prostatic acid phosphatase isoform TM-PAP precursor

długość: 1787 bp

liczba eksonów: 11

sekwencja kodująca: od 51 do 146 nukleotydu

białko dojrzałe: od 147 do 1304 nukleotydu

eksony

1 - od 1 do 170, długość 170

2 - od 171 do 266, długość 96

3 - od 267 do 353, długość 87

4 - od 354 do 506, długość 153

5 - od 507 do 605, długość 99

6 - od 606 do 698, długość 93

7 - od 699 do 831, długość 133

8 - od 832 do 914, długość 83

9 - od 915 do 1018, długość 104

10 - od 1019 do 1188, długość 170

11 - od 1189 do 1787, długość 599

sekwencja eksonu 3:

Starter forward

Starter reverse

ctgg gcatggagca gcattatgaa cttggagagt atataagaaa gagatataga aaattcttga atgagtccta taaacatgaa cag

sekwencja eksonu 4:

gtttata ttcgaagcac agacgttgac cggactttga tgagtgctat gacaaacctg gcagccctgt ttcccccaga aggtgtcagc

atctggaatc ctatcctact ctggcagccc atcccggtgc acacagttcc tctttctgaa gatcag
transkrypt mRNA:

START

STOP

1 gaagtggtag cagttcctcc taactcctgc cagaaacagc tctcctcaac atgagagctg

61 cacccctcct cctggccagg gcagcaagcc ttagccttgg cttcttgttt ctgctttttt

121 tctggctaga ccgaagtgta ctagccaagg agttgaagtt tgtgactttg gtgtttcggc

181 atggagaccg aagtcccatt gacacctttc ccactgaccc cataaaggaa tcctcatggc

241 cacaaggatt tggccaactc acccagctgg gcatggagca gcattatgaa cttggagagt

301 atataagaaa gagatataga aaattcttga atgagtccta taaacatgaa caggtttata

361 ttcgaagcac agacgttgac cggactttga tgagtgctat gacaaacctg gcagccctgt

421 ttcccccaga aggtgtcagc atctggaatc ctatcctact ctggcagccc atcccggtgc

481 acacagttcc tctttctgaa gatcagttgc tatacctgcc tttcaggaac tgccctcgtt

541 ttcaagaact tgagagtgag actttgaaat cagaggaatt ccagaagagg ctgcaccctt

601 ataaggattt tatagctacc ttgggaaaac tttcaggatt acatggccag gacctttttg

661 gaatttggag taaagtctac gaccctttat attgtgagag tgttcacaat ttcactttac

721 cctcctgggc cactgaggac accatgacta agttgagaga attgtcagaa ttgtccctcc

781 tgtccctcta tggaattcac aagcagaaag agaaatctag gctccaaggg ggtgtcctgg

841 tcaatgaaat cctcaatcac atgaagagag caactcagat accaagctac aaaaaactca

901 tcatgtattc tgcgcatgac actactgtga gtggcctaca gatggcgcta gatgtttaca

961 acggactcct tcctccctat gcttcttgcc acttgacgga attgtacttt gagaaggggg

1021 agtactttgt ggagatgtac tatcggaatg agacgcagca cgagccgtat cccctcatgc

1081 tacctggctg cagccccagc tgtcctctgg agaggtttgc tgagctggtt ggccctgtga

1141 tccctcaaga ctggtccacg gagtgtatga ccacaaacag ccatcaagtt ctaaaggtca

1201 tctttgctgt tgccttttgc ctgatatctg ctgtcctaat ggtactactg tttatccaca

1261 ttcgccgtgg actctgctgg cagagagaat cctatgggaa catctgaaca gacagctgga

1321 taagccaggc caacctcctg tgacacagca tctctcagtg gtgccgcatc taaaggacag

1381 gcttttgcca tgtgggcatt gccatcctca caccctgcct tttgaatctg cccagagcag

1441 ggtctgaact cacagtgacc cacaggctgc tgctggatga acactcaggc tacctaggtc

1501 ttctcataat ggagtggtag tgcaggctgc ttgttcagct agaaagaggc tgttatgcat

1561 aggatggttg tattctctgc cacagttgtc cggagagaaa taagaagcca aactccaatc

1621 agccttttac ctgcaaagag tgaagggtga gaaggtggac aaagacatag attagaaaaa

1681 tactggatat tgggggaagt tagactagaa gtattattat acagggtgat tcttacgaaa

1741 gaagacccaa tcataaatta taaataaact ttttatttag ctattaa

Wydruk sekwencji aminokwasów (transbłonowe):

1 mraaplllar aaslslgflf llffwldrsv lakelkfvtl vfrhgdrspi dtfptdpike

61 sswpqgfgql tqlgmeqhye lgeyirkryr kflnesykhe qvyirstdvd rtlmsamtnl

121 aalfppegvs iwnpillwqp ipvhtvplse dqllylpfrn cprfqelese tlkseefqkr

181 lhpykdfiat lgklsglhgq dlfgiwskvy dplycesvhn ftlpswated tmtklrelse

241 lsllslygih kqkeksrlqg gvlvneilnh mkratqipsy kklimysahd ttvsglqmal

301 dvyngllppy aschltelyf ekgeyfvemy yrnetqhepy plmlpgcsps cplerfaelv

361 gpvipqdwst ecmttnshqv lkvifavafc lisavlmvll fihirrglcw qresygni

hydrofobowe