolítico y ?, que puede actuar como estabilizador
para ?. El factor de procesividad de la abrazadera deslizante beta también está presente por
duplicado, uno para cada núcleo, para crear una abrazadera que encierra el ADN, lo que
permite una alta procesividad.5? El tercer conjunto es un complejo cargador de pinzas de siete
subunidades (t2?dd'??).

El viejo "modelo de trombón" de los libros de texto describe un complejo de alargamiento con
dos equivalentes de la enzima central en cada horquilla de replicación (RF), uno para cada
hebra, el rezagado y el adelantado.6? Sin embargo, la evidencia reciente de estudios de una
sola molécula indica un promedio de tres equivalentes estequiométricos de enzima central en
cada RF tanto para Pol III como para su contraparte en B. subtilis, PolC.7? La microscopía
fluorescente en la célula ha revelado que la síntesis de la cadena principal puede no ser
completamente continua, y Pol III* (es decir, las subunidades a, e, t, d y ? de la holoenzima sin
la abrazadera deslizante ß2) tiene una alta frecuencia de disociación de los RF activos.8? En
estos estudios, la tasa de rotación de la horquilla de replicación fue de aproximadamente 10 s
para Pol III *, 47 s para la pinza deslizante ß2 y 15 m para la helicasa DnaB. Esto sugiere que la
helicasa DnaB puede permanecer asociada de manera estable en los RF y servir como un punto
de nucleación para la holoenzima competente. Los estudios in vitro de una sola molécula han
demostrado que Pol III * tiene una alta tasa de renovación de RF cuando está en exceso, pero
permanece asociada de manera estable con horquillas de replicación cuando la concentración
es limitante.8? Otro estudio de una sola molécula mostró que la actividad de la helicasa de
ADNB y el alargamiento de la hebra pueden proceder con una cinética estocástica
desacoplada.8?

Pol IV

La ADN polimerasa IV (Pol IV) es una ADN polimerasa propensa a errores que participa en
mutagénesis no dirigida.9? Pol IV es una polimerasa de la familia Y expresada por el gen dinB
que se activa mediante la inducción de SOS causada por polimerasas estancadas en la
bifurcación de replicación. Durante la inducción de SOS, la producción de Pol IV se multiplica
por diez y una de las funciones durante este tiempo es interferir con la procesividad de la
holoenzima Pol III. Esto crea un punto de control, detiene la replicación y da tiempo para
reparar las lesiones del ADN a través de la vía de reparación adecuada.10? Otra función de Pol
IV es realizar la síntesis de translesiones en la bifurcación de replicación estancada como, por
ejemplo, eludir los aductos de N2-desoxiguanina a un ritmo más rápido que atravesar el ADN
no dañado. Las células que carecen del gen dinB tienen una mayor tasa de mutagénesis
causada por agentes que dañan el ADN.11?

Pol V

La ADN polimerasa V (Pol V) es una ADN polimerasa de la familia Y que participa en la

respuesta SOS y en los mecanismos de reparación del ADN de la síntesis de translesión.12? La
transcripción de Pol V a través de los genes umuDC está altamente regulada para producir solo
Pol V cuando el ADN dañado está presente en la célula y genera una respuesta SOS. Las
polimerasas estancadas hacen que RecA se una al ssDNA, lo que hace que la proteína LexA se
digiera automáticamente. LexA pierde entonces su capacidad para reprimir la transcripción del
operón umuDC. La misma nucleoproteína RecA-ssDNA modifica postraduccionalmente la
proteína UmuD en proteína UmuD '. UmuD y UmuD 'forman un heterodímero que interactúa
con UmuC, que a su vez activa la actividad catalítica de la polimerasa de umuC en el ADN
dañado.13? Se ha propuesto un modelo de "cinturón de herramientas" de polimerasa para
cambiar la pol III por la pol IV en una horquilla de replicación detenida, donde ambas
polimerasas se unen simultáneamente a la pinza ß.14? Sin embargo, la participación de más de
una polimerasa TLS trabajando en sucesión para evitar una lesión aún no se ha demostrado en
E. coli. Además, Pol IV puede catalizar tanto la inserción como la extensión con alta eficiencia,
mientras que pol V se considera la principal polimerasa SOS TLS. Un ejemplo es la derivación
del entrecruzamiento de guanina timina intracatenaria donde se demostró, basándose en la
diferencia en las firmas mutacionales de las dos polimerasas, que pol IV y pol V compiten por
TLS del entrecruzamiento intracatenario.14?

Familia D

En 1998, se descubrió la familia D de ADN polimerasas.15? El complejo PolD es un

heterodímero de dos cadenas, cada una codificada por DP1 (corrección pequeña) y DP2
(catalítico grande). A diferencia de otras ADN polimerasas, la estructura y el mecanismo del
núcleo catalítico DP2 se parecen a los de las ARN polimerasas de múltiples subunidades. La
interfaz DP1-DP2 se parece a la del dedo de zinc de polimerasa eucariota de clase B y su
pequeña subunidad. DP1, una exonucleasa similar a Mre11, es probablemente el precursor de
una pequeña subunidad de Pol a y e, proporcionando capacidades de corrección de pruebas
ahora perdidas en eucariotas. Su dominio HSH N-terminal es similar a las proteínas AAA,
especialmente la subunidad d y RuvB de Pol III , en estructura. DP2 tiene un dominio KH de
clase II. PolD es más estable al calor y más preciso que la polimerasa Taq , pero aún no se ha
comercializado. Se ha sugerido que la ADN polimerasa de la familia D fue la primera en
evolucionar en organismos celulares y que la polimerasa replicativa del último antepasado
común universal (LUCA) pertenecía a la familia D.16?
Transcriptasa inversa (RT)

Es una ADN polimerasa dependiente de ARN (RdDp) que sintetiza ADN a partir de una plantilla
de ARN. La familia de la transcriptasa inversa contiene tanto la funcionalidad de la ADN
polimerasa como la funcionalidad de la ARNasa H, que degrada el ARN emparejado con el
ADN. La transcriptasa inversa se emplea comúnmente en la amplificación de ARN con fines de
investigación. Usando una plantilla de ARN, la PCR puede utilizar la transcriptasa inversa,
creando una plantilla de ADN. Esta nueva plantilla de ADN se puede utilizar para una
amplificación típica por PCR. Los productos de tal experimento son, por tanto, productos de
PCR amplificados a partir de ARN.

La transcripción inversa se acompaña de un cambio de plantilla entre las dos copias del
genoma (recombinación por elección de copia). De 5 a 14 eventos de recombinación por
genoma ocurren en cada ciclo de replicación. El cambio de plantilla (recombinación) parece ser
necesario para mantener la integridad del genoma y como un mecanismo de reparación para
salvar los genomas dañados

ADN polimerasa en eucariotas

Hay varios tipos de ADN polimerasa en los eucariotas: son las Pol ?, a, d, ?, ?, ?, e, ß, s, ?, µ, ?,
?, ?, TDT y la RT. La primasa (que es parte de la molécula de ADN polimerasa a) sintetiza
cebadores de ARN y además comienza la elongación con ADN de las dos cadenas. Después se
produce un cambio de polimerasa y entra la ADN polimerasa s, que continúa la síntesis.

Polimerasas ß, ?, s, µ (beta, lambda, sigma, mu) y TdT

Las polimerasas de la familia X contienen la polimerasa eucariota pol ß (beta) bien conocida,
así como otras polimerasas eucariotas como Pol s (sigma), Pol ? (lambda) , Pol µ (mu) y
desoxinucleotidil transferasa terminal (TdT) . Las polimerasas de la familia X se encuentran
principalmente en vertebrados y algunas se encuentran en plantas y hongos. Estas polimerasas
tienen regiones altamente conservadas que incluyen dos motivos hélice-horquilla-hélice que
son imperativos en las interacciones ADN-polimerasa. Un motivo está ubicado en el dominio
de 8 kDa que interactúa con el ADN corriente abajo y un motivo está ubicado en el dominio del
pulgar que interactúa con la cadena del cebador. Pol ß, codificado por el gen POLB, es
necesario para la reparación por escisión de base de parche corto, una vía de reparación del
ADN que es esencial para reparar bases alquiladas u oxidadas, así como sitios abásicos . Pol ? y
Pol µ, codificados por los genes POLL y POLM respectivamente, están involucrados en la unión
de extremos no homólogos , un mecanismo para volver a unir las roturas de doble cadena del
ADN debido al peróxido de hidrógeno y la radiación ionizante, respectivamente. TdT se
expresa sólo en tejido linfoide y añade "n nucleótidos" a las roturas de doble hebra formadas
durante la recombinación V (D) J para promover la diversidad inmunológica.17?

Polimerasas a, d y e (alfa, delta y épsilon)

Pol a (alfa) , Pol d (delta) y Pol e (épsilon) son miembros de las polimerasas de la familia B y son
las principales polimerasas implicadas en la replicación del ADN nuclear. El complejo Pol a
(complejo pol a-ADN primasa) consta de cuatro subunidades: la subunidad catalítica POLA1 , la
subunidad reguladora POLA2 y las subunidades primasa pequeña y grande PRIM1 y PRIM2,
respectivamente. Una vez que la primasa ha creado el cebador de ARN, Pol a comienza la
replicación alargando el cebador con ~ 20 nucleótidos. Debido a su alta procesividad, Pol d se
hace cargo de la síntesis de las cadenas principales y retrasadas de Pol a. Pol d se expresa
mediante los genes POLD1 , creando la subunidad catalítica, POLD2 , POLD3 y POLD4 creando
las otras subunidades que interactúan con el antígeno nuclear de células proliferantes (PCNA),
que es una abrazadera de ADN que permite que Pol d posea procesividad. Pol e está codificado
por el gen POLE1, la subunidad catalítica, POLE2 y POLE3. Se ha informado que la función de
Pol e es extender la cadena principal durante la replicación, mientras que Pol d replica
principalmente la hebra rezagada; sin embargo, evidencia reciente sugirió que Pol d también
podría tener un papel en la replicación de la cadena principal de ADN. La región C-terminal de
Pol e "reliquia de la polimerasa", a pesar de ser innecesaria para la actividad de la polimerasa,
se cree que es esencial para la vitalidad celular. Se cree que la región C-terminal proporciona
un punto de control antes de entrar en anafase, proporciona estabilidad a la holoenzima y
agrega proteínas a la holoenzima necesarias para el inicio de la replicación. Pol e tiene un
dominio "palma" más grande que proporciona alta procesividad independientemente del
PCNA.

En comparación con otras polimerasas de la familia B, la familia de exonucleasas DEDD

responsable de la corrección de pruebas está inactivada en Pol a. Pol e es único en el sentido
de que tiene dos dominios con dedos de zinc y una copia inactiva de otra polimerasa de la
familia B en su C-terminal. La presencia de este dedo de zinc tiene implicaciones en los
orígenes de Eukaryota, que en este caso se coloca en el grupo Asgard con polimerasa arqueal
B3.

Polimerasas ?, ? y ? (eta, iota y kappa)

Pol ? (eta) , Pol ? (iota) y Pol ? (kappa), son ADN polimerasas de la familia Y implicadas en la
reparación del ADN por síntesis de translesión y codificadas por los genes POLH, POLI y POLK
respectivamente. Los miembros de la Familia Y tienen cinco motivos comunes para ayudar a
unir el sustrato y el extremo del cebador y todos incluyen los dominios típicos del pulgar, la
palma y el dedo de la mano derecha con dominios agregados como el dedo meñique (LF), el
dominio asociado a la polimerasa (PAD) o muñeca. El sitio activo, sin embargo, difiere entre los
miembros de la familia debido a las diferentes lesiones que se reparan. Las polimerasas de la
familia Y son polimerasas de baja fidelidad, pero se ha demostrado que hacen más bien que
mal, ya que las mutaciones que afectan a la polimerasa pueden causar diversas enfermedades,
como cáncer de piel y la variante de Xeroderma Pigmentosum (XPS). La importancia de estas
polimerasas se evidencia por el hecho de que el gen que codifica la ADN polimerasa ? se
conoce como XPV, porque la pérdida de este gen da como resultado la variante Xeroderma
Pigmentosum de la enfermedad. Pol ? es particularmente importante para permitir una
síntesis de translesión precisa del daño del ADN resultante de la radiación ultravioleta. La
funcionalidad de Pol ? no se comprende completamente, pero los investigadores han
encontrado dos funciones probables. Se cree que Pol ? actúa como un extensor o un
insertador de una base específica en ciertas lesiones del ADN. Las tres polimerasas de síntesis
de translesiones, junto con Rev1, se reclutan en las lesiones dañadas a través de ADN
polimerasas replicativas estancadas. Hay dos vías de reparación de daños que llevan a los
investigadores a concluir que la vía elegida depende de qué hebra contiene el daño, la hebra
principal o la rezagada.

Polimerasas Rev1 y ? (zeta)

La Pol ? otra polimerasa de la familia B, está formada por dos subunidades Rev3, la subunidad
catalítica, y Rev7 (MAD2L2), que aumenta la función catalítica de la polimerasa y participa en
la síntesis de translesiones. Pol ? carece de actividad exonucleasa 3 'a 5', es único porque
puede extender cebadores con desajustes terminales. Rev1 tiene tres regiones de interés en el
dominio BRCT , dominio de unión a ubiquitina, y dominio C-terminal y tiene capacidad de
transferasa de dCMP, que agrega lesiones opuestas de desoxicitidina que detendrían las
polimerasas replicativas Pol d y Pol e. Estas polimerasas estancadas activan complejos de
ubiquitina que a su vez disocian las polimerasas de replicación y reclutan Pol ? y Rev1. Juntos,
Pol ? y Rev1 añaden desoxicitidina y Pol ? se extiende más allá de la lesión. A través de un
proceso aún indeterminado, Pol ? se disocia y las polimerasas de replicación se reasocian y
continúan la replicación. Pol ? y Rev1 no son necesarios para la replicación, pero la pérdida del
gen REV3 en la levadura en gemación puede causar una mayor sensibilidad a los agentes que
dañan el ADN debido al colapso de las horquillas de replicación donde las polimerasas de
replicación se han estancado.

Polimerasas ?, ? y ? (gamma, theta y nu)

Pol ? (gamma), Pol ? (theta) y Pol ? (nu) son polimerasas de la familia A. Durante mucho
tiempo se pensó que Pol ?, codificada por el gen POLG era la única polimerasa mitocondrial.
Sin embargo, investigaciones recientes muestran que al menos Pol ß (beta) , una polimerasa
de la Familia X, también está presente en las mitocondrias. Cualquier mutación que produzca
una Pol ? limitada o que no funcione tiene un efecto significativo sobre el ADNmt y es la causa
más común de trastornos mitocondriales hereditarios autosómicos. Pol ? contiene un dominio
de polimerasa C-terminal y un dominio de exonucleasa N-terminal 3'-5 'que están conectados
a través de la región enlazadora, que se une a la subunidad accesoria. La subunidad accesoria
se une al ADN y es necesaria para la procesividad de Pol ?. La mutación puntual A467T en la
región enlazadora es responsable de más de un tercio de todos los trastornos mitocondriales
asociados con Pol ?. Si bien muchos homólogos de Pol ?, codificados por POLQgen, se
encuentran en eucariotas, su función no se comprende claramente. La secuencia de
aminoácidos en el extremo C es lo que clasifica a Pol ? como polimerasa de la familia A,
aunque la tasa de error de Pol ? está más estrechamente relacionada con las polimerasas de la
familia Y. Pol ? extiende los extremos del cebador que no coinciden y puede eludir sitios
abásicos añadiendo un nucleótido. También tiene actividad desoxirribofosfodiesterasa
(dRPasa) en el dominio de la polimerasa y puede mostrar actividad ATPasa en estrecha
proximidad al ssDNA. Pol ? (nu) se considera la menos eficaz de las enzimas polimerasas. Sin
embargo, la ADN polimerasa nu juega un papel activo en la reparación de la homología
durante las respuestas celulares a los enlaces cruzados.
Transcriptasa inversa (RT)

Es una ADN polimerasa dependiente de ARN (RdDp) que sintetiza ADN a partir de una plantilla
de ARN. La familia de la transcriptasa inversa contiene tanto la funcionalidad de la ADN
polimerasa como la funcionalidad de la ARNasa H, que degrada el ARN emparejado con el
ADN. La transcriptasa inversa se emplea comúnmente en la amplificación de ARN con fines de
investigación. Usando una plantilla de ARN, la PCR puede utilizar la transcriptasa inversa,
creando una plantilla de ADN. Esta nueva plantilla de ADN se puede utilizar para una
amplificación típica por PCR. Los productos de tal experimento son, por tanto, productos de
PCR amplificados a partir de ARN.

La transcripción inversa se acompaña de un cambio de plantilla entre las dos copias del
genoma (recombinación por elección de copia). De 5 a 14 eventos de recombinación por
genoma ocurren en cada ciclo de replicación. El cambio de plantilla (recombinación) parece ser
necesario para mantener la integridad del genoma y como un mecanismo de reparación para
salvar los genomas dañados.

Telomerasa

La telomerasa es una enzima que funciona para replicar los extremos de los cromosomas
lineales, ya que la ADN polimerasa normal no puede replicar los extremos o los telómeros. El
saliente 3 'monocatenario del cromosoma bicatenario con la secuencia 5'-TTAGGG-3' recluta
telomerasa. La telomerasa actúa como otras ADN polimerasas al extender el extremo 3 ', pero,
a diferencia de otras ADN polimerasas, la telomerasa no requiere una plantilla. La subunidad
TERT, un ejemplo de transcriptasa inversa, utiliza la subunidad de ARN para formar la unión
cebador-molde que permite que la telomerasa extienda el extremo 3 'de los extremos del
cromosoma. Se cree que la disminución gradual del tamaño de los telómeros como resultado
de muchas replicaciones a lo largo de la vida está asociada con los efectos del envejecimiento.

ADN polimerasas virales

Los virus de ADN sintetizan una gran variedad de ADN polimerasas, que en su mayoría no
están emparentadas con las ADN polimerasas celulares o con las de otros virus de ADN. Los
virus retrotranscritos como el VIH se caracterizan por sintetizar transcriptasas inversas, las
cuales si están emparentadas entre sí y también con las transcriptasas inversas celulares en
especial con las eucariotas.

El fago F29 sintetiza una ADN polimerasa propia. Esta enzima es muy utilizada en biología
molecular para múltiples procedimientos de desplazamiento de amplificación de ADN, y tiene
una serie de características que la hacen particularmente adecuada para esta aplicación.

Referencias
 Hübscher, Ulrich. (2010). DNA polymerases : discovery, characterization, and functions in
cellular DNA transactions. World Scientific. ISBN 978-981-4299-17-6. OCLC 670430601.
Consultado el 31 de enero de 2021.

Camps, Manel; Loeb, Lawrence A. (2004-02). «When Pol I Goes into High Gear: Processive
DNA Synthesis by Pol I in the Cell». Cell Cycle (en inglés) 3 (2): 114-116. ISSN 1538-4101.
doi:10.4161/cc.3.2.651. Consultado el 31 de enero de 2021.

Chien, A.; Edgar, D. B.; Trela, J. M. (1 de septiembre de 1976). «Deoxyribonucleic acid

polymerase from the extreme thermophile Thermus aquaticus.». Journal of Bacteriology (en
inglés) 127 (3): 1550-1557. ISSN 0021-9193. PMID 8432. doi:10.1128/jb.127.3.1550-1557.1976.
Consultado el 31 de enero de 2021.

Banach-Orlowska, Magdalena; Fijalkowska, Iwona J.; Schaaper, Roel M.; Jonczyk, Piotr (2005).
«DNA polymerase II as a fidelity factor in chromosomal DNA synthesis in Escherichia coli».
Molecular Microbiology (en inglés) 58 (1): 61-70. ISSN 1365-2958. doi:10.1111/j.1365-
2958.2005.04805.x. Consultado el 31 de enero de 2021.

Olson, Matthew W.; Dallmann, H. Garry; McHenry, Charles S. (1995-12). «DnaX Complex of
Escherichia coli DNA Polymerase III Holoenzyme THE ?·?». Journal of Biological Chemistry 270
(49): 29570-29577. ISSN 0021-9258. doi:10.1074/jbc.270.49.29570. Consultado el 31 de enero
de 2021.

Banach-Orlowska, Magdalena; Fijalkowska, Iwona J.; Schaaper, Roel M.; Jonczyk, Piotr (2005).
«DNA polymerase II as a fidelity factor in chromosomal DNA synthesis in Escherichia coli».
Molecular Microbiology (en inglés) 58 (1): 61-70. ISSN 1365-2958. doi:10.1111/j.1365-
2958.2005.04805.x. Consultado el 31 de enero de 2021.

Liao, Yi; Li, Yilai; Schroeder, Jeremy W.; Simmons, Lyle A.; Biteen, Julie S. (20 de diciembre de
2016). «Single-Molecule DNA Polymerase Dynamics at a Bacterial Replisome in Live Cells».
Biophysical Journal (en inglés) 111 (12): 2562-2569. ISSN 0006-3495. PMID 28002733.
doi:10.1016/j.bpj.2016.11.006. Consultado el 31 de enero de 2021.

«Bacterial replisomes». Current Opinion in Structural Biology (en inglés) 53: 159-168. 1 de
diciembre de 2018. ISSN 0959-440X. doi:10.1016/j.sbi.2018.09.006. Consultado el 31 de enero
de 2021.

Goodman, Myron F. (1 de junio de 2002). «Error-Prone Repair DNA Polymerases in

Prokaryotes and Eukaryotes». Annual Review of Biochemistry 71 (1): 17-50. ISSN 0066-4154.
doi:10.1146/annurev.biochem.71.083101.124707. Consultado el 31 de enero de 2021.

Mori, Tetsuya; Nakamura, Tatsuro; Okazaki, Naoto; Furukohri, Asako; Maki, Hisaji; Akiyama,
Masahiro Tatsumi (2012). «Escherichia coli DinB inhibits replication fork progression without
significantly inducing the SOS response». Genes ^|^ Genetic Systems 87 (2): 75-87. ISSN 1341-
7568. doi:10.1266/ggs.87.75. Consultado el 31 de enero de 2021.

Jarosz, Daniel F.; Godoy, Veronica G.; Walker, Graham C. (1 de abril de 2007). «Proficient and
Accurate Bypass of Persistent DNA Lesions by DinB DNA Polymerases». Cell Cycle 6 (7): 817-
822. ISSN 1538-4101. PMID 17377496. doi:10.4161/cc.6.7.4065. Consultado el 31 de enero de
2021.

Patel, Meghna; Jiang, Qingfei; Woodgate, Roger; Cox, Michael M.; Goodman, Myron F. (1 de
junio de 2010). «A new model for SOS-induced mutagenesis: how RecA protein activates DNA
polymerase V». Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology 45 (3): 171-184. ISSN
1040-9238. PMID 20441441. doi:10.3109/10409238.2010.480968. Consultado el 31 de enero
de 2021.

Sutton, Mark D.; Walker, Graham C. (17 de julio de 2001). «Managing DNA polymerases:
Coordinating DNA replication, DNA repair, and DNA recombination». Proceedings of the
National Academy of Sciences (en inglés) 98 (15): 8342-8349. ISSN 0027-8424. PMID
11459973. doi:10.1073/pnas.111036998. Consultado el 31 de enero de 2021.

Raychaudhury, Paromita; Basu, Ashis K. (29 de marzo de 2011). «Genetic Requirement for
Mutagenesis of the G[8,5-Me]T Cross-Link in Escherichia coli: DNA Polymerases IV and V
Compete for Error-Prone Bypass». Biochemistry 50 (12): 2330-2338. ISSN 0006-2960. PMID
21302943. doi:10.1021/bi102064z. Consultado el 31 de enero de 2021.

Ishino, Yoshizumi; Komori, Kayoko; Cann, Isaac K. O.; Koga, Yosuke (15 de abril de 1998). «A
Novel DNA Polymerase Family Found inArchaea». Journal of Bacteriology (en inglés) 180 (8):
2232-2236. ISSN 0021-9193. PMID 9555910. doi:10.1128/JB.180.8.2232-2236.1998.
Consultado el 31 de enero de 2021.

Koonin, Eugene V.; Krupovic, Mart; Ishino, Sonoko; Ishino, Yoshizumi (9 de junio de 2020).
«The replication machinery of LUCA: common origin of DNA replication and transcription».
BMC Biology 18 (1): 61. ISSN 1741-7007. PMID 32517760. doi:10.1186/s12915-020-00800-9.
Consultado el 31 de enero de 2021.

Yamtich, Jennifer; Sweasy, Joann B. (1 de mayo de 2010). «DNA polymerase Family X:

Function, structure, and cellular roles». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and
Proteomics. DNA Polymerase: Structure and Function (en inglés) 1804 (5): 1136-1150. ISSN
1570-9639. PMID 19631767. doi:10.1016/j.bbapap.2009.07.008. Consultado el 31 de enero de
2021.

Bibliografía

«La Replicación».

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