Professional Documents
Culture Documents
Virusologija Uzimanje Materijala
Virusologija Uzimanje Materijala
• Klasifikacija virusa
• DNK virusi
• RNK virusi
3. Prema tipu nukleinske kiseline, građi virusne čestice i načinu replikacije virusa:
• Familije (-viridae)
• Podfamilije (-virinae)
• Rodove (-virus)
• Vrste
2. Širenje (diseminacija) virusa – najčešće preko krvi (viremija) i limfotoka , rjeđe preko
perifernih nervnih vlakana
8. želimo otkriti koliko je neka osoba predisponirana za određenu infekciju (važno npr.
prije zaposlenja, prije transplantacije organa, u trudnoći).
10. kada od dijagnoze zavise terapijski postupci i prognoza oboljenja (npr. teratogeni
virusi, diferencijalna dijagnoza virusnih encefalitisa, virusne bolesti sa atipičnom
kliničkom slikom...)
Uzimanje uzoraka
Transport uzoraka
Identifikaciju virusa
1. Uzorak treba uzeti u pravo vrijeme – u akutnoj fazi bolesti, 1-3 dana od pojave prvih
simptoma. Uzorke treba uzeti prije primene antivirusne terapije! Za serološku analizu se
uzima parni uzorak seruma: na početku bolesti i 10-14 dana kasnije.
2. Uzorak treba uzeti sa pravog mjesta – što zahteva dobro poznavanje patogeneze bolesti i
tropizma virusa.
3. Uzorak treba uzeti na pravi način – što podrazumjeva pravilan izbor tehnike uzimanja, koja
treba da bude najbolja za postavljanje dijagnoze i najkomfornija za pacijenta.
4. Uzorci se mogu uzeti uz :
• aktivno učešće pacijenta (urin, sputum, stolica...) • pasivno učešće pacijenta (krv, brisevi,
punktati...) Uzimanje treba obaviti pod sterilnim uslovima! Instrumenti moraju biti hemijski
čisti i sterilni, najbolje oni za jednokratnu upotrebu.
5. Potrebno je uzeti dovoljnu količinu materijala - za sve analize koje se žele izvršiti.
6. Posude koje se koriste za uzimanje uzoraka moraju biti: hemijski čiste, sterilne, sa
adekvatnim zapušačem ili zatvaračem na zavrtanje, najbolje one predviđene za jednokratnu
upotrebu.
7. Uzorak je neophodno pravilno i jasno obilježiti što podrazumjeva da na njemu mora pisati:
Sadrže: - rastvor soli (odgovarajuća jonska koncentracija) - proteine (najčešće albumin ili
želatin) - pufer (održanje pH) -antibiotike i fungicide
• BRISEVI
• Ne treba da budu od kalcijum alginata ili prirodne vate (pamuka) jer oni smanjuju
infektivnost virusa.
• Drške briseva treba da budu od metala ili plastike
1. Krv se uzima vene punkcijom ili kroz venski kateter (8-10 ml).
• virusološka dijagnostika - puna krv (Na-citrat, EDTA ili heparin), ili plazma - za PCR
ne sme da bude sa heparinom!
• TEČNI UZORCI
1. Saliva -uzima se pomoću 1 ili 2 brisa sa sluznice prednjeg dijela poda usne duplje i
predjela oko otvora Stensonovog kanala. Bris se stavlja u epruvetu sa TMV i dobro
zatvori.
1. Bris lezije- bris se natopi fiziološkim rastvorom i rotira preko lezije. Stavlja se u
epruvetu sa TMV.
2. Bris vezikule- vezikula se prebriše sterilnim fiziološkim rastvorom i probuši sterilnim
instrumentom. Jednim brisom se pokupi tečnost iz vezikule, a drugim sadržaj dna
vezikule. Brisevi se stavljaju u epruvete sa TMV.
3. Aspirat vezikule- vezikula se probuši sterilnom iglom i njen sadržaj aspirira špricem.
Špric se ispere sa TMV.
UZORCI SA OKA
infektivnosti.
TRANSPORT UZORAKA
• Zaštitu od lomljenja
• Zaštitu od svetlosti
• Adekvatnu temperaturu:
- 37°C - 5% CO2
- Adherentne - jednoslojne
- višeslojne
1. Primarne kulture ćelija (PMK) - dobijaju se direktno od organa ili tkiva, sadrže više
tipova ćelija - mogu se presađivati 2-3 puta
3. Trajne ćelijske kulture (VERO, He-La, HEp-2) – obično se dobiju od tumorskog tkiva,
a broj dijeljenja ćelija nije ograničen. Broj hromozoma u ćelijama je različit-
heteroploidan.
Direktan metod –CPE – vidljive promene ćelija nastalih usled replikacije virusa u
njima (citocidni virusi).
Može se vidjeti kao:
Indirektne metode - koriste se za viruse koji ne daju CPE (necitocidni ili umereni virusi) ili za
viruse koji sporo daju CPE u kulturama ćelija.
Razlikujemo:
1. Metod hemadsorpcije
2. Metod interferencije
Metod hemadsorpcije
Metod interferencije
Fenomen interferencije je interakcija između dva virusa pri čemu dolazi do zaustavljanja
replikacije jednog od virusa - znak prisustva necitocidnog virusa je odsustvo CPE
kontrolnog citocidnog virusa
Embrionirana jaja
Embrionirana jaja
žumančana kesa
alantoisna šupljina
amnionska šupljina
POKSOVI
Fenomen elucije
Laboratorijske životinje
potrebno je odabrati:
Direktan metod:
- nastanak tumora
- smrt životinje
Indirektan metod:
- histopatološki preparat
PCR
Brz razvoj novih tehnika, metoda i aparatura, brzo nadopunjuje naše znanje o biologiji
uzročnika infekcija.
nukleinska kiselina rastopi posebnim puferom koji zbog svoga sastava omogući odvajanje od
djelića za koje je bila fiksirana
DETAKCIJA ANTIGENA
Tehnika imunofluorescencije
Radioimunoesej (RIA)
-virus nije potrebno razmnožavati budući da nije potrebna prisutnost infektivnih čestica,
Imunoenzimske metode
Najčešće se koristi tzv. "metoda duplog sendvića" (engl. double sandwich assay).
Na dnu mikrotitarske pločice su vezana specifična antitijela za virusni antigen koja
djeluju kao "lovac" za antigene u uzorku. Ako su u uzorku prisutni antigeni, oni se
vežu na antitijela i pritom nastanu imunosni kompleksi. Na njih se nakon ispiranja u
slijedećem koraku dodaje za virus specifično antitijelo, ovaj put označeno pomoću
enzima. Nakon ispiranja dodaje se supstrat specifičan za enzim, koji zbog djelovanja
enzima promijeni boju. Intenzivnost boje izmjeri se pomoću spektrofotometra.
Uzorak je najčešće bris uronjen u tekući medij. Tekućina skupa sa stanicama se odijeli
u sterilnu epruvetu i centrifugira, nakon čega se odvoji supernatant, a stanice se nanesu
na označena mjesta na posebnom predmetnom teflonskom stakalcu.
Virusnu infekciju potvrđuje nalaz (za određeni virus) specifičnih nakupina virusnih
antigena koji se vide u obliku zelene fluorescencije u unutrašnjosti inficiranih stanica.
Različiti virusi imaju specifičnu raspodjelu i lokalizaciju unutar inficiranih stanica
(jezgra, citoplazma).
Metoda ima značajnu prednost pred drugim metodama u brzini izvođenja. Međutim,
ova metoda ima i nekoliko nedostataka - upotrebljivost metode je ograničena samo na
one uzročnike za koje su na komercijalnom tržištu na raspolaganju odgovarajuća
monoklonska antitijela; za mikroskopiranje je potrebna iskusna osoba jer je za
pouzdanu interpretaciju rezultata potrebno višegodišnje iskustvo; rezultati se mogu
očitavati samo individualnim mikroskopiranjem što u razdoblju većih epidemija
predstavlja veliki napor i opterećenje za laboratorijske radnike.
Imunoflorescencija
Imunohistohemijske metode
Lateks aglutinacija
Glavna prednost ove metode jeste da se u uzorku može prikazati bilo koji virus
ukoliko je prisutan u dovoljnom broju. Uspješnost ove metode dokazuje njena
upotreba kod otkrića velikog broja za čovjeka važnih virusa, kao što su npr. virus
hepatitisa B, rotavirusi, norovirusi i virus SARS. Danas je upotreba ove metode
ograničena na dokazivanje enteričnih virusa kod gastroenteritisa i dokazivanje
herpesvirusa i poksvirusa iz kožnih promjena. Elektronskim mikroskopiranjem virus
često ne možemo opredijeliti dalje od nivoa virusne porodice jer se pojedini virusi
unutar porodice ne razlikuju dovoljno po morfološkim osobinama.
DETAKCIJA ANTIGENA
Tehnika imunofluorescencije
Radioimunoesej (RIA)
-virus nije potrebno razmnožavati budući da nije potrebna prisutnost infektivnih čestica,
Metode za dokazivanje virusnih antigena najčešće se koriste kod virusnih infekcija dišnih
puteva (respiratorni sincicijski virus, adenovirus, virusi parainfluence i influence), uzoraka
dobijenih iz mjehurića na koži ili sluznici (virus varičele, virus herpes simpleks tip 1 i 2) i kod
virusnih gastroenteritisa kod djece (rotavirusi, adenovirusi, norovirusi).
Imunoenzimske metode
Najčešće se koristi tzv. "metoda duplog sendvića" (engl. double sandwich assay).
Na dnu mikrotitarske pločice su vezana specifična antitijela za virusni antigen koja djeluju
kao "lovac" za antigene u uzorku. Ako su u uzorku prisutni antigeni, oni se vežu na antitijela i
pritom nastanu imunosni kompleksi. Na njih se nakon ispiranja u slijedećem koraku dodaje za
virus specifično antitijelo, ovaj put označeno pomoću enzima. Nakon ispiranja dodaje se
supstrat specifičan za enzim, koji zbog djelovanja enzima promijeni boju. Intenzivnost boje
izmjeri se pomoću spektrofotometra.
Elisa reader
Uzorak je najčešće bris uronjen u tekući medij. Tekućina skupa sa stanicama se odijeli u
sterilnu epruvetu i centrifugira, nakon čega se odvoji supernatant, a stanice se nanesu na
označena mjesta na posebnom predmetnom teflonskom stakalcu.
virusnu infekciju potvrđuje nalaz (za određeni virus) specifičnih nakupina virusnih antigena
koji se vide u obliku zelene fluorescencije u unutrašnjosti inficiranih stanica. Različiti virusi
imaju specifičnu raspodjelu i lokalizaciju unutar inficiranih stanica (jezgra, citoplazma).
Metoda ima značajnu prednost pred drugim metodama u brzini izvođenja. Međutim, ova
metoda ima i nekoliko nedostataka - upotrebljivost metode je ograničena samo na one
uzročnike za koje su na komercijalnom tržištu na raspolaganju odgovarajuća monoklonska
antitijela; za mikroskopiranje je potrebna iskusna osoba jer je za pouzdanu interpretaciju
rezultata potrebno višegodišnje iskustvo; rezultati se mogu očitavati samo individualnim
mikroskopiranjem što u razdoblju većih epidemija predstavlja veliki napor i opterećenje za
laboratorijske radnike.
Signal se detektuje pomoću fluorescentnog mikroskopa.
Imunoflorescencija
Brzi testovi za dokazivanje antigena virusa temelje se na reakciji između antigena i označenog
antitijela na principu lateralne imunodifuzije.
Imunohistohemijske metode
Lateks aglutinacija
Kod elektronskog mikroskopa (EM) za stvaranje slike umjesto svjetla upotrebljava se snop
elektrona. Na ovaj način se postiže prekoračenje ograničenja razlučivanja svjetlosnog
mikroskopa koje je ograničeno na valnu dužinu vidljive svjetlosti. U virologiji se najviše
upotrebljava transmisijska elektronska mikroskopija kod koje se umjesto svjetlosti kroz
uzorak usmjeri snop elektrona. Neki elektroni se na površini uzorka zaustave, a drugi prolaze
kroz njega (transmisija) i projiciraju sliku na fluorescentnom zaslonu. Informacije koje EM
može pružiti kod gledanja uzorka jesu morfologija, veličina i površinske strukture virusa.
Građa nekih virusa je toliko značajna da ih po morfološkim svojstvima možemo uvrstiti u
određenu virusnu porodicu.
Glavna prednost ove metode jeste da se u uzorku može prikazati bilo koji virus ukoliko je
prisutan u dovoljnom broju. Uspješnost ove metode dokazuje njena upotreba kod otkrića
velikog broja za čovjeka važnih virusa, kao što su npr. virus hepatitisa B, rotavirusi,
norovirusi i virus SARS. Danas je upotreba ove metode ograničena na dokazivanje enteričnih
virusa kod gastroenteritisa i dokazivanje herpesvirusa i poksvirusa iz kožnih promjena.
Elektronskim mikroskopiranjem virus često ne možemo opredijeliti dalje od nivoa virusne
porodice jer se pojedini virusi unutar porodice ne razlikuju dovoljno po morfološkim
osobinama.
DETEKCIJA ANTITIJELA
Mjerenje specifičnih antitijela usmjerenih protiv virusa, danas je jedna od najvažnijih metoda
dijagnostičke virologije. Ova je tehnologija omogućila automatizaciju i tako je postalo
moguće sa malo napora pregledati veliki broj seruma u kratkom vremenu.
Serološka dijagnostika ovisi od dinamike stvaranja antitijela. U akutnoj fazi bolesti moguće je
dokazivati IgM-antitijela, a u rekonvalescenciji IgG- i IgM-antitijela. Uzorak koji se
pretražuje može biti serum, plazma ili likvor.
Metodom RVK dokazuje se prisutnost antitijela protiv različitih virusa (mumps, ospice,
krpeljni menin-goencefalitis, poliovirus, enterovirusi itd.).
Ova metoda ne omogućava dokazivanje pojedinih različitih razreda antitijela nego se uvijek
određuju samo zajednička antitijela (zajedno IgG i IgM). Dokaz akutne infekcije izvodi se
testiranjem dva uzorka u vremenskom razmaku od 14 dana kada se određuje moguća
promjena u titru antitijela (četverostruki porast za potvrdu akutne infekcije).
Sistem komplementa
Sastoji se od serumskih proteina i proteina u ćelijskoj membrani koji reaguju međusobno kao
i sa drugim molekulima imunog sistema na način koji je visoko kontrolisan.
Aktivacija komplementa obuhvata sekvencijalnu proteolizu proteina komplementa pri čemu
se stvaraju proteolitički enzimi. Proteini koji čine sistem komplementa su proteini plazme koji
su normalno inaktivni; aktiviraju se u određenim uslovima da bi stvorili produkte koji
ostvaruju brojne efektorne funkcije komplementa.
- Inflamacija
- Anafilaksa
Virusi koji na svojoj površini izražavaju hemaglutinine su virus rubele, virus influence, virusi
parainfluence, virus mumpsa i brojni arbovirusi (npr. virus krpeljnog meningoencefalitisa).
Prisutnost specifičnih antitijela u serumu bolesnika sprječava aglutinaciju eritrocita, te dolazi
do inhibicije hemaglutinacije. Kod ove metode je važno serum bolesnika prije testiranja
obraditi kaolinom ili mješavinom heparina i magnezijevog klorida da bi se odstranili
nespecifični inhibitori hemaglutinacije.
Ovom metodom se ne mogu određivati pojedine klase antitijela (npr. IgM ili IgG) nego samo
skupni titar neutralizacijskih antitijela.
Pomoću metode western blot (WB) dokazuju se antitijela protiv tačno određenih virusnih .
Rezultat se pokaže u obliku obojenih prugastih područja na filter-papiru, a ukazuju na
reakciju sa tačno određenim antigenom. Sto je veći broj obojenih prugastih područja, veća je
mogućnost da je potvrđena infekcija s određenim virusom.
Varijanta ove metode je metoda imunoblot. Kod ove metode se umjesto prirodnih virusnih
proteina (obično iz izolata virusa) na membranu, u tačno određenim razmacima, nanesu
rekombinantni virusni proteini (dobiveni kloniranjem i ekspresijom virusnih proteina u
ekspresijskim sistemima). Prugasta područja su kod imunoblot metode nanesena na
membranu u jednakim razmacima i zato ih je lakše interpretirati .
Western blot se koristi u serološkim tehnikama kao metoda za potvrdu rezultata kod kritičnih
infekcija koje za bolesnika mogu imati teške posljedice, kao što su npr. infekcija virusom
HIV, infekcija virusom hepatitisa C i ponekad infekcija virusom Epstein-Barrovim.