Professional Documents
Culture Documents
Praktikum Iz Biokemije - Nove Skripte
Praktikum Iz Biokemije - Nove Skripte
Zavod za kemiju
Priredio:
U višim biljkama nalazimo dvije glavne grupe pigmenata: klorofile a i b, koji daju biljci karakterističnu
zelenu boju, te žute ili narančaste pigmente karotenoide. Klorofil a je glavni pigment koji apsorbira svjetlo u
kloroplastima zelenih biljaka. Po svojoj građi klorofili su porfirinski kompleksi magnezija s dugim postranim
lancem alkohola fitola. U većini viših biljaka klorofil a i klorofil b se nalaze u omjeru 3:1. Klorofili se
međusobno razlikuju po supstituentu na pirolnom prstenu 2. Klorofil a ima u tom položaju metilnu skupinu,
a klorofil b aldehidnu skupinu. Apsorpcijski spektri klorofila se prema tome razlikuju. Klorofil a pokazuje
jaku apsorpciju u crvenom i plavoljubičastom dijelu spektra, dok su apsorpcijski maksimumi klorofila b u
oba slučaja pomaknuti prema centru spektra.
Karotenoidi su duge poliizoprenoidne molekule, koje na krajevima lanaca imaju nezasićene, supstituirane
cikloheksenske prstenove. Razlikujemo karotene koji u svojoj strukturi ne sadrže kisik i njima strukturno
slične ksantofile koji ga sadrže. Karotenoidi se ubrajaju u tzv. pomoćne pigmente budući da apsorbiranu
energiju mogu prenijeti na klorofil. Karotenoidi apsorbiraju u dijelu spektra u kojem klorofili nisu
djelotvorni i na taj način proširuju spektar djelovanja fotosintetskog aparata.
Postupak:
Odvagne se 0,1- 0,5 g svježeg lišća (npr. peršina) i prenese u tarionik. Lišće se zatim homogenizira u
tarioniku uz dodatak nešto čistog kvarcnog pijeska i 3-4 mL acetona. Dobiveni ekstrakt filtrira se kroz
stakleni filtar u vakuumu. Ekstrakt se ispire nekoliko puta s malim količinama acetona sve dok se posljednja
količina filtrata ne obezboji. Filtrat se prenese u odmjernu tikvicu od 25 mL i nadopuni acetonom. Optička
gustoća (A) filtrata mjeri se na spektrofotometru pri 662, 645 i 470 nm.
/nm A
662
645
470
Kemikalije i pribor:
uzorak lišća
kvarcni pijesak
aceton
satno staklo
tarionik
menzura 10 mL 2
špatula
Slika 1. Apsorpcijski spektri klorofila a i b
3
2. Vježba
Za vrijeme klijanja, zrna pšenice (kao i zrna drugih žitarica) sintetiziraju amilazu. Amilaza djeluje na
pohranjeni škrob, pri čemu nastaje šećer potreban za razvoj embrija.
Pri mjerenju aktivnosti enzima mjeri se promjena koncentracije supstrata ili pak promjena koncentracije
produkta. U ovoj vježbi studenti prate vremenski tijek reakcije razgradnje škroba djelovanjem amilaze, te
ovisnost enzimske aktivnosti o pH i temperaturi.
Menzurom dodati 7 mL 1 mol/dm 3 HCl u epruvetu t = 0 i u kontrolnu epruvetu. U preostale epruvete dodati
po 1 mL enzima i zabilježiti vrijeme početka reakcije. Nakon naznačenog vremena zaustaviti reakciju
dodatkom još 7 mL 1 mol/dm 3 HCl i promućkati sadržaj epruvete. Zatim u svaku epruvetu dodati po 1 mL
otopine joda. Otopina joda oboji otopinu škroba u plavo.
Očitati apsorbanciju na spektrofotometru pri 580 nm. Kontrolu upotrijebiti za određivanje nultočke
instrumenta. Upisati dobivene vrijednosti u tablicu u bilježnici. Od dobivene vrijednosti odbiti apsorbanciju
kontrole.
t/min 0 0.5 1 2 3 4 5 10 K
V(škrob) 2 mL 2 ml
H2O
V(enzim) 1 mL 1 mL
V(HCl) 7 mL 7 mL 7 mL 7 mL 7 mL 7 mL 7 mL 7 mL 7 mL
nakon nakon nakon nakon nakon nakon nakon
komentar odmah odmah
0.5 min 1 min 2 min 3 min 4 min 5 min 10 min
V(indikator) 1 mL 1 mL
komentar na kraju na kraju
% = (Z/X) ∙100
Z=X-Y
4
Gdje X označuje količinu škroba na početku reakcije t = 0, a Y označuje količinu škroba u vremenu t. Prema
tome, Z predstavlja količinu hidroliziranog škroba u vremenu t.
Nacrtati ovisnost postotnog udjela hidroliziranog škroba (ordinata) o vremenu izraženom u minutama
(apscisa).
pH vrijednosti, pH = 3, 4, 5, 6 i 7
Dodati 2 mL otopine škroba u puferu odgovarajućeg pH u epruvete. Pustiti odvijanje reakcija onoliko
vremena koliko je potrebno za hidrolizu oko 75 % škroba (potrebno vrijeme očitati iz grafa dobivenog u
prethodnom pokusu) ili 50% ukoliko je reakcija spora. Dodati 1 mL otopine enzima u svaku epruvetu, te
zabilježiti vrijeme početka reakcije za svaku epruvetu. Po isteku vremena dodati 7 mL 1 mol/dm 3 HCl i
protresti sadržaj epruvete. Potom, u svaku epruvetu dodati po 1 mL otopine joda. Očitati apsorbanciju na
spektrofotometru pri 580 nm. Upisati dobivene vrijednosti u tablicu u bilježnici. Od dobivene vrijednosti
odbiti apsorbanciju kontrole.
pH 3 4 5 6 7 K
V(škrob) 2 mL 2 ml
H2O
V(enzim) 1 mL 1 mL
V(HCl) 7 mL 7 mL 7 mL 7 mL 7 mL 7 mL
komentar istovremeno odmah
V(indikator) 1 mL 1 mL
komentar na kraju na kraju
Izračunati postotni udio hidroliziranog škroba i nacrtati ovisnost postotnog udjela hidroliziranog škroba o
pH.
5
Slika 3. Graf ovisnosti udjela hidroliziranog škroba o pH vrijednosti medija
Reagensi:
Citratni pufer (limunska kiselina i natrijev citrat (10 mmol/dm 3), pH 5, ohlađen).
1 mol/dm3 HCl
Otopina joda: 5 g KI, 0,36 g KIO3 u 1 dm3 2 mmol/dm3 NaOH
0,05 % otopina škroba u 0,05 mol/dm3 citratnog pufera kod pH 3, 4, 5, 6, 7
Prirediti 500 mL 10 mmol/dm3 natrijevog citrata (1,47 g/500 mL) i 250 mL 10 mmol/dm 3 limunske kiseline
(0,53 g/250 mL). Držati u hladnjaku.
Pomiješati 325 mL 10 mmol/dm3 natrijevog citrata i 175 mL 10 mmol/dm 3 limunske kiseline. Dobiva se 500
mL pufera pH 5. Potrebno je provjeriti pH!
6
Pufere prirediti prema sljedećoj tablici:
Dodati 50 mL štok otopine škroba u 450 mL pufera pH 5, čime se dobiva 500 mL gotove otopine.
7
3. Vježba
Hillova reakcija
Kada se izolirani kloroplasti osvijetle u prisutnosti odgovarajućeg oksidacijskog sredstva dolazi do razvijanja
kisika uz istovremenu redukciju dodanog akceptora elektrona. Ova reakcija, nazvana prema njenom
pronalazaču engleskom znanstveniku Robertu Hillu, može se prikazati sljedećom općom jednadžbom:
2H2O + 2A 2AH2 + O2
U ovoj reakciji voda je donor elektrona, a kao akceptor (Hillov reagens) može poslužiti 2,6-
diklorfenolindofenol (DCPIP), spoj plave boje u oksidiranom, a bezbojan u reduciranom obliku. U slučaju
DCPIP-a reakcija glasi:
Odvagne se 20 g ispranog svježeg lišća špinata s kojeg se prethodno uklone peteljke i oštećeni dijelovi. Lišće
se posuši filter papirom te usitni. Usitnjeni biljni materijal prenese se u mikser, koji sadrži 40 mL hladnog
izolacijskog medija (0,4 mol/dm3 saharoze, 0,3 mol/dm3 NaCl i 0,02 mol/dm3 tris pufera pH = 7,5). Smjesa
se homogenizira 15 sekundi pri maksimalnoj brzini miksera. Nakon što se ukloni biljni materijal sa stjenki
miksera, smjesa se ponovno homogenizira 10 sekundi. Homogenizirana smjesa se profiltrira kroz 4 sloja
gaze, a filtrat se skuplja u prethodno ohlađenu kivetu za centrifugiranje.
8
Filtrat se centrifugira 1 minutu kod 1400 RPM. Supernatant se dekantira u čistu ohlađenu kivetu i ponovno
centrifugira 5 minuta pri 3500 RPM (slike). Supernatant se ovoga puta odbaci, a talog se suspendira u 10 mL
hladnog izolacijskog medija pomoću staklenog štapića. Suspenzija kloroplasta se čuva na ledu. Pripravi se
otopina za mjerenje razrjeđenjem 1 mL suspenzije kloroplasta u 10 mL izolacijskog medija.
Hillova reakcija
Da bi odredili učinak koncentracije klorofila i intenziteta svjetla na brzinu redukcije DCPIP-a, u epruvete se
dodaju sljedeće inkubacijske smjese:
Izolacijski Suspenzija
Epruveta de-H2O / mL DCPIP / mL
medij / mL kloroplasta* / mL
0 3,5 1 0,5 -
1 3,5 0,5 0,5 0,5
2 3,5 0,5 0,5 0,5
*Dodaje se neposredno prije mjerenja
Epruveta 0 služi kao "slijepa" proba prema kojoj se mjeri optička gustoća uzoraka 1 i 2, ali i kao dokaz da se
boja DCPIP-a ne gubi stajanjem ili nekim drugim procesom.
Epruveta 1 služi kao neosvijetljena kontrola i omotana je s dva sloja aluminijske folije.
Smjese je potrebno dodavati redoslijedom navedenim u tablici, a nakon dodavanja prethodno izmješane
suspenzije kloroplasta epruvete je potrebno vorteksirati 5-10 sekundi i zapisati vrijeme. Odmah zatim uzorak
se prelije u kivetu i mjeri se apsorbancija uzoraka, a potom se uzorci osvjetljavaju tijekom 15 minuta.
Mjerenje se pritom ponavlja svake 3 minute. Smanjenje mjerene apsorbancije pokazuje smanjenje
koncentracije DCPIP-a, odnosno napredovanje reakcije.
= 600 nm
Epruveta 0 min 3 min 6 min 9 min
0
1
2
9
Slika 5. Lijevo: Epruvete broj 1 i 2 nakon provedene Hillove reakcije. Desno: S epruvete broj 1
uklonjena zaštitna folija. Uočiti boju reakcijske smjese u lijevoj epruveti.
Kemikalije i pribor:
epruvete,
pipete,
mikser,
izvor svjetlosti,
odmjerne tikvice, 25 mL,
centrifuga,
kivete za cetrifugiranje,
vaga,
spektrofotometar s kivetama od 1 cm
10
4. Vježba
Analiza vitamina C
Vitamin C ili askorbinska kiselina je vitamin topljiv u vodi. Važan je antioksidans, sudjeluje u metabolizmu
masnih kiselina, sintezi kolagena i karnitina. Izuzetno je nestabilan te gubi aktivnost kuhanjem ili
skladištenjem. Glavni izvor vitamina C su biljke, naročito šipak, crvena paprika, svježi špinat, svježi i kiseli
kupus, limun, naranče i jabuke. Dnevna količina potrebna organizmu je oko 60 mg.
Redoks titracija s otopinom kalijevog jodida jedan je od načina određivanja koncentracije vitamina C.
Kako je jod relativno netopljiv u vodi, to se u otopinu mora dodati kalijev jodid. Na ovaj način nastaje
kalijev trijodid (KI3), čime se bitno povećava topljivost joda.
Trijodid oksidira vitamin C do dehidroaskorbinske kiseline:
Postupak:
11
Na isti se način provodi i titracija uzorka.
Kako je vitamin C nestabilan, to se titracija mora provoditi sa svježe pripremljenim otopinama vitamina C,
koje je potrebno čuvati na tamnom mjestu.
Račun:
U 25 mL standardne otopine vitamina C koncentracije 0,5 mg/mL, masa vitamina C je ms = 12,5 mg.
Iz podatka o volumenu utrošene otopine jodida prilikom titracije standardne otopine vitamina (Vs) možemo
izračunati volumen jodida potreban za titraciju 1 mg vitamina C, V (1 mg, vit. C):
12.5 Vs
V otop . jodida za standard =V = mg/mL V (1 mg, vit. C) =
Vs ms
Prema tome, iz volumena utrošenog jodida za titraciju uzorka (Vu) lako se računa masa vitamina C (mu) u
uzorku:
12.5
m u= =4 V u mg /100 mL mu = V (1 mg, vit. C) ∙ Vu
Vs
Zadatak je odrediti masu vitamina C u 100 mL uzorka i usporediti dobivenu količinu s deklariranom
količinom vitamina C u proizvodu.
Slika 6. Erlenmeyerova tikvica s uzorkom vitamina C u točki završetka titracije; uočiti boju
12
Reagensi:
Otopina škroba:
0,50 g škroba otopiti u 50 mL zagrijane vode.
Otopina jodida:
5 g kalijevog jodida (KI) i 0,268 g kalijevog jodata (KIO 3) otopiti u 200 mL destilirane vode. Dodati
12 mL konc. sumporne kiseline i dopuniti vodom do oznake volumena 500 mL.
13