MANUEL QUALITE
DE
TRANSITION
Révision 7
Janvier 2019
[N° SIRET: 130008 $84 00018
‘VetAgio Sup - Campus vtésinaie de Lyon
[Bureau Alle 3 nivea 1
Locaux desis: Bitiment Galtier
I, avenue Bourglat
69280 MARCY LETOILE
98788725 51
Site inte: hap www vetagro-sup ervce/platefomestechnolopiquesaboratire-national-de-reference-Iman!MQ
] Laboratoire aetces
Microorganismes
Alienentaires MANUEL QUALITE DE TRANSITION Newson 7
veiagosp Pathogénes
Campus vétérinaire de Lyon Page 2/30
| Manuel Qualité
Date d’application :
3A Janier 2olF
Redigé par Revu par Approuvé par
nom = V. MARICAU-FLOTTES nom: C, MAZUY-CRUCHAUDET — |nom: D. SERGENTET-THEVENOT
date: BA. 04. AG date: 31 foi Jag date: Bi jouls
‘Ce document eta propriété excused LMAPILNR STEC.
‘Se.ditusion cu sa reprosuctn, parle ou toll, nas de renvepi, et ined sans aurea da aeston.MQ
Q Laboratoire arses
Microorganismes
Alimentnires MANUEL QUALITE DE TRANSITION Version?
verges Pathogénes
Campus vétérinaire de Lyon | Page 3/32
SOMMAIRE
MODIFICATIONS DU MANUEL QUALITESPAR. RAPPORT 'A' 1.A:\ VERSION
PRECEDENTE, c ueranet
GESTION DU MANUEL QUALITI
PRESENTATION DU LMAP/LNR
1. EXIGENCES GENERALES...
1.1, IMPARTIALITE,
1.2, CONFIDENTIALIT!
EXIGENCES STRUCTURELLES
3. EXIGENCES RELATIVES AUX RESSOURCES.
3.1 PERSONNEL...
3.2. INSTALLATIONS ET CONDITIONS AMBIANTE!
3.3, EQUIPEMENTS
3.4, TRACABILITE METROLOGIQUE..
FSo 6 aun
4
5
17
18,
3.5. PRODUITS ET SERVICES FOURNI 18
4, EXIGENCES RELATIVES AUX PROCESSUS. 19
4.1 REVUE DES DEMANDES, APPELS D'OFFRES ET CONTRATS, al
4.2. SELECTION, VERIFICATION ET VALIDATION DES METHODE! 20
4.3, ECHANTILLONNAGE. 21
4.4, MANUTENTION DES OBJETS D'ESSAIS OU D’ETALONNAGE.. 21
4.5. ENREGISTREMENTS TECHNIQUES. 22
4,6. EVALUATION DE L"INCERTITUDE DE MESURE 22
4.7. ASSURER LA VALIDITE DES RESULTATS. 23
4.8. RAPPORTS SUR LES RESULTA1 23
4.9. RECLAMATIONS. 24
4.10. TRAVAUX NON-CONFORMES, 24
4.11, MAITRISE DES DONNEES ET GESTION DE L'INFORMATION.. 24
5, EXIGENCES RELATIVES AU SYSTEME DE MANAGEMENT. 26
5.1, OPTIONS... 26
5.2. DOCUMENTATION DU SYSTEME 27
533. MAITRISE DE LA DOCUMENTATION DU SYSTEME DE MANAGEMENT... 29
5.4. MAITRISE DES ENREGISTREMENTS 30
30
30
31
31
32
5.5. ACTIONS A METTRE EN OEUVRE FACE AUX RISQUES ET OPPORTUNITES
. AMELIORATION
.7. ACTIONS CORRECTIVE!
. AUDITS INTERNES,
). REVUE DE DIRECTI‘ Laboratoire d’études MQ
‘Microorganismes ,
‘Alimentaires MANUEL QUALITE DE TRANSITION Yersion:7
veges Pathogenes
Campus vétérinaire de Lyon Page 4/32
MODIFICATIONS DU MANUEL QUALITE PAR RAPPORT A LA
VERSION PRECEDENTE
Page Chapitre et Intitulé Résumé de la modification
| Integration des exigences de la version 2017 de
la norme NF EN ISO 17025
‘Modification compléte de la structure du Manuel
QualitéMicroorganismes A
see MANUEL QUALITE DE TRANSITION Version 7
wages Pathogénes
Campus vétérinaire de Lyon Page 5/32
g Laboratoire tudes me
Ce manuel qualité décrit les conditions d’organisation, de fonctionnement et les moyens mis en
ceuvre par le Laboratoire d”études des Microorganismes Alimentaires Pathogénes pour gérer et
garantir la qualité de ses prestations et ainsi d’assurer la satisfaction de ses clients,
Ce manuel permet de répondre aux exigences des clients, de la réglementation et des normes
qualité ou techniques applicables, Ce manuel contient la déclaration de politique qualité.
Les chapitres de ce manuel sont structurés pour répondre aux exigences de la norme NF EN
ISO / CEI 17025 version 2017.
GESTION DU MANUEL QUALITE
La gestion de ce manuel qualité est définie dans la procédure « DOC.P.01 : Gestion des
documents internes »
IDENTIFICATION DU MANUEL QUALITE,
Le manuel qualité est identifié par un code et un numéro de version.
REVISION DU MANUEL QUALITE,
Tous les membres du laboratoire peuvent demander la révision du manuel qualité. Les
demandes de modifications sont prises en compte par le responsable qualité. Aprés étude des
demandes, et si nécessaire, le responsable qualité modifie le manuel. Par défaut, le manuel
qualité est revu une fois par an,
(CLASSEMENT EY DIFFUSION DU MANUEL QUALITE
Un exemplaire papier est classé dans le bureau du responsable qualité,
Le manuel qualité est consultable sous format PDF sur le site intemet du LMAP ainsi que dans
la partie « Documentation interme » du Soft 1002.MQ
‘Microorganismes
S Laboratoire d'études
pats MANUEL QUALITE DE TRANSITION vara
vos Pathogénes
‘Campus vétérinaire de Lyon Page 6/32
PRESENTATION DU LMAP/LNR STEC
Le Laboratoire d’études des Microorganismes Alimentaires Pathogénes (LMAP) est un
laboratoire de I’ Institut d’enseignement supérieur de recherche en alimentation, santé animale,
sciences agronomiques et environnement (VetAgro Sup), situé sur le campus vétérinaire de
Lyon.
| VetAgro Sup est un établissement public national a caractére scientifique culturel et
professionnel. L*établissement est placé sous l’autorité du Ministére en charge de I'Agriculture
et en soutien du programme de la Direction Générale de I’Enseignement et de la Recherche (cf
«MQ.A02 :Organigramme du LMAP au sein de VetAgro Sup »).
Le LMAP est adossé a l’unité mixte de recherche Université de Lyon/CNRS/INRA/VetAgro
Sup 5557 « laboratoire d’Ecologie microbienne » et plus particuligrement & I’équipe BPOE
(Bactéries Pathogénes et Opportunistes de l'Environnement).
Le laboratoire développe des activités d’expertise et d’appui scientifique et technique auprés de
Ja Direction Générale de I’Alimentation (DGAl) notamment qui ont été reconnues dés 2007 et
officialisées par le Ministére en charge de I’Agriculture en 2010 (obtention du titre de
Laboratoire National de Référence -LNR- pour les Escherichia coli (y compris les E. coli
producteurs de Shigatoxines -STEC-)).
SES ACTIVITES.
Missions prévues par le code rural
Les missions des laboratoires nationaux de référence sont définies conformément au code rural
| et de la péche maritime partie législative et réglementaire (livres II Alimentation, santé
| publique, vétérinaire et protection des végétaux, notamment articles L. 202-2 et R. 202-2 AR
202-7).
| Le LMAP, en tant que laboratoire national de référence, est chargé, dans son domaine de
compétence :
| + Dudéveloppement, de l'optimisation et de la validation de méthodes danalyse et de la
| participation a leur normalisation ;
| + De animation technique du réseau des laboratoires agréés, notamment par
organisation réguliére d’Essais Inter Laboratoires d’ Aptitude (EILA) et de sessions
de formation pour les laboratoires officiels et désignés par la DGAL agréés pour la
recherche des STEC ou d°E: coli 0157 dans les aliments ;
- De la réalisation d'analyses officielles et notamment de la confirmation de résultats
analyses effectuées par les laboratoires agréés* ou reconnus ;
“Le LMAP 1a ainsi pas vocation d effectuer des analyses de premiére intention car il s‘appuie
notamment sur les laboratoires officiels et la proportion d'analyses réalisées dans la portée
daceréditation relevant des compétences du LNR est donc trés minoritaire.
D’assurer une veille scientifique ;
+ De répondre & toute demande dexpertise scientifique ou technique du ministére de
Vagriculture,Microorganismes
g Laboratoire d'études MO
Alimentaires MANUEL QUALITE DE TRANSITION Version 7
Vetgro sp Pathogénes
Campus vétérinaire de Lyon Page 7/32
+ Dapporter a Etat, aux laboratoires agréés et aux plates-formes mentionnées au II de
{ Tarticle L. 201-14, lappui scientifique et technique nécessaire a la collecte, au
traitement, a Vaccessibilité, 4 la transmission et a la diffusion des données
d'épidémiosurveillance. Le laboratoire peut également apporter son appui aux autres
gestionnaires de dispositifs de surveillance (ordonnance n°2015-1242 du 7 octobre
2015 - art. 1)
Une convention passée entre le Ministre chargé de l'agriculture et chaque laboratoire national
de référence précise les conditions de réalisation de ces missions ainsi que d'éventuelles
missions particuliéres pouvant lui étre confiées en fonction de son domaine de compétence.
Autres missions
Le LMAP peut confirmer les résultats des analyses d’autocontréles comme prévu par les
normes de référence.
Le LMAP en tant que LNR £. coli appartient au réseau de LNR curopéen animé par le
laboratoire de référence de l'Union Européenne (LR-UE). Il participe ainsi notamment aux
essais inter laboratoires organis¢s par le LR-UE et assure la diffusion d’informations recueillies
a T’échelon européen aux acteurs nationaux, notamment aux laboratoires officiels,
En 2015, le laboratoire est accrédité COFRAC selon la norme NF EN ISO/CEI 17025:2008
pour les analyses microbiologiques des produits et environnement agro-alimentaires pour une
période de quatre ans du 1* juin 2015 au 31 mai 2019 (annexe technique correspondante n°
1-902, extrait ci-dessous, portée complate disponible sur www.cofrac.fr)
ACCREDITATION
Le laboratoire demande la suppression de ’accréditation GenDise et Vidas et demande une
extension d’accréditation selon les méthodes internes LMAP/DGAL/Screening PCR STEC-
al.3 et LMAP/DGAL/confirmation isolement STEC-al.2.‘Microorganismes
g Laboratoire d'études MQ
en oan MANUEL QUALITE DE TRANSITION Version 7
Campus vétérinaire de Lyon Page 8/32
*AGROALIMENTAIRE / DIVERS ALIMENTS / Analyses microbiologiques
{ (Analyses microbiologiques des produits et environnement agro-alimentaires ~ LAB GTA 59)
‘ Caraetéristique ah Référence de la
Oni mesurée ou recherehée [Prineipe dela méthode méthode
Enrichissement
Détection des neon automatisée
+ Produits Seinen ieee ‘Amplification par PCR en
Toxines (STEC) et lense
+ Produits * des genes stx (saufstx2) et | LMAP/DGAL/Sereenin
Ce {étermination des :
laitiers = lait et eae (détection) g PCR STEC-al.3
fromages au lait |Se™08™UPes 0157, 026, | aes genes rfbEorss, wha
Bi a O15) lon,
cru 103, O111 et O145 des | cor, thplovs, w2tor
STEC hautement eae ig
pathogénes (Geroeraupes)
Méthode qualitative _
Concentration baetérienne par
méthode automatisée VIDAS.
ESPT et isolement sur gélose
| Extraction manuelle d’ADN
Isolement et Amplification par PCR en
Produits earnés : | confirmation des STEC | temps réel LMAP/DGAL/contirmat
Viande et des STEC hautement | -des genes stx (sauf'stx2) et | ion isolement STEC-al.2
| pathogénes eae
des génes rfbEoisr, whdlor,
| wexo2s, thplonss, Wexous
Méthode qualitative
j Concentration bactérienne par
| immuno- séparation
| magnétique (IMS) et
| isolement sur gélose)
i Extraction manuelle d’ADN
Isolement et
confirmation des STEC | temps réel : LMAP/DGAL/confirmat
| Lait et fromages [et des STEC hautement | ~