Disciplina de Fundamentos de Genética Aplicada (FOAr)

Profª Draª Raquel Mantuaneli Scarel Caminaga

Projeto Genoma Humano & Bancos Genômicos na Internet

Gene escolhido: TNFA

Discente: Sílvio André Lopes

Programa de Pós-Graduação em Ciências Farmacêuticas
Faculdade de Ciências Farmacêuticas – Câmpus de Araraquara
Comentário: O artigo científico acima traça uma associação entre a Doença de Crohn (alvo
de pesquisa em meu projeto de mestrado) e a periodontite, uma doença que é bastante
abordada e discutida no decorrer da disciplina. Achei bastante interessante a temática do
artigo, visto que é possível relacionar as duas enfermidades de áreas distintas (farmacêutica
e odontológica) sob um mesmo fator: o genético. Dessa forma, como é relatado no estudo,
indivíduos com Doença de Crohn (uma doença inflamatória intestinal) podem apresentar
também a periodontite (uma doença infecciosa e inflamatória das gengivas). Foi analisado
a presença do polimorfismo no gene TNF-A-308 G>A, podendo exercer grande influência na
mudança do fenótipo em pacientes que apresentem as duas doenças.
Comentário: achei muito interessante entender esse contexto genético. Localização do
gene: 6p21.33 (lê-se: braço curto do cromossomo 6, iniciando-se em região 2, banda 1, e
estendendo-se até região 3, banda 3). O gene apresenta 4 éxons.

Comentário: Ficou claro e evidente como são numeradas as posições de início e fim de
cada éxon, os links existem para outras informações e o esquema visual que facilita o
entendimento. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/7124
Comentário: achei bastante interessante como a sequência de nucleotídeos do gene
aparece, o quão é extensa, e como ela está demarcada.
Comentário: éxons realçados; o que não está realçado, são íntrons.
Comentário: proteína de fator de necrose tumoral de Homo sapiens. Locus: NP_000585; é
uma proteína linear que apresenta 233 aminoácidos (aa). Essa é a isoforma 2
(NP_000585.2). Accession: NP_000585; Version: NP_000585.2. Essa proteína é um fator
de necrose tumoral (TNF-α), sendo essa uma citocina pró-inflamatória, secretada por
macrófagos. Foi relatada presente na resposta inflamatória contra o coronavírus.

Comentário: achei muito abrangente e interessante, a variedade e a biodiversidade de seres

vivos, sendo completamente diferentes entre si e em distâncias continentais. São mais de
70 animais em que a sequência desse gene está presente.
Comentário: É interessante ver que alterações em um mesmo gene pode levar a vários
tipos de doenças, como ocorre no gene TNFA – e nessa imagem, podemos verificar que a
suscetibilidade da mutação nesse gene (no cromossomo 6p21.33) pode causar asma,
malária, enxaqueca e choque séptico.
Comentário: Senti uma grande identificação com o site e foi muito positiva a experiência de
poder ver cada detalhe do cromossomo, do gene e da proteína, podendo analisar
amplamente. Foi possível verificar as noções de localidade do gene TNFA no cromossomo,
estando situado no braço curto do cromossomo 6, iniciando-se em região 2, banda 1, e
estendendo-se até região 3, banda 3. Também foi possível estudar as sequências do gene,
o local das proteínas, as regiões de íntrons, splicing, e o RNAm.
Comentário: Nessas ilustrações, foi possível analisar cada fragmento do gene
detalhadamente, sequências alinhadas e coloridas do gene, com uma legenda com todas
as cores do gene indicando cada nucleotídeo. Também é possível ver nessa parte do site
Ensemble, no gene TNFA, os sítios polimórficos e os tipos de mutações destacadas por
cores diferentes. É possível identificar as mutações nos segmentos de nucleotídeos
indicados, como os locais em que ocorreu “frameshif”, “missense”, inserção e as regiões
codificadoras.
Comentário: Gostei muito desse esquema, ficou muito didático e ilustrativo, com bastantes
detalhes. Essa ilustração da célula permite observar diretamente nela onde as proteínas
estão. A proteína está presente na membrana plasmática e é secretada para o meio extra-
celular onde irá auxiliar o sistema imunológico.
Comentário: Nesse link GeneCards, é perceptível a quantidade de informação interessante
sobre o gene TNFA. Por ser relacionado a minha área, destaquei a área de fármacos. No
caso do gene TNFA, há 227 medicamentos de diferentes tipos, aprovados ou em caráter
experimental e com diversos mecanismos de ação dentro das células.
Comentário: escolhi o PHARMGKB pois eu particularmente me interesso muito pela área
de farmacogenômica, além de ser de minha área de interesse. É possível verificar
informações de anotação, nome de alelos, literaturas, rotas, informações que podem ser
prescritas aos pacientes. Acho interessante essa questão multidisciplinar da genética com o
lado humano e suas relações com a assistência farmacêutica, promovendo a empatia e a
qualidade de vida àqueles que precisam.