Tiras BS Lu QO N) 2 = |S) ca l= a BIOQUIMICA cuarta edicion } DAVID L..NELSON MICHAEL M. COXPet i | 3B xiv indice de materias Indice general raed 1 Fundamentos de bioquimica 1. TESTRUCTURAY CATALISIS 45 Flagua 47 ‘Aminodcidos, péptidesy proteinas. 75 Estructura tridimensional de las proteinas 116 Funcién de las proteinas 157 Enzimas 190 Glicidos y gucobiologia. 238 Nuclestidos y cidos nucleicas 273 Tecnologias de la informacién basadas enel DNA 306 Upidos. 343 ‘Membranas bioligicas y transporte 369 Biosefalizacién 421 weereseen BES BIOENERGETICAY METABOLISMO 481 Principios de bioenergética 489 Glucdlisis, gluconeogénesis y ruta de las pentosas fosfato 521 Principios de regulacién metabotica: lucosa y gucégeno 560 El ciclo del cdo citico 601 Catabolismo de los dcidos grasos 631 Oxidacién de aminoécidos y produecién de ures 656 Fosforlacin oxidatva y fotofosforiacién 690 Biosintesis de glicidos en plantas yybacterias 751 Biosintesis de lpidos 787 Biosintesis de aminodcidos, nucledtidos ‘ymoléculas relacionadas 633 Integracin y egulacién hormonal del tmetabolisma de los mamiferos. 881 LAS RUTAS DELA INFORMACION. 921 Genes y cromosomas 923 Metabolismo del DNA 948, ‘Metabolismo del RNA 995 ‘Metabolismo de las protefnas 1034 Regulacién de la expresién génica 1081 Apéndice A Abreviaturas comunes en la literatura cientfica bioquimica A-1 ‘Apéndice B Soluciones abreviadas de los problemas SA-t Glosario G-t Procedencia de fas ilustraciones Plt Indice alfabético 1 1 Fundamentos de bioquimica 1 1.4 Fundamentos celulares 3 Las células son las unidades estructurales y funcionales de todos los organismos vivos 3 Las dimensiones celulares estin limitadas por la capacidad de difusion del oxigeno 4 Los seres vivos se clasifican en tres dominios 4 Escherichia coli es la célula procariética mejor estudiada 5 Las células eucariéticas poseen diversos orgénulos ‘membranosos que pueden aislarse para su estudio 6 El citoplasma se organiza gracias al citoesqueleto yesaliamente dinamico 9 Las células construyen estructuras suprameleculares 10 Los estudios in vitro podrian no detectar interacciones importantes entre moléculas 11 1.2 Fundamentos quimicos 12 Las biomoléculas son compuestos de carbono con una diversidad de grupos funcionales 13, Las macromoléculas son los principales constituyentes de las células 15 Recuadro 1-1 Peso molecular, masa molecular y las unidades ‘que deben utilizarse 15 La estructura tridimensional se describe en términos de configuracion y conformacion 16 Recuadro 1-2 Louls Pasteur y la actividad dptica: in vino, vortas 19 Las interacciones entre las biomoléculas son estereoespecificas 20 1.3 Fundamentos fisicos 21 Los organismos vivos existen en un estado estacionario dindmico y no se encuentran nunca en equilibrio con suentomo 21 Los orgaanismos transforman energfa y materia 22 EL Mlyjo de electrones proporciona energia para los organismos 22 Crear y mantener e! orden requiere trabajo y energia 23 Bl acoplamiento energético conecta las reacciones bioldgicas 23 Recuadro 1-3 Entropia: as ventajas de estar desorganizado 24 Kg AG? miden In tendencia de una reaceién ‘Para transcurrir espontaneamente 26 Los enzimas facilitan las secuencias de reacciones quimicas 26 El metabolismo est regulado para conseguir equilibrio yeconomia 27 1.4 Fundamentos genéticos 28 La continuidad genética reside en las moléculas de DNA 29) La estructura del DNA hace posible su replicacién yy Teparacion con fidelidad casi perfecta 29 La seenencia lineal del DNA codifica proteinas con estructuras tridimensionales 29 1.8 Fundamentos evolutivos 31 Los cambios en las instrucciones hereditarias hacen posible laevolucion 31 Las primeras biomuoléculas aparecieron por evolucién, quimica 32 La evolucién quimica puede simularse en el laboratorio 32 Los primeros genes y calalizadores podrian haber sido ‘moléculas de RNA o precursores relacionados 32 La evolucidn biolégica empez6 hace mas dle tres rail quinientos millones de afios 34La primera célula fue probablemente quimioheterdtrofa 34 Las céhulas eucaridticas evolucionaron a partir de las procaristicas a través de diversas fases 35 ‘La anatomfa molecular revela relaciones evolutivas 36 La genomica funcional permite deducir la correspondencia entre genes y procesos celulares espectficos 38 La comparacién de genomas tendré una importancia cada vez mayor en la biologia y medicina humanas 38 | ESTRUCTURAY CATALISIS 45 2 Elagua 47 21 Interaeciones débiles on los sistemas acuosos 47 ‘Los puentes de hidrégeno confieren al agua sus propiedades extraordinarias 47 Elagua forma puentes de hidrégeno con los solutos polares 49 Elagua interacciona electrostaticamente con los solutos cargados 50 Ta entropia aumenta cuando se disuelve una sustancia, cristalina 51 Los gases apolares se disuelven mal en el agua 52 Los compuestos apolares fuerzan caribios desfavorables energéticamente en la estructura del agua 52 Las interacciones de van der Waals son atracciones Interatémicas débiles 54 Las interacciones débiles son eruciales para la estructura y funcién delas macromoléculas 54 Los solutos afectan a las propiedades coligativas de las disoluciones acuosas 56 Rocuadro 2-1 Respuesta tactil en plantas: un fenémeno osmético 59 2.2 lonizacién del agua, écidos débiles y hases débiles 60 Blagua pura esté ligeramente ionizada 60 1a jonizacién del agua se expresa mediante una constante de equilibrio 61 La escala de pH representa las concentraciones de H* yOu” 61 Recuadro 2-2 El products Iénico de! agua: des problemas Hustratives. 62 Los dicidos y bases débiles tienen constantes de disociacion caracteristicas 63 Las curvas de titulacién proporcionan el pk, de los deidos débiles 64 2.3 Tamponamientos contra cambios de pH en los sistemas bioligicos 65 Los tampones son mezclas de Acidos débiles y sus bases cconjugadas 66 Una expresién sencilla relaciona pH, pK; ¥ concentracién detampén 66 ‘Los dcidos o bases débiles tamponan células y tejidos contra cambios de pH 67 Recuadro 2-3 Resolucién de problemas con la eouacién de Henderson-Hassolbalch 67 Recuadro 2-4 Sangre, pulmones y tampén: el slstema tampén del bicarbonato 63 2.4 El agua como reactive. 69 2.5 La adecuacién del ambiente acuaso @ los organismos os 70 Indice de materias cS 3 Aminodcidos, péptidos y proteinas_ 75 3.4 Aminodcidos 75 Los aminodcidos tienen caracter‘sticas estructurales comunes 76 Los residuos aminodcidos de las proteinas son estereoisimeros 1. 7 Los aminoacids se pueden clasficar segtin su grupo R78 Los aminofcidos no esténdar tienen también importantes funciones. 80 Los aminoicidas pueden actuar como dcidos y bases 81 Recuadro 21 Absorcién de la luz por las moléculas: ley de Lambert-Beer 62 Los aminodeidos tienen curvas de tinllacién caracteristieas 82 a curva de titulacion predice la carga eléctrica de los amino‘cidos 84 Los amminodcidos difieren en sus propiedades cido-base 84 3.2 Péptidosy proteinas. 85 Los péptidos son cadenas de aminodcidlos 85 Los péptidos pueden distinguitse por su comportamiento de fonizacion 86 Existen pépridos y polipéptidos biologieamente activos e una gran variedad de tamafos 86 Los polipéptidos tienen una composicion de aminodcidos ‘caracteristica 87 Algunas proteinas contienen grupos qulmicos diferentes alos aminodcidos 88 Existen varios niveles de estructura de las proteinas $8 3.3 Trabajar con protenas 89 Las proteinas se pueden separar y purificar 89 Las proteinas pueden separarse y caracterizarse or electroforesis 92 Es posible cuantificar las proteinas no aisladas 94 3.4 Estructura covalente de las proteinas 96 La funcisn de una proteina depend de su secuencia de aminodcitlos 96 Se ha determinado la secuencia de aminodcidos de millones de proteinas 95 Los polipéptidos cortos se secuencian utilizanda procedimientos automiticos 97 Las proteinas grandes deben secuenciarse a partir de fragmentos mis pequenos 99 Las secuencias de aminodcidos se pueden deducir también mediante otros métodos 100 Recuadro 3-2 Investigacion de las proteinas mediante la espectrometria de masas 102 Pueden sintetizarse quimicamente péptidos y protefnas pequeflas 104 La secueencia de aminoacidos proporciona informacién, ‘bioquimica importante 106 ‘3.5 Socuonclas de proteinas y evolucién 106 [Las secuencias de proteina permiten deducir la historia dela vidaen la Tierra 107 4 Estructura tridimensional de las proteinas 116 4.1 Visin general sobre la estructura proteica_ 116 4a conformacién de una proteina esta estabiizada principalmente por interacciones débiles 117 Elenlace peptidico es plano y rigid 118yi Indice de materias 42 Estructura secundaria de las proteinas 120 La hélice a es una estructura secundaria habitual fen protefnas 120 La secuencia de aminodcidos afecta ala estabilidad delahélice a 121 Recuadro 4-1 Cémo distingulr dextrogiro de levégiro 122 La conformacign B organiza las cadenas polipeptidicas en forma de hoja 123 ‘Los giros f son frecuentes en las protefnas 123 as estructuras secundarias comunes tienen angulos de enlace y un contenido de aminoacidos caracteristico 124 4.3 Estructuras terelaria y cuaternaria de las proteins. 125 Las proteinas fibrosas estan adaptadas a una funcién estructural 126 Recuadro 4-2 La ondulacién permanente es un ejemplo de Ingenieria bioquimica 127 En las proteinas globulares la diversidad estructural refleja la diversidad funcional 129 Recuadro 4-3 Razones para que los marineros, exploradores y ‘estudiantes universitaros consuman fruta y verduras frescas 130 La mioglobina proporcioné las primeras claves acerca de la complejidad de las estructuras proteicas globulares 132 Las proteinas globulares tienen estructuras terciarias diversas 134 Recuadro 4-4 Métodes para determinar la estructura tridimensional de una proteina 136 El andlisis de numerosas proteinas globulares revela patrones estructurales comunes 139 Los motivos proteicos constituyen Ia base de la clasificacién estructural de las proteinas 141 Las estructuras cuaternarias de las proteinas comprenden desde dimeros sencillos hasta grandes complejos 144 Bxisten limites al tamafio de las protefnas 146 4.4 Desnaturalizacin y plegamiento de proteinas 147 1a pérdida de la estructura conduce a la pérdida de funcion 147 La secuencia de aminodcidos determina la estructura tercaria 148 Los polipéptidos se pliegan ripidamente y segén un proceso de varias etapas 148) Recuadto 4-5 Muerte por un plegamiento incorrecto: las enfermedades pridnicas 150 ‘Algunas proteinas sufren un plegamiento asistido 151 5 Funcién de las proteinas 157 ‘5.1. Unié reversible proteinatigando:protefnas de unién a oxigeno 158 El oxigeno puede estar unido a un grupo prostético hemo 158 La mioglobina tiene un tinico sitio de fijacién para eloxigeno 159 Las inieracciones protefna-ligando se pueden describir cuantitativamente 160 La estructura proteica afecta al modo de union delligando 162 El oxigeno es transportado en la sangre por la mioglobina 162 Las subunidades de la hemoglobina son similares, estructuralmente ala mioglobina 163 La hemoglobina experiment un cambio estructural al unirse aloxigeno 164 La hemoglobina tne oxigeno de manera cooperativa 164 La unién cooperativa de ligando puede ser descrita cuantitativamente 167 Existen dos modelos que explican los mecanismos de 1a unin cooperativa 167 Recuado 5-1 Monéxido de carbono: un asesino slencioso. 168, La hemoglobina también transportalH" y COz 170 La unin de oxigeno a la hemoglobina esta regulada por et 2prbisfosfogicerato 171 ‘La anemia falelforme es una enfermedad molecular dela, hemoglobina 172 5.2 Interacclones complementarias entre protenas ligandos: sistema inmunitarioy las inmunoglobulinas. 174 1a respuesta inmunitaria es el resultado de la aceién 4e una serie de céluas y proteinas especializadas. 175 as e6lulas distinguen lo propio de lo ajeno exponiendo pépidos en su superficie 176 Las anticuerpos poseen dos sitios idénticos de unin ‘aantigeno 178 Los anticuerpos se unen fuertemente al antigeno de una ‘manera especifica 180 Las interacciones antigeno-antienerpo som Ia base de diversos ‘procesos analticos importantes 180 5.3 Interacciones proteleas moduladas por energia quimic actina, miosina y motores moleculares 182 Las principales proteinas del muisculo son Ia actina yla miosina 182 (tras proteinas adicionales onganizan los filaments delgado ‘ygnieso en estructuras ordenadas 184 Los flamentos gruesos de miosina se deslizan a fo largo de los filamentos delgados de actina 185 6 Enzimas 190 6.1 Introducelén alos enzimas 191 La mayoria de enzimas son proteinas 191 Los enzimas se clasifican segrin las reacciones que catalizan 192 6.2 {Cémo funcionan los enzimas? 193, ‘Los envimas alteran las velocidades de reaceién. pero no los equilibrios 193 Las velocidades de reaccién y lo equilibrios tienen. definiciones termodindmicas precisas 195 Unos pocos principios explican el poder catalitico vy la especificidad de los enzimas 196 Las interacciones débiles entre enzima y sustrato son Optimas en el estado de transicién 197 Los erwimas utilizan la energia de fijacién para proporeionar especificidad de reaccién y catalisis 198 Grupos cataliticos espeefficos contribuyen alacatélisis 200 6.3 La cinética enzimatica como método para comprender ef rmocanismo 202 La concentracién del sustrato afecta a la velocidad de las reacciones catalizadas por enzimas 202 La relaci6n entre concentracién de sustrato y velocidad de reaccion se puede expresar de manera cuantitativa 204 Para comparar las actividades enzimaticas se utilizan Tos parimetros cinéticos 205 Recuadro 6-1 Transformaciones de la ecuacién de Michaelis-Menten: grfica de dobles reciproces 206, ‘Muchos enaimas catalizan reacciones en las que intervienen dos o més sustratos 207 La cinética en el estado pre-estacionario puede aportar pruebas sobre pasos especificos de la reaceién 208‘Los enzimas estan sujetos a inhibicion reversible irreversible 209 Recuadro 6-2 Pruebas cinéticas para determinar los mecanismos ‘deinhibicién 210 El pH afecta a la actividad enziméticn 212 6.4 Ejemplos de reacclones enzimaticas 213 En el mecanismo de la quimotripsina se produce la acilacién y desacilacidn de un residuo de Ser 213 [En la hexoquinasa se produce un encaje inducido durante Ja uni6n del sustrato 218 El mecanismo de reaccién de la enolasa requiere la presencia de iones metalicos 219 Recuadro 6-3 Pruebas de Ia complementarledad entre el enzima vel estado de transicién 220 El isozima utiliza dos reacciones de desplazamiento rnucleofflico sucesivas 222 6.5 Enzimas roguladores 225 Tos enzimas alostéricos experimentan cambios conformacio- nales en respuesta a la unin del modulador 225 En muchas rutas las etapas reguladoras estn catalizadas por enzimas alostéricos 226 Las propiedades cinéticas de los enzimas alostéricos difieren del comportamiento de Michaelis Menten 227 Algunes enzimas reguladores experimentan modificaciones covalentes reversibles 228 ‘Los grupos fosforilo afectan a la estructura y la actividad catalitica de las proteinas 228 Las fosforilaciones multiples permiten un exquisito control dela regulacion 230 Algunos enzimas y otras proteinas son regulados mediante Ja rotura proteolitica de un precursor engimético 231 Algunos enzimas reguladores utilizan varios mecanismos de regulacién 232 7 Gllcidos y glucobiologia 238 7.1 Monosacérides y disacéridos 238 Las dos familias de monosacéridos: aldosas y cetosas 239 Los monosacéridos tienen centros asimétricos 239 Los monosacdridos comunes tienen estructura ciclica 240 Los onganismos contienen numerosos derivados de las hexosas 243 Los monosacairidos son agentes reductores 244 Los disacaridos contienen un enlace glucosfdieo 245) 7.2 Polisacérides 247 Algunos homopolisacdridos son formas de almacenamiento de combustible 247 Algunos polisacaridos tienen funcién estructural 248 Factores estéricos y los puentes de hidrégeno contribuyen al plegamiento de los homopolisacéridos 250 Las paredes celulares de algas y bacterias contienen heteropolisacaridos estructurales 252 1s ghicosaminoghicanos son heteropolisacaridos de la matriz extracelular 253 7.3 Glucoconjugados: proteoglucanos, gucoproteinas Y slucolipidos 255 ‘Los proteoglucanos son macromoléeulas de la superficie celular y de la matriz extracelular que contienen slucosaminoglucanos 256 Las ghucoproteinas contienen oligosacaridos unidos covalentemente 258 Los glucolipidos y los lipopolisacdridos son eomponentes de lamembrana 260 Indice de mateias xvi 7.4 Los giéeldes como moléculas portadoras de informacién: el cédigo de los anicares 261, Las lectinas son proteinas que leen el cédigo de los azvicares e intervienen en muchos procesos biolégicos 262 Las interacciones lectina-ghicido son muy fuertes y muy especificas 264 7.5 Andlisis de glicidos 267 8 Nuclestidos y dcidos nucleicos 273 ‘8.1 Algunos conceptos basicos 273 Los nuclestidos y dcidas nucleicos estan formados por bases ¥ pentosas caracteristicas 273 Los nucleotidos sucesivos de los dcidos nucleicos estén lunidos por enlaces fosfodiéster 276 Las propiedades de las bases de los nucletidos influyen en la estructura tridimensional de los dcidos nucleicos. 278 8.2 Estructura de los deldos mucoleas 279 BIDNA almacena informacién genética 280 Las moléculas de DNA tienen diferente composicion de bases 281 BIDNAes unadoble hélice 282 E|DNA adopta diferentes formas tridimensionales 283 Algunas secnencias de DNA adoptan estructuras no habituales 285 Los RNA mensajeros codifican la cadenas polipeptidicas 287 Muchos RNA tienen estructuras tridimensionales complejas 288 8.3 Quimica do los écdos nuceicos. 291 IDNA ¥ el RNA de dable helice pueden desnaturalizarse 201 Los icidos muclelcos de especies diferentes pueden formar ‘brides 292 Los nucle6tides y los dcidos nucleicos experimentan transformaciones no enzimdticas 293. Algunas bases del DNA estan melladas 296. Es posible determinar la secuencia de largas eadenas de DNA. 296 La sintesis quimica de DNA ha sido automatizada 298 ‘8.4 Otras funcionos de os nucleétides 300 Los nucleotidos transportan energia quirnica fen las eélulas 300 Los nucledtidos de adenina forman parte de muchos cofactores enzimaticos 301 Algunos nucleotides son moléculas reguladoras 302 9 Tecnologias de la informacién basadas enelDNA 306 9.1 Clonacién del DNA: fundamentos 306 BIDNA recombinante se produce con endonucleasas de restriceién y DNA ligasa 307 Los vectores de clonacién permiten la amplificacién de fragmentos de DNA insertados 311 1a hibridacién permite la deteccién de secuencias espeeificas deDNA 314 La expresin de genes clonados produce grandes cantidades de proteina 315 Laalteracién de los genes clonados produce protefnas modificadas 316 9.2 De los genes alos genomas 347 Las genotecas suministran catalogos especializados de informacion genética 318will Indice de materias, a reacci6n en cadena de la polimerasa amplifica secuencias de DNA especificas 319 Secuenciacién de genomas enteros 321 Recuadro 9-1 Un arma poderosa para la medicina forense 322 ‘9.3 De los genomas alos protoosomas 325 Las relaciones entre las secuencias o as estructuras dan informacion sobre la funcién de las protemas 326 Los patrones de expresi6n celular pueden revelar la funcién celular de un gen 326 La deteccion de las interacciones proteina-proteina es til ene estudio de las funciones celulares y moleculares 327 9.4 Modificaciones de los genomas y nuevos productos blotecnolégicas 330 Un pardsito bacteriano facilita la clonacién en plantas 330 La manipulacion de los genomas animales suministra informacion sobre la estructura de los cromasomas ylaexpresién génica 332 ‘Las nuevas tecnologfas pueden facihtar el descubritniento de nuevos farmacos 335 Recuadro 9-2 £1 genoma humano la terapla génica humana 336 La tecnologia del DNA recombinante ofrece nuevos Productos y nuevas posibilidades 38 10 Lipidos 343 10.1 Lipidos de almacenamiento 343 Los dcidos grasos son derivados de hidrocarburos. 343 Los tricilgiceroles son éteres de dcidos grasos Yalcerol 343 Los tiaeliglicerolesaportan enersiaalmacenada Yalslamiento 548 Muchos alimentos contienentracliceroles 346 Recuadro 10-1 Cachalotos:cabezones de las profundidades. 347 las ceras sirven como almacenes de enersia y como Cubiertas impereables al agua 318 102 Lildos ostucturaes dels membranas 348 os licerofostolipidos son derivatios del dcido fostatidico 340 Agunos fosfolipids tienen écidos grasos unos por enlace fer 349, Los cloroplastos contienen gelactotpidos y sulfolipidos. 361 las arquebacterias contienen Iipidos de membrana particlares 352 Los esfingolipdos son dervados del esfingosina 352 Los esfingolipidos de la superficie celular son sitios de reeanoeimiento biog 363 ‘Los fosfolipidos y los esfingolipides se degradan. enisosomas. 354 os esteroles tienen cuatro ailloshidrocarbonados fusionados 354 Recuadro 10-2 Algunas enfermedades genéticas humanas_ son cnsecuoncia do una acumulaclén anormal de lipides do membrana’ 358 10.3 Liptos como sefale,coactoesy plgmentos 387 16s fosftidiinositoes son derivatos de esfingosina Aue actian como seals intracelulares 387 Los iecsanoides son portadores de mensajes als clas Vecinas 358 las hormonas esteroidens transportan mensajes entre tejidos. 350 Las plantas uilizan fosfatdiinositoles esteroides y compuestos tipo leaanoide para enviar senales 360 las vitaminas A yD son precursores hormenales 360 [Las vitaminas E y K y las quinonas lip(dicas son cofactores, de oxidaci6n-reduiccion 362 Los dolicoles activan precursores glucfdicos para labiosintesis 363 104 Trabajar con lipides 363 ia extraccion de lipidos requiere la utilizacion de disolventes organicos 364 1La cromatografia de adsorcién separa los Mpidos de polaridad dllerente 365 La cromatogralla gas-quido separa las mezclas de derivacos liptdicos volatiles 365, La hicrlisis especifica ayuda a determina la estructura lipidica 365 La espectrometria de masas revela la estructura lipidica completamente 385 11 Membranas biolégicas y transporte 369 14.1 Composicién y arquitectura de las membranas. 370 Cada tipo de membrana presenta una composicién, de proteinas y lipidos caracteristica 270 ‘Todas las membranas bioldaicas comparten ciertas propiedades fundamentales 371 Blelemento bésico estructural de las membranas es una bieapa lpidica. 371 Las proteinas periféricas de membrana se solubilizan ficiimente 373 ‘Muchas proteinas abarcan la bicapa lipidiea 373 Las protefnas integrales son sostenidas en la membrana por interacciones hidrofbicas com lipidos 375 Puede predecirse la topologia de una protelna integral de membrana a partir de su secuencia 376 ‘Lipidos unidos covalentemente anclan algunas protetnas demembrana 378 11.2 Dindmica de membranas 380 Los grupos acilo del interior de la bicapa estén ordenados en grados diferentes 380 El movimiento de lipides transbicapa requiere catilisis 981 Lipidos y proteinas difunden lateralmente en la bicapa 382 Los esfirwolipidos y el colesterol se agrupan conjuntamente enbalsas de membrana 383 Recuadro 11-1 Microscopla de fuerza atémica para vsuallzar Droteinas de membrana 384 Las caveolinas definen una clase especial de balsas de membrana 385 Gierias proteinas integrales favorecen las interaceiones intercelulares y la adhesin 386 1a fusion de las membranas es crucial en muchos procesos biolégicos 387 11.3 Transporte de soluts a través de membranas. 389 Protefnas de membrana facilitan el transporte pasivo 389 Les transportadores pueden agruparse en superfamilias segiin sus estructuras 391 El transportador de glucosa de los eritrocitos faclita, el transporte pasivo 393 Bl intercambiador de cloruro-bicarbonato cataliza el cotransporte electroneutro de aniones a través dela membrana eritrocitaria 395 Recuadro 11-2 Transporte defectuoso de glucesa y de agua ‘en dos formas de diabetes 396 El transporte activo da lugar al movimiento de soluto contra un. ‘radiente de concentracion o gradiente electroquimico 397 Las ATPasas experimentan fosforilacién durante sus ciclos cataliticas 398Las bombs de Oa tipo P mantienen una baja concentracién de calcio en el citosol. 400, Las ATPasas tino F son bombas de protones reverses Jmpulsadas por el ATP. 401 Los transportadores ABC uilizan ATP para impulsar transporte activo de una ampli gama de sustratos 402 Los gradientes de iones proporcionan la energia para el transporte activo secundario 402 Recuadro 11-3 Un canal iénic defectuaso en la fibrosis uistiea 403, [Las acuaporinas forman canales transmembrana hidroffios para el paso de agua. 406 Los canals selectivos de iones permiten el movimiento ripido de iones a través de las membranas 408 La funcién del canal idnico se aide eléctricamente 409 La estructura de un canal de K* muestra las bases de su especificidad 409 Elcanal de Na* neuronal es un canal idnico de compuerta requlada por voltaje 410 BBlreceptor de acetilcotina es un canal iio de compuierta regulada por ligando. 411 Canales i6nicos defectuosos pueden tener consecuencias fsioligieas adversas. 415 12 Biosefializaci6n 421 12.1 Mecanlsmos moleculares de transduccion de sofial 422 Recuadro 12-1 El andlisis de Scatchard cuantiica la interaccl6n receptorigando 423 12.2 Canales i6nicos de compuerta regulada 425 {Los canales iénicos son el fundamento de la senalizacion eléctrica en células excitables 425 El receptor nicotinico de acetilcolina es un canal iénico de compuerta regulada por ligando 426 Los canales iGnicos de compuerta regulada por voltaje producen potenciales de aceién neuronales. 427 Las neuronas tienen canales receptores que responden ‘una variedad de neurotransmisores 428 12.3 Enzimas receptores. 429 El receptor de insulina es una protefna quinasa espeeffica de tirosina 429 Las guanilil ciclasas de receptores generan el segundo ‘mensajero cGMP 433 12.4 Receptors acopladas a protein Gy segundos mensajes. 435, El sistema receptor B-adrenérgico acta a través del segundo mensajero cAMP. 435 Elreceplor B-adrenérgico se desensibiliza por fosforacion 439 ELAMP efclco actia como segundo mensajero para un conjunto de molécuias reguladoras 441 Dos segundos mensajeros proceden de fosfatidiinositoles. 442 El calcio ¢s un segundo mensajero en muchas transductiones de senal 442 Recuadro 12-2 FRET: bloqumica vsualizada en una eétula va 446 12.5 Proteinas de armazén polivalentes y balsas de mombrana 448 Modulos proteicos unen residuos de Tyr, Ser o Thr {osforilados de proteinas asociadas 448 ‘Las balsas de membrana y las caveolas pueden segregar protelnas de seftalizacién 461 12.6 Sefalizacién en microorganismos y plantas 452 La sefalizacién bacteriana impone Ia fosforilacion. ‘enum sistema de dos componentes. 452 Indice de materias x 19s sistemas de sefializacién en plantas tienen algunos de los componentes utilzados por microbios ymamiferos 452 Las plantas detectan etileno a través de un sistema de dos comporentes ¥ una cascada MAPK 454 Proteinas quinasa tipo receptor transducen seftales, de péptidos y brasinostervides 455 12.7 Transduceién sensorial en la vista, el ofato yel gusto 456 La luz hiperpolariza los conos y bastones del ojo devertebrados 456 La luz desencadena cambios de conformacién en el receptor dela rodopsina 457 La rodopsina excitada actiia a través de la proteina G ‘transducina reduciendo la concentracién de cGMP 457 ‘La amplificacién de la sefal visual tiene lugar en los bastones yeonos 458 La sefal visual termina r4pidamente 458 La rodopsina se desensibiliza por fosforilacion 459 Las conos estén especializados en la visién en color 460 El olfato y el gusto en vertebrados utilizan mecanismos similares al sistema visual 460 Recuadro 12-3 Daltonismo: experimento de John Dalton ‘desde la tumba 461 Ls sistemas de receptores serpentina acoplados a protefna G presentan caracteristicas eomunes 462 La interrupeidn en la semtalizacisn por proteinas G provoca enfermedades 464 12.8 Regulacién de la transeripclén por hormonas esteroideas 465, 12.9 Regulacién del ciclo colular por proteinas quinasa 466 Elciclo celular tiene cuatro etapas 466 ‘Los niveles de las protesnas quinasa dependientes de ciclina experimentan oscilaciones 467 Las CDK regulan la divisin celular por fosforilacién de proteinas clave 470 12.40 Oncogenes, genes supresores de tumores y muerte celular progamada 471 Los oncogenes son formas mutadas de genes de proteinas que regulan el ciclo celular 471 Defectos en los genes supresores de tumores eliminan restricciones normales dle la division celular 472 La apoptosis es el suicidio celular programado 473 Il BIOENERGETICAY METABOLISMO 481 13 Principios de bioenergética 489 13.1 Blocnorgétca y tormodinémica 490 Las transformaciones biologicas de energia obedecen las leyes de la termodinamiea 490 Las células precisan fuentes de energia libre 491 La variacion de eneraia libre estandar esta directamente relucionada eon la constante de equilibiio 491 La variacion de energia libre real depende elas eoncentraciones de reacivos-y productos 499 las variaciones de energia libre estandar son aditivas 494 13.2 Tansforencia de guposfosforilyATP_ 496 [La varincion de energia libre en la hidriiss del ATP es grande ynegativa 496 ios compuestosfosfriladosy toésteres también tienen energias lbres de hidilisiselevadas 497 Recuadro 13-1 Energia bre de Mdrlss del AT dentro elas euls: ol coste real de los procosos metabsices 498wx nice de materas Ss I ATP proporciona energia por transferencta de grupo yno por simple hidrélisis 500 ELATP dona grupos fosforilo, pzofostorllo yadenililo 502 Rocwaco 13° Los estes de a weléraga: informesresplandeciontes det ATP 503 Tin formacign de macromoléculas informativas requlere energia 504 ELATP aporta energia para el transporte activo Yylacontraceién niscular 604 Lat transfosforilaciones entre nucleétidos se dan en todos Tos tipos celulares 505 Bl palifsfato inorginico es un dador potencial de grupos fosforlo 506 Las ecuaciones bioquinicas y qumicas no son identicas 506 433 Reacciones de oxidacénreduceiin 507 Bi fije de clectrones puede realizar trabajo bilégleo 507 las reacciones de oxidacion-reduecién se pueden deserbir en forma de semirreacciones 508 Blas owidaciones bioldgias interviene con frecuencia Ta deshidrogenacién 508 Los potenciales do redueeign son una medida de a afinidad orlos electrones 500 Los poteneiales de reduccié esténdar perten el eélevlo de ia variacin de energia Wore 510 Laoxidacion celular de glucosa a didxido de carbono ‘eajuere transportadores de electrones especializados 512 ‘Unos euattostipos de coenwinas y proteins actin como transportadores universales de electrones 512 ELNADH y el NADPH acttan con las deshidrogenasas com ansportadores solubles de electrones 512 La defciencia en la dieta de niacina, forma vitaminica “del NAD y del NADB, prodiice pelagra 914 ‘tas nucledtidos de flavina est fuertemente wnidos fenas favopeoteinas. 515 14 Glucdlisis, gluconeogénesis y ruta de las pentosas fosfato 521 a Glucoisis 522 ‘Una visidn global a glucdliss tiene dos fases 523 1a fave preparatoria de la glucdlisis precisa ATP. 525 ia fase de beneficios de la gluedlsis produce ATP yNADH 529 Bibalance global muestra una ganancia neta de ATP. 533 ia glucélisis esta sometida a una regulacion estricta 533, El catabolismo de la glucosa esté alterado en el tejido ‘eanceroso. 533 14.2 Rutas alimentadoras de a glucélisis 534 El glucogeno y el almidén se degradan mediante fosfordlsis 534 Los polisacdridos y disacaridos de la dieta se hidrotizan ‘amonosaciridos 535 Otros monosacdridos pueden entrar en diferentes puntos de la ruta ghicolitica 636 414.3 Destinos de prwato en condiciones anaerdbleas: formentaclin 538 El piruvato es el aceptor electronico terminal en la fermentacién kictien 588 Bl etanol es el producto reducido en la fermentacion aleohdlica. 538 Recuadro 14-1 otas, calmanes ycolacantos la ghuciisls ‘en condiciones limitantes de oxigeno 539 La tiamina pirofosfato transporta grupos “aldehido activos” 540 Algunas fermentaciones microbianas dan lugar a otros ‘productos finales con valor comercial 541 Recuadto 14-2 Elaboracién dela corvezn 842 144 Gluconeogénesis 543 La conversién de piruvato en fosfoenolpiruvato requiere dos reacciones exergonicas 544 La conversion de la fructosa 1,6-bisfosfato ‘en fructosa 6-fosfato constituye el segundo rodeo 547 La conversién de la ghucosa 6-fosfato en glueosa libre ‘constituye eltercer rodeo 547 La gluconeogénesis es energéticamente cara, pero es esencial 548 Los intermediarios del ciclo del 4cido ettrico y muchos amino‘icidos son glucogénicos 548 La gluconeogénesis y la glucslisis estan reguladas de forma reciproca, 548 145 Rota de las pentosas fosfato de axidacién de la glucosa 549 la fase oxidativa produce pentosas fosfato y NADPH 550 ‘Recuadro 14-3 zPor qué no comia falafel Pitdgoras?: deficiencia de glucosa 6-fostato deshidrogenasa $51 ‘La fase no oxidativa recicla las pentosas fosfato a xlucosa 6-fosfato 502 El sindrome de Wernicke-Korsakoff esta exacerbado por un defecto en la transcetolasa 654 La glucosa 6-fosfato se reparte entre la glucélisis y la ruta de las pentosas fosfato 554 15 Principios de regulacién metabélica: glucosa y glucdgeno 560 15.1 Motabolismo del gucégeno en animales 562 Ladegradacién del glucdgeno ests catalizada ‘por la glucdgeno fosforilasa 502 1a glucosa L-fosfato puede entrar en la ghucélisis 0, ‘on el higado, reponer la glucosa sanguinea 563 Elnnclestido-azdear UDP-glucosa aporta glucosa. paralasintesis de slucégeno 565 ‘Racuntre 36 Gary Gort Con: poneros GA meas ylas enfermedades dl glucégeno S66 La glucogenina incorpora los residuos iniciales de azticar del ghucdgeno 569 15.2 Rogulactén de las rutas metabélicas S74 {Las cétias vivas mantienen un estado estacionario, dinamico 571 ‘Los mecanismos reguladores se desarrollaron bajo fuertes presiones selectivas 571 Los enzimas reguladores responden a cambios en la concentracidn de metabolites 672 La actividad enaimatica se puede alterar de diversas ‘maneras 874 15.3. Rogulacién coordinada de ta gucéitsis yyla gluconeogénesis 575 [Los isozimas de la hexoquinasa de miisculo y de higado stn afectados de forma diferente por su producto, laglucosa 6-fosfato 576 Recuadro 15-2 Isozimas: proteins diferentes que catalizan lamisma reaccién 57 1a fosfofructoquinas-1 se halla sometida a una compleja rregulacién alostérica, 578 ‘piruvato quinasa es inhibida alostéricamente porel ATP 579,Existen diversos puntos de control de lagluconeogénesis 580 La fructosa 2,6-bisfosfato es un regulador potente de Ia glucélisis y de la gluconeogénesis 581 {¢Somtinuitles los ciclos dle sustrato? 583 ‘La xilulosa 5-fosfato es un regulador clave de los metabolismos glucidico y ipidico 583 15.4 Regulacién coordinada dela sintesis y degradacién del gucdgono 583 La glucdgeno fosforilasa est sujeta a control alostérico yhormonal 584 La glucdgeno sintasa también esté regulada por fosforilacion, y¥desfosforilacién 586 ‘La glucégeno sintasa quinasa 3 interviene en las acciones dela insulina 586 1La fosfoprotefna fosfatasa 1 es clave para el metabolismo del glucégeno 588 El transporte al interior de la eétula limita la utilizacion de glucosa 588 El metabolismo ghicfdico esta coordinado por sefiales alostéricas y hormonales 588 La insulina modifica la expresién de muchos genes inplicados en el metabolismo de ghicidos y de lipidos 590 El metabolismo de ghicidos y de lipids esta integrado mediante mecanismes hormonales y alostéricos 591 15.5 Analisis del control metabélico 591 Se puede medir experimentalmente la contribucién de cada enzima al Mujo a través de una rata 92 El coeficiente de control cuantifiea el efecto de un cambio, en una actividad enzimatica sobre el flujo metabélico através de una ruta 592 Bl coeficiente de elasticidad est relacionaddo con Ja sensibilidad de un enzima a cambios en la concentracion de metabolito o de regulador 593 El coeficiente de respuesta expresa el efecto de un controlador externa sobre el fo a través dela ruta 593 El analisis del control metabolico se ha aplicado al ‘metabolismo glucidico con resultados sorprendentes 93, Recuadro 15-3 Analisis del control metabolice: aspectos ‘cuantitatvos. 594 El analisis del control metabdlico sugiere un método general para incrementar el lujo a través de una ruta 596 16 El ciclo del dcido citrico 601 16.1 Producclén de acetiL-CaA (acetate acthvade) 602 El piruvato se oxida a acetil-CoA y CO. 602 El complejo de Ja piruvato deshidrogenasa necesita cinco coenzimas 603 El complejo de la piruvato deshidrogenasa esta formado por tres enzimas diferentes 604 Enla canalizacion de sustratos, los intermediarios nunca abandonan la superficie enzimética 605 16.2 Reacciones del ciclo del écido cftrice 606 Elciclo del dcido eitrica tiene ocho pasos 608 Recuado 16-1 Sintasas y sntotasas; ligasas y liasas; quinasas, {osfatasas y fosforlasas: isi, una nomenclatura confusal 613, a enengia de las oxidaciones del ciclo se conserva eficientemente 614 Recuado 16-2 Citrate: una molécula simétrca que reacclona asimétricamonte 614 ¢Por qué es tan complicada la oxidacton del acetato? 616, Indice de materias aad ‘Los componentes del ciclo del acido citrico son importantes intermediarios biosintéticos 616 Las reaociones anaplerdticas reponen los intermediarios del ciclo del dcido citrieo 618 Recuadro 16-3 Citratosintasa, limonada y suministro mundial de alimentos 618 Labiotina de la piruvato carboxilasa transporta arupos CO, 618 16.3. Regulacién del ciclo del dcido cittico 621 La produccién de acetil-CoA por el complejo de Ia piruvato eshidrogenasa est regulada por mecanismos alostéricos yeovalentes 621 El ciclo del acido citrico est regulado en sus tres etapas exerginieas 622 En el ciclo del acido citrico puede darse la canalizacién, de sustratos a través de complejos multienzimaticos 622 16.4 El ciclo del glowlato 623 El ciclo del glioxilato produce compuestos de cuatro carbonos a partir de acetato €23 Los ciclos del dcido cilrico y del glioxilato tienen una regulacién coordinada 624 17 Catabolismo de los dcidos grasos 631 17.1. Digestion, movlizacién y transporte de grasas 632 Las grasas de la dieta se absorben en el intestino delgado 632 ‘Las hormonas activan la movilizaci6n de triacilgticeroles almacenados 634 ‘Los didlos grasos son activacdlos y transportados al interior de las mitocondrias 635 17.2 Oxidactén de los écidos grasos 637 ‘La B-oxidacion de dcidos grasos saturados se produce en cuatro pasos bisicos 638 ‘Los cuatro pasos de la f-oxidacton se repiten para generar acetil-CoA y ATP 639 Elacetil CoA puede continuar oxidéndose a través del ciclo del dcido citrica 639 Recuadro 17-1 Los sos levan a cabo la -oxidacién durante la hibernacién 640 ‘La oxidacién de dcidos grasos insaturados requiere dos reacciones adicionales 641 La oxidacién de acidos grasos de cadena impar requiere tres reacciones adicionales 642, La oxidacién de acidos grasos esta regulada 642 Defectos genéticos de las acil graso-CoA deshidrogenasas producen enfermedades graves 643 Recuadro 17-2 El coenzima By, una solucién radical a un problema desconcertante 644 Los peroxisomas también llevan a cabo la -oxidacién 646 Los peroxisomas y glioxisomas de las plantas utilizan acetil- GoA procedente de la B-oxidacién como precursor Diosintético 647 Los enzimas de la f-oxidaci6n de diferentes orgénulos than tenido una evolucién divergente 647 En el reticulo endoplasmatico tiene hugar la w-oxidacién de los fcidos grasos 648 El écido fitdnico experimenta a-oxidacién enlos peroxisomas 649 17.3 Cuerpos ceténicos 650 Los cuerpos cetdnicos formadios en el higado se exportan ‘otros drganos como combustible 650 Durante la diabetes y en situaciones de inanictén se da tuna sobreproduecion de cuerpos cetonicas 652sell Indice de materias 18 Oxidacién de aminodcidos y produccién de urea 656 18.1 Destinos metabélicas e os grupos amino 657 ‘as proteinas de la deta se desradan enzimaticamente aaminodcidos 658 [BI pitidoxal fostato participa en la transferencia de arupos ‘amino al a-cetoglutarato 600 El glutamato libera su grupo amino en forma de amoniaco en elhigado 661 1a glutamina transporta amoniaco al higado 662 Recuadro 18-1 Determinacién de leslones isulares. 664 J alanina transporta amoniaco desde los miisculos fesqueléticns al higado 664 Elamoniaco es téxico para los animales 665 18.2 Excrecién de nitrégenoy ciclo dela urea 6 ‘La urea se produce a partir de amonfaco en cinco pasos enwimiticos. 687 Los ciclos del dcido eftrieo y de ta urea pueden conectarse 688, La actividad del ciclo de la urea est regutada ‘ados niveles. 659 Las interconexiones entre rutas reducen el eoste energético del ciclo de aurea 669 Defects genéticos en el ciclo de la urea pueden ser letales 669 18.3 Rutas de degradactén de los aminoseldos 671 Algunios aminodcldos se converien en giicosa, otros fen cuerpos cetinicos 671 ‘Varios cofactores enzimdticos juegan papeles importantes nel eatabolismo de los aminascidos 672 Seis aminodicidos se degradan apiruvato 674 Siete aminoicidos se degradan a acetil Co-A. 677 En algunas personas el eatabotismo dela fenilalanina es genéticamente defectuoso 679 Ginco aminoscidos se convierten en e-cetoglutarato 681 Cuatro aminoacidos se convierten en succinilCoA 682 110s aminodcidos de caciena ramificada no se degradan enelhigado 689 Recuacro 18-2 Detectives clentitinsresuelven tun crimen misteriso 684 Ta asparagina y el aspartato se degradan a oxalacetato 685 19 Fosforilacién oxidativa y fotofosforilacién 690 FOSFORILACION OXIDATIVA 691. 19.1 Reaclones de transornca de electones nias mitecondis 681, Los electrones son canalizados hacia transportadores ‘niversales de electrones 692 Los electrones pasan a través de una serie de transportadotes unidos a membrana 603 Los transportadores de electrones actilan en complejos: tmultienzimtiens 698 La enersia de la transferencia de clectrones se conserva fieleniomente enim gradiente de protones 701 Las mitocondsi de plantas tlenen mecanismosalterativos para oxidar el NADIT” 704 192 Sintsis dATP 704 Recuattro 19-4 Calor, plantas malollentes y rutasrespratorias alternativas. 706 La ATP sintasa esta compuesta por dos dominios funcionales, FyyF, 708 En la superficie de P, el ATP estd estabilizado frente AlADP 708 El gradiente de protones impulsa la iberacién del ATP. dela superficie del enzima 709 Cadla subunidad 8 de la ATP sintasa puede adoptar tres: conformaciones diferentes 709 La catilisis rotacional es Ia clave en el mecanismo de unién yy cambio dela sintesis de ATP. 711 Elacoplamlento quinuiosmético permite que las estequiometrias del consumo de Os y de la sintesis de ATP no se correspondan con ntimeros enteros 712 La fuerza proton-motria suministra energfa para el transporte activo 713 Sistemas de lanzadera envfan indirectamente NADH citos6lico a las mitocondrias para su oxidacién 714 19:3 Regulacién de la fosfrlaci6n oxidativa 718 La fosforilacin oxidativa est regulada por las necesidades energéticas celulares 716 ‘Una proteina inhibidora impide la hidrélisis de ATP durante, Taisquemia 717 ‘Las mitocondrias desacopladas del tejide adiposo marrén producen calor 717 Las rutas de formacién de ATP estén reguladas de forma coordinada 718 19.4 Genes mitocondrales: su origen y los ofectos ‘de mutaciones. 718 ‘Mfutaciones en genes mitocondriales producen enfermedades humanas 719 Las mitocondrias evolucionaron a partir de bacterias cendosimbidticas 721 419.5 Funclén de las mitocondrias en la apoptosis y en el estrés ‘oxidativo 721 FOTOSINTESIS: CAPTACION DE LA ENERGIA LUMINOSA 723 19.6 Caractersticas generales dela fotofosforilacién 723. 1a fotosintesis en plantas tiene lugar en los cloroplastos 724 La luz produce un flujo de electrones en Tos cloroplastos 724 19.7 Absoreién dea uz 725 1Las clorofllas absorben energfaInminosa para a fotosintesis 725 Los pigmentos accesorios aumentan la gama de absoreién delaluz 728 La clorofilacanaliza Ia enengia absorhida a centros de reaccidn mediante transferencia de excitones 728 19.8 £1 acontecimiento fotoquimico central: ef flujo lectrénica Impulsado por a luz 730 Las bacterias tienen uno de los dos tipos de centros de reaccidn foloquimicos individuales 730 Factores cinéticos y termodindmicos evitan la disipacién de energia por conversién interna 732, Dos centros de reaccion actdan en tandem en plantas superiores 733 Las clorofilas antena estan intimamente asociadas a los transportadores electrénicos 734 La separacidn espacial de los fotosistemas Ly Il evita el latrocinio de exeitones 736 El complejo del citocromo bs une los fotosistemas Ily 1 737 Las clanobacterias utilizan el complejo del citocramo baf ¥y el citocrome ce tanto en la fosforitacion oxidativa como en la fotofosforilacién 738 El agua es escindida por el complejo que desprende oxigeno 738indice de meters at 19,9 Sintesis de ATP por fotofesforilacién 740 Un gradiente de protones acopla el uo electrénico con la fosforiiacion 740 Se ha establecido la estequiometria aproximada de lafotofostorilacién 741 EL ujo cicico de electrones produce ATP, pero no NADPH iO, 741 La ATP sintasa de los cloroplastos es como la de las mitocondrias 742, Los dloroplastos evolucionaron a partir de bacterias endosimbisticas 742 Diversos organismos fotosintéticos utilizan dadores de hidrdgeno diferentes del agua 743 2m Jas bacterias hal6flas una tiniea protesna absorbe luz yy bomrbea protones para impulsar la sintesis de ATP 743 20 Biosintesis de gliicidos en plantas ybacterias 751 20.4 Sintesisfotosintética de giles 751 ‘Los plastidios son argémulos propios de las células vegetales yde las algas 752 La asimilacién del didxido de carbono tienen lugar en tres fases. 753 Cada triosa fostato sintetizada a partir de CO, cnesta seis NADPHy nueve ATP 762 Un sistema de transporte exporta triosas fosfato desde elcloroplasto e importa fostato 763 Cuatro enzimas del ciclo de Calvin son activados indirectamente por Ia luz. 764 20.2 Fotorrespiraciényrutas C, y CAM. 766 1a fotorrespiraciGn es el resultado de la actividad oxigenasa dela rubiseo 766 ‘La nuta de recuperacién del fosfoglicolato es costosa 767 En las plantas C,, la Mjacidn del COs y a actividad rubisco estan separadas espacialmente 769 En las plantas CAM, la eaptacién de CO, y a accién (e la rubisco estén separadas en el tiempo 770 20.3 Biosintesis de almidén y sacarosa. 771 La ADP-glucosa es el sustrato de a sintesis de almidén, ‘ent los plastidios de las plantas y de la sintesis de glucégeno enlas bacterias 771 La UDP-glucosa es el sustrato de la sintesis de sacarosa en el citosol de las células de hojas 771 1a conversién de triosas fosfato en sacarosa y almidén esta cestrechamente regulada 772 20.4 Sintesis de pollsacdrides de la pared celular: colulasa vegetal Y peptidoglucano bacteriano 774 1a celulosa es sintetizada por estructuras supramoleculares en la membrana plasmatiea 775 Diigosacaridos unidos a lipides son precursores en lasintesis, dela pated celular bacteriana 777 Recuadro 20-1 El proyectil contra el chaleco antibalas:peniclina yfactamasa 779 20.5 Integrackin dol metabolism glucidco en la célua vegetal 780. a gluconeogénesis convierte las grasas y proteinas ‘en glucosé en las semillas en germinacién 780 Fondos o reservas de intermediarios comurtes unen rutas endiferentes orginulos 781 21 Biosintesis de lipides 787 21.4 Blosintesis de dcidos grasose leosanoides 787 El malonil-CoA se formaa partir del aceti-CoA ydelbicarbonato 788 la sintesis de acidos arasos transcurre mediante luna secuencia de reacciones repetidas 788 El complejo de la ido graso sintasa tiene siete sitios activos diferentes 789 a dcido graso sintasa recibe los grupos acetilo ymalonilo 790 Las reacciones dela écido graso sintasa se repiten hasta formar palmitato 791 a cid graso sintasa de algunos organismos esta compuesta. or proteinas multifuncionales 794 La sintesis de dcidos grasos se produce en el eitosol sie muchos organismos pero en las plantas tienen lugar enlos cloroplastos 794 Blacetato sale de la mitocondria en forma de citrato 794 La biosintesis de dcidos grasos est4 estrechamente regulada 795 Los didlos grasos de cadena larga se sintetizan a partir del palmitato 797 La desaturacién de los écidos grasos necesita una oxidasa de funcién mixta 798, Recuadro 21-1 Oridasas de funckén mints, oxigenasasy etocrome 450 798 Los icosanoides se forman a partir de fcidos grasos olinsaturados de 20.carbonos 800 Recuadro 21-2 El remedio esti en el sitio (activo): sozimas dd la cilooxigonasa y la bisqueda de una asplrina mejor 802 21.2 Biosintesis de triaciigiceroles 804 Los triacilliceroles y glicerofosfollpidos ge sintetizan, partir de los mismos precursores 804 1a biosintesis de triaclgiceroles en los animales est regulada por hormonas 804 El tejido adiposo genera glicerol 3-fosfato mediante aliceroneogénesis 806 21.3 Biosintesis de fsfolipldos de membrana 808 ‘Las eélulas tienen dos estrategias para unir grupos de cabeza de los fosfolipidos 809 La sintesis de fosfolipidos en B. colt utiliza CDP -diacilglicerol 811 ‘Los eucatiotas sintetizan fosfolfpidas anl6nicos a partir del CDP-diaciglicerol 811 Las rutas eucariticas hasta la fosfatidilserina, {osfatidileanolamina y fostatidlcolina estan interrelacionadas 812 la sintesis de plasmaldgeno requiere la formacion de um alcohol graso unido por enlace éter 813 Las sintesis de esfingolipidos y glicerofasfolipidos comparten recursotes y algunos mecanismos. 813 Los lipidos polares estn destinados a membranas celulares especificas 814 24.4 Biosintesis de colesterol esteroldes e Isoprenoides. 816 El colesteral se forma cel acetil CoA en cuatro fases. 816 Elcolesteral tiene varias destinas 820 Elcolesterol y otros lipides son transportados por lipoprotefnas plasméticas 820 Recuadro 21-3 Les alelos dela apoE predicen la Incidencia de la enfermedad de Alzholmer 824 Los ésteres de colesterol entran en las eélulas por endocitosis Iacilitada por receptor 824 Labiosintesis del colesterol est4 regulada a diversos niveles 825, Las hormonas esteroideas se forman por rotura dela cadena lateral y oxidacin dol colesterol 827 Los intermediarios de la sintesis del colesterol tienen muchos destinos alternativos 825aly {dive de materiss ——$—<$<—<—<—$—$—$————— es 22 Biosintesis de aminodcidos, nucledtidos y moléculas relacionadas 833 22.1 Aspectos generales del metabolismo del ntrégono 834 Bl ciclo del nitrégeno mantiene una reserva de nitrogeno disponible biolégicamente 834 El nitrogeno es fijado por enzimas del complejo dela nitrogenasa 834 Elamoniaco se incorpora a las biomoléculas a través del ghutamato y las glutamina 837 La glutamina sintetasa es un punto de regulacion principal en el metabolismo del nitrigeno 888 ‘Varios tipos de reacciones tienen un papel especial en la biosintesis de aminoscidos y nucleétidos #40 22.2 Blosintesis de los aminodcides 841 Ela-cetoglutarato es precursor del ghutamato, la glutamina, laprofina y la arginina 842 La serina, la glicina y la cisteina proceden. del 3fosfogliceraio 842, ‘Tres aminodcidos no esenciales y seis aminodcides esenciales se sintetizan a partir de oxalacetato y piruvato 845 El corismato es un intermediario clave en la sintesis de triptofano, fenilalanina y tirosina 849 La biosintesis de la histidina utiliza precursores de la biosintesis de purinas 851 La biosintests de los arinodcis se halla bajo contro alostérico 851 22.3 Moléculas dorvadas de aminodcidos 854 Laglicina es un precursor de las porfirinas 854 El hemo es la fuente de Tos pigmentos billares 854 Recuadiro 22-1 Bloquimica de reyes y vampiros 857 La biosintesis de la croatina y del glutation se realiza ‘partir de aminofcidos 857 Los n-aminodcidas se hallan bisicamente en las bacterias 858 Los aminodcidos aromaticos son precursores de muchos ccompuestos presentes en los vegetales 859 Los aminodecidos se convierten en aminas bidsenas por descarboxilacién 859 La arginina es el precursor de la sintesis biol6gica del 6xido nitrico 860 Recuatro 22-2 Un eaballo de Troya bloquimico para la euracién de la enfermedad del suefo africana 862 22.4 Biosintesis y ogradacién de los nuclestides 862 Lasintesis de novo de los muclestides de purina empleza ‘con el PRPP 864 Labiosintesis de los nucledtidlos de purina esta regulada por retroinhibicién 866 ‘Los nuclestidos de pirimidina se sintetizan a partir de aspartato, PRPP y carbamil fosfato 867 La biosintesis de los nucledtidos de pirimidina esta regulada ‘por retroinhibicion 868 Los mucledsidas monofasfato se convvierten en nuctesisiclos Trifosfato 868 Los ribonuclestidos son los precursores de los desoxirribonuclestidos 869 EL timidilato se forma a partir cle CDP y AUMP_ 873, La degradacidn de las purinas y las pirimidinas produce ‘Acido tirico ¥ urea, respectivamente 873 Las bases purinicas y pirimidinieas se reciclan a través de mutas de recuperacion 875 Una sobreproduccién de dcido tirico es la causa delagota 875 ‘Muchos agentes quimioterapéuticos actdan sobre enzimas de las rutas de biosintesis de nuclestidos 876 23 Integracién y regulacién hormonal del metabolismo de los mamiferos 801 23.1 Hormonas: estructuras dversas para funciones diversas 881 BEI descubrimiento y la purificaci6n de las hormonas requieren un bioensayo 882 Recuattro 23-1 ,Cémo se dosoubre una hormona? El arduo camino hasta la insulina purificada 883 Las hormonas actiian a través de receptores celulares de elevada afinidad 884 Las hormonas son quimicamente diversas 886 La liberacién de hormonas est regulada por seftales neuronales y hormonales jerarquizadas 889 23.2 Metabolismo especifica de los tejidos: division fel trabajo 892 El higado transforma y distribuye los nutrientes 893 El tejido adiposo almacena y suministra deidos grasos 897 El miisculo utiliza ATP para realizar trabajo mecdnico 898 El cerebro emplea enengfa para la transmisiGn de los impulsos eléctricos 900 La sangre transporta ox{geno, metabolites y hormonas 900 23.3 Regulacién hormonal el metabolismo energético 902 El pancreas secreta insulina 0 glucagén en respuesta ‘cambios en la glucosa en sangre 902 La ingulina contrarresta la glucosa sanguinea elevada 904 El alucagén contrarresta los niveles bajos de ghicosa en sangre 904 Durante el ayuno ¥ la inanicién el metabolismo se modifica ‘para proporcionar combustible para el cerebro 906, ‘La adrenalina es la sefial de una actividad inminente 908 El cortisol indica estrés, incluyendo los bajos niveles, de glucosa en sangre 909 La diabetes es un defecto en la produceién o en la accién, de a insulina 909 123.4 Obesidad y regulacion dela masa corporal 910 {a veoria ipostatica predice la regulacion por Fetroalimentacién del tejido adiposo 910 La leptina estimula la proxtuceion de hormonas peptidicas anorexigénicas 12 Talleptina desencadena una cascada de sefalizacion que regula la expresion génica 913 El sistema de Ia Teptina puede haber evolucionado para regular la respuesta ala inanieién 913 La insulina actia en el micleo arcuato para regular Ja ingesta y la conservacion de energia 914 La adiponectina acta a través de la AMPK 914 La dicta regula la expresion de genes cruciales para, ‘el mantenimiento de la masa corporal 915 La grelina yla PYYj 9 establecen los habitos de ingesta ‘acorto plazo 916 Il LAS RUTAS DE LA INFORMACION 924 24 Genes y cromosomas 923 24.1 Blementos cromosémicos 924 Los genes son segments de DNA que codifican cadenas polipeptidicas y RNA 924 las moléculas dé DNA son mucho ms langas que las células que las contienen $25 {Los genes y los cromosomas eucaristicos son muy complejos. 92824.2 DNA superenrollado 930 La mayor parte del DNA celular est subenrollado 932 El subenrollamiento del DNA se define por el ntimero de enlace topolgica 933 Las topoisomerasas catalizan cambios en el ntimero de enlace del DNA 935 La compactacién del DNA requiere una forma especial de superenrollamiento 937 24.3 La estructura de los cromosomas 938 La cromatina esté compuesta por DNA y proteinas 938 Las histonas son pequefias proteinas bisicas 939 [Los nucleosomas son las unidades fundamentales de organizaciin dela cromatina 940 Los nucleasomas se empaquotan en sucesivos 6rdenes superiores de organizacion 942 Las estructuras de los cromosomias condensados se mantienen mediante proteinas SMC 943 ELDNA bacteriano también se encuentra altarmente organizado 943, 25 Metabolismo del DNA 948 25.4 Replicacién del DNA 950 La replicacién del DNA est gobernada por un conjunto de reglas fundamentales 950 ELDNA es degradado por nucleasas 952 IDNA es sintetizado por DNA polimerasas 952 Lareplicacién es muy precisa 954 E. coli posee al menos cinco DNA polimerasas 955 La replicacién del DNA requiere muchos enzaimas ¥ factores protei Lareplicacién del cromosoma de E.coli procede or etapas 958 Lareplicacion bacteriana corre a cargo de factorfas replicativas ancladas en la membrana 963 La replicacién en las células eucaristicas os mas compleja 964 25.2 Reparacién del DNA 966 Las mutaciones estn relacionadas con el céncer 966 ‘Todds las células tienen miiltiples sistemas de reparacién del DNA 967 Recuatiro 25-1 Reparacién del DNA y cdncer 970 La interaecién de las horquillas ce replicacién con lesiones del DNA puede inducir sintesis de DNA propensa al error através de lalesion 976 25.3 Recombinacién dol DNA 978 La recombinacién genética homéloga tienen nnltiples| Tunciones 979 La recombinacién durante la meiosis se inicia en roturas| de doble cadena 980 La recombinacién requiere una multitud de engimas y otras proteinas 982 ‘Todos los aspectos del metabolismo del DNA participan ena reparaci6n de las horquillas de replicacién Dloqueadas 984 La recombinacién espeeifia de sitio produce reordenamientos precisos del DNA 985 La recombinaciin especifia de sitio puede ser necesaria para completar la replicacién del cromosoma 988 Los elementos genéticos transponibles se mueven de un lugara otro 988 Los genes de las inmunoglobulinas se forman por recombinacién $80 Indie de materia xy 26 Metabolismo del RNA 995 26.4 Sintesis de RNA dependiente de DNA 996 ELRNA es sintetizado por RNA polimerasas 996 La sintesis del RNA empieza en los promotores 998 La transcripeién esta regulada a diferentes niveles 1001 Laterminacién de la sintesis del RNA esta indicada por secuencias especificas 1001 Recuadro 26-1 La RNA polimerasa deja su huella enum promotor 1002 as eélulas eucarioticas tienen tres tipos de RNA polimerasas nucleares 1003 La RNA polimerasa Il requiere otros muchos factores proteicos para su actividad 1003 La RNA polimerasa depencliente de DNA es inhibida selectivamente 1006 26.2 Maduractén det RNA. 1007 Los mRNA eucaridticas levan un casquete enelextremo 5” 1008 ‘Tanto los intrones como los exones son transeritos del DNA ‘al RNA 1008 ELRNA cataliza el corte y empalme de los intrones. 1009 Los mRNA eucariéticos tienen una estructura caracteristica enelextremo 3! 1011 La maduracién diferencial del RNA da lugar a miitiples ‘productos a partir de un gen 1014 Los RNA ribos6mnicos y los tRNA también son ‘modificados 1014 Algunas etapas del metabolismo del RNA estén catalizadas por enzimas de RNA 1017 Los mRNA celulares se degradan a velocidades diferentes 1020 1a polinuclestido fosforilasa forma polimeros de tipo RNA. de secuencia aleatoria 1020 28.3 Sintesis de RNAy DNA dependionte de RNA 1021 a transcriptasa inversa produce DNA a partir de RNA vitieo 1021 Algunos retrovirus provocan efincer y sida 1023 Muchos transposones, retrovirus e intrones pueden tener ‘un origen evolutivo comin 1023 ‘Recuadro 26-2 Tratamionto del sida con inhibidores dd la transcriptasa versa del IH 1024 La telomerasa es una transeriptasa inversa especializada 1025 Alguinos RNA viricos se replican por medio de una RNA polimerasa dependiente de RNA. 1027 La sintesis de RNA ofrece pistas importantes sobre la evolucion bioguimiea 1027 Recuadro 26-3 El método SELEX para generar polimeros de RNA, ‘con nuevas funciones 1030 27 Metabolismo de las proteinas 1034 27.4 Elcédig genético 1034 El eédigo genético fue descifrado mediante moldes dde mRNA artifctales 1035 El balanceo permite que algunos tRNA reconczcan ms deun coden 1039 Recuadro 27-1 Camblo de montura a modio camino: desplaamiento el marco detraducelén yedicién det mRNA. 1040 Roouatro 27-2 Exepciones que confiman la rela: aiacones ‘atures del cédigo genética 1042 27.2 Sintsis de proteinas 1048 Labiosintesis de las proteinas tienen lugar en cinco tapas 1044 Elnibosoma es una compleja maquina supramolecular 1045aw indice de meterias Recuatro 27-3 De un mundo de RNA a un mundo de proteina 1048 Los RNA de transferencia tienen rasgos estructurales ‘caracteristicas 1049 Fase I: las aminoacil-{RNA sintetasas unen los aminoscides ‘correctos a sustRNA 1051 ase 2: la sintesis de proteinas empieza can un arninoécido especifico 1054 Fase 3: los enlaces peptidicns se forman durante la fase de elongacion 1058 Fase 4: la terminacion de la sintesis de polipéptidas requiere uuna sefial especifica 1061 ‘Fase 5: plegamiento y modificacién de las cadenas polipeptidicas recién sintetizadas 1082 Recuadro 27-4 Variacién Induclda en el cédigo genético: supresién de mutaciones sin sentid 1065 La sintesis de proteinas es inhibida por muchos antibisticos ytoxinas 1065 27.3 Destino y degradacién de las proteinas 1068 La modificacién postraduccién de muchas protefnas ‘eucariticas empieza en el reticulo endoplasmatico 1068 1a glucosilacion juega un papel clave en el destino de las proveinas 1069 Las secuencias sefal para el transporte nuclear no son cortadas 1071 Las bacterias también utilizan secuenciae serial para el destino de las proteinas 1072 Las eélulas importan proteinas mediante endocitosis. facilitada por receptores 1074 ‘Todas las células disponen de sistemas especializados de degradacidn de proteinas 1075 28 Regulacidn de la expresion génica 1081 28.1 Principos de regulactongénloa 1082 La RNA polimerasa se une al DNA en los ppromotores 1082 Bl inicio de la transcripcion est4 regulada por proteinas «que se unen a los promotores o cerca de ellos 1083, La mayoria de los genes procaristicos estan agrupados yyse regulan en operomies 1085 Bl operon lac esta sujeto a regulacién negativa 1085 Las protesnas reguladoras tienen dominios independientes deunionalDNA 1087 Las proteinas reguladoras también tienen dominios de interaccin proteina-proteina 1090 28.2 Regulacién deta expresi6n génica en los procaritas 1092 Eloperdn lac esté sujeto a regulacion positiva 1098 ‘Muchos genes de los enzimnas de la biosintesis de amino- ‘cidos se regulan por atenuacién de la transcripcién 1094 1a inducci6n de la respuesta SOS requiere la destrucelén de proteinas represoras. 1097 Ia sintesis de proteinas ribasémicas esta coordinada ‘con la sintesis de rRNA 1098 Algunos genes se regulan por recombinacién genética 1100 28.3 Regulacion deta expresion génica on los eucariotas, 1102 ‘La cromatina transcripeionalmente activa es ‘estracturalmente diferente de la cromatina ingctiva 1102 ‘La cromatina se remodela por acetilacion y desplazamienta de los nucleosomas 1103, ‘Muchos promotores eucaristicos se regulan positivamente 1103, ‘Transactivadores y coactivadores que se unen al DNA facilitan el ensarablaje de los factores de transcripcién sgenerales 1104 Los genes del metabolismo de Ia galactosa en las levadhuras stdin sujetos tanto a regulacién positiva como nogativa 1106 Los transactivadores de unién al DNA tienen tna estructura modular 1108 La expresién génica eucariética puede ser regulada Dor seflales intercelulares e intracelulares 1108 1a fosforilacién de los factores de transeripoi6n mucleares puede contribuira su reglacién 1109 Muchos mRNA eucariticos estan sometides a represién, traduccional 1109 Bi silenciamiento postranscripeional de los genes se produce por interferencia del RNA 1110 El desarrollo est controlado por cascadas de proteinas| reguladoras 1111 ‘Apéndice A Abreviaturas comunes en la literatura cientifica bloquimica At ‘Apéndice & Soluciones abreviadas de los problemas SA-1 Giosario 6-1 ‘ Procedencia de las ilustraciones PL Indice alfabético 14capitulo FUNDAMENTOS DE BIOQUIMICA 1.1 Fundamentos celulares 3 1.2. Fundamentos quimicos 12 1.3. Fundamentos fisioos 21 1.4 Fundamentos genéticos 28 1.5. Fundamentos evolutivos 31 Con el descubrimiento de la célula, la biologfa habia descubierto su tomo... A partir de entonces el estudio de la célula y el andlisis de su estructura result6 esencial para Ja caracterizacin de la vida con el objeto de identifcar aquellas propiedades comunes y necesarias para la vida de cada una de las células y también, alternativamente, para identficar diferencias asociadas con el desarrollo de funciones especificas. —Frangois Jacob, La logique du vivant: une histoire de rhétédité, 1970 Debemos reconocer, y asi me lo parece, que el hombre, con todas sus nobles cualdades... acarrea todavia en su estructura fisica el sello indeleble de su humilde origen. —Gharles Dani, The Descent of Man, 1874 pect szrositatamente unos qunes o vent il itones de aos, el universo navié de un eataclismo explosive que esparcié particnlas subatémicas extremadamente calientes y reas en enerafa. En euestiin de segundos se formaron los ele mentos mAs simples, Al tiempo que el universo se expandia y enfriaba, se condensaba la materia bajo la influeneia de ka ara- vedad y se formaban las estrellas. Algunas de ellas #e hicieron enormes, explotaron en supernovas y liberaron la energia ne cesaria para producir elementos mis complejas a partir de ka fusion de los nicleos atémicos mus simples, De este modo apa- recieron la Tierra y los elementos quimicos que hay se encue tran en ella, La vida apareci6 hace unos cuatro mil millones de anos en forma de microorganismos sencillos dotados de la ea. ppacidad de extraer energia de los compuestos orginicns 0 de la hg solar Esta energia sirvio para sintetizar una amplia variedad de blomoléeulas a partir de los elementos y compuestos mis simples presentes en la superficie de la Terra. ‘La bioquimica se pregunta acerca del modo en que tiles de diferentes moléculas inanimadas dieron lugar a las comple jas propiedades de los organisms vivos. Cuando estas molé ‘culas se alslan y examinan individualmente cumplen todas las leyes fisicas y quimicas que deseriben el comportamiento de la ‘materia inanimada, del mismo modo que ocurre con texos Jos procesos que tienen Iugar en organismos vivos, El estudio de Ja bioquimica muestra el modo en que las moléculas inanima- das que constituyen los organisinos vivos interaecionan para ‘mantener y perpeluar la vida, rigiéndose por las misraas leyes {isicas ¥ qutmieas que gobiernan todo el universo, A pesar de ello, os onganismos paseen cuatidades que los dlistinguen de otras agrupaciones de materia, ;Cusles son las ‘caractertsticas distintivas de los organisimos vivos? Un elevado grado de complejidad quimica y de or- ganizaci6n microseéplea. Las inrineadas estructuras internas celulares estan formadas por miles de moléculas| diferentes (Fig. 1-1a). Cada una posee su propia secuen cia de subunidades caracteristica, una estructura tridi- mensional inca e interacciona con una seleceién altamente especifica de moléculas ce la eétula Sistemas para la extraccién, transformacién y uso de energia del entorno (Fig. 1-1), que permiten alos organismos construlr y mantener sus complejas extract ras ¥ llevar a cabo trabajo mecainico, quimico, osmético ¥ eléctrico. Contrariamente, la materia inanimada tiende a degradarse hacia un estado mis desordenado, equi brandose con su entorno, La capacidad para autorreplicarse y antoensamblar- se (Fig. 1-1c). Una tnica eéhula hacteriana eolocada en lun medio nutriente estéril puede generar mil millones de clas “hijas”idérticas a ela en 24 horas. Cada eélula contiene miles de moléculas diferentes, algunas dle elas de una gran complejidadl; a pesar de ello, ada bacteria2 Ccaptuio 4 Fundamentos de bioquimica FIGURA 1-1. Algunas caracteristicas de la materia viva. (a) En esta seccién fina de tejido muscular de vetebrado, vista por el microsco: Pio electrénico, se apreca su omganizacién y complejidad micros: pica. ¢b) Un hale6n de las praderas se nutre mediante el consumo de ln pequefio pijaro. () La reproduccidn bioligiea tiene lugar conf delidal casi periecta es tna copia fel del original y toda la informacion para su construccion esta contenida en el material genético de la célula original Mecanismos para detectar y responder a las altera- ciones en su entorno, mesiiante un ajuste constante a estos cambios gracias ala adaptacidn de sus procesos: quimicos internos. La existencia de funciones definidas para cada uno de sus componentes y Ia regulacién de las interac- clones entre ellos. Bsto es cierto no tinieamente para estructuras macroseépicas como hojas y tallos el cora- on y Jos pulimones, sino también para estructuras mi ‘croscopicas intracellares y para compuestos quimicos individuales, Existe una relacién dinimica entre los com. ponentes quimieos de un organismo vivo; los eammbios en tno de los componentes producen cambios compensato- rios en otro, de modo que el conjunto posee un caracter propio, mas alli del de cada una de sus partes individua- Jes, El conjunto de moléculas leva a eabo un programa {que tiene como resultado inal la reproduceién del mismo ya perpetnacién de este conjunto de matéeulas; en defi- nitiva, el resultado final es la vida. Una historia de cambio evolutivo. Los organisimos, vvarian sus estrategias vitales heredadas para sobrevivie Cen situaciones nuevas, Bl resultado de eones de anos de evohicion es ima enorme diversidad de formas de vida, superficiamente muy diferentes (Pig, 1-2) pero relacionadas a través de sus ancestros comunes, A pesar de estas propiedades comunes de las que se de duce que existe una uniformidad fundamental en todas las rmanifestaciones de la vida, existen rauy pocas generalizaciones que sean absolutamente correctas para todos los organismos vivos y bajo todas las condiciones. La diversidad es enorme, La gama de habitats en que viven los organismos tiene su reflejo fen la gama jgualmente-amplia de adaptaciones bloguimicas es peeificas que tienen lugar en un entorno quimico compartido, Con el objeto de primar laclardad de exposicion, en este libro usaremos algunas generalizaciones que, aunque no perfectas, resultan tiles; con frecuencia también comentaremos algunas lexcepeiones que pueden ayudar a aclarar aquellas generaliza ciones cientificas. FIGURA 1-2 Organismos vivos diferentes comparten caractersticas 10, bestias, plantas y microorganismos del suelo comparten con ol hombre las mismas unidades estructurales baisicas (células)y los mismostipos de macromoléculas (DNA, RNA, proteinas) compuestas por los mismos tipos de subunidades mono- inéicas(nuclestids, amino). U de sinters de los componentes celulares, compart el mismo cédigo, genético y descienden de los mismos ancestos evolutives. Detalle ‘el “Jacin del Edén*, obra de an van Kessel el Joven (1626-1679), lzan los mismos mecanismosLa bioguimica pretende describir en términos moleculares aquellas estructuras, mecanismos y procesos quimicos com- ppartidos por todos los organismos y proporciona los principios de organizacién que subyacen en todas las diversas formas de ‘vida, prineipios a los que nos referiremos colectivamente como la l6gica molecular de ta vida. Aunque la bioquimica pro- porciona conocimientos y aplicaciones précticas, su preocupa- cidn diltima es e1 prodigio de la vida misma. Por tanto, en este capitulo introductorio deseribiremos los fundamentos celulares, quimicos, fisicos (termodinamicos) ¥ genéticos de la bioguimica y el principio general de la evalucio: el desarrollo de las propiedades de las células vivas a lo largo de las generaciones. Durante la lectura de este libro puede resultar Util referirse a este capitulo de vez en cuando con el objeto de reftescar la memoria sobre estos temas basics. 1.1 Fundamentos celulares [La unidad y diversidad de los organismos es evidente incluso a nivel celular. Los organisms mas pequefios son unicelulares y icroseépicas. Los organismos mayores contienen muchos ti- ‘pos de eélulas de tamafo, forma y funciones diferentes. A pesar de estas diferencias obvias, todas las eétulas comparten ciertas propiedades fundamentales, observables a nivel bioquimico, Las células son las unidades estructurales yy funcionales de todos los organismos vivos “Todas las céIulas comparten cierias caracteristicas estructura- les Fig 1-3). La membrana plasmitiea define la perferia de Ja eula,separando su eontenido del medio extemo. Esta com puesta por moléculas de lipides ¥ de proteinas que forman una bbarera hidrofobica fina y exible. Actia como una barrera a la libre circnlacién de iones inorgéniens y de la mayor parte de compuestos cargados o polares. Las proteinas de transporte de la membrana plasmtica permiten el paso de ciertos iones y ‘moléculas; las receptoras transmiten senules hacia el interior de la ella; por su parte, los enzimas de membrana participan en algunas reacciones. Gracias ala interaecidn no covalente entre Jas subunidades individuales de lipides y proteinas de la mem brana plasmatica, la estructura global tiene un elevado grado de flexibilidad que permite que se produzean cambios en la forma yeeltamaio de la eéiula. Al crecer la cétula se insertan en la ‘membrana nuevas moléculas de lipo y proteinareciénsintet- ada; ln divin cehular produce dos eétula, cada una con si ‘propia membrana. El crecimiento y a dvisién ({isi6n) celular se producen sin pérdida de aintegrdad de la membrana 1 volumen interno limitado por la membrana celular, el citoplasma (Fig. 1-3), esta compuesto por una disolucién acuosa, el eitosol, yuna variedad de particulas en suspension ‘con funciones espectfiens. El citosol es una solucion muy eon centrada que contiene: enzimas y las moléculas de RNA que los eodifican; las subunidades monoméricas (aminodcidos y ‘nuctedtidos) a partir de las cuales s¢ forman estas macromolé callas;centenares de pequefias moléculas ongnicas denomina das metabolites, intermediarios de las rutas biosintéticas y 1.1 Fundamentos celulares 3 Niicleo (cucariotas) onucleoide (baeterias) Contiene material genético: DNA El nucleo Bicapa lipidica rosistonte ¥ llexible. Selectivamente permeable para sustancias polares. También incluye ‘proteins de membrana que ‘actian en el transporte, \y en la recepeién de sefiales \yeomoensias Citoplasma rr Contenido acuoso de la cclula y particulas y frgdnuos suspendidos fen el mismo, centitugecin 9 180.000 | Sobrenadante:citosl Disolucién concentrada de enzimas, RNA, subunidades monoméricas, metabolites e ones ' inoranicos uv Pallet: partioulas yorgios. Ribosomas geinulos de almacenamiento, ritocondras lroplaste, isosomas, retical endoplasmatin. FIGURA 1-3. Caracteristicas universales de las eélulas vvas. Todas las eéluas tienen un nicleo 0 nucteoide, una membrana plasmatica y itoplasma, El citosol es lz parte de ctoplasma que permanece en el sobrenadante después de una cenifugacién del extracto celular a 150.000 g durante 1 hora dogradativas; eoenzimas, compuestos esenciales en muchas reaceiones catalizadas enzimdticamente; iones inorgénicos; v ribosomas, pequetias particulas compuestas por proteinas ¥ RNA en las que tiene lugar la sintesis de proteinas. ‘Todlas las eélulas tienen, al menos durante una parte de st ciclo vital, un meicleo 0 un mueleoide, en el que se almacena y replica el genoma (el conjunto de genes, compuestos de DNA), El nucleoide bacteriano no se encuentra separado del cito. plasma por una membrana, pero en los organismos superiores el nécleo contiene el material nuclear que se halla englobado enel interior de una membrana doble, Ia envoltura nuclear. Las células que poseen envoltura nuclear se denominan ewea- rlotas (del griego eu, “verdadero”, y karyon, “niicleo”); las ‘que no poseen envoltura nuclear —Ias células bacterianas- se enominan procariotas (del griesio pro, “antes”).4 Capitulo 1 Fundamentes de bioquimica Las dimensiones celulares estén limitadas Por la capacidad de difusién del oxigeno La mayor parte de células son de tamafto microscéplco. Fl di ‘metro tipico de las células animales y vegetales es de unos 5 a 100 pm, y muchas bacterias tienen una longitu de tan sélo 1 ‘a2 jm (véase la contracubierta posterior para encontrar in- ormacién sobre las unidades y sus abreviaturas). 2Qué es lo que limita las dimensiones de uta cla? E] himive inferior vie ne probablemente mareado por el ntimero minima de cada tuna de las diferentes biomoléculas mecesarias, Las céhulas ‘completas més pequelas, los micoplasmas, tienen un dismetro de 300 nin y un volumen de aproximadamente 10°" ral. Un solo ribosoma bacteriano tiene una longitud de aproximada- ‘mente 20 nm en su dimension més alargacta, de modo que un [Pequeno niimero de ribosomas ocupan ya una fracciGn signifi caliva del volumen de una célula de micoplasma. [Elimite superior del amatio celular viene mareada por la velocidad de difusion de las moléculas disueltas en sistemas acuosos, Por ejemplo, una eélula bacteriana que depende de reacciones que consumen oxigeno para la produceion de si cenergia debe obtener el oxigeno molecular del medio en el que se enctientra mediante difusin a través de su membrana plas matica. La célula es tan pequeita y a relacién entre el drea de su superficie y su volumen tan grande, que el Oy aleanza con facilidad todas las partes de su citoplasma por difsién. Sin embargo, al aumentar el tarailo de la eélula, descionde la re- Jacién superficie/volumen hasta legar al punto en que st me Bubacterias ie Belcan Lee eed Bacterins parpura positivas del azutte Cinnobacterias Flavobacterias ‘Thermotoga, tabolismo consume Oy a uma velocidad superior a a del sun nistro mediante difusi6n, En esta situacién, el metabelisma ‘que requiere Oz se hara imposible cuando el tamaiio celular ‘rezea por encima de un determinado punto, que representard 1 te6rico litite superior del tamatio de la e@tula Los seres vivos se clasifican en tres dominios ‘Todos los organismos vivos pertenecen a uno de los tres gran. {des grupos (reinos o domainios) que representan las tes ramias de la evolucién a partir de un progenitor comin (Fig. 1-4) Desde un punto de vista bioquitnico se puede distinguir entre dos grandes grupos de procariotas: las arquebacterias (del tsrlego archo, “origen’) y kis eubacterias (cel griego eu, “ver~ dadero"). Las eubacterias habitan en el suelo, en las aguas superficiales y en los tejdos de otros organismas vivos 0 en descomposicion, La mayor parte de las bacterias mejor esti diadas, incluyendo a Escherichia coli, son eubacterias. Las. arquebacterias se han descubierto mis recientvemente y estiin mucho menos caracterizadas bioquimicamente. La mayor parte de ellas habitan en medios muy extremos. Las pruebas de que se dispone sugieren que las arquebacterias y las euba teriasdivergieron pronto ¥ constituyen dos dominios distintos, Mamadtos también Archaea y Bacteria, Todos los organismos ceucariéticos, que constituyen el tercer dominio, Euearya, evo- lucionaron a partir de la tisma rama que dio origen a los AY- chaea; las arquebacterias estén, por tanto, ms esirechamente relacionadas con los eutcariotas que con las eubacterias FIGURA 1-4 Flogenia de los tres dominios de lava. Las relacionesflogenéticas se iustran a menudo mediante un “rbot genealigico” de ete tipo, La rlacién evolurva entre dos organisms seré tanto ms estrecha cuanto menores sean los punts de ramificacién entre lls,1.1 Fundamentos celulares 5 ‘Todos los organismos Fotétrofos Quimistrofos (cnorgia proveniente {energia proveniente de fe laius) ‘compuestoa quimicos) Autétrofos Heterstrofos Heterétrofos (carbone ‘carbono (carbono proveniente de provenieate provenivate de ‘ompuestos orgnicos) ‘de COs) compuestos orgiicas) Bjemplos: -Kjemplos:

You might also like

• The Subtle Art of Not Giving a F*ck: A Counterintuitive Approach to Living a Good Life

  

  From Everand

  The Subtle Art of Not Giving a F*ck: A Counterintuitive Approach to Living a Good Life

  Mark Manson

  Rating: 4 out of 5 stars

  4/5 (5807)
• The Gifts of Imperfection: Let Go of Who You Think You're Supposed to Be and Embrace Who You Are

  

  From Everand

  The Gifts of Imperfection: Let Go of Who You Think You're Supposed to Be and Embrace Who You Are

  Brene Brown

  Rating: 4 out of 5 stars

  4/5 (1091)
• Never Split the Difference: Negotiating As If Your Life Depended On It

  

  From Everand

  Never Split the Difference: Negotiating As If Your Life Depended On It

  Chris Voss

  Rating: 4.5 out of 5 stars

  4.5/5 (842)
• • Magazines
  • Podcasts
  • Sheet music
• Principles: Life and Work

  

  From Everand

  Principles: Life and Work

  Ray Dalio

  Rating: 4 out of 5 stars

  4/5 (599)
• The Glass Castle: A Memoir

  

  From Everand

  The Glass Castle: A Memoir

  Jeannette Walls

  Rating: 4.5 out of 5 stars

  4.5/5 (1716)
• Grit: The Power of Passion and Perseverance

  

  From Everand

  Grit: The Power of Passion and Perseverance

  Angela Duckworth

  Rating: 4 out of 5 stars

  4/5 (590)
• Sing, Unburied, Sing: A Novel

  

  From Everand

  Sing, Unburied, Sing: A Novel

  Jesmyn Ward

  Rating: 4 out of 5 stars

  4/5 (1104)
• Hidden Figures: The American Dream and the Untold Story of the Black Women Mathematicians Who Helped Win the Space Race

  

  From Everand

  Hidden Figures: The American Dream and the Untold Story of the Black Women Mathematicians Who Helped Win the Space Race

  Margot Lee Shetterly

  Rating: 4 out of 5 stars

  4/5 (897)
• Shoe Dog: A Memoir by the Creator of Nike

  

  From Everand

  Shoe Dog: A Memoir by the Creator of Nike

  Phil Knight

  Rating: 4.5 out of 5 stars

  4.5/5 (537)
• The Perks of Being a Wallflower

  

  From Everand

  The Perks of Being a Wallflower

  Stephen Chbosky

  Rating: 4.5 out of 5 stars

  4.5/5 (2104)
• The Hard Thing About Hard Things: Building a Business When There Are No Easy Answers

  

  From Everand

  The Hard Thing About Hard Things: Building a Business When There Are No Easy Answers

  Ben Horowitz

  Rating: 4.5 out of 5 stars

  4.5/5 (345)
• Elon Musk: Tesla, SpaceX, and the Quest for a Fantastic Future

  

  From Everand

  Elon Musk: Tesla, SpaceX, and the Quest for a Fantastic Future

  Ashlee Vance

  Rating: 4.5 out of 5 stars

  4.5/5 (474)
• Bad Feminist: Essays

  

  From Everand

  Bad Feminist: Essays

  Roxane Gay

  Rating: 4 out of 5 stars

  4/5 (1016)
• The Outsider: A Novel

  

  From Everand

  The Outsider: A Novel

  Stephen King

  Rating: 4 out of 5 stars

  4/5 (1850)
• Her Body and Other Parties: Stories

  

  From Everand

  Her Body and Other Parties: Stories

  Carmen Maria Machado

  Rating: 4 out of 5 stars

  4/5 (821)
• The Emperor of All Maladies: A Biography of Cancer

  

  From Everand

  The Emperor of All Maladies: A Biography of Cancer

  Siddhartha Mukherjee

  Rating: 4.5 out of 5 stars

  4.5/5 (271)
• The Sympathizer: A Novel (Pulitzer Prize for Fiction)

  

  From Everand

  The Sympathizer: A Novel (Pulitzer Prize for Fiction)

  Viet Thanh Nguyen

  Rating: 4.5 out of 5 stars

  4.5/5 (122)
• Angela's Ashes: A Memoir

  

  From Everand

  Angela's Ashes: A Memoir

  Frank McCourt

  Rating: 4.5 out of 5 stars

  4.5/5 (440)
• Brooklyn: A Novel

  

  From Everand

  Brooklyn: A Novel

  Colm Toibin

  Rating: 3.5 out of 5 stars

  3.5/5 (1946)
• The Little Book of Hygge: Danish Secrets to Happy Living

  

  From Everand

  The Little Book of Hygge: Danish Secrets to Happy Living

  Meik Wiking

  Rating: 3.5 out of 5 stars

  3.5/5 (401)
• The World Is Flat 3.0: A Brief History of the Twenty-first Century

  

  From Everand

  The World Is Flat 3.0: A Brief History of the Twenty-first Century

  Thomas L. Friedman

  Rating: 3.5 out of 5 stars

  3.5/5 (2259)
• A Man Called Ove: A Novel

  

  From Everand

  A Man Called Ove: A Novel

  Fredrik Backman

  Rating: 4.5 out of 5 stars

  4.5/5 (4610)
• The Art of Racing in the Rain: A Novel

  

  From Everand

  The Art of Racing in the Rain: A Novel

  Garth Stein

  Rating: 4 out of 5 stars

  4/5 (4203)
• A Tree Grows in Brooklyn

  

  From Everand

  A Tree Grows in Brooklyn

  Betty Smith

  Rating: 4.5 out of 5 stars

  4.5/5 (1929)
• Steve Jobs

  

  From Everand

  Steve Jobs

  Walter Isaacson

  Rating: 4.5 out of 5 stars

  4.5/5 (806)
• The Yellow House: A Memoir (2019 National Book Award Winner)

  

  From Everand

  The Yellow House: A Memoir (2019 National Book Award Winner)

  Sarah M. Broom

  Rating: 4 out of 5 stars

  4/5 (98)
• Devil in the Grove: Thurgood Marshall, the Groveland Boys, and the Dawn of a New America

  

  From Everand

  Devil in the Grove: Thurgood Marshall, the Groveland Boys, and the Dawn of a New America

  Gilbert King

  Rating: 4.5 out of 5 stars

  4.5/5 (266)
• The Woman in Cabin 10

  

  From Everand

  The Woman in Cabin 10

  Ruth Ware

  Rating: 3.5 out of 5 stars

  3.5/5 (2520)
• Yes Please

  

  From Everand

  Yes Please

  Amy Poehler

  Rating: 4 out of 5 stars

  4/5 (1898)
• Team of Rivals: The Political Genius of Abraham Lincoln

  

  From Everand

  Team of Rivals: The Political Genius of Abraham Lincoln

  Doris Kearns Goodwin

  Rating: 4.5 out of 5 stars

  4.5/5 (234)
• A Heartbreaking Work Of Staggering Genius: A Memoir Based on a True Story

  

  From Everand

  A Heartbreaking Work Of Staggering Genius: A Memoir Based on a True Story

  Dave Eggers

  Rating: 3.5 out of 5 stars

  3.5/5 (231)
• Fear: Trump in the White House

  

  From Everand

  Fear: Trump in the White House

  Bob Woodward

  Rating: 3.5 out of 5 stars

  3.5/5 (738)
• Wolf Hall: A Novel

  

  From Everand

  Wolf Hall: A Novel

  Hilary Mantel

  Rating: 4 out of 5 stars

  4/5 (3811)
• John Adams

  

  From Everand

  John Adams

  David McCullough

  Rating: 4.5 out of 5 stars

  4.5/5 (2409)
• On Fire: The (Burning) Case for a Green New Deal

  

  From Everand

  On Fire: The (Burning) Case for a Green New Deal

  Naomi Klein

  Rating: 4 out of 5 stars

  4/5 (74)
• The Light Between Oceans: A Novel

  

  From Everand

  The Light Between Oceans: A Novel

  M.L. Stedman

  Rating: 4.5 out of 5 stars

  4.5/5 (789)
• The Unwinding: An Inner History of the New America

  

  From Everand

  The Unwinding: An Inner History of the New America

  George Packer

  Rating: 4 out of 5 stars

  4/5 (45)
• Manhattan Beach: A Novel

  

  From Everand

  Manhattan Beach: A Novel

  Jennifer Egan

  Rating: 3.5 out of 5 stars

  3.5/5 (792)
• The Constant Gardener: A Novel

  

  From Everand

  The Constant Gardener: A Novel

  John le Carré

  Rating: 3.5 out of 5 stars

  3.5/5 (104)
• Rise of ISIS: A Threat We Can't Ignore

  

  From Everand

  Rise of ISIS: A Threat We Can't Ignore

  Jay Sekulow

  Rating: 3.5 out of 5 stars

  3.5/5 (137)
• Little Women

  

  From Everand

  Little Women

  Louisa May Alcott

  Rating: 4 out of 5 stars

  4/5 (104)
• ITA - AesysLocator User Manual

  

  Document6 pages

  ITA - AesysLocator User Manual

  Javier Salvo

  No ratings yet
• Clase 02 - BM - Tipos de Células, Teoría Celular y Método Científico.

  

  Document44 pages

  Clase 02 - BM - Tipos de Células, Teoría Celular y Método Científico.

  Javier Salvo

  No ratings yet
• Clase 03 - BM - Organelos Celulares y Su Función en El Metabolismo.

  

  Document43 pages

  Clase 03 - BM - Organelos Celulares y Su Función en El Metabolismo.

  Javier Salvo

  No ratings yet
• Libro - Manual de Crecimiento y Neurodesarrollo

  

  Document177 pages

  Libro - Manual de Crecimiento y Neurodesarrollo

  Javier Salvo

  100% (2)
• Historia de La Pedagogía

  

  Document125 pages

  Historia de La Pedagogía

  Javier Salvo

  No ratings yet