UNIVERSIDAD PRIVADA ANTENOR ORRGO

FACULTAD DE MEDICINA HUMANA

ESCUELA PROFESIONAL DE MEDICINA HUMANA
CURSO: GENÉTICA Y EMBERIOLIOGÍA

SEMANA 12

PRÁCTICA
INTERPRETACIÓN DE RESULTADOS DE PRUEBAS MOLECULARES DE
FILIACIÓN GENÉTICA:

POLIMORFISMOS DE SECUENCIAS CORTAS REPETIDAS EN TÁNDEM (STR)

EN PRUEBA DE PATERNIDAD
I. INTRODUCCIÓN
Una prueba paternidad es un estudio genético que tiene como objetivo determinar el
vínculo genético ascendente en primer grado entre un individuo y su genitor masculino, o
su genitor femenino en el caso de existir duda de la paternidad por diferentes situaciones.
Las investigaciones de ADN permitieron usar los marcadores genéticos en la secuencia
de nucleótidos del ADN genómico. En 1985, se descubrieron los minisatélites formados
por secuencias de nucleótidos que se repiten en número variable de veces y, gracias a los
multilocus y a la técnica de Southern blots, en 1993 se llegó a estudios genéticos del ADN
que permiten saber quién es el padre genético con una certeza de 0,99998 (del 99,998%).

Más tarde, se descubrieron marcadores (polimorfismos) más específicos de secuencia del

ADN que permitieron una certeza del 99,9999% para saber quién es el padre genético,
siempre y cuando se tenga una muestra genética del posible padre y del supuesto hijo o
hija.
Los marcadores que más se utilizan son las llamadas "huellas digitales" del ácido
desoxirribonucleico, que son polimorfismos (variaciones) que se heredan en las longitudes
del ADN repetitivo (secuencias cortas repetidas en tándem, en ingles STR = Short Tándem
Repeat). La nomenclatura utilizada para la asignación de los alelos para los
diferentes STR está regulada por un comité de nomenclatura de la Sociedad Internacional
de Genética Forense. Todos los resultados de ADN para paternidad o maternidad que se
realicen siguiendo estas consideraciones científicas deben ser iguales en cualquier parte
del mundo.
La prueba de análisis de ADN tiene alta confiabilidad, pero carece de certeza. La
probabilidad de certeza se relaciona con la probabilidad estadística de que dos personas
tengan las mismas huellas de ADN, como sucede, por ejemplo, en el caso de los gemelos.
La seguridad depende de cuántos marcadores (polimorfismos) se comparen, y eso varía
según el caso y lo que se quiere buscar o demostrar. También depende de qué tan
comunes sean esos mismos marcadores (polimorfismos) en la población estudiada. No
existe una certeza del 100%, y por eso se considera una probabilidad del 99%. 4
Cuando no se cuenta con muestras del presunto padre, se puede obtener un índice de
paternidad utilizando muestras de los padres paternos. También es posible obtener

1
 muestras de prenatales mediante el procedimiento de amniocentesis y el de
las vellosidades coriónicas.

II. COMPETENCIA DE LOGRO

1. Explica en qué consiste las pruebas de polimorfismos de secuencias cortas repetidas en
tándem (STR).
2. Fundamenta la prueba de polimorfismos de secuencias cortas repetidas en tándem
(STR).
3. Explica la aplicación de la prueba de polimorfismos de secuencias cortas repetidas en
tándem en la filiación genética.
4. Interpreta resultados de pruebas de filiación genética basadas en polimorfismos de
secuencias cortas repetidas en tándem.

III. GENERALIDADES
PRUEBADE PATERNIDAD
Factores a tener en cuenta en una prueba de paternidad:
La mayoría de procedimiento médicos no afectarán los resultados de una prueba de
paternidad, sin embargo, los siguientes escenarios pueden tener un efecto en los
resultados:
- Un participante que ha recibido recientemente una transfusión de sangre.
- Un participante que ha tenido un trasplante de médula ósea.
- Sí es posible no usar dichas muestras. En este caso se usa Muestras Especiales.
- No se puede realizar la prueba en muestras obtenidas de cepillos de dientes, vasos,
manchas de sangre, sudor, chicles, u otras fuentes.

Confiabilidad de la prueba
La prueba de paternidad es altamente confiable (99.9999%), siendo uno de los exámenes
más seguros y precisos que existe en la actualidad.
El valor exacto de confiabilidad depende del tipo de resultado:
Inclusión: Si un hombre es el padre biológico de un niño es determinado con un 99.9% =
99.99999% de seguridad.
Exclusión: Si un hombre no es el padre biológico de un niño es determinado con 100% de
seguridad.

Participantes en la prueba
Además del presunto padre y presunto hijo, es recomendable, pero no indispensable, que
participe la madre. En casos que no se cuenta con la presencia del presunto padre se puede
incluir familiares directos del presunto padre.

Obtención de la muestra
Generalmente se usa una muestra de saliva, ya que es muy fácil de obtener. Simplemente,
se enjuaga la boca, se espera 5 minutos y se frota un hisopo de algodón la parte interna
del carrillo de la boca para obtener la muestra.

2
 En casos especiales se puede usar muestra de cabello, en este caso se requiere una
muestra significativa (de 7 a 10 hebras de cabello) pero que debe de ser tomada desde la
raíz, es decir, arrancados. En la raíz del cabello se encuentra la información genética
heredada del padre. Un cabello cortado, sin raíz, solo posee un tipo de ADN, que se hereda
de madres a hijos, por lo que solo sería útil para realizar pruebas de maternidad o
parentesco biológico por vía materna lo cual es un examen poco frecuente.

¿Existe alguna diferencia en el resultado según el tipo de muestra?

No hay ninguna diferencia de veracidad entre muestras. Esto se debe a que todas las
células de una persona poseen exactamente el mismo ADN, por lo que la exactitud y
veracidad de los resultados es siempre la misma, independientemente de la muestra
utilizada, bien sea sangre, saliva u otro tipo de muestra.

Uña: Se necesitan 10 piezas de uñas. No usar lacas, esmaltes. Cabello: Se necesitan 7 a 10

hebras de cabello con el folículo (de raíz). El cabello cortado, es decir, sin raíz, no se podrá
analizar.

Selección de prueba de paternidad:

a) En proceso de gestación
Esta prueba no requiere preparación (ayuno u otras restricciones).
El paciente debe firmar un consentimiento informado, demostrar que cuenta con 10 o más
semanas de embarazo (ecografía, HCG, FUR). La toma de muestra se realiza al presunto
padre como a la mamá.

b) Después del nacimiento

b.1. Con disponibilidad de la madre, el hijo y el presunto padre para la obtención de las
muestras.
b.2. Con disponibilidad de presunto padre y el hijo.
b.3. Con disponibilidad de la madre, el hijo (no del presunto padre) y alternativamente
de los abuelos, tíos o hijos por parte del presunto padre.

Prueba de paternidad mediante marcadores tipo str

En pruebas de paternidad los marcadores del tipo STR (Short Tandem Repeat) son
utilizados por su gran poder discriminativo y por ayudar a identificar individuos
genéticamente.

Las secuencias STR utilizadas se componen de unidades que contienen cada una 4 a 5 pares
de bases nucleotídicas (por ejemplo, la secuencia tetramérica “gata” del locus D7S280
tiene 4 pares de base) y lo que varía es el número de veces que estas unidades se repiten
en cada individuo5.

Así por ejemplo en el cromosoma 7 está el locus polimórfico D7S280 que posee 13
variantes polimórficas. Una persona tendrá una de las 13 variantes en cada par
cromosómico; pudiendo ser entonces homocigota o heterocigota para el locus D7S280.

3
A continuación, se muestra la secuencia de un alelo (variante) representativo de este
locus. (Esta secuencia procede de GenBank, una base de datos de ADN pública). La
secuencia tetramérica repetida en D7S280 es "gata". Los alelos diferentes de este locus
tienen entre 6 y 15 repeticiones en tándem de la secuencia "gata".
¿Cuántas repeticiones hay en la secuencia mostrada a continuación? Observe que una de
las secuencias tetraméricas es “gaca”, en lugar de “gata”

1 aatttttgta ttttttttag agacggggtt tcaccatgtt ggtcaggctg

actatggagt
61 tattttaagg ttaatatata taaagggtat gatagaacac ttgtcatagt
ttagaacgaa
121 ctaacgatag atagatagat agatagatag atagatagat agatagatag
atagacagat
181 agatagtttt tttttatctc actaaatagt ctatagtaaa catttaatta
ccaatatttg
241 gtgcaattct gtcaatgagg ataaatgtgg aatcgttata attcttaaga
atatatattc
301 cctctgagtt tttgatacct cagattttaa ggcc

Herencia de los alelos polimórficos

Las variantes o alelos polimórficos carecen de interacciones intra-alélicas e inter-alelicas.
En la figura 1 se observa que se ha indicado a los padres y a su hijo las variantes
polimórficas (alelos) que poseen en cada miembro del par de cromosomas homólogos 7,
siendo tanto el padre (14/18) y la madre (15/17) heterocigotos; y que el hijo hereda de la
madre el alelo con 15 repeticiones, lo que implica que del padre recibió el alelo con 18
repeticiones (por tanto el hijo es heterocigoto 15/18); el alelo 18 que necesariamente se
hereda del padre dado que se conoce el alelo de la madre, se le llama alelo paterno
obligado.

El número de repeticiones de un determinado STR no es único de un individuo, es decir, el

número de repeticiones de un alelo heredado por el hijo a partir del padre biológico puede
coincidir por azar con uno de los alelos del supuesto padre, por lo que es necesario estudiar
varios STR conjuntamente para el estudio de paternidades. En la tabla 1 se muestra los loci

4
polimórficos, el cromosoma de ubicación, el rango de repeticiones y el número de alelos
observados para cada polimorfismo.

Índice de Paternidad (IP) y Probabilidad de Paternidad (W)

El índice de paternidad (IP), indica cuantas veces es más probable que el supuesto padre
(SP) sea el padre biológico (X), respecto a que no lo sea (Y), y suele describirse como:

IP = X/Y.

Haciendo algunas simplificaciones diremos que la interpretación de un caso de paternidad

consiste en contrastar dos hipótesis o posibilidades contrarias:

X: El supuesto padre (SP) es el padre biológico del hijo

Y: El supuesto padre (SP) NO es el padre biológico y por lo tanto es otro hombre
El IP se estima a partir de los alelos/genotipos de cada STR usado en una prueba de
paternidad; luego se obtiene un IP total multiplicando el IP de todos los STRs, es decir:

IP total= IPSTR-1 x IPSTR-2 x IPSTR-3 …etc.

Probabilidad de Paternidad (W)

Otra manera de interpretar el IP total es convirtiéndolo a probabilidad de paternidad,
ampliamente conocido como W, usando la siguiente fórmula:

W = IP/ (1+ IP)

5
 Descripción del cuadro 1:
 Columna 1: Marcador STR
Marcadores con polimorfismo tipo short tándem repeet (STR)
 Columna 2: Supuesto padre (SP)
Alelos del marcador STR que posee el supuesto padre (SP). Los alelos se designan por el
número de veces que se repite en tándem la secuencia nucleotídica característica del
marcador.
Ejemplo: 29/30 indica que el SP tiene en un cromosoma una variante del marcador o
polimorfismo STR (D21S11) con 29 repeticiones y, en el cromosoma homólogo una
variante del mismo marcador STR con 30 repeticiones; Por lo tanto, es heterocigoto.
11 indica que en ambos cromosomas homólogos el SP posee la misma variante polimórfica
(D7S820) con 11 repeticiones; por tanto, es homocigoto. La forma abreviada de escribir
11/11 es entonces 11 para el caso de homocigosis.
La misma interpretación se sigue para los datos de la columna 3: Hijo/a (H) y la columna
4: Madre (M)
 Columna 5: Similitud SP-H (frecuencia del alelo)
- Para el marcador D21S11 se observa que el hijo es homocigoto para la variante con 30
repeticiones eso quiere decir que de la madre heredo una de las variantes con 30
repeticiones y del padre biológico la otra variante con 30 repeticiones.
- Observando al SP (columna 2) este tiene un genotipo heterocigoto 29/30 por lo que se
deduce que sí pudo heredarle una variante 30 con una probabilidad de 1/2
- 0.2977 es la frecuencia (frec) en que se encuentra la variable 30 en la población
 Columna 7: Fórmula IP (X/Y) Aplicando la fórmula para IP se tendría ½ /(0.2977)
 Columna 8: Fórmula IP (X/Y) Misma fórmula anterior simplificada multiplicando x 2 a
ambos miembros 1/(0.5954)
 Columna 9: Índice de Paternidad (IP)
Índice de paternidad (IP)
IP = X/Y = 1/0.5954 = 1.6795

6
 El IP STR D21S11 de 1.6795 quiere decir que es 1.6795 veces más probable que el supuesto
padre sea el padre biológico respecto a que lo sea otro sujeto de la población elegido al
azar.

En cambio, para el STR D7S820 el IP alcanza 3.3146, decir que es 3.3147 veces más
probable que el supuesto padre sea el padre biológico respecto a que lo sea otro sujeto
de la población elegido al azar.

El valor de IP más bajo para D21S11 (1.6795) en comparación al de D7S820 (3.3147) indica
que el alelo heredado del padre es más frecuente en la población.

 De igual forma se procede para calcular el IP para cada uno de los marcadores empleados.

Índice de paternidad total (IP total)

Se obtiene multiplicando los IP individuales para cada marcador STR.

IP total = 1.6795 x 3.3141 x 1.9084 x ………. =21.24

Probabilidad de paternidad (W)

W = IP / (1 + IP) = 21.24 / (1 + 21.24) = 21.24 / 22.24 = 0.9550 = 95.50%

Ejemplo:
:

7
 IV. PRESENTACIÓN DE CASO
Un hombre de 30 años, soltero, tiene dudas sobre la paternidad de un menor de 3 años y
se realiza estudio de paternidad. En el informe de resultados se indican las fechas de toma
de muestra, los datos personales, los distintos marcadores genéticos estudiados y los
alelos presentes en el hijo, la madre y del presunto padre.

En la conclusión del estudio se indica que la probabilidad de paternidad es de

99,99999999%.

SUPUESTO SIMILITUD INDICE DE

SISTEMA PADRE MADRE HIJ@ ENTRE SP PATERNIDAD
GENÉTICO (SP) (M) (H) yH X Y (IP) =X/Y
D351358 13/15 14/15 15 15 0.5 0.412
D151656 14/17.3 17.3 14/17.3 0.096
D2S441 10./11 10./14 10 10 0.5 0.463
D10S1248 12./16 14 14/16 0.085
D13S317 9./12 10./11 9/11. 9 0.5 0.183
PENTA E 7./13 11 11/13. 0.08699
D16S539 12/13. 11/13. 0.25799
D18S51 13/15 15/17 13/15 0.114
D2S1338 18/19 19/20 18/19 0.07599
CSF1PO 12 11/12. 11/12. 12 0.25 0.15899
PENTA D 9/13. 11/13. 13 0.204
TH01 7/9.3 6/9.3 6/7. 0.312
VWA 14/17 17 17 0.281999
D21S11 29/31 29/39.2 29/39.2 0 0.32899 0
D7S820 11/12. 8/11. 11/12. 0.18699
D5S818 11/12. 11/13. 12/13. 12 0.5 0.284
TPOX 8/12. 11 8/11. 0.536999
DYS391 10 0 0 0 0 0
D8S1179 12 12/16. 12 0.099
D12S391 18/19 21 18/21. 0.193999
D19S433 13/14 13/14 14 0.263
FGA 20/22 22/25 20/22 20 0.5 0.07399
D22S1045 11 11 11 0.039
AMEL XY XY XX 0 0 0

8
V. ACTIVIDAD:

1. Complete en la tabla la columna de similitud ente SP y H escribiendo la variante

polimórfica que hereda el hijo H del SP (ten en cuenta que un alelo es heredado de
la madre y otro del padre).
2. Completa en la tabla la columna X con la probabilidad con que el SP hereda a su hijo
cada uno de los 24 polimorfismos considerados (no considera a DYS391 y AMEL)
3. Completa en la tabla los Índices de Paternidad (IP) con los datos de X e Y para cada
uno de los 24 polimorfismos considerados.
4. Obtenga el IP total multiplicando entre si cada uno de los 24 IP hallados.
5. ¿Defina con sus términos que son polimorfismos genéticos?
6. Explique con sus términos ¿en qué consisten los polimorfismos SRT (Short Repeat
Tándem)? Cite un ejemplo para ilustración.
7. ¿Cuáles son las aplicaciones de los polimorfismos?
8. ¿Qué es un alelo paterno obligado?
9. ¿Cuál es la interpretación de los resultados y el grado de certeza del examen?

PRUEBA DE EXCLUSIÓN DE PATERNIDAD MEDIANTE POLIMORFISMO ABO Y Rh

En las siguientes tablas complete los datos con los genotipos de los individuos
involucrados y concluya si se excluye o no la paternidad del supuesto padre
fundamentando su respuesta

CASO 1 GRUPO SANGUÍNEO GRUPO SANGUÍNEO DEL GRUPO SANGUÍNEO

DE LA MADRE HIJO DEL SUPUESTO
PADRE
Fenotipos O Rh+ A Rh+ O Rh-
Genotipos
Conclusión Se excluye la paternidad ( ) No se excluye la paternidad ( )
Explicación

CASO 2 GRUPO SANGUÍNEO GRUPO SANGUÍNEO DEL GRUPO SANGUÍNEO

DE LA MADRE HIJO DEL SUPUESTO
PADRE
Fenotipos A Rh+ A Rh+ O Rh-
Genotipos
Conclusión Se excluye la paternidad ( ) No se excluye la paternidad ( )
Explicación

9
 CASO 3 GRUPO SANGUÍNEO GRUPO SANGUÍNEO DEL GRUPO SANGUÍNEO
DE LA MADRE HIJO DEL SUPUESTO
PADRE
Fenotipos A Rh+ AB Rh+ O Rh-
Genotipos
Conclusión Se excluye la paternidad ( ) No se excluye la paternidad ( )
Explicación

VI. BIBLIGRAFÍA:

Tang H, Kirkness EF, Lippert C, Biggs WH, Fabani M, Guzman E, Ramakrishnan S, Lavrenko V,
Kakaradov B, Hou C, Hicks B, Heckerman D, Och FJ, Caskey CT, Venter JC, Telenti A. Profiling of Short-
Tandem-Repeat Disease Alleles in 12,632 Human Whole Genomes. Am J Hum Genet. 2017 Nov
2;101(5):700-715. doi: 10.1016/j.ajhg.2017.09.013. PMID: 29100084; PMCID: PMC5673627.

Xiao Lei. Comparison of different STR typing for a special allele at D7S820 locus by using ten different
STR multiplex system. Forensic Res Criminol Int J. 2019; 7(3):135‒142. Recuperado de:
https://medcraveonline.com/FRCIJ/FRCIJ-07-00277.pdf

Ramírez, J. Papel de la variabilidad genética en las enfermedades mendelianas y multifactoriales.

Gac Med Mex. 2019; 155:499-507. Recuperado de:
https://www.medigraphic.com/pdfs/gaceta/gm-2019/gm195h.pdf

10